DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1KU9A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.

Summary

Notation:
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1KU9-A 23.8  0.0  151   151  100   HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223;                                "         
   2:  1SFX-A  9.9  2.5   90   109   22   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;                     "         
   3:  2NYX-A  9.3  9.8   76   146    8   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,               "         
   4:  1Q1H-A  9.0  2.5   75    85   29   TRANSCRIPTION FACTOR E;                                    "         
   5:  2D1H-A  8.9  4.3   95   102   23   109AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL                    "         
   6:  2P4W-A  8.8  3.3   86   197   20   TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;            "         
   7:  2NR3-A  8.7  4.9   82   168   23   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
   8:  2NNN-A  8.7  1.8   69   134   12   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
   9:  1QBJ-A  8.7  2.2   63    65   16   PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE            "         
  10:  2FE3-A  8.6  6.4   84   141   19   PEROXIDE OPERON REGULATOR;                                 "         
  11:  2HEO-A  8.5  1.4   58    59   14   Z-DNA BINDING PROTEIN 1;                                   "         
  12:  1SFU-A  8.5  3.1   67    70   16   34L PROTEIN;                                               "         
  13:  2DK5-A  8.4  1.6   68    91   18   DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA                     "         
  14:  1R1U-A  8.4  2.0   66    94   23   REPRESSOR PROTEIN;                                         "         
  15:  1SD4-A  8.2  9.6   77   122   12   PENICILLINASE REPRESSOR;                                   "         
  16:  1LNW-A  8.2  9.2   72   141   15   MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR;                     "         
  17:  2OQG-A  8.1  5.6   88   109   16   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY            "         
  18:  2HZT-A  8.1  3.2   72    98   17   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YTCD;          "         
  19:  1Z1D-A  8.1  1.9   65    69   17   REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT;                      "         
  20:  1MZB-A  8.1  6.5   84   133   13   FERRIC UPTAKE REGULATION PROTEIN;                          "         
  21:  2FXA-A  7.9 10.3   68   156   22   PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;                "         
  22:  1LVA-A  7.8 11.8   81   258   14   SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;                 "         
  23:  2G9W-A  7.7  5.2   94   119   16   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  24:  2ETH-A  7.7 10.3   86   141   17   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE, MAR FAMILY;           "         
  25:  1P4X-A  7.7  2.8   80   250   16   STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A HOMOLOGUE;            "         
  26:  1JGS-A  7.7  9.5   74   138   15   MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR;               "         
  27:  2HOE-A  7.5  9.9   97   354   14   N-ACETYLGLUCOSAMINE KINASE;                                "         
  28:  2FBH-A  7.5  2.1   73   137   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA3341;                          "         
  29:  2DK8-A  7.5  3.8   67    81   12   DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA                     "         
  30:  1R1T-A  7.5  2.2   66    98   24   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR SMTB;                            "         
  31:  1HST-A  7.5  1.9   62    74   11   HISTONE H5;                                                "         
  32:  2O03-A  7.4  7.5   83   129   16   PROBABLE ZINC UPTAKE REGULATION PROTEIN FURB;              "         
  33:  2GXG-A  7.4  9.5   76   140   21   146AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL                    "         
  34:  2FA5-A  7.4  1.7   64   139   22   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY;                "         
  35:  1YYV-A  7.4  2.3   67   114   18   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  36:  2F2E-A  7.3  8.4   82   142   13   PA1607;                                                    "         
  37:  2A61-A  7.3 11.5   85   142   14   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TM0710;                          "         
  38:  1S3J-A  7.3  6.5   74   143   18   YUSO PROTEIN;                                              "         
  39:  1MKM-A  7.3  2.5   71   246   20   ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            "         
  40:  2CWE-A  7.2  7.6  106   191   14   HYPOTHETICAL TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN,              "         
  41:  1LJ9-A  7.2  8.4   73   144   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA;                            "         
  42:  2OBP-A  7.1  2.6   66    81   12   PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;                              "         
  43:  2IA2-A  7.1  9.6   98   250   13   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  44:  2HR3-A  7.1 11.9   80   139   11   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  45:  1Z91-A  7.1  2.8   73   137   15   ORGANIC HYDROPEROXIDE RESISTANCE TRANSCRIPTIONAL           "         
  46:  1Z05-A  7.1  8.7   97   396   10   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY;                     "         
  47:  1J5Y-A  7.0  8.4   93   172   15   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR                "         
  48:  2BV6-A  6.9  2.5   69   137   20   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MGRA;                   "         
  49:  1XN7-A  6.9  1.9   61    78   16   HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG;                                 "         
  50:  1UB9-A  6.9  5.7   72   100   18   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1061;                               "         
  51:  1TQI-A  6.9  2.8   74   269   12   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  52:  2FSW-A  6.8  2.1   67   102   13   PG_0823 PROTEIN;                                           "         
  53:  1W1W-E  6.8  2.8   63    70   13   STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1;                    "         
  54:  2FRH-A  6.7  3.3   77   127   13   STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;                      "         
  55:  2FBI-A  6.7  1.8   70   136   21   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  56:  1Z7U-A  6.7 10.2   79   111   13   HYPOTHETICAL PROTEIN EF0647;                               "         
  57:  1XMK-A  6.7  3.7   69    79    9   DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;          "         
  58:  1U2W-A  6.7  2.0   63   105   22   CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;                   "         
  59:  1IN4-A  6.7  2.2   64   298   11   HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB;                       "         
  60:  1I1S-A  6.7  2.3   69    96   13   MOTA;                                                      "         
  61:  1BIA-A  6.7  7.3  101   292   10   BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN;                                 "         
  62:  2E1N-A  6.6  2.1   67   110   19   PEX;                                                       "         
  63:  1JHF-A  6.6  3.2   70   197   17   LEXA REPRESSOR;                                            "         
  64:  1XMA-A  6.5  2.6   66   101   14   PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                       "         
  65:  1UCR-A  6.5  2.1   63    74   13   PROTEIN DSVD;                                              "         
  66:  1U5T-A  6.5  3.2   72   213   13   APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;                "         
  67:  1STZ-A  6.5 11.9   93   323   17   HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA                "         
  68:  2H09-A  6.4  6.2   74   127   12   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;                            "         
  69:  1W5S-A  6.4  2.1   66   390   11   ORC2;                                                      "         
  70:  2NS0-A  6.3  2.8   64    85   13   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  71:  2HTJ-A  6.3  5.8   78    81   13   P FIMBRIAL REGULATORY PROTEIN KS71A;                       "         
  72:  2ESH-A  6.3  9.3   69   114   19   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN TM0937;                     "         
  73:  1P6R-A  6.3  2.6   69    82   16   PENICILLINASE REPRESSOR;                                   "         
  74:  1FX7-A  6.3  7.2   71   230   15   IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;                             "         
  75:  1X19-A  6.2  7.7   77   350    8   CRTF-RELATED PROTEIN;                                      "         
  76:  1TBX-A  6.2  1.8   62    94   18   HYPOTHETICAL 11.0 KDA PROTEIN;                             "         
  77:  1T6S-A  6.2 14.4   83   162    8   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  78:  2CO5-A  6.1  2.0   64    92   13   VIRAL PROTEIN F93;                                         "         
  79:  1ZG3-A  6.1  3.4   81   358   22   ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE;                       "         
  80:  1YG2-A  6.1 10.6   71   169   21   GENE ACTIVATOR APHA;                                       "         
  81:  1KGS-A  6.1  4.9   71   219   17   DNA BINDING RESPONSE REGULATOR D;                          "         
  82:  1P2F-A  6.0  3.5   72   217   19   RESPONSE REGULATOR;                                        "         
  83:  1FP1-D  6.0  3.8   83   341   12   ISOLIQUIRITIGENIN 2'-O-METHYLTRANSFERASE;                  "         
  84:  2O0Y-A  5.9 11.7  104   242    7   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  85:  2IXS-A  5.9  9.8  105   319   12   SDAI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             "         
  86:  1Y0U-A  5.9  2.2   56    89   23   ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE;           "         
  87:  1LDD-A  5.9  1.9   57    74   21   ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;                                "         
  88:  1FT9-A  5.9  2.7   66   210   12   CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION             "         
  89:  1CF7-A  5.9  1.9   58    67   17   PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);                      "         
  90:  2PG4-A  5.8  1.9   67    92   12   UNCHARACTERIZED PROTEIN;                                   "         
  91:  2JSC-A  5.8  5.2   70    96   20   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050;                  "         
  92:  1U6G-A  5.8 10.9   89   715    9   CULLIN HOMOLOG 1;                                          "         
  93:  1YLF-A  5.7  4.6   87   117   10   RRF2 FAMILY PROTEIN;                                       "         
  94:  2P6R-A  5.6  8.3  101   683    7   AFUHEL308 HELICASE;                                        "         
  95:  2FBK-A  5.6  8.4   68   156   19   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, MARR FAMILY;                    "         
  96:  2CFX-A  5.6 10.7   65   140   15   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;                   "         
  97:  1ODD-A  5.6  2.6   68   100   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN OMPR;                   "         
  98:  2IA0-A  5.5 10.7   75   156   20   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
  99:  2GAI-A  5.5  3.7   77   581   12   DNA TOPOISOMERASE I;                                       "         
 100:  2FOK-A  5.5  4.0   71   558   15   FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             "         
 101:  2CGP-A  5.5  2.6   72   200   15   PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);               "         
 102:  1UST-A  5.5  2.6   61    92   13   HISTONE H1;                                                "         
 103:  1FNN-A  5.5  2.1   65   379   18   CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 6;                           "         
 104:  2HS5-A  5.4  4.9   78   207   13   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR GNTR;                   "         
 105:  2FNA-A  5.4  2.6   64   352   20   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
 106:  2HWV-A  5.3  2.8   67   101   10   DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR VICR;                       "         
 107:  1WY0-A  5.3 10.3   75   327    7   GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;                   "         
 108:  1OYW-A  5.3  2.8   65   516    9   ATP-DEPENDENT DNA HELICASE;                                "         
 109:  1E17-A  5.3  3.3   65    90   14   AFX;                                                       "         
 110:  1CY0-A  5.3  2.6   64   534    9   DNA TOPOISOMERASE I;                                       "         
 111:  2DBB-A  5.2  6.6   65   146   23   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
 112:  2COH-A  5.2  2.5   72   194   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
 113:  2CMX-A  5.2  2.5   60    70   27   HYPOTHETICAL 13.2 KDA PROTEIN;                             "         
 114:  2C6Y-A  5.2  2.3   63    98   13   INTERLEUKIN 2 PROMOTOR;                                    "         
 115:  2GWR-A  5.1  3.4   68   225   15   DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR MTRA;                       "         
 116:  2FYN-A  5.1  7.1   79   428    8   CYTOCHROME B;                                              "         
 117:  1GXP-A  5.1  3.6   68   103   12   5'-D(*GP*AP*GP*CP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*                       "         
 118:  1BM9-A  5.1  8.2   71   120   15   REPLICATION TERMINATOR PROTEIN;                            "         
 119:  2HYE-C  5.0 11.1   88   719    9   DNA DAMAGE-BINDING PROTEIN 1;                              "         
 120:  1OYI-A  5.0  2.0   54    62   15   DOUBLE-STRANDED RNA-BINDING PROTEIN;                       "         
 121:  1NHA-A  4.9  2.6   55    67   20   TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF, ALPHA                 "         
 122:  1I1G-A  4.9  9.2   64   140   20   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;                            "         
 123:  1GKU-B  4.9  2.5   60  1011   13   REVERSE GYRASE;                                            "         
 124:  2V1X-A  4.8  3.4   71   527    7   ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1;                             "         
 125:  2EV0-A  4.8 10.7   67   131   15   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;                            "         
 126:  2CG4-A  4.8  8.1   68   150    7   REGULATORY PROTEIN ASNC;                                   "         
 127:  1B4A-A  4.8  7.9   85   146   12   ARGININE REPRESSOR;                                        "         
 128:  2QC0-A  4.7  3.6   79   367   13   UNCHARACTERIZED PROTEIN;                                   "         
 129:  2DU9-A  4.7  6.0   91   116   11   PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATORS;                      "         
 130:  2DI3-A  4.7  5.2   84   231   14   BACTERIAL REGULATORY PROTEINS, GNTR FAMILY;                "         
 131:  1R7J-A  4.7  8.3   63    90   14   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A;                     "         
 132:  1WI9-A  4.6  3.0   62    72   11   PROTEIN C20ORF116 HOMOLOG;                                 "         
 133:  1I7D-A  4.6  2.7   66   620   15   DNA TOPOISOMERASE III;                                     "         
 134:  2GAU-A  4.5  2.8   75   218    9   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;                 "         
 135:  2ESN-A  4.5 11.4   73   299   16   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
 136:  1ZYB-A  4.5  2.9   71   230   11   TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY;                       "         
 137:  2B0L-A  4.4  3.1   70    98   20   GTP-SENSING TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC                    "         
 138:  2A5Y-B  4.4  3.1   66   501    9   APOPTOSIS REGULATOR CED-9;                                 "         
 139:  1UFM-A  4.4  5.1   67    84    9   COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;                                    "         
 140:  1E2X-A  4.4  5.7   93   222    5   FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;                   "         
 141:  1D8J-A  4.4  3.6   64    81   13   GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;                   "         
 142:  2OD5-A  4.3  3.3   62    91   15   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
 143:  1W36-D  4.3 13.2   93   538   10   DNA HAIRPIN;                                               "         
 144:  1U5T-C  4.3 10.1   93   178    4   APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;                "         
 145:  1BBY-A  4.3  2.9   64    69   14   RAP30;                                                     "         
 146:  1WFX-A  4.2  4.6   77   180   10   PROBABLE RNA 2'-PHOSPHOTRANSFERASE;                        "         
 147:  1RI7-A  4.2  8.6   76   146   16   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
 148:  1WJ5-A  4.1  4.8   67   120   12   HYPOTHETICAL PROTEIN (RIKEN CDNA 0610009H20);              "         
 149:  2P5V-A  4.0  6.6   68   156   21   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;                "         
 150:  2IP2-A  4.0  9.1   80   330    5   PROBABLE PHENAZINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE;             "         
 151:  2IJL-A  4.0  7.6   67   110   10   MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;              "         
 152:  2HYD-A  4.0  4.9   61   578    2   ABC TRANSPORTER HOMOLOG;                                   "         
 153:  2HKX-A  4.0  2.7   72   218   14   CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION             "         
 154:  1YIO-A  4.0  2.5   53   198   17   RESPONSE REGULATORY PROTEIN;                               "         
 155:  2NOV-A  3.9  5.6   95   440    6   DNA TOPOISOMERASE 4 SUBUNIT A;                             "         
 156:  1RP3-A  3.9  6.3   54   235   17   RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA);               "         
 157:  1QZZ-A  3.9 11.8   89   340    9   ACLACINOMYCIN-10-HYDROXYLASE;                              "         
 158:  1DVE-A  3.9  4.9   65   214    5   HEME OXYGENASE-1;                                          "         
 159:  1A04-A  3.9  2.9   53   205   15   NITRATE/NITRITE RESPONSE REGULATOR PROTEIN NARL;           "         
 160:  2H6B-A  3.7  3.0   62   239   18   CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;                             "         
 161:  2BS2-C  3.7  5.5   76   254    3   QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A;          "         
 162:  1O57-A  3.7  3.6   57   270   11   PUR OPERON REPRESSOR;                                      "         
 163:  1FSE-A  3.7  2.8   52    67   23   GERE;                                                      "         
 164:  2FEZ-A  3.6 11.9   88   373   13   PROBABLE REGULATORY PROTEIN EMBR;                          "         
 165:  1T98-A  3.6  9.5   91   266    8   CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;                         "         
 166:  1O7D-C  3.6  1.8   45   150    7   LYSOSOMAL ALPHA-MANNOSIDASE;                               "         
 167:  1L0O-C  3.6  3.3   47    57   13   ANTI-SIGMA F FACTOR;                                       "         
 168:  1S6L-A  3.5  3.3   66   192    6   ALKYLMERCURY LYASE;                                        "         
 169:  2HGC-A  3.4  2.9   59    78    8   YJCQ PROTEIN;                                              "         
 170:  2H7O-A  3.4  1.9   45   270   11   PROTEIN KINASE YPKA;                                       "         
 171:  2G7H-A  3.4  4.8   57   167   21   METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE                           "         
 172:  2O8X-A  3.3  2.5   45    61   11   PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR;                    "         
 173:  2AXL-A  3.3 10.5   75   144   11   WERNER SYNDROME;                                           "         
 174:  1S29-A  3.3  4.5   59    92    7   LA PROTEIN;                                                "         
 175:  1R71-A  3.3  6.0   57   114   12   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;                    "         
 176:  1EH6-A  3.3  2.6   56   168    5   O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;                      "         
 177:  2GMG-A  3.2  2.8   58   105   14   HYPOTHETICAL PROTEIN PF0610;                               "         
 178:  1X3U-A  3.2  3.0   57    79   14   TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN FIXJ;                   "         
 179:  1WLQ-C  3.2  4.9   88   185    7   GEMININ;                                                   "         
 180:  1FC3-A  3.2  4.0   67   119    9   SPO0A;                                                     "         
 181:  2P8T-A  3.1  9.0   64   184   25   HYPOTHETICAL PROTEIN PH0730;                               "         
 182:  2HQR-A  3.1  5.8   71   223    7   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
 183:  1RZ4-A  3.1  8.9   73   213    8   EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3                 "         
 184:  1OTV-A  3.1  3.6   70   254    9   COENZYME PQQ SYNTHESIS PROTEIN C;                          "         
 185:  1J1J-A  3.1  4.9   69   217    9   TRANSLIN;                                                  "         
 186:  2BKN-A  3.0  2.6   53   190    9   HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236;                               "         
 187:  1K78-A  3.0  6.3   69   124   14   PAIRED BOX PROTEIN PAX5;                                   "         
 188:  1B9M-A  3.0  7.3   77   258   12   PROTEIN (MODE);                                            "         
 189:  2O7T-A  2.9  4.0   61   188   10   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
 190:  2IW5-B  2.9  4.2   54   133    6   LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;                     "         
 191:  2GA1-A  2.9  2.5   47   101    9   PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION DUF433;                        "         
 192:  1ZEL-A  2.9 12.9   80   293    8   HYPOTHETICAL PROTEIN RV2827C;                              "         
 193:  1Q16-C  2.9  9.7   78   224    6   RESPIRATORY NITRATE REDUCTASE 1 ALPHA CHAIN;               "         
 194:  2PFT-A  2.8  2.5   43   519    2   EXOCYTOSIS PROTEIN;                                        "         
 195:  2FQ3-A  2.8  3.2   54    85    7   TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;                     "         
 196:  1PP8-F  2.8  3.6   67   113    9   39 KDA INITIATOR BINDING PROTEIN;                          "         
 197:  1P4W-A  2.8  3.3   54    87   15   RCSB;                                                      "         
 198:  1OMI-A  2.8  2.8   67   224   10   LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;                          "         
 199:  1KQ8-A  2.8  3.2   57    75   19   HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 3 FORKHEAD HOMOLOG 1;            "         
 200:  1JKU-A  2.8  1.6   51   266    2   PSEUDOCATALASE;                                            "         
 201:  1FSH-A  2.8  3.4   57    94   14   DISHEVELLED-1;                                             "         
 202:  2UXH-A  2.7  4.0   62   206   13   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;                   "         
 203:  2OWO-A  2.7  2.8   46   586   11   26-MER;                                                    "         
 204:  2EWF-A  2.7  4.1   75   587   12   NICKING ENDONUCLEASE N.BSPD6I;                             "         
 205:  2DOA-A  2.7  4.2   65   104   11   RNA POLYMERASE II ELONGATION FACTOR ELL;                   "         
 206:  2BDP-A  2.7 11.6   76   580   12   PROTEIN (DNA POLYMERASE I);                                "         
 207:  1V3F-A  2.7  3.8   73   120   15   PLECKSTRIN 2;                                              "         
 208:  1U78-A  2.7  7.7   73   103    5   TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;                      "         
 209:  1D8Y-A  2.7 12.6   83   601   10   DNA POLYMERASE I;                                          "         
 210:  2O3F-A  2.6  3.1   53    83   11   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;          "         
 211:  2CWL-A  2.6  5.0   57   299    5   MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE;                             "         
 212:  1XME-A  2.6  3.8   67   557    4   CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE I;                        "         
 213:  1MJG-A  2.6  4.4   81   672    6   CARBON MONOXIDE DEHYDROGENASE BETA SUBUNIT;                "         
 214:  1IXC-A  2.6 11.6   82   289    7   LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN;                              "         
 215:  1HBX-G  2.6  6.2   70   112   13   SERUM RESPONSE FACTOR;                                     "         
 216:  1AB4-A  2.6  4.5   99   477    8   GYRASE A;                                                  "         
 217:  2OFL-A  2.5  3.9   60   221   13   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
 218:  2NTZ-A  2.5  8.0   69   183   10   PARB;                                                      "         
 219:  1OM2-A  2.5  8.2   66    95   11   PROTEIN (MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT             "         
 220:  1MGT-A  2.5  2.0   55   169   18   PROTEIN (O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE);          "         
 221:  2V1D-A  2.4  8.9   97   666    9   LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1;                             "         
 222:  2AXT-D  2.4  3.0   57   340    2   PHOTOSYSTEM Q(B) PROTEIN;                                  "         
 223:  1WRJ-A  2.4  1.9   51   150   16   METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE                           "         
 224:  1W9C-A  2.4  2.9   53   321    6   CRM1 PROTEIN;                                              "         
 225:  1HLV-A  2.4  9.1   79   131   10   MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;                            "         
 226:  1HKQ-A  2.4  3.3   67   125   10   REPLICATION PROTEIN;                                       "         
 227:  1EYS-M  2.4  8.1   79   318    4   PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;                            "         
 228:  1DE4-C  2.4  6.8   81   635    6   HEMOCHROMATOSIS PROTEIN;                                   "         
 229:  1BGW-A  2.4  3.4   85   679    6   TOPOISOMERASE;                                             "         
 230:  1AKH-A  2.4  2.5   37    49    5   PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1);                         "         
 231:  2OF7-A  2.3  6.2   80   191   14   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
 232:  2NPP-B  2.3  3.0   45   388    2   PROTEIN PHOSPHATASE 2, REGULATORY SUBUNIT A (PR            "         
 233:  2IPQ-X  2.3  3.0   62   121   10   HYPOTHETICAL PROTEIN STY4665;                              "         
 234:  2GLO-A  2.3  3.6   46    59    9   BRINKER CG9653-PA;                                         "         
 235:  2FUG-2  2.3  6.3   74   178    5   NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;                       "         
 236:  2DAO-A  2.3  3.2   63   118   10   TRANSCRIPTION FACTOR ETV6;                                 "         
 237:  2B9R-A  2.3  9.0   80   254   10   HUMAN CYCLIN B1;                                           "         
 238:  1VIN-A  2.3  4.9   70   252   11   CYCLIN A;                                                  "         
 239:  1V4R-A  2.3  4.2   60   100   10   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;                                 "         
 240:  1T33-A  2.3  3.9   61   220    8   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR              "         
 241:  1M2V-B  2.3  4.7   79   748   11   PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23;                           "         
 242:  1L8Q-A  2.3  3.4   61   321   18   CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA;            "         
 243:  1D3U-B  2.3  3.8   71   201   10   TATA-BINDING PROTEIN;                                      "         
 244:  2NRA-C  2.2  5.5   81   252   15   PI PROTEIN;                                                "         
 245:  2IF4-A  2.2  7.8   66   258    2   ATFKBP42;                                                  "         
 246:  2CFP-A  2.2  2.6   60   417    5   LACTOSE PERMEASE;                                          "         
 247:  1O4X-A  2.2  3.0   41   127   15   TRANSCRIPTION FACTOR OCT-1;                                "         
 248:  2H9U-A  2.1  2.8   50   101    8   DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;                            "         
 249:  2EUF-A  2.1  3.6   61   244   11   VIRAL CYCLIN;                                              "         
 250:  2DI4-A  2.1  3.9   62   176   15   CELL DIVISION PROTEIN FTSH HOMOLOG;                        "         
 251:  2DH4-A  2.1  9.3   75   326    7   YPL069C;                                                   "         
 252:  2CSO-A  2.1  3.0   57   127   12   PLECKSTRIN;                                                "         
 253:  1ZH5-A  2.1  7.4   67   185    6   LUPUS LA PROTEIN;                                          "         
 254:  1REP-C  2.1  7.8   72   214    4   DNA (5'-                                                   "         
 255:  1NEX-A  2.1 10.3   59   129    5   CENTROMERE DNA-BINDING PROTEIN COMPLEX CBF3                "         
 256:  2NRJ-A  2.0  6.1   76   338   11   HBL B PROTEIN;                                             "         
 257:  2ID3-A  2.0  4.2   62   191   13   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
 258:  2CW7-A  2.0  4.8   69   537   17   ENDONUCLEASE PI-PKOII;                                     "         
 259:  2BYV-E  2.0  6.9   74   922   15   RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4;                  "         
-

No 1: 1KU9A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223;

DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE  120
DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query EEKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD  151
ident |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct EEKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD  151
DSSP  LLHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL


No 2: 1SFXA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                           |    |  |         | |  ||  |   |  
Sbjct ......hxsnplgelvkalekLSFKPSDVRIYSLLLER.GGXRVSEIARELDLSARFVRD   53
DSSP  ......llllhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhll
Query SLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKkleekcn  119
ident  || |   ||||            | |       |         |               
Sbjct RLKVLLKRGFVRREIVEKgWVGYIYSAEKPEKVLKEFKSSILGEIERIEKXFT.......  106
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEEELlLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.......


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct .............................dgs  109
DSSP  .............................lll


No 3: 2NYXA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,

DSSP  .............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHH
Query .............xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDI   47
ident                                               ||     |      
Sbjct pataeesvdvitdalltasrllvaisahsiaqvDENITIPQFRTLVILSNH.GPINLATL   59
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLEEHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLL.LLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query XEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGER.KNYYEAVDGfssikdiakrkhdliak  106
ident    |             |              |                           
Sbjct ATLLGVQPSATGRXVDRLVGAELIDRLPHPTSRrELLAALTKR..............grd  105
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLlLEEEEELHH..............hhh


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekeFIKQKIKGierxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct vvrqvtehrrteiariveQXAPAERH....glvraltafteagge  146
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLHHHHH....hhhhhhhhhhhhlll


No 4: 1Q1HA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR E;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLlLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfsELAKIHgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                  |||   |   |  |  ||       |   |   | |    |  
Sbjct .......mvnaedlfiNLAKSL.LGDDVIDVLRILLDKGTEMTDEEIANQLNIKVNDVRK   52
DSSP  .......llllllhhhHHHHLL.LLLLLHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLL.LLLLLEEEELlHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGFVRKVWIK.GERKNYYEAVdGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident  |  ||| |||       |    |                                    
Sbjct KLNLLEEQGFVSYRKTRsGWFIYYWKPN.IDQIN..........................   85
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEELlLLLEEEEELL.HHHHL..........................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct ................................   85
DSSP  ................................


No 5: 2D1HA MOLECULE: 109AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL

DSSP  llhhhhhhhHHHHHHhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkLIIELFseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                              ||        || |        | ||  |  
Sbjct .....xxkeKLESKKdeIRCCYKITDTDVAVLLKXVEIEKPITSEELADIFKLSKTTVEN   55
DSSP  .....llhhHHHHHHhhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAV.DGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEdlkkleekcn  119
ident ||||| ||| |         | ||         |                          
Sbjct SLKKLIELGLVVRTKT...PKYYYSISsNILEKIRNDLLNCAKRXELAAT..........  102
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEL...LLEEEEELlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..........


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct ................................  102
DSSP  ................................


No 6: 2P4WA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfsELAKihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                         |         |     |   |    ||      |  
Sbjct .......mgeelnrllDVLG....NETRRRILFLLTKR..PYFVSELSRELGVGQKAVLE   47
DSSP  .......llhhhhhhhHHHH....LHHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLL...LLLLEEEELL.HHHH........hHHHH...........
Query SLKKLEELGFVRKVWIKG...ERKNYYEAVD.GFSS........iKDIA...........   97
ident  |  ||| |       |        ||                                 
Sbjct HLRILEEAGLIESRVEKIprgRPRKYYMIKKgLRLEilltptlfgSEMYeakgvrkspey  107
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEELLLlllLLLEEEEELLlEEEEeeeelleeeEEEEelllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   97
ident                                                             
Sbjct eqakeliksqepinvkmrelaeflhelnerireiieekreleearilietyientmrrla  167
DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........hhhhhhhHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query ...........krkhdliAKTYEDLKKLEEkcneeekefikqkikgierxkkisekilea  146
ident                      |    |                                 
Sbjct eenrqiieeifrdiekilPPGYARSLKEKF..............................  197
DSSP  hhlhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHLLL..............................


DSSP  hhhll
Query lndld  151
ident      
Sbjct .....  197
DSSP  .....


No 7: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL......LLEEHHHHHHHHL..
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD......KPLTISDIXEELK..   52
ident                        ||         |           |||           
Sbjct .................naeALQLNSTEVRILGCLIEKQatnpetYPLTLNALVIACNqk   43
DSSP  .................lllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhLLEEHHHHHHHHLll


DSSP  ........LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELlHHHHHHHhhhhhhhhh
Query ........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVdGFSSIKDiakrkhdli  104
ident            | |  ||  ||  |  | |     |    |                   
Sbjct tsrdpvxnLTQGQVGQSLRALEGRGLTRLVXG..SRADRWEHK.VDKGLEL....vpaqv   96
DSSP  llllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL..LLLLEEEEL.HHHHHLL....lhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHHHH................
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkISEKILEALN................  148
ident                                        | |                  
Sbjct iltgllllrgpqtvselltrsnrxhdfedseqvvHQLERLIARGlatlvprqsgqredry  156
DSSP  hhhhhhhhhlleehhhhhhhlllllllllhhhhhHHHHHHHHLLleeeelllllllllee


DSSP  .........hll
Query .........dld  151
ident             
Sbjct xhligdpedlqd  168
DSSP  eellllhhhhll


No 8: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLL
Query ......xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKIS   54
ident                             ||     |    |     |             
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangIGNGLTPTQWAALVRLGET.GPCPQNQLGRLTAXD   59
DSSP  llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkk  113
ident           |   |           |                                 
Sbjct AATIKGVVERLDKRGLIQRSADPDDgRRLLVSLSPA.......................g   96
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLEeEEEEEEELHH.......................h


DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                       
Sbjct raeleaglaaareinrqalaplslqeqetlrgllarli  134
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlll


No 9: 1QBJA MOLECULE: PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                   |      |  |  |    |   |   
Sbjct .....................SIYQDQEQRILKFLEELGegKATTAHDLSGKLGTPKKEI   39
DSSP  .....................LHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident    |  |   |   |                                             
Sbjct NRVLYSLAKKGKLQKEAG...TPPLWKIA...............................   65
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEEL...............................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct .................................   65
DSSP  .................................


No 10: 2FE3A MOLECULE: PEROXIDE OPERON REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL.....LLH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.....ISK   55
ident                              |    |  |    |  ||   |       | 
Sbjct .......helkealetlketGVRITPQRHAILEYLVNSMAHPTADDIYKALEgkfpnMSV   53
DSSP  .......lhhhhhhhhhhhlLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHhhlllLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLlLLEEEELLhhHHHH...........hhHHHH....
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGErKNYYEAVDgfSSIK...........diAKRK....  100
ident   |   |    | | |               |   |                        
Sbjct ATVYNNLRVFRESGLVKELTYGDA.SSRFDFVT..SDHYhaicencgkivdfHYPGldev  110
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLEEEELL..LLEEeeeellllleeelLLLLlhhh


DSSP  ...........hhhhhhhhhhHHHHHHHLLlllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...........hdliaktyedLKKLEEKCNeeekefikqkikgierxkkisekilealnd  149
ident                            |                                
Sbjct eqlaahvtgfkvshhrleiygVCQECSKKE..............................  140
DSSP  hhhhhhhhlleeeeeeeeeeeELHHHHHHH..............................


DSSP  ll
Query ld  151
ident   
Sbjct .n  141
DSSP  .l


No 11: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                   |     |  |          |     
Sbjct ........................DNLEQKILQVLSDDGGPVAIFQLVKKCQVPKKTLNQ   36
DSSP  ........................LHHHHHHHHHHHHHLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident  |  |     |           |                                     
Sbjct VLYRLKKEDRVSSPS.....PKYWSIG.................................   58
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEE.....LLEEEEL.................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                
Sbjct ..............................g   59
DSSP  ..............................l


No 12: 1SFUA MOLECULE: 34L PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                               |             |       ||| |   
Sbjct ...................cTVNDAEIFSLVKKEVLSLNtnDYTTAISLSNRLKINKKKI   41
DSSP  ...................lLLLLHHHHHHHHHHHHLLLllLEELHHHHHHHLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident    | ||     |  |                                            
Sbjct NQQLYKLQKEDTVKMVPS...NPPKWFKNYNC............................   70
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEELLLL............................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct .................................   70
DSSP  .................................


No 13: 2DK5A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                || |      |     |            
Sbjct .......gssgssgdsqnagKMKGsDNQEKLVYQIIEDAGnKGIWSRDVRYKSNLPLTEI   53
DSSP  .......lllllllllllllLLLLlLLLHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELL.LLLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWI.KGERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident    || ||       |       |  |                                 
Sbjct NKILKNLESKKLIKAVKSvAASKKKVYMLYN.............................   84
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLlLLLLLLEEEELL.............................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct ...........................lsgpssg   91
DSSP  ...........................lllllll


No 14: 1R1UA MOLECULE: REPRESSOR PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                     |               |  |        |   |  |  ||
Sbjct ..........ntdtlervteIFKAlgDYNRIRIMELLSVS..EASVGHISHQLNLSQSNV   48
DSSP  ..........lhhhhhhhhhHHHHllLHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident |  || |     |            |   |                              
Sbjct SHQLKLLKSVHLVKAKRQ..GQSMIYSLDDIH............................   78
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLHH............................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct .................vatmlkqaihhanhpk   94
DSSP  .................hhhhhhhhhhhhllll


No 15: 1SD4A MOLECULE: PENICILLINASE REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG   56
ident                               |  |     |      |  |       |  
Sbjct ....................qVEISXAEWDVXNIIWDK.KSVSANEIVVEIQkykeVSDK   39
DSSP  ....................lLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHHllllLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEEL.LHHH........................
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAV.DGFS........................   91
ident         |             |    |                                
Sbjct TIRTLITRLYKKEIIKRYKS..ENIYFYSSNiKEDDikxktaktflnklyggdxkslvln   97
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELlLHHHhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query sikdiakrkhdliaKTYEDLKKLEekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                             
Sbjct fakneelnnkeieeLRDILNDISK...................................k  122
DSSP  hhhlllllhhhhhhHHHHHHHHLL...................................l


No 16: 1LNWA MOLECULE: MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR;

DSSP  ..........llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHH
Query ..........xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEE   50
ident                                  |      |          |   |    
Sbjct nypvnpdlxpalxavfqhvrtriqseldcqRLDLTPPDVHVLKLIDEQ.RGLNLQDLGRQ   59
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLLHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHH


DSSP  HLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL.LLLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query LKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI.KGERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktye  109
ident     |         ||    ||        |       |                     
Sbjct XCRDKALITRKIRELEGRNLVRRERNpSDQRSFQLFLTDE...................g  100
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLLLEEEEELHH...................h


DSSP  hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqkikGIERxkkisekilealndld  151
ident                                           
Sbjct laihqhaeaixsrvhdelfaplTPVE.qatlvhlldqclaaq  141
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHH.hhhhhhhhhhhhhll


No 17: 2OQGA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfsELAKihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                   |         |     |  |      
Sbjct ..gxtvgtyaelasvfAALS....DETRWEILTELGRA..DQSASSLATRLPVSRQAIAK   52
DSSP  ..lllhhhhhhhhhhhHHLL....LHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLllLLLEEEELlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIKgeRKNYYEAVdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKleekcne  120
ident  |  |   | |  |     |   | |  |    |                          
Sbjct HLNALQACGLVESVKVG..REIRYRAL.GAELNKTARTLERIGAEWDRRLAAI.......  102
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEEL..LEEEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......


DSSP  llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                
Sbjct ........................kqiaesx  109
DSSP  ........................hhhhlll


No 18: 2HZTA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YTCD;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN   57
ident                            |        |         |        |    
Sbjct ..............xslveATLEviGGKWKXVILXHLTHG..KKRTSELKRLXPnITQKX   44
DSSP  ..............llhhhHHHHhhLLLLHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLH.hHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDG.fSSIKdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident     |  ||  |            |  ||      |                        
Sbjct LTQQLRELEADGVINRIVYNQvPPKVEYELSEYgrSLEG.....................   83
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELLLhhHHHH.....................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct .....................ildxlxawganhinr   98
DSSP  .....................hhhhhhhhhhhhhll


No 19: 1Z1DA MOLECULE: REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLL..LEEHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDK..PLTISDIXEELK.ISKGN   57
ident                       ||      |            |   |    ||  |   
Sbjct ....................ANGLTVAQNQVLNLIKACPRpeGLNFQDLKNQLKhMSVSS   40
DSSP  ....................LLLLLHHHHHHHHHHHLLLLllLEEHHHHHHHLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident        |   |                  |                             
Sbjct IKQAVDFLSNEGHIYSTV....dDDHFKSTDAE...........................   69
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEELL....lLLEEEELLLL...........................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct ..................................   69
DSSP  ..................................


No 20: 1MZBA MOLECULE: FERRIC UPTAKE REGULATION PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhHHHHH..hhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL.....L
Query xiixeeakkliiELFSE..lakiHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.....I   53
ident                                     |          |    |       
Sbjct ............MVENSelrkagLKVTLPRVKILQMLDSAQRHMSAEDVYKALMeagedV   48
DSSP  ............LHHHHhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHhllllL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLEEEELLHHH............hhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGFS............sikdiakrkh  101
ident     |   |   |  | |             |  |                         
Sbjct GLATVYRVLTQFEAAGLVVRHNFD.GGHAVFELADSGHhdhmvcvdtgeviefmdaeiek  107
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLL.LLLLEEEELLLLLleeeeellllleeeellhhhhh


DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query DLIAKTYEDLkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident        |                                          
Sbjct RQKEIVRERG........................felvdhnlvlyvrkkk  133
DSSP  HHHHHHHLLL........................lllllllleeeellll


No 21: 2FXAA MOLECULE: PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;

DSSP  ..............llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHH
Query ..............xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdKPLTIS   45
ident                                       ||        | |       ||
Sbjct ppydvkealvftqkxaqlskalwksiekdwqqwLKPYdLNINEHHILWIAYQL.NGASIS   59
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHlLLHHHHHHHHHHHHH.LLEEHH


DSSP  HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdlia  105
ident  |               ||||| |  |          |                      
Sbjct EIAKFGVXHVSTAFNFSKKLEERGYLRFSKR.....TYVQLTEE.........gtevfws  105
DSSP  HHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL.....LEEEELHH.........hhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhHHHH.....hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefIKQK.....ikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                    
Sbjct lleefdptrnavfkgsqplyHLFGkfpevaexxcxirhiygddfxeifets  156
DSSP  hhhhllhhhlhhhhhlhhhhHHHLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


No 22: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                  |       |           |      
Sbjct ........................gSPEKILAQIIQEHREGLDWQEAATRASLSLEETRK   36
DSSP  ........................lLHHHHHHHHHHLLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELL................................
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVD................................   88
ident  |      | |       |   |                                     
Sbjct LLQSXAAAGQVTLLRV..ENDLYAISTEryqawwqavtraleefhsryplrpglareelr   94
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEEHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleehhhhh


DSSP  ..................hhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhHHHH.................
Query ..................gfssikdiakrkhdlIAKTyeDLKK.................  113
ident                                   |                         
Sbjct sryfsrlparvyqalleewsregrlqlaantvaLAGF..TPSFsetqkkllkdledkyrv  152
DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeELLL..LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............hhhhllLLLHHH.HHHHHH...........................
Query ..............leekcnEEEKEF.IKQKIK...........................  131
ident                     | |                                     
Sbjct srwqppsfkevagsfnldpsELEELLhYLVREGvlvkindefywhrqalgeareviknla  212
DSSP  hllllllhhhhhhhllllhhHHHHHHhHHHHLLleeellllleeehhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ..........................gierxkkisekilealndld  151
ident                                               
Sbjct stgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn  258
DSSP  llllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll


No 23: 2G9WA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK....ISKG   56
ident                        |     ||   |     | |     | |         
Sbjct ...................kltRLGDLERAVXDHLWSRTEPQTVRQVHEALSarrdLAYT   41
DSSP  ...................lhhHLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEHHHHHHHHLllllLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLiAKTYedlkklee  116
ident  |   |  |     |            |  | |                           
Sbjct TVXAVLQRLAKKNLVLQIR.....AHRYAPVHGRDELVAGLXVDALA.QAED........   87
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEL.....LLEEEELLLHHHHHHHHHHHHHL.LLLL........


DSSP  hlllllhhhhhhhHHHHLHHHHH....hhhhhhhhHHLL......
Query kcneeekefikqkIKGIERXKKI....sekilealNDLD......  151
ident                                              
Sbjct .............SGSRQAALVHfvervgadeadaLRRAlaelea  119
DSSP  .............HHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhHHHHhhhhhl


No 24: 2ETHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE, MAR FAMILY;

DSSP  .......llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLL
Query .......xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI   53
ident                                            |   |     | | |  
Sbjct hxdaleifktlfslvxrfssylpsneeiSDXKTTELYAFLYVALF.GPKKXKEIAEFLST   59
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhHHLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLH.HHHHHhhhhhhhhhhHHHHHHH
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDG.FSSIKdiakrkhdliAKTYEDL  111
ident  | ||      ||  | |         |                             |  
Sbjct TKSNVTNVVDSLEKRGLVVREXDPVDrRTYRVVLTEKgKEIFGeilsnfesllKSVLEKF  119
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHHhHHHHHhhhhhhhhhhHHHHLLL


DSSP  hhhhhhlllllhhhhHHHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefiKQKIKGIerxkkisekilealndld  151
ident                    |                    
Sbjct ..............sEEDFKVV....segfnrxvealsre  141
DSSP  ..............lHHHHHHH....hhhhhhhhhhhhll


No 25: 1P4XA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A HOMOLOGUE;

DSSP  .llhHHHHHHHHH...............................................
Query .xiiXEEAKKLII...............................................   12
ident             |                                               
Sbjct mkynNHDKIRDFIiieaymfrfkkkvkpevdmtikefilltylfhqqentlpfkkivsdl   60
DSSP  llllLLLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllllleeehhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct cykqsdlvqhikvlvkhsyiskvrskiderntyisiseeqrekiaervtlfdqiikqfnl  120
DSSP  lllhhhlhhhhhhhhhlllleeeellllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................hhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHH
Query ........................elfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDI   47
ident                                    |        ||            | 
Sbjct adqsesqmipkdskeflnlmmytmyfkniikkHLTLSFVEFTILAIITSQNkNIVLLKDL  180
DSSP  hlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHLLLlLLEEHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhh
Query XEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdli  104
ident  |            |  |   |   |      |||                         
Sbjct IETIHHKYPQTVRALNNLKKQGYLIKERSTEdERKILIHMDdaQQDH.............  227
DSSP  HHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLEEEELLhhHHHH.............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                
Sbjct ........................aeqllaqvnqlladkdhlhlvfe  250
DSSP  ........................hhhhhhhhhhhlllllhhhllll


No 26: 1JGSA MOLECULE: MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR;

DSSP  ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL
Query ........xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK   52
ident                                       |           |       | 
Sbjct lfneiiplgrlihmvnqkkdrllneylsPLDITAAQFKVLCSIRCA.ACITPVELKKVLS   59
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHHL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident    |     |  |   | |         |        |                      
Sbjct VDLGALTRMLDRLVCKGWVERLPNPNDkRGVLVKLTTG.................gaaic  102
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHH.................hhhhh


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhHHHHHLhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqKIKGIErxkkisekilealndld  151
ident                       |                 
Sbjct eqchqlvgqdlhqeltkNLTADE....vatleyllkkvlp  138
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLLL....hhhhhhhhhllll


No 27: 2HOEA MOLECULE: N-ACETYLGLUCOSAMINE KINASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                      |  |       |||   |  |  
Sbjct ...........................iSRILKRIXKS..PVSRVELAEELGLTKTTVGE   31
DSSP  ...........................lLLLHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLhhHHHHhhHHHHhhhhhhhhHHHH........
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDgfSSIKdiAKRKhdliaktyEDLK........  112
ident   |   | | |                                                 
Sbjct IAKIFLEKGIVVEEKDSPRPTKSLKISP..NCAY..VLGI.......eVTRDeiaaclid   80
DSSP  HHHHHHHHLLEEEEELLLLLLEEEEELH..HHLE..EEEE.......eELLLeeeeeeee


DSSP  ..hhhhhlllllhhHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL...................
Query ..kleekcneeekeFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD...................  151
ident                          |  |          |                    
Sbjct asxnilaheahplpSQSDREETLNVXYRIIDRAKDXXEKLGsklsaltvaapgpidterg  140
DSSP  lllleeeeeeeellLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllleeeeeellleellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct iiidprnfplsqiplanllkekygievwvendadxgavgekwytkrddsfawiltgkgig  200
DSSP  eellllllllllllhhhhhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct agiiidgelyrgengyageigytrvfngneyvfledvcnenvvlkhvlsxgfslaeards  260
DSSP  eeeeelleellllllllllhhhleeelllleeehhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gdvrvkeyfddiaryfsigllnlihlfgiskiviggffkelgenflkkikievethllyk  320
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ..................................
Query ..................................  151
ident                                   
Sbjct hsvdxsfskvqepviafgaavhalenylervtts  354
DSSP  llleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 28: 2FBHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA3341;

DSSP  ..llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query ..xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                         ||      |   |       |               
Sbjct yfgtllaqtsrawraeldrrlSHLGLSQARWLVLLHLARHRDSPTQRELAQSVGVEGPTL   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLL.LLLLLEEEELL.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIK.GERKNYYEAVD.GFSSikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident    |  ||  | ||        |                                     
Sbjct ARLLDGLESQGLVRRLAVAeDRRAKHIVLTPkADVL..................iadiea  102
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLLEEEELLlHHHH..................hhhhhh


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct iaasvrndvltgideseqalcqqvllrilanlenr  137
DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 29: 2DK8A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL.LLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.ISKGNVS   59
ident                                           |   |  |   |      
Sbjct ............gssgssgpdadPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPhIEAQQRA   48
DSSP  ............lllllllllllHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHLLlLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident      |   |              |   |                               
Sbjct VAINRLLSMGQLDLLRS..NTGLLYRIKD...............................   75
DSSP  HHHHHHHHHLLEEEEEL..LLLEEEEELL...............................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLl
Query eeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLd  151
ident                                 
Sbjct .........................sgPSSG.   81
DSSP  .........................llLLLL.


No 30: 1R1TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR SMTB;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                        |           |  |   |   |       |   ||
Sbjct ....elqaiapevaqslaefFAVLaDPNRLRLLSLLARS..ELCVGDLAQAIGVSESAVS   54
DSSP  ....llllllhhhhhhhhhhHHHHlLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident   |  |  |  |        |  ||   |                               
Sbjct HQLRSLRNLRLVSYRKQ..GRHVYYQLQDHH.............................   83
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLHH.............................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct .................ivalyqnaldhlqec   98
DSSP  .................hhhhhhhhhhhllll


No 31: 1HSTA MOLECULE: HISTONE H5;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLL..LEEHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDK..PLTISDIXEELK......   52
ident                                 |               |    |      
Sbjct ......................shPTYSEMIAAAIRAEKSrgGSSRQSIQKYIKshykvg   38
DSSP  ......................llLLHHHHHHHHHHLLLLllLEEHHHHHHHHHhhllll


DSSP  .lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLlLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGErKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident          |   |   |        |                                 
Sbjct hnADLQIKLSIRRLLAAGVLKQTKGVGA.SGSFRLAK.......................   74
DSSP  llHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLEEEELL.......................


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                         
Sbjct ........................................   74
DSSP  ........................................


No 32: 2O03A MOLECULE: PROBABLE ZINC UPTAKE REGULATION PROTEIN FURB;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL.....LLH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.....ISK   55
ident                              |    |   |          ||      |  
Sbjct ................asaagvrSTRQRAAISTLLETLDDFRSAQELHDELRrrgenIGL   44
DSSP  ................llllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHHhllllLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLEEEELLHH............hhhhhhhhhhhhH
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGF............ssikdiakrkhdL  103
ident   |   |      | |            |                               
Sbjct TTVYRTLQSMASSGLVDTLHTD.TGESVYRRCSEHhhhhlvcrscgstievgdheveawA  103
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL.LLLEEEEELLLLlleeeeellllleeeellhhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHHhhhHHHH..hhhhhhll
Query IAKTYEDLkkleekcneeekefikqkikgIERXkkiSEKI..lealndld  151
ident                                     |  |          
Sbjct AEVATKHG.....................FSDV...SHTIeifgtcsdcr  129
DSSP  HHHHHHLL.....................LLLL...LLLLeeeellllll


No 33: 2GXGA MOLECULE: 146AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL

DSSP  ......llhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLL
Query ......xiixeeakkliielfselAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKIS   54
ident                              |      |         | |           
Sbjct enriqimstiakiyramsrelnrrLGELNLSYLDFLVLRATSDG..PKTMAYLANRYFVT   58
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkk  113
ident       |  |||| | |  |      ||   |                            
Sbjct QSAITASVDKLEEMGLVVRVRDREdRRKILIEITEK..................gletfn  100
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLlLLLEEEEELHH..................hhhhhh


DSSP  hhhhlllllhhhhhhHHHHHLH..hhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqKIKGIER..xkkisekilealndld  151
ident                     |                   
Sbjct kgieiykklanevtgDLSEDEVilvldkiskilkrieeis  140
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllLLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 34: 2FA5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY;

DSSP  ...........llhhhhhhhhhhhhhhHHHHH.LLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHH
Query ...........xiixeeakkliielfsELAKI.HGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIX   48
ident                                   |       |  || |       |   
Sbjct hpvllnleqflpyrlsvlsnrisgniaKVYGDrYGXAIPEWRVITILALY.PGSSASEVS   59
DSSP  llllllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhHLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHH


DSSP  HHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEelllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKvwikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliakty  108
ident       |  ||     | | || |                                    
Sbjct DRTAXDKVAVSRAVARLLERGFIRR........SXLALSPA...............grqv   96
DSSP  HHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEL........LLLEELHH...............hhhh


DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                            
Sbjct yetvaplvnexeqrlxsvfsaeeqqtlerlidrlakdglprxa  139
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhl


No 35: 1YYVA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKG   56
ident                                      |         ||        |  
Sbjct .....qlregnlfaeqcpsrEVLKhvtSRWGVLILVALRDG..THRFSDLRRXXGgVSEX   53
DSSP  .....lllllllllllllhhHHHHhhhLHHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHLLlLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident     ||  ||  ||   |          |                               
Sbjct XLAQSLQALEQDGFLNRVSYPVvPPHVEYSLTPL..........................   87
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH..........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct .........geqvsdxvaaladwielnlpqvlaqre  114
DSSP  .........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 36: 2F2EA MOLECULE: PA1607;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                                     |   |   
Sbjct ........tshkqascpvarPLDVigDGWSXLIVRDAFEG..lTRFGEFQKSLGLAKNIL   50
DSSP  ........llllllllllllLHHHhlLLLHHHHHHHHHLL..lLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLH........................hhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDG........................fssik   94
ident    |  | | |    |         |   |                              
Sbjct AARLRNLVEHGVXVAVPAESGSHQEYRLTDKgralfpllvairqwgedyffapdeshvrl  110
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLEEEEELHHhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhHHHHHHhhhlllllhhhhhhhHHHHLHhhhHHHHhhhhhhhll
Query diakrkhdliaktyEDLKKLeekcneeekefikqkIKGIERxkkISEKilealndld  151
ident                                         |    |           
Sbjct verdsgqpvprlqvRAGDGS.............plAAEDTR...VSRD.........  142
DSSP  eellllllllllllLLLLLL.............llLHHHEE...EELL.........


No 37: 2A61A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TM0710;

DSSP  .........LLHHhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHH
Query .........XIIXeeakkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEEL   51
ident           |                    |            |    |         |
Sbjct kqpferilrEICF.....mvkvegrkVLRDFGITPAQFDILQKIYFE.GPKRPGELSVLL   54
DSSP  lhhhhhhhhHHHH.....hhhhhhhlLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHH


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyed  110
ident    |  |    | ||  |           |                              
Sbjct GVAKSTVTGLVKRLEADGYLTRTPDPADrRAYFLVITRK..............geeviek  100
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLEeEEEEEEELHH..............hhhhhhh


DSSP  hhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHL.hhhhhhhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekeFIKQKIKGIE.rxkkisekilealndld  151
ident                                           
Sbjct vierrenfiekitsDLGKEKSSKIldylkelkgvmernfskq  142
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhllll


No 38: 1S3JA MOLECULE: YUSO PROTEIN;

DSSP  .........llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHH
Query .........xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEEL   51
ident                                |       | | |      |  | | |  
Sbjct sadqlxsdiqlslqalfqkiqpexlesxEKQGVTPAQLFVLASLKKH.GSLKVSEIAERX   59
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHH.LEEEHHHHHHHH


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyed  110
ident       |      ||              |       |                      
Sbjct EVKPSAVTLXADRLEQKNLIARTHNTKDrRVIDLSLTDE.....................   98
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHH.....................


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlHHHHH............hhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekefikqkikgieRXKKI............sekilealndld  151
ident                                                      
Sbjct ........gdikfeevlagrkaixARYLSflteeexlqaahitaklaqaaetd  143
DSSP  ........hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 39: 1MKMA MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                          |                  | | |    |  |   
Sbjct .....................mNTLKKAFEILDFIVKNPGDVSVSEIAEKFNMSVSNAYK   39
DSSP  .....................lLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELL.HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVD.GFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident     ||| |||            |                                    
Sbjct YMVVLEEKGFVLRKKD.....KRYVPGYkLIEYGS.........................   69
DSSP  HHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELLhHHHHHH.........................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHL.............................
Query eeekefikqkikgierxkkisekileaLNDL.............................  150
ident                            |                                
Sbjct .........................fvLRRFnirdiahdhlvdimkrtgetvhlilkdgf  104
DSSP  .........................hhHHHLlhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct egvyidkvegeqsipmvsrlgmkvdlystasgksilafvpekelkeylkivelkpktpnt  164
DSSP  eeeeeeeelllllllllllllleeellllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct itnprvlkrelekirkrgyavdneeneigimcvgvpifdhngypvagvsisgvarkftee  224
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeehhhllhh


DSSP  .....................l
Query .....................d  151
ident                       
Sbjct kieeysdvlkekaeeisrklgy  246
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 40: 2CWEA MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN,

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                     |       |||   | |       
Sbjct .........akkvkvitdpeVIKVmlEDTRRKILKLLRNK..EMTISQLSEILGKTPQTI   49
DSSP  .........llleeeellhhHHHHhlLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEE.LLLL..LLLLEEEELLHhhHHHHhhhhHHHH......hhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKV.WIKG..ERKNYYEAVDGfsSIKDiakrKHDL......iaktye  109
ident      || | | |              ||                               
Sbjct YHHIEKLKEAGLVEVKrTEMKgnLVEKYYGRTAD..VFYI...nLYLGdeelryiarsrl  104
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEeEEEEllEEEEEEEELLL..EEEE...lLLLLlhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL..................
Query dlkkleekcneEEKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD..................  151
ident               |             |                               
Sbjct ktkidifkrlgYQFEENELLNIMDRMSQKEFDATVRISKYIEekedalkdfsnediihai  164
DSSP  hhhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  ...........................
Query ...........................  151
ident                            
Sbjct ewlstaelardeeylellkrlgsilkr  191
DSSP  hhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlll


No 41: 1LJ9A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....LLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG....LNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKG   56
ident                     |      |                      | |  |    
Sbjct .tdilreigmiaraldsisNIEFkelsLTRGQYLYLVRVCEN.PGIIQEKIAELIKVDRT   58
DSSP  .llhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLhhhlLLLLHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLL.LLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGER.KNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident       | ||| ||                |                             
Sbjct TAARAIKRLEEQGFIYRQEDASNKkIKRIYATEK......................gknv   96
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLlLEEEEELHH......................hhhh


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhHHLH............hhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikGIER............xkkisekilealndld  151
ident                                                 
Sbjct ypiivrenqhsnqvalQGLSeveisqladylvrmrknvsedwefvkkg  144
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 42: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEELKISK   55
ident                       |       |   |          |     |        
Sbjct ......................GIDPAIVEVLLVLREAGiengaTPWSLPKIAKRAQLPX   38
DSSP  ......................LLLHHHHHHHHHHHHHLlllllLLLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident       |  |   |                                              
Sbjct SVLRRVLTQLQAAGLADVSVEA.DGRGHASLTQE..........................   71
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL.LLLEEEEELHH..........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ..........................gaalaaqlfp   81
DSSP  ..........................hhhhhhhhll


No 43: 2IA2A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHhHHLL.LLEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAIlYLSD.KPLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                              ||            | ||             
Sbjct ....................YVQSLARGLAVIRC.FDHRnQRRTLSDVARATDLTRATAR   39
DSSP  ....................LLHHHHHHHHHHHL.LLLLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELL.HHHHHHH..hhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH
Query XSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVD.GFSSIKD..iakrkhdLIAKTYEDLKKLEE  116
ident   |  | ||| |                                        | |     
Sbjct RFLLTLVELGYVATDG......SAFWLTPrVLELGYSylsslslpeVAQPHLEKLSHKVH   93
DSSP  HHHHHHHHHLLEEELL......LEEEELHhHHHLLHHhhllllhhhHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  H...........................................................
Query K...........................................................  117
ident                                                             
Sbjct Esssvsildgadivyvarvpvsrixtvgitigtrlpayatsxgrvllaglpddeldayle  153
DSSP  Leeeeeeeelleeeeeeeellllleellllllleeehhhlhhhhhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  117
ident                                                             
Sbjct kldiqrltertitardelkaailavradgicvldqeleaglrsxaapirgasgltvaavn  213
DSSP  hlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeeee


DSSP  ...........lLLLLHHHHHHHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ...........cNEEEKEFIKQKIKGIerxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct istpaarysledLHSDLIPSLRVTATD........ieqdlatvnr  250
DSSP  eeeehhhllhhhHHHHLHHHHHHHHHH........hhhhhhhhhl


No 44: 2HR3A MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...............LLHHHHhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHH
Query ...............XIIXEEakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTIS   45
ident                                          |   |           | |
Sbjct ptnqdlqlaahlrsqVTTLTR.......rlrreaqADPVQFSQLVVLGAIDRLGGDVTPS   53
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhHHHHHH.......hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLH.hhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDG.fssikdiakrkhdli  104
ident            |    |  ||  |                                    
Sbjct ELAAAERXRSSNLAALLRELERGGLIVRHA.....RTRVSLSSEgrrnlygnrakreewl  108
DSSP  HHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL.....LLEEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHLH.hhhhhhhhhhhhhhll
Query aktYEDLkkleekcneeekefikqkIKGIER.xkkisekilealndld  151
ident                                                 
Sbjct vraXHAC.................lDESERAllaaagplltrlaqfee  139
DSSP  hhhHHHH.................lLHHHHHhhhhhhhhhhhhhllll


No 45: 1Z91A MOLECULE: ORGANIC HYDROPEROXIDE RESISTANCE TRANSCRIPTIONAL

DSSP  ......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLL
Query ......xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI   53
ident                                          |      ||     | |  
Sbjct mklenqlsfllyassremtkqykplLDKLnITYPQYLALLLLWEH.ETLTVKKMGEQLYL   59
DSSP  llhhhlhhhhhhhhhhhhhlllhhhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHH.LEEEHHHHHHLLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLH.hHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDG.fSSIKdiakrkhdliaktyedl  111
ident   |     ||  |  |           |                                
Sbjct DSGTLTPMLKRMEQQGLITRKRSEEDeRSVLISLTEDgaLLKE.................  102
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLLLLLlLLLEEEELHHhhLHHH.................


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                         
Sbjct .....kavdipgtilglskqsgedlkqlksalytlletlh  137
DSSP  .....hlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 46: 1Z05A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                              | ||        |    |   |         
Sbjct .....................DHIKqINAGRVYKLIDQK.gPISRIDLSKESELAPASIT   38
DSSP  .....................LHHHhHHHHHHHHHHHHH.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELLL.....LLLLLEEEELLhHHHHH....................
Query XSLKKLEELGFVRKVWIK.....GERKNYYEAVDgFSSIK....................   94
ident      |                 |                                    
Sbjct KITRELIDAHLIHETTVQeaisrGRPAVGLQTNN.LGWQFlsmrlgrgyltialhelgge   97
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELHHhhhhhLLLLEEEEELL.LLEEEeeeeeelleeeeeeeellll


DSSP  .....................................HHHHhhhhhhhhhhHHHH.....
Query .....................................DIAKrkhdliaktyEDLK.....  112
ident                                                             
Sbjct vlidtkidiheidqddvlarllfeieeffqtyaaqldRVTS.......iaiTLPGlvnse  150
DSSP  eeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllEEEE.......eeeEELLeeell


DSSP  ....hhHHHLllllhhhHHHHhHHHLHHHHHHH...........................
Query ....klEEKCneeekefIKQKiKGIERXKKISE...........................  141
ident                   |          |                              
Sbjct qgivlqMPHY......nVKNL.ALGPEIYKATGlpvfvandtrawalaeklfghsqdvdn  203
DSSP  lleeeeLLLL......lLLLL.LHHHHHHHHHLlleeeeehhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct svlisihhglgagivldgrvlqgrhgnigelghiqidpqgkrchcgnygcletvassqai  263
DSSP  eeeeeellleeeeeeelleelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct rdqvtariqagepsclatveeisiedicaaaadgdplavdviqqlgrylgaaiaivinlf  323
DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct npekiliggvinqaksilypsieqcireqslpvyhqdlklvesrfykqatmpgaalikqa  383
DSSP  llleeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ...hhhhhhhhll
Query ...kilealndld  151
ident              
Sbjct lydglllmkvveg  396
DSSP  hhllhhhhhhhhl


No 47: 1J5YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                  ||  |  |       |||  |      
Sbjct ...................xKTVRQERLKSIVRILERSKEPVSGAQLAEELSVSRQVIVQ   41
DSSP  ...................lHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLL.EEEELllllllLEEEEL...LHHHhhhhhHHHHH...............
Query SLKKLEELGF.VRKVWikgerkNYYEAV...DGFSsikdiAKRKH...............  101
ident     |  ||               |       | |                         
Sbjct DIAYLRSLGYnIVATP......RGYVLAggkSGVS.....RLVAVkhapeeikeellcvv   90
DSSP  HHHHHHHHLLlLEEEL......LEEELLlllLLEE.....EEEEEellhhhhhhhhhhhh


DSSP  .....hhhHHHHhhHHHH..............hhhlllllhhhhhHHHHHHLHHH.....
Query .....dliAKTYedLKKL..............eekcneeekefikQKIKGIERXK.....  137
ident                                                             
Sbjct rnggrivdVIVE..HPVYgeirgiidvsseeevlkfvnlxexaktEPLLTLSGGVhlhti  148
DSSP  hllleeeeEEEE..ELLLeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllLLLLLHHHHEeeeee


DSSP  .hhhhhhhhHHHHL.........l
Query .kisekileALNDL.........d  151
ident                         
Sbjct eapdeetxeRIXRElkkkgfliee  172
DSSP  eellhhhhhHHHHHhhhlllllll


No 48: 2BV6A MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MGRA;

DSSP  .......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLLlLEEHHHHHHHHL
Query .......xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSDkPLTISDIXEELK   52
ident                                |      |  ||     |        || 
Sbjct xnlkeqlcfslynaqrqvnryysnkvFKKYnLTYPQFLVLTILWDES.PVNVKKVVTELA   59
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHlLLHHHHHHHHHHHHLL.EEEHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLL.LLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGER.KNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident    | ||  ||  |                      |                       
Sbjct LDTGTVSPLLKRXEQVDLIKRERSEVDQrEVFIHLTDK......................   97
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLlLEEEEELHH......................


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                         
Sbjct setirpelsnasdkvasasslsqdevkelnrllgkvihaf  137
DSSP  hhhhhhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 49: 1XN7A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                           |   |   | |         |   |         
Sbjct ........................mASLIQVRDLLALR.GRMEAAQISQTLNTPQPMINA   35
DSSP  ........................lLLHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLL................LLLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEELGFVRKVWIKG................ERKNYYEAVdgfssikdiakrkhdli  104
ident  |  ||  |                                                   
Sbjct MLQQLESMGKAVRIQEEPdgclsgsckscpegkaCLREWWALR.................   78
DSSP  HHHHHHHHLLEEEELLLLllllllllllllllllLLLLEEEEL.................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                
Sbjct ...............................................   78
DSSP  ...............................................


No 50: 1UB9A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1061;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLLlLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSDkPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                           |         |         | |   |    || 
Sbjct ............meelkeimKSHIlgNPVRLGIMIFLLPRR.KAPFSQIQKVLDLTPGNL   47
DSSP  ............lhhhhhhhLLHHhhLHHHHHHHHHHHHHL.EEEHHHHHHHLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident       ||  | |              |  |                             
Sbjct DSHIRVLERNGLVKTYKVIAdRPRTVVEITDF............................   79
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH............................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkISEKilealndld  151
ident                                   
Sbjct .....gmeeakrflsslkaviDGLD........l  100
DSSP  .....hhhhhhhhhhhhhhhhHHHL........l


No 51: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN   57
ident                          |                       |     |    
Sbjct ..............mniaelYGKMGKHSWRIMDAIFKNLwdyEYVPLQLISSHARIGEEK   46
DSSP  ..............llhhhhHHLLLHHHHHHHHHHHLLLlllLLEEHHHHHHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident     || |  |  |                                              
Sbjct ARNILKYLSDLRVVQNRQK...DYEGSTFTFI............................   75
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEELHH............................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH......HHHL.....................
Query cneeekefikqkikgierxkkisekILEA......LNDL.....................  150
ident                           |                                 
Sbjct .....glslyslhrlvrsgkvdaigKLMGegkesaVFNCysekfgecvvkfhkvkvkehf  130
DSSP  .....hhhhhhhhhhhhllllleeeEEEEellleeEEEEeellleeeeeeeelllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct svlairsarnefralqklqglavpkvyawegnavlmelidakelyrvrvenpdevldmil  190
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeelleeeeelllleehhhlllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct eevakfyhrgivhgdlsqynvlvseegiwiidfpqsvevgeegwreilerdvrniityfs  250
DSSP  hhhhhhhhlleelllllllleeelllleeelllllleelllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................l
Query ..................d  151
ident                    
Sbjct rtyrtekdinsaidrilqe  269
DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhl


No 52: 2FSWA MOLECULE: PG_0823 PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHhlLLLEEHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYlsDKPLTISDIXEELK.ISKGN   57
ident                            |                           ||   
Sbjct ........rkisdeecpvrkSXQIfaGKWTLLIIFQIN..RRIIRYGELKRAIPgISEKX   50
DSSP  ........llllllllhhhhHHHHhlLLLHHHHHHHHL..LLLEEHHHHHHHLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident     || |   |   |           |                                
Sbjct LIDELKFLCGKGLIKKKQYPEvPPRVEYSLTPL...........................   83
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH...........................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ................gekvlpiideiakfgxenl  102
DSSP  ................hhllhhhhhhhhhhhhhhl


No 53: 1W1WE MOLECULE: STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHL...LLLEEHHHHHHHHL.lLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK.iSKG   56
ident                          |       ||       |     |           
Sbjct .........................KAIVQMAKILRKElseEKEVIFTDVLKSQAkrEAS   35
DSSP  .........................LHHHHHHHHHHHHlllLLLEEHHHHHHLLLlhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident         |   |                |                              
Sbjct RGFFDILSLATEGCIGLSQTEAFGNIKIDAKPA...........................   68
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLLEEEEELHH...........................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct .................................lf   70
DSSP  .................................hl


No 54: 2FRHA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;

DSSP  llHHHH.............hhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLL.LEEHHH
Query xiIXEE.............akkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDK.PLTISD   46
ident                                 |         ||               |
Sbjct ..GSHMaitkindcfellsmvtyadklkslIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEkEYYLKD   58
DSSP  ..LLLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLlEEEHHH


DSSP  HHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLL.LEEEE...LLHHhhhhhhhhhhhh
Query IXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGERK.NYYEA...VDGFssikdiakrkhd  102
ident |   |      |    | |       |                                 
Sbjct IINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERtVLILVnaqQRKK............  106
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLlLEEELllhHHHH............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query liaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                  
Sbjct ............................iesllsrvnkriteanneiel  127
DSSP  ............................hhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 55: 2FBIA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ....llhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHH
Query ....xiixeeakkliielfselAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKG   56
ident                          |||      |  ||                 |   
Sbjct rpsltltllqareaamsffrpsLNQHGLTEQQWRVIRILRQQ.GEMESYQLANQACILRP   59
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllhhhHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.LLEEHHHHHHHLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident      |  ||  | ||        |  |                                
Sbjct SMTGVLARLERDGIVRRWKAPKDqRRVYVNLTEK...................gqqcfvs  100
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLEeEEEEEEELHH...................hhhhhhh


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct msgdmeknyqriqerfgeeklaqllellnelkkikp  136
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 56: 1Z7UA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN EF0647;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN   57
ident                            |        |            |  |  |    
Sbjct ......snaxttdkqtsinLALStiNGKWKLSLXDELFQG..TKRNGELXRALDgITQRV   52
DSSP  ......lllllllhhhhhhHHHHllLLLLHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLH.hHHHH.hhhhhhhhhhhhHHHHHHHh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDG.fSSIK.diakrkhdliakTYEDLKKl  114
ident     |   |  | |             |                                
Sbjct LTDRLREXEKDGLVHRESFNElPPRVEYTLTPEgyALYDalsslchwgetfaQKKARLN.  111
DSSP  HHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlLLEEEEEELHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhHHHHHHL.


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                      
Sbjct .....................................  111
DSSP  .....................................


No 57: 1XMKA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHlllLHHHhHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLL.LHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKIhglNKSVgAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI.SKGNVS   59
ident                                   |                         
Sbjct ...............gsHMASldmAEIKeKICDYLFNV.SDSSALNLAKNIGLtKARDIN   44
DSSP  ...............llLLLLhhhHHHHhHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLHhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEELL..HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVD..GFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident   |   |  | |                |                               
Sbjct AVLIDMERQGDVYRQGT...TPPIWHLTDkkRERMQI.......................   78
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEELHhhHLLLLL.......................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct .................................k   79
DSSP  .................................l


No 58: 1U2WA MOLECULE: CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;

DSSP  ....llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLL
Query ....xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKIS   54
ident                         |               |      |   ||   |   
Sbjct gydeekvnriqgdlqtvdisgvsqILKAiaDENRAKITYALCQD.EELCVCDIANILGVT   59
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhHHHHhhLHHHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEllllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVwikgerKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkl  114
ident   | |  |  |   | |            |   |                          
Sbjct IANASHHLRTLYKQGVVNFR......LALYSLGDEH........................   89
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEL......LLEEEELLHH........................


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                      
Sbjct .....................irqimmialahkkevk  105
DSSP  .....................hhhhhhhhhhhhllll


No 59: 1IN4A MOLECULE: HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qflrpksldefigqenvkkklslaleaakmrgevldhvllagppglgkttlahiiaselq   60
DSSP  lllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tnihvtsgpvlvkqgdmaailtslergdvlfideihrlnkaveellysaiedfqidiqpf  120
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tlvgattrsgllssplrsrfgiileldfytvkelkeiikraaslmdveiedaaaemiakr  180
DSSP  eeeeeellhhhllhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhl


DSSP  ......................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHH.
Query ......................xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYL.   37
ident                                             ||              
Sbjct srgtpriairltkrvrdmltvvkadrintdivlktmevlniDDEGLDEFDRKILKTIIEi  240
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllLLLLLLHHHHHHHHHHHHh


DSSP  LLLL.EEHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhh
Query SDKP.LTISDIXEELKISKGNVS.XSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikd   95
ident               |       |      |   ||                         
Sbjct YRGGpVGLNALAASLGVEADTLSeVYEPYLLQAGFLARTP......RGRIVTEK......  288
DSSP  LLLLlLLHHHHHHHHLLLHHHHHhHLHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHH......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                         
Sbjct ..............................................aykhlkyevp  298
DSSP  ..............................................hhhhllllll


No 60: 1I1SA MOLECULE: MOTA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhHHHHHHHH...LLLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliieLFSELAKI...HGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK.ISKG   56
ident                           ||                 |     |        
Sbjct ............mSKVTYIIKasnDVLNEKTATILITIAKK.DFITAAEVREVHPdLGNA   47
DSSP  ............lLLHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHLLlLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident  |      |   | | |                                           
Sbjct VVNSNIGVLIKKGLVEKSG......DGLIITGE...........................   74
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEL......LEEELLHH...........................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct .............aqdiisnaatlyaqenapellk   96
DSSP  .............hhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 61: 1BIAA MOLECULE: BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLlHHHHHHHHHHHhLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLnKSVGAVYAILYlSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                 | |             | |  |      
Sbjct ....................MKDN.TVPLKLIALLA.NGEFHSGEQLGETLGMSRAAINK   38
DSSP  ....................LLLL.HHHHHHHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLllllLLEEEELL................................
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAVD................................   88
ident     |   |              |                                    
Sbjct HIQTLRDWGVDVFTVP....GKGYSLPEpiqllnakqilgqldggsvavlpvidstnqyl   94
DSSP  HHHHHHHLLLLLEEEL....LLEEELLLllllllhhhhhhlllllleeellllllhhhhh


DSSP  ....................hHHHHhHHHHhhhhHHHHhhhhhhhHHHHlllllhHHHHH
Query ....................gFSSIkDIAKrkhdLIAKtyedlkkLEEKcneeekEFIKQ  128
ident                                   |            |            
Sbjct ldrigelksgdaciaeyqqagSPFG.ANLY....LSMF......wRLEQ......PAAAI  137
DSSP  hllhhhllllleeeellllllLLLL.LEEE....EEEE......eEELL......LLLLH


DSSP  HHHHHLHHHH........................................hhhhHHHH..
Query KIKGIERXKK........................................isekILEA..  146
ident                                                             
Sbjct GLSLVIGIVMaevlrklgadkvrvkwpndlylqdrklagilveltgaaqivigaGINMam  197
DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhlllllleeellleeeelleeeeeeeeeeelleeeeeeeEEELll


DSSP  .hHHLL......................................................
Query .lNDLD......................................................  151
ident                                                             
Sbjct wiTLQEaginldrntlaamlirelraalelfeqeglapylsrwekldnfinrpvkliigd  257
DSSP  llLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeeeell


DSSP  ...................................
Query ...................................  151
ident                                    
Sbjct keifgisrgidkqgallleqdgiikpwmggeislr  292
DSSP  eeeeeeeeeellllleeeeelleeeeellleeeel


No 62: 2E1NA MOLECULE: PEX;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHH.......LL
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEEL.......KI   53
ident                            |  | | |               |         
Sbjct ....mdfediyrffqdppphylskELAVCYVLAVLRHE..DSYGTELIQHLethwpnyRL   54
DSSP  ....llhhhhhhhhhlllleellhHHHHHHHHHHHLLL..LEEHHHHHHHHhhhllleEL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL....LLLLEEEELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG....ERKNYYEAVDGFSSIkdiakrkhdliaktye  109
ident |       || ||        | |          |                         
Sbjct SDTVLYTALKFLEDEQIISGYWKKVegrgRPRRMYQLAQANDDR................   98
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLllllLLEEEEEELLLLLHH................


DSSP  hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                           
Sbjct ..............................srdlaqlweryl  110
DSSP  ..............................hhhhhhhhhhhl


No 63: 1JHFA MOLECULE: LEXA REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLEEHHHHHHHHLL.LH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD....KPLTISDIXEELKI.SK   55
ident                        |      |             | |   |   |   | 
Sbjct .....................KALTARQQEVFDLIRDHIsqtgMPPTRAEIAQRLGFrSP   39
DSSP  .....................LLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLHHHHHHHLLLlLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident       || |   |    |                                         
Sbjct NAAEEHLKALARKGVIEIVSG...ASRGIR.LLQEE........................   71
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEELLL...LLLLEE.ELLLL........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHL.........................
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDL.........................  150
ident                                                             
Sbjct ..............................eEGLPlvgrvaadepllaqqhieghyqvdp  101
DSSP  ..............................lLLEEeelllllllllllhhheeeeelllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct slfkpnadfllrvsgmsmkdigimdgdllavhktqdvrngqvvvariddevtvkrlkkqg  161
DSSP  hhlllllleeeellllllhhhlllllleeeeeelllllllleeeeeelleeeeeeeeeel


DSSP  ...................................l
Query ...................................d  151
ident                                     
Sbjct nkvellpensefkpivvdlrqqsftieglavgvirn  197
DSSP  leeeeelllllllleeeellllleeeeeeeeeeeel


No 64: 1XMAA MOLECULE: PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhllllHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfsELAKihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........   52
ident                                   |           |             
Sbjct ..............sdVIRG.....YVDTIILSLLIEG..DSYGYEISKNIRiktdelyv   39
DSSP  ..............llLHHH.....LHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHHHhhhlllll


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident |           ||  |           |  ||                           
Sbjct IKETTLYSAFARLEKNGYIKSYYGEEtKRRTYYRITPE......................   77
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEElLEEEEEEELHH......................


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                         
Sbjct ................gikyykqkceeweltkkvinkfvk  101
DSSP  ................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 65: 1UCRA MOLECULE: PROTEIN DSVD;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHH...HLLLLEEHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILY...LSDKPLTISDIXEELK.ISKG   56
ident                               |   |     |       |           
Sbjct .......................MEEAKQKVVDFLNsksGSKSKFYFNDFTDLFPdMKQR   37
DSSP  .......................LLHHHHHHHHHHLlhhHHLLLEEHHHHHHHLLlLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident  |   |  |                  |                                
Sbjct EVKKILTALVNDEVLEYWSS..GSTTMYGLKG............................   67
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELL............................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ............................agkqaaa   74
DSSP  ............................hhhhhhl


No 66: 1U5TA MOLECULE: APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vnktilekqsvelrdqlmvfqerlvefakkhnselqaspefrskfmhmcssigidplslf   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct drdkhlftvndfyyevclkvieicrqtkdmnggvisfqelekvhfrklnvglddleksid  120
DSSP  lllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleehhhhhhlllllllllhhhhhhhhh


DSSP  .llhhhhhhhhHHHH.hhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHhHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query .xiixeeakklIIEL.fselakIHGLNKSVGAVYAILyLSDKPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident             |            |         |         ||     |       
Sbjct mlkslecfeifQIRGkkflrsvPNELTSDQTKILEIC.SILGYSSISLLKANLGWEAVRS  179
DSSP  hhllllllleeEELLeeeelllLLLLLLLHHHHHHLL.LLLLLLLHHHHHHHHLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident    |      |              |                                  
Sbjct KSALDEMVANGLLWIDYQ.gGAEALYWDPSWIT...........................  211
DSSP  HHHHHHHHHLLLLEEELL.lLLLLEEELHHHHH...........................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct ...............................rq  213
DSSP  ...............................ll


No 67: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHL....LLLEEHHHHHHH..HLLL
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLS....DKPLTISDIXEE..LKIS   54
ident                        ||     |            ||       |      |
Sbjct ......................KLNDRQRKVLYCIVREyienKKPVSSQRVLEVsnIEFS   38
DSSP  ......................LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLHHHHHHHllLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLH.........................
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDG.........................   89
ident         |||| ||                  |                          
Sbjct SATIRNDMKKLEYLGYIYQPHT....sAGRIPTDKglrfyyeemlkisketseadlavet   94
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEELLLL....lLLLEELHHhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhl


DSSP  ...........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH........................
Query ...........fssikdiakrkhdliaktyedLKKL........................  114
ident                                                             
Sbjct fksmpladpekvlflagnllarltegyvlierPNTRdlkilrvmlipvsedylifsilte  154
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelLLHHhlllleeeeeelllleeeeeeeel


DSSP  ................................HHHLL.................lLLHHH
Query ................................EEKCN.................eEEKEF  125
ident                                                           | 
Sbjct fgvskvtpiktqerlnweeierqlnfllrgrtVGEVLmgkieslkgsgflrliesLIGET  214
DSSP  leeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllHHHHHhlllhhhhllhhhhhhhhHHLLL


DSSP  hhHHHH.........................hhlHHHHHHHHHhHHHH............
Query ikQKIK.........................gieRXKKISEKIlEALN............  148
ident                                        |                    
Sbjct ..VERYldaglenllkdetltledirnlleevkdQKFLESLVGeGITVrigreigrkkle  272
DSSP  ..LLLEeeelhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllHHHHHHHLLlLLEEeehhhhllhhhl


DSSP  ................................................hll
Query ................................................dld  151
ident                                                    
Sbjct kfavfsgkyfkgespigsvylftskvtkydrnhrvfeyilnrlseyftsts  323
DSSP  leeeeeeeeeelleeeeeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 68: 2H09A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN   57
ident                                                 |    |  |   
Sbjct .............egfrqvREAHRRELIDDYVELISDLIrevGEARQVDMAARLGVSQPT   47
DSSP  .............lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLHHHHHHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident |   || |   |                                                
Sbjct VAKMLKRLATMGLIEMIPW.....RGVFLTAE..geklaqesrerhqivenfllvlgvsp  100
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELHH..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgiERXKKISEKilealndld  151
ident                 |                 
Sbjct eiarrdaegmehhvseETLDAFRLF.......tq  127
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllhHHHHHHHHL.......ll


No 69: 1W5SA MOLECULE: ORC2;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct glfkdrrvfdenyippelrvrrgeaealariylnrllsgaglsdvnmiygsigrvgigkt   60
DSSP  lllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tlakftvkrvseaaakegltvkqayvnafnapnlytilslivrqtgypiqvrgapaldil  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kalvdnlyvenhyllvildefqsmlsspriaaedlytllrvheeipsrdgvnrigfllva  180
DSSP  hhhhhhhhhhlleeeeeeellhhhhllllllhhhhhhhhlhhhhllllllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sdvralsymrekipqvesqigfklhlpayksrelytileqraelglrdtvweprhlelis  240
DSSP  eelhhhhhhhhhlhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhh


DSSP  ..............................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHH
Query ..............................xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGA   30
ident                                                      |      
Sbjct dvygedkggdgsarraivalkmacemaeamgrdslsedlvrkavsenthelEALSIHELI  300
DSSP  hhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhlllllLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHL....LLLEEHHHHHHHHL...........LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL
Query VYAILYLS....DKPLTISDIXEELK...........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVW   75
ident                                               || |  || |    
Sbjct ILRLIAEAtlggMEWINAGLLRQRYEdasltmynvkpRGYTQYHIYLKHLTSLGLVDAKP  360
DSSP  HHHHHHHHhhllLLLLLHHHHHHHHHhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL


DSSP  LllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlh
Query IkgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgier  135
ident                                                             
Sbjct S....TTLFRLAPHLP..........................................ad  374
DSSP  L....LLEEEELLLLL..........................................hh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhll
Query xkkisekilealndld  151
ident                 
Sbjct rlievvdniiqakmas  390
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhll


No 70: 2NS0A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHL.....l
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELK.....i   53
ident                                 | |           ||            
Sbjct ...................xtvsDRELEECIRALLDARAdsASICPSDVARAVApddwrp   41
DSSP  ...................llllHHHHHHHHHHHHHHLLllLLLLHHHHHHHHLllllhh


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLL.......llLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIK.......geRKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliak  106
ident     |      |   | |                                          
Sbjct LXEPVREAAGRLADAGEVEVTQKGavvdprsarGPIRIRWTRTD................   85
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLeelllllllLLLEEEELLLL................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct .............................................   85
DSSP  .............................................


No 71: 2HTJA MOLECULE: P FIMBRIAL REGULATORY PROTEIN KS71A;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnkSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                   |           | | |         
Sbjct ..........................MKNEILEFLNRH.NGGKTAEIAEALAVTDYQARY   33
DSSP  ..........................LHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLHhhHHHHhHHHHhhhhhHHHHhHHHHhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGfsSIKDiAKRKhdliaKTYEdLKKLeekcne  120
ident  |  ||  | |           |                                     
Sbjct YLLLLEKAGMVQRSPLRRGMATYWFLKGE..KQAG.QSCS..sttLEHH.HHHH......   81
DSSP  HHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLL..LLLL.LHHH..hllLLLL.LLLL......


DSSP  llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                
Sbjct ...............................   81
DSSP  ...............................


No 72: 2ESHA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN TM0937;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........   52
ident                                         |       | |         
Sbjct ................rggrgfrGWWLASTILLLVAEK..PSHGYELAERLAefgieipg   42
DSSP  ................llllhhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHHllllllll


DSSP  .llhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL..LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE..RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktye  109
ident     ||    |  ||| ||    |          |                         
Sbjct ighmGNIYRVLADLEESGFLSTEWDTTVspPRKIYRITPQ............gklylrei   90
DSSP  llllLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLllLEEEEEELHH............hhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhlllllhhhHHHHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefIKQKIKGIerxkkisekilealndld  151
ident                                           
Sbjct lrsledmkrrietleeRIKRVLQE..................  114
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHL..................


No 73: 1P6RA MOLECULE: PENICILLINASE REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG   56
ident                               |                  ||      |  
Sbjct .................mkkipqISDAELEVMKVIWKH.SSINTNEVIKELSktstWSPK   42
DSSP  .................llllllLLHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHHhhllLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHHHhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFSsikdIAKRkhdliaktyedlkklee  116
ident      |  |   |          |   |      |      |                  
Sbjct TIQTMLLRLIKKGALNHHKE..GRVFVYTPNIDES.dyiEVKS.................   82
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLLLL.lllLLLL.................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ...................................   82
DSSP  ...................................


No 74: 1FX7A MOLECULE: IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;

DSSP  llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhHHHHHHHHHHLL...lLEEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnksVGAVYAILYLSD...kPLTISDIXEELKISKGN   57
ident                                    |             | | |  |   
Sbjct .........mneLVDT...........TEMYLRTIYDLEeegvTPLRARIAERLDQSGPT   40
DSSP  .........lllLLLH...........HHHHHHHHHHHHhhllLLLHHHHHHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLH......hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDG......fssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident ||      |  |  |            |                                
Sbjct VSQTVSRMERDGLLRVAGD.....RHLELTEKgralaiavmrkhrlaerllvdviglpwe   95
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhLHHHHH......hhhhhHHHHH................
Query kkleekcneeekefikqkikgiERXKKI......sekilEALND................  149
ident                                                             
Sbjct evhaeacrwehvmsedverrlvKVLNNPttspfgnpipgLDELGvgpepgaddanlvrlt  155
DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhHHLLLLlllllllllllHHHHLlllllllllllleehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  149
ident                                                             
Sbjct elpagspvavvvrqltehvqgdidlitrlkdagvvpnarvtvettpgggvtivipghenv  215
DSSP  hlllllleeeeeeeelhhhhllhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeelllllle


DSSP  .............ll
Query .............ld  151
ident                
Sbjct tlphemahavkvekv  230
DSSP  eelhhhhlleeeeel


No 75: 1X19A MOLECULE: CRTF-RELATED PROTEIN;

DSSP  .............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHH.hHHHHHHHHLllLEEH
Query .............xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSV.gAVYAILYLSdkPLTI   44
ident                                  |                      |   
Sbjct hssglvprgshmmsnndllnyyhranelvfkglIEFScmKAAIelDLFSHMAEG..PKDL   58
DSSP  llllleeelleeelllhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHhhHHHHhhLHHHHHLLL..LLLH


DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLH...............
Query SDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDG...............   89
ident                  |  |                                       
Sbjct ATLAADTGSVPPRLEMLLETLRQMRVINLED......GKWSLTEFadymfsptpkepnlh  112
DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHHhhhhlllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct qtpvakamafladdfymglsqavrgqknfkgqvpyppvtrednlyfeeihrsnakfaiql  172
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct lleeakldgvkkmidvgggigdisaamlkhfpeldstilnlpgaidlvnenaaekgvadr  232
DSSP  hhhhllllllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ...hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL.............lllhhhhhhhhHHH
Query ...fssikdiakrkhdliaktyedlkklEEKCN.............eeekefikqkiKGI  133
ident                              |                              
Sbjct mrgiavdiykesypeadavlfcrilysaNEQLStimckkafdamrsggrllildmviDDP  292
DSSP  eeeeelllllllllllleeeeellhhhlLHHHHhhhhhhhhllllllleeeeeeellLLL


DSSP  LHHhhHHHHHH..........................................hhhhhll
Query ERXkkISEKIL..........................................ealndld  151
ident |                                                           
Sbjct ENP..NFDYLShyilgagmpfsvlgfkeqarykeileslgykdvtmvrkydhllvqavkp  350
DSSP  LLL..LHHHHHhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeeeeeelleeeeeeell


No 76: 1TBXA MOLECULE: HYPOTHETICAL 11.0 KDA PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG   56
ident                               | | ||         |           |  
Sbjct ....................stpfFYPEAIVLAYLYDN.EGIATYDLYKKVNaefpXSTA   39
DSSP  ....................llllLLHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHHHHHHHllllLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident       | |   |||                                             
Sbjct TFYDAKKFLIQEGFVKERQE..RGEKRLYLTEK...........................   70
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELHH...........................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ...........gklfaislktaietykqikkrhhh   94
DSSP  ...........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 77: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHH..HH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKG..NV   58
ident                                 |    |  |                   
Sbjct ...................mQEQRQQLLRSLEALIFSSEEPVNLQTLSQITAHKFTpsEL   41
DSSP  ...................lHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLLLhhHH


DSSP  HHHHHHHHHLL.......LEEEELllllllLEEEELLhhhHHHH...........hhhhh
Query SXSLKKLEELG.......FVRKVWikgerkNYYEAVDgfsSIKD...........iakrk  100
ident       |                         |                           
Sbjct QEAVDELNRDYeatgrtfRIHAIA......GGYRFLT...EPEFadlvrqllapviqrrl   92
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhllleEEEEEL......LEEEEEE...LHHHhhhhhhhhllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhHHHHhHHLLLLLHHHHHH....................hhhhhlhhhhhh
Query hdliaktyedLKKLeEKCNEEEKEFIKQ....................kikgierxkkis  140
ident                      |   |                                  
Sbjct srsmlevlavVAWH.QPVTKGEIQQIRGaspdysidrllarglievrgradspgrplqyg  151
DSSP  hhhhhhhhhhHHHH.LLEEHHHHHHHHLlllllhhhhhhhllleeeeeellllllleeee


DSSP  hhhhhhhhhll
Query ekilealndld  151
ident            
Sbjct ttevfldlfhl  162
DSSP  elhhhhhhlll


No 78: 2CO5A MOLECULE: VIRAL PROTEIN F93;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL......LL
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK......IS   54
ident                                   |      |       |        ||
Sbjct .....................kyMRINYYIILKVLVINGSRLEKKRLRSEILkrfdidIS   39
DSSP  .....................llLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEHHHHHHHHHhhhlllLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkl  114
ident  |        |      |                                          
Sbjct DGVLYPLIDSLIDDKILREEEA..PDGKVLFLTEK.........................   72
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL..LLLLEEEELHH.........................


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                      
Sbjct .................gmkefeelheffkkivchhh   92
DSSP  .................hhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 79: 1ZG3A MOLECULE: ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE;

DSSP  .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLL.HHHH..HHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLL...
Query .xiixeeakkliielfselakIHGLN.KSVG..AVYAILYLSDKPLTISDIXEELKI...   53
ident                            ||              || | |     ||    
Sbjct gseeselyhaqihlykhvynfVSSMAlKSAMelGIADAIHNHGKPMTLSELASSLKLhps   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhllhHHHHHhHHHHhhLHHHHHHHHLLLEEHHHHHHHLLLlll


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.....LLLLEEEELLH...................
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.....ERKNYYEAVDG...................   89
ident         |  |   ||  |   ||     |    |                        
Sbjct KVNILHRFLRLLTHNGFFAKTIVKGkegdeEEEIAYSLTPPskllisgkptclssivkga  120
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlllllLLEEEEEELHHhhllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct lhpssldmwssskkwfnedkeqtlfecatgesfwdflnkdsesstlsmfqdamasdsrmf  180
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct klvlqenkrvfegleslvdvgggtggvtkliheifphlkctvfdqpqvvgnltgnenlnf  240
DSSP  hhhhhhlhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhlllllllleee


DSSP  .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................fssikdi   96
ident                                                             
Sbjct vggdmfksipsadavllkwvlhdwndeqslkilknskeaishkgkdgkviiidisidets  300
DSSP  eellllllllllleeeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhleeeeeeleellll


DSSP  hHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHHH......hl
Query aKRKHDLIAktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilEALN......dl  150
ident   |                                                         
Sbjct dDRGLTELQ...ldydlvmltmflgkertkqewekliydagfssykitPISGfkslievy  357
DSSP  lLHHHHHHH...hhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhlllleeeeeEELLleeeeeee


DSSP  l
Query d  151
ident  
Sbjct p  358
DSSP  l


No 80: 1YG2A MOLECULE: GENE ACTIVATOR APHA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........   52
ident                                   |       |  ||  |          
Sbjct .........................SLPHVILTVLSTR..DATGYDITKEFSasigyfwk   33
DSSP  .........................LHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLlhhhhlll


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllllEEEELLH...hhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDG...fssikdiakrkhdliaktye  109
ident  |   |   | |  | | |  |         |                            
Sbjct ASHQQVYRELNKMGEQGLVTCVLE......VYSITQAgrsalgewfdqptahptvrdefs   87
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......LEEELHHhhhhhhhhhhllllllllllhhh


DSSP  hHHHHHHHLLlllHHHHHH.........................................
Query dLKKLEEKCNeeeKEFIKQ.........................................  128
ident               |                                             
Sbjct aKLMACSVQS...AEPYRLqlaelveesrklvahyqeieaayyanpavldkqqrlerltl  144
DSSP  hHHHHHHLLL...HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhh


DSSP  ..hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ..kikgierxkkisekilealndld  151
ident                          
Sbjct rrnllvrqawiqwadevlaelnama  169
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 81: 1KGSA MOLECULE: DNA BINDING RESPONSE REGULATOR D;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nvrvlvvederdladlitealkkexftvdvcydgeegxyxalnepfdvvildixlpvhdg   60
DSSP  lleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct weilksxresgvntpvlxltalsdveyrvkglnxgaddylpkpfdlreliarvralirrk  120
DSSP  hhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhllllllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  LLHHHHHH.......hhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHL
Query XIIXEEAK.......kliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK   52
ident                               | |        |        |     | | 
Sbjct SESKSTKLvcgdlildtatkkayrgskEIDLTKKEYQILEYLVXNkNRVVTKEELQEHLW  180
DSSP  LLLLLLEEeelleeeelllleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLL.......LEEEELlllllLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELG.......FVRKVWikgerKNYYEAVDgfssikdiakrkhdlia  105
ident           | |               |         | | |                 
Sbjct VFSDVLRSHIKNLRKKVdkgfkkkIIHTVR.....GIGYVARD.................  218
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLEEEEL.....LLEEEELL.................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                               
Sbjct .............................................e  219
DSSP  .............................................l


No 82: 1P2FA MOLECULE: RESPONSE REGULATOR;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xxwkiavvdddknilkkvseklqqlgrvktfltgedflndeeafhvvvldvxlpdysgye   60
DSSP  lleeeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhlllllleeeeelllllllhhh


DSSP  ..................................................LLHH..HHHH
Query ..................................................XIIX..EEAK    8
ident                                                          | |
Sbjct icrxiketrpetwvilltllsddesvlkgfeagaddyvtkpfnpeillarVKRFleREKK  120
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhHHHHhhHLLL


DSSP  HH..........hhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHL...lL
Query KL..........iielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK...iS   54
ident  |                       | |        |     |  |     |       |
Sbjct GLydfgdlkidatgftvflkgkRIHLPKKEFEILLFLAENaGKVVTREKLLETFWedpvS  180
DSSP  LEeeelleeeelllleeeelleELLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHHLllllL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL........LEEEELlllllLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELG........FVRKVWikgerKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliak  106
ident    |    |                   |        |                      
Sbjct PRVVDTVIKRIRKAIeddpnrprYIKTIW.....GVGYXFTG..................  217
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHllllllllLEEEEL.....LLEEEELL..................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct .............................................  217
DSSP  .............................................


No 83: 1FP1D MOLECULE: ISOLIQUIRITIGENIN 2'-O-METHYLTRANSFERASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL.LHHH.hHHHHHHHHL...LLLEEHHHHHHHHL...
Query xiixeeakkliielfselaKIHGL.NKSV.gAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK...   52
ident                          |         |             | |   |    
Sbjct ..qtedsaclsamvlttnlVYPAVlNAAIdlNLFEIIAKAtppGAFMSPSEIASKLPast   58
DSSP  ..llhhhhhhhhhhhhhllHHHHHhHHHHhlLHHHHHHLLlllLLLLLHHHHHLLLLhhh


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL...LLLLEEEELLH.................
Query ...iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG...ERKNYYEAVDG.................   89
ident             |  |                     |                      
Sbjct qhsdLPNRLDRMLRLLASYSVLTSTTRTIedgGAERVYGLSMVgkylvpdesrgylasft  118
DSSP  llllHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllLEEEEEEELLLhhhhllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct tflcypallqvwmnfkeavvdedfmgkdkkmnqifnksmvdvcatemkrmleiytgfegi  178
DSSP  hhhllhhhhhhhllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct stlvdvgggsgrnleliiskyplikginfdlpqvienapplsgiehvggdmfasvpqgda  238
DSSP  leeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhlllllllleeeeellllllllleee


DSSP  ....................................hhhhhhhhHHHHHHHhhhhhhhhh
Query ....................................fssikdiaKRKHDLIaktyedlkk  113
ident                                                             
Sbjct milkavchnwsdekcieflsnchkalspngkviivefilpeepnTSEESKL.........  289
DSSP  eeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhheeeeeeeeeeeeeelllllLLHHHHH.........


DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhHLHH.......................hhhhhhhhHHHH..
Query leekcneeekefikqkikgIERX.......................kkisekilEALN..  148
ident                                                        | |  
Sbjct ................vstLDNLmfitvggrertekqyeklsklsgfskfqvacRAFNsl  333
DSSP  ................hhhHHHHhhhhhlllleehhhhhhhhhhlllleeeeeeEELLle


DSSP  .....hll
Query .....dld  151
ident         
Sbjct gvmefykx  341
DSSP  eeeeeell


No 84: 2O0YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHhHHLL.LLEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAIlYLSD.KPLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                            |                     |  |  |  | 
Sbjct ....................gvrSVTRVIDLLEL.FDAAhPTRSLKELVEGTKLPKTTVV   39
DSSP  ....................llhHHHHHHHHHLL.LLLLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELL.HHHHHHHHHHHHH.hhhHHHHHH.HHHH..
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVD.GFSSIKDIAKRKH.dliAKTYED.LKKL..  114
ident                         |                             |     
Sbjct RLVATXCARSVLTSRAD.....GSYSLGPeXLRWVRLAGRTWAppeeVVDIXRqLSADtg   94
DSSP  HHHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELHhHHHHHHHHHHHHLllhhHHHHHHhHHHHhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  114
ident                                                             
Sbjct etvnlyirqglsrvvvaqcestatvrsviplgvpyplwagaagkilllaapeliddvaad  154
DSSP  leeeeeeeelleeeeeeeellllllllllllllleellllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  114
ident                                                             
Sbjct sphgpefadqlrekvedgrergyqlvhgerelgssglsfplvdshgtvvaaltlggptgr  214
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeehhh


DSSP  hhhlLLLLHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHhhhhhhhll
Query eekcNEEEKEFIKQKIKGIERxkKISEKilealndld  151
ident                                      
Sbjct ftedRTPHYIECTRAAAEEISaiGLPGL.........  242
DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLL.........


No 85: 2IXSA MOLECULE: SDAI RESTRICTION ENDONUCLEASE;

DSSP  llhhhhhhhHHHHHHHHHHHH...LLLLH..HHHHHHHHHHH..........LLLLEEHH
Query xiixeeakkLIIELFSELAKI...HGLNK..SVGAVYAILYL..........SDKPLTIS   45
ident            |     | |                   |                |   
Sbjct ..ndidetaATIDTARALLKSfgfEAQRHnvRSAVTLLALAGlkpgdhwadsTTPRLGVQ   58
DSSP  ..lllllllLLHHHHHHHHHHlllLHHHLlhHHHHHHHHHLLllllllhhhlLLLLEEHH


DSSP  HHHHHHL.........lLHHHHH.HHHHHHHHLLLEEEE.LLLLLL....LLEEEEL..L
Query DIXEELK.........iSKGNVS.XSLKKLEELGFVRKV.WIKGER....KNYYEAV..D   88
ident  |               |        |      ||                | |      
Sbjct KIMDWSGaywakpyatgSREDFRkKTLRQWVDNGFAVLNpDNLNIAtnsqLNEYCLSdeA  118
DSSP  HHHHHHHhhllllllhhHHHHHHhHLHHHHHHLLLEEELlLLLLLLllllLLEEEELhhH


DSSP  HHH............hhHHHH................................hhhhhhh
Query GFS............siKDIA................................krkhdli  104
ident                                                             
Sbjct AQAirsygtdafesalvDFLSkasdtvraraealraamisvdladgdefllspagqnpll  178
DSSP  HHHhhhlllllhhhhhhHHHLlllhhhhhhhhhhhhlleeeeeelleeeeelllllhhhh


DSSP  hhhHHHHHH.HHHHL.........................................LLLL
Query aktYEDLKK.LEEKC.........................................NEEE  122
ident     |                                                       
Sbjct kkmVEEFMPrFAPGAkvlyigdtrgkhtrfekrifeetlgltfdphgrmpdlvlhdKVRK  238
DSSP  hhhHHLHHHhHLLLLeeeeeelllllleeelhhhhhhlllllllllllllleeeeeLLLL


DSSP  hhHHHHH.....................................................
Query keFIKQK.....................................................  129
ident                                                             
Sbjct ..WLFLMeavkskgpfdeerhrtlrelfatpvaglvfvncfenreamrqwlpelawetea  296
DSSP  ..EEEEEeellllllllhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeellhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  .hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query .ikgierxkkisekilealndld  151
ident                        
Sbjct wvaddpdhlihlngsrflgpyer  319
DSSP  eellllllleeellhhhllllll


No 86: 1Y0UA MOLECULE: ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE;

DSSP  .....llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllleEHHHHHHHHLLLH
Query .....xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkplTISDIXEELKISK   55
ident                              |         |           ||  |  ||
Sbjct ghxsleewikadslekadeyhkrynyavTNPVRRKILRXLDKG...rSEEEIXQTLSLSK   57
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHHHHLL...lLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident       || ||       |             |                           
Sbjct KQLDYHLKVLEAGFCIERVG......ERWVVTDA..........................   85
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELLL..........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ................................gkiv   89
DSSP  ................................llll


No 87: 1LDDA MOLECULE: ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK........   52
ident                           |       |           |   ||        
Sbjct ..................kyeltlQRSLPFIEGMLTNL.GAMKLHKIHSFLKitvpkdwg   41
DSSP  ..................llhhhhHHHHHHHHHHHHHH.LLEEHHHHHHHHHhhllhhhl


DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktye  109
ident    |        |  |   |              || |                      
Sbjct ynrITLQQLEGYLNTLADEGRLKYIA.....NGSYEIV......................   74
DSSP  lllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEELLL.....LLEEEEL......................


DSSP  hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                           
Sbjct ..........................................   74
DSSP  ..........................................


No 88: 1FT9A MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pprfnianvllspdgetffrgfrskihakgslvctgegdengvfvvvdgrlrvylvgeer   60
DSSP  llllllhhhhlllllllllllleeeeelllleeelllllllleeeeeeleeeeeeeelle


DSSP  ............................................llhhhhhhhhhhhhhh
Query ............................................xiixeeakkliielfs   16
ident                                                             
Sbjct eislfyltsgdmfcmhsgclveatertevrfadirtfeqklqtcpsmawgliailgralt  120
DSSP  eeeeeeeellleeellllleeeellleeeeeelhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHLL............LLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query elakIHGL...NKSVGAVYAILYLSD............KPLTISDIXEELKISKGNVSXS   61
ident                                          |   |      |    |  
Sbjct scmrTIEDlmfHDIKQRIAGFFIDHAnttgrqtgvivsVDFTVEEIANLIGSSRQTTSTA  180
DSSP  hhhhHHHHhhlHHHHHHHHHHHHHLLllllllllllleELLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query LKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcnee  121
ident |  |   |              |                                     
Sbjct LNSLIKEGYISRQG.....RGHYTIPNLVR..............................  205
DSSP  HHHHHHLLLLEELL.....LLLEELLLHHH..............................


DSSP  lhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                               
Sbjct .........................lkaaa  210
DSSP  .........................hhhll


No 89: 1CF7A MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHLL.LHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELKI.SKGNV   58
ident                                   |       |        |    |   
Sbjct .................srhekslGLLTTKFVSLLQEAKdGVLDLKLAADTLAVrQKRRI   43
DSSP  .................llllllhHHHHHHHHHHHHHLLlLEEEHHHHHHHLLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident       ||  |   |       ||                                    
Sbjct YDITNVLEGIGLIEKKS.....KNSIQWK...............................   67
DSSP  HHHHHHHHHHLLEEEEE.....LLEEEEL...............................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct .................................   67
DSSP  .................................


No 90: 2PG4A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKG   56
ident                        |           |              |      |  
Sbjct ................xddetLRLQfGHLIRILPTLLEFEkkgYEPSLAEIVKASGVSEK   44
DSSP  ................lllhhHHLLhHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHH.HHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVS.XSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident          |   | |        |                                   
Sbjct TFFxGLKDRLIRAGLVKEETLS.YRVKTLKLTEK..........................   77
DSSP  HHHlLHHHHHHHLLLEEEEEEE.LLEEEEEELHH..........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct .....................grrlaeclekcrdvl   92
DSSP  .....................hhhhhhhhhhhhhhl


No 91: 2JSCA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                     |               |     ||
Sbjct .................larLGRAlaDPTRCRILVALLDG..VCYPGQLAAHLGLTRSNV   41
DSSP  .................lllHHHHhlLHHHHHHHHHHHLL..LLLLLLHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident |  |  |   | |        |   |   |                              
Sbjct SNHLSCLRGCGLVVATYE..GRQVRYALADSH....................laralgel   79
DSSP  HHHHHHHLLLLLEEEEEL..LLLEEEEELLHH....................hhhhhhhl


DSSP  llllhhhhhhhhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikGIERxkkisekilealndld  151
ident                ||                
Sbjct vqvvlavdtdqpcVAER................   96
DSSP  lllllllllllllLLLL................


No 92: 1U6GA MOLECULE: CULLIN HOMOLOG 1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ldqiwddlragiqqvytrqsmaksrymelythvynyctsvglelykrlkeflknyltnll   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kdgedlmdesvlkfytqqwedyrfsskvlngicaylnrhwvrreckgiyeiyslalvtwr  120
DSSP  hllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dclfrplnkqvtnavlkliekerngetintrlisgvvqsyvelglgptltvykesfesqf  180
DSSP  hhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ladterfytresteflqqnpvteymkkaearlleeqrrvqvylhestqdelarkceqvli  240
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ekhleifhtefqnlldadknedlgrmynlvsriqdglgelkkllethihnqglaaiekcg  300
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eaalndpkmyvqtvldvhkkynalvmsafnndagfvaaldkacgrfinnnavtkmaqsss  360
DSSP  lhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kspellarycdsllkkeeaeledtlnqvmvvfkyiedkdvfqkfyakmlakrlvhqnsas  420
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ddaeasmisklkqacgfeytsklqrmfqdigvskdlneqfkkhltnsepldldfsiqvls  480
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeelleee


DSSP  .......llhhhhhHHHH.......................hhhhHHHH........hhL
Query .......xiixeeaKKLI.......................ielfSELA........kiH   22
ident                                                             
Sbjct sgswpfqqsctfalPSELersyqrftafyasrhsgrkltwlyqlsKGELvtncfknrytL  540
DSSP  hhhlllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhlEEEEeellllllleE


DSSP  LLLHHHHHHHHHhHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL.......
Query GLNKSVGAVYAIlYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVW.......   75
ident        |     |      |         |        |  |                 
Sbjct QASTFQMAILLQ.YNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDenanvde  599
DSSP  EEEHHHHHHHHH.HHLLLEEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLllllhhh


DSSP  lllllLLEEEELlHHHHhhhHHHH...............hhhhhhhhhhhhhhHHHH...
Query ikgerKNYYEAVdGFSSikdIAKR...............khdliaktyedlkkLEEK...  117
ident                       |                              |      
Sbjct velkpDTLIKLY.LGYK...NKKLrvninvpmkteqkqeqetthknieedrklLIQAaiv  655
DSSP  lllllLLEEEEL.LLLL...LLLLeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhh


DSSP  ................lLLLLHHHHH..........hhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ................cNEEEKEFIK..........qkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                             
Sbjct rimkmrkvlkhqqllgeVLTQLSSRFkprvpvikkcidiliekeylervdgekdtysyla  715
DSSP  hhhlllleeehhhhhhhHHHHHLLLLlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeeeeell


No 93: 1YLFA MOLECULE: RRF2 FAMILY PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHLLLL.EEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLSDKP.LTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                   ||        |     |         
Sbjct ....................kISSRfSIAVHILSILKNNPSSlCTSDYXAESVNTNPVVI   40
DSSP  ....................lLLHHhHHHHHHHHHHHHLLHHhLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEElllllllLEEEELLH.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVwikgerkNYYEAVDG.FSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident       |   |||                                               
Sbjct RKIXSYLKQAGFVYVN.......GGAGLLKDlHEIT....................lldv   73
DSSP  HHHHHHHHHLLLEEEL.......LLEEELLLhHHLL....................hhhh


DSSP  lllllhHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH..........hhhhll
Query cneeekEFIKQKIKGIERXKKISEKILE..........alndld  151
ident                            |                
Sbjct yhavnvIGANIQAVLEIILIQAQSAXEEvlrnitxgqlfetlqe  117
DSSP  hhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhhhll


No 94: 2P6RA MOLECULE: AFUHEL308 HELICASE;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkveelaesissyavgilkeeelfppqaeavekvfsgknlllamptaagktllaemamvr   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhllllleeeelllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................................................LL
Query ..........................................................XI    2
ident                                                             
Sbjct eaikggkslyvvplralagekyesfkkwekiglrigistgdyesrdehlgdcdiivttSE  120
DSSP  hhhlllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllleeeellllllllllllllleeeeeHH


DSSP  HHHHHHHH....................................................
Query IXEEAKKL....................................................   10
ident                                                             
Sbjct KADSLIRNraswikavsclvvdeihlldsekrgatleilvtkmrrmnkalrviglsatap  180
DSSP  HHHHHHHLlllhhhhlleeeellhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct nvteiaewldadyyvsdwrpvplvegvlcegtlelfdgafstsrrvkfeelveecvaeng  240
DSSP  lhhhhhhhllleeeellllllleeeeeellleeeeeelleeeeeellhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct gvlvfestrrgaektavklsaitakyveneglekaileenegemsrklaecvrkgaafhh  300
DSSP  leeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct agllngqrrvvedafrrgnikvvvatptlaagvnlparrvivrslyrfdgyskrikvsey  360
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhllllleeeellllllllllllleeeellleeellleeellhhhh


DSSP  ...................................hhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHH
Query ...................................iielfselakihgLNKSVGAVYAIL   35
ident                                                           | 
Sbjct kqmagragrpgmdergeaiiivgkrdreiavkryifgeperitsklgvETHLRFHSLSII  420
DSSP  hhhhllllllllllleeeeeellhhhhhhhhhllllllllllllllllHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLlllEEHHHHHHHHL..........lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllllEEE
Query YLSdkpLTISDIXEELK..........iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknYYE   85
ident        |                               ||  | |              
Sbjct CDG.yaKTLEELEDFFAdtfffkqneisLSYELERVVRQLENWGMVVEAA.......HLA  472
DSSP  HHL.llLLHHHHHHHHHllllhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL.......LEE


DSSP  ELLH............hHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhhhhhhhhHHLLLLLhHHHHH
Query AVDG............fSSIKDIAKRKHD.....liaktyedlkkleEKCNEEEkEFIKQ  128
ident                    |                                        
Sbjct PTKLgslvsrlyidpltGFIFHDVLSRMElsdigalhlicrtpdmerLTVRKTD.SWVEE  531
DSSP  ELHHhhhhhhllllhhhHHHHHHHLLLLLllhhhhhhhhhhllllllLLLLLLL.HHHHH


DSSP  HHHhHLHHH...................................................
Query KIKgIERXK...................................................  137
ident                                                             
Sbjct EAFrLRKELsyypsdfsveydwflsevktalclkdwieekdedeicakygiapgdlrriv  591
DSSP  HHHhHHHHLllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  ..............hhhhhHHHH.....................................
Query ..............kisekILEA.....................................  146
ident                                                             
Sbjct etaewlsnamnriaeevgnTSVSglterikhgvkeellelvrirhigrvrarklynagir  651
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLlhhhhhhhlllhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllll


DSSP  ...........................hhhll
Query ...........................lndld  151
ident                                 
Sbjct naedivrhrekvasligrgiaervvegisvks  683
DSSP  lhhhhhhlhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhl


No 95: 2FBKA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, MARR FAMILY;

DSSP  ...........................llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHH
Query ...........................xiixeeakkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYA   33
ident                                                  |||        
Sbjct dtaallerirsdwarlnhgpsagpmltllllerlhaalgreierTYAASGLNAAGWDLLL   60
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHL..LLLEEHHHHHHHHLLLhhHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHhh
Query ILYLS..DKPLTISDIXEELKISkgNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfs   91
ident  || |     |          ||    |     | | |                      
Sbjct TLYRSapPEGLRPTELSALAAISgpSTSNRIVRLLEKGLIERRE......ASIRLTPQ..  112
DSSP  HHHHHllLLLLLHHHHHHHLLLLlhHHLLHHHHHHHHLLEELLL......LLLEELHH..


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHH.........
Query sikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkISEK.........  142
ident                                                             
Sbjct ...........................gralvthllpahlattqrvlAPLSaqeqrtlee  145
DSSP  ...........................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLllhhhhhhh


DSSP  ..hhhhhhhll
Query ..ilealndld  151
ident            
Sbjct lagrmlagleq  156
DSSP  hhhhhhhhhll


No 96: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |          |      |         | |   |  
Sbjct .....................MKLDQIDLNIIEELKKD.sRLSMRELGRKIKLSPPSVTE   38
DSSP  .....................LLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident     ||  |                                                   
Sbjct RVRQLESFGIIKQYT.............................................   53
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEE.............................................


DSSP  llhhhhhhhhhHHLHhhhHHHH...................hhhhHHHLL..........
Query eekefikqkikGIERxkkISEK...................ileaLNDLD..........  151
ident            |                                                
Sbjct ...levdqkklGLPV...SCIVeatvknadyerfksyiqtlpnieFCYRIagaacymlki  107
DSSP  ...eeellhhhLLLE...EEEEeeeehhhlhhhhhhhhhlllleeEEEEEelllleeeee


DSSP  .................................
Query .................................  151
ident                                  
Sbjct naesleavedfinktspyaqtvthvifseidtk  140
DSSP  eellhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeellll


No 97: 1ODDA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN OMPR;

DSSP  llhhhhhhhhHHHH..hhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHL.....
Query xiixeeakklIIEL..fselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK.....   52
ident                          |     ||   |      ||               
Sbjct aviafgkfklNLGTremfredePMPLTSGEFAVLKALVSHPrEPLSRDKLMNLARgreys   60
DSSP  leeeelleeeELLLleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHLLLlLLLLHHHHHHHHLlllll


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLL........LEEEELLlllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELG........FVRKVWIkgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdli  104
ident             |                ||        |  |                 
Sbjct AMERSIDVQISRLRRMVeedpahprYIQTVWG.....LGYVFVPD...............  100
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHllllllllLEEEELL.....LEEEELLL...............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                
Sbjct ...............................................  100
DSSP  ...............................................


No 98: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |          |      ||||   | ||        
Sbjct ......................HLDDLDRNILRLLKKD.aRLTISELSEQLKKPESTIHF   37
DSSP  ......................LLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHH......
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaKTYEDLKKL......  114
ident   ||| | |      |                                            
Sbjct RIKKLQERGVIERYTIilgeqlkpkhlalivlevgkpedfleryiSYISSTLSAlpgvlf   97
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEEEeellllllleeeeeeeeellllhhhhhhhHHHHHHHHLllleee


DSSP  ...............hhhllLLLHH.HHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHLL.......
Query ...............eekcnEEEKE.FIKQKikgierxkkisekilealNDLD.......  151
ident                                                             
Sbjct vaksgedkiialvgknnkdeLVKFIeENITS.....ipnlkhiqifpitEIKKgedltgf  152
DSSP  eeeellleeeeeeeellllhHHHHHhHHLLL.....llleeeeeeeellEEEElllhhhh


DSSP  ....
Query ....  151
ident     
Sbjct laev  156
DSSP  hlll


No 99: 2GAIA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE I;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kyivvespakaktiksilgneyevfasmghiidlpkskfgvdlekdfepefavikgkekv   60
DSSP  leeeellhhhhhhhhhhhhhhleeeellllleellllllleellllleelleellllhhh


DSSP  ..........................................................ll
Query ..........................................................xi    2
ident                                                             
Sbjct veklkdlakkgelliasdmdregeaiawhiarvtntlgrknrivfseitprvireavknp  120
DSSP  hhhhhhhhhhlleeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.................LLHHHHHHHHHHHHLL......
Query ixeeakkliielfselaKIHG.................LNKSVGAVYAILYLSD......   39
ident                                             |               
Sbjct reidmkkvraqlarrilDRIVgyslspvlwrnfksnlsAGRVQSATLKLVCDREreilrf  180
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct vpkkyhritvnfdgltaeidvkekkffdaetlkeiqsidelvveekkvsvkkfappepfk  240
DSSP  llleeeeeeeeelleeeeelllllllllhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct tstlqqeaysklgfsvsktmmiaqqlyegvetkdghiafitymrtdstrvsdyakeearn  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhleelllleellllllllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct litevfgeeyvgaheairptnvfmtpeeagkylnsdqkklyeliwkrflasqmkpsqyee  360
DSSP  hhhhhllhhhlllllllllllllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct trfvlrtkdgkyrfkgtvlkkifdgyekvwkterntgefpfeegesvkpvvvkieeqetk  420
DSSP  eeeeeelllllleeeeeeeeeeelhhhhllllllllllllllllleellleeeeeeeell


DSSP  ..LLEEHHHHHHHHL....LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELL..HHH
Query ..KPLTISDIXEELK....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVD..GFS   91
ident      |      |                | |   |   |         |          
Sbjct pkPRYTEGSLVKEMErlgiGRPSTYASTIKLLLNRGYIKKIR......GYLYPTIvgSVV  474
DSSP  llLLLLHHHHHHHHHhhllLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHhhHHH


DSSP  HH..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHhhhhHH
Query SI..kdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkISEKIlealND  149
ident                                                             
Sbjct MDylekkysdvvsvsftaemekdldeveqgkktdkivlrefyesfssvfDRNDR....IV  530
DSSP  HHhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllLLLLL....LL


DSSP  LL.................................................
Query LD.................................................  151
ident  |                                                 
Sbjct VDfptnqkcscgkemrlsfgkygfylkcecgktrsvkndeiaviddgkifl  581
DSSP  LLeeeeeellllleeeeeeelleeeeelllllleellllllleeelleeel


No 100: 2FOKA MOLECULE: FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct irtfgwvqnpgkfenlkrvvqvfdrnskvhnevknikiptlvkeskiqkelvaimnqhdl   60
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iytykelvgtgtapcdaiiqatiadqgkgyidnwssdgflrwahalgfieyinksdsfvi  120
DSSP  leehhhhhlllllllllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelllleeee


DSSP  .......llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhlllLHHHHHHHHHHHhLLLLEEHHHHHHHHL.
Query .......xiixeeakkliielfsELAKihglNKSVGAVYAILYlSDKPLTISDIXEELK.   52
ident                                          |      ||  |    |  
Sbjct tdvglaysksadgsaiekeilieAISS....YPPAIRILTLLE.DGQHLTKFDLGKNLGf  175
DSSP  lhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHHL....LHHHHHHHHHHL.LLLLEEHHHHHLLLLl


DSSP  ...................................lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEE.LL
Query ...................................iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKV.WI   76
ident                                     |          |  || |      
Sbjct sgesgftslpegilldtlanampkdkgeirnnwegsSDKYARMIGGWLDKLGLVKQGkKE  235
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlllhHHHHHHHHHHHHHHLLLEEELlEE


DSSP  LL.....LLLL.EEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query KG.....ERKN.YYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqki  130
ident        |                                                    
Sbjct FIiptnkEFIShAFKITGE.........................................  254
DSSP  EElllleEEELlEEEELHH.........................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhHHHL........................................
Query kgierxkkisekileaLNDL........................................  150
ident                                                             
Sbjct .....glkvlrrakgsTKFTrvpkrvywemlatnltdkeyvrtrralileilikagslki  309
DSSP  .....hhhhhhhhhllLLLLlllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct eqiqdnlkklgfdevietiendikglintgifieikgrfyqlkdhilqfvipnrlvksel  369
DSSP  hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeelleeeellllllllllllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct eekkselrhklkyvpheyielieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyrgkhlggsrkpd  429
DSSP  hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct gaiytvgspidygvivdtkaysggynlpigqademqryveenqtrnkhinpnewwkvyps  489
DSSP  eeeelllllllleeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct svtefkflfvsghfkgnykaqltrlnhitncngavlsveelliggemikagtltleevrr  549
DSSP  lllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhhhhhllllhhhhhl


DSSP  ........l
Query ........d  151
ident          
Sbjct kfnngeinf  558
DSSP  lllleelll


No 101: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dptlewflshchihkypskstlihqgekaetlyyivkgsvavlikdeegkemilsylnqg   60
DSSP  lhhhhhhhllleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeeeellllleeeeeeelll


DSSP  .......................................................LLHHH
Query .......................................................XIIXE    5
ident                                                             
Sbjct dfigelglfeegqersawvraktacevaeisykkfrqliqvnpdilmrlsaqmarRLQVT  120
DSSP  leelhhhlllllllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL.............LLEEHHHHHHHHL
Query EAKKLIIELFselakihglnKSVGAVYAILYLSD.............KPLTISDIXEELK   52
ident   |                    |     |                    |   |     
Sbjct SEKVGNLAFL..........DVTGRIAQTLLNLAkqpdamthpdgmqIKITRQEIGQIVG  170
DSSP  HHHHHHHHHL..........LHHHHHHHHHHHHLllllleeelleeeEELLHHHHHHHHL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlk  112
ident  |   |   || ||                                              
Sbjct CSRETVGRILKMLEDQNLISAHG......KTIVVYG........................  200
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEEEL........................


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                        
Sbjct .......................................  200
DSSP  .......................................


No 102: 1USTA MOLECULE: HISTONE H1;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL..LLLEEHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS..DKPLTISDIXEELK......   52
ident                                   |      |           |      
Sbjct ..................keeassKSYRELIIEGLTALkeRKGSSRPALKKFIKenypiv   42
DSSP  ..................llllllLLHHHHHHHHHLLLllLLLEEHHHHHHHHHhhlhhh


DSSP  ....lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ....iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliakty  108
ident               ||  | |                     |                 
Sbjct gsasnFDLYFNNAIKKGVEAGDFEQPK...gpAGAVKLAKKKS.................   82
DSSP  hllllHHHHHHHHHHHHHHLLLEELLL...llLLEEEELLLLL.................


DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                            
Sbjct .................................pevkkekevs   92
DSSP  .................................llllllllll


No 103: 1FNNA MOLECULE: CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 6;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aivvddsvfspsyvpkrlphreqqlqqldillgnwlrnpghhypratllgrpgtgktvtl   60
DSSP  lllllhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeellllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rklwelykdkttarfvyingfiyrnftaiigeiarslnipfprrglsrdeflallvehlr  120
DSSP  hhhhhhhlllllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct erdlymflvlddafnlapdilstfirlgqeadklgafrialvivghndavlnnldpstrg  180
DSSP  hlllleeeeeelhhhllhhhhhhhhhhlllhhhhlllleeeeeeelllhhhhlllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct imgkyvirfspytkdqifdilldrakaglaegsysedilqmiaditgaqtpldtnrgdar  240
DSSP  hhllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllllllllllllhh


DSSP  .....................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHL.
Query .....................xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLS.   38
ident                                            ||             | 
Sbjct laidilyrsayaaqqngrkhiapedvrksskevlfgiseevlIGLPLHEKLFLLAIVRSl  300
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  ....LLLEEHHHHHHHHL..........LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllLLEE
Query ....DKPLTISDIXEELK..........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYY   84
ident         |  |  |  |                   |  | | | |             
Sbjct kishTPYITFGDAEESYKivceeygerpRVHSQLWSYLNDLREKGIVETRQN....TTLI  356
DSSP  hhhlLLLEEHHHHHHHHHhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEL....LEEE


DSSP  EELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query EAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekil  144
ident                                                             
Sbjct SIGTEP............................................ldtleavitk  372
DSSP  ELLLLL............................................hhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhll
Query ealndld  151
ident        
Sbjct likeelr  379
DSSP  hhhhhll


No 104: 2HS5A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR GNTR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHH..hHHLL..LLEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAI..lYLSD..KPLTISDIXEELKISKG   56
ident                             |                |   ||   |  |  
Sbjct ....................tsrtTRVAGILRDAiidGTFRpgARLSEPDICAALDVSRN   40
DSSP  ....................lhhhHHHHHHHHHHhhhLLLLllLEELHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLHHHhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFSsiKDIAKRKHDLIAktyedlkklee  116
ident  |      | |   |                                             
Sbjct TVREAFQILIEDRLVAHELN.....RGVFVRVPTAedITELYICRRVVE..........c   85
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELLLLHhhHHHHHHHHHHHH..........h


DSSP  hlllllhhHHHHH...............................................
Query kcneeekeFIKQK...............................................  129
ident                                                             
Sbjct agvngfdpATGDLsrvaealdladeryavedwtgvgtadihfhsalaslnnsnridelxr  145
DSSP  hhhhllllLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh


DSSP  ........................................hhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................ikgierxkkisekilealnd  149
ident                                                             
Sbjct svwnearlvfhvxddahrfhgpyltrnheiydalaagnteaagqllktyledaeaqilga  205
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ll
Query ld  151
ident   
Sbjct yr  207
DSSP  ll


No 105: 2FNAA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gxlfdtspkdnrkdffdrekeieklkglrapitlvlglrrtgkssiikiginelnlpyiy   60
DSSP  lllllllllllhhhllllhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ldlrkfeernyisykdfllelqkeinklvkrlpsllkalkniqgivixgneikfnrlsfa  120
DSSP  eehhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllleeelllleeellllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nllesfeqaskdnviivldeaqelvklrgvnllpalayaydnlkrikfixsgsexgllyd  180
DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhhllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeellhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ylrvedpesplfgrafstvelkpfsreeaieflrrgfqeadidfkdyevvyekiggipgw  240
DSSP  hllllllllllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhh


DSSP  .................llhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLL..lLHHHHHHHHHHHhllLL
Query .................xiixeeakkliielfsELAKIHG..lNKSVGAVYAILYlsdKP   41
ident                                  |          |        |    | 
Sbjct ltyfgfiyldnknldfainqtleyakklilkefENFLHGReiaRKRYLNIXRTLS...KC  297
DSSP  hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLhhhHHHHHHHHHHHL...LL


DSSP  EEHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHHhhhhh
Query LTISDIXEELK......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFssikd   95
ident    ||    |       ||       |  |       |          |           
Sbjct GKWSDVKRALEleegieISDSEIYNYLTQLTKHSWIIKEG......EKYCPSEPL.....  346
DSSP  LLHHHHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL......LLEEELLHH.....


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                         
Sbjct ..................................................islafs  352
DSSP  ..................................................hhhhll


No 106: 2HWVA MOLECULE: DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR VICR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHH......hLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHLL
Query xiixeeakkliielfsELAK......iHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELKI   53
ident                              |          |        |          
Sbjct ....shmtigdltihpDAYMvskrgekIELTHREFELLYYLAKHiGQVMTREHLLQTVWG   56
DSSP  ....lleeelleeellLLLEeeelleeEELLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLL


DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHLL........lEEEELlllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhh
Query .....SKGNVSXSLKKLEELG........fVRKVWikgerKNYYEAVDGFssikdiakrk  100
ident          |      | |                        |                
Sbjct ydyfgDVRTVDVTVRRLREKIedspshptyLVTRR.....GVGYYLRNPE..........  101
DSSP  hhhllLHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllEEEEL.....LLEEEELLLL..........


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                    
Sbjct ...................................................  101
DSSP  ...................................................


No 107: 1WY0A MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;

DSSP  ..llhhhhhhhhhhhhHHHHHHHLL...................................
Query ..xiixeeakkliielFSELAKIHG...................................   23
ident                   |                                         
Sbjct ekyeelfarikekaklIDEKIFELIpekdprvlyeaarhyplaggkrvrpfvvltsteav   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHLlllllhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhhhllll


DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query ....................lnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsxslk   63
ident                                                             
Sbjct ggdplraiypavaielihnyslvhddimdmdetrrgkptvhriwgvnmailagdllfska  120
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhLLLEeeelllllllleeeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLH
Query kleeLGFVrkvwikgerknyyeavDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNeeEK  123
ident                                     |               ||      
Sbjct feavARAE..............ipPEKKARVLEVIVKASNELCEGQARDLEFEKKS..TV  164
DSSP  hhhhHLLL..............llHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LL


DSSP  HH.HHHHHHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHLL..............................
Query EF.IKQKIKGI.ERXKKISEKILEALNDLD..............................  151
ident                              |                              
Sbjct TIeEYMEMISGkTGALFEASAKVGGIIGTDneeyikalsswgrnvgiafqiwddvldlia  224
DSSP  LHhHHHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct dekklgkpvgsdirkgkktlivahffenadekdkqrflkifgkdiksdvmeaidllkkyg  284
DSSP  lhhhhlllllhhhhhllllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ...........................................
Query ...........................................  151
ident                                            
Sbjct sidyaaeiakdmikkanealrilpkskarmdlellakfivere  327
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhllllhhhhhhhhhhhhlllll


No 108: 1OYWA MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xaqaevlnlesgakqvlqetfgyqqfrpgqeeiidtvlsgrdclvvxptgggkslcyqip   60
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeelllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alllngltvvvsplislxkdqvdqlqangvaaaclnstqtreqqlevxtgcrtgqirlly  120
DSSP  hhhllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iaperlxldnflehlahwnpvllavdeahcisqwghdfrpeyaalgqlrqrfptlpfxal  180
DSSP  elhhhhllllhhhhhlllleeeeeellhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tataddttrqdivrllglndpliqissfdrpniryxlxekfkpldqlxryvqeqrgksgi  240
DSSP  ellllhhhhhhhhhhhllllleeeellllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhlllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iycnsrakvedtaarlqskgisaaayhaglennvradvqekfqrddlqivvatvafgxgi  300
DSSP  eelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhllllleeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkpnvrfvvhfdiprniesyyqetgragrdglpaeaxlfydpadxawlrrcleekpqgql  360
DSSP  lllllleeeellllllhhhhhhhhllllllllleeeeeeelhhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  ............................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHH
Query ............................xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVY   32
ident                                                             
Sbjct qdierhklnaxgafaeaqtcrrlvllnyfgegrqepcgncdicldppkQYDGSTDAQIAL  420
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllllllllllhhhhllllEEELHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLEEHHHHHHHHL.......................LLHHHHHHHHHHHHHLL
Query AILYLSDKPLTISDIXEELK.......................ISKGNVSXSLKKLEELG   69
ident                 |                           |          |  ||
Sbjct STIGRVNQRFGXGYVVEVIRgannqrirdyghdklkvygxgrdKSHEHWVSVIRQLIHLG  480
DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHllllhhhhhhlhhhlllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEEEELLllllLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query FVRKVWIkgerKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqk  129
ident  |                                                          
Sbjct LVTQNIA...qHSALQLTEA........................................  497
DSSP  LEEEEHH...hLLEEEELHH........................................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikgierxkkisekilealndld  151
ident                       
Sbjct ...arpvlrgesslqlavpriv  516
DSSP  ...hhhhhhllllleeelllll


No 109: 1E17A MOLECULE: AFX;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLlHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHL.......
Query xiixeeakkliielfselakIHGLnKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK.......   52
ident                                         | ||   | |          
Sbjct ...............srrnaWGNQ.SYAELISQAIESApEKRLTLAQIYEWMVrtvpyfk   44
DSSP  ...............lllllLLLL.LHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHHHhhlhhhh


DSSP  .........lLHHHHHHHHHHhhhLLLEEEELLL.LLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhh
Query .........iSKGNVSXSLKKleeLGFVRKVWIK.GERKNYYEAVDGFssikdiakrkhd  102
ident            |      |          ||                             
Sbjct dkgdsnssagWKNSIRHNLSL...HSKFIKVHNEaTGKSSWWMLNPEG............   89
DSSP  hhhllllhhhHHHHHHHHHHL...LLLEEEELLLlLLLLLEEEELLLL............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query liaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                  
Sbjct ................................................g   90
DSSP  ................................................l


No 110: 1CY0A MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE I;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gkalvivespakaktinkylgsdyvvkssvghirdlpalvnrmgvdpwhnweahyevlpg   60
DSSP  lleeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeellllleelllhhhhhleellllleelleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kekvvselkqlaekadhiylatdldregeaiawhlreviggddarysrvvfneitknair  120
DSSP  lhhhhhhhhhhhllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllhhhhh


DSSP  ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.............LLHHHHHHHHHHHHLL
Query ........xiixeeakkliielfselaKIHG.............LNKSVGAVYAILYLSD   39
ident                                                             
Sbjct qafnkpgelnidrvnaqqarrfmdrvvGYMVspllwkkiarglsAGRVQSVAVRLVVERE  180
DSSP  hhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhllllllLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct reikafvpeefwevdastttpsgealalqvthqndkpfrpvnkeqtqaavsllekarysv  240
DSSP  hhhhhlllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeelleelllllhhhhhhhhhhhhhlleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct leredkpttskpgapfitstlqqaastrlgfgvkktmmmaqrlyeagyitymrtdstnls  300
DSSP  eeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct qdavnmvrgyisdnfgkkylpespnqyaskensqeaheairpsdvnvmaeslkdmeadaq  360
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllhhhlllllllllllllllllllllllllllllhhhlllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct klyqliwrqfvacqmtpakydsttltvgagdfrlkargrilrfdgwtkvmilpavnkgda  420
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeelhhhhhlllllllllle


DSSP  ................LLEEHHHHHHHHL....LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllll
Query ................KPLTISDIXEELK....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikge   79
ident                           ||                     | ||       
Sbjct ltlveltpaqhftkppARFSEASLVKELEkrgiGRPSTYASIISTIQDRGYVRVEN....  476
DSSP  eeeeeeeeeeeellllLLLLHHHHHHHHHhlllLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEL....


DSSP  llLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query rkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkki  139
ident       |                                                     
Sbjct ..RRFYAEKM............geivtdrleenfrelmnydftaqmensldqvanheaew  522
DSSP  ..LEEEELHH............hhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllh


DSSP  hhhhhhhhhhll
Query sekilealndld  151
ident             
Sbjct kavldhffsdft  534
DSSP  hhhhhhhhhhhl


No 111: 2DBBA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |         ||      ||       |         
Sbjct ......................KLDRVDMQLVKILSEN.sRLTYRELADILNTTRQRIAR   37
DSSP  ......................LLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident    ||  ||  ||  |                                            
Sbjct RIDKLKKLGIIRKFTI................................ipdidklgymya   65
DSSP  HHHHHHHHLLEEEEEE................................eellhhhleeee


DSSP  llhhhhhhhhhhhLHHHHHHHH..hhhhHHHL............................
Query eekefikqkikgiERXKKISEK..ileaLNDL............................  150
ident                   ||                                        
Sbjct ivlikskvpsdadKVISEISDIeyvksvEKGVgryniivrlllpkdikdaenliseflqr  125
DSSP  eeeeeellhhhhhHHHHHHLLLlleeeeEEEElllleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ....................l
Query ....................d  151
ident                      
Sbjct iknaenvevilisevrkfeii  146
DSSP  llleeeeeeeeeeeeeeelll


No 112: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct etvsfkagdvilypgvpgprdrayrvleglvrleavdeegnaltlrlvrpggffgeealf   60
DSSP  lleeelllleeellllllllllleeeeelleeeeeellllleeeeeeelllleellhhhh


DSSP  .....................................LLHHHHHHHHHHHhhhhhhhhll
Query .....................................XIIXEEAKKLIIElfselakihg   23
ident                                                             
Sbjct gqeriyfaeaatdvrleplpenpdpellkdlaqhlsqGLAEAYRRIERLA..........  110
DSSP  lllllleeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHH..........


DSSP  llHHHHHHHHHHHHLL.............lLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLL
Query lnKSVGAVYAILYLSD.............kPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGF   70
ident          | |                    |              |      |   | 
Sbjct tqRLKNRXAAALLELSetplaheeegkvvlKATHDELAAAVGSVRETVTKVIGELAREGY  170
DSSP  hlLHHHHHHHHHHHHLlllleeeelleeeeELLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEELllllllLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query VRKVWikgerkNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqki  130
ident  |               |                                          
Sbjct IRSGY......GKIQLLDLKG.......................................  185
DSSP  EEEEL......LEEEELLHHH.......................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kgierxkkisekilealndld  151
ident                      
Sbjct ............lkelaesrg  194
DSSP  ............hhhhhllll


No 113: 2CMXA MOLECULE: HYPOTHETICAL 13.2 KDA PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLL...LHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI...SKGN   57
ident                          |     | ||      ||  ||     |   |  |
Sbjct ....................tlnsYKXAEIXYKILEKK.GELTLEDILAQFEIsvpSAYN   39
DSSP  ....................lllhHHHHHHHHHHHHHH.LEELHHHHHHHHLLlhhHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLL..lEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELG..fVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident     ||   |              ||                                  
Sbjct IQRALKAICERHpdeCEVQYK..NRKTTFKWIK...........................   70
DSSP  HHHHHHHHHHHLlllEEEEEL..LLLEEEEELL...........................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ....................................   70
DSSP  ....................................


No 114: 2C6YA MOLECULE: INTERLEUKIN 2 PROMOTOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHL.......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK.......   52
ident                                        || ||   |            
Sbjct ...................dskppYSYAQLIVQAITMApDKQLTLNGIYTHITknypyyr   41
DSSP  ...................lllllLLHHHHHHHHHHLLlLLLEEHHHHHHHHHhhlllll


DSSP  ....lLHHHHHHHHHHHhhlLLEEEELLL...LLLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhh
Query ....iSKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIK...GERKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdl  103
ident              |          ||                                  
Sbjct tadkgWQNSIRHNLSLN...RYFIKVPRSqeePGKGSFWRIDpaSESK............   86
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHL...LLEEEELLLlllLLLLLEEEELhhHHHH............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                 
Sbjct ....................................lieqafrkrrpr   98
DSSP  ....................................hhhhhlllllll


No 115: 2GWRA MOLECULE: DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR MTRA;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dtxrqrilvvdddaslaexltivlrgegfdtavigdgtqaltavrelrpdlvlldlxlpg   60
DSSP  llllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xngidvcrvlradsgvpivxltaktdtvdvvlglesgaddyixkpfkpkelvarvrarlr  120
DSSP  llhhhhhhhhhlllllleeeeeellllllhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhhll


DSSP  .llhHHHH........hhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHH
Query .xiiXEEA........kkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEE   50
ident                                 |          |        |     | 
Sbjct rnddEPAExlsiadveidvpahkvtrngeQISLTPLEFDLLVALARKpRQVFTRDVLLEQ  180
DSSP  llllLLLLeeeelleeeelllleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHH


DSSP  HLL...LHHHHHHHHHHHHHL........LLEEEELlllllLLEEEELLHhhhhhhhhhh
Query LKI...SKGNVSXSLKKLEEL........GFVRKVWikgerKNYYEAVDGfssikdiakr   99
ident           |      |             |  |         | |             
Sbjct VWGyraDTRLVNVHVQRLRAKvekdpenpTVVLTVR.....GVGYKAGPP..........  225
DSSP  HLLlllLLHHHHHHHHHHHHHhlllllllLLEEEEL.....LLEEEELLL..........


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query khdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                     
Sbjct ....................................................  225
DSSP  ....................................................


No 116: 2FYNA MOLECULE: CYTOCHROME B;

DSSP  llhhhhhhhHHHH............hhhhhhhhllLLHHHHHhhHHHHhlllleehhhhh
Query xiixeeakkLIIE............lfselakihgLNKSVGAvyAILYlsdkpltisdix   48
ident           |                                                 
Sbjct .........GIPHdhyeprtgiekwlhsrlpivalAYDTIMI..PTPR............   37
DSSP  .........LLLLlllllllhhhhhhhllllhhhhHHHHHLL..LLLL............


DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeELLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query eelkiskgnvsxslkkleelgfvrkvwikgerknyyeAVDGFSsIKDIAKRKHDLIAKTY  108
ident                                             |               
Sbjct .....................................NLNWMW.IWGVVLAFCLVLQIVT   59
DSSP  .....................................LLLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH....lLLLLHHHH......HHHHHHHLHHHHHHHHHHHHH.HHLL......
Query EDLKKLEEK....cNEEEKEFI......KQKIKGIERXKKISEKILEAL.NDLD......  151
ident                    | |                      |   |           
Sbjct GIVLAMHYTphvdlAFASVEHImrnvngGFMLRYLHANGASLFFIAVYLhIFRGlyygsy  119
DSSP  HHHHHLLLLllhhhHHHHHHHHhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct kaprevtwivgmliylammatafmgyvlpwgqmsfwgatvitglfgaipgighsiqtwll  179
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ggpavdnatlnrffslhyllpfviaalvaihiwafhstgnnnptgvevrrtskaeaqkdt  239
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vpfwpyfiikdvfalavvllvffaivgfmpnylghpdnyieanplrtpahivpewyflpf  299
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhlllllllllllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct yailraftadvwvvqianfisfgiidakffgvlamfgailvmalvpwldtspvrsgryrp  359
DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllllllhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct mfkiyfwllaadfviltwvgaqqttfpydwisliasaywfayflvilpilgaiekpvapp  419
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  .........
Query .........  151
ident          
Sbjct atieedfna  428
DSSP  llhhhhhhl


No 117: 1GXPA MOLECULE: 5'-D(*GP*AP*GP*CP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*

DSSP  llhHHHH.......hhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHL
Query xiiXEEA.......kkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK   52
ident     ||                                                      
Sbjct ..aVEEViemqglsldptshrvmageePLEMGPTEFKLLHFFMTHPeRVYSREQLLNHVW   58
DSSP  ..lLLLLeeelleeeelllleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHHLLlLLLLHHHHHHHHL


DSSP  .....lLHHHHHHHHHHHHH.......LLLEEEELlllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhh
Query .....iSKGNVSXSLKKLEE.......LGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFssikdiakrk  100
ident           |      |            |  |         |     |          
Sbjct gtnvyvEDRTVDVHIRRLRKalepgghDRMVQTVR.....GTGYRFSTRF..........  103
DSSP  llllllLLLHHHHHHHHHHHhhllllhHHHEEEEL.....LLEEEELLLL..........


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                    
Sbjct ...................................................  103
DSSP  ...................................................


No 118: 1BM9A MOLECULE: REPLICATION TERMINATOR PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELK........   52
ident                                          |      | |         
Sbjct ..........eekrsstgflvkqrAFLKLYMITMTEQE..rLYGLKLLEVLRsefkeigf   48
DSSP  ..........llllllllllllhhHHHHHHHHHHHHLL..lLLLLLHHHHHHhhhlllll


DSSP  .LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL.....LLLLEEEELLHHHHHHhhhhhhhhhhhh
Query .ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.....ERKNYYEAVDGFSSIKdiakrkhdliak  106
ident       |  ||  |   |       |           |   |                  
Sbjct kPNHTEVYRSLHELLDDGILKQIKVKKegaklQEVVLYQFKDYEAAKL............   96
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllllLEEEEEEELLHHHHHH............


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikQKIKgierxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct .ykkqlkveldrckkliekalSDNF....................  120
DSSP  .hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL....................


No 119: 2HYEC MOLECULE: DNA DAMAGE-BINDING PROTEIN 1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kklviknfrdrprlpdnytqdtwrklheavravqsstsirynleelyqavenlcshkvsp   60
DSSP  lllleelllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhlllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mlykqlrqacedhvqaqilpfredsldsvlflkkintcwqdhcrqmimirsiflfldrty  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vlqnstlpsiwdmglelfrthiisdkmvqsktidgilllierersgeavdrsllrsllgm  180
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lsdlqvykdsfelkfleetnclyaaegqrlmqerevpeylnhvskrleeegdrvityldh  240
DSSP  hhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct stqkpliacvekqllgehltailqkgldhlldenrvpdlaqmyqlfsrvrggqqallqhw  300
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct seyiktfgtaivinpekdkdmvqdlldfkdkvdhvievcfqknerfvnlmkesfetfink  360
DSSP  hhhhhhhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rpnkpaeliakhvdsklragnkeatdeelertldkimilfrfihgkdvfeafykkdlakr  420
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llvgksasvdaeksmlsklkhecgaaftsklegmfkdmelskdimvhfkqhmqnqsdsgp  480
DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ...................llhhHHHH....................hhhhhhhHHHH..
Query ...................xiixEEAK....................kliielfSELA..   19
ident                                                             
Sbjct idltvniltmgywptytpmevhlTPEMiklqevfkafylgkhsgrklqwqttlgHAVLka  540
DSSP  leeeeeeeellllllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhhllllleellllhhhlEEEEel


DSSP  ......hhLLLLHHHHHHHHHhHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH..LLLE
Query ......kiHGLNKSVGAVYAIlYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEE..LGFV   71
ident                  |               |     |        |  |        
Sbjct efkegkkeFQVSLFQTLVLLM.FNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACgkARVL  599
DSSP  llllllleEEEEHHHHHHHHH.LLLLLLEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHLLLLllLLLE


DSSP  EEEL..lllllLLEEEELLhhhHHHHHH.................hhhhhhhhhhhhhhh
Query RKVW..ikgerKNYYEAVDgfsSIKDIA.................krkhdliaktyedlk  112
ident  |                      |                                   
Sbjct IKSPkgkevedGDKFIFNG...EFKHKLfrikinqiqmketveeqvsttervfqdrqyqi  656
DSSP  EELLlllllllLLEEEELL...LLLLLLlleelhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hHHHH............llLLLHHHHHH............hhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query kLEEK............cnEEEKEFIKQ............kikgierxkkisekilealn  148
ident                      |                                      
Sbjct dAAIVrimkmrktlghnllVSELYNQLKfpvkpgdlkkrieslidrdymerdkdnpnqyh  716
DSSP  hHHHHhhhhhlleeelhhhHHHHHHHLLllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleee


DSSP  hll
Query dld  151
ident    
Sbjct yva  719
DSSP  lll


No 120: 1OYIA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-BINDING PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHHL.....lLLEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgAVYAILYLS.....dKPLTISDIXEELKISK   55
ident                                  |             |       |   |
Sbjct ............................rSNAEIVCEAiktigiEGATAAQLTRQLNMEK   32
DSSP  ............................lLLHHHHHHHhhhhllLLEEHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllLLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident   |   |  |     |                                            
Sbjct REVNKALYDLQRSAMVYSSDD...IPPRWFMT............................   61
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLEELLL...LLLEEELL............................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ...................................t   62
DSSP  ...................................l


No 121: 1NHAA MOLECULE: TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF, ALPHA

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........   52
ident                              ||   |     | |  |              
Sbjct ......................dvQVTEDAVRRYLTRK..PMTTKDLLKKFQtkktglss   36
DSSP  ......................llLLLHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLlllllllh


DSSP  .lLHHHHHHHHHHHHhlllEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iSKGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedl  111
ident           || |          |    |                              
Sbjct eqTVNVLAQILKRLN....PERKMI..NDKMHFSLKE.......................   67
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHL....LEEEEE..LLEEEEELLL.......................


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                         
Sbjct ........................................   67
DSSP  ........................................


No 122: 1I1GA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                  ||           |   | ||   |  
Sbjct .......................IDERDKIILEILEKD.aRTPFTEIAKKLGISETAVRK   36
DSSP  .......................LLLHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEeelllllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRkvwikgerknyyeaVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident   | ||| |                                                   
Sbjct RVKALEEKGIIE..............GYTI..............................   52
DSSP  HHHHHHHHLLLL..............LLLL..............................


DSSP  llhhhhhhhhhhHLHHH...................hhhHHHHhhHHHL...........
Query eekefikqkikgIERXK...................kisEKILeaLNDL...........  150
ident                                              |              
Sbjct ....kinpkklgYSLVTitgvdtkpeklfevaeklkeydFVKE..LYLSsgdhmimaviw  106
DSSP  ....llllhhhlLLEEEeeeeeelhhhhhhhhhhhhhllLEEE..ELLLllllleeeeee


DSSP  .................................l
Query .................................d  151
ident                                   
Sbjct akdgedlaeiisnkigkiegvtkvcpaiileklk  140
DSSP  ellhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeellllll


No 123: 1GKUB MOLECULE: REVERSE GYRASE;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aaaaaaaaaaaaaaaaaaaslclfpedfllkefveffrkcvgepraiqkmwakrilrkes   60
DSSP  lllllllleellllleelllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct faataptgvgktsfglamslflalkgkrcyvifptsllviqaaetirkyaekagvgtenl  120
DSSP  eelllllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igyyhgripkrekenfmqnlrnfkivitttqflskhyrelghfdfifvddvdailkaskn  180
DSSP  eeelllllllhhhhhhhhlhhhlleeeeehhhhhhllllllllleeeellhhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vdkllhllgfhydlktkswvgeargclmvstatakkgkkaelfrqllnfdigssritvrn  240
DSSP  hhhhhhhlleeeelllleeeelllleeeellllllllllhhhhhhhhllllllleellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vedvavndesistlssileklgtggiiyartgeeaeeiyeslknkfrigivtatkkgdye  300
DSSP  eeeeeellllllllhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllleeellllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kfvegeidhligtahrgldlperirfavfvgcpsfrvtiedidslspqmvkllaylyrnv  360
DSSP  hhhhlllleeeeelllllllllllleeeeellleeeeelllhhhllhhhhhhhhlllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct deierllpaverhidevreilkkvmgkerpqakdvvvregevifpdlrtyiqgsgrtsrl  420
DSSP  hhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelleeeeelhhhhhhhhhlllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct faggltkgasflleddsellsafieraklydiefksidevdfeklsreldesrdryrrrq  480
DSSP  elleelleeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct efdlikpalfivesptkarqisrffgkpsvkvldgavvyeipmqkyvlmvtasighvvdl  540
DSSP  hlllleeeeeeellhhhhhhhhhhheeleeeeelleeeeeeellleeeeeeellllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct itnrgfhgvlvngrfvpvyasikdnsrsriealrklahdaefvivgtdpdtegekiawdl  600
DSSP  llllllllllllllllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhhleeeelllllhhhhhhhhhh


DSSP  ................................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.....
Query ................................xiixeeakkliielfselaKIHG.....   23
ident                                                             
Sbjct knllsgcgavkraefhevtrrailealeslrdvdenlvkaqvvrriedrwiGFVLsqklw  660
DSSP  hhhhlllleeeelllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhh


DSSP  .........LLHHHHHHHHHHHHLLL..................................
Query .........LNKSVGAVYAILYLSDK..................................   40
ident                 |                                           
Sbjct erfnnrnlsAGRAQTLVLGWIIDRFQesrerrkiaivrdfdlvlehdeeefdltiklvee  720
DSSP  hllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHLhhhleeeeeeelllleeellllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   40
ident                                                             
Sbjct reelrtplppyttetmlsdanrilkfsvkqtmqiaqelfenglityhrtdstrvsdvgqr  780
DSSP  eeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   40
ident                                                             
Sbjct iakeylgddfvgrewgesgahecirptrpltrddvqrliqegvlvveglrwehfalydli  840
DSSP  hhhhhhlllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   40
ident                                                             
Sbjct frrfmasqcrpfkvvvkkysiefdgktaeeerivraegrayelyravwvknelptgtfrv  900
DSSP  hhhhhhllllleeeeeeeeeeeelleeeeelleeeeelhhhhhlllllllllllleeeee


DSSP  ...........LEEHHHHHHHHL.......lLHHHhhhHHHHHHHLLLEEEELllllllL
Query ...........PLTISDIXEELK.......iSKGNvsxSLKKLEELGFVRKVWikgerkN   82
ident            | | | |    |                   |     |           
Sbjct kaevksvpkvlPFTQSEIIQMMKergigrpsTYAT...IVDRLFMRNYVVEKY......G  951
DSSP  ellleeeelllLLLHHHHHHHHHhhllllllLHHH...HHHHHHHLLLEEEEL......L


DSSP  EEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query YYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek  142
ident                                                             
Sbjct RMIPTKL.........gidvfrflvrryakfvsedrtrdlesrmdaiergeldylkaled 1002
DSSP  EEEELHH.........hhhhhhhhhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhll
Query ilealndld  151
ident          
Sbjct myaeiksid 1011
DSSP  hhhhhhlll


No 124: 2V1XA MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sspaawnkedfpwsgkvkdilqnvfklekfrplqletinvtmagkevflvmptgggkslc   60
DSSP  llhhhhlllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeellllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yqlpalcsdgftlvicplislmedqlmvlkqlgisatmlnassskehvkwvhaemvnkns  120
DSSP  hhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeellllllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct elkliyvtpekiakskmfmsrlekayearrftriavdevhccsqwghdfrpdykalgilk  180
DSSP  llleeeelhhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rqfpnasligltatatnhvltdaqkilciekcftftasfnrpnlyyevrqkpsntedfie  240
DSSP  hhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhlllllleeeellllllleeeeeeellllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct divklingrykgqsgiiycfsqkdseqvtvslqnlgihagayhanlepedkttvhrkwsa  300
DSSP  hhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct neiqvvvatvafgmgidkpdvrfvihhsmsksmenyyqesgragrddmkadcilyygfgd  360
DSSP  lllleeeelllllllllllleeeeeellllllhhhhhhhhllllllllleeeeeeelhhh


DSSP  ........................................llhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................xiixeeakkliielfselak   20
ident                                                             
Sbjct ifrissmvvmenvgqqklyemvsycqniskcrrvlmaqhfdevwacnkmcdncckdsafe  420
DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhllllllllllhhhhllllee


DSSP  HLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHL................llHHHHHHH
Query IHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELK................isKGNVSXS   61
ident              ||         ||                                  
Sbjct RKNITEYCRDLIKILKQAEelnEKLTPLKLIDSWMgkgaaklrvagvvaptlpREDLEKI  480
DSSP  EEELHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLllllhhhlllllllllllHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLLEEEELLLL..lLLLEEEELL.HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query LKKLEELGFVRKVWIKG..eRKNYYEAVD.GFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident                        |                                    
Sbjct IAHFLIQQYLKEDYSFTayaTISYLKIGPkANLLNN........................  516
DSSP  HHHHHHLLLEEEEEEELlllEEEEEEELHhHHHHHL........................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct ......................eahaitmqvtk  527
DSSP  ......................llllleeeeel


No 125: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN   57
ident                           |        |           ||| | |      
Sbjct .......................TTPSMEDYIEQIYMLIeekGYARVSDIAEALAVHPSS   37
DSSP  .......................LLHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLHHHHHHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEellllllllEEEELLH............................
Query VSXSLKKLEELGFVRKvwikgerknYYEAVDG............................   89
ident |     ||                                                    
Sbjct VTKMVQKLDKDEYLIY.........GLVLTSKgkkigkrlvyrhelleqflriigvdeek   88
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEL.........LLEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  .............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHLllllhhhhhhhhhhhlhh
Query .............fssikdiakrkhdliaktyEDLKKLEEKCneeekefikqkikgierx  136
ident                                                             
Sbjct iyndvegiehhlswnsidrigdlvqyfeeddaRKKDLKSIQK..................  130
DSSP  hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllhhHHHHHHHHHH..................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhll
Query kkisekilealndld  151
ident                
Sbjct ..............k  131
DSSP  ..............l


No 126: 2CG4A MOLECULE: REGULATORY PROTEIN ASNC;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                   |                  |      
Sbjct .....................yLIDNLDRGILEALMGN.aRTAYAELAKQFGVSPETIHV   38
DSSP  .....................lLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliAKTYedlkkleekcne  120
ident    |    |      |                                            
Sbjct RVEKMKQAGIITGARIdvspkqlgydvgcfigiilksakdypsaLAKL............   86
DSSP  HHHHHHHHLLEEEEEEeelllllllleeeeeeeeellhhhhhhhHHHH............


DSSP  llhhhhhhhhhhHLHHhHHHHhhhHHHH................................
Query eekefikqkikgIERXkKISEkilEALN................................  148
ident                                                             
Sbjct ...........eSLDE.VTEA...YYTTghysifikvmcrsidalqhvlinkiqtideiq  131
DSSP  ...........hLLLL.EEEE...EEELlllleeeeeeellhhhhhhhhhhlllllllee


DSSP  ................hll
Query ................dld  151
ident                    
Sbjct stetlivlqnpimrtikpn  150
DSSP  eeeeeelleeeeellllll


No 127: 1B4AA MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL.....LLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK.....ISK   55
ident                                  |        |       |         
Sbjct ........................GQRHIKIREIIMSN.DIETQDELVDRLReagfnVTQ   35
DSSP  ........................LHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHHHhllllLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHhlllEEEELLLLLllLEEEELLHH....hhHHHHHHHHHHhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEelgfVRKVWIKGErkNYYEAVDGF....ssIKDIAKRKHDliaktyedl  111
ident   ||   |         ||         |                |              
Sbjct ATVSRDIKEMQ....LVKVPMANG.rYKYSLPSDQrfnplqKLKRALVDVF.........   81
DSSP  HHHHHHHHHLL....LEEEELLLL.lEEEELLLLLlllhhhHHHHHHHHHE.........


DSSP  hhhhhhlllllhhhhHHHHhhhlhhhHHHHHHhHHHHHL.....................
Query kkleekcneeekefiKQKIkgierxkKISEKIlEALNDL.....................  150
ident                                                             
Sbjct ..........ikldgTGNL....lvlRTLPGN.AHAIGVlldnldwdeivgticgddtcl  126
DSSP  ..........eeeeeELLE....eeeEELLLL.HHHHHHhhhhhlllleeeeeellleee


DSSP  ...................l
Query ...................d  151
ident                     
Sbjct iicrtpkdakkvsnqllsml  146
DSSP  eeellhhhhhhhhhhhhlll


No 128: 2QC0A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;

DSSP  .............................................LLHHhHHHH......
Query .............................................XIIXeEAKK......    9
ident                                                             
Sbjct ewqaeqaynhlpplpldsklaelaetlpilkaciparaalaelkqAGEL.LPNQgllinl   59
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.LLLHhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct lplleaqgsseienivtttdklfqyaqedsqadpxtkealryrtalyqcftqlsnrplcv  119
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct ttaleicstiksvqxdvrkvpgtsltnqatgeviytppagesvirdllsnweaflhnqdd  179
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllllleelllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct vdplikxaxahyqfeaihpfidgngrtgrvlnilylidqqllsapilylsryivahkqdy  239
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhlhhhh


DSSP  .......................................hhhhhhHHHHHHL.LLLHHhh
Query .......................................liielfSELAKIH.GLNKSvg   29
ident                                               |          |  
Sbjct yrlllnvttqqewqpwiifilnaveqtakwtthkiaaareliahtTEYVRQQlPKIYS.h  298
DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHlLLLLL.h


DSSP  HHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEllllLLLLEEEELLH
Query AVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVwikgERKNYYEAVDG   89
ident               |    |         |  || |   |    |               
Sbjct ELVQVIFEQ.PYCRIQNLVESGLAKRQTASVYLKQLCDIGVLEEV....GKEKLFVHPKF  353
DSSP  HHHHHHHHL.LEEEHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEL....LLLLEEELHHH


DSSP  .......hhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query .......fssIKDIakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek  142
ident                                                             
Sbjct vtlxtkdsnqFSRY..............................................  367
DSSP  hhhhhlllllLLLL..............................................


DSSP  hhhhhhhll
Query ilealndld  151
ident          
Sbjct .........  367
DSSP  .........


No 129: 2DU9A MOLECULE: PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATORS;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHH........hhhlLLLEEHHHHHHHHL
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAI........lylsDKPLTISDIXEELK   52
ident                                  |                          
Sbjct .......................VPLYKQIASLIedsivdgtlsidQRVPSTNELAAFHR   37
DSSP  .......................LLHHHHHHHHHhhhhhlllllllLEELLHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHH
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAV.DGFSSIKDIAKRKHDL.IAKTYED  110
ident |        |  | | |   |                    |                 |
Sbjct INPATARNGLTLLVEAGILYKKRG.....IGXFVSaQAPALIRERRDAAFAAtYVAPLID   92
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELlLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHH


DSSP  HHHHHHhlllllhhhHHHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query LKKLEEkcneeekefIKQKIKGierxkkisekilealndld  151
ident                    |                     
Sbjct ESIHLG........fTRARIHA.........lldqvaesrg  116
DSSP  HHHHLL........lLHHHHHH.........hhhhhhhhll


No 130: 2DI3A MOLECULE: BACTERIAL REGULATORY PROTEINS, GNTR FAMILY;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.........lLEEHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.........kPLTISDIXEEL   51
ident                          |    |                          | |
Sbjct .......................sVKAHESVMDWVTEELrsgrlkigdhLPSERALSETL   37
DSSP  .......................lHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllLLLHHHHHHHH


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlllllEEEELLHhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhh
Query KISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgerknYYEAVDGfssikDIAKRKHDLIAKTYedl  111
ident   |       |  || ||                                 |   |    
Sbjct GVSRSSLREALRVLEALGTISTATGS.gprsGTIITAA...pgQALSLSVTLQLVTN...   90
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLLL.lhhhLLEELLL...llLHHHHHHHHHHHLL...


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHHH..................................
Query kkleekcneeekefikqkikgIERXK..................................  137
ident                                                             
Sbjct ...................qvGHHDIyetrqllegwaalhssaergdwdvaeallekmdd  131
DSSP  ...................llLHHHHhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhlll


DSSP  ...hhhhhhhhHHHHLL...........................................
Query ...kisekileALNDLD...........................................  151
ident                                                             
Sbjct pslpledflrfDAEFHVviskgaenplistlmealrlsvadhtvararalpdwratsarl  191
DSSP  llllhhhhhhhHHHHHHhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh


DSSP  ........................................
Query ........................................  151
ident                                         
Sbjct qkehrailaalragestvaatlikehiegyyeetaaaeal  231
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 131: 1R7JA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A;

DSSP  llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhHHHHHHHHhllLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnksvGAVYAILYlsdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                              |                |      |      
Sbjct ..........kkSKLE..........iiQAILEACK...SGSPKTRIMYGANLSYALTGR   37
DSSP  ..........llLHHH..........hhHHHHHHHL...LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident   | |  |   |           |                                    
Sbjct YIKMLMDLEIIRQEG......KQYMLTKK...................geelledirkfn   72
DSSP  HHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHH...................hhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhHHHHHLHhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqKIKGIERxkkisekilealndld  151
ident             |                  
Sbjct emrknmdqLKEKINS.............vls   90
DSSP  hhhhhhhhHHHHHHH.............hhl


No 132: 1WI9A MOLECULE: PROTEIN C20ORF116 HOMOLOG;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHhHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLNKsVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                      | |     |              
Sbjct ..................gSSGSSGF.LTEFINYIKKS.KVVLLEDLAFQMGLRTQDAIN   40
DSSP  ..................lLLLLLLH.HHHHHHHHHHL.LEELHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident     |   |    |     |                                        
Sbjct RIQDLLTEGTLTGVID..DRGKFIY...................................   63
DSSP  HHHHHHHHLLLLEEEL..LLLLEEE...................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                
Sbjct ......................itpsgpssg   72
DSSP  ......................lllllllll


No 133: 1I7DA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE III;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mrlfiaekpslaraiadvlpkphrkgdgfiecgngqvvtwcighlleqaqpdaydsryar   60
DSSP  leeeeellhhhhhhhhllllllleeelleeeellleeeeellllleeellhhhhlhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct wnladlpivpekwqlqprpsvtkqlnvikrflheaseivhagdpdregqllvdevldylq  120
DSSP  lllllllllllllleeelhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeellllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ...................................................llhhhhhhh
Query ...................................................xiixeeakk    9
ident                                                             
Sbjct lapekrqqvqrclindlnpqaveraidrlrsnsefvplcvsalararadwlyginmtray  180
DSSP  llhhhhhlleelllllllhhhhhhhhllleehhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL..............................
Query liielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD..............................   39
ident                      |       |                              
Sbjct tilgrnagyqgvLSVGRVQTPVLGLVVRRDeeienfvakdffevkahivtpaderftaiw  240
DSSP  hhhhhlllllllLLLLLLHHHHHHHHHHHHhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct qpseacepyqdeegrllhrplaehvvnrisgqpaivtsyndkresesaplpfslsalqie  300
DSSP  lllhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeelleeeeeeeeelllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct aakrfglsaqnvldicqklyethklitfprsdcrylpeehfagrhavmnaisvhapdllp  360
DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct qpvvdpdirnrcwddkkvdahhaiiptarssainlteneakvynliarqylmqfcpdavf  420
DSSP  llllllllllllllhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   39
ident                                                             
Sbjct rkcvieldiakgkfvakarflaeagwrtllgskerdeendgtplpvvakgdellcekgev  480
DSSP  eeeeeeelllllleeeleeeeeelhhhhhllllhhhllleelllllllllleeeeeeeee


DSSP  ........LLEEHHHHHHHHL.....................LLHHHHHHHHHHHHHLLL
Query ........KPLTISDIXEELK.....................ISKGNVSXSLKKLEELGF   70
ident            |                                          |   ||
Sbjct verqtqppRHFTDATLLSAMTgiarfvqdkdlkkilratdglGTEATRAGIIELLFKRGF  540
DSSP  eeeellllLLEEHHHHHHHHHlhhhhlllhhhhhhhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEELllllllLEEEELLH.........................................
Query VRKVWikgerkNYYEAVDG.........................................   89
ident   |         |    |                                          
Sbjct LTKKG......RYIHSTDAgkalfhslpematrpdmtahwesvltqisekqcryqdfmqp  594
DSSP  EEELL......LEEEELHHhhhhhhhllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  ...................hhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query ...................fssIKDIakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqki  130
ident                       |                                     
Sbjct lvgtlyqlidqakrtpvrqfrgIVAP..................................  620
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllhhhllLLLL..................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kgierxkkisekilealndld  151
ident                      
Sbjct .....................  620
DSSP  .....................


No 134: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lghllrdvwsllneeerelldkeiqpfpckkastvfsegdipnnlfylyegkikilrrfh   60
DSSP  lhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct isrivkpgqffgmrpyfaeetcsstaiavenskvlaipveaieallkgntsfcryflkal  120
DSSP  eeeeelllleelhhhhhhlllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL.............LLEEHH
Query ..XIIXEEAKKLIIELFselakihglnKSVGAVYAILYLSD.............KPLTIS   45
ident        |                      |     |                   |   
Sbjct akELGYAERRTVTLTQK..........HVRGRLAETLLILKenfgfendgatlsIYLSRE  170
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHL..........LHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllLLLLHH


DSSP  HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFSsikdiakrkhdlia  105
ident            |    |                         |                 
Sbjct ELATLSNMTVSNAIRTLSTFVSERMLALDG......KRIKIIDCDR..............  210
DSSP  HHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELLHHH..............


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                               
Sbjct ......................................lqktarsg  218
DSSP  ......................................hhhhhhhl


No 135: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHhHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKsVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                               |   ||             || ||    | 
Sbjct .................pllRRLDLN.LLLVFDALYRH...RNVGTAASELAISASAFSH   39
DSSP  .................lllLLLLLL.HHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHH...LLLEEEELllllllLEEEEL.LHHHH........................
Query SLKKLEE...LGFVRKVWikgerkNYYEAV.DGFSS........................   92
ident  |  |                   |                                   
Sbjct ALGRLRQgldDELFLRQG......NRMQPTqRAEHLaaavaaalralgegleewrpfvpg   93
DSSP  HHHHHHHhhlLLLEEEEL......LEEEELhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllll


DSSP  .......................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLL..........
Query .......................ikdiakrkhdliaktyedlkKLEEKCN..........  119
ident                                               |             
Sbjct qsqrtfvfaatdytafallpplmnrlqhsapgvrlrlvnaerkLSVEALAsgridfalgy  153
DSSP  lllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllLLHHHHHhlllleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct deeherlpegiqahdwfadryvvvarrdhprlagaptlegylaerhavvtpwnedsgvid  213
DSSP  lllllllllleeeeeeeeeleeeeeelllllllllllhhhhhlleeeeellllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct rllarsglrrevavqlptvlaalflagstdflltaprhaaralaeaaglalypapfdipp  273
DSSP  hhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeehhhhhhhhhhhleeeellllllll


DSSP  ....llLHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ....eeEKEFikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct yvlrlySHVQ..........grdahawmigqlkgld  299
DSSP  eeeeeeEELL..........llhhhhhhhhhlllll


No 136: 1ZYBA MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sdkihhhhhhxetxfdtllqlplfqglchedftsildkvklhfikhkagetiiksgnpct   60
DSSP  llllllhhhhhhhhhllhhhlhhhllllhhhhhhhhhlllleeeeelllleeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qlcfllkgeisivtnakeniytvieqieapyliepqslfgxntnyassyvahtevhtvci  120
DSSP  eeeeeeeleeeeeeelhhhlleeeeeeelleeelhhhhllllllllleeeellleeeeee


DSSP  .............................LLHHHHHhhHHHHhhhhhhhhllllHHHHHH
Query .............................XIIXEEAkkLIIElfselakihglnKSVGAV   31
ident                                                             
Sbjct skafvlsdlfrydifrlnyxnivsnraqnLYSRLWD..EPTL............DLKSKI  166
DSSP  ehhhhhhlhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLL..LLLL............LHHHHH


DSSP  HHHHHHLL.......LLEE.HHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLE
Query YAILYLSD.......KPLT.ISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNY   83
ident                       |    |     | |  |  |   |              
Sbjct IRFFLSHCekpqgekTFKVkXDDLARCLDDTRLNISKTLNELQDNGLIELHR......KE  220
DSSP  HHHHHLLLlllllleEEELlHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEL......LE


DSSP  EEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query YEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiseki  143
ident     |                                                       
Sbjct ILIPDAQK....................................................  228
DSSP  EEELLHHH....................................................


DSSP  hhhhhhll
Query lealndld  151
ident         
Sbjct ......ll  230
DSSP  ......hl


No 137: 2B0LA MOLECULE: GTP-SENSING TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD....KPLTISDIXEELKISKG   56
ident                        |  |                  |  | |     |   
Sbjct .....hhhhhhmskavvqmaiSSLSYSELEAIEHIFEELdgneGLLVASKIADRVGITRS   55
DSSP  .....lllllhhhhhhhhhhhHLLLHHHHHHHHHHLLLLllleEEELHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEeLLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEaVDGFSSIKdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident      | |||  |           |  |  |                             
Sbjct VIVNALRKLESAGVIESRSL..GMKGTYIkVLNNKFLI......................   91
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEL..LLLLEEEeELLHHHHH......................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ............................elenlks   98
DSSP  ............................hhhhlll


No 138: 2A5YB MOLECULE: APOPTOSIS REGULATOR CED-9;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mlceiecralstahtrlihdfeprdaltylegkniftedhseliskmstrlerianflri   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yrrqaselgplidffnynnqshladfledyidfainepdllrpvviapqfsrqmldrkll  120
DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lgnvpkqmtcyireyhvdrvikkldemcdldsfflflhgragsgksviasqalsksdqli  180
DSSP  hllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ginydsivwlkdsgtapkstfdlftdillmlkseddllnfpsvehvtsvvlkrmicnali  240
DSSP  llllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct drpntlfvfddvvqeetirwaqelrlrclvttrdveisnaasqtcefievtsleidecyd  300
DSSP  lllleeeeeeeellhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhlllleeeeelllllhhhhhh


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................x    1
ident                                                             
Sbjct fleaygmpmpekeedvlnktielssgnpatlmmffkscepktfekmaqlnnklesrglvg  360
DSSP  hhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHLL..lHHH
Query iixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKI..sKGN   57
ident                       |        |                            
Sbjct vecitpysykslamalqrcvEVLSDEDRSALAFAVVMPpgVDIPVKLWSCVIPVeqlDDE  420
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhHLLLHHHHHHLLHHHLLLllLLEEHHHHHHHLLLlllLHH


DSSP  HHHHHHHHHHL.LLEEEELLlllLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEEL.GFVRKVWIkgeRKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkl  114
ident |   || |                                                    
Sbjct VADRLKRLSKRgALLSGKRM...PVLTFKIDhiIHMF.............lkhvvdaqti  464
DSSP  HHHHHHHLLLLlLLLEEELL...LLLEEELLhhHHHH.............hhlllllhhh


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                      
Sbjct angisileqrlleietvirpedfpkfmqlhqkfydsl  501
DSSP  hhhhllllllllllllllllllllllllllhhhhlll


No 139: 1UFMA MOLECULE: COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                     |     |       | |       
Sbjct ..........gssgssggssildRAVIEHNLLSASKLY.NNITFEELGALLEIPAAKAEK   49
DSSP  ..........lllllllllllllHHHHHHHHHHHHHLL.LEEEHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL..LEEEELLllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SLKKLEELG..FVRKVWIkgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident         |        |                                          
Sbjct IASQMITEGrmNGFIDQI....DGIVHFETREA...........................   78
DSSP  HHHHHHHLLllLEEEELL....LLEEEELLLLL...........................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLl
Query neeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLd  151
ident                                  
Sbjct ..........................sgPSSG.   84
DSSP  ..........................llLLLL.


No 140: 1E2XA MOLECULE: FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHH..HHLL...lLEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAIL..YLSD...kPLTISDIXEELKISK   55
ident                                                      |      
Sbjct ....................qspaGFAEEYIIESIwnNRFPpgtiLPAERELSELIGVTR   40
DSSP  ....................llhhHHHHHHHHHHHhlLLLLllllLLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLHHHHHHHH...................
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFSSIKDI...................   96
ident       |  |   |                                              
Sbjct TTLREVLQRLARDGWLTIQHG.....KPTKVNNFWETSGLNiletlarldhesvpqlidn   95
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....EEEEELLHHHHLLHHhhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhlllllhhhHHHH..........................h
Query akrkhDLIAKTYEDLKKLEekcneeekefIKQK..........................i  130
ident        |                                                    
Sbjct llsvrTNISTIFIRTAFRQ......hpdkAQEVlatanevadhadafaeldynifrglaf  149
DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHH......lhhhHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhlHHHHHHHHH...............................................
Query kgieRXKKISEKI...............................................  143
ident                                                             
Sbjct asgnPIYGLILNGmkglytrigrhyfanpearslalgfyhklsalcsegahdqvyetvrr  209
DSSP  hlllHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhh


DSSP  .....hhhhhhll
Query .....lealndld  151
ident              
Sbjct yghesgeiwhrmq  222
DSSP  hhhhhhhhhhhhl


No 141: 1D8JA MOLECULE: GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.....LLLEEHHHHHHHHLL..
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.....DKPLTISDIXEELKI..   53
ident                                              |||   |  |     
Sbjct ...............alsgsSGYKFGVLAKIVNYMKTRhqrgdTHPLTLDEILDETQHld   45
DSSP  ...............lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLLLHHHHHHHHLLll


DSSP  ....LHHHHH.HHHHHHhhlLLEEEELllllllLEEEELLhHHHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query ....SKGNVS.XSLKKLeelGFVRKVWikgerkNYYEAVDgFSSIKdiakrkhdliakty  108
ident      |       |                     |                        
Sbjct iglkQKQWLMtEALVNN...PKIEVID......GKYAFKP.KYNVR..............   81
DSSP  llhhHHHHHHlLHHHHL...LLEEELL......LLEEELL.LLLLL..............


DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                            
Sbjct ...........................................   81
DSSP  ...........................................


No 142: 2OD5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHhHHHHHHHHHL..LLLEEHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSvGAVYAILYLS..DKPLTISDIXEELK......   52
ident                          |              | |     | |         
Sbjct ....................ETESXKT.VRIREKIKKFlgDRPRNTAEILEHINstxrhg   39
DSSP  ....................LLHHHHH.HHHHHHHHHHllLLLEEHHHHHHHHHllllll


DSSP  LLHHHHHHHHHHHhhlLLEEEELLLL........llLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIKG........erKNYYEAVDgfssikdiakrkhdli  104
ident          | |        ||                                      
Sbjct TTSQQLGNVLSKD...KDIVKVGYIKrsgilsggydICEWATRN................   80
DSSP  LLHHHHHHHHHHL...LLEEEEEEEEeeellleeeeEEEEEEHH................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                
Sbjct ....................................wvaehcpewte   91
DSSP  ....................................hhhhhllllll


No 143: 1W36D MOLECULE: DNA HAIRPIN;

DSSP  .........lLHHHhhHHHHHHH.HHHHHHHllLLHHHHHHHHHHHHL....LLLEEHHH
Query .........xIIXEeaKKLIIEL.FSELAKIhgLNKSVGAVYAILYLS....DKPLTISD   46
ident                             |        |    | |          |  | 
Sbjct klqkqlleavEHKQ..LRPLDVQfALTVAGD..EHPAVTLAAALLSHDagegHVCLPLSR   56
DSSP  llhhhhhhhhHLLL..LLHHHHHhHHHHLLL..LLHHHHHHHHHHHHHhhllLLEEELLL


DSSP  HHH.............hhlLLHHhHHHHHH..HHHH....lLLEEEELllllllLEEEEL
Query IXE.............elkISKGnVSXSLK..KLEE....lGFVRKVWikgerkNYYEAV   87
ident                             |                               
Sbjct LENneashpllatcvseigELQN.WEECLLasQAVSrgdepTPMILCG......DRLYLN  109
DSSP  LLLhhhhllllllllllllLLLL.HHHHHHhlLLEElllllLLEEELL......LEEEEH


DSSP  L....................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHH..........
Query D....................gfssikdiakrkhdliaktyedlKKLEEK..........  117
ident                                             |               
Sbjct RmwcnertvarffnevnhaievdeallaqtldklfpvsdeinwqKVAAAValtrrisvis  169
DSSP  HhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhllllllllllhhHHHHHHhhllleeeee


DSSP  ........llLLLHHHHHH.........................................
Query ........cnEEEKEFIKQ.........................................  128
ident                                                             
Sbjct ggpgtgktttVAKLLAALIqmadgercrirlaaptgkaaarlteslgkalrqlpltdeqk  229
DSSP  llllllhhhhHHHHHHHHHhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhhlhhhhhllllllll


DSSP  ....................hhhhhlhhhhhhhhhhhHHHHLL.................
Query ....................kikgierxkkisekileALNDLD.................  151
ident                                           |                 
Sbjct kripedastlhrllhagnplhldvlvvdeasmidlpmMSRLIDalpdharviflgdrdql  289
DSSP  llllllllllllllllllllllleeeellhhhllhhhHHHHHHlllllleeeeeellllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct asveagavlgdicayanagftaerarqlsrltgthvpagtgteaaslrdslcllqksyrf  349
DSSP  hhllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhlleeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gsdsgigqlaaainrgdktavktvfqqdftdiekrllqsgedyiamleealagygryldl  409
DSSP  lllllhhhhhhhhlllhhhhhllllhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lqaraepdliiqafneyqllcalregpfgvaglnerieqfmqqkrqpsrlpehettwamt  469
DSSP  hhllllllllhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vhksqgsefdhaalilpsqrtpvvtrelvytavtrarrrlslyaderilsaaiatrterr  529
DSSP  lllllllllleeeeellllllllllhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhhhhllllll


DSSP  .........
Query .........  151
ident          
Sbjct sglaalfss  538
DSSP  llhhhhlll


No 144: 1U5TC MOLECULE: APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;

DSSP  llhhhhhHHHH........hhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHH.HLLLLEEHHH.hhH
Query xiixeeaKKLI........ielfselakiHGLN.KSVGAVYAILY.LSDKPLTISD.ixE   49
ident          |                                                  
Sbjct .......SALPpvysfpplytrqpnsltrRQQIsTWIDIISQYCKtKKIWYMSVDGtskN   53
DSSP  .......LLLLhhhhlhhhhlllllhhhhHHHHhHHHHHHHHHHLlLLLLEELLLLlllL


DSSP  HHL.......LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL....llLLLL.EEEELLHHHhHHHHH
Query ELK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI....kgERKN.YYEAVDGFSsIKDIA   97
ident            |              |                   |             
Sbjct LFNnediqrsVSQVFIDEIWSQMTKEGKCLPIDQsgrrssNTTTtRYFILWKSLdSWASL  113
DSSP  LLLlllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLllllllLLLLlLEEELLLLHhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHH...................hh
Query KRKHDLIAKtyedlkkleekcneeekefikqkikgIERX...................kk  138
ident                                                             
Sbjct ILQWFEDSG........................klNQVItlyelsegdetvnwefhrmpe  149
DSSP  HHHHHHHHL........................llLLEElhhhhlllllllllllllllh


DSSP  hhhhhhhHHHHL................l
Query isekileALNDL................d  151
ident                              
Sbjct sllyyclKPLCDrnratmlkdendkviai  178
DSSP  hhhhhhhLLLLLlllleelllllllleel


No 145: 1BBYA MOLECULE: RAP30;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHL...LLLEEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELKISKGN   57
ident                               |   |             |     |     
Sbjct ......................RARADKQHVLDMLFSAfekHQYYNLKDLVDITKQPVVY   38
DSSP  ......................LLHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLLHHHHHHHLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHhhhllLEEEELLLLLlLLEEEELLhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKleelgFVRKVWIKGErKNYYEAVDgFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident     ||                 ||  |                                
Sbjct LKEILKE.....IGVQNVKGIH.KNTWELKP.EYRH........................   67
DSSP  HHHHHHH.....HLLLLLLLLL.LLLLLLLL.LLLL........................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct ................................yq   69
DSSP  ................................ll


No 146: 1WFXA MOLECULE: PROBABLE RNA 2'-PHOSPHOTRANSFERASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHH..........lLLLEEHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYL..........sDKPLTISDIXEE   50
ident                                  ||                   |   | 
Sbjct ........................VRLSKTLAGILRHhpgrygvrltrEGWARVSEVVEG   36
DSSP  ........................LLHHHHHHHHHHLllhhhllllllLLLEEHHHHHHH


DSSP  HL......LLHHHHHHHHHHHhHLLLEEEEllllllLLEEEELLH...............
Query LK......ISKGNVSXSLKKLeELGFVRKVwikgerKNYYEAVDG...............   89
ident |                       |                |  |               
Sbjct LRkagwswVEEWHIVGVALHD.PKGRYELR......NGEIRARYGhsipvnveplpgepp   89
DSSP  HHhlllllLLHHHHHHHHHHL.LLLLEEEE......LLEEEELLLlllllllllllllll


DSSP  .......................hhhhHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh
Query .......................fssiKDIAKRKhdliaktyedlkkleekcneeekefi  126
ident                                                             
Sbjct pilyhgtteealplixergixrgrrlkVHLTSSL......................edav  127
DSSP  leeeelllhhhhhhhhhhlllllllllEEEELLH......................hhhh


DSSP  hhhhhhHLHHhhHHHHH...................hhhhHHLL...........
Query kqkikgIERXkkISEKI...................lealNDLD...........  151
ident                                                        
Sbjct stgrrhGNLV..AVLLVdveclrrrglkverxsktvytvdWVPPeciaevrresl  180
DSSP  hhhlllLLLL..EEEEEehhhhhhllllleelllleeeelLLLHhheeeeeelll


No 147: 1RI7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |         ||           |             
Sbjct .......................LDEIDKKIIKILQND.gKAPLREISKITGLAESTIHE   36
DSSP  .......................LLHHHHHHHHHHLLL.lLLLHHHHHHHLLLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyEDLKkleekcne  120
ident    || | |   |                                      |        
Sbjct RIRKLRESGVIKKFTA..................iidpealgysmlafILVK........   70
DSSP  HHHHHHHLLLLLLLLL..................lllhhhlllleeeeEEEE........


DSSP  llHHHHHHHHHHHLHhHHHH........................................
Query eeKEFIKQKIKGIERxKKIS........................................  140
ident   |             |                                           
Sbjct .vKAGKYSEVASNLA.KYPEivevyettgdydmvvkirtknseelnnfldligsipgveg  128
DSSP  .eLLLLHHHHHHHHH.LLLLeeeeeelllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  hhhhhhhHHLL.......
Query ekilealNDLD.......  151
ident                   
Sbjct thtmivlKTHKettelpi  146
DSSP  eeeeellLLLLlllllll


No 148: 1WJ5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN (RIKEN CDNA 0610009H20);

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLL.LEEHHHHHHH..HLLL...
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDK.PLTISDIXEE..LKIS...   54
ident                                   |                  |      
Sbjct ......gssgssgnkdnldlagltSLLSEKIKEFLQEKKMqSFYQQELETVesLQSLasr   54
DSSP  ......lllllllllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHLLhhHHHHhll


DSSP  ......................HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHHH
Query ......................KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSS   92
ident                              |  | | | |            |        
Sbjct pvthstgsdqvelkdsgtsgvaQRVFKNALQLLQEKGLVFQRD..sgsDKLYYVTTKDKD  112
DSSP  lllllllllllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLEELLL..lllLLLLEELLLLLL


DSSP  hhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikdiakRKHDliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                            
Sbjct ...lqsGPSS................................................g  120
DSSP  ...lllLLLL................................................l


No 149: 2P5VA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        | |        |      ||     |    |      
Sbjct ....................qlTLDKTDIKILQVLQEN.gRLTNVELSERVALSPSPCLR   39
DSSP  ....................llLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEeeelllllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVrkvwikgerknyyeaVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident  || ||  | |                                                 
Sbjct RLKQLEDAGIV...............RQYA...........allspesvnlglqafirvs   73
DSSP  HHHHHHHLLLE...............EEEE...........eeellhhhllleeeeeeee


DSSP  llhhhhhhHHHHHLHHHHHHH.............hHHHH.....................
Query eekefikqKIKGIERXKKISE.............kILEA.....................  146
ident                 |                                           
Sbjct irkakdarEDFAASVRKWPEVlscfaltgetdyllQAFFtdxnafshfvldtllshhgvq  133
DSSP  elllllhhHHHHHHHLLLLLEeeeeeellllleeeEEEEllhhhhhhhhhhlllllllee


DSSP  ..................hhhll
Query ..................lndld  151
ident                        
Sbjct daqssfvlkeikhttslplnhll  156
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllllhhhl


No 150: 2IP2A MOLECULE: PROBABLE PHENAZINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...lHHHHHHhHHHHH.LLLLEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...nKSVGAVyAILYL.SDKPLTISDIXEELKISKG   56
ident                                        |                    
Sbjct .......nlaaarnliqvvtGEWKsrcvYVATRL.GLADLiESGIDSDETLAAAVGSDAE   52
DSSP  .......lhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhHHHHHL.LHHHHhHLLLLLHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEllllllLLEEEELLH...........................
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVwikgerKNYYEAVDG...........................   89
ident         |                  |                                
Sbjct RIHRLMRLLVAFEIFQGD.....tRDGYANTPTshllrdvegsfrdmvlfygeefhaawt  107
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEE.....lLLEEEELHHhhlllllllllhhhhhhhllhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct paceallsgtpgfelafgedfysylkrcpdagrrfllamkasnlafheiprlldfrgrsf  167
DSSP  lhhhhhhhlllhhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllee


DSSP  ..............................................hhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................................fssikdiakrkhdl  103
ident                                                             
Sbjct vdvgggsgeltkailqaepsargvmldregslgvardnlssllagervslvggdmlqevp  227
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhlhhhhhllleeeeellllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhHLLLLL..................hhhhhhhhHHHLhHHHHHHHHH.
Query iaktyedlkkleeKCNEEE..................kefikqkiKGIErXKKISEKIL.  144
ident                 |                                           
Sbjct sngdiyllsriigDLDEAAslrllgncreamagdgrvvviertisASEP.SPMSVLWDVh  286
DSSP  lllleeeeellhhHLLHHHhhhhhhhhhhhllllleeeeeellllLLLL.LHHHHHHHHh


DSSP  .....................................hhhhhll
Query .....................................ealndld  151
ident                                             
Sbjct lfmacagrhrtteevvdllgrggfaverivdlpmetrmivaara  330
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhhhhlleeeeeeeeellleeeeeeeel


No 151: 2IJLA MOLECULE: MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.....LLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG.....LNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISK   55
ident                     |       |                   ||        | 
Sbjct ..........krlplkpvlRIDFppgerLGHGKVELXQLIAET...GSISAAGRAXDXSY   47
DSSP  ..........llllleeeeEEEEllleeELHHHHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHL...LLEEEELlllllllEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEEL...GFVRKVWikgerknYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlk  112
ident          |                                                  
Sbjct RRAWLLVDALNHXfrqPVICSQR.......GAALTVF.....................ga   79
DSSP  HHHHHHHHHHHHHlllLLEEELL.......LEEELHH.....................hh


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhHHHLHHHhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqkiKGIERXKkisekilealndld  151
ident                     |                  
Sbjct elleryrgxeerxnealrEDIDWLE........anrnpq  110
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHHH........hhllll


No 152: 2HYDA MOLECULE: ABC TRANSPORTER HOMOLOG;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC..  118
ident                                                             
Sbjct .............................MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIpm   31
DSSP  .............................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhh


DSSP  ......................................lLLLHHHHHHHHHHHLHHHHHH
Query ......................................nEEEKEFIKQKIKGIERXKKIS  140
ident                                              |              
Sbjct lipllikyaidgvinnhalttdekvhhltiaigialfifVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNK   91
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLL.................................................
Query EKILEALNDLD.................................................  151
ident                                                             
Sbjct ILYDIRKKLYNhlqalsarfyannqvgqvisrvindveqtkdfiltglmniwldcitiii  151
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct alsimffldvkltlaalfifpfyiltvyvffgrlrkltrersqalaevqgflhervqgis  211
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vvksfaiedneaknfdkkntnfltralkhtrwnaysfaaintvtdigpiivigvgaylai  271
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct sgsitvgtlaafvgylellfgplrrlvasfttltqsfasmdrvfqlidedydikngvgaq  331
DSSP  hllllhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct pieikqgrididhvsfqyndneapilkdinlsiekgetvafvgmsgggkstlinliprfy  391
DSSP  lllllllleeeeeeeellllllllleeeeeeeelllleeeeellllllhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct dvtsgqilidghnikdfltgslrnqiglvqqdnilfsdtvkenillgrptatdeevveaa  451
DSSP  llleeeeeelleehhhllhhhhhhleeeellllllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct kmanahdfimnlpqgydtevgergvklsggqkqrlsiariflnnppilildeatsaldle  511
DSSP  hhlllhhhhhllllhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct sesiiqealdvlskdrttlivahrlstithadkivvienghivetgthreliakqgayeh  571
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhllllleeeeeelleeeeeelhhhhhhlllhhhh


DSSP  .......
Query .......  151
ident        
Sbjct lysiqnl  578
DSSP  hhlllll


No 153: 2HKXA MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct atqmrltdtnllevlnseeysgvlkefreqryskkailytpnternlvflvksgrvrvyl   60
DSSP  llllllllllhhhhllllllllllllleeeeelllleeellllllleeeeeeeleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ayedkeftlaileagdifcthtrafiqamedttilytdirnfqnivvefpafslnmvkvl  120
DSSP  eelleeeeeeeeellleeellllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL..............llEEH
Query ..XIIXEEAKKLIIElfselakihglnKSVGAVYAILYLSD..............kpLTI   44
ident                                     |                    |  
Sbjct gdLLKLLLTIINGLV..........fkDARLRLAEFLVQAAmdtglkvpqgiklelgLNT  170
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHH..........hlLHHHHHHHHHHHHHhhhleeelleeeeellLLH


DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhh
Query SDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdli  104
ident   |   |      ||  |      |    |             |                
Sbjct EEIALMLGTTRQTVSVLLNDFKKMGILERVN.....QRTLLLKDLQK.............  212
DSSP  HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL.....LLEEEELLHHH.............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                
Sbjct .........................................lkefss  218
DSSP  .........................................hhhhll


No 154: 1YIOA MOLECULE: RESPONSE REGULATORY PROTEIN;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct akptvfvvdddmsvreglrnllrsagfevetfdcastflehrrpeqhgclvldmrmpgms   60
DSSP  llleeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeellhhhhhhhlllllleeeeeelllllll


DSSP  .........................................................llh
Query .........................................................xii    3
ident                                                             
Sbjct gielqeqltaisdgipivfitahgdipmtvramkagaieflpkpfeeqalldaieqglql  120
DSSP  hhhhhhhhhhlllllleeeeellllllllhhhhhlleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHlllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query xeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLsdkPLTISDIXEELKISKGNVSXSLK   63
ident                     |      |          |    |  || |    |     
Sbjct naerrqaretqdqleqlfSSLTGREQQVLQLTIR...GLMNKQIAGELGIAEVTVKVHRH  177
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLHHHHHHHHHHLL...LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLleeeelllllllleeeELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllh
Query KLEELGfvrkvwikgerknyyeAVDGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeek  123
ident                        |                                    
Sbjct NIMQKL.........nvrslanLVHLVEKY..............................  198
DSSP  HHHHHL.........llllhhhHHHHHHHL..............................


DSSP  hhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query efikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                             
Sbjct ............................  198
DSSP  ............................


No 155: 2NOVA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE 4 SUBUNIT A;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....LLHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG....LNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEEL   51
ident                            |                                
Sbjct ...................ALPDirdgLKPVQRRILYSMNKDSntfdkSYRKSAKSVGNI   41
DSSP  ...................LLLLllllLLHHHHHHHHHHHHLLlllllLLEEHHHHHHHH


DSSP  L.....lLHHHHHHHHHHHHH.....lLLEEEEL.........lllllLLEEEELLH...
Query K.....iSKGNVSXSLKKLEE.....lGFVRKVW.........ikgerKNYYEAVDG...   89
ident                              |                              
Sbjct MgnfhphGDSSIYDAMVRMSQnwknreILVEMHGnngsmdgdppaamrYTEARLSEIagy  101
DSSP  HhhllllLLLLLHHHHHHLLLllllllLLEEEELllllllllllllllLLEEEELHHhhl


DSSP  ...........................................hhhhhhHHHHHHHHHH.
Query ...........................................fssikdIAKRKHDLIA.  105
ident                                                           | 
Sbjct llqdiekktvpfawnfddtekeptvlpaafpnllvngstgisgyatdipPHNLAEVIDAa  161
DSSP  llllhhhhhlleeelllllleeellllllllhhhhhleellllllleelLLLHHHHHHHh


DSSP  ..hhhHHHHhhhhhlllllhhhhhhHHHHHLHHHH.........................
Query ..ktyEDLKkleekcneeekefikqKIKGIERXKK.........................  138
ident                          ||                                 
Sbjct vymidHPTA................KIDKLMEFLPgpdfptgaiiqgrdeikkayetgkg  205
DSSP  hhhhhLLLL................LHHHHLLLLLlllllllleellhhhhhhhhhhlee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  138
ident                                                             
Sbjct rvvvrskteieklkggkeqiviteipyeinkanlvkkiddvrvnnkvaevrdelriaida  265
DSSP  elleeleeeeeellllleeeeeeellllllhhhhhhhllhhhhllllllleellleelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  138
ident                                                             
Sbjct ntelvlnylfkytdlqinynfnmvaidnftprqvgivpilssyiahrrevilarsrfdke  325
DSSP  llllhhhhhhhlllleelleeeleeeelleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  138
ident                                                             
Sbjct kaekrlhiveglirvisildevialirasenkadakenlkvydfteeqaeaivtlqlyrl  385
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllllhhhhhlllllllllhhhhhhhhlllhhhh


DSSP  ..................................hhhhHHHHHHHL........l
Query ..................................isekILEALNDL........d  151
ident                                        |               
Sbjct tntdvvvlqeeeaelrekiamlaaiigdertmynlmkkELREVKKKfatprlssl  440
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHHHHHhllllllll


No 156: 1RP3A MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA);

DSSP  ......................LLHH..................................
Query ......................XIIX..................................    4
ident                                                             
Sbjct hmknpysnqiereelilkylplVKAIatnikkhlpedvdirdlisygviglikavdnlst   60
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    4
ident                                                             
Sbjct enpkraeayiklrikgaiydylrsldfgsrqvrekerrikevveklkeklgreptdeeva  120
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh


DSSP  ..............................................hhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................................eeakkliielfsel   18
ident                                                             
Sbjct kelgisteelfktldkinfsyilsleevfrdfardyselipsstnveeevikreltekvk  180
DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhLLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLleeeellll
Query akiHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikg   78
ident      |      |          |        |  |   ||    |  |           
Sbjct eavSKLPEREKLVIQLIFYE..ELPAKEVAKILETSVSRVSQLKAKALERL.........  229
DSSP  hhhLLLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.........


DSSP  lllleeeellhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhh
Query erknyyeavdgfsSIKDiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkk  138
ident                                                             
Sbjct ...........reMLSN...........................................  235
DSSP  ...........hhHHHL...........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhll
Query isekilealndld  151
ident              
Sbjct .............  235
DSSP  .............


No 157: 1QZZA MOLECULE: ACLACINOMYCIN-10-HYDROXYLASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHhHHHHHH..HHHHLLL..lEEHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKsVGAVYA..ILYLSDK..pLTISDIXEELKISKG   56
ident                               | |   |         |             
Sbjct .....leptdqdldvllknlGNLVTPmALRVAAtlRLVDHLLagaDTLAGLADRTDTHPQ   55
DSSP  .....llllhhhhhhhhhllLLLHHHhHHHHHHhlLHHHHHHlllLLHHHHHHHHLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEllllllLLEEEELLHH..........................
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVwikgerKNYYEAVDGF..........................   90
ident   |     |   |                                               
Sbjct ALSRLVRHLTVVGVLEGG....ekGRPLRPTRLGmlladghpaqqrawldlngavshadl  111
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEELL....llLLLLEELLLHhhhlllllllhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  ...........................hhhhhhhhhhhhhhhHHHH.hHHHHHHHLLLL.
Query ...........................ssikdiakrkhdliaKTYE.dLKKLEEKCNEE.  121
ident                                              |              
Sbjct aftglldvvrtgrpayagrygrpfwedlsadvaladsfdalmSCDEdlAYEAPADAYDWs  171
DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhllHHHLllLLHHHHHLLLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  121
ident                                                             
Sbjct avrhvldvgggnggmlaaialraphlrgtlvelagpaerarrrfadagladrvtvaegdf  231
DSSP  llleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelll


DSSP  .....lhhhhhHHHHH........................hlhhhhhHHHHHHH......
Query .....ekefikQKIKG........................ierxkkiSEKILEA......  146
ident                                                             
Sbjct fkplpvtadvvLLSFVllnwsdedaltilrgcvralepggrllvldrADRFFSTlldlrm  291
DSSP  llllllleeeeEEELLhhhllhhhhhhhhhhhhhheeeeeeeeeeelLHHHHHHhhhhhh


DSSP  ............................................hhhll
Query ............................................lndld  151
ident                                                  
Sbjct ltfmggrvrtrdevvdlagsaglalasertsgsttlpfdfsileftavs  340
DSSP  hhhhllllllhhhhhhhhhllleeeeeeeeelllllllleeeeeeeell


No 158: 1DVEA MOLECULE: HEME OXYGENASE-1;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLlhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ...sqdlsealkeatkevhIRAEN...................................s   22
DSSP  ...lllhhhhhhhhhhhhhHHHHL...................................l


DSSP  hhhHHHHllleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query slkKLEElgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNe  120
ident                                  |              |           
Sbjct efmRNFQ.................kgqvSREGFKLVMASLYHIYTALEEEIERNKQNPV.   64
DSSP  hhhHHHH.................llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.


DSSP  llHHHHHhHHHHHLhHHHHHHHHHHHHHH...............................
Query eeKEFIKqKIKGIErXKKISEKILEALND...............................  149
ident                     |                                       
Sbjct ..YAPLY.FPEELH.RRAALEQDMAFWYGphwqeaipytpatqhyvkrlhevggthpell  120
DSSP  ..LHHHL.LLLLLL.LHHHHHHHHHHHHLllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  149
ident                                                             
Sbjct vahaytrylgdlsggqvlkkiaqkamalpssgeglafftfpsidnptkfkqlyrarmntl  180
DSSP  hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ................................ll
Query ................................ld  151
ident                                   
Sbjct emtpevkhrvteeaktafllnielfeelqallte  214
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 159: 1A04A MOLECULE: NITRATE/NITRITE RESPONSE REGULATOR PROTEIN NARL;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct epatilliddhpmlrtgvkqlismapditvvgeasngeqgielaesldpdlilldlnmpg   60
DSSP  lleeeeeelllhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mngletldklrekslsgrivvfsvsnheedvvtalkrgadgyllkdmepedllkalhqaa  120
DSSP  llhhhhhhhhhhllllleeeeeellllhhhhhhhhhlllleeeellllhhhhhhhhhhhh


DSSP  .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query .xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                         |                 |    |   | |    | 
Sbjct agemvlsealtpvlaaslerdvNQLTPRERDILKLIAQG...LPNKMIARRLDITESTVK  177
DSSP  hlllllllllhhhhhhhllllhHHLLHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLleeeelllllllleeeELLH.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query XSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeAVDG.FSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident    |                      |                                 
Sbjct VHVKHMLKKM.........klksrveAAVWvHQER.........................  203
DSSP  HHHHHHHHHH.........llllhhhHHHHhHHHL.........................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct ...............................if  205
DSSP  ...............................ll


No 160: 2H6BA MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct veglgkdfcgaiipdnffpieklrnytqmglirdfakgsavimpgeeitsmiflvegkik   60
DSSP  lllleeeelleeeellllllhhhhhlhhhleeeeelllleeelllllllleeeeeellee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ldiifedgsekllyyaggnsligklyptgnniyatameptrtcwfsekslrtvfrtdedm  120
DSSP  eeeellllleeeeeeelllleelllllllleeeeeellleeeeeelhhhhhhhhhhllhh


DSSP  .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhHHHHHHHHHHLL..............LLEEHH
Query .xiixeeakkliielfselakihGLNKsVGAVYAILYLSD..............KPLTIS   45
ident                          |          |                  ||   
Sbjct ifeifknyltkvayyarqvaemnTYNP.TIRILRLFYELCssqgkrvgdtyeitMPLSQK  179
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllEELL.LHHHHHHHHHHHhhhleeelleeeeeLLLLHH


DSSP  HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllllEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDGFSsikdiakrkhdlia  105
ident  | |        ||  |  |       |                                
Sbjct SIGEITGVHHVTVSRVLACLKRENILDKKKN......KIIVYNLGE..............  219
DSSP  HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......EEEELLHHH..............


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                               
Sbjct ..........................lkhlseqtsvdklaaaldhh  239
DSSP  ..........................hhhhhlllleehhhhhhlll


No 161: 2BS2C MOLECULE: QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHH.HHHHlllleehhhhhhhhlllhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYA.ILYLsdkpltisdixeelkiskgnvs   59
ident                                                             
Sbjct ........................MTNESILESySGVT......................   14
DSSP  ........................LLHHHHHHHhHLLL......................


DSSP  hhhhhhhhllleeeelllllllleEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.
Query xslkkleelgfvrkvwikgerknyYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC.  118
ident                                                             
Sbjct ......................peRKKSRMPAKLDWWQSATGLFLGLFMIGHMFFVSTIl   52
DSSP  ......................llLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  .lLLLHHH.HHHH.............hhhhLHHHHHHHHHHHHHHHLL............
Query .nEEEKEF.IKQK.............ikgiERXKKISEKILEALNDLD............  151
ident           |                                |                
Sbjct lgDNVMLWvTKKFeldfifeggkpivvsflAAFVFAVFIAHAFLAMRKfpinyrqyltfk  112
DSSP  llHHHHHHhHHHLlllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct thkdlmrhgdttlwwiqamtgfamfflgsvhlyimmtqpqtigpvsssfrmvsewmwply  172
DSSP  hhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lvllfavelhgsvglyrlavkwgwfdgetpdktranlkklktlmsaflivlglltfgayv  232
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................
Query ......................  151
ident                       
Sbjct kkgleqtdpnidykyfdykrth  254
DSSP  hhhlllllllllllllllllll


No 162: 1O57A MOLECULE: PUR OPERON REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL.lLLEEhHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS.dKPLTiSDIXEELKISKGNVS   59
ident                                   |              |     |   |
Sbjct ....................kfrrSGRLVDLTNYLLTHphELIPlTFFSERYESAKSSIS   40
DSSP  ....................lllhHHHHHHHHHHHHLLllLLLLhHHHHHHLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLL...leeeellllllllEEEEllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query XSLKKLEELG...fvrkvwikgerknYYEAvdgfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident   |                                                         
Sbjct EDLTIIKQTFeqqgigtlltvpgaagGVKY..............................   70
DSSP  HHHHHHHHHHhhllleeeeeelllllEEEE..............................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhHHHHHHHHLL.........................
Query kcneeekefikqkikgierxkkiseKILEALNDLD.........................  151
ident                             |                               
Sbjct ...................ipkmkqAEAEEFVQTLgqslanperilpggyvyltdilgkp  111
DSSP  ...................eelllhHHHHHHHHHHhhhhllhhheellleellllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct svlskvgklfasvfaereidvvmtvatkgiplayaaasylnvpvvivrkdgstvsinyvs  171
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhllleeeellllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gssnriqtmslakrsmktgsnvliiddfmkaggtingminlldefnanvagigvlveaeg  231
DSSP  llllleeeeeeehhhllllleeeeeeeeelllhhhhhhhhhlhhhlleeeeeeeeeeell


DSSP  .......................................
Query .......................................  151
ident                                        
Sbjct vderlvdeymslltlstinmkeksieiqngnflrffkdn  270
DSSP  llllllllleeeeeeellllllllleeeellhhhhllll


No 163: 1FSEA MOLECULE: GERE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        | |    |   |       |   |  || ||   |  
Sbjct ...................skpLLTKREREVFELLVQD...KTTKEIASELFISEKTVRN   38
DSSP  ...................lllLLLHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLleeeelllllllleeeELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeAVDGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcne  120
ident                           |                                 
Sbjct HISNAMQKL........gvkgrsqaVVELLRMG...........................   63
DSSP  HHHHHHHHH........llllhhhhHHHHHHLL...........................


DSSP  llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                
Sbjct ...........................elel   67
DSSP  ...........................llll


No 164: 2FEZA MOLECULE: PROBABLE REGULATORY PROTEIN EMBR;

DSSP  llhhhhHHHHHHhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHL.LLLEEHHHHHHHHL......l
Query xiixeeAKKLIIelfselakihgLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK......i   53
ident                              || | |      |         |        
Sbjct ..rldfGLLGPLqmtidgtpvpsGTPKQRAVLAMLVINrNRPVGVDALITALWeewppsg   58
DSSP  ..leeeELLLLLeeeelleelllLLHHHHHHHHHHHHLlLLEELHHHHHHHHHlllllll


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLL.........lEEEELllllllLEEEELL................
Query SKGNVSXSLKKLEELG.........fVRKVWikgerkNYYEAVD................   88
ident            |  |                        |                    
Sbjct ARASIHSYVSNLRKLLggagidprvvLAAAP......PGYRLSIpdntcdlgrfvaekta  112
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhEEEEL......LEEEELLlhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHH
Query ...................................gfssikdiakrkhdliaktYEDLKK  113
ident                                                             
Sbjct gvhaaaagrfeqasrhlsaalrewrgpvlddlrdfqfvepfatalvedkvlahtAKAEAE  172
DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHH


DSSP  H.HHHL..........................LLLL........................
Query L.EEKC..........................NEEE........................  122
ident                                                             
Sbjct IaCGRAsaviaelealtfehpyreplwtqlitAYYLsdrqsdalgayrrvkttladdlgi  232
DSSP  HhLLLHhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhHHHHlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .................hhHHHHHHHHHL...............................
Query .................keFIKQKIKGIE...............................  134
ident                      |   |                                  
Sbjct dpgptlralnerilrqqplDAKKSAKTTAagtvtvldqrtmasgqqavaylhdiasgrgy  292
DSSP  lllhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllllleeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  134
ident                                                             
Sbjct plqaaatrigrlhdndivldsanvsrhhavivdtgtnyvindlrssngvhvqherirsav  352
DSSP  elllleeeeelllllleelllllllllleeeeelllleeeeellllllleelleelllee


DSSP  ....hhhhhhhhhhhhhhhll
Query ....rxkkisekilealndld  151
ident                      
Sbjct tlndgdhiricdheftfqisa  373
DSSP  ellllleeeelleeeeeelll


No 165: 1T98A MOLECULE: CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL......LLEE..HHHHHHHHL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD......KPLT..ISDIXEELK   52
ident                        |                             |      
Sbjct .......vpelvawarkndfsISLPVDRLSFLLAVATLNgerldgEXSEgeLVDAFRHVS   53
DSSP  .......llhhhhhhhhhlllEEELHHHHHHHHHHHHHHhlllllLLLHhhHHHHHHHHH


DSSP  ........lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELlllllllEEEELLH..............h
Query ........iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknYYEAVDG..............f   90
ident                                        |                    
Sbjct dafeqtsetIGVRANNAINDXVRQRLLNRFT.......IYRLTPLgigitdyyirqrefs  106
DSSP  hhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHLLEEELL.......LEEELHHhhhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhhhlllllhhhHHHHHHHH.LHHHHH.HHHHHHHHH
Query ssikdiakrkhdliaktyeDLKKLeekcneeekefIKQKIKGI.ERXKKI.SEKILEALN  148
ident                    |                               |        
Sbjct tlrlsxqlsivagelkraaDAAEE..........gGDEFHWHRnVYAPLKySVAEIFDSI  156
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHL..........lLLHHHHHHhLHHHHHhLHHHHHHHH


DSSP  HLL.........................................................
Query DLD.........................................................  151
ident ||                                                          
Sbjct DLTqrlxdeqqqqvkddiaqllnkdwraaisscelllsetsgtlrelqdtleaagdklqa  216
DSSP  HHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..................................................
Query ..................................................  151
ident                                                   
Sbjct nllriqdatxthddlhfvdrlvfdlqskldriiswgqqsidlwigydrhv  266
DSSP  hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 166: 1O7DC MOLECULE: LYSOSOMAL ALPHA-MANNOSIDASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH..HHHHHhhl
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiAKRKHDLIAKTYED..LKKLEekc  118
ident                                                             
Sbjct ...................................gDSAPLNEAMAVLQHhdAVSGT...   22
DSSP  ...................................lLLHHHHHHHHHLLLllLLLLL...


DSSP  llllhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL...........................
Query neeekefIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD...........................  151
ident                 |         | |                               
Sbjct ......sRQHVANDYARQLSEGWRPCEVLMSNAlahlsglkedfafcrklnisicpltqt   76
DSSP  ......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllleellllhhhlllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aerfqvivynplgrkvdwmvrlpvskhvylvkdpggkivpsdvvtipssdsqellfsalv  136
DSSP  lleeeeeeeellllleeeeeeeeelllleeeellllleelleeeeelllleeeeeeeeee


DSSP  ..............
Query ..............  151
ident               
Sbjct pavgfsiysvsqmp  150
DSSP  llleeeeeeeeell


No 167: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHL....LLLEEHHHHHHHHLL
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVGAVYAILYLS....DKPLTISDIXEELKI   53
ident                                                  |   |   | |
Sbjct .................dgtVKVSrslKEMGNKIRKAKDELsktrGRAPTVTEIADHLGI   43
DSSP  .................lllLLLHhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHllleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEElgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkk  113
ident |   |                                                       
Sbjct SPEDVVLAQEAVRL..............................................   57
DSSP  LHHHHHHHHHHHHL..............................................


DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                       
Sbjct ......................................   57
DSSP  ......................................


No 168: 1S6LA MOLECULE: ALKYLMERCURY LYASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhHHHHHHhHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvGAVYAIlYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                         |         |      |  
Sbjct ........................adllVPLLRE.LAKGRPVSRTTLAGILDWPAERVAA   35
DSSP  ........................llllLHHHHH.HHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHhHHLLleEEELlllllLLEEEELLHH..............................
Query SLKKlEELGfvRKVWikgerKNYYEAVDGF..............................   90
ident  |                                                          
Sbjct VLEQ.ATST..EYDK.....DGNIIGYGLTlretsyvfeiddrrlyawcaldtlifpali   87
DSSP  HHLL.LLLL..LEEL.....LLEELLLLLLllllleeeeelleeeeelllllllllhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHHHhhHHHHhhHHHH.
Query ssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgIERXKkiSEKIleALND.  149
ident                                                             
Sbjct grtarvsshcaatgapvsltvspseiqavepagmavslvlpqEAADV.rQSFC..CHVHf  144
DSSP  llleeeeeelllllleeeeeelllleeeeelllleeeellllLLLLL.lLLLL..LLLEe


DSSP  ..............................................ll
Query ..............................................ld  151
ident                                                 
Sbjct fasvptaedwaskhqgleglaivsvheafglgqefnrhllqtmssrtp  192
DSSP  ellhhhhhhhhhlllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


No 169: 2HGCA MOLECULE: YJCQ PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLLLLeehhHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSDKPltisDIXEELKISKGNVSX   60
ident                          |   |          |                   
Sbjct .........................KLRYAILKEIFEGNTP....LSENDIGVTEDQFDD   31
DSSP  .........................LLHHHHHHHHHHHLLL....LLHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEE.EELLlllLLLE....eeELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEELGFVR.KVWIkgeRKNY....yeAVDGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident     |   |                                                   
Sbjct AVNFLKREGYIIgVHYS...DDRPhlyklgPELTEKGE......................   66
DSSP  HHHHHHHHLLEElLEEL...LLLEelllllLEELHHHH......................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ........................nylkengtwska   78
DSSP  ........................hhhhhhllllll


No 170: 2H7OA MOLECULE: PROTEIN KINASE YPKA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfssIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEekcne  120
ident                                 |     |       |             
Sbjct ...............................rITPKKLRELSDLLRTHLSSAATK.....   24
DSSP  ...............................lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....


DSSP  llhhhhhhHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHL..............................
Query eekefikqKIKGIERXKKISEKILEALNDL..............................  150
ident            |           |                                    
Sbjct ......qlDMGGVLSDLDTMLVALDKAEREvdkdqlksfnslilktyrviedyvkgnfml   78
DSSP  ......llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct sivepslqriqkhldqthsfsdigslvrahkhletllevlvtlsqpvssetygflnrlae  138
DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct akitlsqqlntlqqqqesakaqlsilinrsgswadvarqslqrfdstrpvvkfgteqyta  198
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct ihrqmmaahaaitlqevseftddmrnftvdsiplliqlgrsslmdehlveqreklreltt  258
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........l
Query ...........d  151
ident             
Sbjct iaerlnrlerew  270
DSSP  hhhhhhhhhhhl


No 171: 2G7HA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE

DSSP  ....................................................llhhhhhh
Query ....................................................xiixeeak    8
ident                                                             
Sbjct miiqieeyfigmifkgnqlvrntiplrreeifnfmdgevvsnpedehlkvaeiilklyfa   60
DSSP  leeeelleeeeeeelllleeeeelllllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhHLLLL.hHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query kliielfselakIHGLN.kSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKL   65
ident                        |  |       | ||  ||   |  |   |   ||  
Sbjct eiddkkvrelisYKLEVpeFTKKVLDIVKDIEfgKTLTYGDIAKKLNTSPRAVGMALKRN  120
DSSP  llllllllllllLLLLLllLLHHHHHHHLLLLllLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHLL


DSSP  hHLLLE.eeellllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query eELGFV.rkvwikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeeke  124
ident                                                             
Sbjct pLPLIIpchrvvakNSLG..........................................  138
DSSP  lLLLLLhhhheellLLLL..........................................


DSSP  hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHLL.....
Query fikqkikgierxkkisekilealNDLD.....  151
ident                                 
Sbjct ...gysygldkkkfilererlnmVSFKfnkvy  167
DSSP  ...llllllhhhhhhhhhhhlllLLLLlllll


No 172: 2O8XA MOLECULE: PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHH.HHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAI.LYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVS   59
ident                        |             |    |   |         |   
Sbjct ........mgfedlvevttmiADLTTDQREALLLtQLLG...LSYADAAAVCGCPVGTIR   49
DSSP  ........llhhhhhhhhlllLLLLHHHHHHHHHhHLLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident                                                             
Sbjct SRVARARDAL..................................................   59
DSSP  HHHHHHHHHH..................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct ..............................la   61
DSSP  ..............................hl


No 173: 2AXLA MOLECULE: WERNER SYNDROME;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK........   52
ident                                            |      |         
Sbjct .............mddsedtSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRgsnsqrla   47
DSSP  .............lllllllEEELHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlllllhhh


DSSP  ..............lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllLLLLEEEELL.HHHH.....
Query ..............iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVD.GFSS.....   92
ident                           |   ||   |               |        
Sbjct dqyrrhslfgtgkdqTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRynKFMKICALTKkGRNWlhkan  107
DSSP  hhllllllllhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELHhHHHHhhhll


DSSP  ....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLlhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query ....ikdiakrkhdliaktyedlkkleEKCNEEekefikqkikgierxkkisekilealn  148
ident                                 |                           
Sbjct tesqslilqaneelcpkklllpssktvSSGTKE..........................h  141
DSSP  lllllleeellllllllllllllllllLLLLLL..........................l


DSSP  hll
Query dld  151
ident    
Sbjct cyn  144
DSSP  lll


No 174: 1S29A MOLECULE: LA PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHH................hlLLLEE
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILY................lsDKPLT   43
ident                           |    |                            
Sbjct ..............gshxplSSENkQKLQKQVEFYFSdvnvqrdiflkgkxaenaEGFVS   46
DSSP  ..............llllllLHHHhHHHHHHHHHHLLhhhhlllhhhhhhhllllLLLEE


DSSP  HHHHHHH.....hlLLHHHHHHHHHHHhhlLLEEEELLlllllLEEEELLHHHhhhhhhh
Query ISDIXEE.....lkISKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFSsikdiak   98
ident                    |                             |          
Sbjct LETLLTFkrvnsvtTDVKEVVEAIRPS...EKLVLSED....gLXVRRRDPLP.......   92
DSSP  HHHHLLLhhhhlllLLHHHHHHHHLLL...LLEEELLL....lLEEEELLLLL.......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query rkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                      
Sbjct .....................................................   92
DSSP  .....................................................


No 175: 1R71A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;

DSSP  llhhhhHHHHhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeAKKLiielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                   |          ||  |   |      
Sbjct ......EADQ..vienlqrnelTPREIADFIGRELAKG...KKKGDIAKEIGKSPAFITQ   49
DSSP  ......LLHH..hhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHH....llleeeelllllllleeeellhhhhhhhHHHHHHHhHHHHhhhhhhhhh
Query SLKKLEE....lgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdIAKRKHDlIAKTyedlkklee  116
ident     |                                        |              
Sbjct HVTLLDLpekiadafntgrvrdvtvvnelvtafkkrpeeVEAWLDD.DTQE.........   99
DSSP  HHHHHLLlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHL.LLLL.........


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ....................itrgtvkllreflde  114
DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhl


No 176: 1EH6A MOLECULE: O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;

DSSP  ........................................................llhh
Query ........................................................xiix    4
ident                                                             
Sbjct cemkrttldsplgklelsgceqglheikllgevpapaavlggpeplmqctawlnayfhqp   60
DSSP  llleeeeelllllleeeeeelleeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhHHHHLlllHHHHHHHHHHHHL...lLLEEHHHHHHHHLL..LHHHHH
Query eeakkliielfseLAKIHglnKSVGAVYAILYLS...dKPLTISDIXEELKI..SKGNVS   59
ident                           |   |                           | 
Sbjct eaieefpvpalhhPVFQQ..eSFTRQVLWKLLKVvkfgEVISYQQLAALAGNpkAARAVG  118
DSSP  hhhhhllllllllHHHHL..lLHHHHHHHHHHHHllllLLEEHHHHHHHLLLllLHHHHH


DSSP  HHHHHHhHLLL..EEEE.llllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query XSLKKLeELGF..VRKV.wikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkklee  116
ident                                                             
Sbjct GAMRGN.PVPIliPCHRvvcssGAVG..................................  143
DSSP  HHLLLL.LLLLllLHHHeelllLLLL..................................


DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                    
Sbjct ..........nysgglavkewllaheghrlgkpgl  168
DSSP  ..........lllllhhhhhhhhhhllllllllll


No 177: 2GMGA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PF0610;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHH....llLHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEEL....kiSKG   56
ident                       |           |         |     |      || 
Sbjct ...............ahhhhhhGSATRREKIIELLLEG..DYSPSELARILdmrgkgSKK   43
DSSP  ...............lllllllLHHHHHHHHHHHLLLL..LLLLLHHHHLLllllllLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLL....leEEELLLL.........................llLLEEEEL
Query NVSXSLKKLEELG....fvRKVWIKG.........................erKNYYEAV   87
ident      ||                                                     
Sbjct VILEDLKVISKIAkregmvLLIKPAQcrkcgfvfkaeinipsrcpkcksewieEPRFKLE  103
DSSP  HHHHHHHHHHHHHlllleeEEELLLLlllllllllllllllllllllllllllLLLEEEE


DSSP  Lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhh
Query Dgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileal  147
ident                                                             
Sbjct R...........................................................  104
DSSP  E...........................................................


DSSP  hhll
Query ndld  151
ident     
Sbjct ...k  105
DSSP  ...l


No 178: 1X3UA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN FIXJ;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |      |          |    |   | ||   |  
Sbjct .....gshmddandiraRLQT..LSERERQVLSAVVAG...LPNKSIAYDLDISPRTVEV   50
DSSP  .....lllllllhhhhhHHHH..HLHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHH...LLLEEeelllllllleeeELLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEE...LGFVRkvwikgerknyyeAVDGFSSikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident                                                             
Sbjct HRANVMAkmkAKSLP...........hlVRMALAG.........................   74
DSSP  HHHHHHHhllLLLHH...........hhHHHHHHH.........................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct .............................gfgps   79
DSSP  .............................lllll


No 179: 1WLQC MOLECULE: GEMININ;

DSSP  ...llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLL.HHHHHHHHHHHHLL...LLEEHHHHHHHHLL
Query ...xiixeeakkliielfselakIHGLN.KSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKI   53
ident                                      |           |          
Sbjct kapayqrfhalaqpglpglvlpyKYQVLvEXFHSXDTIVSXLHnrsETVTFAKVKQGVQE   60
DSSP  lllhhhhlhhhhllllllllllhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  ..lhHHHHHHHHHHHHLL..LEEEELLL...........LLLLLEEEELL..........
Query ..skGNVSXSLKKLEELG..FVRKVWIK...........GERKNYYEAVD..........   88
ident                       |                       |             
Sbjct xxrkRFEERNVGQIKTVYpxSYRFRQECnvptfkdsikrSDYQLTIEPLLgqegatqlta  120
DSSP  hhllLLLHHHHHHHHHHLllLEEEEEEEllllllllllhHHEEEEEEELLlllllllllh


DSSP  ......hhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhHHHHhH
Query ......gfssikdiakrKHDLIAKTYEDLKKleekcneeekefikqkikgierxKKISeK  142
ident                             |                               
Sbjct tcllqrrqvfrqnlverVKEQHKVFLASLNP.....................pxAVPD.D  158
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLL.....................llLLLL.L


DSSP  HHH..................hhhhll
Query ILE..................alndld  151
ident  |                         
Sbjct QLTrwhprfnvdevpdiepaelpqppv  185
DSSP  LLLlllllllhhhllllllllllllll


No 180: 1FC3A MOLECULE: SPO0A;

DSSP  lLHHHHHHHHHHHHH...hHHHHhllllHHHHHHHHHHHHLL..........llEEHHHH
Query xIIXEEAKKLIIELF...sELAKihglnKSVGAVYAILYLSD..........kpLTISDI   47
ident           |          |                                    ||
Sbjct .NKPKNLDASITSIIheigVPAH.....IKGYLYLREAIAMVyhdiellgsitkVLYPDI   54
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLL.....LHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhhlllLHHHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHL.........................LLEEeellllllll
Query XEELKISKGNVSXSLKKLEEL.........................GFVRkvwikgerkn   82
ident           |        |                                        
Sbjct AKKYNTTASRVERAIRHAIEVawsrgnlesisslfgytvsvskakpTNSE..........  104
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhlhhhhllllllLHHH..........


DSSP  eeeELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query yyeAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek  142
ident                                                             
Sbjct ..fIAMV....................................................a  110
DSSP  ..hHHHH....................................................h


DSSP  hhhhhhhll
Query ilealndld  151
ident          
Sbjct dklrlehka  119
DSSP  hhhhhllll


No 181: 2P8TA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH0730;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHhllLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYlsdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                            | ||   |     ||    | | |    | |  
Sbjct .....................eyTVEDVLAVIFLLK...EPLGRKQISERLELGEGSVRT   36
DSSP  .....................llLHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLEEEEllllllllEEEELLH...............................
Query SLKKLEELGFVRKVwikgerknYYEAVDG...............................   89
ident  | ||  |   |                                                
Sbjct LLRKLSHLDIIRSK........GHFLTLKgkeirdkllsmfsepigvsvdgypgiaivvk   88
DSSP  HHHHHHHLLLEEEL........LEEELHHhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeeeel


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhHHHHH.........hhhhlhHHHH.
Query fssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekeFIKQK.........ikgierXKKI.  139
ident                                                             
Sbjct nppefksielrdeaikfdakgamiltvkdneivfpEDFRPlkemypevakkivdyEDGDa  148
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelleeellLLLLLhhhllhhhhhhllllLLLLe


DSSP  ........................hhhhhhhhhhll
Query ........................sekilealndld  151
ident                                     
Sbjct viitwaetpakalksaihvayilkkeeitpeilevv  184
DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhlll


No 182: 2HQRA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mrvllieknsvlggeiekglnvkgfmadvtesledgeylmdirnydlvmvsdknalsfvs   60
DSSP  lleeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhhh


DSSP  .......................................................lLHHH
Query .......................................................xIIXE    5
ident                                                             
Sbjct rikekhssivvlvssdnptseeevhafeqgaddyiakpyrsikalvariearlrfwGSNV  120
DSSP  hhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeellllllhhhhhhhhhhllllLLLL


DSSP  .......hHHHHH.....hhhhhHHHHhllllhhHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHL
Query .......eAKKLI.....ielfsELAKihglnksVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK   52
ident                           |          |   |                  
Sbjct ieigdltiSPDEEkiiykgreveVKGK.......PFEVLTHLARHRdQIVSKEQLLDAIW  173
DSSP  eeelleeeELLLLeeeelleeelLLLL.......LLHHHHHHHHLLlEEEEHHHHHHHHL


DSSP  .....LLHHHHHHHHHHHHHLLL......eEEELLlllLLLEEEellhhhhhhhhhhhhh
Query .....ISKGNVSXSLKKLEELGF......vRKVWIkgeRKNYYEavdgfssikdiakrkh  101
ident                                       |  |                  
Sbjct eepemVTPNVIEVAINQIRQKMDkplgistVETVR...RRGYRF................  214
DSSP  lllllLHHHLHHHHHHHHHHHHHlllllllEEELL...LLEEEE................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLl
Query dliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLd  151
ident                                                   
Sbjct ........................................cypkpACEE.  223
DSSP  ........................................lllhhHLLL.


No 183: 1RZ4A MOLECULE: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct amfeqxranvgkllkgidrynpenlatleryvetqakenaydleanlavlklyqfnpaff   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlhhhl


DSSP  ...........................................LLHHHHHHH........
Query ...........................................XIIXEEAKK........    9
ident                                                 |           
Sbjct qttvtaqillkaltnlphtdftlckcxidqahqeerpirqilyLGDLLETCHfqafwqal  120
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllhhhhllllhhhhhhHHHHHHLLLhhhhhhhl


DSSP  hhhhhhhhhhhhllLLHHhHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHL.LLHHHHHHHHHHHHhl
Query liielfselakihgLNKSvGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK.ISKGNVSXSLKKLEel   68
ident                                        | |   |         |    
Sbjct denxdllegitgfeDSVRkFICHVVGITY.QHIDRWLLAEXLGdLSDSQLKVWXSKYG..  177
DSSP  llllhhhhllllhhHHHHhHHHHHHHHHL.LEELHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHHHL..


DSSP  llEEEELlllllllEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh
Query gfVRKVWikgerknYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikq  128
ident                                                             
Sbjct ..WSADE.......QIFICSQEE.............................sikpkniv  199
DSSP  ..LEELL.......LEELLLHHH.............................hlllllll


DSSP  hhhhHLHHHHHHHhhhhhhhhll
Query kikgIERXKKISEkilealndld  151
ident           |            
Sbjct ekidFDSVSSIXA.........s  213
DSSP  llllHHHHHHHHL.........l


No 184: 1OTVA MOLECULE: COENZYME PQQ SYNTHESIS PROTEIN C;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct .......................................litdtlspqafeealrakgdf   21
DSSP  .......................................lllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhHHHHLLLeeeelllllllleeeELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.L
Query slkKLEELGFvrkvwikgerknyyeAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC.N  119
ident                                 |                        |  
Sbjct yhiHHPYHIA............mhnGDATRKQIQGWVANRFYYQTTIPLKDAAIMANCpD   69
DSSP  lhhHLHHHHH............hhhLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHL......HHHHHHHHHHHHHH.........................
Query EEEKEFIKQKIKGIE......RXKKISEKILEALN.........................  148
ident         | |                    ||                           
Sbjct AQTRRKWVQRILDHDgshgedGGIEAWLRLGEAVGlsrddllserhvlpgvrfavdayln  129
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHllllllLHHHHHHHHHHHLLllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  148
ident                                                             
Sbjct farracwqeaacssltelfapqihqsrldswpqhypwikeegyfyfrsrlsqanrdvehg  189
DSSP  hhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  148
ident                                                             
Sbjct lalakaycdsaekqnrmleilqfkldilwsmldamtmayalqrppyhtvtdkaawhttrl  249
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll


DSSP  ..hll
Query ..dld  151
ident      
Sbjct vlehh  254
DSSP  lllll


No 185: 1J1JA MOLECULE: TRANSLIN;

DSSP  .........................llhhhhhhhhhhhhHHHHHhHLLLlhhhhhhhhhh
Query .........................xiixeeakkliielFSELAkIHGLnksvgavyail   35
ident                                               |             
Sbjct msvseifvelqgflaaeqdireeirkvvqsleqtareilTLLQG.VHQG...........   48
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHH.HHLL...........


DSSP  hhlllleehhhhhhhhlllhhhhhhhhhHHHH............................
Query ylsdkpltisdixeelkiskgnvsxslkKLEE............................   67
ident                                                             
Sbjct .........................agfQDIPkrclkarehfgtvkthltslktkfpaeq   83
DSSP  .........................lllLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  .......................................................lllee
Query .......................................................lgfvr   72
ident                                                             
Sbjct yyrfhehwrfvlqrlvflaafvvyletetlvtreavteilgiepdrekgfhldvedylsg  143
DSSP  hhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhh


DSSP  eelllllllleeeellhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLlllHHHHHHHHHH
Query kvwikgerknyyeavdgFSSIkDIAKRKHDLIAKTYEDLKKleEKCNeeeKEFIKQKIKG  132
ident                                |                           |
Sbjct vlilaselsrlsvnsvtAGDY.SRPLHISTFINELDSGFRL..LNLK...NDSLRKRYDG  197
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL...LHHHHHHHLL


DSSP  HLHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query IERXKKISEKILEALNDLD.  151
ident      |  |     |     
Sbjct LKYDVKKVEEVVYDLSIRGf  217
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLl


No 186: 2BKNA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEekcne  120
ident                                 |    |    |                 
Sbjct ..........................pkSVKEIFIEMKDTVELMVDLAYASLLFG.....   29
DSSP  ..........................llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....


DSSP  llhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD.............................  151
ident       |                   |                                 
Sbjct .....DKEIAEEVLELEERIDLLNYQLMMHSvlaarnvkeaeqvitilqianaiedisna   84
DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct agdlakmvlegvelhpviketilegeeiigkiqvypesvivgktlgeldlatntgvwiia  144
DSSP  hhhhhhhhhlllllllhhhhhhhlllleeeeeelllllllllllhhhhlhhhhhlleeee


DSSP  ..............................................
Query ..............................................  151
ident                                               
Sbjct vrrgkrwifgpnenfkiragdvligrgtrtsidhlkeiargairvi  190
DSSP  eeelleeeelllllllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhllllll


No 187: 1K78A MOLECULE: PAIRED BOX PROTEIN PAX5;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                              ||   |  | | || 
Sbjct ........gvnqlggvfvngrplPDVVRQRIVELAHQG...VRPCDISRQLRVSHGCVSK   49
DSSP  ........lllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLeeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHL.L
Query SLKKLEELGFvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhDLIAKTYEDLKKLEEKC.N  119
ident  |    | |                                                   
Sbjct ILGRYYETGS.......................ikpgviggSKPKVATPKVVEKIAEYkR   86
DSSP  HHHHHHHHLL.......................llllllllLLLLLLLHHHHHHHHHHhH


DSSP  LLL...........................hhhhHHHHhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query EEE...........................kefiKQKIkgierxkkisekilealndld  151
ident                                                            
Sbjct QNPtmfaweirdrllaervcdndtvpsvssinriIRTK.....................  124
DSSP  HLLlllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhHHLL.....................


No 188: 1B9MA MOLECULE: PROTEIN (MODE);

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL......LLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLL
Query xiixeeakkliielfselaKIHG......LNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKIS   54
ident                                           ||     ||       ||
Sbjct ............hxqaeilLTLKlqqklfADPRRISLLKHIALS...GSISQGAKDAGIS   45
DSSP  ............lllleeeEEEEelleeeELHHHHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHH...LLLEEEELllllllLEEEELLH.....hhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEE...LGFVRKVWikgerkNYYEAVDG.....fssikdiakrkhdliak  106
ident                    |                                        
Sbjct YKSAWDAINEXNQlseHILVERAT......GGAVLTRYgqrliqlydllaqiqqkafdvl   99
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhlLLLEEELL......LLEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhHHHHhhhhhlllllhhhhhhhHHHHLHHHHHHH.........................
Query tyEDLKkleekcneeekefikqkIKGIERXKKISE.........................  141
ident    |                             |                          
Sbjct sdDDAL...............plNSLLAAISRFSLqtsarnqwfgtitardhddvqqhvd  144
DSSP  hhLLLL...............llLLHHHHHHHHLEeellleeeeeeelllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct vlladgktrlkvaitaqsgarlgldegkevlillkapwvgitqdeavaqnadnqlpgiis  204
DSSP  eeellllleeeeellhhhhhhllllllleeeeeelhhhleeellhhhhhllleeeeeeee


DSSP  ............................................hhhhhhhhll
Query ............................................kilealndld  151
ident                                                       
Sbjct hiergaeqcevlxalpdgqtlcatvpvneatslqqgqnvtayfnadsviiatlc  258
DSSP  eeeellleeeeeeellllleeeeeeehhhhllllllleeeeeelhhhleeeeel


No 189: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLL.....lEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSDK.....pLTISDIXEELKISK   55
ident                          |                    ||   | |      
Sbjct ...................XRADALKRREHIITTTCNLYRthhhdsLTXENIAEQAGVGV   41
DSSP  ...................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllhhhLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHhhhhlLLEEeelllllllleeeELLH.HHHHH...hhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeAVDG.FSSIK...diakrkhdliaktyedl  111
ident                                    |                        
Sbjct ATLYRNFP..drfTLDX............aCAQYlFNVVIslqlqaistfptdpegvwts   87
DSSP  HHHHHHLL..lhhHHHH............hHHHHhHHHHHhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL....................
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD....................  151
ident                                                             
Sbjct fnqllfdrglgslvpalapeslddlpdevsalrrtTEKNTttlinlakqhglvhhdiapg  147
DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhllllhhhllhhhhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  .........................................
Query .........................................  151
ident                                          
Sbjct tyivglitisrppitalatisenshkallglylsglkhgxx  188
DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 190: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi   60
DSSP  llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ..LLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL.LLHHH
Query ..XIIXeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN   57
ident                                                 |       |   
Sbjct epYRLP.........eviqkcnarwtTEEQLLAVQAIRKY..GRDFQAISDVIGnKSVVQ  109
DSSP  hhHLLL.........lllllllllllHHHHHHHHHHHHHH..LLLHHHHHHHHLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEeelllllllleeeELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRkvwikgerknyyeAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek  117
ident |                                                           
Sbjct VKNFFVNYRRRFNID............eVLQE............................  129
DSSP  HHHHHHHLLLLLLHH............hHHHH............................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                   
Sbjct ..............................weae  133
DSSP  ..............................hhll


No 191: 2GA1A MOLECULE: PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION DUF433;

DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLL.....HHHHHHHHHH
Query ....................xiixeeakkliielfselaKIHGLN.....KSVGAVYAIL   35
ident                                                     |    |  
Sbjct xnkktqlleviaalpeelvdqalnyvqxlqnpiqitpgvCGGQARirntrIPVWTLVAYR   60
DSSP  llhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllHHHLLEellllLLHHHHHHHH


DSSP  HHLlllEEHHHHHHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhh
Query YLSdkpLTISDIXEELK.ISKGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssik   94
ident                         |      |                            
Sbjct QQG...APDKELLANYPgLTAEDLSAAWHYYEQNP.........................   92
DSSP  HLL...LLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHHHHHLH.........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query diakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                          
Sbjct ................................................eqidreiaq  101
DSSP  ................................................hhhhhhhll


No 192: 1ZELA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RV2827C;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLL.LEEHHHHHHHHL.....LL
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDK.PLTISDIXEELK.....IS   54
ident                               |   |        |  |    |        
Sbjct ...........amvvspagadrriPTWASRVVSGLARDRPvVVTKEDLTQRLTeagcgRD   49
DSSP  ...........leeelllllllllLHHHHHHHHHHHHHLLlLEEHHHHHHHHHhllllLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHhlllEEEELLllLLLLEEEELlHHHH......................
Query KGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIkgERKNYYEAVdGFSS......................   92
ident        |                                                    
Sbjct PDSAIRELRRIG....WLVQLP..VKGTWAFIP.PGEAaisdpylplrswlardqnagfm  102
DSSP  HHHHHHHHHHHL....LEEELL..LLLEEEELL.LLLLeeelllhhhhhhhhhlllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   92
ident                                                             
Sbjct lagasaawhlgyldrqpdgripiwlppakrlpdglasyvsvvripwnaadtallaprpal  162
DSSP  elhhhhhhhhlllllllllleeeellllllllhhhllleeeellllllllhhhhlllhhh


DSSP  ........................hhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHLLLL.......
Query ........................ikdiakrkhdliaktYEDLKKLEEKCNEE.......  121
ident                                                             
Sbjct lvrrrldlvawatglpalgpeallvqiatrpasfgpwadLVPHLDDLVADCSDerlerll  222
DSSP  hhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhlllhhhHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhh


DSSP  .........lhHHHHH................................hhhhhlhhhhhh
Query .........ekEFIKQ................................kikgierxkkis  140
ident                                                             
Sbjct sgrptsawqraSYLLDsggepargqallakrhtevmpvtrfttahsgesvwapeyqlvde  282
DSSP  llllhhhhhhhHHHHHhlllhhhhhhhhlllllllllleeelllllllleeehhhleeel


DSSP  hhhhhhhhhll
Query ekilealndld  151
ident            
Sbjct lvvpllrvigk  293
DSSP  lhhhhhhhhhl


No 193: 1Q16C MOLECULE: RESPIRATORY NITRATE REDUCTASE 1 ALPHA CHAIN;

DSSP  .................................llhhhhhhhhhhhHHHHHHHHLL....
Query .................................xiixeeakkliieLFSELAKIHG....   23
ident                                                             
Sbjct xqflnmfffdiypyiagavfligswlrydygqytwraassqmldrkGMNLASNLFHigil   60
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllllllllllLHHHHHHHHHhhhh


DSSP  .....llhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhHLLLEEEELlll
Query .....lnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsxslkkleELGFVRKVWikg   78
ident                                                             
Sbjct gifvghffgmltphwmeawlpievkqkmamfaggasgvlcliggvlllKRRLFSPRV...  117
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLHHH...


DSSP  lllleeEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL................lll
Query erknyyEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCN................eee  122
ident           |                                                 
Sbjct .....rATTTGADILILSLLVIQCALGLLTIPFSAQHMDGSemmklvgwaqsvvtfhgga  172
DSSP  .....hHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhhhhhhhhlllllh


DSSP  hhhhHHHHhHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL........................
Query kefiKQKIkGIERXKKISEKILEALNDLD........................  151
ident           | |        |  |                            
Sbjct sqhlDGVA.FIFRLHLVLGMTLFLLFPFSrlihiwsvpveyltrkyqlvrarh  224
DSSP  hhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhllhhhhhllleeeelll


No 194: 2PFTA MOLECULE: EXOCYTOSIS PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYedlkkleekcne  120
ident                                            |                
Sbjct ............................DHVISYYHVASDTEKIIREG............   20
DSSP  ............................LLLLLHHHHHHHHHHHHHHL............


DSSP  llhhhhhhHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefikqKIKGIERXKKISEKILEALNDLD.............................  151
ident                                                             
Sbjct ......ptGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNspdspelnkvkllfergkeslesefrslm   74
DSSP  ......llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct trhskvvspvllldlisaddelehlpesvlrdvvrisrwlveygrnqdfmnvyyqirssq  134
DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ldrsikglkehfrksldvetdayihcvsafvklaqseyrllmeiipehhqkktfdsliqd  194
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aldglmlegenivsaarkaiirhdfstvltvfpilrhlkqtkpefdqvlqgtaastknkl  254
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhlhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct pglitsmetigakaledfadnikndpdkeynmpkdgtvheltsnailflqqlldfqetag  314
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct amlasqessefskrllstyickvlgnlqlnllskskvyedpalsaiflhnnynyilksle  374
DSSP  hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct kseliqlvavtqktaersyrehieqqiqtyqrswlkvtdyiaeknlpvfqpgvklrdker  434
DSSP  lllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct qmikerfkgfndgleelckiqkvwaipdteqrdkirqaqkdivketygaflhrygsvpft  494
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  .........................
Query .........................  151
ident                          
Sbjct knpekyikyrveqvgdmidrlfdts  519
DSSP  llhhhhllllhhhhhhhhhllllll


No 195: 2FQ3A MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhHHHH.hLLLL.............hhhHHHHHHHHHL.....lLL
Query xiixeeakkliielfsELAK.iHGLN.............ksvGAVYAILYLS.....dKP   41
ident                                                    |        
Sbjct .........skwfnleKIHSieVQSLpefftnripsktpevyMRYRNFMVNSyrlnpnEY   51
DSSP  .........lllllllLLLHhhHHHLhhhlllllllllhhhhHHHHHHHHHHhhhlllLL


DSSP  EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllleeeellhhhhhhhhhhhhh
Query LTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknyyeavdgfssikdiakrkh  101
ident                      | |   |                                
Sbjct FSVTTARRNVSGDAAALFRLHKFLTKWGLINYQV..........................   85
DSSP  LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL..........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                   
Sbjct ..................................................   85
DSSP  ..................................................


No 196: 1PP8F MOLECULE: 39 KDA INITIATOR BINDING PROTEIN;

DSSP  .........llhHHHHHHHHHHHhhHHHHHllllhhhhhHHHHHHHLL............
Query .........xiiXEEAKKLIIELfsELAKIhglnksvgaVYAILYLSD............   39
ident                                            |                
Sbjct dsndleasftsrLPPEIVAALKR..KSSRD.....pnsrFPRKLHMLLtylasnpqleee   53
DSSP  lllhhhhhhhhlLLHHHHHHHHL..LLLLL.....llllHHHHHHHHHhhhlllhhhhhh


DSSP  ..........lLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHhlllEEEELLllLLLLEEeeLLH
Query ..........kPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIkgERKNYYeaVDG   89
ident                        |        |  |                       |
Sbjct iglswisdtefKMKKKNVALVMGIKLNTLNVNLRDLA....FEQLQHdkGGWTQW.kRSG  108
DSSP  hleeellllleEELHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLL....LEELLLllLLLEEE.eLLL


DSSP  Hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query Fssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealnd  149
ident |                                                           
Sbjct F.........................................................tr  111
DSSP  L.........................................................ll


DSSP  ll
Query ld  151
ident   
Sbjct ns  113
DSSP  ll


No 197: 1P4WA MOLECULE: RCSB;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                        |      |               |   |  |    | 
Sbjct .ytpesvakllekisaggygDKRLSPKESEVLRLFAEG...FLVTEIAKKLNRSIKTISS   56
DSSP  .llllhhhhhhhhhhlllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLleeeelllllllleeeELLH.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeAVDG.FSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcn  119
ident   |                            |                            
Sbjct QKKSAMMKL.........gvdndiaLLNYlSSVS..........................   81
DSSP  HHHHHHHHH.........llllhhhHHHHhHHHL..........................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                 
Sbjct ..........................mtpvdk   87
DSSP  ..........................llllll


No 198: 1OMIA MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk   60
DSSP  lhhhhhhhhlllllleellllleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee


DSSP  ......................................................LLHHHH
Query ......................................................XIIXEE    6
ident                                                             
Sbjct gafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqTLQKQV  120
DSSP  lleeeellllllllllllleeeellllleeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhllllHHHHHHHHHHHHLLL................leEHHHhhhh
Query AKKLIIELFSELAkihglnKSVGAVYAILYLSDK................plTISDixee   50
ident    |                  |     |                               
Sbjct SYSLAKFNDFSIN......GKLGSICGQLLILTYvygketpdgikitldnltMQEL....  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHH......HHHHHHHHHHHHHHHhheeeelleeeellllllHHHL....


DSSP  hlllhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllllEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lkiskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyed  110
ident        ||    ||                                             
Sbjct .....SAVSRIISKLKQEKVIVYKNS......CFYVQNLD....................  199
DSSP  .....LHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......LEEELLHH....................


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                          
Sbjct ................ylkryapkldewfylacpatwgkln  224
DSSP  ................hhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll


No 199: 1KQ8A MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 3 FORKHEAD HOMOLOG 1;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHL.......
Query xiixeeakkliielfselakihglnkSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK.......   52
ident                                      |    ||   | | |        
Sbjct ..........................YIALITMAIRDSAgGRLTLAEINEYLMgkfpffr   34
DSSP  ..........................LHHHHHHHHLLLLlLLLLHHHHHHHHHhhlllhh


DSSP  ..lLHHHhHHHHHHHHHLLLEEEE.LLLLLL...LLEEEellhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..iSKGNvSXSLKKLEELGFVRKV.WIKGER...KNYYEavdgfssikdiakrkhdliak  106
ident               |       ||           ||                       
Sbjct gsyTGWR.NSVRHNLSLNDCFVKVlRDPSRPwgkDNYWM.....................   72
DSSP  hllLLLH.HHHHHHHHHHLLLEELlLLLLLLlllLLLEE.....................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                              
Sbjct ..........................................lnp   75
DSSP  ..........................................lll


No 200: 1JKUA MOLECULE: PSEUDOCATALASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeelLHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavDGFSSIKD...IAKRKHDLIAKTYEDLKkleek  117
ident                                                             
Sbjct .....mfkhtrklqynakpdrsdpimaRRLQESLGgqwGETTGMMSYLSQGWAST.....   50
DSSP  .....leeellllllllllllllhhhhHHHHHHHHlllLHHHHHHHHHHHHHHLL.....


DSSP  lllllhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL..........................
Query cneeekefIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD..........................  151
ident                            |                                
Sbjct .......gAEKYKDLLLDTGTEEMAHVEMISTMIgylledapfgpedlkrdpslattmag  103
DSSP  .......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct mdpehslvhglnaslnnpngaawnagyvtssgnlvadmrfnvvresearlqvsrlysmte  163
DSSP  llhhhhhlllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct degvrdmlkfllaretqhqlqfmkaqeeleekygiivpgdmkeiehsefshvlmnfsdgd  223
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhlleeellllll


DSSP  ...........................................
Query ...........................................  151
ident                                            
Sbjct gskafegqvakdgekftyqenpeamggiphikpgdprlhnhqg  266
DSSP  hhhhhllllllllllleeellllllllllllllllhhhlllll


No 201: 1FSHA MOLECULE: DISHEVELLED-1;

DSSP  llhhhhhhHHHHhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHH.....HLLL..........LEEHH
Query xiixeeakKLIIelfselakihgLNKSVGAVYAILY.....LSDK..........PLTIS   45
ident                               |                             
Sbjct ........EAPL.........tvKSDMSAIVRVMQLpdsglEIRDrmwlkitianAVIGA   43
DSSP  ........LLLL.........llLLLHHHHHHHHHLlllllLLLLeeelleeellLLHHH


DSSP  HHHHHHL..........lLHHHHHHHHHHHhhlllEEEEL...lllllLLEEEELlhhhh
Query DIXEELK..........iSKGNVSXSLKKLeelgfVRKVW...ikgerKNYYEAVdgfss   92
ident |    |                 |  ||        |             |         
Sbjct DVVDWLYthvegfkerreARKYASSMLKHG....fLRHTVnkitfseqCYYVFGD.....   94
DSSP  HHHHHHHhhllllllhhhHHHHHHHHHHLL....lEELLLllllllllLLLEELL.....


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                            
Sbjct ...........................................................   94
DSSP  ...........................................................


No 202: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHH.LLLL....EEHHHHHHHHLLL
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKIS   54
ident                                          |      |  || |     
Sbjct ....................TKEEaQETRAQIIEAAERaFYKRgvarTTLADIAELAGVT   40
DSSP  ....................LHHHhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHHHHHhhhhlLLEEeelllllllleeeELLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeAVDGFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkl  114
ident  |              |                |                          
Sbjct RGAIYWHFN..nkaELVQ............aLLDSLHETH....................   66
DSSP  HHHHHHHLL..lhhHHHH............hHHHHLLHHH....................


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHHHHL........................
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilEALNDL........................  150
ident                                                             
Sbjct .............................dHLARASesedevdplgcmrklllqvfnelv   97
DSSP  .............................hHHHHHHhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct ldartrrineilhhkceftddmceirqqrqsavldchkgitlalanavrrgqlpgeldae  157
DSSP  hlhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh


DSSP  ................................................l
Query ................................................d  151
ident                                                  
Sbjct raavamfayvdglirrwlllpdsvdllgdvekwvdtgldmlrlspalrk  206
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlhhhll


No 203: 2OWOA MOLECULE: 26-MER;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfsSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEkcne  120
ident                                                 | |         
Sbjct ..............................mESIEQQLTELRTTLRHHEYLYHVMD....   26
DSSP  ..............................lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....


DSSP  llhhhhhhHHHHhlHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefikqKIKGieRXKKISEKILEALNDLD.............................  151
ident          |             |  |                                 
Sbjct ......apEIPD..AEYDRLMRELRELETKHpelitpdsptqrvgaaplaafsqirhevp   78
DSSP  ......llLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllhhhllllllllllleeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct mlsldnvfdeesflafnkrvqdrlknnekvtwccelkldglavsilyengvlvsaatrgd  138
DSSP  lllleeellhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeelleeeeeeeelleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gttgeditsnvrtiraiplklhgeniparlevrgevflpqagfekinedarrtggkvfan  198
DSSP  lleeellhhhhhlllllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct prnaaagslrqldpritakrpltffcygvgvleggelpdthlgrllqfkkwglpvsdrvt  258
DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhhlllleeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhlllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lcesaeevlafyhkveedrptlgfdidgvvikvnslaqqeqlgfvaraprwavafkfpaq  318
DSSP  eellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellhhhhhhhllllllllleeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct eqmtfvrdvefqvgrtgaitpvarlepvhvagvlvsnatlhnadeierlglrigdkvvir  378
DSSP  eeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeelleeeeeeelllhhhhhhhlllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ragdvipqvvnvvlserpedtrevvfpthcpvcgsdvervegeavarctgglicgaqrke  438
DSSP  eellleeeeeeelhhhlllllllllllllllllllleeelllllleeellhhhlhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct slkhfvsrramdvdgmgdkiidqlvekeyvhtpadlfkltagkltglermgpksaqnvvn  498
DSSP  hhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhllllllhhhhhlllhhhhhllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct alekakettfarflyalgirevgeataaglaayfgtlealeaasieelqkvpdvgivvas  558
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhlllhhhhlllllllhhhhh


DSSP  ............................
Query ............................  151
ident                             
Sbjct hvhnffaeesnrnvisellaegvhwpap  586
DSSP  hhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 204: 2EWFA MOLECULE: NICKING ENDONUCLEASE N.BSPD6I;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHhHHHHHHHHHHLLLLEE........HHHHHHHHL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKsVGAVYAILYLSDKPLT........ISDIXEELK   52
ident                          |        |                      || 
Sbjct ........makkvnwyvscspRSPEK.IQPELKVLANFEGSYWkgvkgykaQEAFAKELA   51
DSSP  ........lllllllllllllLLHHH.HHHHHHHHHHHLLLLLlllllhhhHHHHHHHHH


DSSP  .....llhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlllllLEEEELLH..................
Query .....iskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDG..................   89
ident                      |||           |                        
Sbjct alpqflgaFSTRDRVAPMKTYGFVFVDEE.....GYLRITEAgkmlannrrpkdvflkql  106
DSSP  llhhhlllLLHHHHHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELHHhhhhhllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct vkwqypsfqhkgkeypeeewsinplvfvlsllkkvgglskldiamfcltatnnnqvdeia  166
DSSP  hhlllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct eeimqfrnerekikgqnkkleftenyffkrfekiygnvshkskietkmrnardvadattr  226
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............................................HHHHhHHHHhhhhh
Query ..............................................FSSIkDIAKrkhdl  103
ident                                                             
Sbjct yfrytglfvargnqlvlnpeksdlideiissskvvknytrveefheYYGN.PSLP.....  280
DSSP  hhhhllleeeelleeeelhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhHHLL.LLLL.....


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHH....................
Query iaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiSEKI....................  143
ident                                                             
Sbjct ...................................qFSFEtkeqlldlahrirdentrla  305
DSSP  ...................................lLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..........................hhhhHHLL..........................
Query ..........................lealNDLD..........................  151
ident                                 |                           
Sbjct eqlvehfpnvkveiqvlediynslnkkvdvETLKdviyhakelqlelkkkklqadfndpr  365
DSSP  hhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct qleevidllevyhekknvieekikarfiankntvfewltwngfiilgnaleyknnfvide  425
DSSP  hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct elqpvthaagnqpdmeiiyedfivlgevttskgatqfkmesepvtrhylnkkkelekqgv  485
DSSP  llleeelllllllleeeellleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ekelyclfiapeinkntfeefmkynivqntriiplslkqfnmllmvqkkliekgrrlssy  545
DSSP  lleeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllhh


DSSP  ..........................................
Query ..........................................  151
ident                                           
Sbjct diknlmvslyrttiecerkytqikagleetlnnwvvdkevrf  587
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


No 205: 2DOAA MOLECULE: RNA POLYMERASE II ELONGATION FACTOR ELL;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL..LLHH.H
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK..ISKG.N   57
ident                               |   | |   |         |         
Sbjct ..............gssgssgvsqrPFRDRVLHLLALR..PYRKAELLLRLQkdGLTQaD   44
DSSP  ..............lllllllllllLHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHHHhhLLLHhH


DSSP  HHHHHHHHHHllLEEEELLllllLLEEEELLH........................hHHH
Query VSXSLKKLEElgFVRKVWIkgerKNYYEAVDG........................fSSI   93
ident        |                      |                             
Sbjct KDALDGLLQQ..VANMSAK....DGTCTLQDCmykdvqkdwpgysegdqqllkrvlvRKL   98
DSSP  HHHHHHHHHH..LLEELLL....LLEEELLLLhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhHHL


DSSP  HhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL
Query KdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD  151
ident                                                           
Sbjct S....................................................GPSSG  104
DSSP  L....................................................LLLLL


No 206: 2BDPA MOLECULE: PROTEIN (DNA POLYMERASE I);

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aamaftladrvteemladkaalvvevveenyhdapivgiavvnehgrfflrpetaladpq   60
DSSP  llllleelllllhhhhlleeeeeeelllllllllllleeeeeelleeeeelhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fvawlgdetkkksmfdskraavalkwkgielcgvsfdlllaaylldpaqgvddvraaakm  120
DSSP  hhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhlllllllleeeehhhhhhhhlhhhllllhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kqyeavrpdeavygkgakravpdepvlaehlvrkaaaiwelerpfldelrrneqdrllve  180
DSSP  llllllllhhhhhllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct leqplssilaemefagvkvdtkrleqmgkelaeqlgtveqriyelagqefninspkqlgv  240
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhleeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ilfeklqlpvlkktktgystsadvleklapyheivenilhyrqlgklqstyiegllkvvr  300
DSSP  hhhllllllllleelleelllhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhll


DSSP  ..............................LLHH..........................
Query ..............................XIIX..........................    4
ident                                |                            
Sbjct pdtkkvhtifnqaltqtgrlsstepnlqniPIRLeegrkirqafvpsesdwlifaadysq  360
DSSP  lllleelleeellllllllleeelllllllLLLLhhhhhhhhheellllleeeeeeeell


DSSP  ..............hhhhhhhhhHHHHHHHhLLLL............hHHHHHHHHHHHL
Query ..............eeakkliieLFSELAKiHGLN............kSVGAVYAILYLS   38
ident                                                    ||       
Sbjct ielrvlahiaeddnlmeafrrdlDIHTKTA.MDIFqvsedevtpnmrrQAKAVNFGIVYG  419
DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllLHHHHHH.HHHLlllhhhllhhhhhHHHHHHHHHHHL


DSSP  llleEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLL.leEEEL......................
Query dkplTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELG.fvRKVW......................   75
ident             | ||            |                               
Sbjct ...iSDYGLAQNLNISRKEAAEFIERYFESFpgvKRYMenivqeakqkgyvttllhrrry  476
DSSP  ...lLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHhhhhhhhhhhleeellllleee


DSSP  .....lLLLL........................lleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .....iKGER........................knyyeavdgfssikdiakrkhdliak  106
ident                                                             
Sbjct lpditsRNFNvrsfaermamntpiqgsaadiikkamidlnarlkeerlqahlllqvhdel  536
DSSP  lhhhhlLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllee


DSSP  hhhhHHHHhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHHhHHLL...............
Query tyedLKKLeekcneeekefikqkikgierxkkisEKILEAlNDLD...............  151
ident      |                                |                     
Sbjct ileaPKEE..................merlcrlvPEVMEQ.AVTLrvplkvdyhygstwy  577
DSSP  eeeeEHHH..................hhhhhhhhHHHHHH.LLLLllllleeeeeellll


DSSP  ...
Query ...  151
ident    
Sbjct dak  580
DSSP  lll


No 207: 1V3FA MOLECULE: PLECKSTRIN 2;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHhHHHHHHHHH....HLLL............LEEH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKsVGAVYAILY....LSDK............PLTI   44
ident                       |                                     
Sbjct ...................gSSGSSG.LHRIVDKMHdtstGIRPspnmeqgstykkTFLG   40
DSSP  ...................lLLLLLH.HHHHHHHHLllllLLLLllllllllllllLEEH


DSSP  HHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL...............llllLLEE
Query SDIXEELK.....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI...............kgerKNYY   84
ident |     |       |          | |  | | |                        |
Sbjct SSLVDWLIssnfaASRLEAVTLASMLMEENFLRPVGVrsmgairsgdlaeqflddsTALY  100
DSSP  HHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEELLLlllllllllllllllllllLLEE


DSSP  EELLHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query EAVDGfsSIKDiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekil  144
ident          |                                                  
Sbjct TFAES..YKKK.................................................  109
DSSP  EELLL..LLLL.................................................


DSSP  hhHHHLL......
Query eaLNDLD......  151
ident              
Sbjct ..VSSKEsgpssg  120
DSSP  ..LLLLLllllll


No 208: 1U78A MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                     |                |      
Sbjct .................prgsalSDTERAQLDVMKLLN...VSLHEMSRKISRSRHCIRV   40
DSSP  .................llllllLHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLlleeeelllllllleeeellhhhhhhHHHHhhHHHHhhhHHHHHHHHHHL..
Query SLKKLEELgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikDIAKrkHDLIaktYEDLKKLEEKC..  118
ident  ||                                                         
Sbjct YLKDPVSY........................gtSKRA..PRRK.alSVRDERNVIRAas   73
DSSP  HHHLHHHL........................llLLLL..LLLL.llLHHHHHHHHHHhh


DSSP  ....lLLLH.HHHHHHHHhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ....nEEEK.EFIKQKIKgierxkkisekilealndld  151
ident                                       
Sbjct nscktARDIrNELQLSAS........krtilnvikrsg  103
DSSP  hllllHHHHhHHLLLLLL........hhhhhhhhhhll


No 209: 1D8YA MOLECULE: DNA POLYMERASE I;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct misydnyvtildeetlkawiaklekapvfafatatdsldnisanlvglsfaiepgvaayi   60
DSSP  llllllleelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllllleeeeeeeeelleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pvahdyldapdqisreralellkplledekalkvgqnlkydrgilanygielrgiafdtm  120
DSSP  elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeellhhhhhhhhhlllllllleeeehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lesyilnsvagrhdmdslaerwlkhktitfeeiagkgknqltfnqialeeagryaaedad  180
DSSP  hhhhhhllllllllhhhhhhhhhllllllhhhhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vtlqlhlkmwpdlqkhkgplnvfeniemplvpvlsrierngvkidpkvlhnhseeltlrl  240
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aelekkaheiageefnlsstkqlqtilfekqgikplkktpstseevleelaldyplpkvi  300
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhllllhhhhhh


DSSP  ....................................................LLHH....
Query ....................................................XIIX....    4
ident                                                             
Sbjct leyrglaklkstytdklplminpktgrvhtsyhqavtatgrlsstdpnlqniPVRNeegr  360
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllllleeellllllllleeelllhhhlLLLLhhhh


DSSP  ...................................hhhhhhhhhHHHHHHHhLLLL....
Query ...................................eeakkliieLFSELAKiHGLN....   25
ident                                                             
Sbjct rirqafiapedyvivsadysqielrimahlsrdkglltafaegkDIHRATA.AEVFglpl  419
DSSP  hhhlllllllleeeeeeeellhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllLHHHHHH.HHHLlllh


DSSP  ........hHHHHHHHHHHHLlllEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLEEeell
Query ........kSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEE.LGFVRkvwi   76
ident          |  |    |               | |             |    |     
Sbjct etvtseqrrSAKAINFGLIYG...MSAFGLARQLNIPRKEAQKYMDLYFErYPGVL....  472
DSSP  hhllhhhhhHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhLHHHH....


DSSP  lllllleeeeLLHHH.............................................
Query kgerknyyeaVDGFS.............................................   91
ident                                                             
Sbjct ..........EYMERtraqakeqgyvetldgrrlylpdikssngarraaaeraainapmq  522
DSSP  ..........HHHHHhhhhhhhhleeellllleeelhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH...........hllLLLHHHHHHHHHhhlhhhhhh
Query sikdiakrkhdliaktyedlkKLEE...........kcnEEEKEFIKQKIKgierxkkis  140
ident                                                 |           
Sbjct gtaadiikramiavdawlqaeQPRVrmimqvhdelvfevHKDDVDAVAKQIhqlmenctr  582
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLEeeeeeelleeeeeeELLLHHHHHHHHhhhhhhlll


DSSP  HHHH........hhhhhll
Query EKIL........ealndld  151
ident                    
Sbjct LDVPllvevgsgenwdqah  601
DSSP  LLLLlleeeeeellhhhhl


No 210: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;

DSSP  llhhhhhhhhhhhHHHHHHhhlllLHHHHHHHHHHHHLLLL...EEHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliieLFSELAkihglNKSVGAVYAILYLSDKP...LTISDIXEELKISKGN   57
ident                           |                  |   |      |   
Sbjct ...xatgglaiiqSXXHXL.....PPSERKLADYILAHPHXaieSTVNEISALANSSDAA   52
DSSP  ...llllhhhhhhHHHHHL.....LHHHHHHHHHHHHLHHHhhlLLHHHHHHHLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHH..lllEEEElllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEE..lgfVRKVwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle  115
ident |      |                                                    
Sbjct VIRLCXSLGLkgfqdLXXR.........................................   71
DSSP  HHHHHHHLLLllhhhHHHH.........................................


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ........................vagdlakptfqg   83
DSSP  ........................hhhhhhlhhhll


No 211: 2CWLA MOLECULE: MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeellllllllEEEEL..LHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
Query slkkleelgfvrkvwikgerknYYEAV..DGFSSIKD...IAKRKHDLIAKTYEDLKkle  115
ident                                                             
Sbjct ......mflridrlqielpmpkEQDPNaaAAVQALLGgrfGEMSTLMNYMYQSFNFR...   51
DSSP  ......leeellllllllllllLLLHHhhHHHHHHLLlllLHHHHHHHHHHHHHHLL...


DSSP  hhlllllhHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHL.........................
Query ekcneeekEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDL.........................  150
ident            |     |           |                              
Sbjct ......gkKALKPYYDLIANIATEELGHIELVAATinsllaknpgkdleegvdpesaplg  105
DSSP  ......llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllllllllllllhhhlllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct fakdvrnaahfiagganslvmgamgehwngeyvftsgnlildllhnfflevaarthklrv  165
DSSP  hhhlllllhhhhlllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct yemtdnpvaremigyllvrggvhaaaygkalesltgvemtkmlpipkidnskipeakkym  225
DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllllhhhlhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct dlgfhrnlyrfspedyrdlgliwkgaspedgtevvvvdgpptggpvfdaghdaaefapef  285
DSSP  hllllleeeellllllllhhhllllllllllllleeeellllllllllllllhhhlllll


DSSP  .............l
Query .............d  151
ident               
Sbjct hpgelyeiakklye  299
DSSP  llhhhhhhhhhhll


No 212: 1XMEA MOLECULE: CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE I;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhHHLLLeeeelllllllleeeelLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query slkklEELGFvrkvwikgerknyyeavDGFSsIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCN.  119
ident       |                          |        |                 
Sbjct .....SEISR...............vyEAYP.EKKATLYFLVLGFLALIVGSLFGPFQAl   39
DSSP  .....LLLLH...............hhHHLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHh


DSSP  ...................lLLHHHH.HHHH.HHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.......
Query ...................eEEKEFI.KQKI.KGIERXKKISEKILEALNDLD.......  151
ident                                                             
Sbjct nygnvdaypllkrllpfvqsYYQGLTlHGVLnAIVFTQLFAQAIMVYLPARELnmrpnmg   99
DSSP  hllllllhhhhhhhllllllHHHHHHhHHHHhHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lmwlswwmafiglvvaalpllaneatvlytfypplkghwafylgasvfvlstwvsiyivl  159
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct dlwrrwkaanpgkvtplvtymavvfwlmwflaslglvleavlfllpwsfglvegvdplva  219
DSSP  hhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllleelhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct rtlfwwtghpivyfwllpayaiiytilpkqaggklvsdpmarlafllflllstpvgfhhq  279
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct fadpgidptwkmihsvltlfvavpslmtaftvaaslefagrlrggrglfgwiralpwdnp  339
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct afvapvlgllgfipggaggivnasftldyvvhntawvpghfhlqvaslvtltamgslywl  399
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lpnltgkpisdaqrrlglavvwlwflgmmimavglhwagllnvprrayiaqvpdayphaa  459
DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhlhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vpmvfnvlagivllvalllfiyglfsvllsrerkpelaeaplpfaevisgpedrrlvlam  519
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhllllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ......................................
Query ......................................  151
ident                                       
Sbjct drigfwfavaailvvlaygptlvqlfghlnpvpgwrlw  557
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelllll


No 213: 1MJGA MOLECULE: CARBON MONOXIDE DEHYDROGENASE BETA SUBUNIT;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhHLLLHHHhhH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeeLKISKGNvsX   60
ident                                                             
Sbjct ..................................................RFRDLSH..N    8
DSSP  ..................................................LLLLLLL..L


DSSP  HHHhhhhllleeeELLLL.................................lllleeeEL
Query SLKkleelgfvrkVWIKG.................................erknyyeAV   87
ident                                                             
Sbjct CRP......seapRVMEPknrdrtvdpavlemlvkskddkvitafdrfvaqqpqckigYE   62
DSSP  LLL......llllLLLLLllllllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhHL


DSSP  LH.................................HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query DG.................................FSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKL  114
ident                                          |                 |
Sbjct GIccrfcmagpcrikatdgpgsrgicgasawtivaRNVGLMILTGAAAHCEHGNHIAHAL  122
DSSP  LLeellllllleellllllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLL..............................LLLHHHH.HHHHHHHLH........
Query EEKCN..............................EEEKEFI.KQKIKGIER........  135
ident  |                                  |              |        
Sbjct VEMAEgkapdysvkdeaklkevcrrvgievegksvLELAQEVgEKALEDFRRlkgegeat  182
DSSP  HHHHLllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHhHHHHHHHHLlllllllh


DSSP  .......................HHHHHHHHHHHhHHLL.....................
Query .......................XKKISEKILEAlNDLD.....................  151
ident                                                             
Sbjct wlmttinegrkekfrthnvvpfgIHASISELVNQ.AHMGmdndpvnlvfsairvaladyt  241
DSSP  hhhllllhhhhhhhhhlllllllHHHHHHHHHHH.HLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gehiatdfsdilfgtpqpvvseanmgvldpdqvnfvlhghnpllseiivqaaremegeak  301
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aagakginlvgicctgnevlmrqgiplvtsfasqelaictgaidamcvdvqcimpsisav  361
DSSP  hllllleeeeeehhhhhhhhhhhllleeelhhhhhhhhlllllleeeellllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aecyhtriittadnakipgayhidyqtataiesaktairmaieafkerkesnrpvyipqi  421
DSSP  hllllleeeelllllllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct knrvvagwslealtkllatqnaqnpirvlnqaildgelagvalicgcnnlkgfqdnshlt  481
DSSP  leeeeelllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vmkellknnvfvvatgcsaqaagklglldpanvetycgdglkgflkrlgeganieiglpp  541
DSSP  hhhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhlllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vfhmgscvdnsravdllmamandlgvdtpkvpfvasapeamsgkaaaigtwwvslgvpth  601
DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vgtmppvegsdliysiltqiasdvyggyfifemdpqvaarkildaleyrtwklgvhkeva  661
DSSP  elllllllllhhhhhhhhlhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........
Query ...........  151
ident            
Sbjct eryetklcqgy  672
DSSP  hhlllllllll


No 214: 1IXCA MOLECULE: LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHllllEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLsdkpLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                                   |  |      
Sbjct .......................XEFRQLKYFIAVAE...aGNXAAAAKRLHVSQPPITR   34
DSSP  .......................LLHHHHHHHHHHHH...hLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHH...LLLEEeelllllllleEEELL.HHHH..................hhhhhh
Query SLKKLEE...LGFVRkvwikgerknyYEAVD.GFSS..................ikdiak   98
ident     ||                     |    |                           
Sbjct QXQALEAdlgVVLLE...........IELTAaGHAFledarrilelagrsgdrsraaarg   83
DSSP  HHHHHHHhhlLLLLL...........LLLLHhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  hhhhhhhhHHHHHH.HHHHHLlllLHHH......hhhhhhhHLHHHHHHHHHH.......
Query rkhdliakTYEDLK.KLEEKCneeEKEF......ikqkikgIERXKKISEKIL.......  144
ident                                                             
Sbjct dvgelsvaYFGTPIyRSLPLL..lRAFLtstptatvslthxTKDEQVEGLLAGtihvgfs  141
DSSP  lleeeeeeELLHHHhLHHHHH..hHHHHhhllleeeeeeelLHHHHHHHHHHLllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  144
ident                                                             
Sbjct rffprhpgieivniaqedlylavhrsqsgkfgktckladlraveltlfprggrpsfadev  201
DSSP  lllllllleeeeeeeeeeeeeeeehhhhhhllleelhhhhllleeeellllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  144
ident                                                             
Sbjct iglfkhagiepriarvvedataalaltxagaassivpasvaairwpdiafarivgtrvkv  261
DSSP  hhhhhhllllleeeeelllhhhhhhhhhllllleeeehhhhlllllleeeeeelllllee


DSSP  .....................hhhhhll
Query .....................ealndld  151
ident                             
Sbjct piscifrkekqppilarfvehvrrsakd  289
DSSP  eeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll


No 215: 1HBXG MOLECULE: SERUM RESPONSE FACTOR;

DSSP  llhhhhhhHHHHhhhhhhhhhllllhhhhhHHHHHHH................llLLEE.
Query xiixeeakKLIIelfselakihglnksvgaVYAILYL................sdKPLT.   43
ident           |                       |                         
Sbjct .......dSAIT..................LWQFLLQllqkpqnkhmicwtsndgQFKLl   35
DSSP  .......lLLLL..................HHHHLLLllllhhhllleeelllllLEEEl


DSSP  .hhhHHHHHL.......LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllLLEEEELLHHHHhhh
Query .isdIXEELK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAVDGFSSikd   95
ident                        |  |          ||      |  |  |        
Sbjct qaeeVARLWGirknkpnMNYDKLSRALRYYYVKNIIKKVNG...qKFVYKFVSYPEI...   89
DSSP  lhhhHHHHHHhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL...lLLEEEELLLLHH...


DSSP  hhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHHLlllLHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyEDLKkLEEKCneeEKEFikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                         
Sbjct ..........lnmSRND.YIHSG...LYSS...................ftlnsln  112
DSSP  ..........hllLHHH.HHHLL...LEEE...................eelhhhl


No 216: 1AB4A MOLECULE: GYRASE A;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....LLHHHHHHHHHHHHLL.....LLEEHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG....LNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEEL   51
ident                            |      |                         
Sbjct ................vgrALPDvrdgLKPVHRRVLYAMNVLGndwnkAYKKSARVVGDV   44
DSSP  ................lllLLLLllllLLHHHHHHHHHHHHLLlllllLLEEHHHHHHHH


DSSP  L.....LLHHHHHHHHHHHHH.....LLLEEEEL.........lllllLLEEEEL..LHH
Query K.....ISKGNVSXSLKKLEE.....LGFVRKVW.........ikgerKNYYEAV..DGF   90
ident            |                 |                              
Sbjct IgkyhpHGDSAVYDTIVRMAQpfslrYMLVDGQGnfgsidgdsaaamrYTEIRLAkiAHE  104
DSSP  HhhlllLLHHHHHHHHHHLLLlllllLLLEEEELllllllllllllllLLEEEELllHHH


DSSP  H..........................hHHHH...................hHHHHH...
Query S..........................sIKDI...................aKRKHD...  102
ident                                                             
Sbjct LmadleketvdfvdnydgtekipdvmptKIPNllvngssgiavgmatnipphNLTEVing  164
DSSP  HlllllllllleeelllllleeelllllLLLHhhhhleeelllllleeelllLHHHHhhh


DSSP  ..........hhhHHHHhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHL..................
Query ..........liaKTYEdlkkleekcneeekefikQKIKGIE..................  134
ident                 |                                           
Sbjct clayiddedisieGLME.hipgpdfptaaiingrrGIEEAYRtgrgkvyiraraevevet  223
DSSP  hhhhhhlllllhhHHLL.llllllllllleelllhHHHHHHHhleeeeeeeleeeeelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  134
ident                                                             
Sbjct iivheipyqvnkarliekiaelvkekrvegisalrdesdkdgmriviegevvlnnlysqt  283
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelllllllleeellhhhhhhhhhhl


DSSP  .....................HHHHHH.................................
Query .....................RXKKIS.................................  140
ident                        | |                                  
Sbjct qlqvsfginmvalhhgqpkimNLKDIIaafvrhrrevvtrrtifelrkardrahileala  343
DSSP  lleeeeeeeleeeelleeeelLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  140
ident                                                             
Sbjct valanidpiielirhaptpaeaktalvanpwqlgnvaamledaarpewlepefgvrdgly  403
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlleellhhhlllllllllllllllleelllee


DSSP  ..................................................hhhhHHHHHL
Query ..................................................ekilEALNDL  150
ident                                                            |
Sbjct ylteqqaqaildlrlqkltgleheklldeykelldqiaellrilgsadrlmeviREELEL  463
DSSP  ellhhhhhhhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHHH


DSSP  .............l
Query .............d  151
ident               
Sbjct vreqfgdkrrteit  477
DSSP  hhhhhlllllleel


No 217: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHH.LLLL....EEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKISK   55
ident                                                |   |  |   | 
Sbjct .....................SKSEQTRALILETAXRlFQERgydrTTXRAIAQEAGVSV   39
DSSP  .....................LHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLlhhhLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHhhhhllleeeelllllllleeeELLH.HHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKkleelgfvrkvwikgerknyyeAVDG.FSSIKDIAKRkhdliaktyedlkkl  114
ident ||                               |    |                     
Sbjct GNAYYYFA..................gkehLIQGfYDRIAAEHRA...............   66
DSSP  HHHHHHLL..................lllhHHHHhHHHHHHHHHH...............


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHLL.......................
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealNDLD.......................  151
ident                                                             
Sbjct ..............avrevlaretdlearlagvLKVWldiatpyhefavqffknaadpds  112
DSSP  ..............hlllhhhllllhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct plspfspeseharveaigihravlagaktkvpeelrdilpelxwlsqxglvlywifdrte  172
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  .................................................
Query .................................................  151
ident                                                  
Sbjct grersyrlaergarltargvvlarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv  221
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll


No 218: 2NTZA MOLECULE: PARB;

DSSP  llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllHHHHHHHHHHHhLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnKSVGAVYAILYlSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident              |                               ||      |   |  
Sbjct ..........qtALQH.........SIREIGLRLXRxKNDGXSQKDIAAKEGLSQAKVTR   41
DSSP  ..........llLLLL.........LHHHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL...leeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhh
Query SLKKLEELG...fvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkHDLIAKTYEdlkkleek  117
ident  |                                                          
Sbjct ALQAASAPEelvalfpvqseltfsdyktlcavgdexgnlefdqLIQNISPEI........   93
DSSP  HHHHHLLLHhhhhllllhhhllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHH........


DSSP  lllllhhhhhhHHHH...........hlhhhhHHHHhHHHHH..................
Query cneeekefikqKIKG...........ierxkkISEKiLEALN..................  148
ident                                      |                      
Sbjct .........ndILSIeexaedevknkilrlitKEAS.LLTDKksvvtelwkfedkdrfar  143
DSSP  .........hlLLLLllllllllhhhhhhhhlHHHH.HHHLLllleeellllllllleee


DSSP  .....................................hll
Query .....................................dld  151
ident                                         
Sbjct krvkgrafsyefnrlskelqeeldrxighilrksldkkpk  183
DSSP  eelllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 219: 1OM2A MOLECULE: PROTEIN (MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT

DSSP  ............LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllhhhHHHHHHHHHLLlleehHHHH
Query ............XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHglnksvGAVYAILYLSDkpltiSDIX   48
ident                        | |  ||            |                 
Sbjct raglsklpdlkdAEAVQKFFLEEIQLGEELLAQG...dyeKGVDHLTNAIAvcgqpQQLL   57
DSSP  llllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...lhhHHHHHHHHHHHhhllhHHHH


DSSP  HHHlLLHHHhhHHHHHHHHlllEEEElllllllleeeellhhhhhhhhhhHHHHHhhhHH
Query EELkISKGNvsXSLKKLEElgfVRKVwikgerknyyeavdgfssikdiakRKHDLiakTY  108
ident   |             |                                           
Sbjct QVLqQTLPP..PVFQMLLT...KLPT...................isqriVSAQSlgeDD   93
DSSP  HHHhHHLLL..HHHHHHHH...HLLL...................hhhhhHHHHLlllLL


DSSP  HHhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query EDlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                            
Sbjct VE.........................................   95
DSSP  LL.........................................


No 220: 1MGTA MOLECULE: PROTEIN (O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE);

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mlsvekfrvgervvwigvifsgrvqgiafafdrgtlmkrihdlaehlgkrgvsisldvqp   60
DSSP  leeeeeeeelleeeeeeeeellleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  .....llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHH.HHLL..LLEEHHHHHHHHL
Query .....xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAIL.YLSD..KPLTISDIXEELK   52
ident                            |       ||  |          |  |    | 
Sbjct sdypekvfkvligeldnasflrelsfEGVTPFEKKVYEWLtKNVKrgSVITYGDLAKALN  120
DSSP  llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllLLLLHHHHHHHHHHhHHLLllLLEEHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHhHHLL..LEEEellllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKlEELG..FVRKvwikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyed  110
ident  |   |    |                                                 
Sbjct TSPRAVGGAMKR.NPYPivVPCHrvvahDGIG............................  151
DSSP  LLHHHHHHHHHL.LLLLllLLHHheellLLLL............................


DSSP  hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                          
Sbjct .......................yyssgieekkflleiegv  169
DSSP  .......................lllllhhhhhhhhhhlll


No 221: 2V1DA MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1;

DSSP  llhhhhhhhHHHH......hhhHHHHHLLL..............lhhHHHHHHHHHHL..
Query xiixeeakkLIIE......lfsELAKIHGL..............nksVGAVYAILYLS..   38
ident             |                                               
Sbjct ........pSGVEgaafqsrlpHDRMTSQEaacfpdiisgpqqtqkvFLFIRNRTLQLwl   52
DSSP  ........lLLHHhhhhhllllLLLLLHHHhhhlhhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ...lLLEEHHHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEE.....eELLLL........
Query ...dKPLTISDIXEEL....KISKGNVSXSLKKLEELGFVR.....kVWIKG........   78
ident       ||       |          |      ||  |                      
Sbjct dnpkIQLTFEATLQQLeapyNSDTVLVHRVHSYLERHGLINfgiykrIKPLPtkktgkvi  112
DSSP  hlllLLLLHHHHHHHLlllhHHLHHHHHHHHHHHHHLLLLLllllllLLLLLllllleee


DSSP  .............................................lllleeeellhHHHH
Query .............................................erknyyeavdgFSSI   93
ident                                                             
Sbjct iigsgvsglaaarqlqsfgmdvtlleardrvggrvatfrkgnyvadlgamvvtglgGNPM  172
DSSP  eelllhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllllllleeeelleeeelllleellllLLHH


DSSP  ......................................................hhhhhh
Query ......................................................kdiakr   99
ident                                                             
Sbjct avvskqvnmelakikqkcplyeangqavpkekdemveqefnrlleatsylshqldfnvln  232
DSSP  hhhhhhlllleeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleel


DSSP  hhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLLL.....................................
Query khdliaKTYEDLKKLEEKCNEEE.....................................  122
ident                                                             
Sbjct nkpvslGQALEVVIQLQEKHVKDeqiehwkkivktqeelkellnkmvnlkekikelhqqy  292
DSSP  leellhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct keasevkpprditaeflvkskhrdltalckeydelaetqgkleeklqeleanppsdvyls  352
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  .............hhhhhhhhhhhlHHHHHhHHHHhHHHHLL..................
Query .............kefikqkikgieRXKKIsEKILeALNDLD..................  151
ident                            |                                
Sbjct srdrqildwhfanlefanatplstlSLKHW.DQDD.DFEFTGshltvrngyscvpvalae  410
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLL.LLLH.HHLLLLlleeelllllhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct gldiklntavrqvrytasgceviavntrstsqtfiykcdavlctlplgvlkqqppavqfv  470
DSSP  llleelleeeeeeeeelleeeeeeeelllllleeeeeeleeeelllhhhhhlllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct pplpewktsavqrmgfgnlnkvvlcfdrvfwdpsvnlfghvgsttasrgelflfwnlyka  530
DSSP  llllhhhhhhhhhleellleeeeeellllllllllleeellllllllllllleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct pillalvageaagimenisddvivgrclailkgifgssavpqpketvvsrwradpwargs  590
DSSP  leeeeeelhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeellllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ysyvaagssgndydlmaqpitpgpsipgapqpiprlffagehtirnypatvhgallsglr  650
DSSP  leellllllhhhhhhhhlllllllllllllllllleeellhhhlllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ................
Query ................  151
ident                 
Sbjct eagriadqflgamytl  666
DSSP  hhhhhhhhhlllhhhl


No 222: 2AXTD MOLECULE: PHOTOSYSTEM Q(B) PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeELLH......HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeAVDG......FSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKL  114
ident                                                 |           
Sbjct ..................gwfdildDWLKrdrfvfVGWSGILLFPCAYLALGGWLTGTTF   42
DSSP  ..................llhhhhhHHHLllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  ...........HHHLL.............................lllhhhhhhHHHHHL
Query ...........EEKCN.............................eeekefikqKIKGIE  134
ident                                                             
Sbjct vtswythglasSYLEGcnfltvavstpansmghsllllwgpeaqgdftrwcqlgGLWTFI  102
DSSP  lllllllllllLLLLLllllllllllllhhhlllllllllllllllhhhhhhhlHHHHHH


DSSP  HH.HHHHHHHHHHHHHLL..........................................
Query RX.KKISEKILEALNDLD..........................................  151
ident                                                             
Sbjct ALhGAFGLIGFMLRQFEIarlvgvrpynaiafsapiavfvsvfliyplgqsswffapsfg  162
DSSP  HHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhlllhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vaaifrfllffqgfhnwtlnpfhmmgvagvlggallcaihgatventlfqdgegastfra  222
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct fnptqaeetysmvtanrfwsqifgiafsnkrwlhffmlfvpvtglwmsaigvvglalnlr  282
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ..........................................................
Query ..........................................................  151
ident                                                           
Sbjct sydfisqeiraaedpefetfytknlllnegirawmapqdqphenfvfpeevlprgnal  340
DSSP  llllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllllllllllllll


No 223: 1WRJA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE

DSSP  .............................................llhhhhhhhhhhhhh
Query .............................................xiixeeakkliielf   15
ident                                                             
Sbjct mivyglykspfgpitvaknekgfvmldfcdcaerssldndyftdffykldlyfegkkvdl   60
DSSP  lleeeeeeelleeeeeeelllleeeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  hhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhHHLL..LE
Query selakiHGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKlEELG..FV   71
ident          |     |             |        | |   |   | |         
Sbjct tepvdfKPFNEFRIRVFKEVMRIKwgEVRTYKQVADAVKTSPRAVGTALSK.NNVLliIP  119
DSSP  llllllLLLLHHHHHHHHHHLLLLllLLEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHL.LLLLllLL


DSSP  EEelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query RKvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkik  131
ident                                                             
Sbjct CH.................................................rvigekslg  130
DSSP  HH.................................................heellllll


DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gierxkkisekilealndld  151
ident                     
Sbjct gysrgvelkrkllelegidv  150
DSSP  lllllhhhhhhhhhhlllll


No 224: 1W9CA MOLECULE: CRM1 PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEekcne  120
ident                                 |                           
Sbjct ..........................viQLGRIYLDMLNVYKCLSENISAAIQAN.....   29
DSSP  ..........................llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....


DSSP  llhhhHHHHH.HHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL............................
Query eekefIKQKI.KGIERXKKISEKILEALNDLD............................  151
ident                |           |                                
Sbjct .....GEMVTkQPLIRSMRTVKRETLKLISGWvsrsndpqmvaenfvpplldavlidyqr   84
DSSP  .....LLHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct nvpaarepevlstmaiivnklgghitaeipqifdavfectlnminkdfeeypehrtnffl  144
DSSP  llhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct llqavnshcfpaflaipptqfklvldsiiwafkhtmrnvadtglqilftllqnvaqeeaa  204
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct aqsfyqtyfcdilqhifsvvtdtshtagltmhasilaymfnlveegkistslnpgnpvnn  264
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllh


DSSP  .........................................................
Query .........................................................  151
ident                                                          
Sbjct qiflqeyvanllksafphlqdaqvklfvtglfslnqdipafkehlrdflvqikefag  321
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 225: 1HLVA MOLECULE: MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX   60
ident                                          |    |     |     | 
Sbjct ...............mgpkrrqlTFREKSRIIQEVEEN.PDLRKGEIARRFNIPPSTLST   44
DSSP  ...............llllllllLHHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query SLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakRKHDLIAKTYEDLKKLEEkcne  120
ident  ||                                       |                 
Sbjct ILKNKRAIL.......aserkygvastcrktnklspydKLEGLLIAWFQQIRAAGL....   93
DSSP  HHHLHHHHH.......hhhhhhhhhhhllllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLL....


DSSP  llhhhhhhHHHHHLHHH...............hhhHHHHHHHhhll
Query eekefikqKIKGIERXK...............kisEKILEALndld  151
ident         |                                     
Sbjct ......pvKGIILKEKAlriaeelgmddftasngwLDRFRRR..rs  131
DSSP  ......llLHHHHHHHHhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHH..ll


No 226: 1HKQA MOLECULE: REPLICATION PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLL...........LLEEHHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSD...........KPLTISDIXE   49
ident                        |                                   |
Sbjct ..........qsnklieSSHT..LTLNEKRLVLCAASLIdsrkplpkdgyLTIRADTFAE   48
DSSP  ..........llhhhhhHHHL..LLHHHHHHHHHHHHLLlllllllhhheEEEEHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHH.HHHHHLL...................leEEELllllLLLEEEELLH
Query ELKISKGNVSXSL.KKLEELG...................fvRKVWikgeRKNYYEAVDG   89
ident    |        |      |                       |           |    
Sbjct VFGIDVKHAYAALdDAATKLFnrdirryvkgkvvermrwvfhVKYR...eGQGCVELGFS  105
DSSP  HLLLLHHHHHHHHhHHHHHHHllleeeeelleeeeeelleeeEEEE...lLLLEEEEEEL


DSSP  HHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query FSSikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealnd  149
ident                                                             
Sbjct PTI..........................................iphltmlhkeftsyq  123
DSSP  LLL..........................................lllhhhhhhhhhhll


DSSP  ll
Query ld  151
ident   
Sbjct lk  125
DSSP  ll


No 227: 1EYSM MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;

DSSP  .......llhhhhhhhhhhhHHHHHHhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhll
Query .......xiixeeakkliieLFSELAkihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelki   53
ident                                                             
Sbjct peyqniftavqvrapaypgvPLPKGN..................................   26
DSSP  llllllllllleelllllllLLLLLL..................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllLEEEELLLLL...LLLEEEELLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query skgnvsxslkkleelgFVRKVWIKGE...RKNYYEAVDGfSSIKDIAKRKHDLIAKTYED  110
ident                   |                                         
Sbjct .............lprIGRPIFSYWLgkiGDAQIGPIYL.GLTGTLSIFFGLVAISIIGF   72
DSSP  .............lllLLLLLLLLLHhhhLLLLLLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL.................lllhhhhHHHH.HHHLHHHHHHHHHHHHHHHL..
Query LKKLEEKCN.................eeekefiKQKI.KGIERXKKISEKILEALNDL..  150
ident                                        |              |     
Sbjct NMLASVHWDvfqflkhffwlgleppppqyglriPPLSeGGWWLIAGLFLTLSILLWWVrt  132
DSSP  HHHHLLLLLhhhhhhhhhhlllllllhhhllllLLHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct ykraealgmsqhlswafaaaiffylvlgfirpvmmgswakavpfgifphldwtaafsiry  192
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct gnlyynpfhmlsiaflygsallfamhgatilsvsrfggdreidqithrgtaaegaalfwr  252
DSSP  llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhlllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  150
ident                                                             
Sbjct wtmgfnatmesihrwawwcavltvitagigillsgtvvdnwylwavkhgmapaypevvta  312
DSSP  hhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  .....l
Query .....d  151
ident       
Sbjct vnpyet  318
DSSP  llllll


No 228: 1DE4C MOLECULE: HEMOCHROMATOSIS PROTEIN;

DSSP  .....................................................LLHHhHH
Query .....................................................XIIXeEA    7
ident                                                             
Sbjct lywddlkrklsekldstdftstikllnensyvpreagsqkdenlalyvenqfrEFKL.SK   59
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LE


DSSP  HH..........................................................
Query KK..........................................................    9
ident                                                             
Sbjct VWrdqhfvkiqvkdsaqnsviivdkngrlvylvenpggyvayskaatvtgklvhanfgtk  119
DSSP  EEeeeeeeeeeelllllleeeeeelllleellllllllleelllleeeeeleeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct kdfedlytpvngsivivragkitfaekvanaeslnaigvliymdqtkfpivnaelsffgh  179
DSSP  hhhhllllllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllleeeellllllllllllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct ahlgtgdpytpgfpsfnhtqfppsrssglpnipvqtisraaaeklfgnmegdcpsdwktd  239
DSSP  llllllllllllllllhhhlllllllllllllleeellhhhhhhhhllllllllhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    9
ident                                                             
Sbjct stcrmvtsesknvkltvsnvlkeikilnifgvikgfvepdhyvvvgaqrdawgpgaaksg  299
DSSP  lllllllllleeeeeeelleeeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeelllllllllllh


DSSP  ...................................hhhhhhhhhhhhlllLHHHHhhhhh
Query ...................................liielfselakihglNKSVGavyai   34
ident                                                     |       
Sbjct vgtalllklaqmfsdmvlkdgfqpsrsiifaswsagdfgsvgatewlegyLSSLH.....  354
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhhlHHHHL.....


DSSP  hhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhhhhhHHHH...........................
Query lylsdkpltisdixeelkiskgnvsxslkKLEE...........................   67
ident                                                             
Sbjct ...........................lkAFTYinldkavlgtsnfkvsaspllytliek  387
DSSP  ...........................llEEEEeellllllllleeeeeelhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   67
ident                                                             
Sbjct tmqnvkhpvtgqflyqdsnwaskvekltldnaafpflaysgipavsfcfcedtdypylgt  447
DSSP  hhhhlllllllllllllllhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeellllllllll


DSSP  .........llleeeellllLLLL....eEEEL...LHHHHhhHHHHhHHHHHHHHHHHH
Query .........lgfvrkvwikgERKN....yYEAV...DGFSSikDIAKrKHDLIAKTYEDL  111
ident                                            |              ||
Sbjct tmdtykelieripelnkvarAAAEvagqfVIKLthdVELNL..DYER.YNSQLLSFVRDL  504
DSSP  llllhhhhhhhlllhhhhhhHHHHhhhhhHHHHhllLLLLL..LHHH.HHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLlllHHHHHhhHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL....................
Query KKLEEKCNeeeKEFIKqkIKGIERXKKISEKILEALNDLD....................  151
ident                                    |                        
Sbjct NQYRADIK...EMGLS..LQWLYSARGDFFRATSRLTTDFgnaektdrfvmkklndrvmr  559
DSSP  HLLHHHHH...HLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct veyhflspyvspkespfrhvfwgsgshtlpallenlklrkqnngafnetlfrnqlalatw  619
DSSP  hhhlllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................
Query ................  151
ident                 
Sbjct tiqgaanalsgdvwdi  635
DSSP  hhhhhhhhhlllhhhl


No 229: 1BGWA MOLECULE: TOPOISOMERASE;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rksritnypkledankagtkegykctlvltegdsalslavaglavvgrdyygcyplrgkm   60
DSSP  lllllllllllllllllllllhhhleeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lnvreasadqilknaeiqaikkimglqhrkkyedtkslryghlmimtdqdhdgshikgli  120
DSSP  llllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllleeeeellllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct inflessflglldiqgfllefitpiikvsitkptkntiafynmpdyekwreeeshkftwk  180
DSSP  hhhhhhhlhhhhllllleeellllleeeeeellleeeeeellhhhhhhhhhhlhhhllee


DSSP  ..........................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHH
Query ..........................xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVY   32
ident                                                           | 
Sbjct qkyykglgtslaqevreyfsnldrhlkifhslqglfsladnirsiPNVLdgFKPGQRKVL  240
DSSP  eeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlLLLLllLLHHHHHHH


DSSP  HHHH..HLLLLEEHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHH.......LLLEEEEL..
Query AILY..LSDKPLTISDIXEELK......ISKGNVSXSLKKLEE.......LGFVRKVW..   75
ident            |                            |                   
Sbjct YGCFkkNLKSELKVAQLAPYVSectayhHGEQSLAQTIIGLAQnfvgsnnIYLLLPNGaf  300
DSSP  HHHHhlLLLLLEEHHHHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLLLLLll


DSSP  .........lllllLLEEEEL.LHHHHH................................
Query .........ikgerKNYYEAV.DGFSSI................................   93
ident                 | |                                         
Sbjct gtratggkdaaaarYIYTELNkLTRKIFhpaddplykyiqedektvepewylpilpmilv  360
DSSP  llhhhlllllllllLLEELLLlLHHHHLlhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhh


DSSP  .............hhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhHHHH.
Query .............kdiaKRKHDliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierXKKI.  139
ident                                                             
Sbjct ngaegigtgwstyippfNPLEI.............................ikniRHLMn  391
DSSP  hleeeelllleeeelllLHHHH.............................hhhhHHHHh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  139
ident                                                             
Sbjct deeleqmhpwfrgwtgtieeieplryrmygrieqigdnvleitelpartwtstikeylll  451
DSSP  lllllllllllllllleeeelllleeeeeleeeeeelleeeeeellllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  139
ident                                                             
Sbjct glsgndkikpwikdmeeqhddnikfiitlspeemaktrkigfyerfklispislmnmvaf  511
DSSP  hhllllllllllleeeellllllleeeellhhhhhhhhhhlhhhhllleeeeellleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  139
ident                                                             
Sbjct dphgkikkynsvneilsefyyvrleyyqkrkdhmserlqwevekysfqvkfikmiiekel  571
DSSP  llllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  139
ident                                                             
Sbjct tvtnkprnaiiqelenlgfprfnkegkpyygspndeieelygtyeyllgmriwsltkery  631
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllhhhhlllhhhhlhhhh


DSSP  .....................hhhhHHHHHHL...............l
Query .....................sekiLEALNDL...............d  151
ident                                                 
Sbjct qkllkqkqeketelenllklsakdiWNTDLKAfevgyqeflqrdaear  679
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhll


No 230: 1AKHA MOLECULE: PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1);

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHL..llleEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvGAVYAILYLS..dkplTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                                       |    |
Sbjct ......................ispqarAFLEEVFRRKqslnskEKEEVAKKCGITPLQV   38
DSSP  ......................llhhhhHHHHHHHHHLllllhhHHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident                                                             
Sbjct RVWFINKRMRS.................................................   49
DSSP  HHHHHHHHHHL.................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct .................................   49
DSSP  .................................


No 231: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHH.LLLL....EEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKISK   55
ident                              |  |  |           |   | |    | 
Sbjct .................glrerkKTRTREAIRAATYGlIRQQgyeaTTVEQIAERAEVSP   43
DSSP  .................lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHH...HHHHLLleeeelllllllleeeellhhhHHHHHHH..............
Query GNVSXSLK...KLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfsSIKDIAK..............   98
ident   |                                                         
Sbjct STVLRYFPtreDIVLTD......................EYDPVXAaelaarpagepwsd   81
DSSP  HHHHHHLLlhhHHHLLL......................LLHHHHHhhhhlllllllhhh


DSSP  ..............................................HHHHHHHHHHHHhh
Query ..............................................RKHDLIAKTYEDlk  112
ident                                               |             
Sbjct slrhvlrkalglgageeaelirlrtrllaevpavrarxlenxsdtgRXLARAIADRTG..  139
DSSP  hhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHL..


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhHHHHHHHHHHHHHLL.....................
Query kleekcneeekefikqkikgierxKKISEKILEALNDLD.....................  151
ident                            |      |                         
Sbjct ................ldpdglevRIVSXSLVGGLXEVSrywaehdheeslaelvdrald  183
DSSP  ................lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhh


DSSP  ........
Query ........  151
ident         
Sbjct alenglpa  191
DSSP  hhhhllll


No 232: 2NPPB MOLECULE: PROTEIN PHOSPHATASE 2, REGULATORY SUBUNIT A (PR

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeellhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgFSSIKDIAKRKHDLIAKTyeDLKKleekcne  120
ident                                       |                     
Sbjct .............................QEKLFIQKLRQCCVLFDF..VSDP.......   22
DSSP  .............................LLLLLLLHHHHHHHHHHH..LLLL.......


DSSP  llHHHHHHhhHHHLHHHHHHHHHhhhhHHLL.............................
Query eeKEFIKQkiKGIERXKKISEKIlealNDLD.............................  151
ident                                                             
Sbjct .lSDLKWK..EVKRAALSEMVEYithnRNVItepiypevvhmfavnmfrtlppssnptga   79
DSSP  .lLLLLLL..LLHHHHHHHHHHHhhllLLLLllllllhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct efdpeedeptleaawphlqlvyefflrflespdfqpniakkyidqkfvlqllelfdsedp  139
DSSP  lllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhlllhhhhhhhhhllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct rerdflkttlhriygkflglrayirkqinnifyrfiyetehhngiaelleilgsiingfa  199
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lplkeehkifllkvllplhkvkslsvyhpqlaycvvqflekdstltepvvmallkywpkt  259
DSSP  llllhhhhhhhhhllhhhhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct hspkevmflneleeildviepsefvkimeplfrqlakcvssphfqvaeralyywnneyim  319
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct slisdnaakilpimfpslyrnskthwnktihgliynalklfmemnqklfddctqqfkaek  379
DSSP  hhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........
Query .........  151
ident          
Sbjct lkeklkmke  388
DSSP  hhhhhllll


No 233: 2IPQX MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN STY4665;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLL....................L
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSD....................K   40
ident                                   |                         
Sbjct .....................lsSTELGDLFWSWLRDGLregdipvntadacvhltcgfV   39
DSSP  .....................llHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllllleeeelleE


DSSP  LEEHHHHHHHHL...lLHHHHHHHHHHHhhlLLEE......EELLLL..........LLL
Query PLTISDIXEELK...iSKGNVSXSLKKLeelGFVR......KVWIKG..........ERK   81
ident                  |  |     |       |                         
Sbjct FISVPGVFFLFLkshgRKEQVQAAFEKX...RKHRvsdsrrFWQCCLyeepggrgryKKL   96
DSSP  EEELLHHHHHHHhhllHHHHHHHHHHLL...LLLLllllllLEEEEEeeellleeeeEEE


DSSP  LEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query NYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkise  141
ident   |                                                         
Sbjct TGYLIKXS.............................................eiyngnf  111
DSSP  EEEEEEHH.............................................hhlllll


DSSP  hhhhhhhhll
Query kilealndld  151
ident           
Sbjct pddslflkvi  121
DSSP  lllllleeel


No 234: 2GLOA MOLECULE: BRINKER CG9653-PA;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLH.HHHHHHHHHHHLLL.lEEHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNK.SVGAVYAILYLSDK.pLTISDIXEELKISKGNV   58
ident                                |                      |     
Sbjct ..................gsrrIFTPhFKLQVLESYRNDNDckGNQRATARKYNIHRRQI   42
DSSP  ..................llllLLLHhHHHHHHHHHHHLLLllLLHHHHHHHLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc  118
ident    |     |                                                  
Sbjct QKWLQCESNLR.................................................   53
DSSP  HHHHLLHHHHH.................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                  
Sbjct ...........................ssvann   59
DSSP  ...........................hhhlll


No 235: 2FUG2 MOLECULE: NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;

DSSP  .llhHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLEEHHHHHHHHL...LLHH
Query .xiiXEEAKKLIielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK...ISKG   56
ident                                                | |          
Sbjct ffddKQDFLEET...fakyppegrrAAIMPLLRRVQQEE.gWIRPERIEEIARlvgTTPT   56
DSSP  llllLHHHHHHH...hhllllllhhHHHHHHHHHHHHHH.lLLLHHHHHHHHHhhlLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHhllLEEEEL.........................................
Query NVSXSLKKLEelgFVRKVW.........................................   75
ident  |               |                                          
Sbjct EVMGVASFYS...YYQFVPtgkyhlqvcatlscklagaeelwdyltetlgigpgevtpdg  113
DSSP  HHHHHHHHLL...LLLLLLllleeeeeellhhhhlllhhhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  .........llllllleeeelLHHHhhhHHHHhhHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllhhhh
Query .........ikgerknyyeavDGFSsikDIAKrkHDLIAKTYedlkkleekcneeekefi  126
ident                                                             
Sbjct lfsvqkveclgschtapviqvNDEP...YVEC..VTRARLEA............llaglr  156
DSSP  leeeeeellllllllllleelLLLL...LLLL..LLHHHHHH............hhhhhh


DSSP  hhhhhhhlhhHHHHhhhhhhhhhll
Query kqkikgierxKKISekilealndld  151
ident                          
Sbjct agkrleeielPGKC...ghhvheve  178
DSSP  llllhhhlllLLLL...llllllll


No 236: 2DAOA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR ETV6;

DSSP  llHHHHHhhhhhHHHHhhhhhllllhhhhHHHHHHHH.................llLLEE
Query xiIXEEAkkliiELFSelakihglnksvgAVYAILYL.................sdKPLT   43
ident                                    |                        
Sbjct ..GSSGS.....SGCR.............LLWDYVYQllsdsryenfirwedkeskIFRI   40
DSSP  ..LLLLL.....LLLL.............LHHHHHHHhhhlhhhllleeeeehhhlEEEE


DSSP  ..hhhhHHHHL.......LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLllllLLEEEEL.LHHHHH
Query ..isdiXEELK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAV.DGFSSI   93
ident                         |  |     |   ||                     
Sbjct vdpnglARLWGnhknrtnMTYEKMSRALRHYYKLNIIRKEPG...qRLLFRFMkTPDEIM   97
DSSP  llhhhhHHHHHhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLL...lLLEEEELlLLHHHL


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                           
Sbjct .....................................sgrtdrlehlesqelsgpssg  118
DSSP  .....................................llllllhhhhhllllllllll


No 237: 2B9RA MOLECULE: HUMAN CYCLIN B1;

DSSP  ..............................llhhhhHHHH..............hhhhhh
Query ..............................xiixeeAKKL..............iielfs   16
ident                                                             
Sbjct vkdiyaylrqleaaqavrpkyllgrevtgnmrailiDWLVqvqmkfrllqetmymtvsii   60
DSSP  lllllllhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  HHHHHLL.....lLHHHHHHHHHHHHL...LLLEEHHHHHHHH..LLLHHHHHHHHHHHH
Query ELAKIHG.....lNKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEEL..KISKGNVSXSLKKLE   66
ident                 ||              |  | |          |        |  
Sbjct DRFMQNNsvpkkmLQLVGVTAMFIASKyeeMYPPEIGDFAFVTdnTYTKHQIRQMEMKIL  120
DSSP  HHHHLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLleeeelllllllleeeeLLHHH...................................
Query ELGfvrkvwikgerknyyeaVDGFS...................................   91
ident                                                             
Sbjct RAL..............nfgLGRPLplhflrraskigevdveqhtlakylmeltmldydm  166
DSSP  HHL..............lllLLLLLhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh


DSSP  ........hhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhHHHLHHHHHHHHH
Query ........sikdiakrkhdliakTYEDLKkleekcneeekefikqkiKGIERXKKISEKI  143
ident                                                   |         
Sbjct vhfppsqiaagafslalkildngEWTPTL.............qhylsYTEESLLPVMQHL  213
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLLH.............hhhllLLLLLLLLHHHHH


DSSP  .................................hhhhhhll
Query .................................lealndld  151
ident                                          
Sbjct aknvvmvnqgltkhmtvknkyatskhakistlpqlnsalvq  254
DSSP  hhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhllhhhlllllhhhll


No 238: 1VINA MOLECULE: CYCLIN A;

DSSP  ................................llhhhhHHHH..............hhhh
Query ................................xiixeeAKKL..............iiel   14
ident                                                             
Sbjct dihtylremevkckpkvgymkkqpditnsmrailvdwlVEVGeeyklqnetlhlavnyid   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhHHHHhhllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHL...LLLEEHHHHHHHHL..LLHHHHHHHHHHHHH
Query fselakIHGL..NKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK..ISKGNVSXSLKKLEE   67
ident                ||     |        |               |  |         
Sbjct rflssmSVLRgkLQLVGTAAMLLASKfeeIYPPEVAEFVYITDdtYTKKQVLRMEHLVLK  120
DSSP  hhhlllLLLHhhHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLleeeelllllllleeeeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh
Query LGfvrkvwikgerknyyeaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefik  127
ident                                                             
Sbjct VL..............afdLAAPT...............inqfltqyflhqqpanckves  151
DSSP  HL..............lllLLLLL...............hhhhhhhhhhhlllllhhhhh


DSSP  hhhhhhlhhhhhHHHHHHHH.HHLL...................................
Query qkikgierxkkiSEKILEAL.NDLD...................................  151
ident                 |  |                                        
Sbjct lamflgelslidADPYLKYLpSVIAaaafhlalytvtgqswpeslvqktgytletlkpcl  211
DSSP  hhhhhhhhhhhlHHHHLLLLhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllhhhh


DSSP  .........................................
Query .........................................  151
ident                                          
Sbjct ldlhqtylrapqhaqqsirekyknskyhgvsllnppetlnl  252
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhllhhhlllllllll


No 239: 1V4RA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.....lLEEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.....kPLTISDIXEELKISK   55
ident                                                   ||        
Sbjct .............mpykapegkgyADVATHFRTLIKSGElapgdtLPSVADIRAQFGVAA   47
DSSP  .............llllllllllhHHHHHHHHHHLLLLLllllllLLLHHHHHHHLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHhLLLEEEELLLllllleeeeLLHHHhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEeLGFVRKVWIKgerknyyeaVDGFSsikdiAKRKhdliaktyedlkkle  115
ident   ||  |  |                                                  
Sbjct KTVSRALAVLK.SEGLVSSRGA..lgtvvekNPIVI.....TGAD...............   84
DSSP  LHHHHHLLLLL.LLLLLEEELL..leeelllLLLLL.....LLHH...............


DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                     
Sbjct ....................rlkrmekngmryapge  100
DSSP  ....................hhhlllllllllllll


No 240: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHH..LLLL..EEHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYL..SDKP..LTISDIXEELKISK   55
ident                                  |             |  ||        
Sbjct ...............mnipTTTTkGEQAKSQLIAAALAqfGEYGlhATTRDIAALAGQNI   45
DSSP  ...............llllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhLLHHHHHHHHLLLH


DSSP  HHHHHHHHhhhhlLLEEeelllllllleeeELLH.HHHH.................hhhh
Query GNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeAVDG.FSSI.................kdia   97
ident                                                             
Sbjct AAITYYFG..skeDLYL............aCAQWiADFLgekfrphaekaerlfsqpapd   91
DSSP  HHHHHHHL..lhhHHHH............hHHHHhHHHHhhhlhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL......
Query krkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD......  151
ident                                                     |       
Sbjct rdairelillacknmimlltqedtvnlskfisreqlsptsayqlvheqvIDPLHthltrl  151
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlHHHHHhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct vaaytgcdandtrmilhthallgevlafrlgketillrtgwpqfdeekaeliyqtvtchi  211
DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........
Query .........  151
ident          
Sbjct dlilhgltq  220
DSSP  hhhhhhhhl


No 241: 1M2VB MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fltpaqeqlhqqirpmnqlypidlltelpppitdltlpppplvippermlvpselsnasp   60
DSSP  lllhhhhhhhhhlllllllleeellllllllllhhhlllllllllhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dyirstlnavpknssllkksklpfglvirpyqhlyddidppplnedglivrcrrcrsymn  120
DSSP  lleeelllleellhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleellllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pfvtfieqgrrwrcnfcrlandvpmqmdqsdpndpksrydrneikcavmeymapkeytlr  180
DSSP  llleeelllleeelllllleeellhhhlllllllhhhhhhlhhhhlleeeeellhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qpppatycflidvsqssiksgllattintllqnldsipnhdertrisilcvdnaihyfki  240
DSSP  lllllleeeeeellhhhhhllhhhhhhhhhhhlllllllllllleeleeeellleeeeel


DSSP  ...................................................lLHHHHHH.
Query ...................................................xIIXEEAK.    8
ident                                                             
Sbjct pldqinmmdiadleepflprpnsmvvslkacrqnietlltkipqifqsnlitNFALGPAl  300
DSSP  llllleeeeellllllllllllllleellllhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLHHHHh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    8
ident                                                             
Sbjct ksayhliggvggkiivvsgtlpnlgigklqrrnentsketaqllscqdsfyknftidcsk  360
DSSP  hhhhhhhlllleeeeeeellllllllllllllllllllhhhhhllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............hhhhHHHHHHHH.................................
Query ...............kliiELFSELAK.................................   20
ident                                                             
Sbjct vqitvdlflasedymdvasLSNLSRFTagqthfypgfsgknpndivkfstefakhismdf  420
DSSP  hleeeeeeeeelllllhhhHHHHHHLLllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ..................hLLLLhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhHHHH..
Query ..................iHGLNksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgNVSX..   60
ident                     |                                 | |   
Sbjct cmetvmrargstglrmsrfYGHF..............................fNRSSdl  450
DSSP  eeeeeeeeeellleeeeeeELLL..............................lLLLLle


DSSP  .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................slkklee   67
ident                                                             
Sbjct cafstmprdqsylfevnvdesimadycyvqvavllslnnsqrririitlamptteslaev  510
DSSP  eeeeeellllleeeeeeellllllleeeeeeeeeeeellleeeeeeeeeeeeeellhhhh


DSSP  llleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLhhhhh
Query lgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNEEEkefik  127
ident                        ||  |                ||     |        
Sbjct yasadqlaiasfynskavekaLNSSLDDARVLINKSVQDILATYKKEIVVSNTAGgaplr  570
DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLlllle


DSSP  hHHHHHlHHHHHHHHHHHH..HHHLL..................................
Query qKIKGIeRXKKISEKILEA..LNDLD..................................  151
ident                                                             
Sbjct lCANLR.MFPLLMHSLTKHmaFRSGIvpsdhrasalnnleslplkylikniypdvyslhd  629
DSSP  eEHHHL.LHHHHHHHHHLLllLLLLLllhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlleeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct madeaglpgtivlpqpinatsslferyglylidngnelflwmggdavpalvffnqrvrni  689
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllleeeeellleeeeeellllllhhhllhhhhhhh


DSSP  ...........................................................
Query ...........................................................  151
ident                                                            
Sbjct inqlrnhddvityqslyivrarevatlrlwasstlvedkilnnesyreflqimkarisk  748
DSSP  hhhllllllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhll


No 242: 1L8QA MOLECULE: CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dflnpkytlenfivgegnrlayevvkealenlgslynpifiygsvgtgkthllqaagnea   60
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kkrgyrviyssaddfaqaxvehlkkgtinefrnxyksvdllllddvqflsgkertqieff  120
DSSP  hhlllleeeeehhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllleeeeelhhhhlllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hifntlyllekqiilasdrhpqkldgvsdrlvsrfeggilveieldnktrfkiikeklke  180
DSSP  hhhhhhhhllleeeeeelllhhhlllllhhhhhhhhlleeeellllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................LLHHHHHHHHHHHHH....
Query .........................................XIIXEEAKKLIIELF....   15
ident                                                    | |      
Sbjct fnlelrkevidyllentknvreiegkikliklkgfeglerkERKERDKLXQIVEFVanyy  240
DSSP  llllllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhh


DSSP  .......hhhhHHLL.LLHHHHHHHHH.HHHLllleehhHHHHHHL....lLHHHHHHHH
Query .......selaKIHG.LNKSVGAVYAI.LYLSdkpltisDIXEELK....iSKGNVSXSL   62
ident                       | |      |          |            |    
Sbjct avkvedilsdkRNKRtSEARKIAXYLCrKVCS......aSLIEIARafkrkDHTTVIHAI  294
DSSP  lllhhhhllllLLLLlHHHHHHHHHHHhHHHL......lLHHHHHHhllllLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHLLleeeelllllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query KKLEELGfvrkvwikgerknyyeaVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneee  122
ident    ||                     ||                                
Sbjct RSVEEEK...........krkfkhLVGF................................  311
DSSP  HHHHHLL...........lllhhhHHHH................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                              
Sbjct ...................lekqafdkic  321
DSSP  ...................hhhhhhhhhl


No 243: 1D3UB MOLECULE: TATA-BINDING PROTEIN;

DSSP  ......................llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL....HHHHHHHHH
Query ......................xiixEEAKKLIIELFSELAKIHGLN....KSVGAVYAI   34
ident                                         |   ||              
Sbjct mvsdaaernlafalseldritaqlklPRHVEEEAARLYREAVRKGLIrgrsIESVMAACV   60
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllllHHHHHHHHH


DSSP  HHHL...LLLEEHHHHHHHhLLLHhhHHHHHHHHHHLLL.....................
Query LYLS...DKPLTISDIXEElKISKgnVSXSLKKLEELGF.....................   70
ident          | |   |                                            
Sbjct YAACrllKVPRTLDEIADI.ARVD..KKEIGRSYRFIARnlnltpkklfvkptdyvnkfa  117
DSSP  HHHHhhhLLLLLHHHHHHH.LLLL..HHHHHHHHHHHHHhllllhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  ...........................eeeeLLLL.....................LLLL
Query ...........................vrkvWIKG.....................ERKN   82
ident                                                         |   
Sbjct delglsekvrrraieildeaykrgltsgkspAGLVaaalyiasllegekrtqrevaEVAR  177
DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhHHHHhhhhhhhhhhllllllhhhhhHHHL


DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query yyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek  142
ident                                                             
Sbjct .............................................vtevtvrnrykelve  192
DSSP  .............................................llhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhll
Query ilealndld  151
ident          
Sbjct klkikvpia  201
DSSP  hllllllll


No 244: 2NRAC MOLECULE: PI PROTEIN;

DSSP  llhHHHHHHHhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHL...........lLLEEHHHHHH
Query xiiXEEAKKLiielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLS...........dKPLTISDIXE   49
ident        |               |      |                         |   
Sbjct ..vNKKTKIRhrnelnhTLAQ..LPLPAKRVMYMALALidskeplergrvFKIRAEDLAA   56
DSSP  ..lLLLLEEEeehhhhhHHHH..LLHHHHHHHHHHHHLllllllllllllEEEEHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHHHLLL.............................eEEELllllL
Query ELKISKGNVSXSLKKLEELGF.............................vRKVWikgeR   80
ident   ||        ||    |                                         
Sbjct LAKITPSLAYRQLKEGGKLLGaskislrgddiialakelnseeldlniiewIAYS...pD  113
DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllllhhhhhhhhlllllllllleeeEEEE...lL


DSSP  LLEEEeLLHHH............................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KNYYEaVDGFS............................sikdiakrkhdliaktyedlk  112
ident   |                                                         
Sbjct EGYLS.LKFTRtiepyissligkknkfttqlltaslrlssqyssslyqlirkhysnfkkk  172
DSSP  LLEEE.EEELLllhhhlllllllhhheeeeehhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhHHLHHhhHHHH..............................
Query kleekcneeekefikqkikGIERXkkISEK..............................  142
ident                           |  |                              
Sbjct nyfiisvdelkeeliaytfDKDGN..IEYKypdfpifkrdvlnkaiaeikkkteisfvgf  230
DSSP  eeeeeehhhhhhhhlleelLLLLL..LEELlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhlleeeeee


DSSP  .............hhhhhhhll
Query .............ilealndld  151
ident                       
Sbjct tvhekegrkisklkfefvvded  252
DSSP  eeeellllllleeeeeeeelll


No 245: 2IF4A MOLECULE: ATFKBP42;

DSSP  llhhhHHHHH......hhhhhhhhhHHLL...............................
Query xiixeEAKKL......iielfselaKIHG...............................   23
ident                                                             
Sbjct nvppkVDSEAevldekvskqiikegHGSKpskystcflhyrawtknsqhkfedtwheqqp   60
DSSP  lllllLLLLLeeeelleeeeeeellLLLLllllleeeeeeeeeellllllleehhhhlll


DSSP  ......................LLHH.......hhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlll
Query ......................LNKS.......vgavyailylsdkpltisdixeelkis   54
ident                                                             
Sbjct ielvlgkekkelaglaigvasmKSGEralvhvgwelaygkegnfsfpnvppmadllyeve  120
DSSP  eeeelllllhhhhhhhhhhhhlLLLLeeeeeelhhhlllllllllllllllllleeeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeellhhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.H
Query kgnvsxslkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfSSIKdiAKRKHDLIAKTYEDLK.K  113
ident                                        |                    
Sbjct vigfdetkegkarsdmtveerigaadrrkmdgnslfKEEK..LEEAMQQYEMAIAYMGdD  178
DSSP  eeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHLLhH


DSSP  HHHHLllllHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHH........................
Query LEEKCneeeKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALND........................  149
ident                                                             
Sbjct FMFQL....YGKYQDMALAVKNPCHLNIAACLIKLKrydeaighcnivlteeeknpkalf  234
DSSP  HHHLL....LHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhh


DSSP  ......................ll
Query ......................ld  151
ident                         
Sbjct rrgkakaelgqmdsarddfrkaqk  258
DSSP  hhhhhhhllllhhhhhhhhhhlll


No 246: 2CFPA MOLECULE: LACTOSE PERMEASE;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeEELL..HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyEAVD..GFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC  118
ident                                              |   |          
Sbjct ........................MYYLknTNFWMFGLFFFFYFFIMGAYFPFFPIWLHD   36
DSSP  ........................LLLLllLHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLLLLHHHHHH


DSSP  L...........................................................
Query N...........................................................  119
ident                                                             
Sbjct Inhisksdtgiifaaislfsllfqplfgllsdklglrkyllwiitgmlvmfapffififg   96
DSSP  Hhlllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhllllllllhhhhhhllh


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................e  120
ident                                                             
Sbjct pllqynilvgsivggiylgfcfnagapaveafiekvsrrsnfefgrarmfgcvgwalgas  156
DSSP  hhhlllllhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhHHHHHHHLHHHHH.HHHHHHHHHHLL............................
Query eekefiKQKIKGIERXKKI.SEKILEALNDLD............................  151
ident                            |                                
Sbjct ivgimfTINNQFVFWLGSGcALILAVLLFFAKtdapssatvanavganhsafslklalel  216
DSSP  hhhhhhHHLLLHHHHLHHHhHHHHHHHLLLLLlllllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct frqpklwflslyvigvsctydvfdqqfanfftsffatgeqgtrvfgyvttmgellnasim  276
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct ffapliinriggknalllagtimsvriigssfatsalevvilktlhmfevpfllvgcfky  336
DSSP  llhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct itsqfevrfsatiylvcfcffkqlamifmsvlagnmyesigfqgaylvlglvalgftlis  396
DSSP  hhhhlllllhhhhlhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .....................
Query .....................  151
ident                      
Sbjct vftlsgpgplsllrrqvneva  417
DSSP  hhhllllllllllllllllll


No 247: 1O4XA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR OCT-1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eepsdleeleqfaktfkqrriklgftqgdvglamgklygndfsqttisrfealnlsfknm   60
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllhhhh


DSSP  ....llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhHHHHHHHHHL..llleEHHHHHHHHLLL
Query ....xiixeeakkliiELFSelakihglnksvGAVYAILYLS..dkplTISDIXEELKIS   54
ident                 |                |               |  |   |   
Sbjct aklkpllekwlndasiETNI...........rVALEKSFLENqkptseEITMIADQLNME  109
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllLHHH...........hHHHHHHHHHLllllhhHHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkl  114
ident |                                                           
Sbjct KEVIRVWFCNRRQKE.............................................  124
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHH.............................................


DSSP  hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                      
Sbjct ..................................kri  127
DSSP  ..................................lll


No 248: 2H9UA MOLECULE: DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHH.lLLLEEHHhhhhhhllLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYL.sDKPLTISdixeelkiSKGNVS   59
ident                            | |    |                         
Sbjct .........acegapevrigrkpvMNYVLAILTTLMEqgTNQVVVK....argrNINRAV   47
DSSP  .........lllllleeelllllhHHHHHHHHHHHLLllLLEEEEE....eellHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLL..lEEEEL....................lllllllEEEELLHHHhhhhhh
Query XSLKKLEELG..fVRKVW....................ikgerknYYEAVDGFSsikdia   97
ident                                                |            
Sbjct DAVEIVRKRFaknIEIKDikidsqeievqtpegqtrtrrvssieiCLEKAGESA......  101
DSSP  HHHHHHHHHLlllEEEEEeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeEEEELLLLL......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query krkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld  151
ident                                                       
Sbjct ......................................................  101
DSSP  ......................................................


No 249: 2EUFA MOLECULE: VIRAL CYCLIN;

DSSP  .........LLHHHHHHHHHH.......................................
Query .........XIIXEEAKKLII.......................................   12
ident                                                             
Sbjct lnrakidstTMKDPRVLNNLKlrelllpkftslweiqtevtvdnrtilltwmhllcesfe   60
DSSP  leellllhhHHLLHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct ldksvfplsvsildrylckkqgtkktlqkigaacvligskirtvkpmtvskltylsftnl  120
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllllhh


DSSP  ..................hHHHH................................hhhhl
Query ..................eLFSE................................lakih   22
ident                                                             
Sbjct elinqekdilealkwdteaVLATdfliplcnalkipedlwpqlyeaasttickaliqpni  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllLLHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh


DSSP  LLLHhhHHHH.........hhhhhlLLLE..EHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLle
Query GLNKsvGAVY.........ailylsDKPL..TISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGfv   71
ident  |                         |      |    |  |   |        |    
Sbjct ALLS..PGLIcaggllttietdntnCRPWtcYLEDLSSILNFSTNTVRTVKDQVSEAF..  236
DSSP  HHLL..HHHHhhhhhhhhhhlllllLLLLhhHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH..


DSSP  eeelllllllleeeellhhhhhhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
Query rkvwikgerknyyeavdgfssikdIAKRKHdliaktyedlkkleekcneeekefikqkik  131
ident                                                             
Sbjct ......................slYDLEIL..............................  244
DSSP  ......................hlLLHHHL..............................


DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gierxkkisekilealndld  151
ident                     
Sbjct ....................  244
DSSP  ....................


No 250: 2DI4A MOLECULE: CELL DIVISION PROTEIN FTSH HOMOLOG;

DSSP  .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................lLHHHHHHHHHH
Query .XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHG........................lNKSVGAVYAIL   35
ident      |  |  | |    |                                  |   |  
Sbjct tISPKEKEKIAIHEAGHALMGLVSddddkvhkisiikhiydkkdlynkiLVLLGGRAAEE   60
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllleelllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLeehhhhhHHHLLlhHHHH....................................
Query YLSDKPltisdixEELKIskGNVS....................................   59
ident     |                                                       
Sbjct VFFGKD....gitTGAENdlQRATdlayrmvsmwgmsdkvgpiairrtavdtspdllrei  116
DSSP  HHHHHH....hllHHHHHhhHHHHhhhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ......hhhHHHHhllleeeelllllllleeeeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ......xslKKLEelgfvrkvwikgerknyyeaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkk  113
ident             |                                               
Sbjct deevkriitEQYE..............kakaivEEYKE......................  140
DSSP  hhhhhhhhhHHHH..............hhhhhhHHLHH......................


DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHHH.....hll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilEALN.....dld  151
ident                                            
Sbjct .......plkavvkklleketitceefvevfKLYGielkdkck  176
DSSP  .......hhhhhhhhhhhhleelhhhhhhhhHHHLllllllll


No 251: 2DH4A MOLECULE: YPL069C;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeELKISKGNVSX   60
ident                                                      |  | | 
Sbjct ..................................tknkmeakidelinnDPVWSSQNESL   26
DSSP  ..................................lhhhhhhhhhhhhllLLLLLHHHHHH


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   60
ident                                                             
Sbjct iskpynhillkpgknfrlnlivqinrvmnlpkdqlaivsqivellhnsslliddiednap   86
DSSP  hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ...........hhhhhhhllleeeelllllllleeeeLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...........slkkleelgfvrkvwikgerknyyeaVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYE  109
ident                                                             
Sbjct lrrgqttshlifgvpstintanymyframqlvsqlttKEPLYHNLITIFNEELINLHRGQ  146
DSSP  eelleelhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLL.lLHHH.HHHHHHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHLL...............
Query DLKKLEEKCNE.eEKEF.IKQKIKGI.ERXKKISEKILEALNDLD...............  151
ident  |                                   |                      
Sbjct GLDIYWRDFLPeiIPTQeMYLNMVMNkTGGLFRLTLRLMEALSPSshhghslvpfinllg  206
DSSP  HHHHHHHHLLLllLLLHhHHHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct iiyqirddylnlkdfqmssekgfaeditegklsfpivhalnftktkgqteqhneilrill  266
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  151
ident                                                             
Sbjct lrtsdkdiklkliqilefdtnslaytknfinqlvnmikndnenkylpdellyiidhlsel  326
DSSP  hllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhlhhhl


No 252: 2CSOA MOLECULE: PLECKSTRIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLH...hhhhhHHHHH....HLLL............L
Query xiixeeakkliielfselakihGLNK...svgavYAILY....LSDK............P   41
ident                                   |                         
Sbjct .............gssgssgrsIRLPetidlgalYLSMKdtekGIKElnlekdkkifnhC   47
DSSP  .............lllllllllLLLLllllhhhhHHHHHllllLLLLeeeeelleeeeeE


DSSP  EEHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL..............llllLL
Query LTISDIXEELK.....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI..............kgerKN   82
ident  |       |                  |   |                           
Sbjct FTGNCVIDWLVsnqsvRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDmsksavdgtaenpfldnpDA  107
DSSP  EEHHHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEELHhhhhhhhlllllllllllLL


DSSP  EEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query YYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek  142
ident  |   |                                                      
Sbjct FYYFPD.................................................sgffc  118
DSSP  EEELLL.................................................lllle


DSSP  hhhhhhhll
Query ilealndld  151
ident          
Sbjct eensgpssg  127
DSSP  eelllllll


No 253: 1ZH5A MOLECULE: LUPUS LA PROTEIN;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLL.HHHHHHHHHHHHL..................llL
Query xiixeeakkliielfselakIHGLN.KSVGAVYAILYLS..................dkP   41
ident                                   | |                       
Sbjct ..................gdNEKXAaLEAKICHQIEYYFgdfnlprdkflkeqikldegW   42
DSSP  ..................lhHHHHHhHHHHHHHHHHHHLllllhhhlhhhhhhhlllllL


DSSP  EEHHHHHHH.....hlLLHHHHHHHHHHHhHLLLEEEElllllllLEEEellhhhhhhhh
Query LTISDIXEE.....lkISKGNVSXSLKKLeELGFVRKVwikgerkNYYEavdgfssikdi   96
ident                          | |                                
Sbjct VPLEIXIKFnrlnrltTDFNVIVEALSKS.KAELXEIS....edkTKIR...........   86
DSSP  EEHHHHLLLhhhhhhlLLHHHHHHHHHLL.LLLLEEEL....lllLEEE...........


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHH.............
Query akrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkKISEKI.............  143
ident                                                             
Sbjct ..........................rspskplpevtdeykNDVKNRsvyikgfptdatl  120
DSSP  ..........................ellllllllllhhhhHHHHLLeeeeelllllllh


DSSP  ...................................HHHHHHLL.................
Query ...................................LEALNDLD.................  151
ident                                                             
Sbjct ddikewledkgqvlniqxrrtlhkafkgsifvvfdSIESAKKFvetpgqkyketdllilf  180
DSSP  hhhhhhhllllleeeeeeeellllleeeeeeeeelLHHHHHHHhllllleelleeleeee


DSSP  .....
Query .....  151
ident      
Sbjct kddyf  185
DSSP  hhhll


No 254: 1REPC MOLECULE: DNA (5'-

DSSP  llhHHHHhhhhhhhhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHLL...........LLEEHHHHHH
Query xiiXEEAkkliielfselakihglnksvGAVYAILYLSD...........KPLTISDIXE   49
ident                                                            |
Sbjct .spRIVQ..........sndlteaayslSRDQKRMLYLFvdqirkshdgiCEIHVAKYAE   49
DSSP  .llEEEE..........lhhhhhlllllLHHHHHHHHHHhhhhhllllleEEEEHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHHHLL...............leEEELLllllLLEEEELL......
Query ELKISKGNVSXSLKKLEELG...............fvRKVWIkgerKNYYEAVD......   88
ident          |                                       |          
Sbjct IFGLTSAEASKDIRQALKSFagkevvfyesfpwfikpAHSPS....RGLYSVHInpylip  105
DSSP  HLLLLHHHHHHHHHHHHHLLllleeellleeelllllLEEEE....LLEEEEELlhhhhh


DSSP  ............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhh
Query ............gfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierx  136
ident                                                             
Sbjct ffiglqnrftqfrlsetkeitnpyamrlyeslcqyrkpdgsgivslkidwiieryqlpqs  165
DSSP  hhllllllleeeehhhhlllllhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeehhhhhhhllllhh


DSSP  hHHHHHHHHHH.HHLL.................................
Query kKISEKILEAL.NDLD.................................  151
ident                                                  
Sbjct yQRMPDFRRRFlQVCVneinsrtpmrlsyiekkkgrqtthivfsfrdit  214
DSSP  hHLHHHHHHHLhHHHHhhhhhhlleeeeeeeeelllleeeeeeeeeell


No 255: 1NEXA MOLECULE: CENTROMERE DNA-BINDING PROTEIN COMPLEX CBF3

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhHHHH..........................LLLLHHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKI..........................HGLNKSVGAVYAI   34
ident                                                     ||      
Sbjct ............snvvlVSGEgerftvdkkiaerslllknylivxpvPNVRSSVLQKVIE   48
DSSP  ............leeeeELLLlleeeeehhhhlllhhhhhllleeelLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLL......leEHHHHHHhhlLLHHHHHHHHHHHHHLLL..EEEElllllllleeee
Query LYLSDK......plTISDIXEelkISKGNVSXSLKKLEELGF..VRKVwikgerknyyea   86
ident                                        |                    
Sbjct WAEHHRdsnfpvdsWDREFLK...VDQEXLYEIILAANYLNIkpLLDA.......gckvv   98
DSSP  HHHHLLlllllllhHHHHHLL...LLHHHHHHHHHHHHHHLLhhHHHH.......hhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query vdgfssikdiakrkhdliaktyedLKKLEEKcneeekefikqkikgierxkkisekilea  146
ident                                                             
Sbjct aexirgrspeeirrtfnivndftpEEEAAIR.............................  129
DSSP  hhhhllllhhhhhhhhlllllllhHHHHLLL.............................


DSSP  hhhll
Query lndld  151
ident      
Sbjct .....  129
DSSP  .....


No 256: 2NRJA MOLECULE: HBL B PROTEIN;

DSSP  llhHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhHHHHlllleehhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiiXEEAKKLIielfselakihglnksvgavyaILYLsdkpltisdixeelkiskgnvsx   60
ident      |                                                      
Sbjct ...LSEIEQTN......................NGDT.......................   12
DSSP  ...LLLLLLLL......................LHHH.......................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllleeeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE  120
ident                                        |  | ||          |   
Sbjct .........................alSANEARXKETLQKAGLFAKSXNAYSYXLIKNPD   47
DSSP  .........................llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  L...........................................................
Query E...........................................................  121
ident                                                             
Sbjct Vnfegitingyvdlpgrivqdqknarahavtwdtkvkkqlldtlngiveydttfdnyyet  107
DSSP  Lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  121
ident                                                             
Sbjct xveaintgdgetlkegitdlrgeiqqnqkyaqqlieeltklrdsighdvrafgsnkellq  167
DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  121
ident                                                             
Sbjct silknqgadvdadqkrleevlgsvnyykqlegfnvxkgailglpiiggiivgvardnlgk  227
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhhlhhhlhhhlllllhhhllleeeeeellleeeeeehhhhhh


DSSP  ...................LHHH.HHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL..........
Query ...................EKEF.IKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD..........  151
ident                             |             |                 
Sbjct lepllaelrqtvdykvtlnRVVGvAYSNINEXHKALDDAINALTYXSTQWhdldsqysgv  287
DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhh


DSSP  ...................................................
Query ...................................................  151
ident                                                    
Sbjct lghienaaqkadqnkfkflkpnlnaakdswktlrtdavtlkegikelkvet  338
DSSP  hhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleel


No 257: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHH.LLLL....EEHHHHHHHHLLL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKIS   54
ident                       |       ||               |    |       
Sbjct .....................GGRTaRIREAVLLAAGDaLAADgfdaLDLGEIARRAGVG   39
DSSP  .....................LHHHhHHHHHHHHHHHHhHHHHlhhhLLHHHHHHHHLLL


DSSP  HHHHHHHHH.hhhhLLLEeeelllllllleeeeLLHHH......................
Query KGNVSXSLK.kleeLGFVrkvwikgerknyyeaVDGFS......................   91
ident |  |                                                        
Sbjct KTTVYRRWGtpgglAADL...............LADXAeqslpradtgaleedlranarl   84
DSSP  HHHHHHHHLlhhhhHHHH...............HHHHHhhlllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................HHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query .............................SIKDIAKrkhdliaktyedlkkleekcneee  122
ident                                                             
Sbjct vvrtlddprqgrlfraliaaslcneqaaeALHRFYA........................  120
DSSP  hhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHH........................


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH....................................
Query kefikqkikgierxkkisekILEA....................................  146
ident                       |                                     
Sbjct ..................vrVDEWagcvrdavargevpdgtdphgvvaavsaplyyalln  162
DSSP  ..................hhHHHHhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ........................hhhll
Query ........................lndld  151
ident                              
Sbjct tgrslteadadraaraastaaragvwvtg  191
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 258: 2CW7A MOLECULE: ENDONUCLEASE PI-PKOII;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct silpeewlpvleegevhfvrigelidrmmeenagkvkregetevlevsglevpsfnrrtn   60
DSSP  lllllleeeeeelleeeeeehhhhhhhhhhllhhhleellleeeeellleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kaelkrvkalirhdysgkvytirlksgrrikitsghslfsvrngelvevtgdelkpgdlv  120
DSSP  leeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellleeeeelllleeeeellllllllee


DSSP  ....................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHlll
Query ....................xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLsdk   40
ident                                              |              
Sbjct avprrlelpernhvlnlvelllgtpeeetldivmtipvkgKKNFFKGMLRTLRWIFG...  177
DSSP  eeelllllllllleeehhhhhhlllhhhhlleeeeeelllLLLHHHHHHHHHHHHLL...


DSSP  leehhhhhhHHLLlhhHHHHHHHHHHHLLLEEEELllllllLEEEELLHHH.........
Query pltisdixeELKIskgNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFS.........   91
ident                      |  || || ||           ||  |  |         
Sbjct .......eeKRPR...TARRYLRHLEDLGYVRLKK......IGYEVLDWDSlknyrrlye  221
DSSP  .......llLLLL...LHHHHHHHHHHLLLEEELL......LLEEELLHHHhhhhhhhhh


DSSP  .........................hhHHHH............hhhhhHHHHH.......
Query .........................siKDIA............krkhdLIAKT.......  107
ident                                                             
Sbjct alvenvryngnkreylvefnsirdavgIMPLkelkewkigtlngfrmrKLIEVdeslakl  281
DSSP  hhhhhleeelllleeeeehhhhlllhhHLLHhhhllleeeelllleeeLEEELlhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  107
ident                                                             
Sbjct lgyyvsegyarkqrnpkngwsysvklynedpevlddmerlasrffgkvrrgrnyveipkk  341
DSSP  hhhhhhheeeeeellllllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhllleelllleeellh


DSSP  ....................hhhhhHHHHhllllLHHHHH....................
Query ....................yedlkKLEEkcneeEKEFIK....................  127
ident                                                             
Sbjct igyllfenmcgvlaenkripefvftSPKG..vrlAFLEGYfigdgdvhpnkrlrlstkse  399
DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhllllhhhhhLLHH..hhhHHHHHHhhhllllllllleeeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  127
ident                                                             
Sbjct llanqlvlllnsvgvsavklghdsgvyrvyineelpfvkldkkknayyshvipkevlsev  459
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllleeeellllleeeeellllllllllllllllhhhlllhhhhhhh


DSSP  ......................................................hhhhhh
Query ......................................................qkikgi  133
ident                                                             
Sbjct fgkvfqknvspqtfrkmvedgrldpekaqrlswliegdvvldrvesvdvedydgyvydls  519
DSSP  hlllllllllhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlleeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhll
Query erxkkisekilealndld  151
ident                   
Sbjct vednenflvgfglvyahn  537
DSSP  elllleeeelllleeeel


No 259: 2BYVE MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct wiacldkrplerssedvdiiftrlkgvkafekfhpnllrqiclcgyyenlekgitlfrqg   60
DSSP  lhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct digtnwyavlagsldvkvsetsshqdavtictlgigtafgesildntprhativtresse  120
DSSP  lllleeeeeeelleeeeelllllhhhleeeeeelllleelhhhhhlllllleeeelllee


DSSP  ...............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHLLL.....
Query ...............xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailYLSDK.....   40
ident                                                             
Sbjct llrieqedfkalwekyrqymagllappygvmetgsnnvpsekilragkilRIAILsraph  180
DSSP  eeeeehhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhHHHHHhhlhh


DSSP  ..............LEEHHHHHHHHL......lLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL...ll
Query ..............PLTISDIXEELK......iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVW...ik   77
ident                                  |          | | |    |      
Sbjct mirdrkyhlktyrqCCVGTELVDWMIqqtscvhSRTQAVGMWQVLLEDGVLNHVDqerhf  240
DSSP  hleeeeelleeeeeEEEHHHHHHHHHhllllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLlllll


DSSP  lllLLEEEELL.................................................
Query gerKNYYEAVD.................................................   88
ident       |   |                                                 
Sbjct qdkYLFYRFLDderedaplpteeekkecdeelqdtmlllsqmgpdahmrmilrkppgqrt  300
DSSP  lllLLEEEEHHhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhll


DSSP  ........................hhhhhhhhhhHHHH......................
Query ........................gfssikdiakRKHD......................  102
ident                                     |                       
Sbjct vddleiiydellhikalshlsttvkrelagvlifESHAkggtvlfnqgeegtswyiilkg  360
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhllllhhhhhhhlllleeEEELlllleeellllllleeeeeeel


DSSP  .............hhhhhhHHHHhHHHHLLlllhhHHHHHhhhHLHHhHHHH........
Query .............liaktyEDLKkLEEKCNeeekeFIKQKikgIERXkKISE........  141
ident                       | |                  |                
Sbjct svnvviygkgvvctlhegdDFGK.LALVND....aPRAAS...IVLR.EDNChflrvdke  411
DSSP  leeeeellleeeeeellllEELH.HHHLLL....lLLLLE...EEEL.LLLEeeeeeehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct dfnrilrdveantvrlkehdqdvlvlekvpaqqkytvmsgtpekilehfletirlepsln  471
DSSP  hhhhhhhhhhlleeeeelllleeeeeeelllllleeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct eatdsvlndfvmmhcvfmpntqlcpalvahyhaqpsqgteqermdyalnnkrrvirlvlq  531
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct waamygdllqeddvamafleefyvsvsddarmmaafkeqlpelekivkkrqpirgsdevl  591
DSSP  hhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhlllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct fkvycidhtyttirvpvaasvkevisavadklgsgegliivkmnsggekvvlksndvsvf  651
DSSP  eellllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhllllllllleeellllleeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct ttltingrlfasltplpeqegpttgtvgtfelmsskdlayqmttydwelfncvheleliy  711
DSSP  llllllleeellllllhhhhllllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct htfgrhnfkkttanldlflrrfneiqfwvvtevclcsqlskrvqllkkfikiaahckeyk  771
DSSP  hhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct nlnsffaivmglsnvavsrlaltweklpskfkkfyaefeslmdpsrnhrayrltaaklep  831
DSSP  lhhhhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  141
ident                                                             
Sbjct plipfmpllikdmtfthegnktfidnlvnfekmrmiantartvryyrsqpfnpdaaqank  891
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  .....................hhhhhhhhll
Query .....................kilealndld  151
ident                                
Sbjct nhqdvrsyvrqlnvidnqrtlsqmshrlepr  922
DSSP  llhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlll