DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1JR7A MOLECULE: HYPOTHETICAL 37.4 KDA PROTEIN IN ILEY-GABD

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1JR7-A 52.9  0.0  306   306  100   HYPOTHETICAL 37.4 KDA PROTEIN IN ILEY-GABD                 "         
   2:  1DRT-A 22.6  3.0  262   315   17   CLAVAMINATE SYNTHASE 1;                                    "         
   3:  2OG5-A 22.5  2.9  258   315   17   PUTATIVE OXYGENASE;                                        "         
   4:  1GQW-A 18.5  2.7  227   277   14   ALPHA-KETOGLUTARATE-DEPENDENT TAURINE                      "         
   5:  1OIH-A 17.7  3.3  225   254   14   PUTATIVE ALKYLSULFATASE ATSK;                              "         
   6:  1NX4-A 17.5  3.4  219   247   13   CARBAPENEM SYNTHASE;                                       "         
   7:  2Q4A-A 16.9  3.1  233   321   16   CLAVAMINATE SYNTHASE-LIKE PROTEIN AT3G21360;               "         
   8:  2DBI-A  7.5  4.3  172   397    6   HYPOTHETICAL PROTEIN YBIU;                                 "         
   9:  2FCT-A  7.2  3.1  147   304    8   SYRINGOMYCIN BIOSYNTHESIS ENZYME 2;                        "         
  10:  2YU1-A  6.8  3.6  151   386    9   JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION               "         
  11:  2OPW-A  6.8  3.9  148   286   14   PHYHD1 PROTEIN;                                            "         
  12:  2OQ6-A  6.7  4.4  168   348    7   JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION               "         
  13:  2HJI-A  6.3  2.8  119   156    9   E-2/E-2' PROTEIN;                                          "         
  14:  1MZE-A  6.2  4.0  144   335   14   FACTOR INHIBITING HIF1;                                    "         
  15:  2FD8-A  5.7  3.2  116   199   13   ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB;                         "         
  16:  1VR3-A  5.7  2.9  117   179   10   ACIREDUCTONE DIOXYGENASE;                                  "         
  17:  2IUW-A  5.6  3.9  127   205   12   ALKYLATED REPAIR PROTEIN ALKB HOMOLOG 3;                   "         
  18:  1VRB-A  5.3  3.7  131   302   12   PUTATIVE ASPARAGINYL HYDROXYLASE;                          "         
  19:  1JOP-A  5.3  3.4  104   140    8   YHCH PROTEIN;                                              "         
  20:  1BK0-A  4.9  3.8  144   329    8   ISOPENICILLIN N SYNTHASE;                                  "         
  21:  2PA7-A  4.8  2.6   97   135    8   DTDP-6-DEOXY-3,4-KETO-HEXULOSE ISOMERASE;                  "         
  22:  2IXH-A  4.6  3.1  110   184    8   DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      "         
  23:  1WLT-A  4.6  3.0  105   176   11   176AA LONG HYPOTHETICAL DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,          "         
  24:  2O8Q-A  4.5  2.7   86   122   10   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  25:  1W9Y-A  4.5  4.5  139   298   13   1-AMINOCYCLOPROPANE-1-CARBOXYLATE OXIDASE 1;               "         
  26:  1EP0-A  4.5  2.9  107   183   12   DTDP-6-DEOXY-D-XYLO-4-HEXULOSE 3,5-EPIMERASE;              "         
  27:  2IXL-A  4.3  2.9  104   196    7   DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      "         
  28:  1UPI-A  4.2  3.1  107   200   12   DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      "         
  29:  1GP4-A  4.2  4.2  142   346   13   ANTHOCYANIDIN SYNTHASE;                                    "         
  30:  1E5R-A  4.2  2.8  104   260   10   PROLINE OXIDASE;                                           "         
  31:  2GM6-A  3.8  3.7  113   192    7   CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I;                               "         
  32:  2CRQ-A  3.2  3.5   82   112    6   MITOCHONDRIAL TRANSLATIONAL INITIATION FACTOR 3;           "         
  33:  2IFE-A  3.0  2.7   79    91   10   PROTEIN (TRANSLATION INITIATION FACTOR IF3);               "         
  34:  2BDR-A  2.9  4.2  106   166    6   UREIDOGLYCOLATE HYDROLASE;                                 "         
  35:  1YWK-A  2.9  3.6  106   255    5   4-DEOXY-L-THREO-5-HEXOSULOSE-URONATE KETOL-                "         
  36:  2ET1-A  2.8  3.8   87   201   11   OXALATE OXIDASE 1;                                         "         
  37:  2D40-A  2.7  5.8   90   288   12   PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE;                        "         
  38:  2ARH-A  2.7  3.7   88   198   10   HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              "         
  39:  1SQ4-A  2.7  4.3  115   270   10   GLYOXYLATE-INDUCED PROTEIN;                                "         
  40:  1XE7-A  2.6  3.2   85   186    8   HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3                 "         
  41:  1RO5-A  2.6  3.3   87   197   11   AUTOINDUCER SYNTHESIS PROTEIN LASI;                        "         
  42:  1LN4-A  2.6  3.9   78    98    5   HYPOTHETICAL PROTEIN YHBY;                                 "         
  43:  1YFU-A  2.5  4.6   87   174    8   3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE;                     "         
  44:  2H9U-A  2.4  3.6   71   101   17   DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;                            "         
  45:  1PMI-A  2.4  3.8   98   440    5   PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE;                                  "         
  46:  1HA0-A  2.4  6.3  116   494    3   PROTEIN (HEMAGGLUTININ PRECURSOR);                         "         
  47:  10MH-A  2.4  4.4   99   327    8   PROTEIN (CYTOSINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE               "         
  48:  1VHS-A  2.3  4.2   92   165    9   SIMILAR TO PHOSPHINOTHRICIN ACETYLTRANSFERASE;             "         
  49:  2IBX-A  2.2  6.0  113   321    4   HEMAGGLUTININ;                                             "         
  50:  2A2Y-A  2.2  3.2   69    89   10   DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;                            "         
  51:  1WYZ-A  2.2  3.3   78   223    9   PUTATIVE S-ADENOSYLMETHIONINE-DEPENDENT                    "         
  52:  2HQY-A  2.1  3.9   82   298    9   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  53:  2H6B-A  2.1  7.6   95   239    2   CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;                             "         
  54:  1XJA-A  2.1  4.5   79   165   11   ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN;                       "         
  55:  1CX4-A  2.1  3.9   87   275    8   CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT           "         
-

No 1: 1JR7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL 37.4 KDA PROTEIN IN ILEY-GABD                 

DSSP  LLLLLLEEEEELLLLLLEEEEEELHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
Query GQDYSGFTLTPSAQSPRLLELTFTEQTTKQFLEQVAEWPVQALEYKSFLRFRVAKILDDL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GQDYSGFTLTPSAQSPRLLELTFTEQTTKQFLEQVAEWPVQALEYKSFLRFRVAKILDDL   60
DSSP  LLLLLLEEEEELLLLLLEEEEEELHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEELLLLLLLLL
Query CANQLQPLLLKTLLNRAEGALLINAVGVDDVKQADEMVKLATAVAHLIGRSNFDAMSGQY  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct CANQLQPLLLKTLLNRAEGALLINAVGVDDVKQADEMVKLATAVAHLIGRSNFDAMSGQY  120
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEELLLLLLLLL


DSSP  LEEEEELLLLLLLLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEHHHLLLH
Query YARFVVKNVYLRQPHRVMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEQNMQGGNSLLLHLDDWEHL  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct YARFVVKNVYLRQPHRVMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEQNMQGGNSLLLHLDDWEHL  180
DSSP  LEEEEELLLLLLLLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEELLLLLLEEEEEHHHLLLH


DSSP  HHHHLLHHHHLLEEELLLLLLLLLLLEEELLEEELLLLLEEELLLLLLEELLLHHHHHHH
Query DNYFRHPLARRPMRFAAPPSKNVSKDVFHPVFDVDQQGRPVMRYIDQFVQPKDFEEGVWL  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DNYFRHPLARRPMRFAAPPSKNVSKDVFHPVFDVDQQGRPVMRYIDQFVQPKDFEEGVWL  240
DSSP  HHHHLLHHHHLLEEELLLLLLLLLLLEEELLEEELLLLLEEELLLLLLEELLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLLLLLEEEEEEEEEEELLLLL
Query SELSDAIETSKGILSVPVPVGKFLLINNLFWLHGRDRFTPHPDLRRELMRQRGYFAYASN  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SELSDAIETSKGILSVPVPVGKFLLINNLFWLHGRDRFTPHPDLRRELMRQRGYFAYASN  300
DSSP  HHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLLLLLEEEEEEEEEEELLLLL


DSSP  LLLLLL
Query HYQTHQ  306
ident ||||||
Sbjct HYQTHQ  306
DSSP  LLLLLL


No 2: 1DRTA  MOLECULE: CLAVAMINATE SYNTHASE 1;                                    

DSSP  lllllleeeeelllllleEEEEE..LHHHHHHHHHHHllLLHHhhHHLLH.HHHHHHHHH
Query gqdysgftltpsaqsprlLELTF..TEQTTKQFLEQVaeWPVQalEYKSF.LRFRVAKIL   57
ident                                                             
Sbjct ..................TSVDCtaYGPELRALAARL..PRTP..RADLYaFLDAAHTAA   38
DSSP  ..................LEEELhhHHHHHHHHHHHL..LLLH..HHHHHhHHHHHHHHH


DSSP  HHHLlLLHHHHHHHHHHL.LLLLEEEEEELLLLLHH...............hhHHHHHHH
Query DDLCaNQLQPLLLKTLLN.RAEGALLINAVGVDDVK...............qaDEMVKLA  101
ident   |    |   |          | ||     |                       |    
Sbjct ASLP.GALATALDTFNAEgSEDGHLLLRGLPVEADAdlpttpsstpapedrslLTMEAML   97
DSSP  LLLL.HHHHHHHHHHHHHlLLLLEEEEELLLLLLHHhllllllllllllllllLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHEEELLL..LLLLLLLEEEEELLLLLL....LLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEE
Query TAVAHLIGRSNFD..AMSGQYYARFVVKNVYLR....QPHRVMELHNDGTYVEEITDYVL  155
ident   |    |         ||  |                     | |    |      || 
Sbjct GLVGRRLGLHTGYreLRSGTVYHDVYPSPGAHHlsseTSETLLEFHTEMAYHRLQPNYVM  157
DSSP  HHHHHHHLEELEEllLHHHLLLEEELLLLLLLLllllLLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEE


DSSP  EEEEEEELLLLLLEEEEEHHHL.LLHHH.HHLLhHHHLLEEELLLLLlllLLLEEELLEE
Query MMKIDEQNMQGGNSLLLHLDDW.EHLDN.YFRHpLARRPMRFAAPPSknvSKDVFHPVFD  213
ident               |          ||       |  | |                    
Sbjct LACSRADHERTAATLVASVRKAlPLLDErTRAR.LLDRRMPCCVDVA...FRIAQVKPLY  213
DSSP  EEEEELLLLLLLLEEEEEHHHHhHHLLHhHHHH.HLLLLEELLLLHH...HLLLEELLEE


DSSP  ELllLLEEELLLLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHHLllLLEEELLLLLLEEEEELLLEEE
Query VDqqGRPVMRYIDQFVQPKDFEEGVWLSELSDAIETskGILSVPVPVGKFLLINNLFWLH  273
ident  |    |   |      | |         || |         |    |  |   |    |
Sbjct GD.aDDPFLGYDRELLAPEDPADKEAVAALSKALDE..VTEAVYLEPGDLLIVDNFRTTH  270
DSSP  LL.lLLLEELLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH..HLEEELLLLLLEEEEELLLEEE


DSSP  EELLLLLLLL.lEEEEEEEEEEEL...........llllllllll
Query GRDRFTPHPD.lRRELMRQRGYFA...........yasnhyqthq  306
ident  |  | |  |   | | |                           
Sbjct ARTPFSPRWDgkDRWLHRVYIRTDrngqlsggeragdvvaftprg  315
DSSP  EELLLLLLLLllLLEEEEEEEELLhhhlllllllllleellllll


No 3: 2OG5A  MOLECULE: PUTATIVE OXYGENASE;                                        

DSSP  lllllleeeeelllllleEEEEELHHHHHHHHHHHLLLL...hHHHHHL..LHHHHHHHH
Query gqdysgftltpsaqsprlLELTFTEQTTKQFLEQVAEWP...vQALEYK..SFLRFRVAK   55
ident                      |          |                           
Sbjct ................srYDVTLDQSDAELVEEIAWKLAtqatGRPDDAewVEAARNAWH   44
DSSP  ................llLEEELLHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLLLHhhHHHHHHHHL


DSSP  HHHhhllLLHHHHHHHHHHL.LLLLEEEEEEllLLLHH..............hhHHHHHH
Query ILDdlcaNQLQPLLLKTLLN.RAEGALLINAvgVDDVK..............qaDEMVKL  100
ident          |   |          ||         |                        
Sbjct AWP....ATLRRDLAGFRRDsGPDGAIVLRG.lPVDSMglpptprvngsvqreaSLGAAV   99
DSSP  LLL....HHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEL.lLLLLLllllllllllllllllLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHEEELLL..LLLLLLLEEEEELlLLLLL.....LLLLEEEELLLLLLLLLLLE
Query ATAVAHLIGRSNFD..AMSGQYYARFVVKnVYLRQ.....PHRVMELHNDGTYVEEITDY  153
ident     |   |          |      |                    ||     |   | 
Sbjct LLMTACGLGDPGAFlpEKNGALVQDVVPV.PGMEEfqgnaGSTLLTFHNENAFHEHRPDF  158
DSSP  HHHHHHHHLEEEEEllLHHHLLLEEELLL.LLLLLlllllLLLLEEEELLLLLLLLLLLE


DSSP  EEEEEEEEELLLLLLEEEEEHHHLllHHHHHL..LHHHHLL.EEELLLLLLLllllEEEL
Query VLMMKIDEQNMQGGNSLLLHLDDWehLDNYFR..HPLARRP.MRFAAPPSKNvskdVFHP  210
ident |                         |             |  | | |||         |
Sbjct VMLLCLRADPTGRAGLRTACVRRV..LPLLSDstVDALWAPeFRTAPPPSFQ....APAP  212
DSSP  EEEEEEELLLLLLLLEEEEEHHHH..HHHLLHhhHHHHLLLlEELLLLHHHL....LLLL


DSSP  LEEELllLLEEELLLLLLEELLLHHHHHHHHHHHHHHHLllLLEEELLLLLLEEEEELLL
Query VFDVDqqGRPVMRYIDQFVQPKDFEEGVWLSELSDAIETskGILSVPVPVGKFLLINNLF  270
ident |   |    |  |       |        | ||                 |      |  
Sbjct VLLGD.rSDPDLRVDLAATEPVTERAAEALRELQAHFDA..TAVTHRLLPGELAIVDNRV  269
DSSP  LEEEL.lLLEEELLLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHHH..HLEEELLLLLLEEEEELLL


DSSP  EEEEELLLLLLLL.LEEEEEEEEEEEL.........llllllllll
Query WLHGRDRFTPHPD.LRRELMRQRGYFA.........yasnhyqthq  306
ident   |||  |||  |   | | |                         
Sbjct TVHGRTEFTPRYDgTDRWLQRTFVLTDlrrsramrpadgyvlgaap  315
DSSP  EEEEELLLLLLLLlLLLEEEEEEEELLhhhhhhhlhhhlleellll


No 4: 1GQWA  MOLECULE: ALPHA-KETOGLUTARATE-DEPENDENT TAURINE                      

DSSP  llllllEEEEElLLLL..LEEEEEElhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhHHH
Query gqdysgFTLTPsAQSP..RLLELTFteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakILD   58
ident                |                                            
Sbjct ......RLSIT.PLGPyiGAQISGA...............................dRPL   22
DSSP  ......LLEEE.ELLLllLEEEELL...............................lLLL


DSSP  HhllLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEElllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHEEELLL.LLL
Query DlcaNQLQPLLLKTLLNraEGALLINAvgvddvkqadEMVKLATAVAHLIGRSNFD.AMS  117
ident           |    |                            | |   |         
Sbjct S...DNQFEQLYHAVLR..HQVVFLRD........qaITPQQQRALAQRFGELHIHpVYP   69
DSSP  L...HHHHHHHHHHHHH..LLEEEELL........llLLHHHHHHHHHLLLLLLLLlLLL


DSSP  L....LLLEEEEELLLllllllllEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEElLLLLLEEEEE
Query G....QYYARFVVKNVylrqphrvMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEQnMQGGNSLLLH  173
ident               |            | | |  |                 ||  |   
Sbjct HaegvDEIIVLDTHND...nppdnDNWHTDVTFIETPPAGAILAAKELP.STGGDTLWTS  125
DSSP  EelleEEEEEEEELLL...lllllLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEELL.LLLLLEEEEE


DSSP  HHHLlLHHH.hHLLHHHHLLEEELLL...................LLLLLLLLEEELLEE
Query LDDWeHLDN.yFRHPLARRPMRFAAP...................PSKNVSKDVFHPVFD  213
ident            ||  |                                       |||  
Sbjct GIAAyEALSvpFRQLLSGLRAEHDFRksfpeykyrkteeehqrwrEAVAKNPPLLHPVVR  185
DSSP  HHHHhHLLLhhHHHHHLLLEEEELHHhhlllhhhlllhhhhhhhhHHHHLLLLEEEELEE


DSSP  ELL.LLLEEELLLLLLEEL....lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLEEEEEL
Query VDQ.QGRPVMRYIDQFVQP....kDFEEGVWLSELSDAIETSKGILSVPVPVGKFLLINN  268
ident      |         |          |    || |   |                    |
Sbjct THPvSGKQALFVNEGFTTRivdvsEKESEALLSFLFAHITKPEFQVRWRWQPNDIAIWDN  245
DSSP  ELLlLLLEEELLLLLLEEEellllHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHEEEELLLLLLEEEELL


DSSP  LLEEEEELLLLLLllLEEEEEEEEEEElllllllllll
Query LFWLHGRDRFTPHpdLRRELMRQRGYFayasnhyqthq  306
ident     |           ||   |                
Sbjct RVTQHYANADYLP..QRRIMHRATILG....dkpfyra  277
DSSP  LLEEEEELLLLLL..LLEEEEEEEELL....lllllll


No 5: 1OIHA  MOLECULE: PUTATIVE ALKYLSULFATASE ATSK;                              

DSSP  llllLLEEEEELlLLLLEEEEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhHHHHHhh
Query gqdySGFTLTPSaQSPRLLELTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvAKILDdl   60
ident           |        |                                    ||  
Sbjct ....LELDVHPV.AGRIGAEIRGV...........................klSPDLD..   26
DSSP  ....LLLEEEEL.LLLLLEEEELL...........................llLLLLL..


DSSP  llLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEelLLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHEEELLlLLLL..
Query caNQLQPLLLKTLLNraEGALLINavGVDDvkqadEMVKLATAVAHLIGRSNFdAMSG..  118
ident             |             |                 | | |           
Sbjct ..AATVEAIQAALVR..HKVIFFR..GQTH.....LDDQSQEGFAKLLGEPVA.PVVDgt   74
DSSP  ..HHHHHHHHHHHHH..HLEEEEL..LLLL.....LLHHHHHHHHHLLLLLLL.LLLLll


DSSP  LLLEEEEelllllllllLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEElLLLLLEEEEEHHHL.
Query QYYARFVvknvylrqphRVMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEQnMQGGNSLLLHLDDW.  177
ident  |               |    | | | ||                 ||           
Sbjct RYLLQLD..........RANSWHTDVTFVEAYPKASILRSVVAP.ASGGDTVWANTAAAy  123
DSSP  LLLEEEL..........LLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEELL.LLLLLEEEEEHHHHh


DSSP  LLHHH.HHLLhHHHLLEEELLLlllllLLLEEELLEEELL.LLLEEELLLLlLEEL....
Query EHLDN.YFRHpLARRPMRFAAPpsknvSKDVFHPVFDVDQ.QGRPVMRYIDqFVQP....  231
ident   |                             |||  |    |         ||      
Sbjct QELPEpLREL.ADKLWAVHSNE.....VYETEHPVVRVHPiSGERALQLGH.FVKRikgy  176
DSSP  HLLLHhHHHH.HHHLEEEEELL.....LLEEEEELEEELLlLLLEEELLLL.LEEEelll


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLLllLEEEEEEE
Query kDFEEGVWLSELSDAIETSKGILSVPVPVGKFLLINNLFWLHGRDRFTPHpdLRRELMRQ  291
ident            |                 |      |    |            |   | 
Sbjct sLADSQHLFAVLQGHVTRLENTVRWRWEAGDVAIWDNRATQHYAVDDYGT..QPRIVRRV  234
DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHEEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLL..LLLEEEEE


DSSP  EEE.....elllllllllll
Query RGY.....fayasnhyqthq  306
ident                     
Sbjct TLAgevpvgvdgqlsrttrk  254
DSSP  EELlllllllllllleeeel


No 6: 1NX4A  MOLECULE: CARBAPENEM SYNTHASE;                                       

DSSP  llllLLEEEEELLLLLLEEEEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdySGFTLTPSAQSPRLLELTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident           |   |                                             
Sbjct ...sEIVKFNPVXASGFGAYIDHR...................................d   22
DSSP  ...lLLLLLLLLLLLLLLEELLHH...................................h


DSSP  llLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEElllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHEEELLlllllLL
Query caNQLQPLLLKTLLNraEGALLINAvgvddvkqadEMVKLATAVAHLIGRSNFdamsgQY  120
ident             |     |                             |           
Sbjct flEAKTETIKNLLXR..QGFVVVKN........ldIDSDTFRDIYSAYGTIVE.....RD   67
DSSP  hhHLLHHHHHHHHHH..HLEEEELL........llLLHHHHHHHHHLLLEELL.....LL


DSSP  LEEEEELlLLLL.lllLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEELLL.LLLEEEEEHHHLL
Query YARFVVKnVYLR.qphRVMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEQNMQ.GGNSLLLHLDDWE  178
ident                      | ||       | |        |    |           
Sbjct TLKLEGE.KGKIvtgrGQLPFHADGGLLLSQVDQVFLYAAEIKNVKfRGATTVCDHALAC  126
DSSP  LEEELLL.LLLLllllLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEELLLlLLLEEEEEHHHHH


DSSP  ..lhHHHHLlhHHHL.LEEELLLlllllllLEEELLEEELLLlLEEELLLL.........
Query ..hlDNYFRhpLARR.PMRFAAPpsknvskDVFHPVFDVDQQgRPVMRYID.........  226
ident         |                         |||                       
Sbjct qexpAHLLR..VLEEeTFEVRVL.......WFKVPVFTDLGW.VRKXLIYFpfdegqpas  176
DSSP  hhllHHHHH..HHHHlLEEEEEL.......LEELLLEEELLL.LEEELLLLlllllllll


DSSP  LLEELLLHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLLlL
Query QFVQPKDFEEGVWLSELSDAIETSK...GILSVPVPVGKFLLINNLFWLHGRDRFTPHpD  283
ident        |                |            |  |   |    | |  |    |
Sbjct WEPRIVGFTDHETQAFFQELGAFLKqprYYYKHFWEDGDLLIXDNRRVIHEREEFNDD.D  235
DSSP  EEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHHHLlllLEEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLLL.L


DSSP  LEEEEEEEEEEElllllllllll
Query LRRELMRQRGYFayasnhyqthq  306
ident   | | |                
Sbjct IVRRLYRGQTAD...........  247
DSSP  LEEEEEEEEEEL...........


No 7: 2Q4AA  MOLECULE: CLAVAMINATE SYNTHASE-LIKE PROTEIN AT3G21360;               

DSSP  llllLLEEEEELLLL......LLEEEEEELhhhhHHHHhhhllllhhhhhhllhhhhhhh
Query gqdySGFTLTPSAQS......PRLLELTFTeqttKQFLeqvaewpvqaleyksflrfrva   54
ident          ||  |       |                                      
Sbjct ....LLLVETPIPQQkhyeskPFPAVISPP..paLSLP...................lft   35
DSSP  ....LLLEELLLLLLeeelleEELEEEELL..llLLHH...................hhh


DSSP  HHHHHhllllHHHHHHHHHHLllLLEEEEEELlLLLHhhHHHHHHHHHHHHhhhEEELLL
Query KILDDlcanqLQPLLLKTLLNraEGALLINAVgVDDVkqADEMVKLATAVAhliGRSNFD  114
ident               |   |     || |           ||       |           
Sbjct QTIKT.....QKHYLDSLLHE..SGAVLFRGF.PVNS..ADDFNDVVEAFG...FDELPY   82
DSSP  HHHHH.....LHHHHHHHHHH..HLEEEELLL.LLLL..HHHHHHHHHHLL...LLLLLL


DSSP  .....LLLL..LLLEEEEelllllLLLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEEelLLLL
Query .....AMSG..QYYARFVvknvylRQPHRVMELHNDGTYVEEITDYVLMMKIDEqnMQGG  167
ident                           |      |     | |           |    ||
Sbjct vggaaPRTSvvGRVFTAN.....eSPPDQKIPFHHEMAQVREFPSKLFFYCEIE.pKCGG  136
DSSP  lllllLLEEeeLLEEELL.....lLLLLLLEEEELLLLLLLLLLLEEEEEEEEL.lLEEL


DSSP  LEEEEEHHHL.LLHHHH..hLLHHHH.LLEEE.................lllLLLL....
Query NSLLLHLDDW.EHLDNY..fRHPLAR.RPMRF.................aapPSKN....  202
ident            |                                                
Sbjct ETPIVLSHVVyERMKDKhpeFVQRLEeHGLLYvrvlgedddpsspigrgwksTFLThdkn  196
DSSP  LLLEEEHHHHhHHHHHHlhhHHHHHHhHLEEEeeeelllllllllllllhhhHLLLllhh


DSSP  .......LLLL..............EEELLEEELL.LLLEEELLL.LLLE..........
Query .......VSKD..............VFHPVFDVDQ.QGRPVMRYI.DQFV..........  229
ident                             |    |    | |                   
Sbjct laeqravDLGMklewtedggaktvmGPIPAIKYDEsRNRKVWFNSmVAAYtgwedkrndp  256
DSSP  hhhhhhhHLLLlleellllleeeeeEEELLLEEELlLLEEELLLLhHHHHlllllllllh


DSSP  ..ELLL...HHHHH.HHHHHHHHHHllLLLEEELLLLLLEEEEELLLEEEEELLLLllll
Query ..QPKD...FEEGV.WLSELSDAIEtsKGILSVPVPVGKFLLINNLFWLHGRDRFTphpd  283
ident                         |       ||   |  ||| |   || |  |     
Sbjct rkAVTFgdgKPLPAdIVHDCLRILE..EECVAVPWQRGDVLLIDNWAVLHSRRPFD....  310
DSSP  hhHEEElllLLLLHhHHHHHHHHHH..HHLLLLLLLLLLEEEEELLLEEEEELLEE....


DSSP  LEEEEEEEEEEelllllllllll
Query LRRELMRQRGYfayasnhyqthq  306
ident   |                    
Sbjct PPRRVLASLCK............  321
DSSP  LLLEEEEEELL............


No 8: 2DBIA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YBIU;                                 

DSSP  ........................................lllllleeeeellllLLEEE
Query ........................................gqdysgftltpsaqsPRLLE   20
ident                                                             
Sbjct tftsdtlpadhkaairqmkhalraqlgdvqqifnqlsddiatrvaeinalkaqgdAVWPV   60
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLE


DSSP  EEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHHLlllHHHHHHHHHHLllLLE
Query LTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDLCanqLQPLLLKTLLNraEGA   80
ident |                                                         | 
Sbjct LSYA...............................dIKAGH...VTAEQREQIKR..RGC   84
DSSP  EEHH...............................hHHHLL...LLHHHHHHHHH..HLE


DSSP  EEEEEllLLLH..HHHH..............................hhhHHHHHHHHHH
Query LLINAvgVDDV..KQAD..............................emvKLATAVAHLI  108
ident   |                                                         
Sbjct AVIKGhfPREQalGWDQsmldyldrnrfdevypeiypiywsqaqmqarqsEEMANAQSFL  144
DSSP  EEEELllLHHHhhHHHHhhhhhhhhllhhhhlleeelllllhhhhhhhllHHHHHHHHHH


DSSP  E................eELLLlllllLLEEEEELLLllllLLLLEEEELLLL.......
Query G................rSNFDamsgqYYARFVVKNVylrqPHRVMELHNDGT.......  145
ident                   |                             | |         
Sbjct NrlwtfesdgkqwfnpdvSVIY.....PDRIRRRPPG...tTSKGLGAHTDSGalerwll  196
DSSP  HllllleelleelleeeeELLL.....LLLEEELLLL...lLLLLEEEEELLLllhhhhl


DSSP  ..................................LLLLLLLEEEEEEEEEellLLLLEEE
Query ..................................YVEEITDYVLMMKIDEqnmQGGNSLL  171
ident                                                        |    
Sbjct payqrvfanvfngnlaqydpwhaahrteveeytvKCSVFRTFQGWTALSDmlpGQGLLHV  256
DSSP  hhhhhhlhhhhlllhhhllllllllhhhllllllLLLLLLLEEEEEELLLlllLLLLEEE


DSSP  E.EHHHLLLHHHHHLLHH.....hhllEEELlllllllllleeelleeellllleeelll
Query L.HLDDWEHLDNYFRHPL.....arrpMRFAappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryi  225
ident                                                             
Sbjct VpIPEAMAYVLLRPLLDDvpedelcgvAPGR.............................  287
DSSP  LlLLLHHHHHHHHHHLLLlllllllllLLLL.............................


DSSP  llleelllhhhhhhhHHHHHHHHLllLLEEE.LLLLLLEEEEELlLEEEEELLLLLllLL
Query dqfvqpkdfeegvwlSELSDAIETskGILSV.PVPVGKFLLINNlFWLHGRDRFTPhpDL  284
ident                              |      |           |           
Sbjct ..........vlpvsEQWHPLLIE..ALTSIpKLEAGDSVWWHC.DVIHSVAPVEN.qQG  333
DSSP  ..........leellLLLLHHHHL..LLEELlLLLLLLEEEEEL.LLLEEELLLLL.lLL


DSSP  EEEEEEEEEEE..........................................lllllll
Query RRELMRQRGYF..........................................ayasnhy  302
ident     |                                                       
Sbjct WGNVMYIPAAPmceknlayahkvkaalekgaspgdfpredyetnwegrftladlnihgkr  393
DSSP  LLLEEELLLLEelhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllllhhhllhhhhh


DSSP  llll
Query qthq  306
ident     
Sbjct algm  397
DSSP  llll


No 9: 2FCTA  MOLECULE: SYRINGOMYCIN BIOSYNTHESIS ENZYME 2;                        

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllHHHH.HHHHHHLllLLEE.EEEE.lllLLHHHH.......................
Query canqLQPL.LLKTLLNraEGAL.LINA.vgvDDVKQA.......................   94
ident                    |      |                                 
Sbjct .kkfALTAeQRASFEK..NGFIgPFDAyspeEMKETWkrtrlrlldrsaaayqdldatni   57
DSSP  .lllLLLHhHHHHHHH..HLEEeEEELllhhHHHHHHhhhhhhhllllllllllllllhh


DSSP  ..............hhhHHHHHHHHHHHE...EELLLllllllLEEEEELllllllLLLL
Query ..............demVKLATAVAHLIG...RSNFDamsgqyYARFVVKnvylrqPHRV  137
ident                            |                  |             
Sbjct anydrhldddflashicRPEICDRVESILgpnVLCWR......TEFFPKY.....pGDEG  106
DSSP  hhllhhhllhhhhhhllLHHHHHHHHHHHlllEEEEE......EEEEEEL.....lLLLE


DSSP  EEEELLLL........LLLL......LLLEEEEEEEEEellLLLLEEEEEHhhlllhhhh
Query MELHNDGT........YVEE......ITDYVLMMKIDEqnmQGGNSLLLHLddwehldny  183
ident    |   |                                   |                
Sbjct TDWHQADTfanasgkpQIIWpeneefGGTITVWTAFTDaniANGCLQFIPG.........  157
DSSP  ELLLLLLLllllllllLEELllllllLLLEEEEEELLLlllLLLLEEEELL.........


DSSP  hllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleEELLL..................
Query frhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpVMRYI..................  225
ident                                                             
Sbjct ...................................tqNSMNYdetkrmtyepdannsvvk  182
DSSP  ...................................llLLLLLllllllllllllllllee


DSSP  ...........LLLEelllhhhhhhHHHHhhHHHLlLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEE
Query ...........DQFVqpkdfeegvwLSELsdAIETsKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHG  274
ident                                               | |         | 
Sbjct dgvrrgffgydYRQL........qiDENW..KPDE.ASAVPMQMKAGQFIIFWST.LMHA  230
DSSP  lleeeelllllHHHH........llLLLL..LLLH.HHLEEELLLLLEEEEEELL.LEEE


DSSP  ELLLLLLLLLEEEEEEEEEE........................................
Query RDRFTPHPDLRRELMRQRGY........................................  294
ident            |     |                                          
Sbjct SYPHSGESQEMRMGFASRYVpsfvhvypdsdhieeyggrislekygavqvigdetpeynr  290
DSSP  ELLLLLLLLLLEEEEEEEEEellleellllleeeelleeeelllllleeeelllllllll


DSSP  ..elllllllllll
Query ..fayasnhyqthq  306
ident               
Sbjct lvthttrgkkfeav  304
DSSP  llllllllllllll


No 10: 2YU1A  MOLECULE: JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION               

DSSP  .lllllleeeeellLLLLEEEEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhh
Query .gqdysgftltpsaQSPRLLELTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakildd   59
ident                                                             
Sbjct rtfdleeklhtnkyNANFVTFMEGK...................................   25
DSSP  llllhhhhhhllllLLLLLEELLHH...................................


DSSP  hllllHHHHH.hHHHHllllLEEEEEELL.....llLHHH....................
Query lcanqLQPLL.lKTLLnraeGALLINAVG.....vdDVKQ....................   93
ident               |       |             |                       
Sbjct ...dfNVEYIqrGGLR....DPLIFKNSDglgikmpDPDFtvndvkmcvgsrrmvdvmdv   78
DSSP  ...hlLHHHHhhHLLL....LLEEELLLLlllllllLLLLlhhhhhhhllllllllleel


DSSP  .......................................hhhhHHHHhHHHHHHEE....
Query .......................................ademVKLAtAVAHLIGR....  110
ident                                            |         |      
Sbjct ntqkgiemtmaqwtryyetpeeereklynvislefshtrlenmVQRP.STVDFIDWvdnm  137
DSSP  lllllllllhhhhhhhhlllllllllleeeeeelllllllhhhLLLL.HHHHHHLHhhhh


DSSP  ....ellllllLLLLEEEEELllllllLLLLEEEELLLlllllLLLEEEEEEEEEellll
Query ....snfdamsGQYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGtyveeITDYVLMMKIDEqnmqg  166
ident                                   | |          |            
Sbjct wprhlkemqypKVQKYCLMSV......RGCYTDFHVDF.....GGTSVWYHIHQG....g  182
DSSP  llhhhllllllLLLLEEEEEL......LLLEEEEELLH.....HHLEEEEEEEEL....l


DSSP  LLEEEEEHH.hLLLHhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelll
Query GNSLLLHLD.dWEHLdnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryi  225
ident     |         |                                             
Sbjct KVFWLIPPTahNLEL.............................................  197
DSSP  EEEEEELLLhhHHHH.............................................


DSSP  llleelllhhhHHHHHHhhHHHHL.LLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLllllll
Query dqfvqpkdfeeGVWLSElsDAIET.SKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFtphpdl  284
ident                                     |    |    | |           
Sbjct ......yenwlLSGSQG.dIFLGDrVSDCQRIELKQGYTFVIPSG.WIHAVYTP.....t  244
DSSP  ......hhhhhHLLLLL.lLLHHHhLLLLEEEEELLLLEEEELLL.LEEEEELL.....l


DSSP  EEEEEEEEEEELL...............................................
Query RRELMRQRGYFAY...............................................  297
ident                                                             
Sbjct DTLVFGGNFLHSFnipmqlkiyniedrtrvpnkfrypfyyemcwyvleryvycitnrshl  304
DSSP  LEEEEEEEELLLLlhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ....................LLLL...................................L
Query ....................ASNH...................................Y  302
ident                                                             
Sbjct tkefqkeslsmdleqvhlthFELEglrclvdkleslplhkkcvptgiededaliadvkiL  364
DSSP  lhhhhhhhhhhhlllllllhHHHHhhhhhhhhhhlllhhhlllllllllhhhhhhhhhhH


DSSP  LLL..................l
Query QTH..................q  306
ident                       
Sbjct LEElansdpklaltgvpivqwp  386
DSSP  HHHlllllhhhhllllllllll


No 11: 2OPWA  MOLECULE: PHYHD1 PROTEIN;                                            

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllHHHHHHHHHHLllLLEEEEEEllLLLH.HHHH........................
Query canqLQPLLLKTLLNraEGALLINAvgVDDV.KQAD........................   95
ident     | |  |        | |                                       
Sbjct ..acLSPSQLQKFQQ..DGFLVLEGflSAEEcVAMQqrigeivaemdvplhcrtefstqe   56
DSSP  ..llLLHHHHHHHHH..HLEEEELLllLHHHhHHHHhhhhhhhhlllllhhhllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   95
ident                                                             
Sbjct eeqlraqgstdyflssgdkirfffekgvfdekgnflvppeksinkighalhahdpvfksi  116
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllleeeeellllllllllllllhhhleeeeeelhhhhlhhhhhh


DSSP  hhhHHHHHHHHHHE...EELLLllllllLEEEEELllllllLLLLEEEELLLL..LLLLL
Query emvKLATAVAHLIG...RSNFDamsgqyYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGT..YVEEI  150
ident          |   |                                  | |    | |  
Sbjct thsFKVQTLARSLGlqmPVVVQ......SMYIFKQ....phFGGEVSPHQDASflYTEPL  166
DSSP  hllHHHHHHHHHHLlllEEEEE......EEEELLL....llLLLLEEEELHHHllLEELL


DSSP  .LLEEEEEEEEEellLLLLEEEEEHhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleee
Query .TDYVLMMKIDEqnmQGGNSLLLHLddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfh  209
ident                  |                                          
Sbjct gRVLGVWIAVEDatlENGCLWFIPG...................................  191
DSSP  lLEEEEEEELLLlllLLLLEEEELL...................................


DSSP  lleeellllleEELLLLlLEELLLhhhhhhhhhHHHHHhLLLLLEEELLLLLLEEEEELL
Query pvfdvdqqgrpVMRYIDqFVQPKDfeegvwlseLSDAIeTSKGILSVPVPVGKFLLINNL  269
ident                                     |          ||  |   ||   
Sbjct .........shTSGVSR.RMVRAP..pgtsflgSEPAR.DNSLFVPTPVQRGALVLIHGE  238
DSSP  .........llLLLLLE.EEEELL..lleeeeeLLLLL.LHHHLEEELLLLLLEEEEELL


DSSP  lEEEEELLLLLLllLEEEEEEEEEE..............elllllllllll
Query fWLHGRDRFTPHpdLRRELMRQRGY..............fayasnhyqthq  306
ident    |            |                                  
Sbjct .VVHKSKQNLSD..RSRQAYTFHLMeasgttwspenwlqptaelpfpqlyt  286
DSSP  .LEEEELLLLLL..LLLLEEEEEEEelllleelllllllllllllllllll


No 12: 2OQ6A  MOLECULE: JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION               

DSSP  lllllleeeeelllLLLEEEEEELHHHHhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqSPRLLELTFTEQTTkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident               | |      |                                    
Sbjct ...........lnpSARIMTFYPTMEEF................................   17
DSSP  ...........lllLLLLEEELLLHHHH................................


DSSP  llllhHHHHHHHHhlLLLL...EEEEEELL.LLLHH........................
Query canqlQPLLLKTLlnRAEG...ALLINAVG.VDDVK........................   92
ident                                                             
Sbjct ..rnfSRYIAYIE.sQGAHragLAKVVPPKeWKPRAsyddiddlvipapiqqlvtgqsgl   74
DSSP  ..llhHHHHHHHH.hLLHHhhlEEEELLLLlLLLLLlllllllleellleeeeeeeelle


DSSP  ...........................................................h
Query ...........................................................q   93
ident                                                             
Sbjct ftqyniqkkamtvrefrkiansdkyctprysefeelerkywknltfnppiygadvngtly  134
DSSP  eeeeeeellleehhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeellll


DSSP  hhhhhHHHHhhhHHHEE.......elLLLLlllLLEEEEElllllllLLLLEEEELLLll
Query ademvKLATavaHLIGR.......snFDAMsgqYYARFVVknvylrqPHRVMELHNDGty  146
ident                                                       |     
Sbjct ekhvdEWNI.grLRTILdlvekesgiTIEG.vnTPYLYFG......mWKTSFAWHTED..  184
DSSP  lllllLLLL.llLLLHHhhhhhhhllLLLL.llLLEEEEE......lLLLEEEEELLH..


DSSP  lllLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHHL.LLHHHHHL..LHHHHLleeellllllll
Query veeITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDDW.EHLDNYFR..HPLARRpmrfaappsknv  203
ident       |                                      |              
Sbjct ...MDLYSINYLHFG...epKSWYSVPPEHGkRLERLAKGffPGSAQS............  226
DSSP  ...HHLEEEEEEEEE...llEEEEEELHHHHhHHHHHHHHhlHHHHHH............


DSSP  llleeELLEeellllleeeLLLLlleelllhhhhhhhhhhhhhHHLL.......LLLEEE
Query skdvfHPVFdvdqqgrpvmRYIDqfvqpkdfeegvwlselsdaIETS.......KGILSV  256
ident         |          |                                       |
Sbjct .....CEAF.........lRHKM...................tLISPlmlkkygIPFDKV  253
DSSP  .....LLLH.........hHHLL...................eEELHhhhhhllLLLEEE


DSSP  LLLLLLEEEEELLlEEEEELLLLlllllEEEEEEEEEEELL...................
Query PVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFTphpdlRRELMRQRGYFAY...................  297
ident     | |         |                                           
Sbjct TQEAGEFMITFPY.GYHAGFNHG.....FNCAESTNFATRRwieygkqavlcscrkdmvk  307
DSSP  EELLLLEEEELLL.LEEEEEELL.....LEEEEEEEELLLLhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ........lLLLL.LLLL.......................
Query ........aSNHY.QTHQ.......................  306
ident                                          
Sbjct ismdvfvrkFQPErYKLWkagkdntvidhtlptpeaaeflk  348
DSSP  lllhhhhhhHLHHhHHHHhllllllllllllllhhhhhhhl


No 13: 2HJIA  MOLECULE: E-2/E-2' PROTEIN;                                          

DSSP  ............lllllleeEEELlllLLEEeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllh
Query ............gqdysgftLTPSaqsPRLLeltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksf   48
ident                              |                              
Sbjct saltifsvkdpqnslwhstnAEEI..qQQLN.............................   29
DSSP  leeeeeelllllllleeellHHHH..hHHHH.............................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEllLLLHH.........hHHHHHH
Query lrfrvakilddlcanqlqplllktllnrAEGALLINAvgVDDVK.........qADEMVK   99
ident                             | |          |                  
Sbjct ............................AKGVRFERW..QADRDlgaaptaetvIAAYQH   59
DSSP  ............................LLLLEEELL..LLLLLllllllhhhhHHHLHH


DSSP  HHHHHHHhHEEELlllllllLLEEEEELL....LLLLLllLLEEEELLlllllllLLEEE
Query LATAVAHlIGRSNfdamsgqYYARFVVKN....VYLRQphRVMELHNDgtyveeiTDYVL  155
ident                                              |              
Sbjct AIDKLVA.EKGYQ.......SWDVISLRAdnpqKEALR.eKFLNEHTH.......GEDEV  103
DSSP  HHHHHLL.LLLLL.......LEEELLLLLlllhHHHHH.hHHLLLLLL.......LLLLE


DSSP  EEEEEEellllLLEEEEEHhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeel
Query MMKIDEqnmqgGNSLLLHLddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvd  215
ident            |   |                                            
Sbjct RFFVEG....aGLFCLHIG.........................................  118
DSSP  EEEEEL....eEEEEEELL.........................................


DSSP  lllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEE
Query qqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietsKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGR  275
ident                                         |                |  
Sbjct ...................................DEVFQVLCEKNDLISVPAH.TPHWF  142
DSSP  ...................................LEEEEEEEELLLEEELLLL.LLEEE


DSSP  LLLLLlllLEEEEEEEEeeelllllllllll
Query DRFTPhpdLRRELMRQRgyfayasnhyqthq  306
ident |             |                
Sbjct DMGSE...PNFTAIRIF..............  156
DSSP  ELLLL...LLLEEEEEL..............


No 14: 1MZEA  MOLECULE: FACTOR INHIBITING HIF1;                                    

DSSP  ............lllllleeeeellllllEEEEEElhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllh
Query ............gqdysgftltpsaqsprLLELTFteqttkqfleqvaewpvqaleyksf   48
ident                                 |                           
Sbjct sgepreeagalgpawdesqlrsysfptrpIPRLSQ.........................   35
DSSP  llllleelllleelllhhhllllllleeeLLEELL.........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhHHHHHHHHLllLLEEEEEE..llLLLHHH.............
Query lrfrvakilddlcanqlqPLLLKTLLNraEGALLINA..vgVDDVKQ.............   93
ident                   |       |  |               |              
Sbjct ................sdPRAEELIEN..EEPVVLTDtnlvYPALKWdleylqenigngd   77
DSSP  ................llHHHHHHHHL..LLLEEELLllllHHHHHLlhhhhhhhlllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   93
ident                                                             
Sbjct fsvysasthkflyydekkmanfqnfkprsnreemkfhefveklqdiqqrggeerlylqqt  137
DSSP  eeeeeelllllllllhhhhhhlllllllleeeeeehhhhhhhhhhhhhllllleeeeeee


DSSP  ............hHHHHHhhhHHHHHHE......EELLlllllllLEEEEELllllllLL
Query ............aDEMVKlatAVAHLIG......RSNFdamsgqyYARFVVKnvylrqPH  135
ident                                                             
Sbjct lndtvgrkivmdfLGFNW...NWINKQQgkrgwgQLTS.......NLLLIGM......EG  181
DSSP  llllllhhhhhhhHLLLH...HHHHHHHhhhlllLEEE.......EEEEEEL......LL


DSSP  LLEEEELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHhLLLHhhhhllhhhhllEEE
Query RVMELHNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDdWEHLdnyfrhplarrpMRF  195
ident  |   | |               |           |   |                    
Sbjct NVTPAHYDE.......QQNFFAQIKG....yKRCILFPPD.QFEC.......lypypVHH  222
DSSP  LEEEEELLL.......LEEEEEEEEL....lEEEEEELHH.HHHH.......hllllLLL


DSSP  LlllllllllleeelleeellllleeeLLLLlleelllhhhhhhhhhHHHH.........
Query AappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmRYIDqfvqpkdfeegvwlseLSDA.........  246
ident                                                  |          
Sbjct P.........................cDRQS................QVDFdnpdyerfp  241
DSSP  L.........................lLLLL................LLLLllllllllh


DSSP  hhllLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLLLlllLEEEEEEEEEEELllLLLL....
Query ietsKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFTPhpdLRRELMRQRGYFAyaSNHY....  302
ident            |  |  | |    | |                      |     |    
Sbjct nfqnVVGYETVVGPGDVLYIPMY.WWHHIESLLN..gGITITVNFWYKGAptPIEYplka  298
DSSP  hhhhLLEEEEEELLLLEEEELLL.LEEEEEELLL..lLLEEEEEEEELLLllLLLLlllh


DSSP  .................................llll
Query .................................qthq  306
ident                                      
Sbjct hqkvaimrniekmlgealgnpqevgpllntmikgryn  335
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlllll


No 15: 2FD8A  MOLECULE: ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB;                         

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEE..EELLLllHHHH........................
Query canqlqplllktllnraEGALLI..NAVGVddVKQA........................   94
ident                   ||      |       |                         
Sbjct ...............laAGAVILrrFAFNA..AEQLirdindvasqspfrqmvtpggytm   43
DSSP  ...............llLLEEEEllLLLLL..HHHHhhhhhhhhllllllllllllllll


DSSP  ....................................hHHHHHHHHHHH....HHEEELll
Query ....................................dEMVKLATAVAH....LIGRSNfd  114
ident                                          |    |             
Sbjct svamtncghlgwtthrqgylyspidpqtnkpwpampqSFHNLCQRAATaagyPDFQPD..  101
DSSP  lleeeeeelleeeelllleeeellllllllllllllhHHHHHHHHHHHhhllLLLLLL..


DSSP  lllllLLEEEEELlllllllllLEEEELLLLllLLLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEEH
Query amsgqYYARFVVKnvylrqphrVMELHNDGTyvEEITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHL  174
ident                          || |                              |
Sbjct .....ACLINRYA......pgaKLSLHQDKD.ePDLRAPIVSVSLGL....pAIFQFGGL  145
DSSP  .....EEEEEEEL......lllLEEEELLLL.lLLLLLLEEEEEEEL....lEEEEELLL


DSSP  hhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllh
Query ddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdf  234
ident                                                             
Sbjct ............................................................  145
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhHHLLlLLEEELLLLLLEEEEE..lLLEEEEELLLLLLL....LLEEEE
Query eegvwlselsdaIETSkGILSVPVPVGKFLLIN..nLFWLHGRDRFTPHP....DLRREL  288
ident                           |             ||               |  
Sbjct ............KRND.PLKRLLLEHGDVVVWGgesRLFYHGIQPLKAGFhpltIDCRYN  192
DSSP  ............LLLL.LLEEEEELLLLEEEELhhhHHLLEEELLLLLLLllllLLLEEE


DSSP  EEEEEeelllllllllll
Query MRQRGyfayasnhyqthq  306
ident    |              
Sbjct LTFRQ...........ag  199
DSSP  EEEEL...........ll


No 16: 1VR3A  MOLECULE: ACIREDUCTONE DIOXYGENASE;                                  

DSSP  lllllleeeeeLLLL......................LLEEeeeelhhhhhhhhhhhlll
Query gqdysgftltpSAQS......................PRLLeltfteqttkqfleqvaew   38
ident             |                          |                    
Sbjct .........xvQAWYxdestadprkphraqpdrpvslEQLR...................   32
DSSP  .........llEEEElllllllllllllllllllllhHHHH...................


DSSP  lhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllLLLEEEEEellLLLHhHHHHhh
Query pvqaleyksflrfrvakilddlcanqlqplllktllnrAEGALLINavgVDDVkQADEmv   98
ident                                         | |       |         
Sbjct ......................................TLGVLYWK...LDAD.KYEN.d   49
DSSP  ......................................HLLLEEEE...LLHH.HLLL.l


DSSP  HHHHHHHHHhEEELlllllllLLEEEEELLL.....LLLLllLLEEEELLLlllllllLE
Query KLATAVAHLiGRSNfdamsgqYYARFVVKNV.....YLRQphRVMELHNDGtyveeitDY  153
ident                                              | |          | 
Sbjct PELEKIRKX.RNYS.......WXDIITICKDtlpnyEEKI.kXFFEEHLHL.......DE   93
DSSP  HHHHHHHHH.HLLL.......EEEEEEELLLllllhHHHH.hHHHLLEELL.......LL


DSSP  EEEEEEEEellllLLEEEEeHHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeellee
Query VLMMKIDEqnmqgGNSLLLhLDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfd  213
ident              |                                              
Sbjct EIRYILEG....sGYFDVR.DKED....................................  112
DSSP  EEEEEEEE....eEEEEEE.LLLL....................................


DSSP  ellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLLEEEEELLlEEE
Query vdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPVGKFLLINNLfWLH  273
ident                                                |           |
Sbjct ......................................KWIRISXEKGDXITLPAG.IYH  133
DSSP  ......................................LEEEEEEELLEEEEELLL.LLE


DSSP  EELLLLllllLEEEEEEEEE................eelllllllllll
Query GRDRFTphpdLRRELMRQRG................yfayasnhyqthq  306
ident                 |                                
Sbjct RFTLDE...kNYVKAXRLFVgepvwtpynrpadhfdarvqyxsflegta  179
DSSP  EEEELL...lLLEEEEEEELllllllleellllllhhhhhhhhhhhhll


No 17: 2IUWA  MOLECULE: ALKYLATED REPAIR PROTEIN ALKB HOMOLOG 3;                   

DSSP  lllllleeeeeLLLLllEEEEeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpSAQSprLLELtfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                    |                                        
Sbjct .........shMRVI..DREG.......................................   10
DSSP  .........llEEEL..LLLE.......................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlLLLLEEEEEE...LLLLL..HHHH.....................
Query canqlqplllktllnRAEGALLINA...VGVDD..VKQA.....................   94
ident                      |      |   |    |                      
Sbjct ......vyeislsptGVSRVCLYPGfvdVKEADwiLEQLcqdvpwkqrtgiredityqqp   64
DSSP  ......eeeeellllLLEEEEEELLlllHHHHHhhHHHHhhhlllllleeelllleeell


DSSP  ........................hhhHHHHHHHHHH..HEEELlllllllLLEEEEELl
Query ........................demVKLATAVAHL..IGRSNfdamsgqYYARFVVKn  128
ident                                            |                
Sbjct rltawygelpytysritmepnphwhpvLRTLKNRIEEntGHTFN.......SLXCNLYR.  116
DSSP  leeeeeelllllllhhhhlllllllhhHHHHHHHHHHhhLLLLL.......EEEEEEEL.


DSSP  lllllLLLLEEEELLLLLLlLLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHhlllhhhhhllhh
Query vylrqPHRVMELHNDGTYVeEITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDdwehldnyfrhpl  188
ident             | |                                             
Sbjct ....nEKDSVDWHSDDEPSlGRCPIIASLSFGA....tRTFEMRKKP.............  155
DSSP  ....lLLLLEEEELLLLHHhLLLLLEEEEEEEL....lEEEEEEELL.............


DSSP  hhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhh
Query arrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaie  248
ident                                                             
Sbjct ............................................................  155
DSSP  ............................................................


DSSP  llLLLEEELLLLLLEEEEE...LLLEEEEELLLLLLllLEEEEEEEEEeellllllllll
Query tsKGILSVPVPVGKFLLIN...NLFWLHGRDRFTPHpdLRRELMRQRGyfayasnhyqth  305
ident         |   |  |         | |            |     |             
Sbjct pyVERVKIPLDHGTLLIMEgatQADWQHRVPKEYHS.rEPRVNLTFRT..........vy  204
DSSP  llLLEEEEEELLLLEEEEEelhHHHEEEEELLLLLL.lLLEEEEEEEL..........ll


DSSP  l
Query q  306
ident  
Sbjct p  205
DSSP  l


No 18: 1VRBA  MOLECULE: PUTATIVE ASPARAGINYL HYDROXYLASE;                          

DSSP  lllllleeeeelllllleeeEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleLTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ................vlesIISP....................................    8
DSSP  ................llhhHHLL....................................


DSSP  llllHHHHHH.HHHHlllLLEEEEEelLLLLhhhhhHHHHH...................
Query canqLQPLLL.KTLLnraEGALLINavGVDDvkqadEMVKL...................  100
ident          |           |     |                                
Sbjct ...vTXSEFLeEYWP...VKPLVAR..GEVE.....RFTSIpgfekvrtlenvlaiynnp   55
DSSP  ...lLHHHHHhHLLL...LLLEEEL..LLHH.....HHHHLlllhhhllhhhhhhhllll


DSSP  .....................................hhhhhHHHE.....EELLlllll
Query .....................................atavaHLIG.....RSNFdamsg  118
ident                                                     |       
Sbjct vxvvrflvspaealewyekgaalefdftdlfipqvrrwieklKAELrlpagTSSK.....  110
DSSP  eeelleeelhhhhhhhhhlllleeellhhhlllhhhhhhhhhHHHLlllllLLEE.....


DSSP  llLEEEEELLLllllllllEEEELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHhll
Query qyYARFVVKNVylrqphrvMELHNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDdwe  178
ident         ||            | |           |   |           |       
Sbjct ..AIVYAAKNG......ggFKAHFDA.......YTNLIFQIQG....eKTWKLAKNE...  148
DSSP  ..EEEEEELLL......llLLLEELL.......LEEEEEEEEL....lEEEEEELLL...


DSSP  lhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeelllllEEEL...LLLLlEELLlhh
Query hldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrPVMR...YIDQfVQPKdfe  235
ident                                                 |           
Sbjct ........................................nVSNPxqhYDLS.YPDD...  164
DSSP  ........................................lLLLLlllEELL.LLHH...


DSSP  hhhhhhhhhhHHHL.LLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELlllllllLEEEEEEEEEE
Query egvwlselsdAIET.SKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDrftphpdLRRELMRQRGY  294
ident                      |    |  |        |                     
Sbjct ..lqsywkgdPPKEdLPDAEIVNLTPGTXLYLPRG.LWHSTK.....sdQATLALNITFG  216
DSSP  ..hhhhllllLLLLlLLLLEEEEELLLLEEEELLL.LEEEEE.....llLLEEEEEEEEL


DSSP  E...................................................llllllLL
Query F...................................................ayasnhYQ  303
ident                                                             
Sbjct QpawldlxlaalrkklisdnrfrelavnhqslhesskselngylesliqtlsenaetlTP  276
DSSP  LllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLH


DSSP  LL.......................l
Query TH.......................q  306
ident                           
Sbjct EQifqsqdsdfdpyqstqlvfrqllt  302
DSSP  HHhhllllllllhhhhhhhhhhhhhl


No 19: 1JOPA  MOLECULE: YHCH PROTEIN;                                              

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllEEEEE.ELLLllhhhhhhhhhhhhHHHHH.......heeel
Query canqlqplllktllnraegALLIN.AVGVddvkqademvklatAVAHL.......igrsn  112
ident                                             |               
Sbjct ...................MIISSlTNPN........fkvglpKVIAEvcdylntldlna   33
DSSP  ...................LEEEElLLLL........llllllHHHHHhhhhhhhllhhh


DSSP  lllLLLL.....LLEEEEEllllllllllleEEELLLllllllLLEEEEEEEEEellllL
Query fdaMSGQ.....YYARFVVknvylrqphrvmELHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqgG  167
ident             |                                      |        
Sbjct lenGRHDindqiYMNVMEP............KAELHH......EYLDVQVLIRG....tE   71
DSSP  lllEEEElllllEEEEELL............LEEELL......LEEEEEEEEEL....lE


DSSP  LEEEEEHHhllLHHHhhllhhhhlleeellllllllllleeeLLEEellllleeeLLLLl
Query NSLLLHLDdweHLDNyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhPVFDvdqqgrpvmRYIDq  227
ident |           |                                               
Sbjct NIEVGATY..pNLSK.........................yeDYNE......addYQLC.   97
DSSP  EEEELLLL..lLHHH.........................llLLLL......lllLEEE.


DSSP  leelllhhhhhhhhhhhhhHHLLlLLEEELLLLLLEEEEELlLEEEEELLLlllllleEE
Query fvqpkdfeegvwlselsdaIETSkGILSVPVPVGKFLLINNlFWLHGRDRFtphpdlrRE  287
ident                             |      |         |              
Sbjct ...................ADID.DKFTVTMKPKMFAVFYP.YEPHKPCCV.......IK  129
DSSP  ...................LLLL.LLEEEEELLLEEEEELL.LLLEEEEEL.......LE


DSSP  EEEEEEEELllllllllll
Query LMRQRGYFAyasnhyqthq  306
ident                    
Sbjct KLVVKVPVK........li  140
DSSP  EEEEEEEHH........hl


No 20: 1BK0A  MOLECULE: ISOPENICILLIN N SYNTHASE;                                  

DSSP  lllllleeeeellLLLLEEEEEElhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHH
Query gqdysgftltpsaQSPRLLELTFteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDL   60
ident                                                           | 
Sbjct ...........svSKANVPKIDV..............................splFGDD   19
DSSP  ...........llLLLLLLEEEL..............................hhhHLLL


DSSP  LLLL..HHHHHHHHHHLllLLEEEEEELLLLLHH..........................
Query CANQ..LQPLLLKTLLNraEGALLINAVGVDDVK..........................   92
ident  |                  |       |                               
Sbjct QAAKmrVAQQIDAASRD..TGFFYAVNHGINVQRlsqktkefhmsitpeekwdlairayn   77
DSSP  HHHHhhHHHHHHHHHHL..LLEEEEELLLLLHHHhhhhhhhhhhhllhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   92
ident                                                             
Sbjct kehqdqvragyylsipgkkavesfcylnpnftpdhpriqaktpthevnvwpdetkhpgfq  137
DSSP  llllllllleeellllllllleeeeelllllllllhhhhlllllllllllllllllllhh


DSSP  .....HHHHHHHHHHHHHHHHE.........eellllllLLLLEEEEELLL.......LL
Query .....QADEMVKLATAVAHLIG.........rsnfdamsGQYYARFVVKNV.......YL  131
ident             |  |                                            
Sbjct dfaeqYYWDVFGLSSALLKGYAlalgkeenffarhfkpdDTLASVVLIRYPyldpypeAA  197
DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllhhhllllLLLLEEEEEEELllllllhHH


DSSP  LL.....lLLLEEEELLLlllllllleEEEEEeeeelllLLLEEEEeHHHLllhhhhhll
Query RQ.....pHRVMELHNDGtyveeitdyVLMMKideqnmqGGNSLLLhLDDWehldnyfrh  186
ident             | | |                        |                  
Sbjct IKtaadgtKLSFEWHEDV.......slITVLY....qsnVQNLQVE.TAAG.........  236
DSSP  LEelllllEEEEEEELLL.......llEEEEE....ellLLLEEEE.ELLE.........


DSSP  hhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhh
Query plarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsda  246
ident                                                             
Sbjct ............................................................  236
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllLEEE.LLLLlLEEEEEL...........LLEEEEELLLLLLllLEEEEEEE...
Query ietskgILSV.PVPVgKFLLINN...........LFWLHGRDRFTPHpdLRRELMRQ...  291
ident                   |                   |                     
Sbjct ......YQDIeADDT.GYLINCGsymahltnnyyKAPIHRVKWVNAE..RQSLPFFVnlg  287
DSSP  ......EEELlLLLL.LEEEEELhhhhhhlllllLLLLEEEELLLLL..EEEEEEEElll


DSSP  ...eeeellLLLLL........................llll
Query ...rgyfayASNHY........................qthq  306
ident                                           
Sbjct ydsvidpfdPREPNgksdreplsygdylqnglvslinkngqt  329
DSSP  lllllllllLLLLLlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 21: 2PA7A  MOLECULE: DTDP-6-DEOXY-3,4-KETO-HEXULOSE ISOMERASE;                  

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllEEEEEELLlllhhhhhHHHHHhhHHHHhhEEELlllllllL
Query canqlqplllktllnraegALLINAVGvddvkqadEMVKLatAVAHliGRSNfdamsgqY  120
ident                       ||                                    
Sbjct ..................eNKVINFKK.iidsrgsLVAIEenKNIP..FSIK.......R   32
DSSP  ..................lLLEEELLE.eeelleeEEEEEllLLLL..LLLL.......E


DSSP  LEEEEELllllLLLLlLEEEELLLllllllLLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHhlllh
Query YARFVVKnvylRQPHrVMELHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDdwehl  180
ident                     |                             |         
Sbjct VYYIFDT....KGEE.PRGFHAHK......KLEQVLVCLNG....sCRVILDDGN.....   72
DSSP  EEEEELL....LLLL.LEEEEEEL......LLLEEEEEEEL....lEEEEEELLL.....


DSSP  hhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhh
Query dnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwl  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................   72
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllLLEEELLLLL.LEEEEELlLEEEEELLllllllLEEEEEEEEEE.....
Query selsdaietskGILSVPVPVG.KFLLINNlFWLHGRDRftphpdLRRELMRQRGY.....  294
ident             |           |        |               |          
Sbjct ...........IIQEITLDSPaVGLYVGP.AVWHEMHD....fsSDCVMMVLASDyydet  116
DSSP  ...........LEEEEEELLLlEEEEELL.LLEEEEEL....llLLLEEEEEELLlllhh


DSSP  .......elllllllllll
Query .......fayasnhyqthq  306
ident                    
Sbjct dyirqydnfkkyiakinle  135
DSSP  heellhhhhhhhhhhhhhl


No 22: 2IXHA  MOLECULE: DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      

DSSP  llllLLEEEEELllLLLEeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdySGFTLTPSaqSPRLleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident     |                                                       
Sbjct ....SMAMKATR..LAIP..........................................   12
DSSP  ....LLLEEEEE..LLLL..........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllLEEEEEELLlllhhhhhhhhHHHHH.....hhhHHEEELlll
Query canqlqplllktllnraeGALLINAVGvddvkqademvKLATA.....vahLIGRSNfda  115
ident                      |                                      
Sbjct ..................DVILFEPRV..fgddrgfffESYNQrafeeacgHPVSFV...   49
DSSP  ..................LLEEEEELL..eeelleeelLLLLHhhhhhhhlLLLLLL...


DSSP  llllLLEEEEELllllllLLLLEEEELLLLllllLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEE..
Query msgqYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGTyveeITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH..  173
ident                         ||             |                    
Sbjct ....QDNHSRSA......RGVLRGLHYQIR....QAQGKLVRATLG....eVFDVAVDlr   91
DSSP  ....EEEEEEEE......LLLEEEEEEELL....LLLLEEEEEEEL....eEEEEEEEll


DSSP  ..HHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleel
Query ..LDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqp  231
ident                                                             
Sbjct rgSPTF......................................................   97
DSSP  llLLLL......................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLL..LLEEEEELLlEEEEELlllllllLEEEEE
Query kdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPV..GKFLLINNLfWLHGRDrftphpdLRRELM  289
ident                                     |      ||            |  
Sbjct ...................gQWVGERLSAenKRQMWIPAG.FAHGFV....vlsEYAEFL  133
DSSP  ...................lLEEEEEEELllLLEEEELLL.EEEEEE....ellLEEEEE


DSSP  EEEEE..................................elllllllllll
Query RQRGY..................................fayasnhyqthq  306
ident                                                    
Sbjct YKTTDfwapehercivwndpelkidwplqdapllsekdrqgkafadadcfp  184
DSSP  EEELLlllhhheeelllllllllllllllllllllhhhhllllhhhlllll


No 23: 1WLTA  MOLECULE: 176AA LONG HYPOTHETICAL DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,          

DSSP  lllllleeeeellllLLEEeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsPRLLeltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                  |                                          
Sbjct ..........mpfefENLG.........................................    9
DSSP  ..........lleeeEEEE.........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEEEELLlllhhhhhhhhHHHHH.HHHH..HEEELlllll
Query canqlqplllktllnraEGALLINAVGvddvkqademvKLATA.VAHL..IGRSNfdams  117
ident                   |  ||                           |         
Sbjct .................MGIILIKPKV..fpdkrgfflEVFKSeDFTKmrIPNVI.....   45
DSSP  .................LLEEEEEELL..eeelleeeeEEEEHhHHHHllLLLEE.....


DSSP  llLLEEEEELllllllLLLLEEEELlLLLLllLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEE....
Query gqYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNdGTYVeeITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH....  173
ident                    |  ||                                    
Sbjct ..QTNMSFSR......KGVVRGLHY.QRTP..KEQGKIIFVPKG....rILDVAVDvrks   90
DSSP  ..EEEEEEEL......LLLEEEEEE.ELLL..LLLEEEEEEEEL....eEEEEEEEllll


DSSP  ..HHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleel
Query ..LDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqp  231
ident                                                             
Sbjct spTFGK......................................................   96
DSSP  llLLLL......................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLL..LLEEEEELLlEEEEELllllllllEEEEE
Query kdfeegvwlselsdaietskgILSVPVPV..GKFLLINNLfWLHGRDrftphpdlRRELM  289
ident                                   | |      ||               
Sbjct .....................YVKAELNEenHYMLWIPPG.FAHGFQ.....aleDSIVI  129
DSSP  .....................EEEEEEELllLLEEEELLL.EEEEEE.....ellLEEEE


DSSP  EEEEE..............................elllllllllll
Query RQRGY..............................fayasnhyqthq  306
ident                                                
Sbjct YFITHneyspphercisysyidwpikeviisdkdlqcpslekaevfd  176
DSSP  EEEELllllhhheeellhhhlllllllllllhhhhllllllllllll


No 24: 2O8QA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlLLLLEEEEEELLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhheeellllLLLL.
Query canqlqplllktllnRAEGALLINAVGvddvkqademvklatavahligrsnfdaMSGQ.  119
ident                                                          |  
Sbjct ..............gXKLQTTIQHEPK..............dgsgfdrreffeyrDTGVn   32
DSSP  ..............lLLLLLEEELLLL..............lllllllllleeeeELLHh


DSSP  .......LLEEEEELLlllllllllEEEELLLllllllLLEEEEEEEEEellllLLEEEE
Query .......YYARFVVKNvylrqphrvMELHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLL  172
ident                             |             |                 
Sbjct eatggxfGAHVIRAIP.........PTWHTHT......VGFQLFYVLRG....wVEFEYE   73
DSSP  hhhllllEEEEEEELL.........LLLEEEL......LLLEEEEEEEL....eEEEEEL


DSSP  Ehhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleell
Query Hlddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpk  232
ident                                                             
Sbjct D...........................................................   74
DSSP  L...........................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLlllllLEEEEEEEE
Query dfeegvwlselsdaietskgILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFtphpdLRRELMRQR  292
ident                     |  |    |           |   |         |     
Sbjct ....................IGAVXLEAGGSAFQPPG.VRHRELRH....sDDLEVLEIV  109
DSSP  ....................LEEEEEELLLEEELLLL.LLEEEEEE....lLLLEEEEEE


DSSP  EEelllllllllll
Query GYfayasnhyqthq  306
ident               
Sbjct SP.agfatsvvdle  122
DSSP  LL.lllleeellll


No 25: 1W9YA  MOLECULE: 1-AMINOCYCLOPROPANE-1-CARBOXYLATE OXIDASE 1;               

DSSP  lllllleeeeellllLLEEEEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHH
Query gqdysgftltpsaqsPRLLELTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDL   60
ident                                                             
Sbjct ...............ENFPIISLD................................KVNG   13
DSSP  ...............LLLLEEEHH................................HHHL


DSSP  .LLLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEE.ELLL..LLHH........................
Query .CANQLQPLLLKTLLNraEGALLIN.AVGV..DDVK........................   92
ident                |   |                                        
Sbjct vERAATXEXIKDACEN..WGFFELVnHGIPreVXDTvekxtkghykkcxeqrfkelvask   71
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHH..LLEEEEElLLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................HHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............................................QADEMVKLATAVAHLI  108
ident                                              |    |||     | 
Sbjct alegvqaevtdxdwestfflkhlpisnisevpdldeeyrevxrdFAKRLEKLAEELLDLL  131
DSSP  hhllllllhhhlllleeeeeeeelllhhhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  E..........eeLLLLllLLLLEEEEELllllLLLL......lleEEELLLllllllll
Query G..........rsNFDAmsGQYYARFVVKnvylRQPH......rvmELHNDGtyveeitd  152
ident               |    |      |        |            | |         
Sbjct CenlglekgylknAFYGskGPNFGTKVSN....YPPCpkpdlikglRAHTDA.......g  180
DSSP  HhhhlllllhhhhHHHLllLLEEEEEEEE....LLLLllhhhhlllLLLLLL.......l


DSSP  eEEEEEeeeelllLLLEEEEEHHhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelle
Query yVLMMKideqnmqGGNSLLLHLDdwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvf  212
ident                   ||                                        
Sbjct gIILLF...qddkVSGLQLLKDG.....................................  200
DSSP  lEEEEE...elllLLLEEEEELL.....................................


DSSP  eellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEE.LLLLlLEEEEEL...
Query dvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskGILSV.PVPVgKFLLINN...  268
ident                                            | |              
Sbjct .......................................QWIDVpPXRH.SIVVNLGdql  220
DSSP  .......................................EEEELlLLLL.LEEEEELhhh


DSSP  ........LLEEEEELLLLllllLEEEEEEEE......eeelllLLLL............
Query ........LFWLHGRDRFTphpdLRRELMRQR......gyfayaSNHY............  302
ident             |                                               
Sbjct evitngkyKSVXHRVIAQK.dgaRXSLASFYNpgsdaviypapaLVQVypkfvfddyxkl  279
DSSP  hhhlllllLLLLEEELLLL.lllLEEEEEEEEllllleelllhhHLLLllleehhhhhhl


DSSP  ...............llll
Query ...............qthq  306
ident                    
Sbjct yaglkfqakeprfeaxkax  298
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhl


No 26: 1EP0A  MOLECULE: DTDP-6-DEOXY-D-XYLO-4-HEXULOSE 3,5-EPIMERASE;              

DSSP  lllllleeeeelllLLLEeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqSPRLleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                  |                                          
Sbjct .........efrfiKTSL..........................................    9
DSSP  .........leeeeELLL..........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEEEELLlllhhhhhhhhHHHHH.HHHH...HEEELllll
Query canqlqplllktllnraEGALLINAVGvddvkqademvKLATA.VAHL...IGRSNfdam  116
ident                   ||  |                              |      
Sbjct .................DGAIIIEPEV..ytdergyfmETFNEaIFQEnglEVRFV....   46
DSSP  .................LLLEEEEELE..eeelleeeeLLLLHhHHHHlllLLLLL....


DSSP  lllLLEEEEELllllllLLLLEEEELLLLllllLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEE...
Query sgqYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGTyveeITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH...  173
ident                        ||             |   |                 
Sbjct ...QDNESMSV......RGVLRGLHFQRE....KPQGKLVRVIRG....eIFDVAVDlrk   89
DSSP  ...EEEEEEEE......LLLEEEEEEELL....LLLLEEEEEEEL....eEEEEEEElll


DSSP  ...HHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeellllllee
Query ...LDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvq  230
ident                                                             
Sbjct nsdTYGE.....................................................   96
DSSP  lllLLLL.....................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLL..LLEEEEELLlEEEEELLLlllllLEEEE
Query pkdfeegvwlselsdaietskgILSVPVPV..GKFLLINNLfWLHGRDRFtphpdLRREL  288
ident                          |           |      ||              
Sbjct ......................WTGVRLSDenRREFFIPEG.FAHGFLAL....sDECIV  129
DSSP  ......................EEEEEEELllLLEEEELLL.EEEEEEEL....lLEEEE


DSSP  EEEEEE....................................elllllllllll
Query MRQRGY....................................fayasnhyqthq  306
ident                                                       
Sbjct NYKCTElyhpeydsgipwddpdigidwplemvddliisekdrnwkplrenpvyl  183
DSSP  EEEELLlllhhheeelllllllllllllhhhlllllllhhhhllllllllllll


No 27: 2IXLA  MOLECULE: DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      

DSSP  lllllleeeeelllLLLEeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqSPRLleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct .tenffgktlaarpVEAI..........................................   17
DSSP  .llllllllleeeeLLLL..........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEEEELL..lllhHHHHhHHHH...hhhhHHHHEEellll
Query canqlqplllktllnraEGALLINAVG..vddvKQADeMVKL...atavAHLIGRsnfda  115
ident                   | |                                       
Sbjct .................PGMLEFDIPVhgdnrgWFKE.NFQKekmlplgFPESFF....a   55
DSSP  .................LLLEEEELLEeeelleEEEE.EEEHhhhhhhlLLHHHH....l


DSSP  llllLLEEEEELllllllLLLLEEEELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEEE..
Query msgqYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH..  173
ident                         ||                  |               
Sbjct egklQNNVSFSR......KNVLRGLHAEP.......WDKYISVADG...gkVLGTWVDlr   99
DSSP  llllEEEEEEEE......LLLEEEEEELL.......LLEEEEELLL...llEEEEEEEll


DSSP  ...HHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeellllllee
Query ...LDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvq  230
ident                                                             
Sbjct egeTFGN.....................................................  106
DSSP  lllLLLL.....................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLlllllLEEEEEE
Query pkdfeegvwlselsdaietskgILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFtphpdLRRELMR  290
ident                                |           |                
Sbjct ......................TYQTVIDASKSIFVPRG.VANGFQVL....sDFVAYSY  139
DSSP  ......................EEEEEELLLEEEEELLL.EEEEEEEL....lLEEEEEE


DSSP  EEEE.........................................elllllllllll
Query QRGY.........................................fayasnhyqthq  306
ident                                                          
Sbjct LVNDywalelkpkyafvnyadpsldikwenleeaevseadenhpflkdvkplrkedl  196
DSSP  EELLlllhhhhhhleelllllllllllllllllllllhhhhhlllhhhlllllhhhl


No 28: 1UPIA  MOLECULE: DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;                      

DSSP  lllllleeeeellllLLEEeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsPRLLeltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                  |                                          
Sbjct ............mkaRELD.........................................    7
DSSP  ............leeEELL.........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEEEELLlllhhhhhhhhHHHHH.HHHH....HEEELlll
Query canqlqplllktllnraEGALLINAVGvddvkqademvKLATA.VAHL....IGRSNfda  115
ident                   ||  |                  |                  
Sbjct ................vPGAWEITPTI..hvdsrglffEWLTDhGFRAfaghSLDVR...   46
DSSP  ................lLLEEEEELLE..eeelleeeeLLLLHhHHHHhhllLLLLL...


DSSP  llllLLEEEEELllllllLLLLEEEELLLLlllLLLLEEEEEEEEEellllLLEEEEE..
Query msgqYYARFVVKnvylrqPHRVMELHNDGTyveEITDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH..  173
ident          |              ||                                  
Sbjct ....QVNCSVSS......AGVLRGLHFAQL...PPSQAKYVTCVSG....sVFDVVVDir   89
DSSP  ....EEEEEEEL......LLLEEEEEEELL...LLLLLEEEEEEEL....eEEEEEELll


DSSP  ....HHHLllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllle
Query ....LDDWehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfv  229
ident                                                             
Sbjct egspTFGR....................................................   97
DSSP  llllLLLL....................................................


DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLL..LLEEEEELLlEEEEELLLlllllLEEE
Query qpkdfeegvwlselsdaietskgILSVPVPV..GKFLLINNLfWLHGRDRFtphpdLRRE  287
ident                          ||                  ||             
Sbjct .......................WDSVLLDDqdRRTIYVSEG.LAHGFLAL....qDNST  129
DSSP  .......................EEEEEEELllLLEEEELLL.LEEEEEEL....lLLEE


DSSP  EEEEEE....................................................ee
Query LMRQRG....................................................yf  295
ident  |                                                          
Sbjct VMYLXSaeynpqrehtixatdptlavdwplvdgaapslsdrdaaapsfedvrasgllprw  189
DSSP  EEEEELllllllleeelllllllllllllllllllllllhhhhllllhhhhhhllllllh


DSSP  lllllllllll
Query ayasnhyqthq  306
ident            
Sbjct eqtqrfigemr  200
DSSP  hhhhhhhhhhl


No 29: 1GP4A  MOLECULE: ANTHOCYANIDIN SYNTHASE;                                    

DSSP  ............................lllllleeeeelllLLLEEEEEELhhhhhhhh
Query ............................gqdysgftltpsaqSPRLLELTFTeqttkqfl   32
ident                                            |                
Sbjct vaverveslaksgiisipkeyirpkeelesindvfleekkedGPQVPTIDLK........   52
DSSP  lllllhhhhhllllllllhhhlllhhhhlllllhhhhhhlllLLLLLEEELL........


DSSP  hhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHH....LLLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEE.ELL
Query eqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDL....CANQLQPLLLKTLLNraEGALLIN.AVG   87
ident                                         | |  |    |         
Sbjct ........................NIESddekIRENCIEELKKASLD..WGVXHLInHGI   86
DSSP  ........................LLLLllhhHHHHHHHHHHHHHHH..LLEEEEElLLL


DSSP  L..LLHH.....................................................
Query V..DDVK.....................................................   92
ident                                                             
Sbjct PadLXERvkkageeffslsveekekyandqatgkiqgygsklannasgqlewedyffhla  146
DSSP  LhhHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhlllhhhlllleeelllllllllllllleeeeeee


DSSP  ........................HHHHHHHHHHHHHHHHE..........eellllllL
Query ........................QADEMVKLATAVAHLIG..........rsnfdamsG  118
ident                          |     ||| |                        
Sbjct ypeekrdlsiwpktpsdyieatseYAKCLRLLATKVFKALSvglglepdrlekevggleE  206
DSSP  elhhhllhhhlllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllhhhhhllhhhH


DSSP  LLLEEEEELllllLLLL......lLEEEELLLlllllllleEEEEEeeeelLLLLLEEEE
Query QYYARFVVKnvylRQPH......rVMELHNDGtyveeitdyVLMMKideqnMQGGNSLLL  172
ident                           | | |                           | 
Sbjct LLLQXKINY....YPKCpqpelalGVEAHTDV.......saLTFIL....hNXVPGLQLF  251
DSSP  LEEEEEEEE....ELLLllhhhllLEEEELLL.......llEEEEE....eLLLLLEEEE


DSSP  EHHhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleell
Query HLDdwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpk  232
ident                                                             
Sbjct YEG.........................................................  254
DSSP  ELL.........................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEE.LLLLlLEEEEEL...........LLEEEEELLLLL
Query dfeegvwlselsdaietskGILSV.PVPVgKFLLINN...........LFWLHGRDRFTP  280
ident                           ||                       ||       
Sbjct ...................KWVTAkCVPD.SIVXHIGdtleilsngkyKSILHRGLVNKE  294
DSSP  ...................EEEELlLLLL.LEEEEELhhhhhhlllllLLLLEEELLLLL


DSSP  LlllEEEEEEE......eeeelllLLLLLL.....................ll
Query HpdlRRELMRQ......rgyfayaSNHYQT.....................hq  306
ident                                                      
Sbjct K.vrISWAVFCeppkdkivlkplpEXVSVEspakfpprtfaqhiehklfgkeq  346
DSSP  L.leEEEEEEEelllllleelllhHHLLLLllllllleehhhhhhhhhhhhhl


No 30: 1E5RA  MOLECULE: PROLINE OXIDASE;                                           

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllLLEEEEEelllLLHH............................
Query canqlqplllktllnraEGALLINavgvDDVK............................   92
ident                                                             
Sbjct .................MRSHILG...kIELDqtrlapdlaylaavptveefsngfwkhv   40
DSSP  .................LLLEEEE...eLLLLhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeee


DSSP  ..............HHHHHH.HHHHhhhhhhEEELlllllllLLEEEEElllllllLLLL
Query ..............QADEMV.KLATavahliGRSNfdamsgqYYARFVVknvylrqPHRV  137
ident                  | |                                        
Sbjct plwnaptahvehvpYLKEIVtTVFD.....gTHLQ.......MARSRNL.......KNAI   81
DSSP  eeelllllllllllHHHHHHhHHLL.....lLLEE.......EEEEEEE.......ELEE


DSSP  EEEELLLllllllLLEEEEEEEEEelLLLLLEEEEehhhlllhhhhhllhhhhlleeell
Query MELHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEqnMQGGNSLLLhlddwehldnyfrhplarrpmrfaa  197
ident    | |             |                                        
Sbjct VIPHRDF......RYFRTFMVLED..SPLAFHSNE.........................  108
DSSP  EEEELLL......LLLLEEEELLL..LLLEEEEEL.........................


DSSP  llllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEEL
Query ppsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskgILSVP  257
ident                                                             
Sbjct .......................................................DTVIH  113
DSSP  .......................................................LEEEL


DSSP  LLLLLEEEEELLlEEEEELLLLLlllLEEEEEEEEEEELL....................
Query VPVGKFLLINNLfWLHGRDRFTPhpdLRRELMRQRGYFAY....................  297
ident    |           |    |       |        |                      
Sbjct MRPGEIWFLDAA.TVHSAVNFSE...ISRQSLCVDFAFDGpfdekeifadatlyapgstp  169
DSSP  LLLLEEEELLLL.LLEEEEELLL...LLLLEEEEEELLLLlllhhhhlllhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  297
ident                                                             
Sbjct dlperrpftaehrrrilslgqvierenfrdilfllskvhykydvhpsetydwlieiskqa  229
DSSP  llllleellhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhheellllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ......................lllllllll
Query ......................asnhyqthq  306
ident                                
Sbjct gdekmvvkaeqirdfavearalserfsltsw  260
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllll


No 31: 2GM6A  MOLECULE: CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I;                               

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhlllLHHHHhhllhHHHHHHHHHHhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewPVQALeyksfLRFRVAKILDdl   60
ident                                                             
Sbjct ....................................slAPLRE...fiTGLSALLDEQ..   19
DSSP  ....................................llHHHHH...hhHHHHHHHHLL..


DSSP  llllhHHHHHhhhhllllleeeeeelllLLHHHHhhhhhhhhhhhhhheeellllLLLL.
Query canqlQPLLLktllnraegallinavgvDDVKQAdemvklatavahligrsnfdaMSGQ.  119
ident                                                             
Sbjct .....PGEAR.....ilreggallarlvARDDWL.......pdafaqphpeyyqqXLLHc   62
DSSP  .....LLHHH.....hhhhhhhhhhhhhHLLLLL.......lhhhlllllllleeEEEEe


DSSP  ......LLEEEEELLLlllllllLEEEELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEEE
Query ......YYARFVVKNVylrqphrVMELHNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLH  173
ident           ||               |             |             |    
Sbjct dsaerfSIVSFVWGPG......qRTPIHDHT.......VWGLIGXLRG....aEYSQPFV  105
DSSP  llllllEEEEEEELLL......lLLLLLLLL.......LLEEEEEEEL....lEEEEEEE


DSSP  hhhlllHHHHhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelll
Query lddwehLDNYfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkd  233
ident                                                             
Sbjct .....lDGSG..................................................  110
DSSP  .....eLLLL..................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhHHHLllLLEEELLLLLLEEEEELL.LEEEEELlLLLLllLEEEEEEEE
Query feegvwlselsdAIETskGILSVPVPVGKFLLINNL.FWLHGRDrFTPHpdLRRELMRQR  292
ident                            |            |                   
Sbjct ............RPVL..HGEPTRLEPGHVEAVSPTvGDIHRVHnAYDD..RVSISIHVY  154
DSSP  ............LEEE..LLLLEEELLLLEEEELLLlLLLEEEEeLLLL..LLEEEEEEE


DSSP  EE........................elllllllllll
Query GY........................fayasnhyqthq  306
ident |                                     
Sbjct GAniggvrrsvyteagerkpfisgysnpylpnpwdrsk  192
DSSP  LLlhhhlleeeellllleeeelllllllllllllllll


No 32: 2CRQA  MOLECULE: MITOCHONDRIAL TRANSLATIONAL INITIATION FACTOR 3;           

DSSP  lllllleeeeelllLLLEEEEEELHHHhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHH
Query gqdysgftltpsaqSPRLLELTFTEQTtkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDL   60
ident                    || |                                     
Sbjct ...gssgssgpktgPTMTKELVFSSNI.............................GQHD   28
DSSP  ...lllllllllllLLLEEEEEEELLL.............................LHHH


DSSP  LlLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEELL.lllhHHHHHHHHHHHHHHHHHEeellllllll
Query CaNQLQPLLLKTLLNraEGALLINAVG.vddvKQADEMVKLATAVAHLIGrsnfdamsgq  119
ident                                     |                       
Sbjct L.DTKSKQIQQWIEK..KYHVQVTIKRrkdaeQSEEETEEIFNQILQTMP..........   75
DSSP  H.HHHHHHHHHHHHL..LLEEEEEEELlllllLLHHHHHHHHHHHHLLLL..........


DSSP  lleeeeellllllllllleeeellllllllllLEEE..EEEEeeelllllleeeeehhhl
Query yyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitDYVL..MMKIdeqnmqggnslllhlddw  177
ident                                         |                   
Sbjct ...............................dIATFssRPKA..................   86
DSSP  ...............................lLLEEeeEEEE..................


DSSP  llhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhh
Query ehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeeg  237
ident                                                             
Sbjct ............................................................   86
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLleeeeellllllllleeeeeeeeeeell
Query vwlselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLfwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfay  297
ident                                                             
Sbjct .................irggtaSMCVFRHLS.......................kkeek  106
DSSP  .................ehhhleEEEEEELLL.......................lllll


DSSP  LLLLLLlll
Query ASNHYQthq  306
ident          
Sbjct SGPSSG...  112
DSSP  LLLLLL...


No 33: 2IFEA  MOLECULE: PROTEIN (TRANSLATION INITIATION FACTOR IF3);               

DSSP  lllllleeeeellllLLEEEEEElhhhHHHHhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhHHHH
Query gqdysgftltpsaqsPRLLELTFteqtTKQFleqvaewpvqaleyksflrfrvakiLDDL   60
ident                    |  |                                     
Sbjct ..............vIQVKEIKF....RPGT.........................DEGD   17
DSSP  ..............lLEEEEEEE....LLLL.........................LHHH


DSSP  LLlLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEELL.llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEellllllll
Query CAnQLQPLLLKTLLNraEGALLINAVG.vdDVKQADEMVKLATAVAHLIGRsnfdamsgq  119
ident         |   |         |                     |               
Sbjct YQ.VKLRSLIRFLEE..GDKAKITLRFrgrEMAHQQIGMEVLNRVKDDLQE.........   65
DSSP  HL.HHHHHHHHHHHL..LEEEEEEELLlllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.........


DSSP  lleeeeellllllllllleeeelllllllllllEEEEEEEEeelllllleeeeehhhlll
Query yyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitdYVLMMKIDeqnmqggnslllhlddweh  179
ident                                   |                         
Sbjct ...............................laVVESFPTK...................   75
DSSP  ...............................leEELLLLLL...................


DSSP  hhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhh
Query ldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvw  239
ident                                                             
Sbjct ............................................................   75
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLLeeeeellllllllleeeeeeeeeeellll
Query lselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLFwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfayas  299
ident                          |                                  
Sbjct ................iegrqMIMVLAPKKK.............................   90
DSSP  ................lllllLEEEEEELLL.............................


DSSP  lllllll
Query nhyqthq  306
ident        
Sbjct ......q   91
DSSP  ......l


No 34: 2BDRA  MOLECULE: UREIDOGLYCOLATE HYDROLASE;                                 

DSSP  lllllleeeeELLLlllEEEE.......EELHHH....hHHHHhhhllllhhhhhhllhh
Query gqdysgftltPSAQsprLLEL.......TFTEQT....tKQFLeqvaewpvqaleyksfl   49
ident                                                             
Sbjct .xrtlxieplTKEA...FAQFgdvietdGSDHFXinngsTXRF.................   39
DSSP  .leelleeelLHHH...HLLLeeeelllLLLLEEehhhlEEEE.................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhHHHH...
Query rfrvakilddlcanqlqplllktllnraegallinavgvddvkqademvklatAVAH...  106
ident                                                        |    
Sbjct ....................................................hKLATvet   47
DSSP  ....................................................eEEEEell


DSSP  ..hhEEELllllllllLEEEEELllllLLLLLLE.EEELLlllllllLLEEEEEEEEEel
Query ..liGRSNfdamsgqyYARFVVKnvylRQPHRVM.ELHNDgtyveeiTDYVLMMKIDEqn  163
ident                    |                |                       
Sbjct aepeDKAI........ISIFRAD...aQDXPLTVrXLERH......pLGSQAFIPLLG..   88
DSSP  llllLEEE........EEEEEEE...lLLLLEEElEEEEL......lLLLEEEEELLL..


DSSP  lllLLEEEEEHHhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeel
Query mqgGNSLLLHLDdwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmr  223
ident                                                             
Sbjct .npFLIVVAPVG................................................   99
DSSP  .llEEEEEELLL................................................


DSSP  llllleelllhhhhhhhhhhhhhHHLLLLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEEllllllll
Query yidqfvqpkdfeegvwlselsdaIETSKGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRdrftphpd  283
ident                           |                      |          
Sbjct ......................dAPVSGLVRAFRSNGRQGVNYHRG.VWHHP...vltie  133
DSSP  ......................lLLLHHHLEEEEELLLLEEEELLL.LEELL...leell


DSSP  LEEEEEEEEEEEL..........llllllllll
Query LRRELMRQRGYFA..........yasnhyqthq  306
ident  |                               
Sbjct KRDDFLVVDRSGSgnncdehyfteeqxlilnph  166
DSSP  LEEEEEEEEEELLlllleeeellhhhleeelll


No 35: 1YWKA  MOLECULE: 4-DEOXY-L-THREO-5-HEXOSULOSE-URONATE KETOL-                

DSSP  lllllLEEEE.........elLLLLLEEE....eeelHHHH...................
Query gqdysGFTLT.........psAQSPRLLE....ltftEQTT...................   28
ident                             |                               
Sbjct ...lqNMETRythspadirhySTEQLRDEflvekvfiPGAIsltythndrmifggvtptt   57
DSSP  ...leEEEEEllllhhhhlllLHHHHHHHheelllllLLLEeeeeelllleeeeeellll


DSSP  .........................hhhhhhHLLL........lhhhHHHLLhhhhhhhh
Query .........................kqfleqVAEW........pvqaLEYKSflrfrvak   55
ident                                  |                          
Sbjct eeleiildkelgvdyflerrelgviniggpgFIEIdgaketmkkqdgYYIGK........  109
DSSP  lleellllhhhlllllllleeeeeeelllleEEEElleeeeelllleEEELL........


DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhHHHHhhhhhHHHH........
Query ilddlcanqlqplllktllnraegallinavgvddvkqaDEMVklataVAHL........  107
ident                                                             
Sbjct .......................etkhvrfssenpdnpaKFYI.....SCVPahhkypnv  141
DSSP  .......................lllleeeeelllllllLEEE.....EEEEllllllle


DSSP  ...............heeellllLLLLL..........LEEEEELLLlllllllleeeel
Query ...............igrsnfdaMSGQY..........YARFVVKNVylrqphrvmelhn  142
ident                                                             
Sbjct kisideitpmetgdpltlnqrkiYQYIHpnvcescqlqMGYTILEPG.............  188
DSSP  eellllllllllllhhhllleeeEEEELllllllllleEEEEEELLL.............


DSSP  lllllllllLEEEEEEEEEELLLlLLEEEEEHHhlllhhhhhllhhhhlleeelllllll
Query dgtyveeitDYVLMMKIDEQNMQgGNSLLLHLDdwehldnyfrhplarrpmrfaappskn  202
ident                  |              |                           
Sbjct ....sawntRMEAYVYFDMEEDTrIFHMMGKPD...........................  217
DSSP  ....lllllLEEEEEEELLLLLLlEEEEELLLL...........................


DSSP  lllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLL
Query vskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPVGK  262
ident                                                             
Sbjct .................................................ETKHLVMSNEQ  228
DSSP  .................................................LLEEEEELLLE


DSSP  EEEEELlLEEEEELllllllllEEEEEEEEEEElllllllllll
Query FLLINNlFWLHGRDrftphpdlRRELMRQRGYFayasnhyqthq  306
ident           |                                 
Sbjct AAISPS.WSIHSGV.....gtsNYSFIWAMCGE...........  255
DSSP  EEEELL.LLLLLEE.....ellLLEEEEEEELL...........


No 36: 2ET1A  MOLECULE: OXALATE OXIDASE 1;                                         

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllLLHH..................h
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaeWPVQ..................a   42
ident                                                             
Sbjct .tdpdplqdfcvadldgkavsvnghtckpmseagddfLFSSkltkagntstpngsavtel   59
DSSP  .llllllllllllllllllllllllllllhhhlllllLLLLllllllllllllleeeeee


DSSP  hhhllHHHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhh
Query leyksFLRFrvakilddlcanqlqplllktllnraegallinavgvddvkqademvklat  102
ident                                                             
Sbjct dvaewPGTN...................................................   68
DSSP  lllllHHHL...................................................


DSSP  hhhhhheeellllllllLLEEEEELlllllllllLEEEELLLllllllLLEEEEEEEEEe
Query avahligrsnfdamsgqYYARFVVKnvylrqphrVMELHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEq  162
ident                     |                 |               |     
Sbjct .............tlgvSMNRVDFA......pggTNPPHIHP......RATEIGMVMKG.  102
DSSP  .............llllEEEEEEEL......lllEEEEEELL......LLLEEEEEEEL.


DSSP  llllLLEEEEEHHHLLlhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleee
Query nmqgGNSLLLHLDDWEhldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvm  222
ident          |   |                                              
Sbjct ...eLLVGILGSLDSG............................................  115
DSSP  ...lEEEEEELLHHHL............................................


DSSP  lllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELlLLLLl
Query ryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDrFTPHp  282
ident                                 |  |  |    |      |         
Sbjct ............................nKLYSRVVRAGETFVIPRG.LMHFQFnVGKT.  145
DSSP  ............................lLEEEEEELLLLEEEELLL.LLEEEEeLLLL.


DSSP  llEEEEEEEEEEEL..................................llllllllll
Query dlRRELMRQRGYFA..................................yasnhyqthq  306
ident                                                           
Sbjct ..EAYMVVSFNSQNpgivfvpltlfgsdppiptpvltkalrveagvvellkskfaggs  201
DSSP  ..LEEEEEEELLLLllleehhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllll


No 37: 2D40A  MOLECULE: PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE;                        

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhlLLLHHhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaEWPVQaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ..............................tpnancAPAYW...................   11
DSSP  ..............................llllllLLEEE...................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhheeellllLLLL.
Query canqlqplllktllnraegallinavgvddvkqademvklatavahligrsnfdaMSGQ.  119
ident                                                             
Sbjct ..............................................nyqeirpllVLENp   25
DSSP  ..............................................lllllllllEELLl


DSSP  ............LLEEEEElllllllLLLLEEEELLlllllllLLEEEEEEEEEelllLL
Query ............YYARFVVknvylrqPHRVMELHNDgtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqGG  167
ident             |             |  |   |             |          | 
Sbjct alrgqssitatlYAGLQLI......xPGEVAPSHRH.......NQSALRFIVEG...kGA   69
DSSP  llllllllllllEEEEEEE......lLLLEEEEEEE.......LLLEEEEEEEL...lLL


DSSP  LEEEEehhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllll
Query NSLLLhlddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidq  227
ident                                                             
Sbjct FTAVD.......................................................   74
DSSP  EEEEL.......................................................


DSSP  leelllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLLLlllLEEE
Query fvqpkdfeegvwlselsdaietskgILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFTPhpdLRRE  287
ident                              |   | | |       |              
Sbjct .........................GERTPXNEGDFILTPQW.RWHDHGNPGD...EPVI  105
DSSP  .........................LEEEELLLLLEEEELLL.LLEEEELLLL...LLEE


DSSP  EEEEEE......................................................
Query LMRQRG......................................................  293
ident                                                             
Sbjct WLDGLDlplvnilgcgfaedypqqpvtrkegdylpryaanxlplrhqtgnsspifnyryd  165
DSSP  EEEEELhhhhhhhlllleeellllllllllllhhhhhllleellllllllllllleelhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  293
ident                                                             
Sbjct rsrevlhdltrlgdadewdgykxryvnpvtggypxpsxgaflqllpkgfasrvarttdst  225
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllleeeeellllllllllllleeeeeeellllllllleellle


DSSP  ................................................eeLLLL....LL
Query ................................................yfAYAS....NH  301
ident                                                             
Sbjct iyhvvegsgqviignetfsfsakdifvvptwhgvsfqttqdsvlfsfsdrPVQEalglFR  285
DSSP  eeeeeeeeeeeeelleeeeeellleeeellllleeeeeeeeeeeeeeelhHHHHhlllLL


DSSP  LLLll
Query YQThq  306
ident      
Sbjct EAR..  288
DSSP  EEL..


No 38: 2ARHA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              

DSSP  ......................................LLLLL.....LEEEEELLL...
Query ......................................GQDYS.....GFTLTPSAQ...   14
ident                                         | |       ||        
Sbjct daxvkyeellktlenginseegeirlvrksqgrfkeefNFDLSlgskpLLTLKVFLGrkp   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeellllleeEEEEEelleeEEEEEEELLlll


DSSP  .llLEEEEE.ELHHHHHHhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHH
Query .spRLLELT.FTEQTTKQfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddlcaNQLQPLLLKT   72
ident       |                                                |    
Sbjct ywqPWVEVFgVNPNLRNV............................ffgsEAERKLYEFL   92
DSSP  lllLEEEEElLLHHHHHH............................hlllHHHHHHHHHH


DSSP  HHLllLLEEEEEELLLllhhhhhHHHH........hhHHHHHHHEEelllllllllleee
Query LLNraEGALLINAVGVddvkqadEMVK........laTAVAHLIGRsnfdamsgqyyarf  124
ident       |                |                                    
Sbjct SEH..FGRIFVEYFED......kETTYelqkgvppalSRLGFELLK..............  130
DSSP  HLL..LLEEEEELLLL......hHHHHhhhllllhhhLHHHHHHHL..............


DSSP  eellllllllllleeeelllllllllllEEEEEEEEEELLlllleeeeehhhlllhhhhh
Query vvknvylrqphrvmelhndgtyveeitdYVLMMKIDEQNMqggnslllhlddwehldnyf  184
ident                                                             
Sbjct .........................lgyTYFRDWFIPEGL....................  145
DSSP  .........................lllLEEEELLLLLLL....................


DSSP  llhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhh
Query rhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlsels  244
ident                                                             
Sbjct ............................................................  145
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhllllleeellLLLLEEEEELL...leeeeellllllllleeeeeeeeeeellllll
Query daietskgilsvpvPVGKFLLINNL...fwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfayasnh  301
ident                  |                                          
Sbjct ............xeGGHKIQAEKPKteeakkrhlenlkkefeefigkcedeglikkvker  193
DSSP  ............llLLLEEEEELLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh


DSSP  lllll
Query yqthq  306
ident      
Sbjct ynfle  198
DSSP  hhhll


No 39: 1SQ4A  MOLECULE: GLYOXYLATE-INDUCED PROTEIN;                                

DSSP  ......lllllleeeEELLlLLLE.....eeEEELHHHHH........HHHH........
Query ......gqdysgftlTPSAqSPRL.....leLTFTEQTTK........QFLE........   33
ident                |  |                   |                     
Sbjct kssyyaphgghpallTDRA.XFTEayavipkGVXRDIVTShlpfwdnxRXWViarplsgf   59
DSSP  lllllllllllllllLLLL.EELLleeeelhHHLLHHHLLllllleeeEEEEelllllll


DSSP  ............................................hhllllhHHHHHLlhh
Query ............................................qvaewpvQALEYKsfl   49
ident                                                             
Sbjct aetfsqyivelapnggsdkpeqdpnaeavlfvvegelsltlqgqvhaxqpgGYAFIP...  116
DSSP  lllleeeeeeeeeeeeelllllllleeeeeeeeelleeeeellleeeelllEEEEEL...


DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhHHHHhhHHHH....
Query rfrvakilddlcanqlqplllktllnraegallinavgvddvkqadEMVKlaTAVA....  105
ident                                                             
Sbjct ...............................pgadykvrnttgqhtRFHW..IRKHyqkv  143
DSSP  ...............................lllleeeelllllleEEEE..EEEEllll


DSSP  ....................hhheeellllLLLL.........LLEEEEELllllllLLL
Query ....................hligrsnfdaMSGQ.........YYARFVVKnvylrqPHR  136
ident                                                          |  
Sbjct dgvplpeafvtneqdiqplvxpdtegrwstTRFVdxsdxrhdxHVNIVNFE......PGG  197
DSSP  lllllllleeeehhhllleelllhhhleeeELLLlllllllleEEEEEEEL......LLL


DSSP  LEEE.ELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEEehhhlllhhhhhllhhhhlleee
Query VMEL.HNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLhlddwehldnyfrhplarrpmrf  195
ident |                                  |                        
Sbjct VIPFaETHV.......XEHGLYVLEG....kAVYRLN.......................  223
DSSP  EELLlLLLL.......EEEEEEEEEL....eEEEEEL.......................


DSSP  llllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhllllLEE
Query aappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskgILS  255
ident                                                             
Sbjct .........................................................QDW  226
DSSP  .........................................................LEE


DSSP  ELLLLLLEEEEELLlEEEEELllllllLLEEEEEEEEEE..eLLLLLLlllll
Query VPVPVGKFLLINNLfWLHGRDrftphpDLRRELMRQRGY..fAYASNHyqthq  306
ident | |  | |                     |                       
Sbjct VEVEAGDFXWLRAF.CPQACY...sggPGRFRYLLYKDVnrhXRLTLN.....  270
DSSP  EEEELLLEEEEEEL.LLEEEE...lllLLLEEEEEEEELlllLLLLLL.....


No 40: 1XE7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3                 

DSSP  lllllleeeeeLLLLlleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpSAQSprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ...........ANAA.............................................    4
DSSP  ...........LLLL.............................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhheeellllLLLLL
Query canqlqplllktllnraegallinavgvddvkqademvklatavahligrsnfdaMSGQY  120
ident                                                             
Sbjct ...................iepasfvkvpmpeppsslqqlindwqlikhreggyfKETDR   45
DSSP  ...................llllhhhhlllllllhhhhhhhhhhlleellllleeEEEEE


DSSP  ...................LEEEEELLLlllllllLEEEELLLlllllllLEEEEEEEEE
Query ...................YARFVVKNVylrqphrVMELHNDGtyveeitDYVLMMKIDE  161
ident                                        |                    
Sbjct spytmevekpvmvtrnqstLIYYLLTPD.....spIGKFHKNI.......NRIIHILQRG   93
DSSP  llleeeellllleeeelleEEEEEELLL.....llEEEEEEEL.......LLEEEEEEEE


DSSP  ellllLLEEEEEHHHlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeelllllee
Query qnmqgGNSLLLHLDDwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpv  221
ident      |   |   |                                              
Sbjct ....kGQYVLVYPDG.............................................  104
DSSP  ....lEEEEEELLLL.............................................


DSSP  elllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLL......lLEEEEELLlEEEEE
Query mryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPV......gKFLLINNLfWLHGR  275
ident                                  |  |                       
Sbjct ..............................QVKSFKVGFdykngevSQWVVPGG.VFKAS  133
DSSP  ..............................LEEEEEELLlhhhlllLEEEELLL.LEEEE


DSSP  LlLLLL.lLLEEEEEEEEEE.....................elllllllllll
Query DrFTPH.pDLRRELMRQRGY.....................fayasnhyqthq  306
ident         |                                            
Sbjct FlLPNEefDNGFLISEVVVPgfdfedhtflkgedelkhlvgpekaaelaflah  186
DSSP  EeLLLLllLLLEEEEEEELLlllhhheeellhhhhhhhhhlhhhhhhlhhhll


No 41: 1RO5A  MOLECULE: AUTOINDUCER SYNTHESIS PROTEIN LASI;                        

DSSP  .....................................................LLLLL..
Query .....................................................GQDYS..    5
ident                                                             
Sbjct gshmivqigrreefdkkllgemhklraqvfkerkgwdvsvidemeidgydalsPYYMLiq   60
DSSP  lllleeeeeehhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleelleellhhhhllLEEEEee


DSSP  .......LEEEEELLL...................LLLEEEEEELhhHHHHhhhhhllll
Query .......GFTLTPSAQ...................SPRLLELTFTeqTTKQfleqvaewp   39
ident                                    ||   ||                  
Sbjct edgqvfgCWRILDTTGpymlkntfpellhgkeapcSPHIWELSRF..AINS.........  109
DSSP  elleeeeEEEEEELLLllhhhhllhhhhlllllllLLLEEEEEEE..EELL.........


DSSP  hhhhhhllhhhhhhhHHHHhhllLLHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEElllllhhhhhhHHH
Query vqaleyksflrfrvaKILDdlcaNQLQPLLLKTlLNRAEGALLINAvgvddvkqadeMVK   99
ident                             |     |      |                | 
Sbjct .......gqkgslgfSDCT...lEAMRALARYS.LQNDIQTLVTVT...........TVG  147
DSSP  .......llllllllHHHH...hHHHHHHHHHH.HLLLLLEEEEEE...........EHH


DSSP  HHHHHHHHheeelllllllllleeeeellllllllllleeeellllllllllleEEEEEE
Query LATAVAHLigrsnfdamsgqyyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitdyVLMMKI  159
ident                                                             
Sbjct VEKMMIRA............................................glDVSRFG  163
DSSP  HHHHHHHL............................................llEEEELL


DSSP  Eeelllllleeeeehhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeelllll
Query Deqnmqggnslllhlddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgr  219
ident                                                             
Sbjct P...........................................................  164
DSSP  L...........................................................


DSSP  eeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLleeeeellll
Query pvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLfwlhgrdrft  279
ident                                                 |           
Sbjct ................................hlkigieraVALRIELNA..........  182
DSSP  ................................leeelleeeEEEEEELLH..........


DSSP  llllleeeeeeeeeEELLLLlllllll
Query phpdlrrelmrqrgYFAYASnhyqthq  306
ident                  |         
Sbjct ...........ktqIALYGG.vlveqr  197
DSSP  ...........hhhHHHHLL.llllll


No 42: 1LN4A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YHBY;                                 

DSSP  ...lllllleeeeeLLLLlleEEEEELHHHhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhh
Query ...gqdysgftltpSAQSprlLELTFTEQTtkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakil   57
ident                                                             
Sbjct mdlstkqkqhlkglAHPL..kPVVLLGSNG..............................   28
DSSP  llllhhhhhhhhhhHLLL..lLLEEELLLL..............................


DSSP  hhhllLLHHHHHHHHHHLllLLEEEEEELLLllhhHHHHHHHHHHHHHHHHEeellllll
Query ddlcaNQLQPLLLKTLLNraEGALLINAVGVddvkQADEMVKLATAVAHLIGrsnfdams  117
ident                |                             |     |        
Sbjct ...ltEGVLAEIEQALEH..HELIKVKIATE....DRETKTLIVEAIVRETG........   71
DSSP  ...llHHHHHHHHHHHHH..HLEEEEEELLL....LHHHHHHHHHHHHHHHL........


DSSP  lllleeeeellllllllllleeeelllllllllllEEEEEEeeeelllllleeeeehhhl
Query gqyyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitdYVLMMKideqnmqggnslllhlddw  177
ident                                                             
Sbjct ...................................ACNVQV...................   77
DSSP  ...................................LEEEEE...................


DSSP  llhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhh
Query ehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeeg  237
ident                                                             
Sbjct ............................................................   77
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllleeellLLLLEEEEEL...LLEEEEELlllllllleeeeeeeeee
Query vwlselsdaietskgilsvpvPVGKFLLINN...LFWLHGRDrftphpdlrrelmrqrgy  294
ident                            |                                
Sbjct .....................IGKTLVLYRPtkeRKISLPLE..................   98
DSSP  .....................ELLEEEEELLlllLLLLLLLL..................


DSSP  elllllllllll
Query fayasnhyqthq  306
ident             
Sbjct ............   98
DSSP  ............


No 43: 1YFUA  MOLECULE: 3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE;                     

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhlLLLHhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaEWPVqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ...............................mltygAPFN....................    9
DSSP  ...............................lllllLLLL....................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhHHHHhhhhhhhhhhhheeellllLLLL.
Query canqlqplllktllnraegallinavgvddvkQADEmvklatavahligrsnfdaMSGQ.  119
ident                                                           | 
Sbjct ................................FPRW....idehahllkppvgnrQVWQd   33
DSSP  ................................HHHH....hhhlhhhlllllleeELLLl


DSSP  ...LLEEEEELllllllllLLEEEELLlllllllLLEEEEEEEEEellllLLEEEEEHHh
Query ...YYARFVVKnvylrqphRVMELHNDgtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLHLDd  176
ident                         | |                           |     
Sbjct sdfIVTVVGGP.......nHRTDYHDD.......PLEEFFYQLRG....nAYLNLWVDG.   74
DSSP  lleEEEEELLL.......lLLLLEEEL.......LLLEEEEEEEL....lEEEEEEELL.


DSSP  lllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhh
Query wehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfee  236
ident                                                             
Sbjct ............................................................   74
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELlllllllLEEEEEEEEEEEL
Query gvwlselsdaietskGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDrftphpdLRRELMRQRGYFA  296
ident                         |   |       |                       
Sbjct ...............RRERADLKEGDIFLLPPH.VRHSPQ....rpeAGSACLVIERQRP  114
DSSP  ...............EEEEEEELLLLEEEELLL.LLEEEE....lllLLLEEEEEEELLL


DSSP  LL..................................................llllllll
Query YA..................................................snhyqthq  306
ident                                                             
Sbjct AGmldgfewycdacghlvhrvevqlksivtdlpplfesfyasedkrrcphcgqvhpgraa  174
DSSP  LLlleeeeeelllllleeeeeeellllhhhhlhhhhhhhhllhhhhllllllllllllll


No 44: 2H9UA  MOLECULE: DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;                            

DSSP  lllllleeeeellllllEEEEEELhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhH
Query gqdysgftltpsaqsprLLELTFTeqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddL   60
ident                    |                                        
Sbjct .............acegAPEVRIG...................................R   12
DSSP  .............llllLLEEELL...................................L


DSSP  LLL.LHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLlllhhhhhhhhHHHHHHHHHHEEEllllllll
Query CAN.QLQPLLLKTLLNRAEGALLINAVGvddvkqademvKLATAVAHLIGRSnfdamsgq  119
ident           | ||           | |             |                  
Sbjct KPVmNYVLAILTTLMEQGTNQVVVKARG........rniNRAVDAVEIVRKR........   56
DSSP  LLHhHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL........lhhHHHHHHHHHHHHH........


DSSP  lleeeeellllllllllleeeelllllllllLLEEE.EEEEEEELllllleeeeehhhll
Query yyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeiTDYVL.MMKIDEQNmqggnslllhlddwe  178
ident                                        ||| |                
Sbjct .............................faKNIEIkDIKIDSQE...............   72
DSSP  .............................llLLEEEeEEEEEEEE...............


DSSP  lhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhh
Query hldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegv  238
ident                                                             
Sbjct ............................................................   72
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLLeeeeellllllllleeeeeeeeeeelll
Query wlselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLFwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfaya  298
ident                           |                                 
Sbjct .....ievqtpegqtrtrrvssIEICLEKAGE............................   99
DSSP  .....eeeellllleeeeeeeeEEEEEEELLL............................


DSSP  llllllll
Query snhyqthq  306
ident         
Sbjct ......sa  101
DSSP  ......ll


No 45: 1PMIA  MOLECULE: PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE;                                  

DSSP  lllllleeeeelllLLLEeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqSPRLleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident               |                                             
Sbjct ..............SSEK..........................................    4
DSSP  ..............LLLL..........................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllEEEEEELL.......lllhHHHHHH................
Query canqlqplllktllnraegALLINAVG.......vddvKQADEM................   97
ident                       |                                     
Sbjct ...................LFRIQCGYqnydwgkigssSAVAQFvhnsdpsitidetkpy   45
DSSP  ...................EEEEEELEellllleehhhLHHHHHhhhhllllllllllee


DSSP  .hHHHHH.....................................hhhHHEE.........
Query .vKLATA.....................................vahLIGR.........  110
ident                                                             
Sbjct aeLWMGThpsvpskaidlnnqtlrdlvtakpqeylgesiitkfgsskELPFlfkvlsiek  105
DSSP  leEEELLllllleeellllleehhhhhhhlhhhhllhhhhhhhllllLLLEeeeeeeell


DSSP  ..........................ellllLLLL.........................
Query ..........................snfdaMSGQ.........................  119
ident                                                             
Sbjct vlsiqahpdkklgaqlhaadpknypddnhkpEMAIavtdfegfcgfkpldqlaktlatvp  165
DSSP  llleeelllhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEellleeeeeeellhhhhhhhhhhlh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct elneiigqelvdefisgiklpaevgsqddvnnrkllqkvfgklmntdddvikqqtaklle  225
DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct rtdrepqvfkdidsrlpeliqrlnkqfpndiglfcgclllnhvglnkgeamflqakdpha  285
DSSP  hhhhlhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhlllleeeeeelllleeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct yisgdiiecmaasdnvvragftpkfkdvknlvemltysyesvekqkmplqefprskgdav  345
DSSP  eeeeeeeeeeellllleeeelllllllhhhhhhhlllllllhhhhllllllllleeelll


DSSP  ........lleeeeellllllLLLLLEeEELLLllllllLLEEEEEEEEEellllLLEEE
Query ........yyarfvvknvylrQPHRVMeLHNDGtyveeiTDYVLMMKIDEqnmqgGNSLL  171
ident                                                        |    
Sbjct ksvlydppiaefsvlqtifdkSKGGKQ.VIEGL......NGPSIVIATNG....kGTIQI  394
DSSP  eeeeellllllleeeeeelllLLLLEE.EELLL......LLLEEEEEEEL....eEEEEE


DSSP  Eehhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleel
Query Lhlddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqp  231
ident                                                             
Sbjct T...........................................................  395
DSSP  L...........................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEELLLLLlllLEEEEEEE
Query kdfeegvwlselsdaietskGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRDRFTPhpdLRRELMRQ  291
ident                              |                            | 
Sbjct ..................gdDSTKQKIDTGYVFFVAPG.SSIELTADSAnqdQDFTTYRA  436
DSSP  ..................llHHHLEEEELLLEEEELLL.LLEEEEELLLlllLLLEEEEE


DSSP  EEEelllllllllll
Query RGYfayasnhyqthq  306
ident                
Sbjct FVE...........a  440
DSSP  ELL...........l


No 46: 1HA0A  MOLECULE: PROTEIN (HEMAGGLUTININ PRECURSOR);                         

DSSP  ..................lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhHHLLLL...
Query ..................gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleQVAEWP...   39
ident                                                             
Sbjct statlclghhavpngtlvktitddqievtnatelvqssstgkicnnphrilDGIDCTlid   60
DSSP  lleeeeeeelllllleeellllllleeelleeeleelllllleellllleeELLLLLhhh


DSSP  ....HHHHHHLLhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeeeellllLHHHhh
Query ....VQALEYKSflrfrvakilddlcanqlqplllktllnraegallinavgvdDVKQad   95
ident                                                             
Sbjct allgDPHCDVFQ........................netwdlfverskafsncyPYDV..   94
DSSP  hhhlLLLLHHHL........................llllleeeelllllllllLEEL..


DSSP  hhhhHHHHHHHHHEE.ELLL....................lllllllEEEEELLLlllLL
Query emvkLATAVAHLIGR.SNFD....................amsgqyyARFVVKNVylrQP  134
ident              |                                             |
Sbjct pdyaSLRSLVASSGTlEFITegftwtgvtqnggsnackrgpgsgffsRLNWLTKSgstYP  154
DSSP  llhhHHHHHHHHHLLlLEEEllllllllllllleeeeeelleeelllLEEELLLLlllLL


DSSP  LLLEeEELLLLllllllLEEEEEEEEEEL.............lLLLLEEEEEhhhlllhh
Query HRVMeLHNDGTyveeitDYVLMMKIDEQN.............mQGGNSLLLHlddwehld  181
ident                     |                                       
Sbjct VLNV.TMPNND.....nFDKLYIWGIHHPstnqeqtslyvqasGRVTVSTRR........  200
DSSP  LEEE.EEELLL.....lLLEEEEEEEEELllhhhhhhhhllllLLEEEELLL........


DSSP  hhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhh
Query nyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwls  241
ident                                                             
Sbjct ............................................................  200
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllllEEEL................llLLLEEEEeLLLEEEEELLLllllllE
Query elsdaietskgiLSVP................vpVGKFLLInNLFWLHGRDRFtphpdlR  285
ident                                                             
Sbjct ............SQQTiipnigsrpwvrglssriSIYWTIV.KPGDVLVINSN.....gN  242
DSSP  ............LEEEellllllllllllllleeEEEEEEE.LLLLEEEEEEL.....lL


DSSP  EEEE.EEEEEELLL....................................llLLLLLL..
Query RELM.RQRGYFAYA....................................snHYQTHQ..  306
ident                                                             
Sbjct LIAPrGYFKMRTGKssimrsdapidtcisecitpngsipndkpfqnvnkityGACPKYvk  302
DSSP  EEEElEEEELLLLLleeeelllleellllleeelleeellllleelllllllEELLEEll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  306
ident                                                             
Sbjct qntlklatgmrnvpekqtqglfgaiagfiengwegmidgwygfrhqnsegtgqaadlkst  362
DSSP  lllleeellllllllllllllllllllllllllllllllleeeeeeelleeeeeelhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  306
ident                                                             
Sbjct qaaidqingklnrviektnekfhqiekefsevegriqdlekyvedtkidlwsynaellva  422
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllleelllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  306
ident                                                             
Sbjct lenqhtidltdsemnklfektrrqlrenaeemgngcfkiyhkcdnaciesirngtydhdv  482
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeelllleeeelllllhhhhhhhhllllllhh


DSSP  ............
Query ............  306
ident             
Sbjct yrnealnnrfqi  494
DSSP  hhhhhhhhhlll


No 47: 10MHA  MOLECULE: PROTEIN (CYTOSINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE               

DSSP  ....................................LLLL....................
Query ....................................GQDY....................    4
ident                                                             
Sbjct mieikdkqltglrfidlfaglggfrlalescgaecvYSNEwdkyaqevyemnfgekpegd   60
DSSP  lllllllllllleeeeelllllhhhhhhhlllleeeEEELllhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  lleeeeellllLLEEEEEELhhhHHHH.....HHHHllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhH
Query sgftltpsaqsPRLLELTFTeqtTKQF.....LEQVaewpvqaleyksflrfrvakildD   59
ident               |   |       |                                 
Sbjct itqvnektipdHDILCAGFP...CQAFsisgkQKGF.....................edS   96
DSSP  hhhllllllllLLEEEEELL...LLLLlllllLLHH.....................hlL


DSSP  HLLlLHHHHHHHHhHLLLLLEEEEEElllllhhhHHHH....HHHHHHHHHHHEEellll
Query LCAnQLQPLLLKTlLNRAEGALLINAvgvddvkqADEM....VKLATAVAHLIGRsnfda  115
ident                                                 |           
Sbjct RGT.LFFDIARIV.REKKPKVVFMEN.......vKNFAshdnGNTLEVVKNTMNE.....  142
DSSP  LLL.LHHHHHHHH.HHHLLLEEEEEE.......eHHHHlhhhHHHHHHHHHHHHH.....


DSSP  lllllleeeeellllllllllleeeellllllllllLEEEEEEEEEELLLllleeeeehh
Query msgqyyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitDYVLMMKIDEQNMQggnslllhld  175
ident                                     ||    |                 
Sbjct ...................................lDYSFHAKVLNALDY..........  157
DSSP  ...................................lLLLLEEEEEEHHHL..........


DSSP  hlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhh
Query dwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfe  235
ident                                                             
Sbjct ............................................................  157
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLLEEEE..eLLLLLLLL..........
Query egvwlselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLFWLHG..rDRFTPHPD..........  283
ident                                 |                           
Sbjct .................gipqkrerIYMICFRNDLNIQNfqfPKPFELNTfvkdlllpds  200
DSSP  .................lllllleeEEEEEELHHHLLLLlllLLLLLLLLlhhhllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  283
ident                                                             
Sbjct evehlvidrkdlvmtnqeieqttpktvrlgivgkggqgeriystrgiaitlsaygggifa  260
DSSP  hlhhhllllllleellllllllllllleeeelllllllleeeelllllllllllllllll


DSSP  ............................................leeeeeeeeeeellll
Query ............................................lrrelmrqrgyfayas  299
ident                                                             
Sbjct ktggylvngktrklhprecarvmgypdsykvhpstsqaykqfgnsvvinvlqyiaynigs  320
DSSP  llleeeelleeelllhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllllll
Query nhyqthq  306
ident        
Sbjct slnfkpy  327
DSSP  hhlllll


No 48: 1VHSA  MOLECULE: SIMILAR TO PHOSPHINOTHRICIN ACETYLTRANSFERASE;             

DSSP  ..................................................LLLLL.....
Query ..................................................GQDYS.....    5
ident                                                      |      
Sbjct sltlrlaehrdleavvaiynstiasrxvtadtepvtpedrxewfsghtesRPLYVaeden   60
DSSP  lleeeellhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhlllllLLEEEeelll


DSSP  .....LEEEEELLL...LLLEEEEEELhhHHHHHHHHhllllhhhhhhllhhhhhhhHHH
Query .....GFTLTPSAQ...SPRLLELTFTeqTTKQFLEQvaewpvqaleyksflrfrvaKIL   57
ident                       |                                     
Sbjct gnvaaWISFETFYGrpaYNKTAEVSIY..IDEACRGK....................GVG   98
DSSP  lleeeEEEEEELLLlhhHLLEEEEEEE..ELHHHLLL....................LHH


DSSP  HhhllLLHHHHHHHHHHLlLLLEEEEEellllLHHHhHHHHHHHHHHHhhheeellllll
Query DdlcaNQLQPLLLKTLLNrAEGALLINavgvdDVKQaDEMVKLATAVAhligrsnfdams  117
ident        ||  |           |                 ||                 
Sbjct S....YLLQEALRIAPNL.GIRSLXAF....iFGHN.KPSLKLFEKHG............  136
DSSP  H....HHHHHHHHHHHHH.LLLEEEEE....eELLL.HHHHHHHHHLL............


DSSP  lllleeeeellllllllllleeeellllllllllleeEEEEEE..EELLlllleeeeehh
Query gqyyarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeitdyvLMMKID..EQNMqggnslllhld  175
ident                                                             
Sbjct ....................................fAEWGLFpgIAEX...........  149
DSSP  ....................................lEEEEEEeeEEEE...........


DSSP  hlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhh
Query dwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfe  235
ident                                                             
Sbjct ............................................................  149
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeelllLLLEEEEELLleeeeellllllllleeeeeeeeeee
Query egvwlselsdaietskgilsvpvpVGKFLLINNLfwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyf  295
ident                                                             
Sbjct ..................dgkrydLKILGRELSE..........................  165
DSSP  ..................lleeeeEEEEEEELLL..........................


DSSP  lllllllllll
Query ayasnhyqthq  306
ident            
Sbjct ...........  165
DSSP  ...........


No 49: 2IBXA  MOLECULE: HEMAGGLUTININ;                                             

DSSP  .................lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhHLLL.....
Query .................gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqVAEW.....   38
ident                                                             
Sbjct dqicigyhannsteqvdtimeknvtvthaqdilekthngklcdldgvkpliLRDCsvagw   60
DSSP  leeeeeellllllleellllllleellleeeleellllllllllllllleeLLLLlhhhh


DSSP  .....lhHHHHhllhhhhhhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhllllleeeEEELllllhhh
Query .....pvQALEyksflrfrvAKILddlcanqlqplllktllnraegallINAVgvddvkq   93
ident                                                             
Sbjct llgnpmcDEFI...nvpewsYIVE...........kanpvndlcypgdfNDYE.......   99
DSSP  hllllllHHHL...llllllLEEE...........llllllllllleeeLLHH.......


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHE.EELLLL........................llllllEEEEELL
Query ademvklatAVAHLIG.RSNFDA........................msgqyyARFVVKN  128
ident                                                             
Sbjct .......elKHLLSRInHFEKIQiipksswssheaslgvssacpyqgkssffrNVVWLIK  152
DSSP  .......hhHHHHLLLlEEEEEElllllllllllllllleeeeeelleeelllLEELLLL


DSSP  LlllLLLLLEEeELLLlllllLLLEEEEEEEEEEL.............lLLLLEEEEEhh
Query VylrQPHRVMElHNDGtyveeITDYVLMMKIDEQN.............mQGGNSLLLHld  175
ident      |       |            |                                 
Sbjct KnstYPTIKRS.YNNT.....NQEDLLVLWGIHHPndaaeqtklyqnptTYISVGTST..  204
DSSP  LlllLLLEEEE.EELL.....LLLLEEEEEEEEELllhhhhhhhhllllLLEEEELLL..


DSSP  hlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhh
Query dwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfe  235
ident                                                             
Sbjct ............................................................  204
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllEEEL................llLLLEEEEELLlEEEEELLLl
Query egvwlselsdaietskgiLSVP................vpVGKFLLINNLfWLHGRDRFt  279
ident                   |                                         
Sbjct ..................LNQRlvpriatrskvngqsgrmEFFWTILKPN.DAINFESN.  244
DSSP  ..................LEEEellllllllllllllleeEEEEEEELLL.LEEEEEEL.


DSSP  lllllEEEEE..EEEEEELLL....................................llL
Query phpdlRRELM..RQRGYFAYA....................................snH  301
ident                                                             
Sbjct ....gNFIAPeyAYKIVKKGDstimkseleygncntkcqtpmgainssmpfhnihpltiG  300
DSSP  ....lLEEEEleEEEEELLLLlleeellllllllllleeelleelllllleelllllleE


DSSP  LLLLL................
Query YQTHQ................  306
ident                      
Sbjct ECPKYvksnrlvlatglrnsp  321
DSSP  LLLEElllllleeelllllll


No 50: 2A2YA  MOLECULE: DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;                            

DSSP  lllllleeeeellLLLLEEEEEELHHHhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaQSPRLLELTFTEQTtkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                  | |                                        
Sbjct .............MTEKLNEIVVRKTK.................................   14
DSSP  .............LLLLLEEEELLLLL.................................


DSSP  lllLHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEELLLllhhhhhhhhhHHHHHHHHHEEelllllllll
Query canQLQPLLLKTLLNRaEGALLINAVGVddvkqademvkLATAVAHLIGRsnfdamsgqy  120
ident                           |                   |  |          
Sbjct nveDHVLDVIVLFNQG.IDEVILKGTGR.......eiskAVDVYNSLKDR..........   56
DSSP  lhhHHHHHHHHHLLLL.LLLEEEEEELL.......hhhhHHHHHHHHHHH..........


DSSP  leeeeellllllllllleeeelllllllllLLEEE.EEEEEEelllllleeeeehhhlll
Query yarfvvknvylrqphrvmelhndgtyveeiTDYVL.MMKIDEqnmqggnslllhlddweh  179
ident                                   |                         
Sbjct ............................lgDGVQLvNVQTGS..................   70
DSSP  ............................hlLLLLLlLEEEEE..................


DSSP  hhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhh
Query ldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvw  239
ident                                                             
Sbjct ............................................................   70
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhllllleeellllLLEEEEELLleeeeellllllllleeeeeeeeeeellll
Query lselsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLfwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfayas  299
ident                          |                                  
Sbjct ...........evrdrrrisyILLRLKRVY..............................   89
DSSP  ...........eelllleeeeEEEEELLLL..............................


DSSP  lllllll
Query nhyqthq  306
ident        
Sbjct .......   89
DSSP  .......


No 51: 1WYZA  MOLECULE: PUTATIVE S-ADENOSYLMETHIONINE-DEPENDENT                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct etalyllpvtlgdtpleqvlpsynteiirgirhfivedvrsarrflkkvdreididsltf   60
DSSP  llleeeellllllllhhhhlllhhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ....................................................llllllee
Query ....................................................gqdysgft    8
ident                                                             
Sbjct yplnkhtspedisgylkplaggasxgvisedpgadvvaiaqrqklkviplvgpssiilsv  120
DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhhhhhhhhhlllleeelllllhhhhhh


DSSP  eeelllLLLEEEEEElhhhHHHHhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhHHHHhhlllLHHHH
Query ltpsaqSPRLLELTFteqtTKQFleqvaewpvqaleyksflrfrvaKILDdlcanQLQPL   68
ident                                                             
Sbjct xasgfnGQSFAFHGY...lPIEP.......................GERA.....KKLKT  149
DSSP  hhhlllLLLEEEEEE...lLLLL.......................LHHH.....HHHHH


DSSP  HHHHHHLLlLLEEEEEElllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHEEelllllllllleeeeell
Query LLKTLLNRaEGALLINAvgvddvkQADEMVKLATAVAHLIGRsnfdamsgqyyarfvvkn  128
ident |            |                |                             
Sbjct LEQRVYAE.SQTQLFIE.......TPYRNHKXIEDILQNCRP..................  183
DSSP  HHHHHHHH.LLEEEEEE.......LHHHHHHHHHHHHHHLLL..................


DSSP  llllllllleeeellllllllllLEEEEEEEEEELLLllleeeeehhhlllhhhhhllhh
Query vylrqphrvmelhndgtyveeitDYVLMMKIDEQNMQggnslllhlddwehldnyfrhpl  188
ident                           |                                 
Sbjct .......................QTKLCIAANITCEG.......................  197
DSSP  .......................LLEEEEEELLLLLL.......................


DSSP  hhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhhhhhhhh
Query arrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlselsdaie  248
ident                                                             
Sbjct .....................................................efiqtrt  204
DSSP  .....................................................leeeeee


DSSP  llllleeelllLLLEEEEEllleeeeellllllllleeeeeeeeeeelllllllllll
Query tskgilsvpvpVGKFLLINnlfwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfayasnhyqthq  306
ident               |||                                         
Sbjct vkdwkghipkiPCIFLLYK.......................................  223
DSSP  hhhhlllllllLEEEEEEL.......................................


No 52: 2HQYA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ...........................................LLLL..LLEEEEELLLL
Query ...........................................GQDY..SGFTLTPSAQS   15
ident                                                          |  
Sbjct mipfkditladrdtitaftmksdrrncdlsfsnlcswrflydtQFAVidDFLVFKFWAGE   60
DSSP  lllleellhhhhhhhhhhhlllllllhhhlhhhhhhlhhhhllEEEEelLEEEEEEEELL


DSSP  LLEEEEEElhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHL
Query PRLLELTFteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddlCANQLQPLLLKTLLN   75
ident                                                  |   | |    
Sbjct QLAYMMPV.....................................GNGDLKAVLRKLIED   83
DSSP  EEEEELLE.....................................ELLLHHHHHHHHHHH


DSSP  L....LLLEEEEeelllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHEEelllllllllleeeeelllll
Query R....AEGALLInavgvddvkqadeMVKLATAVAHLIGRsnfdamsgqyyarfvvknvyl  131
ident           |                                                 
Sbjct AdkekHNFCMLG............vCSNMRADLEAILPE.....................  110
DSSP  HhhhlLLLEEEE............eLHHHHHHHHHHLLL.....................


DSSP  lllllleeeellllllllllLEEEEEE...EEEEL.........................
Query rqphrvmelhndgtyveeitDYVLMMK...IDEQN.........................  163
ident                                |                            
Sbjct ....................RFIFTEDrayADYIYlrsdlatlkgkkfqakrnhinrfrn  150
DSSP  ....................LEEEEELhhhLEEEEehhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................llllleeeeehhhlllhhh
Query .........................................mqggnslllhlddwehldn  182
ident                                                             
Sbjct typdyeytpitpdriqecldleaewckvnncdqqegtgnerraliyalhnfealgltggi  210
DSSP  hlllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlleeee


DSSP  hhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhhhh
Query yfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwlse  242
ident                                                             
Sbjct lhvngkivaftfgmpinhetfgvhvekadtsidgayaminyefanripeqyiyinreedl  270
DSSP  eeelleeeeeeeeeeeelleeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllllleeelllll


DSSP  hhhhhhllllleeellllLLEEEEELLLeeeeellllllllleeeeeeeeeeelllllll
Query lsdaietskgilsvpvpvGKFLLINNLFwlhgrdrftphpdlrrelmrqrgyfayasnhy  302
ident                    |                                        
Sbjct gieglrkaklsyqpvtilEKYMACLKDH................................  298
DSSP  llhhhhhhhhhlllleeeLLEEEEELLL................................


DSSP  llll
Query qthq  306
ident     
Sbjct ....  298
DSSP  ....


No 53: 2H6BA  MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;                             

DSSP  llllllEEEE......ELLLllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhh
Query gqdysgFTLT......PSAQsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrva   54
ident                                                             
Sbjct ......VEGLgkdfcgAIIP........................................   14
DSSP  ......LLLLeeeellEEEE........................................


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeEEEElllllhhhhhHHHHhhhhhhhhheeelll
Query kilddlcanqlqplllktllnraegalLINAvgvddvkqadEMVKlatavahligrsnfd  114
ident                                                             
Sbjct .........................dnFFPI.........eKLRN...............   25
DSSP  .........................llLLLL.........hHHHH...............


DSSP  llllLLLEEEEELllllllLLLL.EEEELLlllllllllEEEEEEEEEellllLLEEEEe
Query amsgQYYARFVVKnvylrqPHRV.MELHNDgtyveeitdYVLMMKIDEqnmqgGNSLLLh  173
ident     |                                                       
Sbjct ..ytQMGLIRDFA......KGSAvIMPGEE........iTSMIFLVEG....kIKLDII.   64
DSSP  ..lhHHLEEEEEL......LLLEeELLLLL........lLLEEEEEEL....lEEEEEE.


DSSP  hhhlllhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelll
Query lddwehldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkd  233
ident                                                             
Sbjct ............................................................   64
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlLLLLEEELLLLLLEEEE.ELLLEEEEELllllllllEEEEEEEE
Query feegvwlselsdaietSKGILSVPVPVGKFLLI.NNLFWLHGRDrftphpdlRRELMRQR  292
ident                     |                                       
Sbjct .............fedGSEKLLYYAGGNSLIGKlYPTGNNIYAT.....amePTRTCWFS  106
DSSP  .............lllLLEEEEEEELLLLEELLlLLLLLEEEEE.....ellLEEEEEEL


DSSP  E...........................................................
Query G...........................................................  293
ident                                                             
Sbjct Ekslrtvfrtdedmifeifknyltkvayyarqvaemntynptirilrlfyelcssqgkrv  166
DSSP  Hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllhhhhhhhhhhhhhhleee


DSSP  ...............................eellLLLLLLLLL................
Query ...............................yfayASNHYQTHQ................  306
ident                                                             
Sbjct gdtyeitmplsqksigeitgvhhvtvsrvlaclkrENILDKKKNkiivynlgelkhlseq  226
DSSP  lleeeeellllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhLLLEEELLLeeeellhhhhhhhhll


DSSP  .............
Query .............  306
ident              
Sbjct tsvdklaaaldhh  239
DSSP  lleehhhhhhlll


No 54: 1XJAA  MOLECULE: ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN;                       

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhHHHHllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqALEYksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct .....................................pllpGYSF...............    8
DSSP  .....................................llllLLLL...............


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhEEELllllllll
Query canqlqplllktllnraegallinavgvddvkqademvklatavahliGRSNfdamsgqy  120
ident                                                             
Sbjct ...............................................nAHLV........   13
DSSP  ...............................................lLLEE........


DSSP  LEEEEE.LLLLllllllLEEE.ELLLlllllllLEEEEEEEEEellllLLEEEeehhhll
Query YARFVV.KNVYlrqphrVMEL.HNDGtyveeitDYVLMMKIDEqnmqgGNSLLlhlddwe  178
ident         |                         | |   |       |           
Sbjct AGLTPIeANGV...ldfFIDRpLGMK.......GYILNLTIRG....qGVVKN.......   52
DSSP  EEEEEEeLLLL...lllEEEElLLLL.......LEEEEEEEEE....lEEEEE.......


DSSP  lhhhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhh
Query hldnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegv  238
ident                                                             
Sbjct ............................................................   52
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllLLEEELLLLLLEEEEELLlEEEEEllllllllLEEEEEEEEEEELLL
Query wlselsdaietskGILSVPVPVGKFLLINNLfWLHGRdrftphpdLRRELMRQRGYFAYA  298
ident                       |  ||       |                         
Sbjct .............QGREFVCRPGDILLFPPG.EIHHY..grhpeaREWYHQWVYFRPRAY   96
DSSP  .............LLEEEEELLLLEEEELLL.LLEEE..eellllLEEEEEEEEELLLHH


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  298
ident                                                             
Sbjct whewlnwpsifantgffrpdeahqphfsdlfgqiinagqgegrysellainlleqlllrr  156
DSSP  hhhhlllleeelleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .llllllll
Query .snhyqthq  306
ident          
Sbjct meaineslh  165
DSSP  hhhhhhlll


No 55: 1CX4A  MOLECULE: CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT           

DSSP  lllllleeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query gqdysgftltpsaqsprlleltfteqttkqfleqvaewpvqaleyksflrfrvakilddl   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhHHHHHHHHHHhhHHHHheeelllllllLL
Query canqlqplllktllnraegallinavgvddvKQADEMVKLAtaVAHLigrsnfdamsgQY  120
ident                                    |  |                     
Sbjct ....................riihpktddqrNRLQEACKDI.lLFKN.ldpeqmsqvlDA   38
DSSP  ....................lllllllhhhhHHHHHHHLLL.hHHLL.llhhhhhhhhHH


DSSP  LEEEEELlllllllllleEEELLllllllllleEEEEEEEEellllLLEEeeehhhlllh
Query YARFVVKnvylrqphrvmELHNDgtyveeitdyVLMMKIDEqnmqgGNSLllhlddwehl  180
ident      ||               |                                     
Sbjct MFEKLVK.....egehviDQGDD........gdNFYVIDRG....tFDIY..........   71
DSSP  LEEEEEL.....llleeeLLLLL........llEEEEEEEL....eEEEE..........


DSSP  hhhhllhhhhlleeellllllllllleeelleeellllleeelllllleelllhhhhhhh
Query dnyfrhplarrpmrfaappsknvskdvfhpvfdvdqqgrpvmryidqfvqpkdfeegvwl  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................   71
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhHHLLLLLEEELLLLLLEEEEEL....LLEEEEELllllllllEEEEEEEEE...
Query selsdaIETSKGILSVPVPVGKFLLINN....LFWLHGRDrftphpdlRRELMRQRG...  293
ident            |                                       |        
Sbjct .....vKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELAlmynTPRAATIT.....atsPGALWGLDRvtf  121
DSSP  .....eEELLEEEEEEEEELLLEELHHHhhhlLLLLLEEE.....ellLEEEEEEEHhhh


DSSP  ...EELL....LLLL.............................................
Query ...YFAY....ASNH.............................................  301
ident                                                             
Sbjct rriIVKNnakkRKMYesfieslpflkslevserlkvvdvigtkvyndgeqiiaqgdsads  181
DSSP  hhhHHHHhhhhHHHHhhhhhllhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  301
ident                                                             
Sbjct ffivesgevritmkrngaveiarclrgqyfgelalvtnkpraasahaigtvkclamdvqa  241
DSSP  eeeeeeeeeeeeeellleeeeeeelllleellhhhhhlllllleeeeeeeeeeeeeehhh


DSSP  .............................lllll
Query .............................yqthq  306
ident                                   
Sbjct ferllgpcmeimkrniatyeeqlvalfgtnmdiv  275
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll