DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1KU9B
MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1KU9-A 22.1 0.3 151 151 100 HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223; "
2: 1SFX-A 11.6 2.5 90 109 22 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008; "
3: 2P4W-A 10.5 3.3 86 197 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY; "
4: 1QBJ-A 10.3 1.6 61 65 16 PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE "
5: 2NYX-A 10.1 10.0 82 146 11 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN, "
6: 2HEO-A 10.1 1.4 58 59 14 Z-DNA BINDING PROTEIN 1; "
7: 1SFU-A 10.1 2.3 65 70 17 34L PROTEIN; "
8: 1R1U-A 9.8 2.0 66 94 23 REPRESSOR PROTEIN; "
9: 2NNN-A 9.7 1.8 69 134 12 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
10: 2FE3-A 9.7 6.0 83 141 19 PEROXIDE OPERON REGULATOR; "
11: 1Q1H-A 9.7 2.5 75 85 29 TRANSCRIPTION FACTOR E; "
12: 2NR3-A 9.6 5.9 84 168 23 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
13: 1SD4-A 9.5 9.2 79 122 13 PENICILLINASE REPRESSOR; "
14: 1LVA-A 9.3 11.8 81 258 14 SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR; "
15: 1LNW-A 9.3 10.0 73 141 15 MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR; "
16: 2OQG-A 9.2 4.5 85 109 18 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY "
17: 2DK5-A 9.2 1.5 68 91 18 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA "
18: 2G9W-A 9.0 5.1 91 119 16 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
19: 2DK8-A 9.0 3.8 67 81 12 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA "
20: 1R1T-A 9.0 2.1 66 98 24 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR SMTB; "
21: 2HZT-A 8.9 3.2 73 98 16 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YTCD; "
22: 2HOE-A 8.9 10.0 91 354 15 N-ACETYLGLUCOSAMINE KINASE; "
23: 2O03-A 8.8 8.5 80 129 15 PROBABLE ZINC UPTAKE REGULATION PROTEIN FURB; "
24: 1YYV-A 8.8 2.4 67 114 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
25: 1MZB-A 8.8 6.5 84 133 13 FERRIC UPTAKE REGULATION PROTEIN; "
26: 1HST-A 8.8 1.9 62 74 11 HISTONE H5; "
27: 2FXA-A 8.7 1.8 64 156 23 PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR; "
28: 2D1H-A 8.7 4.2 93 102 24 109AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL "
29: 1P4X-A 8.7 2.9 80 250 16 STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A HOMOLOGUE; "
30: 1MKM-A 8.7 6.1 77 246 19 ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
31: 1JGS-A 8.7 9.4 73 138 14 MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR; "
32: 2ETH-A 8.6 10.5 80 141 18 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE, MAR FAMILY; "
33: 1Z1D-A 8.6 1.8 64 69 17 REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT; "
34: 2CWE-A 8.4 6.6 104 191 14 HYPOTHETICAL TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN, "
35: 2OBP-A 8.3 2.8 68 81 12 PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN; "
36: 1XN7-A 8.2 1.9 61 78 16 HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG; "
37: 2IA2-A 8.1 9.5 100 250 15 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
38: 2F2E-A 8.1 8.1 82 142 12 PA1607; "
39: 1Z05-A 8.1 8.7 102 396 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY; "
40: 1XMK-A 8.1 3.3 70 79 9 DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE; "
41: 1W1W-E 8.1 2.8 63 70 13 STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1; "
42: 1J5Y-A 8.1 3.5 73 172 19 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR "
43: 2FBH-A 8.0 4.4 77 137 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA3341; "
44: 2E1N-A 8.0 2.2 67 110 19 PEX; "
45: 1Z7U-A 8.0 10.0 78 111 13 HYPOTHETICAL PROTEIN EF0647; "
46: 1S3J-A 8.0 9.4 76 143 16 YUSO PROTEIN; "
47: 1LJ9-A 8.0 8.4 72 144 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA; "
48: 2GXG-A 7.9 9.0 76 140 20 146AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL "
49: 2FSW-A 7.9 2.1 67 102 13 PG_0823 PROTEIN; "
50: 1U2W-A 7.9 2.2 63 105 21 CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN; "
51: 1BIA-A 7.9 7.1 95 292 12 BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN; "
52: 2FA5-A 7.8 1.7 64 139 22 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY; "
53: 2A61-A 7.8 10.5 85 142 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TM0710; "
54: 2BV6-A 7.7 2.5 69 137 20 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MGRA; "
55: 1JHF-A 7.7 3.2 71 197 17 LEXA REPRESSOR; "
56: 2NS0-A 7.6 2.5 62 85 13 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
57: 2HR3-A 7.6 11.5 78 139 12 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
58: 2FRH-A 7.6 3.4 77 127 13 STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A; "
59: 1Z91-A 7.6 2.8 73 137 15 ORGANIC HYDROPEROXIDE RESISTANCE TRANSCRIPTIONAL "
60: 1XMA-A 7.6 2.6 66 101 14 PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
61: 1TQI-A 7.6 3.1 77 269 12 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
62: 1T6S-A 7.6 2.8 69 162 19 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
63: 2HTJ-A 7.5 3.2 71 81 14 P FIMBRIAL REGULATORY PROTEIN KS71A; "
64: 2ESH-A 7.5 9.2 68 114 22 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN TM0937; "
65: 1UCR-A 7.5 2.1 63 74 13 PROTEIN DSVD; "
66: 1UB9-A 7.5 5.7 72 100 18 HYPOTHETICAL PROTEIN PH1061; "
67: 1U5T-A 7.5 3.0 71 213 13 APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7; "
68: 1STZ-A 7.5 10.9 91 323 18 HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA "
69: 1TBX-A 7.4 1.8 62 94 18 HYPOTHETICAL 11.0 KDA PROTEIN; "
70: 1P6R-A 7.4 2.6 69 82 16 PENICILLINASE REPRESSOR; "
71: 1YG2-A 7.3 10.6 71 169 21 GENE ACTIVATOR APHA; "
72: 1W7P-D 7.3 2.8 69 171 10 VPS22, YPL002C; "
73: 2FBI-A 7.2 1.8 71 136 21 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
74: 2CO5-A 7.2 2.0 64 92 13 VIRAL PROTEIN F93; "
75: 1ZG3-A 7.2 4.9 86 358 20 ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE; "
76: 1KGS-A 7.2 4.7 70 219 17 DNA BINDING RESPONSE REGULATOR D; "
77: 1FT9-A 7.2 2.7 66 210 12 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
78: 1X19-A 7.1 8.6 86 350 7 CRTF-RELATED PROTEIN; "
79: 1IN4-A 7.1 3.0 68 298 12 HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB; "
80: 2H09-A 7.0 6.2 74 127 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR; "
81: 1W5S-A 7.0 2.1 66 390 11 ORC2; "
82: 1CF7-A 7.0 1.9 58 67 17 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
83: 1Y0U-A 6.9 2.2 56 89 23 ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE; "
84: 1P2F-A 6.9 3.5 72 217 19 RESPONSE REGULATOR; "
85: 1FP1-D 6.9 4.0 83 341 13 ISOLIQUIRITIGENIN 2'-O-METHYLTRANSFERASE; "
86: 1YLF-A 6.8 4.9 88 117 14 RRF2 FAMILY PROTEIN; "
87: 1ODD-A 6.8 2.6 68 100 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN OMPR; "
88: 1O57-A 6.8 5.2 80 270 9 PUR OPERON REPRESSOR; "
89: 1FX7-A 6.8 7.3 70 230 16 IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER; "
90: 2JSC-A 6.7 5.2 70 96 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050; "
91: 2CGP-A 6.7 2.6 72 200 15 PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN); "
92: 1I1S-A 6.7 2.3 69 96 13 MOTA; "
93: 2HS5-A 6.6 4.9 85 207 13 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR GNTR; "
94: 2CMX-A 6.5 2.5 60 70 27 HYPOTHETICAL 13.2 KDA PROTEIN; "
95: 1UST-A 6.5 3.1 61 92 11 HISTONE H1; "
96: 2COH-A 6.4 2.4 70 194 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
97: 2PG4-A 6.3 1.9 67 92 12 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
98: 2GAI-A 6.3 3.1 68 581 15 DNA TOPOISOMERASE I; "
99: 2C6Y-A 6.3 2.3 63 98 13 INTERLEUKIN 2 PROMOTOR; "
100: 2CFX-A 6.2 5.8 64 140 17 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC; "
101: 1U6G-A 6.2 10.4 86 715 9 CULLIN HOMOLOG 1; "
102: 1OYI-A 6.2 2.0 54 62 15 DOUBLE-STRANDED RNA-BINDING PROTEIN; "
103: 1GXP-A 6.2 3.8 72 103 11 5'-D(*GP*AP*GP*CP*TP*GP*TP*CP*AP*TP* "
104: 1CY0-A 6.2 2.6 64 534 9 DNA TOPOISOMERASE I; "
105: 2IA0-A 6.1 8.5 85 156 24 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
106: 1LDD-A 6.1 2.2 58 74 17 ANAPHASE PROMOTING COMPLEX; "
107: 1E17-A 6.1 3.3 65 90 14 AFX; "
108: 2IXS-A 6.0 8.7 102 319 12 SDAI RESTRICTION ENDONUCLEASE; "
109: 1FNN-A 6.0 2.5 67 379 16 CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 6; "
110: 1BM9-A 6.0 8.1 71 120 15 REPLICATION TERMINATOR PROTEIN; "
111: 2HWV-A 5.9 2.7 67 101 10 DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR VICR; "
112: 2DBB-A 5.9 6.6 65 146 23 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
113: 1OYW-A 5.9 2.9 65 516 9 ATP-DEPENDENT DNA HELICASE; "
114: 1I1G-A 5.9 10.0 63 140 21 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA; "
115: 1GKU-B 5.9 2.5 60 1011 13 REVERSE GYRASE; "
116: 2P6R-A 5.8 8.6 103 683 8 AFUHEL308 HELICASE; "
117: 2O0Y-A 5.8 11.1 95 242 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
118: 2HYE-C 5.8 11.3 90 719 9 DNA DAMAGE-BINDING PROTEIN 1; "
119: 1NHA-A 5.8 2.6 55 67 20 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF, ALPHA "
120: 2FNA-A 5.7 2.7 65 352 20 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
121: 2FBK-A 5.7 2.2 67 156 18 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, MARR FAMILY; "
122: 1B4A-A 5.7 8.0 86 146 13 ARGININE REPRESSOR; "
123: 2EV0-A 5.6 10.4 70 131 17 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR; "
124: 2DI3-A 5.6 4.7 81 231 16 BACTERIAL REGULATORY PROTEINS, GNTR FAMILY; "
125: 2GWR-A 5.5 3.4 68 225 15 DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR MTRA; "
126: 1I7D-A 5.5 2.8 67 620 16 DNA TOPOISOMERASE III; "
127: 1E2X-A 5.5 5.7 103 222 6 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
128: 2GAU-A 5.4 2.7 74 218 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY; "
129: 2FOK-A 5.4 4.3 67 558 18 FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE; "
130: 2CG4-A 5.4 10.6 65 150 11 REGULATORY PROTEIN ASNC; "
131: 1WY0-A 5.3 11.2 80 327 6 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
132: 2FYN-A 5.2 7.0 79 428 8 CYTOCHROME B; "
133: 1WI9-A 5.2 3.0 61 72 11 PROTEIN C20ORF116 HOMOLOG; "
134: 1WFX-A 5.2 4.4 76 180 12 PROBABLE RNA 2'-PHOSPHOTRANSFERASE; "
135: 1UFM-A 5.2 5.6 67 84 7 COP9 COMPLEX SUBUNIT 4; "
136: 1R7J-A 5.2 10.0 63 90 13 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A; "
137: 2OD5-A 5.1 3.4 62 91 15 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
138: 1WJ5-A 5.1 4.7 67 120 12 HYPOTHETICAL PROTEIN (RIKEN CDNA 0610009H20); "
139: 1D8J-A 5.1 3.6 64 81 13 GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA; "
140: 1BBY-A 5.1 2.9 64 69 14 RAP30; "
141: 2P5V-A 5.0 7.0 68 156 21 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY; "
142: 2HKX-A 5.0 3.4 75 218 13 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
143: 2A5Y-B 5.0 3.4 68 501 9 APOPTOSIS REGULATOR CED-9; "
144: 1QZZ-A 5.0 11.7 88 340 7 ACLACINOMYCIN-10-HYDROXYLASE; "
145: 2IP2-A 4.9 9.5 79 330 3 PROBABLE PHENAZINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE; "
146: 2ESN-A 4.9 11.4 79 299 15 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
147: 2B0L-A 4.9 3.2 69 98 19 GTP-SENSING TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC "
148: 1RI7-A 4.9 6.5 65 146 17 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
149: 2QC0-A 4.8 3.6 80 367 13 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
150: 2H6B-A 4.8 2.9 61 239 18 CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K; "
151: 2DU9-A 4.8 6.1 84 116 11 PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATORS; "
152: 1RP3-A 4.8 6.2 54 235 17 RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA); "
153: 1AOY-A 4.8 3.9 59 78 20 ARGININE REPRESSOR; "
154: 1A04-A 4.6 3.1 55 205 13 NITRATE/NITRITE RESPONSE REGULATOR PROTEIN NARL; "
155: 2V1X-A 4.5 4.1 67 527 9 ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1; "
156: 1U5T-C 4.5 9.9 94 178 6 APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7; "
157: 2HGC-A 4.4 3.3 58 78 10 YJCQ PROTEIN; "
158: 1ZYB-A 4.4 2.9 71 230 11 TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY; "
159: 1YIO-A 4.4 2.6 53 198 17 RESPONSE REGULATORY PROTEIN; "
160: 1FSE-A 4.4 2.7 52 67 23 GERE; "
161: 2NOV-A 4.3 6.5 94 440 4 DNA TOPOISOMERASE 4 SUBUNIT A; "
162: 2IJL-A 4.3 8.4 67 110 10 MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR; "
163: 1T98-A 4.3 9.4 91 266 8 CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF; "
164: 2HYD-A 4.1 4.9 61 578 2 ABC TRANSPORTER HOMOLOG; "
165: 2FEZ-A 4.1 12.2 88 373 11 PROBABLE REGULATORY PROTEIN EMBR; "
166: 1W36-D 4.1 13.6 90 538 9 DNA HAIRPIN; "
167: 1S6L-A 4.1 4.3 70 192 9 ALKYLMERCURY LYASE; "
168: 1OR7-A 4.1 3.2 50 181 14 RNA POLYMERASE SIGMA-E FACTOR; "
169: 1L0O-C 4.1 3.3 47 57 13 ANTI-SIGMA F FACTOR; "
170: 2O8X-A 4.0 2.5 45 61 11 PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR; "
171: 2G7H-A 4.0 2.8 56 167 21 METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE "
172: 2GMG-A 3.9 2.8 58 105 14 HYPOTHETICAL PROTEIN PF0610; "
173: 2BS2-C 3.9 5.5 80 254 5 QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A; "
174: 1ZEL-A 3.9 12.1 82 293 12 HYPOTHETICAL PROTEIN RV2827C; "
175: 1S29-A 3.9 4.0 57 92 7 LA PROTEIN; "
176: 1DVE-A 3.9 5.0 65 214 5 HEME OXYGENASE-1; "
177: 2P8T-A 3.8 9.4 64 184 25 HYPOTHETICAL PROTEIN PH0730; "
178: 2IW5-B 3.7 4.2 54 133 6 LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1; "
179: 2HQR-A 3.6 4.8 69 223 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
180: 2DOA-A 3.6 4.4 65 104 11 RNA POLYMERASE II ELONGATION FACTOR ELL; "
181: 2AXL-A 3.6 10.2 74 144 8 WERNER SYNDROME; "
182: 1O7D-C 3.6 1.8 45 150 7 LYSOSOMAL ALPHA-MANNOSIDASE; "
183: 1X3U-A 3.5 2.8 56 79 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN FIXJ; "
184: 2H7O-A 3.4 1.9 45 270 11 PROTEIN KINASE YPKA; "
185: 2EWF-A 3.4 5.6 94 587 15 NICKING ENDONUCLEASE N.BSPD6I; "
186: 1U78-A 3.4 6.6 68 103 9 TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE; "
187: 1RZ4-A 3.4 8.5 71 213 7 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3 "
188: 1R71-A 3.4 9.5 65 114 14 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB; "
189: 1P4W-A 3.4 3.3 54 87 15 RCSB; "
190: 1ZH5-A 3.3 6.2 70 185 4 LUPUS LA PROTEIN; "
191: 2O7T-A 3.2 4.0 60 188 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
192: 2BKN-A 3.2 2.7 52 190 10 HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236; "
193: 1J1J-A 3.2 5.7 71 217 13 TRANSLIN; "
194: 1IXC-A 3.2 11.6 85 289 12 LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN; "
195: 1HBX-G 3.2 6.2 70 112 13 SERUM RESPONSE FACTOR; "
196: 1B9M-A 3.2 7.7 84 258 8 PROTEIN (MODE); "
197: 2OFL-A 3.1 3.2 60 221 12 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
198: 1OTV-A 3.1 3.6 69 254 9 COENZYME PQQ SYNTHESIS PROTEIN C; "
199: 1SFE-A 3.0 2.5 56 165 7 ADA O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE; "
200: 1Q16-C 3.0 6.8 74 224 7 RESPIRATORY NITRATE REDUCTASE 1 ALPHA CHAIN; "
201: 2IPQ-X 2.9 3.3 62 121 10 HYPOTHETICAL PROTEIN STY4665; "
202: 2GA1-A 2.9 2.7 46 101 11 PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION DUF433; "
203: 2BYV-E 2.9 5.7 79 922 9 RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4; "
204: 2BDP-A 2.9 5.4 72 580 7 PROTEIN (DNA POLYMERASE I); "
205: 1V3F-A 2.9 3.6 71 120 14 PLECKSTRIN 2; "
206: 1L8Q-A 2.9 3.4 60 321 12 CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA; "
207: 2FQ3-A 2.8 3.2 54 85 7 TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3; "
208: 1W9C-A 2.8 2.3 51 321 8 CRM1 PROTEIN; "
209: 1V4R-A 2.8 4.2 60 100 10 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR; "
210: 1REP-C 2.8 3.4 74 214 15 DNA (5'- "
211: 1MJG-A 2.8 5.4 82 672 4 CARBON MONOXIDE DEHYDROGENASE BETA SUBUNIT; "
212: 1MGT-A 2.8 2.2 57 169 18 PROTEIN (O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE); "
213: 1KA8-A 2.8 3.7 59 100 7 PUTATIVE P4-SPECIFIC DNA PRIMASE; "
214: 1K78-A 2.8 6.3 72 124 17 PAIRED BOX PROTEIN PAX5; "
215: 1HKQ-A 2.8 3.4 67 125 10 REPLICATION PROTEIN; "
216: 1D8Y-A 2.8 13.5 75 601 7 DNA POLYMERASE I; "
217: 2OF7-A 2.7 6.9 83 191 13 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
218: 2O3F-A 2.7 3.1 53 83 11 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH; "
219: 1WRJ-A 2.7 2.2 54 150 17 METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE "
220: 1TRO-A 2.7 2.5 42 104 10 PROTEIN (TRP REPRESSOR); "
221: 1PP8-F 2.7 3.8 69 113 7 39 KDA INITIATOR BINDING PROTEIN; "
222: 1O4X-A 2.7 3.0 41 127 15 TRANSCRIPTION FACTOR OCT-1; "
223: 1JKU-A 2.7 1.6 51 266 2 PSEUDOCATALASE; "
224: 1BGW-A 2.7 3.2 82 679 7 TOPOISOMERASE; "
225: 2DT5-A 2.6 10.0 79 210 6 AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN; "
226: 2CW7-A 2.6 4.9 69 537 19 ENDONUCLEASE PI-PKOII; "
227: 2CU7-A 2.6 4.9 56 72 7 KIAA1915 PROTEIN; "
228: 1K6Y-A 2.6 11.6 56 192 5 POL POLYPROTEIN; "
229: 2PFT-A 2.5 2.8 44 519 2 EXOCYTOSIS PROTEIN; "
230: 2NTZ-A 2.5 8.2 66 183 11 PARB; "
231: 2CWL-A 2.5 5.0 57 299 5 MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE; "
232: 2CSO-A 2.5 3.0 57 127 12 PLECKSTRIN; "
233: 1D3U-B 2.5 3.5 68 201 9 TATA-BINDING PROTEIN; "
234: 1AB4-A 2.5 4.5 95 477 6 GYRASE A; "
235: 2V1D-A 2.4 10.6 103 666 15 LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1; "
236: 2NRA-C 2.4 6.5 80 252 14 PI PROTEIN; "
237: 2ID3-A 2.4 4.0 60 191 13 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
238: 2IAI-A 2.4 3.9 66 200 8 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833; "
239: 2DAO-A 2.4 3.4 63 118 10 TRANSCRIPTION FACTOR ETV6; "
240: 2B9R-A 2.4 4.9 71 254 10 HUMAN CYCLIN B1; "
241: 1VIN-A 2.4 4.9 70 252 11 CYCLIN A; "
242: 1T33-A 2.4 4.0 61 220 8 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR "
243: 1OMI-A 2.4 2.7 63 224 13 LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN; "
244: 1N52-A 2.4 5.7 66 732 5 80 KDA NUCLEAR CAP BINDING PROTEIN; "
245: 1MSZ-A 2.4 3.1 45 62 13 DNA-BINDING PROTEIN SMUBP-2; "
246: 1EYS-M 2.4 11.5 71 318 3 PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER; "
247: 1DE4-C 2.4 8.6 74 635 7 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN; "
248: 1CF7-B 2.4 3.0 54 82 9 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
249: 2H9U-A 2.3 2.9 46 101 11 DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2; "
250: 2GUH-A 2.3 6.5 68 179 12 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
251: 2FUG-2 2.3 4.7 70 178 7 NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1; "
252: 1MNM-C 2.3 3.3 42 77 2 PROTEIN (MCM1 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR); "
253: 1M2V-B 2.3 4.6 81 748 7 PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23; "
254: 1A6I-A 2.3 9.0 75 193 12 TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D; "
255: 2HXJ-A 2.2 6.4 66 116 8 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
256: 2FQ4-A 2.2 5.0 60 184 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
257: 2AXT-D 2.2 3.3 60 340 5 PHOTOSYSTEM Q(B) PROTEIN; "
258: 1WLQ-C 2.2 5.2 82 185 6 GEMININ; "
259: 1HLV-A 2.2 9.3 80 131 11 MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B; "
260: 1GDT-A 2.2 3.2 41 183 22 PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE); "
261: 2NRJ-A 2.1 6.0 76 338 11 HBL B PROTEIN; "
262: 2NPP-B 2.1 3.1 45 388 4 PROTEIN PHOSPHATASE 2, REGULATORY SUBUNIT A (PR "
263: 2IF4-A 2.1 7.6 60 258 3 ATFKBP42; "
264: 2I10-A 2.1 4.6 75 179 8 PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
265: 2DH4-A 2.1 10.8 80 326 5 YPL069C; "
266: 1XME-A 2.1 3.4 67 557 6 CYTOCHROME C OXIDASE POLYPEPTIDE I; "
267: 1NEX-A 2.1 9.9 60 129 7 CENTROMERE DNA-BINDING PROTEIN COMPLEX CBF3 "
268: 1KQ8-A 2.1 3.1 54 75 9 HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 3 FORKHEAD HOMOLOG 1; "
269: 1JBG-A 2.1 8.7 71 106 7 TRANSCRIPTION ACTIVATOR OF MULTIDRUG-EFFLUX "
270: 1IGN-A 2.1 10.4 73 189 8 PROTEIN (RAP1); "
271: 2IBD-A 2.0 10.5 76 192 3 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
272: 2G02-A 2.0 2.3 45 404 4 NISIN BIOSYNTHESIS PROTEIN NISC; "
273: 2D5V-A 2.0 3.0 43 135 9 HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 6; "
274: 1QDM-A 2.0 8.4 66 430 5 PROPHYTEPSIN; "
275: 1Q1V-A 2.0 2.9 42 70 10 DEK PROTEIN; "
-
No 1: 1KU9A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MJ223;
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct XIIXEEAKKLIIELFSELAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE 120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE 120
DSSP HHHHHHHLLLEEEELLLLLLLLEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP LLHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query EEKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD 151
ident |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct EEKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD 151
DSSP LLHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL
No 2: 1SFXA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;
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Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
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Sbjct ......hxsnplgelvkalekLSFKPSDVRIYSLLLER.GGXRVSEIARELDLSARFVRD 53
DSSP ......llllhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
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Query SLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKkleekcn 119
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Sbjct RLKVLLKRGFVRREIVEKgWVGYIYSAEKPEKVLKEFKSSILGEIERIEKXFT....... 106
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DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct .............................dgs 109
DSSP .............................lll
No 3: 2P4WA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;
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Query xiixeeakkliielfsELAKihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
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Query SLKKLEELGFVRKVWIKG...ERKNYYEAVD.GFSS........iKDIA........... 97
ident | ||| | | ||
Sbjct HLRILEEAGLIESRVEKIprgRPRKYYMIKKgLRLEilltptlfgSEMYeakgvrkspey 107
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DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct eqakeliksqepinvkmrelaeflhelnerireiieekreleearilietyientmrrla 167
DSSP hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........hhhhhhhHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query ...........krkhdliAKTYEDLKKLEEkcneeekefikqkikgierxkkisekilea 146
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Sbjct eenrqiieeifrdiekilPPGYARSLKEKF.............................. 197
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DSSP hhhll
Query lndld 151
ident
Sbjct ..... 197
DSSP .....
No 4: 1QBJA MOLECULE: PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE
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Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNV 58
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Sbjct .....................siYQDQEQRILKFLEELGegKATTAHDLSGKLGTPKKEI 39
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Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
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Sbjct NRVLYSLAKKGKLQKEAG...TPPLWKIA............................... 65
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Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................. 65
DSSP .................................
No 5: 2NYXA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,
DSSP .............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHH
Query .............xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDI 47
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Sbjct pataeesvdvitdalltasrllvaisahsiaqvDENITIPQFRTLVILSNH.GPINLATL 59
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Query XEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDG.fssikdiakrkhdliA 105
ident | | | |
Sbjct ATLLGVQPSATGRXVDRLVGAELIDRLPHPTSrRELLAALTKRgrdvvrqvtehrrteiA 119
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DSSP HHHHHHhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query KTYEDLkkleekcneeekefiKQKIKGIerxkkisekilealndld 151
ident | |
Sbjct RIVEQX..............aPAERHGL.....vraltafteagge 146
DSSP HHHHLL..............lHHHHHHH.....hhhhhhhhhhlll
No 6: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;
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Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
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Sbjct ........................DNLEQKILQVLSDDGGPVAIFQLVKKCQVPKKTLNQ 36
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Query SLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
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Sbjct VLYRLKKEDRVSSPS.....PKYWSIG................................. 58
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Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct ..............................g 59
DSSP ..............................l
No 7: 1SFUA MOLECULE: 34L PROTEIN;
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Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNV 58
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Sbjct ...................ctvNDAEIFSLVKKEVLSLNtnDYTTAISLSNRLKINKKKI 41
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Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
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Sbjct NQQLYKLQKEDTVKMVPS...NPPKWFKNYNC............................ 70
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Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................. 70
DSSP .................................
No 8: 1R1UA MOLECULE: REPRESSOR PROTEIN;
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Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV 58
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Sbjct ..........ntdtlervteIFKAlgDYNRIRIMELLSVS..EASVGHISHQLNLSQSNV 48
DSSP ..........lhhhhhhhhhHHHHllLHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
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Sbjct SHQLKLLKSVHLVKAKRQ..GQSMIYSLDDIH............................ 78
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Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct .................vatmlkqaihhanhpk 94
DSSP .................hhhhhhhhhhhhllll
No 9: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLL
Query ......xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKIS 54
ident || | | |
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangIGNGLTPTQWAALVRLGET.GPCPQNQLGRLTAXD 59
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DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkk 113
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Sbjct AATIKGVVERLDKRGLIQRSADPDDgRRLLVSLSPA.......................g 96
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Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct raeleaglaaareinrqalaplslqeqetlrgllarli 134
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlll
No 10: 2FE3A MOLECULE: PEROXIDE OPERON REGULATOR;
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Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.....ISK 55
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Sbjct .......helkealetlketGVRITPQRHAILEYLVNSMAHPTADDIYKALEgkfpnMSV 53
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Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGErKNYYEAVDgfssikdiakrkhDLIA.......... 105
ident | | | | | |
Sbjct ATVYNNLRVFRESGLVKELTYGDA.SSRFDFVT..........sdhYHAIcencgkivdf 102
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DSSP .........................HHHHhhHHHHHHLLlllhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query .........................KTYEdlKKLEEKCNeeekefikqkikgierxkkis 140
ident | |
Sbjct hypgldeveqlaahvtgfkvshhrlEIYG.vCQECSKKE..................... 140
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DSSP hhhhhhhhhll
Query ekilealndld 151
ident
Sbjct ..........n 141
DSSP ..........l
No 11: 1Q1HA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR E;
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Query xiixeeakkliielfsELAKIHgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident ||| | | | || | | | | |
Sbjct .......mvnaedlfiNLAKSL.LGDDVIDVLRILLDKGTEMTDEEIANQLNIKVNDVRK 52
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Query SLKKLEELGFVRKVWIK.GERKNYYEAVdGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident | ||| ||| | |
Sbjct KLNLLEEQGFVSYRKTRsGWFIYYWKPN.IDQIN.......................... 85
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Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct ................................ 85
DSSP ................................
No 12: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
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Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD......KPLTISDIXEELK.. 52
ident || | |||
Sbjct .................naeALQLNSTEVRILGCLIEKQatnpetYPLTLNALVIACNqk 43
DSSP .................lllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhLLEEHHHHHHHHLll
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Query ........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVdGFSSIKDiakrkhdli 104
ident | | || || | | | | |
Sbjct tsrdpvxnLTQGQVGQSLRALEGRGLTRLVXG..SRADRWEHK.VDKGLEL....vpaqv 96
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DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhHHHHHHHHHHHH................
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxKKISEKILEALN................ 148
ident | |
Sbjct iltgllllrgpqtvselltrsnrxhdfedseqVVHQLERLIARGlatlvprqsgqredry 156
DSSP hhhhhhhhhlleehhhhhhhlllllllllhhhHHHHHHHHHHLLleeeelllllllllee
DSSP .........hll
Query .........dld 151
ident
Sbjct xhligdpedlqd 168
DSSP eellllhhhhll
No 13: 1SD4A MOLECULE: PENICILLINASE REPRESSOR;
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Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG 56
ident | | | | | |
Sbjct ....................qVEISXAEWDVXNIIWDK.KSVSANEIVVEIQkykeVSDK 39
DSSP ....................lLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHHllllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEEL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAV.DGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | | |
Sbjct TIRTLITRLYKKEIIKRYKS..ENIYFYSSNiKEDD...ikxktaktflnklyggdxksl 94
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELlLHHH...hhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
DSSP hhlllllhhhhHHHHHHHLHHHHhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefiKQKIKGIERXKKisekilealndld 151
ident |
Sbjct vlnfakneelnNKEIEELRDILN........diskk 122
DSSP hhhhhhlllllHHHHHHHHHHHH........hhlll
No 14: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | |
Sbjct ........................gSPEKILAQIIQEHREGLDWQEAATRASLSLEETRK 36
DSSP ........................lLHHHHHHHHHHLLLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELL................................
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVD................................ 88
ident | | | | |
Sbjct LLQSXAAAGQVTLLRV..ENDLYAISTEryqawwqavtraleefhsryplrpglareelr 94
DSSP HHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEEHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleehhhhh
DSSP ..................hhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhHHHH.................
Query ..................gfssikdiakrkhdlIAKTyeDLKK................. 113
ident |
Sbjct sryfsrlparvyqalleewsregrlqlaantvaLAGF..TPSFsetqkkllkdledkyrv 152
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeELLL..LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..............hhhhllLLLHHH.HHHHHH...........................
Query ..............leekcnEEEKEF.IKQKIK........................... 131
ident | |
Sbjct srwqppsfkevagsfnldpsELEELLhYLVREGvlvkindefywhrqalgeareviknla 212
DSSP hllllllhhhhhhhllllhhHHHHHHhHHHHLLleeellllleeehhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ..........................gierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct stgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn 258
DSSP llllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 15: 1LNWA MOLECULE: MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR;
DSSP ..........llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHH
Query ..........xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEE 50
ident | | | |
Sbjct nypvnpdlxpalxavfqhvrtriqseldcqRLDLTPPDVHVLKLIDEQ.RGLNLQDLGRQ 59
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLLHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHH
DSSP HLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL.LLLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query LKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI.KGERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktye 109
ident | || || | |
Sbjct XCRDKALITRKIRELEGRNLVRRERNpSDQRSFQLFLTDE................glai 103
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLLLEEEEELHH................hhhh
DSSP hhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqKIKGIerxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct hqhaeaixsrvhdelfaplTPVEQ....atlvhlldqclaaq 141
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHH....hhhhhhhhhhhhll
No 16: 2OQGA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | |
Sbjct ......gxtvgtyaelasvfaalSDETRWEILTELGRA..DQSASSLATRLPVSRQAIAK 52
DSSP ......lllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgfSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLeekcne 120
ident | | | | | | | | | | |
Sbjct HLNALQACGLVESVKV..GREIRYRALG..AELNKTARTLERIGAEWDRRLAAI...... 102
DSSP HHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELL..HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......
DSSP llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................kqiaesx 109
DSSP ........................hhhhlll
No 17: 2DK5A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELKISKGNV 58
ident || | | |
Sbjct .......gssgssgdsqnagKMKGsDNQEKLVYQIIEDAGnKGIWSRDVRYKSNLPLTEI 53
DSSP .......lllllllllllllLLLLlLLLHHHHHHHHHHHLlLLEEHHHHHHHLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELL.LLLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWI.KGERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident || || | | |
Sbjct NKILKNLESKKLIKAVKSvAASKKKVYMLYN............................. 84
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEELLlLLLLLLEEEELL.............................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........................lsgpssg 91
DSSP ...........................lllllll
No 18: 2G9WA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK....ISKG 56
ident | || | | | | |
Sbjct ...................kltRLGDLERAVXDHLWSRTEPQTVRQVHEALSarrdLAYT 41
DSSP ...................lhhHLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEHHHHHHHHLllllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELL.HHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVD.GFSSIKDIAKRKHDLiAKTYEdlkkle 115
ident | | | | | | |
Sbjct TVXAVLQRLAKKNLVLQIR.....AHRYAPVHgRDELVAGLXVDALAQ.AEDSG...... 89
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEL.....LLEEEELLlHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHH......
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhLHHHHH....hhhhhhhhHHLL......
Query ekcneeekefikqkikgiERXKKI....sekilealNDLD...... 151
ident
Sbjct ................srQAALVHfvervgadeadaLRRAlaelea 119
DSSP ................hhHHHHHHhhhhllhhhhhhHHHHhhhhhl
No 19: 2DK8A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL.LLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.ISKGNVS 59
ident | | | |
Sbjct ............gssgssgpdadPVEIENRIIELCHQFPHGITDQVIQNEMPhIEAQQRA 48
DSSP ............lllllllllllHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHLLlLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident | | | |
Sbjct VAINRLLSMGQLDLLRS..NTGLLYRIKD............................... 75
DSSP HHHHHHHHHLLEEEEEL..LLLEEEEELL...............................
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLl
Query eeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLd 151
ident
Sbjct .........................sgPSSG. 81
DSSP .........................llLLLL.
No 20: 1R1TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR SMTB;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVS 59
ident | | | | | | ||
Sbjct ....elqaiapevaqslaefFAVLaDPNRLRLLSLLARS..ELCVGDLAQAIGVSESAVS 54
DSSP ....llllllhhhhhhhhhhHHHHlLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident | | | | | || |
Sbjct HQLRSLRNLRLVSYRKQ..GRHVYYQLQDHH............................. 83
DSSP HHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLHH.............................
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................ivalyqnaldhlqec 98
DSSP .................hhhhhhhhhhhllll
No 21: 2HZTA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YTCD;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN 57
ident | | | |
Sbjct ..............xslveATLEviGGKWKXVILXHLTHG..KKRTSELKRLXPnITQKX 44
DSSP ..............llhhhHHHHhhLLLLHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHLLlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLH.HHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDG.FSSIKdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | || | | || |
Sbjct LTQQLRELEADGVINRIVYNQvPPKVEYELSEYgRSLEG..................... 83
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELLLhHHHHH.....................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .....................ildxlxawganhinr 98
DSSP .....................hhhhhhhhhhhhhll
No 22: 2HOEA MOLECULE: N-ACETYLGLUCOSAMINE KINASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | ||| | |
Sbjct ...........................iSRILKRIXKS..PVSRVELAEELGLTKTTVGE 31
DSSP ...........................lLLLHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH......
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDgfSSIKdiakrkhdliaktyedLKKL...... 114
ident | | | |
Sbjct IAKIFLEKGIVVEEKDSPRPTKSLKISP..NCAY...........vlgieVTRDeiaacl 78
DSSP HHHHHHHHLLEEEEELLLLLLEEEEELH..HHLE...........eeeeeELLLeeeeee
DSSP .........hhhlllllHHHHHHHHHHHLHhHHHHHHHHHHHH.................
Query .........eekcneeeKEFIKQKIKGIERxKKISEKILEALN................. 148
ident | | |
Sbjct idasxnilaheahplpsQSDREETLNVXYRiIDRAKDXXEKLGsklsaltvaapgpidte 138
DSSP eelllleeeeeeeelllLLLHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHLLlllleeeeeellleell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct rgiiidprnfplsqiplanllkekygievwvendadxgavgekwytkrddsfawiltgkg 198
DSSP lleellllllllllllhhhhhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct igagiiidgelyrgengyageigytrvfngneyvfledvcnenvvlkhvlsxgfslaear 258
DSSP leeeeeelleellllllllllhhhleeelllleeehhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct dsgdvrvkeyfddiaryfsigllnlihlfgiskiviggffkelgenflkkikievethll 318
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP .................................hll
Query .................................dld 151
ident
Sbjct ykhsvdxsfskvqepviafgaavhalenylervtts 354
DSSP llllleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 23: 2O03A MOLECULE: PROBABLE ZINC UPTAKE REGULATION PROTEIN FURB;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL.....LLH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK.....ISK 55
ident | | | || |
Sbjct ................asaaGVRSTRQRAAISTLLETLDDFRSAQELHDELRrrgenIGL 44
DSSP ................llllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEHHHHHHHHHhllllLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLlLLLLEEEELL.........hhhhhhhhhhhhhhHHHH
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVD.........gfssikdiakrkhdLIAK 106
ident | | | | |
Sbjct TTVYRTLQSMASSGLVDTLHTD.TGESVYRRCSehhhhhlvcrscgstievgdhevEAWA 103
DSSP HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL.LLLEEEEELLlllleeeeellllleeeellhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query TYEDLKKLEekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident |
Sbjct AEVATKHGF...................sdvshtieifgtcsdcr 129
DSSP HHHHHHLLL...................llllllleeeellllll
No 24: 1YYVA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKG 56
ident | || |
Sbjct .....qlregnlfaeqcpsrEVLKhvtSRWGVLILVALRDG..THRFSDLRRXXGgVSEX 53
DSSP .....lllllllllllllhhHHHHhhhLHHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHLLlLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || || || | |
Sbjct XLAQSLQALEQDGFLNRVSYPVvPPHVEYSLTPL.......................... 87
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH..........................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .........geqvsdxvaaladwielnlpqvlaqre 114
DSSP .........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 25: 1MZBA MOLECULE: FERRIC UPTAKE REGULATION PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhHHHHH...hhhLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL.....
Query xiixeeakkliieLFSEL...akiHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK..... 52
ident | | |
Sbjct .............MVENSelrkagLKVTLPRVKILQMLDSAQRHMSAEDVYKALMeaged 47
DSSP .............LHHHHhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHhllll
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLlLLLLEEEELLHHH............hhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGFS............sikdiakrk 100
ident | | | | | | |
Sbjct VGLATVYRVLTQFEAAGLVVRHNFD.GGHAVFELADSGHhdhmvcvdtgeviefmdaeie 106
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLL.LLLLEEEELLLLLleeeeellllleeeellhhhh
DSSP hHHHHHHHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hDLIAKTYEDLkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident |
Sbjct kRQKEIVRERG........................felvdhnlvlyvrkkk 133
DSSP hHHHHHHHLLL........................lllllllleeeellll
No 26: 1HSTA MOLECULE: HISTONE H5;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDK..PLTISDIXEELK...... 52
ident | | |
Sbjct ......................shPTYSEMIAAAIRAEKSrgGSSRQSIQKYIKshykvg 38
DSSP ......................llLLHHHHHHHHHHLLLLllLEEHHHHHHHHHhhllll
DSSP .lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLlLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGErKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident | | | |
Sbjct hnADLQIKLSIRRLLAAGVLKQTKGVGA.SGSFRLAK....................... 74
DSSP llHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL.LLEEEELL.......................
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................................ 74
DSSP ........................................
No 27: 2FXAA MOLECULE: PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;
DSSP ..............llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHH
Query ..............xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdKPLTIS 45
ident || | | ||
Sbjct ppydvkealvftqkxaqlskalwksiekdwqqwLKPYdLNINEHHILWIAYQL.NGASIS 59
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHlLLHHHHHHHHHHHHH.LLEEHH
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdlia 105
ident | ||||| | | |
Sbjct EIAKFGVXHVSTAFNFSKKLEERGYLRFSKR.....TYVQLTEE....gtevfwslleef 110
DSSP HHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL.....LEEEELHH....hhhhhhhhhhhl
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct dptrnavfkgsqplyhlfgkfpevaexxcxirhiygddfxeifets 156
DSSP lhhhlhhhhhlhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 28: 2D1HA MOLECULE: 109AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL
DSSP llhhhhhhhhHHHHhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakklIIELfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident || || | | || |
Sbjct ....xxkeklESKK.deIRCCYKITDTDVAVLLKXVEIEKPITSEELADIFKLSKTTVEN 55
DSSP ....llhhhhHHHH.hhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllLLLEEEEL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAV.DGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEdlkkleekcn 119
ident ||||| ||| | | || |
Sbjct SLKKLIELGLVVRTKT...PKYYYSISsNILEKIRNDLLNCAKRXELAAT.......... 102
DSSP HHHHHHHLLLEEEEEL...LLEEEEELlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..........
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................ 102
DSSP ................................
No 29: 1P4XA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A HOMOLOGUE;
DSSP .llhHHHHHHHHH...............................................
Query .xiiXEEAKKLII............................................... 12
ident |
Sbjct mkynNHDKIRDFIiieaymfrfkkkvkpevdmtikefilltylfhqqentlpfkkivsdl 60
DSSP llllLLLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllllleeehhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 12
ident
Sbjct cykqsdlvqhikvlvkhsyiskvrskiderntyisiseeqrekiaervtlfdqiikqfnl 120
DSSP lllhhhlhhhhhhhhhlllleeeellllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........................hhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHH
Query ........................elfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDI 47
ident | || |
Sbjct adqsesqmipkdskeflnlmmytmyfkniikkHLTLSFVEFTILAIITSQNkNIVLLKDL 180
DSSP hlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHLLLlLLEEHHHH
DSSP HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhh
Query XEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdli 104
ident | | | | | |||
Sbjct IETIHHKYPQTVRALNNLKKQGYLIKERSTEdERKILIHMDdaQQDH............. 227
DSSP HHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLEEEELLhhHHHH.............
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................aeqllaqvnqlladkdhlhlvfe 250
DSSP ........................hhhhhhhhhhhlllllhhhllll
No 30: 1MKMA MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | |
Sbjct .....................mNTLKKAFEILDFIVKNPGDVSVSEIAEKFNMSVSNAYK 39
DSSP .....................lLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELL.HHHHHHHHhhhhhhHHHHHHHH.........
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVD.GFSSIKDIakrkhdLIAKTYED......... 110
ident ||| ||| | | |
Sbjct YMVVLEEKGFVLRKKD.....KRYVPGYkLIEYGSFV..lrrfNIRDIAHDhlvdimkrt 92
DSSP HHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELLhHHHHHHHH..hhhlLHHHHHHHhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 110
ident
Sbjct getvhlilkdgfegvyidkvegeqsipmvsrlgmkvdlystasgksilafvpekelkeyl 152
DSSP llleeeeeellleeeeeeeelllllllllllllleeellllhhhhhhhhhllhhhhhhhh
DSSP .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................lkkleek 117
ident
Sbjct kivelkpktpntitnprvlkrelekirkrgyavdneeneigimcvgvpifdhngypvagv 212
DSSP hhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeee
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct sisgvarkfteekieeysdvlkekaeeisrklgy 246
DSSP eeeeehhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 31: 1JGSA MOLECULE: MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR;
DSSP ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL
Query ........xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK 52
ident | | |
Sbjct lfneiiplgrlihmvnqkkdrllneylsPLDITAAQFKVLCSIRCA.ACITPVELKKVLS 59
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHHL
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident | | | | | | |
Sbjct VDLGALTRMLDRLVCKGWVERLPNPNDkRGVLVKLTTG...............gaaiceq 104
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHH...............hhhhhhh
DSSP hhhhhhlllllhhhhhHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikQKIKGierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct chqlvgqdlhqeltknLTADE......vatleyllkkvlp 138
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllLLLLL......hhhhhhhhhllll
No 32: 2ETHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE, MAR FAMILY;
DSSP .......llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLL
Query .......xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI 53
ident | | | | | |
Sbjct hxdaleifktlfslvxrfssylpsneeISDXKTTELYAFLYVALF.GPKKXKEIAEFLST 59
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhHHHLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHLLL
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEEL..LHHH.hhhhhhhhhhhhHHHHHH
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAV..DGFS.sikdiakrkhdlIAKTYE 109
ident | || || | | |
Sbjct TKSNVTNVVDSLEKRGLVVREXDPVDrRTYRVVLTekGKEIfgeilsnfesllkSVLEKF 119
DSSP LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELhhHHHHhhhhhhhhhhhhhHHHLLL
DSSP hhHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlKKLEekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..SEED..................fkvvsegfnrxvealsre 141
DSSP ..LHHH..................hhhhhhhhhhhhhhhhll
No 33: 1Z1DA MOLECULE: REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDK..PLTISDIXEELK.ISKGN 57
ident || | | | || |
Sbjct ....................ANGLTVAQNQVLNLIKACPRpeGLNFQDLKNQLKhMSVSS 40
DSSP ....................LLLLLHHHHHHHHHHHLLLLllLEEHHHHHHHLLlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident | | |
Sbjct IKQAVDFLSNEGHIYSTV....ddDHFKSTDAE........................... 69
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEELL....llLEEEELLLL...........................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................................. 69
DSSP ..................................
No 34: 2CWEA MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTION REGULATOR PROTEIN,
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV 58
ident | ||| | |
Sbjct .........akkvkvitdpeVIKVmlEDTRRKILKLLRNK..EMTISQLSEILGKTPQTI 49
DSSP .........llleeeellhhHHHHhlLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELL...lLLLLLEEEELLHHhhHHHHhhhHHHH......hhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWI...kGERKNYYEAVDGFssIKDIakrKHDL......iaktye 109
ident || | | | ||
Sbjct YHHIEKLKEAGLVEVKRTemkgNLVEKYYGRTADV..FYIN...LYLGdeelryiarsrl 104
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEEEEeeelLEEEEEEEELLLE..EEEL...LLLLlhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhlllllHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL..................
Query dlkkleekcneeeKEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD.................. 151
ident | |
Sbjct ktkidifkrlgyqFEENELLNIMDRMSQKEFDATVRISKYIEekedalkdfsnediihai 164
DSSP hhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllhhhhllllhhhhhhhh
DSSP ...........................
Query ........................... 151
ident
Sbjct ewlstaelardeeylellkrlgsilkr 191
DSSP hhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlll
No 35: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLL.....LLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEELKISK 55
ident | | | | |
Sbjct ......................GIDPAIVEVLLVLREAGiengaTPWSLPKIAKRAQLPX 38
DSSP ......................LLLHHHHHHHHHHHHHLlllllLLLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLlLLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdliaktyedlkk 113
ident | | |
Sbjct SVLRRVLTQLQAAGLADVSVEA.DGRGHASLTqeGAAL...................... 75
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL.LLLEEEEELhhHHHH......................
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................aaqlfp 81
DSSP ................................hhhhll
No 36: 1XN7A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | |
Sbjct ........................mASLIQVRDLLALR.GRMEAAQISQTLNTPQPMINA 35
DSSP ........................lLLHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLL................LLLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEELGFVRKVWIKG................ERKNYYEAVdgfssikdiakrkhdli 104
ident | || |
Sbjct MLQQLESMGKAVRIQEEPdgclsgsckscpegkaCLREWWALR................. 78
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLLllllllllllllllllLLLLEEEEL.................
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................................... 78
DSSP ...............................................
No 37: 2IA2A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILylsDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident || | ||
Sbjct ....................YVQSLARGLAVIRCFdhrNQRRTLSDVARATDLTRATARR 40
DSSP ....................LLHHHHHHHHHHHLLlllLLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHHHHHHHhHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHL.
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFSSIKDiAKRKHDLI.AKTYEDLKKLEEKC. 118
ident | | ||| | | || |
Sbjct FLLTLVELGYVATDG......SAFWLTPRVLELGY.SYLSSLSLpEVAQPHLEKLSHKVh 93
DSSP HHHHHHHHLLEEELL......LEEEELHHHHHLLH.HHHLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 118
ident
Sbjct esssvsildgadivyvarvpvsrixtvgitigtrlpayatsxgrvllaglpddeldayle 153
DSSP leeeeeeeelleeeeeeeellllleellllllleeehhhlhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 118
ident
Sbjct kldiqrltertitardelkaailavradgicvldqeleaglrsxaapirgasgltvaavn 213
DSSP hlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeeee
DSSP ............llLLHHHHHHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ............neEEKEFIKQKIKGierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct istpaarysledlhSDLIPSLRVTAT........dieqdlatvnr 250
DSSP eeeehhhllhhhhhHHLHHHHHHHHH........hhhhhhhhhhl
No 38: 2F2EA MOLECULE: PA1607;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNV 58
ident | |
Sbjct ........tshkqascpvaRPLDviGDGWSXLIVRDAFEG..lTRFGEFQKSLGLAKNIL 50
DSSP ........lllllllllllLLHHhhLLLLHHHHHHHHHLL..lLLHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLH.......................hhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDG.......................fssikd 95
ident | | | | | | |
Sbjct AARLRNLVEHGVXVAVPAESGSHQEYRLTDKgralfpllvairqwgedyffapdeshvrl 110
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLLEEEEELHHhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllee
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhlllllhhhhhhHHHHHLHhhHHHHhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyedLKKLeekcneeekefikqKIKGIERxkKISEkilealndld 151
ident |
Sbjct verdsgqpvprlqvrAGDG............spLAAEDTR..VSRD.......... 142
DSSP eelllllllllllllLLLL............llLLHHHEE..EELL..........
No 39: 1Z05A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | || | | |
Sbjct ....................DHIKQINAGRVYKLIDQK.gPISRIDLSKESELAPASITK 39
DSSP ....................LHHHHHHHHHHHHHHHHH.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELL.....LLLLLLEEEELLhHHHHH.....................
Query SLKKLEELGFVRKVWI.....KGERKNYYEAVDgFSSIK..................... 94
ident | |
Sbjct ITRELIDAHLIHETTVqeaisRGRPAVGLQTNN.LGWQFlsmrlgrgyltialhelggev 98
DSSP HHHHHHHLLLEEEELHhhhhhHLLLLEEEEELL.LLEEEeeeeeelleeeeeeeelllle
DSSP ....................................HHHHhhhhHHHHhhhhhHHHH...
Query ....................................DIAKrkhdLIAKtyedlKKLE... 115
ident
Sbjct lidtkidiheidqddvlarllfeieeffqtyaaqldRVTS....IAIT.....LPGLvns 149
DSSP eeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllEEEE....EEEE.....ELLEeel
DSSP ..hhlllllHHHHhHHHHhHLHHHHHHHHH..............................
Query ..ekcneeeKEFIkQKIKgIERXKKISEKI.............................. 143
ident
Sbjct eqgivlqmpHYNV.KNLA.LGPEIYKATGLpvfvandtrawalaeklfghsqdvdnsvli 207
DSSP llleeeellLLLL.LLLL.HHHHHHHHHLLleeeeehhhhhhhhhhhhlllllllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 143
ident
Sbjct sihhglgagivldgrvlqgrhgnigelghiqidpqgkrchcgnygcletvassqairdqv 267
DSSP eellleeeeeeelleelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhlhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 143
ident
Sbjct tariqagepsclatveeisiedicaaaadgdplavdviqqlgrylgaaiaivinlfnpek 327
DSSP hhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 143
ident
Sbjct iliggvinqaksilypsieqcireqslpvyhqdlklvesrfykqatmpgaalikqalydg 387
DSSP eeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhhhhhll
DSSP .hhhhhhll
Query .lealndld 151
ident
Sbjct lllmkvveg 396
DSSP hhhhhhhhl
No 40: 1XMKA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLL.LHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI.SKGNV 58
ident |
Sbjct ................gshmASLDmAEIKEKICDYLFNV.SDSSALNLAKNIGLtKARDI 43
DSSP ................llllLLHHhHHHHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLHhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLlllLLLEEEELL.HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVD.GFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident | | | | |
Sbjct NAVLIDMERQGDVYRQGT...TPPIWHLTDkKRERMQ....................... 77
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEELHhHHLLLL.......................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................ik 79
DSSP ................................ll
No 41: 1W1WE MOLECULE: STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHHL.lLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK.iSKG 56
ident | || | |
Sbjct .........................KAIVQMAKILRKElseEKEVIFTDVLKSQAkrEAS 35
DSSP .........................LHHHHHHHHHHHHlllLLLEEHHHHHHLLLlhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident | | |
Sbjct RGFFDILSLATEGCIGLSQTEAFGNIKIDAKPA........................... 68
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLLEEEEELHH...........................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................................lf 70
DSSP .................................hl
No 42: 1J5YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident || | | ||| |
Sbjct ...................xKTVRQERLKSIVRILERSKEPVSGAQLAEELSVSRQVIVQ 41
DSSP ...................lHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLL.EEEELllllllLEEEEL...LHHHhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEELGF.VRKVWikgerkNYYEAV...DGFSsikdIAKRkhdliaktyedlkklee 116
ident | || | | |
Sbjct DIAYLRSLGYnIVATP......RGYVLAggkSGVS....RLVA................. 74
DSSP HHHHHHHHLLlLEEEL......LEEELLlllLLEE....EEEE.................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHLL.........................
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealNDLD......................... 151
ident
Sbjct ..................vkhapeeikeellCVVRnggrivdvivehpvygeirgiidvs 116
DSSP ..................eellhhhhhhhhhHHHHllleeeeeeeeellleeeeeeeeel
DSSP ........................................................
Query ........................................................ 151
ident
Sbjct seeevlkfvnlxexakteplltlsggvhlhtieapdeetxerixrelkkkgfliee 172
DSSP lhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhheeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 43: 2FBHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PA3341;
DSSP ...LLHHhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query ...XIIXeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGN 57
ident || | | |
Sbjct yfgTLLA.qtsrawraeldrrlSHLGLSQARWLVLLHLARHRDSPTQRELAQSVGVEGPT 59
DSSP lhhHHHH.hhhhhhhhhhhhhlHHHLLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLL.LLLLLEEEELL.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIK.GERKNYYEAVD.GFSSikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | || | || |
Sbjct LARLLDGLESQGLVRRLAVAeDRRAKHIVLTPkADVL..................iadie 101
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELLLlLLLLLEEEELLlHHHH..................hhhhh
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct aiaasvrndvltgideseqalcqqvllrilanlenr 137
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 44: 2E1NA MOLECULE: PEX;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHH.......LL
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEEL.......KI 53
ident | | | | |
Sbjct ....mdfediyrffqdppphylskELAVCYVLAVLRHE..DSYGTELIQHLethwpnyRL 54
DSSP ....llhhhhhhhhhlllleellhHHHHHHHHHHHLLL..LEEHHHHHHHHhhhllleEL
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL....LLLLEEEELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG....ERKNYYEAVDGFSSIkdiakrkhdliaktye 109
ident | || || | | |
Sbjct SDTVLYTALKFLEDEQIISGYWKKVegrgRPRRMYQLAQANDDR................ 98
DSSP LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLllllLLEEEEEELLLLLHH................
DSSP hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..............................srdlaqlweryl 110
DSSP ..............................hhhhhhhhhhhl
No 45: 1Z7UA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN EF0647;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN 57
ident | | | | |
Sbjct ......snaxttdkqtsinlALSTinGKWKLSLXDELFQG..TKRNGELXRALDgITQRV 52
DSSP ......lllllllhhhhhhhHHHLllLLLHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLH.hHHHH.hhhhhhhhhhhhHHHHHHHh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDG.fSSIK.diakrkhdliakTYEDLKKl 114
ident | | | | |
Sbjct LTDRLREXEKDGLVHRESFNElPPRVEYTLTPEgyALYDalsslchwgetfaQKKARLN. 111
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlLLEEEEEELHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhHHHHHHL.
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................... 111
DSSP .....................................
No 46: 1S3JA MOLECULE: YUSO PROTEIN;
DSSP ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHH
Query ........xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEEL 51
ident | | | | | | |
Sbjct sadqlxsdiqlslqalfqkiqpexlesXEKQgVTPAQLFVLASLKKH.GSLKVSEIAERX 59
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLlLLHHHHHHHHHHHHH.LEEEHHHHHHHH
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyed 110
ident | || | |
Sbjct EVKPSAVTLXADRLEQKNLIARTHNTKDrRVIDLSLTDE................gdikf 103
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHH................hhhhh
DSSP hhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHLhhhhhhhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekefikQKIKGIErxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct eevlagrkaixarylsfLTEEEXL.qaahitaklaqaaetd 143
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHH.hhhhhhhhhhhhhhll
No 47: 1LJ9A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SLYA;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.....LLHHhHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG.....LNKSvGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISK 55
ident | | | |
Sbjct .tdilreigmiaraldsisNIEFkelslTRGQ.YLYLVRVCEN.PGIIQEKIAELIKVDR 57
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLhhhllLLLH.HHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkl 114
ident | ||| || |
Sbjct TTAARAIKRLEEQGFIYRQEDASNkKIKRIYATEK......................gkn 95
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLlLLEEEEELHH......................hhh
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhHHLH............hhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikGIER............xkkisekilealndld 151
ident
Sbjct vypiivrenqhsnqvalQGLSeveisqladylvrmrknvsedwefvkkg 144
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 48: 2GXGA MOLECULE: 146AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL
DSSP ......llhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLL
Query ......xiixeeakkliielfsELAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKIS 54
ident | | | |
Sbjct enriqimstiakiyramsrelnRRLGELNLSYLDFLVLRATSDG..PKTMAYLANRYFVT 58
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLLHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHLLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkk 113
ident | |||| | | | || |
Sbjct QSAITASVDKLEEMGLVVRVRDREdRRKILIEITEK...................gletf 99
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLlLLLEEEEELHH...................hhhhh
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhHHHLH...hhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkiKGIER...xkkisekilealndld 151
ident
Sbjct nkgieiykklanevtgdLSEDEvilvldkiskilkrieeis 140
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 49: 2FSWA MOLECULE: PG_0823 PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHhlLLLLLHHHHHHHHL.LLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYlsDKPLTISDIXEELK.ISKGN 57
ident | ||
Sbjct ........rkisdeecpvrkSXQIfaGKWTLLIIFQIN..RRIIRYGELKRAIPgISEKX 50
DSSP ........llllllllhhhhHHHHhlLLLHHHHHHHHL..LLLEEHHHHHHHLLlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident || | | | |
Sbjct LIDELKFLCGKGLIKKKQYPEvPPRVEYSLTPL........................... 83
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH...........................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................gekvlpiideiakfgxenl 102
DSSP ................hhllhhhhhhhhhhhhhhl
No 50: 1U2WA MOLECULE: CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;
DSSP ...llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLL
Query ...xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKIS 54
ident | | || |
Sbjct gydeekvnriqgdlqtvdisgvsQILKaiaDENRAKITYALCQD.EELCVCDIANILGVT 59
DSSP lllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhHHHHhhhLHHHHHHHHHHHHL.LLEEHHHHHHHHLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLEEEEllllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVwikgerKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkl 114
ident | | | | | | | |
Sbjct IANASHHLRTLYKQGVVNFR......LALYSLGDEH........................ 89
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLEEEL......LLEEEELLHH........................
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .....................irqimmialahkkevk 105
DSSP .....................hhhhhhhhhhhhllll
No 51: 1BIAA MOLECULE: BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | |
Sbjct .....................mKDNTVPLKLIALLANG.EFHSGEQLGETLGMSRAAINK 38
DSSP .....................lLLLHHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHH.LLEEEELlllllLLEEEELL...............................
Query SLKKLEEL.GFVRKVWikgerKNYYEAVD............................... 88
ident | | | |
Sbjct HIQTLRDWgVDVFTVP.....GKGYSLPEpiqllnakqilgqldggsvavlpvidstnqy 93
DSSP HHHHHHHLlLLLEEEL.....LLEEELLLllllllhhhhhhlllllleeellllllhhhh
DSSP .....................hhHHHHHhhhhhHHHHhhhhhhhhHHHHhlllllhHHHH
Query .....................gfSSIKDiakrkHDLIaktyedlkKLEEkcneeekEFIK 127
ident |
Sbjct lldrigelksgdaciaeyqqagsPFGAN....lYLSM.......fWRLE......qPAAA 136
DSSP hhllhhhllllleeeelllllllLLLLE....eEEEE.......eEEEL......lLLLL
DSSP HHHHHHLHHHH............................................hhhhh
Query QKIKGIERXKK............................................iseki 143
ident
Sbjct IGLSLVIGIVMaevlrklgadkvrvkwpndlylqdrklagilveltgaaqivigaginma 196
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhhhlllllleeellleeeelleeeeeeeeeeelleeeeeeeeeell
DSSP hHHHHHLL....................................................
Query lEALNDLD.................................................... 151
ident
Sbjct mWITLQEAginldrntlaamlirelraalelfeqeglapylsrwekldnfinrpvkliig 256
DSSP lLLLLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeeeel
DSSP ....................................
Query .................................... 151
ident
Sbjct dkeifgisrgidkqgallleqdgiikpwmggeislr 292
DSSP leeeeeeeeeellllleeeeelleeeeellleeeel
No 52: 2FA5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY;
DSSP ...........llhhhhhhhhhhhhhhHHHHH.LLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHH
Query ...........xiixeeakkliielfsELAKI.HGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIX 48
ident | | || | |
Sbjct hpvllnleqflpyrlsvlsnrisgniaKVYGDrYGXAIPEWRVITILALY.PGSSASEVS 59
DSSP llllllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhHLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHH
DSSP HHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEelllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKvwikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliakty 108
ident | || | | || |
Sbjct DRTAXDKVAVSRAVARLLERGFIRR........SXLALSPA...............grqv 96
DSSP HHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEL........LLLEELHH...............hhhh
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct yetvaplvnexeqrlxsvfsaeeqqtlerlidrlakdglprxa 139
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhl
No 53: 2A61A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TM0710;
DSSP ....llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHH
Query ....xiixeeakkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKG 56
ident | | | | |
Sbjct kqpferilreicfmvkvegrkVLRDFGITPAQFDILQKIYFE.GPKRPGELSVLLGVAKS 59
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLHHHHHHHHLLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLH.hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHH
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDG.fssikdiakrkhdliaKTYEDLKKL 114
ident | | || | | | || |
Sbjct TVTGLVKRLEADGYLTRTPDPADrRAYFLVITRKgeeviekvierrenfieKITSDLGKE 119
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLEeEEEEEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLHH
DSSP HhhlllllhhhhhhHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query EekcneeekefikqKIKGierxkkisekilealndld 151
ident ||
Sbjct K...........ssKILD...ylkelkgvmernfskq 142
DSSP H...........hhHHHH...hhhhhhhhhhhhllll
No 54: 2BV6A MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MGRA;
DSSP .......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL
Query .......xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSDkPLTISDIXEELK 52
ident | | || | ||
Sbjct xnlkeqlcfslynaqrqvnryysnkvFKKYnLTYPQFLVLTILWDES.PVNVKKVVTELA 59
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHlLLHHHHHHHHHHHHLL.EEEHHHHHHHLL
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLL.LLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGER.KNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident | || || | |
Sbjct LDTGTVSPLLKRXEQVDLIKRERSEVDQrEVFIHLTDK...................... 97
DSSP LLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLLLlLEEEEELHH......................
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct setirpelsnasdkvasasslsqdevkelnrllgkvihaf 137
DSSP hhhhhhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 55: 1JHFA MOLECULE: LEXA REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLLLHHHHHHHHLL.LH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD....KPLTISDIXEELKI.SK 55
ident | | | | | | |
Sbjct .....................KALTARQQEVFDLIRDHIsqtgMPPTRAEIAQRLGFrSP 39
DSSP .....................LLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLHHHHHHHLLLlLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllLLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || | | |
Sbjct NAAEEHLKALARKGVIEIVSG...ASRGIRLLQEEE........................ 72
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEELLL...LLLLEEELLLLL........................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHL.........................
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDL......................... 150
ident
Sbjct ...............................EGLPlvgrvaadepllaqqhieghyqvdp 101
DSSP ...............................LLEEeelllllllllllhhheeeeelllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct slfkpnadfllrvsgmsmkdigimdgdllavhktqdvrngqvvvariddevtvkrlkkqg 161
DSSP hhlllllleeeellllllhhhlllllleeeeeelllllllleeeeeelleeeeeeeeeel
DSSP ...................................l
Query ...................................d 151
ident
Sbjct nkvellpensefkpivvdlrqqsftieglavgvirn 197
DSSP leeeeelllllllleeeellllleeeeeeeeeeeel
No 56: 2NS0A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHL.....l
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELK.....i 53
ident | | ||
Sbjct ...................xtvsdRELEECIRALLDARAdsASICPSDVARAVApddwrp 41
DSSP ...................llllhHHHHHHHHHHHHHLLllLLLLHHHHHHHHLllllhh
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL.......lllLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI.......kgeRKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliak 106
ident | | | |
Sbjct LXEPVREAAGRLADAGEVEVTQKgavvdprsarGPIRIRWTRTD................ 85
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELleelllllllLLLEEEELLLL................
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................................. 85
DSSP .............................................
No 57: 2HR3A MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ................LLHHhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLH
Query ................XIIXeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTI 44
ident | | |
Sbjct ptnqdlqlaahlrsqvTTLT........rrlrreaqADPVQFSQLVVLGAIDRLGGDVTP 52
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhHHHH........hhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLH
DSSP HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELLH.hhhhhhhhhhhhhh
Query SDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDG.fssikdiakrkhdl 103
ident | | | || |
Sbjct SELAAAERXRSSNLAALLRELERGGLIVRHA.....RTRVSLSSEgrrnlygnrakreew 107
DSSP HHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL.....LLEEEELHHhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHLH.hhhhhhhhhhhhhhll
Query iaktYEDLkkleekcneeekefikqkIKGIER.xkkisekilealndld 151
ident
Sbjct lvraXHAC.................lDESERAllaaagplltrlaqfee 139
DSSP hhhhHHHH.................lLHHHHHhhhhhhhhhhhhhllll
No 58: 2FRHA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;
DSSP llHHHH.............hhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHH
Query xiIXEE.............akkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSDK.PLTISD 46
ident | || |
Sbjct ..GSHMaitkindcfellsmvtyadklkslIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEkEYYLKD 58
DSSP ..LLLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLlEEEHHH
DSSP HHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLL.LEEEE...LLHHhhhhhhhhhhhh
Query IXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGERK.NYYEA...VDGFssikdiakrkhd 102
ident | | | | | |
Sbjct IINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERtVLILVnaqQRKK............ 106
DSSP HHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLlLEEELllhHHHH............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query liaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................iesllsrvnkriteanneiel 127
DSSP ............................hhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 59: 1Z91A MOLECULE: ORGANIC HYDROPEROXIDE RESISTANCE TRANSCRIPTIONAL
DSSP ......llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLL
Query ......xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI 53
ident | || | |
Sbjct mklenqlsfllyassremtkqykplLDKLnITYPQYLALLLLWEH.ETLTVKKMGEQLYL 59
DSSP llhhhlhhhhhhhhhhhhhlllhhhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHH.LEEEHHHHHHLLLL
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLH.hHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDG.fSSIKdiakrkhdliaktyedl 111
ident | || | | |
Sbjct DSGTLTPMLKRMEQQGLITRKRSEEDeRSVLISLTEDgaLLKE................. 102
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLLLLLlLLLEEEELHHhhLHHH.................
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .....kavdipgtilglskqsgedlkqlksalytlletlh 137
DSSP .....hlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 60: 1XMAA MOLECULE: PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhllllHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfsELAKihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........ 52
ident | |
Sbjct ..............sdVIRG.....YVDTIILSLLIEG..DSYGYEISKNIRiktdelyv 39
DSSP ..............llLHHH.....LHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHHHhhhlllll
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident | || | | ||
Sbjct IKETTLYSAFARLEKNGYIKSYYGEEtKRRTYYRITPE...................... 77
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEElLEEEEEEELHH......................
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................gikyykqkceeweltkkvinkfvk 101
DSSP ................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 61: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN 57
ident | | |
Sbjct ..............mniaelYGKMGKHSWRIMDAIFKNLwdyEYVPLQLISSHARIGEEK 46
DSSP ..............llhhhhHHLLLHHHHHHHHHHHLLLlllLLEEHHHHHHHHLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLlllLLLEEEELL..HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVD..GFSSikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || | | |
Sbjct ARNILKYLSDLRVVQNRQK...DYEGSTFTFigLSLY....................... 80
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELL...LLLEEEELHhhHHHH.......................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH......HHHL...................
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekILEA......LNDL................... 150
ident |
Sbjct ............slhrlvrsgkvdaigKLMGegkesaVFNCysekfgecvvkfhkvkvke 128
DSSP ............hhhhhhhllllleeeEEEEellleeEEEEeellleeeeeeeellllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct hfsvlairsarnefralqklqglavpkvyawegnavlmelidakelyrvrvenpdevldm 188
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeelleeeeelllleehhhlllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct ileevakfyhrgivhgdlsqynvlvseegiwiidfpqsvevgeegwreilerdvrniity 248
DSSP hhhhhhhhhhlleelllllllleeelllleeelllllleelllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ....................l
Query ....................d 151
ident
Sbjct fsrtyrtekdinsaidrilqe 269
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhl
No 62: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mqeqrqqllrslealifsseepvnlqtlsqitahkftpselqeavdelnrdyeatgrtfr 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllee
DSSP ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL
Query ........xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK 52
ident | | | | | | |
Sbjct ihaiaggyrfltepefadlvrqllapviQRRLSRSMLEVLAVVAWH.QPVTKGEIQQIRG 119
DSSP eeeelleeeeeelhhhhhhhhhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLEEHHHHHHHHL
DSSP LLHHhhhHHHHHHHHHLLEEEELL..lLLLLLEEEELL.HHHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGnvsXSLKKLEELGFVRKVWI..kGERKNYYEAVD.GFSSIKdiakrkhdliaktye 109
ident | | | | | |
Sbjct ASPD...YSIDRLLARGLIEVRGRadsPGRPLQYGTTEvFLDLFH............... 161
DSSP LLLL...LHHHHHHHLLLEEEEEElllLLLLEEEEELHhHHHHLL...............
DSSP hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .........................................l 162
DSSP .........................................l
No 63: 2HTJA MOLECULE: P FIMBRIAL REGULATORY PROTEIN KS71A;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnkSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | |
Sbjct ..........................MKNEILEFLNRH.NGGKTAEIAEALAVTDYQARY 33
DSSP ..........................LHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLHHhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIKGERKNYYEAVDGFssiKDIAkrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident | || | | |
Sbjct YLLLLEKAGMVQRSPLRRGMATYWFLKGEK...QAGQ....................... 67
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLEEEELLLL...LLLL.......................
DSSP llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH....hhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekILEA....lndld 151
ident
Sbjct .....................sCSSTtlehhhhhh 81
DSSP .....................hHHHLlllllllll
No 64: 2ESHA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN TM0937;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........ 52
ident | | |
Sbjct ................rggrgfrGWWLASTILLLVAEK..PSHGYELAERLAefgieipg 42
DSSP ................llllhhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHHllllllll
DSSP .llhHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL..LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE..RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktye 109
ident || | ||| || | |
Sbjct ighmGNIYRVLADLEESGFLSTEWDTTVspPRKIYRITPQ...........gklylreil 91
DSSP llllLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLllLEEEEEELHH...........hhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhlllllhhhHHHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query dlkkleekcneeekefIKQKIKGierxkkisekilealndld 151
ident ||
Sbjct rsledmkrrietleerIKRVLQE................... 114
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHL...................
No 65: 1UCRA MOLECULE: PROTEIN DSVD;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHH...HLLLLLLHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILY...LSDKPLTISDIXEELK.ISKG 56
ident | | | |
Sbjct .......................MEEAKQKVVDFLNsksGSKSKFYFNDFTDLFPdMKQR 37
DSSP .......................LLHHHHHHHHHHLlhhHHLLLEEHHHHHHHLLlLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident | | | |
Sbjct EVKKILTALVNDEVLEYWSS..GSTTMYGLKG............................ 67
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELL............................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................agkqaaa 74
DSSP ............................hhhhhhl
No 66: 1UB9A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1061;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSDkPLTISDIXEELKISKGNV 58
ident | | | | | ||
Sbjct ............meelkeimKSHIlgNPVRLGIMIFLLPRR.KAPFSQIQKVLDLTPGNL 47
DSSP ............lhhhhhhhLLHHhhLHHHHHHHHHHHHHL.EEEHHHHHHHLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLLL.LLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIKG.ERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident || | | | |
Sbjct DSHIRVLERNGLVKTYKVIAdRPRTVVEITDF............................ 79
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEEEELLlLLEEEEEELHH............................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkISEKilealndld 151
ident
Sbjct .....gmeeakrflsslkaviDGLD........l 100
DSSP .....hhhhhhhhhhhhhhhhHHHL........l
No 67: 1U5TA MOLECULE: APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vnktilekqsvelrdqlmvfqerlvefakkhnselqaspefrskfmhmcssigidplslf 60
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct drdkhlftvndfyyevclkvieicrqtkdmnggvisfqelekvhfrklnvglddleksid 120
DSSP lllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleehhhhhhlllllllllhhhhhhhhh
DSSP .llhhhhhhhhHHHH.hhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHhHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query .xiixeeakklIIEL.fselakiHGLNKSVGAVYAILyLSDKPLTISDIXEELKISKGNV 58
ident | | | || |
Sbjct mlkslecfeifQIRGkkflrsvpNELTSDQTKILEIC.SILGYSSISLLKANLGWEAVRS 179
DSSP hhllllllleeEELLeeeellllLLLLLLHHHHHHLL.LLLLLLLHHHHHHHHLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
ident | | |
Sbjct KSALDEMVANGLLWIDYQ.gGAEALYWDPSWIT........................... 211
DSSP HHHHHHHHHLLLLEEELL.lLLLLEEELHHHHH...........................
DSSP llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...............................rq 213
DSSP ...............................ll
No 68: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHL....LLLLLHHHHHHH..HLLL
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLS....DKPLTISDIXEE..LKIS 54
ident || | || | |
Sbjct ......................KLNDRQRKVLYCIVREyienKKPVSSQRVLEVsnIEFS 38
DSSP ......................LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLHHHHHHHllLLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLH.........................
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDG......................... 89
ident |||| || |
Sbjct SATIRNDMKKLEYLGYIYQPHT....sAGRIPTDKglrfyyeemlkisketseadlavet 94
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLEELLLL....lLLLEELHHhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhl
DSSP ............hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhHHHHHL...................
Query ............fssikdiakrkhdliaKTYEdlkKLEEKC................... 118
ident
Sbjct fksmpladpekvlflagnllarltegyvLIER...PNTRDLkilrvmlipvsedylifsi 151
DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlleeEEEL...LLHHHLllleeeeeelllleeeeee
DSSP ....................................LLLL....................
Query ....................................NEEE.................... 122
ident |
Sbjct ltefgvskvtpiktqerlnweeierqlnfllrgrtvGEVLmgkieslkgsgflrliesli 211
DSSP eelleeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllhHHHHhlllhhhhllhhhhhhhhhh
DSSP ........................hhhhhhhhhHHLHHHHHHHHhhHHHH..........
Query ........................kefikqkikGIERXKKISEKilEALN.......... 148
ident |
Sbjct getveryldaglenllkdetltledirnlleevKDQKFLESLVG..EGITvrigreigrk 269
DSSP lllllleeeelhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHLL..LLLEeeehhhhllh
DSSP ...................................................hll
Query ...................................................dld 151
ident
Sbjct klekfavfsgkyfkgespigsvylftskvtkydrnhrvfeyilnrlseyftsts 323
DSSP hhlleeeeeeeeeelleeeeeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 69: 1TBXA MOLECULE: HYPOTHETICAL 11.0 KDA PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG 56
ident | | || | |
Sbjct ....................stpfFYPEAIVLAYLYDN.EGIATYDLYKKVNaefpXSTA 39
DSSP ....................llllLLHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHHHHHHHllllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident | | |||
Sbjct TFYDAKKFLIQEGFVKERQE..RGEKRLYLTEK........................... 70
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELHH...........................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........gklfaislktaietykqikkrhhh 94
DSSP ...........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 70: 1P6RA MOLECULE: PENICILLINASE REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL....LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK....ISKG 56
ident | || |
Sbjct .................mkkipqISDAELEVMKVIWKH.SSINTNEVIKELSktstWSPK 42
DSSP .................llllllLLHHHHHHHHHHHLL.LLEEHHHHHHHHHhhllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHHHhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFSsikdIAKRkhdliaktyedlkklee 116
ident | | | | | | |
Sbjct TIQTMLLRLIKKGALNHHKE..GRVFVYTPNIDES.dyiEVKS................. 82
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLLLL.lllLLLL.................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................... 82
DSSP ...................................
No 71: 1YG2A MOLECULE: GENE ACTIVATOR APHA;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........ 52
ident | | || |
Sbjct .........................SLPHVILTVLSTR..DATGYDITKEFSasigyfwk 33
DSSP .........................LHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLlhhhhlll
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllllEEEELLH...hhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDG...fssikdiakrkhdliaktye 109
ident | | | | | | | | |
Sbjct ASHQQVYRELNKMGEQGLVTCVLE......VYSITQAgrsalgewfdqptahptvrdefs 87
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......LEEELHHhhhhhhhhhhllllllllllhhh
DSSP hhHHHHHHLlllLHHH............................................
Query dlKKLEEKCneeEKEF............................................ 125
ident |
Sbjct akLMACSVQ...SAEPyrlqlaelveesrklvahyqeieaayyanpavldkqqrlerltl 144
DSSP hhHHHHHLL...LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhh
DSSP ............hhHHHHhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ............ikQKIKgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct rrnllvrqawiqwaDEVL.............aelnama 169
DSSP hhhhhhhhhhhhhhHHHH.............hhhhhll
No 72: 1W7PD MOLECULE: VPS22, YPL002C;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ldrekflnkelfldeiareiyeftlsefkdlnsdtnymiitlvdlyamynksmrigtgli 60
DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeehhhhhhhhhhhllllllll
DSSP .............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHH
Query .............xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDI 47
ident
Sbjct spmemreacerfehlglnelklvkvnkrilcvtSEKFDVVKEKLVDLIGDN.PGSDLLRL 119
DSSP lhhhhhhhhllhhhhllllleeeellllleeeeLLLHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHH
DSSP HHHHL.......LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLhHHHHhhhhhhh
Query XEELK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDgFSSIkdiakrk 100
ident | | | | || |
Sbjct TQILSsnnsksnWTLGILMEVLQNCVDEGDLLIDKQ..LSGIYYYKNSyWPSH....... 170
DSSP HHHHLlllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..LLEEEEEELLlLLLL.......
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................................i 171
DSSP ..................................................l
No 73: 2FBIA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ....llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHH
Query ....xiixeeakkliielfseLAKIHGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKG 56
ident ||| | || |
Sbjct rpsltltllqareaamsffrpSLNQHGLTEQQWRVIRILRQQ.GEMESYQLANQACILRP 59
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.LLEEHHHHHHHLLLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL.LLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIKGE.RKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | || | || | |
Sbjct SMTGVLARLERDGIVRRWKAPKDqRRVYVNLTEK...................gqqcfvs 100
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLEeEEEEEEELHH...................hhhhhhh
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct msgdmeknyqriqerfgeeklaqllellnelkkikp 136
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 74: 2CO5A MOLECULE: VIRAL PROTEIN F93;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL......LL
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK......IS 54
ident | | | ||
Sbjct .....................kyMRINYYIILKVLVINGSRLEKKRLRSEILkrfdidIS 39
DSSP .....................llLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEHHHHHHHHHhhhlllLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkl 114
ident | | |
Sbjct DGVLYPLIDSLIDDKILREEEA..PDGKVLFLTEK......................... 72
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL..LLLLEEEELHH.........................
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................gmkefeelheffkkivchhh 92
DSSP .................hhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 75: 1ZG3A MOLECULE: ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE;
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLL.HHHH..HHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLL...
Query .xiixeeakkliielfselakIHGLN.KSVG..AVYAILYLSDKPLTISDIXEELKI... 53
ident || || | | ||
Sbjct gseeselyhaqihlykhvynfVSSMAlKSAMelGIADAIHNHGKPMTLSELASSLKLhps 60
DSSP lllllllllhhhhhhhhhllhHHHHHhHHHHhhLHHHHHHHHLLLEEHHHHHHHLLLlll
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLL.....LLLLLEEEELLH...................
Query SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIK.....GERKNYYEAVDG................... 89
ident | | || | | | |
Sbjct KVNILHRFLRLLTHNGFFAKTIVKgkegdEEEEIAYSLTPPskllisgkptclssivkga 120
DSSP LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELlllllLLLEEEEEELHHhhllllllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct lhpssldmwssskkwfnedkeqtlfecatgesfwdflnkdsesstlsmfqdamasdsrmf 180
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct klvlqenkrvfegleslvdvgggtggvtkliheifphlkctvfdqpqvvgnltgnenlnf 240
DSSP hhhhhhlhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhlllllllleee
DSSP .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................fssikdi 96
ident
Sbjct vggdmfksipsadavllkwvlhdwndeqslkilknskeaishkgkdgkviiidisidets 300
DSSP eellllllllllleeeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhleeeeeeleellll
DSSP hHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHH...........hhlhhhhhhhhhhH
Query aKRKHDLIAktyedlkkleekcneeekefiKQKIK...........gierxkkisekilE 145
ident |
Sbjct dDRGLTELQ..............ldydlvmLTMFLgkertkqewekliydagfssykitP 346
DSSP lLHHHHHHH..............hhhhhhhHHHHLllleehhhhhhhhhhlllleeeeeE
DSSP HHH......hll
Query ALN......dld 151
ident
Sbjct ISGfkslievyp 358
DSSP ELLleeeeeeel
No 76: 1KGSA MOLECULE: DNA BINDING RESPONSE REGULATOR D;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nvrvlvvederdladlitealkkexftvdvcydgeegxyxalnepfdvvildixlpvhdg 60
DSSP lleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct weilksxresgvntpvlxltalsdveyrvkglnxgaddylpkpfdlreliarvralirrk 120
DSSP hhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhllllllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP LLHHHHHH.......hhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL
Query XIIXEEAK.......kliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK 52
ident | | | | | |
Sbjct SESKSTKLvcgdlildtatkkayrgskEIDLTKKEYQILEYLVXNkNRVVTKEELQEHLW 180
DSSP LLLLLLEEeelleeeelllleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHLL
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHL.......LEEEELlllllLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query iSKGNVSXSLKKLEELG.......FVRKVWikgerKNYYEAVDgfssikdiakrkhdlia 105
ident | | | | | |
Sbjct vFSDVLRSHIKNLRKKVdkgfkkkIIHTVR.....GIGYVARD................. 218
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLEEEEL.....LLEEEELL.................
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .............................................e 219
DSSP .............................................l
No 77: 1FT9A MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pprfnianvllspdgetffrgfrskihakgslvctgegdengvfvvvdgrlrvylvgeer 60
DSSP llllllhhhhlllllllllllleeeeelllleeelllllllleeeeeeleeeeeeeelle
DSSP ............................................llhhhhhhhhhhhhhh
Query ............................................xiixeeakkliielfs 16
ident
Sbjct eislfyltsgdmfcmhsgclveatertevrfadirtfeqklqtcpsmawgliailgralt 120
DSSP eeeeeeeellleeellllleeeellleeeeeelhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHLL............LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query elakIHGL...NKSVGAVYAILYLSD............KPLTISDIXEELKISKGNVSXS 61
ident | | | |
Sbjct scmrTIEDlmfHDIKQRIAGFFIDHAnttgrqtgvivsVDFTVEEIANLIGSSRQTTSTA 180
DSSP hhhhHHHHhhlHHHHHHHHHHHHHLLllllllllllleELLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query LKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcnee 121
ident | | | |
Sbjct LNSLIKEGYISRQG.....RGHYTIPNLVR.............................. 205
DSSP HHHHHHLLLLEELL.....LLLEELLLHHH..............................
DSSP lhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .........................lkaaa 210
DSSP .........................hhhll
No 78: 1X19A MOLECULE: CRTF-RELATED PROTEIN;
DSSP .............llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLL.HHHH..HHHHHHHHLllLLLH
Query .............xiixeeakkliielfselaKIHGLN.KSVG..AVYAILYLSdkPLTI 44
ident | | |
Sbjct hssglvprgshmmsnndllnyyhranelvfkgLIEFSCmKAAIelDLFSHMAEG..PKDL 58
DSSP llllleeelleeelllhhhhhhhhhhhhhlhhHHHHHHhHHHHhhLHHHHHLLL..LLLH
DSSP HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEEL..LHHH...........
Query SDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAV..DGFS........... 91
ident | |
Sbjct ATLAADTGSVPPRLEMLLETLRQMRVINLED......GKWSLTefADYMfsptpkepnlh 112
DSSP HHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELhhHHHHlllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 91
ident
Sbjct qtpvakamafladdfymglsqavrgqknfkgqvpyppvtrednlyfeeihrsnakfaiql 172
DSSP lhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 91
ident
Sbjct lleeakldgvkkmidvgggigdisaamlkhfpeldstilnlpgaidlvnenaaekgvadr 232
DSSP hhhhllllllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ........hhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHL.LLLL......hhhhhhhhhHHLH.
Query ........sikdiakrkhdliaktyEDLKKLEEKC.NEEE......kefikqkikGIER. 135
ident |
Sbjct mrgiavdiykesypeadavlfcrilYSANEQLSTImCKKAfdamrsggrllildmVIDDp 292
DSSP eeeeelllllllllllleeeeellhHHLLHHHHHHhHHHHhllllllleeeeeeeLLLLl
DSSP hHHHH..........................................hhhhhhhhhll
Query xKKIS..........................................ekilealndld 151
ident
Sbjct eNPNFdylshyilgagmpfsvlgfkeqarykeileslgykdvtmvrkydhllvqavkp 350
DSSP lLLLHhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeeeeeelleeeeeeell
No 79: 1IN4A MOLECULE: HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qflrpksldefigqenvkkklslaleaakmrgevldhvllagppglgkttlahiiaselq 60
DSSP lllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tnihvtsgpvlvkqgdmaailtslergdvlfideihrlnkaveellysaiedfqidiqpf 120
DSSP lleeeeellllllhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tlvgattrsgllssplrsrfgiileldfytvkelkeiikraaslmdveiedaaaemiakr 180
DSSP eeeeeellhhhllhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhl
DSSP ......................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHH.H
Query ......................xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILY.L 37
ident ||
Sbjct srgtpriairltkrvrdmltvvkadrintdivlktmevlniDDEGLDEFDRKILKTIIeI 240
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllLLLLLLHHHHHHHHHHHhH
DSSP LLL.LLLHHHHHHHHLLLHHHHH.HHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELL..HHHHH
Query SDK.PLTISDIXEELKISKGNVS.XSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVD..GFSSI 93
ident | | | | ||
Sbjct YRGgPVGLNALAASLGVEADTLSeVYEPYLLQAGFLARTP......RGRIVTEkaYKHLK 294
DSSP LLLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHhHLHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHhhHHHLL
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ......................................................yevp 298
DSSP ......................................................llll
No 80: 2H09A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN 57
ident | | |
Sbjct .............egfrqvREAHRRELIDDYVELISDLIrevGEARQVDMAARLGVSQPT 47
DSSP .............lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLHHHHHHHHLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident | || | |
Sbjct VAKMLKRLATMGLIEMIPW.....RGVFLTAE..geklaqesrerhqivenfllvlgvsp 100
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELHH..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh
DSSP lllllhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgiERXKKISEKilealndld 151
ident |
Sbjct eiarrdaegmehhvseETLDAFRLF.......tq 127
DSSP hhhhhhhhhhhhhllhHHHHHHHHL.......ll
No 81: 1W5SA MOLECULE: ORC2;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct glfkdrrvfdenyippelrvrrgeaealariylnrllsgaglsdvnmiygsigrvgigkt 60
DSSP lllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tlakftvkrvseaaakegltvkqayvnafnapnlytilslivrqtgypiqvrgapaldil 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kalvdnlyvenhyllvildefqsmlsspriaaedlytllrvheeipsrdgvnrigfllva 180
DSSP hhhhhhhhhhlleeeeeeellhhhhllllllhhhhhhhhlhhhhllllllllleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sdvralsymrekipqvesqigfklhlpayksrelytileqraelglrdtvweprhlelis 240
DSSP eelhhhhhhhhhlhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhh
DSSP ..............................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHH
Query ..............................xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGA 30
ident |
Sbjct dvygedkggdgsarraivalkmacemaeamgrdslsedlvrkavsenthelEALSIHELI 300
DSSP hhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhlllllLLLLHHHHH
DSSP HHHHHHHL....LLLLLHHHHHHHHL...........LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEL
Query VYAILYLS....DKPLTISDIXEELK...........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVW 75
ident || | || |
Sbjct ILRLIAEAtlggMEWINAGLLRQRYEdasltmynvkpRGYTQYHIYLKHLTSLGLVDAKP 360
DSSP HHHHHHHHhhllLLLLLHHHHHHHHHhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL
DSSP LllllLLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlh
Query IkgerKNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgier 135
ident
Sbjct S....TTLFRLAPHLP..........................................ad 374
DSSP L....LLEEEELLLLL..........................................hh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhll
Query xkkisekilealndld 151
ident
Sbjct rlievvdniiqakmas 390
DSSP hhhhhhhhhhhhhhll
No 82: 1CF7A MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHHH.LLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEEL.KISKGNV 58
ident | | | |
Sbjct .................srhekslGLLTTKFVSLLQEAKdGVLDLKLAADTLaVRQKRRI 43
DSSP .................llllllhHHHHHHHHHHHHHLLlLEEEHHHHHHHLlLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
ident || | | ||
Sbjct YDITNVLEGIGLIEKKS.....KNSIQWK............................... 67
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEEE.....LLEEEEL...............................
DSSP llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................. 67
DSSP .................................
No 83: 1Y0UA MOLECULE: ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE;
DSSP .....llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllllLHHHHHHHHLLLH
Query .....xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkplTISDIXEELKISK 55
ident | | || | ||
Sbjct ghxsleewikadslekadeyhkrynyavTNPVRRKILRXLDKG...rSEEEIXQTLSLSK 57
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHHHHLL...lLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || || | |
Sbjct KQLDYHLKVLEAGFCIERVG......ERWVVTDA.......................... 85
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELLL..........................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................gkiv 89
DSSP ................................llll
No 84: 1P2FA MOLECULE: RESPONSE REGULATOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xxwkiavvdddknilkkvseklqqlgrvktfltgedflndeeafhvvvldvxlpdysgye 60
DSSP lleeeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhlllllleeeeelllllllhhh
DSSP ..................................................LLHH..HHHH
Query ..................................................XIIX..EEAK 8
ident | |
Sbjct icrxiketrpetwvilltllsddesvlkgfeagaddyvtkpfnpeillarVKRFleREKK 120
DSSP hhhhhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhHHHHhhHLLL
DSSP HH..........hhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL...lL
Query KL..........iielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK...iS 54
ident | | | | | | | |
Sbjct GLydfgdlkidatgftvflkgkRIHLPKKEFEILLFLAENaGKVVTREKLLETFWedpvS 180
DSSP LEeeelleeeelllleeeelleELLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHHLllllL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHL........LEEEELlllllLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELG........FVRKVWikgerKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliak 106
ident | | | |
Sbjct PRVVDTVIKRIRKAIeddpnrprYIKTIW.....GVGYXFTG.................. 217
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHllllllllLEEEEL.....LLEEEELL..................
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................................. 217
DSSP .............................................
No 85: 1FP1D MOLECULE: ISOLIQUIRITIGENIN 2'-O-METHYLTRANSFERASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHH.hHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHHL..
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSV.gAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK.. 52
ident | | | | |
Sbjct ...qtedsaclsamvlttnlVYPAvlNAAIdlNLFEIIAKAtppGAFMSPSEIASKLPas 57
DSSP ...llhhhhhhhhhhhhhllHHHHhhHHHHhlLHHHHHHLLlllLLLLLHHHHHLLLLhh
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL...LLLLEEEELLH................
Query ....iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG...ERKNYYEAVDG................ 89
ident | | |
Sbjct tqhsdLPNRLDRMLRLLASYSVLTSTTRTIedgGAERVYGLSMVgkylvpdesrgylasf 117
DSSP hllllHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllLEEEEEEELLLhhhhllllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct ttflcypallqvwmnfkeavvdedfmgkdkkmnqifnksmvdvcatemkrmleiytgfeg 177
DSSP hhhhllhhhhhhhllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct istlvdvgggsgrnleliiskyplikginfdlpqvienapplsgiehvggdmfasvpqgd 237
DSSP lleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhlllllllleeeeelllllllllee
DSSP ........................................hhhhhhhHHHHHHHHhhhhh
Query ........................................fssikdiAKRKHDLIaktye 109
ident |
Sbjct amilkavchnwsdekcieflsnchkalspngkviivefilpeepntsEESKLVST..... 292
DSSP eeeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhheeeeeeeeeeeeeelllllllHHHHHHHH.....
DSSP hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHLH....................hhhhhhhhhHHHH.
Query dlkkleekcneeekefikqkikGIER....................xkkisekilEALN. 148
ident | |
Sbjct ....................ldNLMFitvggrertekqyeklsklsgfskfqvacRAFNs 332
DSSP ....................hhHHHHhhhlllleehhhhhhhhhhlllleeeeeeEELLl
DSSP ......hll
Query ......dld 151
ident
Sbjct lgvmefykx 341
DSSP eeeeeeell
No 86: 1YLFA MOLECULE: RRF2 FAMILY PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHLLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLSDKP.LTISDIXEELKISKGNV 58
ident || | |
Sbjct ....................kISSRfSIAVHILSILKNNPSSlCTSDYXAESVNTNPVVI 40
DSSP ....................lLLHHhHHHHHHHHHHHHLLHHhLLHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEElllllllLEEEEL.LHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKLEELGFVRKVwikgerkNYYEAV.DGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident | ||| |
Sbjct RKIXSYLKQAGFVYVN.......GGAGLLkDLHEIT...................lldvy 74
DSSP HHHHHHHHHLLLEEEL.......LLEEELlLHHHLL...................hhhhh
DSSP lllllHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH.........hhhhll
Query cneeeKEFIKQKIKGIERXKKISEKILE.........alndld 151
ident | | |
Sbjct havnvIGANIQAVLEIILIQAQSAXEEVlrnitxgqlfetlqe 117
DSSP hhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhll
No 87: 1ODDA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN OMPR;
DSSP llhhhhhhhhHHHHH..hhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHHHL.....
Query xiixeeakklIIELF..selakIHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK..... 52
ident | || | ||
Sbjct aviafgkfklNLGTRemfredePMPLTSGEFAVLKALVSHPrEPLSRDKLMNLARgreys 60
DSSP leeeelleeeELLLLeeeelleEELLLHHHHHHHHHHHLLLlLLLLHHHHHHHHLlllll
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHL........LEEEELLlllllLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELG........FVRKVWIkgerkNYYEAVDgfssikdiakrkhdli 104
ident | || | |
Sbjct AMERSIDVQISRLRRMVeedpahprYIQTVWG.....LGYVFVP................ 99
DSSP LLLLLHHHHHHHHHHHHllllllllLEEEELL.....LEEEELL................
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..............................................d 100
DSSP ..............................................l
No 88: 1O57A MOLECULE: PUR OPERON REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELKISKGNVS 59
ident | | | |
Sbjct ....................kfrrSGRLVDLTNYLLTHpHELIPLTFFSERYESAKSSIS 40
DSSP ....................lllhHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL......LEEEELlllLLLLEEEELLhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhh
Query XSLKKLEELG......FVRKVWikgERKNYYEAVDgfssikdIAKRKHDLIAKTYEdlkk 113
ident | | |
Sbjct EDLTIIKQTFeqqgigTLLTVP...GAAGGVKYIP......kMKQAEAEEFVQTLG.... 87
DSSP HHHHHHHHHHhhllleEEEEEL...LLLLEEEEEE......lLLHHHHHHHHHHHH....
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHHHH........................
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilEALND........................ 149
ident
Sbjct .........qslanperilpggyvyltdilgKPSVLskvgklfasvfaereidvvmtvat 138
DSSP .........hhhllhhheellleelllllllLHHHHhhhhhhhhhhllllllleeeeell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 149
ident
Sbjct kgiplayaaasylnvpvvivrkdgstvsinyvsgssnriqtmslakrsmktgsnvliidd 198
DSSP llhhhhhhhhhhhllleeeellllleeeeeeelllllleeeeeeehhhllllleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 149
ident
Sbjct fmkaggtingminlldefnanvagigvlveaegvderlvdeymslltlstinmkeksiei 258
DSSP eelllhhhhhhhhhlhhhlleeeeeeeeeeellllllllllleeeeeeelllllllllee
DSSP ..........ll
Query ..........ld 151
ident
Sbjct qngnflrffkdn 270
DSSP eellhhhhllll
No 89: 1FX7A MOLECULE: IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;
DSSP llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhHHHHHHHHHHL...llLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnksVGAVYAILYLS...dkPLTISDIXEELKISKGN 57
ident | | | | |
Sbjct .........mneLVDT...........TEMYLRTIYDLeeegvTPLRARIAERLDQSGPT 40
DSSP .........lllLLLH...........HHHHHHHHHHHhhhllLLLHHHHHHHHLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLH......hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDG......fssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident || | | | |
Sbjct VSQTVSRMERDGLLRVAGD.....RHLELTEKgralaiavmrkhrlaerllvdviglpwe 95
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhLHHHHH......hhhhhHHHHH................
Query kkleekcneeekefikqkikgiERXKKI......sekilEALND................ 149
ident
Sbjct evhaeacrwehvmsedverrlvKVLNNPttspfgnpipgLDELGvgpepgaddanlvrlt 155
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhHHLLLLlllllllllllHHHHLlllllllllllleehh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 149
ident
Sbjct elpagspvavvvrqltehvqgdidlitrlkdagvvpnarvtvettpgggvtivipghenv 215
DSSP hlllllleeeeeeeelhhhhllhhhhhhhhhllllllleeeeeellllleeeelllllle
DSSP .............ll
Query .............ld 151
ident
Sbjct tlphemahavkvekv 230
DSSP eelhhhhlleeeeel
No 90: 2JSCA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNV 58
ident | | ||
Sbjct .................larLGRAlaDPTRCRILVALLDG..VCYPGQLAAHLGLTRSNV 41
DSSP .................lllHHHHhlLHHHHHHHHHHHLL..LLLLLLHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query SXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
ident | | | | | | | |
Sbjct SNHLSCLRGCGLVVATYE..GRQVRYALADSH....................laralgel 79
DSSP HHHHHHHLLLLLEEEEEL..LLLEEEEELLHH....................hhhhhhhl
DSSP llllhhhhhhhhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikGIERxkkisekilealndld 151
ident ||
Sbjct vqvvlavdtdqpcVAER................ 96
DSSP lllllllllllllLLLL................
No 91: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dptlewflshchihkypskstlihqgekaetlyyivkgsvavlikdeegkemilsylnqg 60
DSSP lhhhhhhhllleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeeeellllleeeeeeelll
DSSP .......................................................LLHHH
Query .......................................................XIIXE 5
ident
Sbjct dfigelglfeegqersawvraktacevaeisykkfrqliqvnpdilmrlsaqmarRLQVT 120
DSSP leelhhhlllllllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL.............LLLLHHHHHHHHL
Query EAKKLIIELFselakihglnKSVGAVYAILYLSD.............KPLTISDIXEELK 52
ident | | | | |
Sbjct SEKVGNLAFL..........DVTGRIAQTLLNLAkqpdamthpdgmqIKITRQEIGQIVG 170
DSSP HHHHHHHHHL..........LHHHHHHHHHHHHLllllleeelleeeEELLHHHHHHHHL
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlk 112
ident | | || ||
Sbjct CSRETVGRILKMLEDQNLISAHG......KTIVVYG........................ 200
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEEEL........................
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ....................................... 200
DSSP .......................................
No 92: 1I1SA MOLECULE: MOTA;
DSSP llhhhhhhhhhhhHHHHHHHH...LLLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL.LLHH
Query xiixeeakkliieLFSELAKI...HGLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK.ISKG 56
ident || | |
Sbjct ............mSKVTYIIKasnDVLNEKTATILITIAKK.DFITAAEVREVHPdLGNA 47
DSSP ............lLLHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHLLlLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident | | | | |
Sbjct VVNSNIGVLIKKGLVEKSG......DGLIITGE........................... 74
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEL......LEEELLHH...........................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .............aqdiisnaatlyaqenapellk 96
DSSP .............hhhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 93: 2HS5A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR GNTR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHH..HHLL..LLLLHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAIL..YLSD..KPLTISDIXEELKISKG 56
ident | | || | |
Sbjct ....................tsrtTRVAGILRDAIidGTFRpgARLSEPDICAALDVSRN 40
DSSP ....................lhhhHHHHHHHHHHHhhLLLLllLEELHHHHHHHHLLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLHHHhhHHHHHHHH.HHHHhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFSsiKDIAKRKH.DLIAktyedlkkle 115
ident | | | |
Sbjct TVREAFQILIEDRLVAHELN.....RGVFVRVPTAedITELYICRrVVEC.......... 85
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELLLLHhhHHHHHHHHhHHHH..........
DSSP hhlllllhhHHHHH..............................................
Query ekcneeekeFIKQK.............................................. 129
ident
Sbjct .agvngfdpATGDLsrvaealdladeryavedwtgvgtadihfhsalaslnnsnridelx 144
DSSP .hhhhllllLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhh
DSSP .....................................hhhhlhhhhhhhhhhhHHHHLL.
Query .....................................ikgierxkkisekileALNDLD. 151
ident |
Sbjct rsvwnearlvfhvxddahrfhgpyltrnheiydalaagnteaagqllktyledAEAQILg 204
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHh
DSSP ...
Query ... 151
ident
Sbjct ayr 207
DSSP lll
No 94: 2CMXA MOLECULE: HYPOTHETICAL 13.2 KDA PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLL...LHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKI...SKGN 57
ident | | || || || | | |
Sbjct ....................tlnsYKXAEIXYKILEKK.GELTLEDILAQFEIsvpSAYN 39
DSSP ....................lllhHHHHHHHHHHHHHH.LEELHHHHHHHHLLlhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHL..lEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELG..fVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || | ||
Sbjct IQRALKAICERHpdeCEVQYK..NRKTTFKWIK........................... 70
DSSP HHHHHHHHHHHLlllEEEEEL..LLLEEEEELL...........................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................................... 70
DSSP ....................................
No 95: 1USTA MOLECULE: HISTONE H1;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL..LLLLLHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS..DKPLTISDIXEELK...... 52
ident | | |
Sbjct ..................keeassKSYRELIIEGLTALkeRKGSSRPALKKFIKenypiv 42
DSSP ..................llllllLLHHHHHHHHHLLLllLLLEEHHHHHHHHHhhlhhh
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query ....iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDgfSSIKdiakrkhdliakty 108
ident || | |
Sbjct gsasnFDLYFNNAIKKGVEAGDFEQPK...gpaGAVKLAK..KKSP.............. 83
DSSP hllllHHHHHHHHHHHHHHLLLEELLL...lllLEEEELL..LLLL..............
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................evkkekevs 92
DSSP ..................................lllllllll
No 96: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct etvsfkagdvilypgvpgprdrayrvleglvrleavdeegnaltlrlvrpggffgeealf 60
DSSP lleeelllleeellllllllllleeeeelleeeeeellllleeeeeeelllleellhhhh
DSSP .....................................LLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhll
Query .....................................XIIXEEAKKLIielfselakihg 23
ident
Sbjct gqeriyfaeaatdvrleplpenpdpellkdlaqhlsqGLAEAYRRIER..........la 110
DSSP lllllleeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHH..........hh
DSSP llHHHHHHHHHHHHLL.............lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLL
Query lnKSVGAVYAILYLSD.............kPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGF 70
ident | | | | | |
Sbjct tqRLKNRXAAALLELSetplaheeegkvvlKATHDELAAAVGSVRETVTKVIGELAREGY 170
DSSP hlLHHHHHHHHHHHHLlllleeeelleeeeELLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP EEEELllllllLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query VRKVWikgerkNYYEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqki 130
ident | |
Sbjct IRSGY......GKIQLLDLKG....................................... 185
DSSP EEEEL......LEEEELLHHH.......................................
DSSP hhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............lkelaesrg 194
DSSP ............hhhhhllll
No 97: 2PG4A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKG 56
ident | | | |
Sbjct ................xddetLRLQfGHLIRILPTLLEFEkkgYEPSLAEIVKASGVSEK 44
DSSP ................lllhhHHLLhHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLLLHH
DSSP HHH.HHHHHHHHHLLEEEELLLlLLLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVS.XSLKKLEELGFVRKVWIKgERKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | | | |
Sbjct TFFxGLKDRLIRAGLVKEETLS.YRVKTLKLTEK.......................... 77
DSSP HHHlLHHHHHHHLLLEEEEEEE.LLEEEEEELHH..........................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .....................grrlaeclekcrdvl 92
DSSP .....................hhhhhhhhhhhhhhl
No 98: 2GAIA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE I;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kyivvespakaktiksilgneyevfasmghiidlpkskfgvdlekdfepefavikgkekv 60
DSSP leeeellhhhhhhhhhhhhhhleeeellllleellllllleellllleelleellllhhh
DSSP ...........................................................l
Query ...........................................................x 1
ident
Sbjct veklkdlakkgelliasdmdregeaiawhiarvtntlgrknrivfseitprvireavknp 120
DSSP hhhhhhhhhhlleeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhll
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL................LLHHHHHHHHHHHHLL......
Query iixeeakkliielfselaKIHG................LNKSVGAVYAILYLSD...... 39
ident | | |
Sbjct reidmkkvraqlarrildRIVGyslspvlwrnfksnlsAGRVQSATLKLVCDREreilrf 180
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct vpkkyhritvnfdgltaeidvkekkffdaetlkeiqsidelvveekkvsvkkfappepfk 240
DSSP llleeeeeeeeelleeeeelllllllllhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct tstlqqeaysklgfsvsktmmiaqqlyegvetkdghiafitymrtdstrvsdyakeearn 300
DSSP hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhleelllleellllllllllllllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct litevfgeeyvgaheairptnvfmtpeeagkylnsdqkklyeliwkrflasqmkpsqyee 360
DSSP hhhhhllhhhlllllllllllllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct trfvlrtkdgkyrfkgtvlkkifdgyekvwkterntgefpfeegesvkpvvvkieeqetk 420
DSSP eeeeeelllllleeeeeeeeeeelhhhhllllllllllllllllleellleeeeeeeell
DSSP ..LLLLHHHHHHHHL....LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLH....
Query ..KPLTISDIXEELK....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDG.... 89
ident | | | | | | |
Sbjct pkPRYTEGSLVKEMErlgiGRPSTYASTIKLLLNRGYIKKIR......GYLYPTIVgsvv 474
DSSP llLLLLHHHHHHHHHhhllLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHHhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct mdylekkysdvvsvsftaemekdldeveqgkktdkivlrefyesfssvfdrndrivvdfp 534
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllee
DSSP ................................HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ................................FSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident
Sbjct tnqkcscgkemrlsfgkygfylkcecgktrsvKNDE........................ 570
DSSP eeeellllleeeeeeelleeeeelllllleelLLLL........................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .......................iaviddgkifl 581
DSSP .......................lleeelleeel
No 99: 2C6YA MOLECULE: INTERLEUKIN 2 PROMOTOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL.......
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK....... 52
ident || || |
Sbjct ...................dskppYSYAQLIVQAITMApDKQLTLNGIYTHITknypyyr 41
DSSP ...................lllllLLHHHHHHHHHHLLlLLLEEHHHHHHHHHhhlllll
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHhhhLLEEEELLL...LLLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhh
Query ....iSKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIK...GERKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdl 103
ident | ||
Sbjct tadkgWQNSIRHNLSLN...RYFIKVPRSqeePGKGSFWRIDpaSESK............ 86
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHL...LLEEEELLLlllLLLLLEEEELhhHHHH............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ....................................lieqafrkrrpr 98
DSSP ....................................hhhhhlllllll
No 100: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | |
Sbjct .....................MKLDQIDLNIIEELKKD.sRLSMRELGRKIKLSPPSVTE 38
DSSP .....................LLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEeelllllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRkvwikgerknyyeaVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident || |
Sbjct RVRQLESFGIIK..............QYTL..................evdqkklglpvs 66
DSSP HHHHHHHLLLEE..............EEEE..................eellhhhlllee
DSSP llhhhhhhhhhhhlHHHHHHHhhhhhhHHLL.............................
Query eekefikqkikgieRXKKISEkilealNDLD............................. 151
ident | |
Sbjct civeatvknadyerFKSYIQT....lpNIEFcyriagaacymlkinaesleavedfinkt 122
DSSP eeeeeeehhhlhhhHHHHHHL....llLEEEeeeeelllleeeeeeellhhhhhhhhhhh
DSSP ..................
Query .................. 151
ident
Sbjct spyaqtvthvifseidtk 140
DSSP llleeeeeeeeeeellll
No 101: 1U6GA MOLECULE: CULLIN HOMOLOG 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ldqiwddlragiqqvytrqsmaksrymelythvynyctsvglelykrlkeflknyltnll 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kdgedlmdesvlkfytqqwedyrfsskvlngicaylnrhwvrreckgiyeiyslalvtwr 120
DSSP hllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dclfrplnkqvtnavlkliekerngetintrlisgvvqsyvelglgptltvykesfesqf 180
DSSP hhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhlhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ladterfytresteflqqnpvteymkkaearlleeqrrvqvylhestqdelarkceqvli 240
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ekhleifhtefqnlldadknedlgrmynlvsriqdglgelkkllethihnqglaaiekcg 300
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct eaalndpkmyvqtvldvhkkynalvmsafnndagfvaaldkacgrfinnnavtkmaqsss 360
DSSP lhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kspellarycdsllkkeeaeledtlnqvmvvfkyiedkdvfqkfyakmlakrlvhqnsas 420
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ddaeasmisklkqacgfeytsklqrmfqdigvskdlneqfkkhltnsepldldfsiqvls 480
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeelleee
DSSP .......llhhhhhHHHH.......................hhhhhHHHH........hL
Query .......xiixeeaKKLI.......................ielfsELAK........iH 22
ident
Sbjct sgswpfqqsctfalPSELersyqrftafyasrhsgrkltwlyqlskGELVtncfknrytL 540
DSSP hhhlllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhleEEEEellllllleE
DSSP LLLHHHHHHHHHhHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEL.......
Query GLNKSVGAVYAIlYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVW....... 75
ident | | | | | |
Sbjct QASTFQMAILLQ.YNTEDAYTVQQLTDSTQIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDenanvde 599
DSSP EEEHHHHHHHHH.HHLLLEEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLllllhhh
DSSP lllllLLEEEELlHHHHhhhHHHH................................hhhh
Query ikgerKNYYEAVdGFSSikdIAKR................................khdl 103
ident |
Sbjct velkpDTLIKLY.LGYK...NKKLrvninvpmkteqkqeqetthknieedrklliqaaiv 655
DSSP lllllLLEEEEL.LLLL...LLLLeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlLLLLHHHHHH............hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iaktyedlkkleekcNEEEKEFIKQ............kikgierxkkisekilealndld 151
ident |
Sbjct rimkmrkvlkhqqllGEVLTQLSSRfkprvpvikkcidiliekeylervdgekdtysyla 715
DSSP hhhlllleeehhhhhHHHHHHHLLLllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeeeeell
No 102: 1OYIA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-BINDING PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHHL.....lLLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgAVYAILYLS.....dKPLTISDIXEELKISK 55
ident | | | |
Sbjct ............................rSNAEIVCEAiktigiEGATAAQLTRQLNMEK 32
DSSP ............................lLLHHHHHHHhhhhllLLEEHHHHHHHLLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllLLLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgeRKNYYEAVdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | | | |
Sbjct REVNKALYDLQRSAMVYSSDD...IPPRWFMT............................ 61
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLEELLL...LLLEEELL............................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...................................t 62
DSSP ...................................l
No 103: 1GXPA MOLECULE: 5'-D(*GP*AP*GP*CP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*
DSSP llhHHHH...hhhhhhhhhHHHH....HLLLLHHHHHHHHHHHHLL.LLLLHHHHHHHHL
Query xiiXEEA...kkliielfsELAK....IHGLNKSVGAVYAILYLSD.KPLTISDIXEELK 52
ident ||
Sbjct ..aVEEViemqglsldptsHRVMageePLEMGPTEFKLLHFFMTHPeRVYSREQLLNHVW 58
DSSP ..lLLLLeeelleeeelllLEEEelleEELLLHHHHHHHHHHHHLLlLLLLHHHHHHHHL
DSSP .....lLHHHHHHHHHHHHH.......HLLEEEELlllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhh
Query .....iSKGNVSXSLKKLEE.......LGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFssikdiakrk 100
ident | | | | | |
Sbjct gtnvyvEDRTVDVHIRRLRKalepgghDRMVQTVR.....GTGYRFSTRF.......... 103
DSSP llllllLLLHHHHHHHHHHHhhllllhHHHEEEEL.....LLEEEELLLL..........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................... 103
DSSP ...................................................
No 104: 1CY0A MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE I;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gkalvivespakaktinkylgsdyvvkssvghirdlpalvnrmgvdpwhnweahyevlpg 60
DSSP lleeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeellllleelllhhhhhleellllleelleelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kekvvselkqlaekadhiylatdldregeaiawhlreviggddarysrvvfneitknair 120
DSSP lhhhhhhhhhhhllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllllllhhhhh
DSSP ........llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.............LLHHHHHHHHHHHHLL
Query ........xiixeeakkliielfselaKIHG.............LNKSVGAVYAILYLSD 39
ident
Sbjct qafnkpgelnidrvnaqqarrfmdrvvGYMVspllwkkiarglsAGRVQSVAVRLVVERE 180
DSSP hhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhllllllLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct reikafvpeefwevdastttpsgealalqvthqndkpfrpvnkeqtqaavsllekarysv 240
DSSP hhhhhlllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeelleelllllhhhhhhhhhhhhhlleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct leredkpttskpgapfitstlqqaastrlgfgvkktmmmaqrlyeagyitymrtdstnls 300
DSSP eeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct qdavnmvrgyisdnfgkkylpespnqyaskensqeaheairpsdvnvmaeslkdmeadaq 360
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllhhhlllllllllllllllllllllllllllllhhhlllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct klyqliwrqfvacqmtpakydsttltvgagdfrlkargrilrfdgwtkvmilpavnkgda 420
DSSP hhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeelhhhhhlllllllllle
DSSP ................LLLLHHHHHHHHL....LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllll
Query ................KPLTISDIXEELK....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikge 79
ident || | ||
Sbjct ltlveltpaqhftkppARFSEASLVKELEkrgiGRPSTYASIISTIQDRGYVRVEN.... 476
DSSP eeeeeeeeeeeellllLLLLHHHHHHHHHhlllLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEL....
DSSP llLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query rkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkki 139
ident |
Sbjct ..RRFYAEKM............geivtdrleenfrelmnydftaqmensldqvanheaew 522
DSSP ..LEEEELHH............hhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllh
DSSP hhhhhhhhhhll
Query sekilealndld 151
ident
Sbjct kavldhffsdft 534
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 105: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | |||| | ||
Sbjct ......................HLDDLDRNILRLLKKD.aRLTISELSEQLKKPESTIHF 37
DSSP ......................LLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEeeelllllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhHHHLlL
Query SLKKLEELGFVrkvwikgerknyyeaVDGFssikdiakrkhdliaktyEDLKklEEKCnE 120
ident ||| | | | | |
Sbjct RIKKLQERGVI...............ERYT....iilgeqlkpkhlalIVLE..VGKP.E 75
DSSP HHHHHHHLLLE...............EEEE....eeellllllleeeeEEEE..ELLL.L
DSSP LLHHHHHHHHHHHLHHHHHHH.......................................
Query EEKEFIKQKIKGIERXKKISE....................................... 141
ident | |
Sbjct DFLERYISYISSTLSALPGVLfvaksgedkiialvgknnkdelvkfieenitsipnlkhi 135
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEeeeeellleeeeeeeellllhhhhhhhhhlllllleeee
DSSP ................hHHHHhhhll
Query ................kILEAlndld 151
ident |
Sbjct qifpiteikkgedltgfLAEV..... 156
DSSP eeeelleeeelllhhhhHLLL.....
No 106: 1LDDA MOLECULE: ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHHL.....
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK..... 52
ident | ||
Sbjct ......................kyELTLQRSLPFIEGMltnLGAMKLHKIHSFLKitvpk 38
DSSP ......................llHHHHHHHHHHHHHHhhhHLLEEHHHHHHHHHhhllh
DSSP ......LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVdgfssikdiakrkhdliak 106
ident | | | | || |
Sbjct dwgynrITLQQLEGYLNTLADEGRLKYIAN.....GSYEIV................... 74
DSSP hhllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEELLLL.....LEEEEL...................
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................................. 74
DSSP .............................................
No 107: 1E17A MOLECULE: AFX;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLlHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL.......
Query xiixeeakkliielfselakIHGLnKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK....... 52
ident | || | |
Sbjct ...............srrnaWGNQ.SYAELISQAIESApEKRLTLAQIYEWMVrtvpyfk 44
DSSP ...............lllllLLLL.LHHHHHHHHHHHLlLLLEEHHHHHHHHHhhlhhhh
DSSP .........lLHHHHHHHHHHhhhHLLEEEELLL.LLLLLEEEELLHHhhhhhhhhhhhh
Query .........iSKGNVSXSLKKleeLGFVRKVWIK.GERKNYYEAVDGFssikdiakrkhd 102
ident | | ||
Sbjct dkgdsnssagWKNSIRHNLSL...HSKFIKVHNEaTGKSSWWMLNPEG............ 89
DSSP hhhllllhhhHHHHHHHHHHL...LLLEEEELLLlLLLLLEEEELLLL............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query liaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................g 90
DSSP ................................................l
No 108: 2IXSA MOLECULE: SDAI RESTRICTION ENDONUCLEASE;
DSSP llhhhhhhhHHHHHHHHHHHH...LLLLH..HHHHHHHHHHH..........LLLLLLHH
Query xiixeeakkLIIELFSELAKI...HGLNK..SVGAVYAILYL..........SDKPLTIS 45
ident | | | | |
Sbjct ..ndidetaATIDTARALLKSfgfEAQRHnvRSAVTLLALAGlkpgdhwadsTTPRLGVQ 58
DSSP ..lllllllLLHHHHHHHHHHlllLHHHLlhHHHHHHHHHLLllllllhhhlLLLLEEHH
DSSP HHHHHHL.........lLHHHHH.HHHHHHHHHLLEEEE.LLLLLL....LLEEEEL..L
Query DIXEELK.........iSKGNVS.XSLKKLEELGFVRKV.WIKGER....KNYYEAV..D 88
ident | | | || | |
Sbjct KIMDWSGaywakpyatgSREDFRkKTLRQWVDNGFAVLNpDNLNIAtnsqLNEYCLSdeA 118
DSSP HHHHHHHhhllllllhhHHHHHHhHLHHHHHHLLLEEELlLLLLLLllllLLEEEELhhH
DSSP HHH............hhHHHH............................hhhhhhhhhHH
Query GFS............siKDIA............................krkhdliakTY 108
ident
Sbjct AQAirsygtdafesalvDFLSkasdtvraraealraamisvdladgdefllspagqnpLL 178
DSSP HHHhhhlllllhhhhhhHHHLlllhhhhhhhhhhhhlleeeeeelleeeeelllllhhHH
DSSP HHHH.HHHHHLL...........................................lllhh
Query EDLK.KLEEKCN...........................................eeeke 124
ident
Sbjct KKMVeEFMPRFApgakvlyigdtrgkhtrfekrifeetlgltfdphgrmpdlvlhdkvrk 238
DSSP HHHHhLHHHHHLllleeeeeelllllleeelhhhhhhlllllllllllllleeeeellll
DSSP hhHHHH......................................................
Query fiKQKI...................................................... 130
ident
Sbjct wlFLMEavkskgpfdeerhrtlrelfatpvaglvfvncfenreamrqwlpelaweteawv 298
DSSP eeEEEEellllllllhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeellhhhhhhhhhhlllleeeee
DSSP hhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct addpdhlihlngsrflgpyer 319
DSSP llllllleeellhhhllllll
No 109: 1FNNA MOLECULE: CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 6;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aivvddsvfspsyvpkrlphreqqlqqldillgnwlrnpghhypratllgrpgtgktvtl 60
DSSP lllllhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeellllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rklwelykdkttarfvyingfiyrnftaiigeiarslnipfprrglsrdeflallvehlr 120
DSSP hhhhhhhlllllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct erdlymflvlddafnlapdilstfirlgqeadklgafrialvivghndavlnnldpstrg 180
DSSP hlllleeeeeelhhhllhhhhhhhhhhlllhhhhlllleeeeeeelllhhhhlllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct imgkyvirfspytkdqifdilldrakaglaegsysedilqmiaditgaqtpldtnrgdar 240
DSSP hhllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllllllllllllhh
DSSP .......................llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHH
Query .......................xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYL 37
ident |
Sbjct laidilyrsayaaqqngrkhiapedvrksskevlfgiseeVLIG..LPLHEKLFLLAIVR 298
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllllhhHHHH..LLHHHHHHHHHHHH
DSSP L.....LLLLLHHHHHHHHL..........LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllLL
Query S.....DKPLTISDIXEELK..........ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKN 82
ident | | | | | | | | | |
Sbjct SlkishTPYITFGDAEESYKivceeygerpRVHSQLWSYLNDLREKGIVETRQN....TT 354
DSSP HhhhhlLLLEEHHHHHHHHHhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEL....LE
DSSP EEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query YYEAVDGFssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek 142
ident
Sbjct LISIGTEP............................................ldtleavi 370
DSSP EEELLLLL............................................hhhhhhhh
DSSP hhhhhhhll
Query ilealndld 151
ident
Sbjct tklikeelr 379
DSSP hhhhhhhll
No 110: 1BM9A MOLECULE: REPLICATION TERMINATOR PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELK........ 52
ident | | |
Sbjct ..........eekrsstgflvkqrAFLKLYMITMTEQE..rLYGLKLLEVLRsefkeigf 48
DSSP ..........llllllllllllhhHHHHHHHHHHHHLL..lLLLLLHHHHHHhhhlllll
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL.....LLLLEEEELLHHHHHHhhhhhhhhhhhh
Query .ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIKG.....ERKNYYEAVDGFSSIKdiakrkhdliak 106
ident | || | | | | |
Sbjct kPNHTEVYRSLHELLDDGILKQIKVKKegaklQEVVLYQFKDYEAAKL............ 96
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELlllllLEEEEEEELLHHHHHH............
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqKIKGierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..ykkqlkveldrckkliekalSDNF................... 120
DSSP ..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL...................
No 111: 2HWVA MOLECULE: DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR VICR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhHHHH......hLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHLL
Query xiixeeakkliielfsELAK......iHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELKI 53
ident | | |
Sbjct ....shmtigdltihpDAYMvskrgekIELTHREFELLYYLAKHiGQVMTREHLLQTVWG 56
DSSP ....lleeelleeellLLLEeeelleeEELLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLL
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHL........lEEEELlllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhh
Query .....SKGNVSXSLKKLEELG........fVRKVWikgerKNYYEAVDGFssikdiakrk 100
ident | | | |
Sbjct ydyfgDVRTVDVTVRRLREKIedspshptyLVTRR.....GVGYYLRNPE.......... 101
DSSP hhhllLHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllEEEEL.....LLEEEELLLL..........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................... 101
DSSP ...................................................
No 112: 2DBBA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || || |
Sbjct ......................KLDRVDMQLVKILSEN.sRLTYRELADILNTTRQRIAR 37
DSSP ......................LLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident || || || |
Sbjct RIDKLKKLGIIRKFTI................................ipdidklgymya 65
DSSP HHHHHHHHLLEEEEEE................................eellhhhleeee
DSSP llhhhhhhhhhhhLHHHHHHHH..hhhhHHHL............................
Query eekefikqkikgiERXKKISEK..ileaLNDL............................ 150
ident ||
Sbjct ivlikskvpsdadKVISEISDIeyvksvEKGVgryniivrlllpkdikdaenliseflqr 125
DSSP eeeeeellhhhhhHHHHHHLLLlleeeeEEEElllleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ....................l
Query ....................d 151
ident
Sbjct iknaenvevilisevrkfeii 146
DSSP llleeeeeeeeeeeeeeelll
No 113: 1OYWA MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xaqaevlnlesgakqvlqetfgyqqfrpgqeeiidtvlsgrdclvvxptgggkslcyqip 60
DSSP llllllllhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeelllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct alllngltvvvsplislxkdqvdqlqangvaaaclnstqtreqqlevxtgcrtgqirlly 120
DSSP hhhllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct iaperlxldnflehlahwnpvllavdeahcisqwghdfrpeyaalgqlrqrfptlpfxal 180
DSSP elhhhhllllhhhhhlllleeeeeellhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tataddttrqdivrllglndpliqissfdrpniryxlxekfkpldqlxryvqeqrgksgi 240
DSSP ellllhhhhhhhhhhhllllleeeellllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhlllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct iycnsrakvedtaarlqskgisaaayhaglennvradvqekfqrddlqivvatvafgxgi 300
DSSP eelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhllllleeeellllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nkpnvrfvvhfdiprniesyyqetgragrdglpaeaxlfydpadxawlrrcleekpqgql 360
DSSP lllllleeeellllllhhhhhhhhllllllllleeeeeeelhhhhhhhhhhhhlllllhh
DSSP ............................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHH
Query ............................xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVY 32
ident
Sbjct qdierhklnaxgafaeaqtcrrlvllnyfgegrqepcgncdicldppkQYDGSTDAQIAL 420
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllllllllllhhhhllllEEELHHHHHHHH
DSSP HHHHHLLLLLLHHHHHHHHL.......................LLHHHHHHHHHHHHHHL
Query AILYLSDKPLTISDIXEELK.......................ISKGNVSXSLKKLEELG 69
ident | | | ||
Sbjct STIGRVNQRFGXGYVVEVIRgannqrirdyghdklkvygxgrdKSHEHWVSVIRQLIHLG 480
DSSP HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHllllhhhhhhlhhhlllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL
DSSP LEEEELLllllLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query FVRKVWIkgerKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqk 129
ident |
Sbjct LVTQNIA...qHSALQLTEA........................................ 497
DSSP LEEEEHH...hLLEEEELHH........................................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...arpvlrgesslqlavpriv 516
DSSP ...hhhhhhllllleeelllll
No 114: 1I1GA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident || | | || |
Sbjct .......................IDERDKIILEILEKD.aRTPFTEIAKKLGISETAVRK 36
DSSP .......................LLLHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident | ||| |
Sbjct RVKALEEKGIIEGYT............................................. 51
DSSP HHHHHHHHLLLLLLL.............................................
DSSP llhhhhhhhhhhHLHHhhHHHH...................hhhhHHHLL..........
Query eekefikqkikgIERXkkISEK...................ileaLNDLD.......... 151
ident |
Sbjct ...ikinpkklgYSLV..TITGvdtkpeklfevaeklkeydfvkeLYLSSgdhmimaviw 106
DSSP ...lllllhhhlLLEE..EEEEeeelhhhhhhhhhhhhhllleeeELLLLlllleeeeee
DSSP ..................................
Query .................................. 151
ident
Sbjct akdgedlaeiisnkigkiegvtkvcpaiileklk 140
DSSP ellhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeellllll
No 115: 1GKUB MOLECULE: REVERSE GYRASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aaaaaaaaaaaaaaaaaaaslclfpedfllkefveffrkcvgepraiqkmwakrilrkes 60
DSSP lllllllleellllleelllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct faataptgvgktsfglamslflalkgkrcyvifptsllviqaaetirkyaekagvgtenl 120
DSSP eelllllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct igyyhgripkrekenfmqnlrnfkivitttqflskhyrelghfdfifvddvdailkaskn 180
DSSP eeelllllllhhhhhhhhlhhhlleeeeehhhhhhllllllllleeeellhhhhhlllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vdkllhllgfhydlktkswvgeargclmvstatakkgkkaelfrqllnfdigssritvrn 240
DSSP hhhhhhhlleeeelllleeeelllleeeellllllllllhhhhhhhhllllllleellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vedvavndesistlssileklgtggiiyartgeeaeeiyeslknkfrigivtatkkgdye 300
DSSP eeeeeellllllllhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhllllllleeellllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kfvegeidhligtahrgldlperirfavfvgcpsfrvtiedidslspqmvkllaylyrnv 360
DSSP hhhhlllleeeeelllllllllllleeeeellleeeeelllhhhllhhhhhhhhlllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct deierllpaverhidevreilkkvmgkerpqakdvvvregevifpdlrtyiqgsgrtsrl 420
DSSP hhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelleeeeelhhhhhhhhhlllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct faggltkgasflleddsellsafieraklydiefksidevdfeklsreldesrdryrrrq 480
DSSP elleelleeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct efdlikpalfivesptkarqisrffgkpsvkvldgavvyeipmqkyvlmvtasighvvdl 540
DSSP hlllleeeeeeellhhhhhhhhhhheeleeeeelleeeeeeellleeeeeeellllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct itnrgfhgvlvngrfvpvyasikdnsrsriealrklahdaefvivgtdpdtegekiawdl 600
DSSP llllllllllllllllleeeellllhhhhhhhhhhhhhhhleeeelllllhhhhhhhhhh
DSSP ................................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.....
Query ................................xiixeeakkliielfselaKIHG..... 23
ident
Sbjct knllsgcgavkraefhevtrrailealeslrdvdenlvkaqvvrriedrwiGFVLsqklw 660
DSSP hhhhlllleeeelllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhh
DSSP .........LLHHHHHHHHHHHHLLL..................................
Query .........LNKSVGAVYAILYLSDK.................................. 40
ident |
Sbjct erfnnrnlsAGRAQTLVLGWIIDRFQesrerrkiaivrdfdlvlehdeeefdltiklvee 720
DSSP hllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHLhhhleeeeeeelllleeellllleeeeeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 40
ident
Sbjct reelrtplppyttetmlsdanrilkfsvkqtmqiaqelfenglityhrtdstrvsdvgqr 780
DSSP eeeeelllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 40
ident
Sbjct iakeylgddfvgrewgesgahecirptrpltrddvqrliqegvlvveglrwehfalydli 840
DSSP hhhhhhlllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 40
ident
Sbjct frrfmasqcrpfkvvvkkysiefdgktaeeerivraegrayelyravwvknelptgtfrv 900
DSSP hhhhhhllllleeeeeeeeeeeelleeeeelleeeeelhhhhhlllllllllllleeeee
DSSP ...........LLLHHHHHHHHL.....llhHHHHhHHHHHHHHLLEEEELllllllLEE
Query ...........PLTISDIXEELK.....iskGNVSxSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYY 84
ident | | | | | | |
Sbjct kaevksvpkvlPFTQSEIIQMMKergigrpsTYAT.IVDRLFMRNYVVEKY......GRM 953
DSSP ellleeeelllLLLHHHHHHHHHhhllllllLHHH.HHHHHHHLLLEEEEL......LEE
DSSP EELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query EAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekil 144
ident
Sbjct IPTKL.........gidvfrflvrryakfvsedrtrdlesrmdaiergeldylkaledmy 1004
DSSP EELHH.........hhhhhhhhhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
DSSP hhhhhll
Query ealndld 151
ident
Sbjct aeiksid 1011
DSSP hhhhlll
No 116: 2P6RA MOLECULE: AFUHEL308 HELICASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mkveelaesissyavgilkeeelfppqaeavekvfsgknlllamptaagktllaemamvr 60
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhllllleeeelllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........................................................LLHH
Query ........................................................XIIX 4
ident
Sbjct eaikggkslyvvplralagekyesfkkwekiglrigistgdyesrdehlgdcdiivTTSE 120
DSSP hhhlllleeeeellhhhhhhhhhhhllllllllleeeellllllllllllllleeeEEHH
DSSP HHHHHHH.....................................................
Query EEAKKLI..................................................... 11
ident
Sbjct KADSLIRnraswikavsclvvdeihlldsekrgatleilvtkmrrmnkalrviglsatap 180
DSSP HHHHHHHllllhhhhlleeeellhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 11
ident
Sbjct nvteiaewldadyyvsdwrpvplvegvlcegtlelfdgafstsrrvkfeelveecvaeng 240
DSSP lhhhhhhhllleeeellllllleeeeeellleeeeeelleeeeeellhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 11
ident
Sbjct gvlvfestrrgaektavklsaitakyveneglekaileenegemsrklaecvrkgaafhh 300
DSSP leeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllleel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 11
ident
Sbjct agllngqrrvvedafrrgnikvvvatptlaagvnlparrvivrslyrfdgyskrikvsey 360
DSSP llllhhhhhhhhhhhhllllleeeellllllllllllleeeellleeellleeellhhhh
DSSP ....................................hhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHH
Query ....................................ielfselakihgLNKSVGAVYAIL 35
ident |
Sbjct kqmagragrpgmdergeaiiivgkrdreiavkryifgeperitsklgvETHLRFHSLSII 420
DSSP hhhhllllllllllleeeeeellhhhhhhhhhllllllllllllllllHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLlllLLHHHHHHHHL..........lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllllEEE
Query YLSdkpLTISDIXEELK..........iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknYYE 85
ident | || | |
Sbjct CDG.yaKTLEELEDFFAdtfffkqneisLSYELERVVRQLENWGMVVEAA.......HLA 472
DSSP HHL.llLLHHHHHHHHHllllhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL.......LEE
DSSP ELLH............hHHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhhhhhhhHHLLLLLhHHHHH
Query AVDG............fSSIKDIAKRKHDL.....iaktyedlkkleEKCNEEEkEFIKQ 128
ident | |
Sbjct PTKLgslvsrlyidpltGFIFHDVLSRMELsdigalhlicrtpdmerLTVRKTD.SWVEE 531
DSSP ELHHhhhhhhllllhhhHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhllllllLLLLLLL.HHHHH
DSSP HHHhHLHHH...................................................
Query KIKgIERXK................................................... 137
ident
Sbjct EAFrLRKELsyypsdfsveydwflsevktalclkdwieekdedeicakygiapgdlrriv 591
DSSP HHHhHHHHLllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllhhhhhhhh
DSSP ............hhhhhHHHH.......................................
Query ............kisekILEA....................................... 146
ident
Sbjct etaewlsnamnriaeevGNTSvsglterikhgvkeellelvrirhigrvrarklynagir 651
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLlllhhhhhhhlllhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllll
DSSP ...........................hhhll
Query ...........................lndld 151
ident
Sbjct naedivrhrekvasligrgiaervvegisvks 683
DSSP lhhhhhhlhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhl
No 117: 2O0YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhhHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnksvgAVYAILylsDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | |
Sbjct ..........gvRSVT..........rviDLLELFdaaHPTRSLKELVEGTKLPKTTVVR 40
DSSP ..........llHHHH..........hhhHHHLLLlllLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELL.HHHHHHHHHhhhhhHHHHHHHHHHH......
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVD.GFSSIKDIAkrkhdLIAKTYEDLKK...... 113
ident | |
Sbjct LVATXCARSVLTSRAD.....GSYSLGPeXLRWVRLAG..rtwAPPEEVVDIXRqlsadt 93
DSSP HHHHHHHLLLEEELLL.....LLEEELHhHHHHHHHHH..hhhLLLHHHHHHHHhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 113
ident
Sbjct getvnlyirqglsrvvvaqcestatvrsviplgvpyplwagaagkilllaapeliddvaa 153
DSSP lleeeeeeeelleeeeeeeellllllllllllllleellllhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 113
ident
Sbjct dsphgpefadqlrekvedgrergyqlvhgerelgssglsfplvdshgtvvaaltlggptg 213
DSSP hllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeellllleeeeeeeeeehh
DSSP ...hhhhlLLLLHHHH.HHHHHHHLhhHHHHhhhhhhhhhll
Query ...leekcNEEEKEFI.KQKIKGIErxKKISekilealndld 151
ident | | |
Sbjct rftedrtpHYIECTRAaAEEISAIG..LPGL........... 242
DSSP hlllllhhHHHHHHHHhHHHHHHHL..LLLL...........
No 118: 2HYEC MOLECULE: DNA DAMAGE-BINDING PROTEIN 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kklviknfrdrprlpdnytqdtwrklheavravqsstsirynleelyqavenlcshkvsp 60
DSSP lllleelllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhlllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlykqlrqacedhvqaqilpfredsldsvlflkkintcwqdhcrqmimirsiflfldrty 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vlqnstlpsiwdmglelfrthiisdkmvqsktidgilllierersgeavdrsllrsllgm 180
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lsdlqvykdsfelkfleetnclyaaegqrlmqerevpeylnhvskrleeegdrvityldh 240
DSSP hhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct stqkpliacvekqllgehltailqkgldhlldenrvpdlaqmyqlfsrvrggqqallqhw 300
DSSP llhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct seyiktfgtaivinpekdkdmvqdlldfkdkvdhvievcfqknerfvnlmkesfetfink 360
DSSP hhhhhhhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rpnkpaeliakhvdsklragnkeatdeelertldkimilfrfihgkdvfeafykkdlakr 420
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct llvgksasvdaeksmlsklkhecgaaftsklegmfkdmelskdimvhfkqhmqnqsdsgp 480
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
DSSP ...................llhhHHHH....................hhhhhhhHHHH..
Query ...................xiixEEAK....................kliielfSELA.. 19
ident
Sbjct idltvniltmgywptytpmevhlTPEMiklqevfkafylgkhsgrklqwqttlgHAVLka 540
DSSP leeeeeeeellllllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhhllllleellllhhhlEEEEel
DSSP ......hhLLLLHHHHHHHHHhHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH..HLLE
Query ......kiHGLNKSVGAVYAIlYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEE..LGFV 71
ident | | | | |
Sbjct efkegkkeFQVSLFQTLVLLM.FNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACgkARVL 599
DSSP llllllleEEEEHHHHHHHHH.LLLLLLEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHLLLLllLLLE
DSSP EEEL..lllllLLEEEELLhhhHHHHHH..............hhhhhhhhhhhhhhhHHH
Query RKVW..ikgerKNYYEAVDgfsSIKDIA..............krkhdliaktyedlkKLE 115
ident | |
Sbjct IKSPkgkevedGDKFIFNG...EFKHKLfrikinqiqmketveeqvsttervfqdrqYQI 656
DSSP EELLlllllllLLEEEELL...LLLLLLlleelhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhHHH
DSSP HHL...................lLLLHHHHHH........hhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query EKC...................nEEEKEFIKQ........kikgierxkkisekilealn 148
ident |
Sbjct DAAivrimkmrktlghnllvselYNQLKFPVKpgdlkkrieslidrdymerdkdnpnqyh 716
DSSP HHHhhhhhhhlleeelhhhhhhhHHHLLLLLLhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleee
DSSP hll
Query dld 151
ident
Sbjct yva 719
DSSP lll
No 119: 1NHAA MOLECULE: TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IIF, ALPHA
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK........ 52
ident || | | | |
Sbjct ......................dvQVTEDAVRRYLTRK..PMTTKDLLKKFQtkktglss 36
DSSP ......................llLLLHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHLLlllllllh
DSSP .lLHHHHHHHHHHHHhhllEEEELLllLLLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .iSKGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIkgERKNYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedl 111
ident || | | |
Sbjct eqTVNVLAQILKRLN....PERKMI..NDKMHFSLKE....................... 67
DSSP hhHHHHHHHHHHHHL....LEEEEE..LLEEEEELLL.......................
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................................ 67
DSSP ........................................
No 120: 2FNAA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gxlfdtspkdnrkdffdrekeieklkglrapitlvlglrrtgkssiikiginelnlpyiy 60
DSSP lllllllllllhhhllllhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ldlrkfeernyisykdfllelqkeinklvkrlpsllkalkniqgivixgneikfnrlsfa 120
DSSP eehhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllleeelllleeellllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nllesfeqaskdnviivldeaqelvklrgvnllpalayaydnlkrikfixsgsexgllyd 180
DSSP hhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhhllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeellhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ylrvedpesplfgrafstvelkpfsreeaieflrrgfqeadidfkdyevvyekiggipgw 240
DSSP hllllllllllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhh
DSSP .................llhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLLL..LHHHHHHHHHHHhllLL
Query .................xiixeeakkliielfsELAKIHGL..NKSVGAVYAILYlsdKP 41
ident | | | |
Sbjct ltyfgfiyldnknldfainqtleyakklilkefENFLHGREiaRKRYLNIXRTLS...KC 297
DSSP hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLHhhHHHHHHHHHHHL...LL
DSSP LLHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHHhhhhh
Query LTISDIXEELK......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFssikd 95
ident || | || | | | |
Sbjct GKWSDVKRALEleegieISDSEIYNYLTQLTKHSWIIKEG......EKYCPSEPL..... 346
DSSP LLHHHHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL......LLEEELLHH.....
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................................islafs 352
DSSP ..................................................hhhhll
No 121: 2FBKA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, MARR FAMILY;
DSSP ...........................llhhhhhhhhhhhhhhHHHHHLLLLHHHHHHHH
Query ...........................xiixeeakkliielfsELAKIHGLNKSVGAVYA 33
ident |||
Sbjct dtaallerirsdwarlnhgpsagpmltllllerlhaalgreieRTYAASGLNAAGWDLLL 60
DSSP lllllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLLHHHHHHHH
DSSP HHH.HLLL.LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHhh
Query ILY.LSDK.PLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGfs 91
ident || | || | | | |
Sbjct TLYrSAPPeGLRPTELSALAAISGPSTSNRIVRLLEKGLIERRE......ASIRLTPQ.. 112
DSSP HHHhHLLLlLLLHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLEELLL......LLLEELHH..
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query sikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................gralvthllpahlattqrvlaplsaqeqrtleelagrmlagleq 156
DSSP ................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 122: 1B4AA MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHL.....LLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELK.....ISK 55
ident | | |
Sbjct ........................GQRHIKIREIIMSN.DIETQDELVDRLReagfnVTQ 35
DSSP ........................LHHHHHHHHHHHHL.LLLLHHHHHHHHHhllllLLH
DSSP HHHHHHHHHHHhhllEEEELLLLLlllEEEELLHH.hHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEelgfVRKVWIKGErknYYEAVDGF.sSIKDIAKRKHDLIAktyedlkkl 114
ident || | || | ||
Sbjct ATVSRDIKEMQ....LVKVPMANG.ryKYSLPSDQrfNPLQKLKRALVDVF......... 81
DSSP HHHHHHHHHLL....LEEEELLLL.leEEELLLLLllLHHHHHHHHHHHHE.........
DSSP hhhlllllhhhHHHHhhhhlhhhhHHHHhhHHHHHL........................
Query eekcneeekefIKQKikgierxkkISEKilEALNDL........................ 150
ident
Sbjct ......ikldgTGNL....lvlrtLPGN..AHAIGVlldnldwdeivgticgddtcliic 129
DSSP ......eeeeeELLE....eeeeeLLLL..HHHHHHhhhhhlllleeeeeellleeeeee
DSSP ................l
Query ................d 151
ident
Sbjct rtpkdakkvsnqllsml 146
DSSP llhhhhhhhhhhhhlll
No 123: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELKISKGN 57
ident | | ||| | |
Sbjct .......................TTPSMEDYIEQIYMLIeekGYARVSDIAEALAVHPSS 37
DSSP .......................LLHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLHHHHHHHHLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEellllllllEEEELLH............................
Query VSXSLKKLEELGFVRKvwikgerknYYEAVDG............................ 89
ident | ||
Sbjct VTKMVQKLDKDEYLIY.........GLVLTSKgkkigkrlvyrhelleqflriigvdeek 88
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEL.........LLEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhh
DSSP ..........hhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhlllllHHHHhhhhhhhlhhhhh
Query ..........fssikdiakrkhdliaktYEDLKKLEEkcneeeKEFIkqkikgierxkki 139
ident | |
Sbjct iyndvegiehhlswnsidrigdlvqyfeEDDARKKDL....ksIQKK............. 131
DSSP hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHH....hhHHHL.............
DSSP hhhhhhhhhhll
Query sekilealndld 151
ident
Sbjct ............ 131
DSSP ............
No 124: 2DI3A MOLECULE: BACTERIAL REGULATORY PROTEINS, GNTR FAMILY;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.........lLLLHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.........kPLTISDIXEEL 51
ident | | | |
Sbjct .......................sVKAHESVMDWVTEELrsgrlkigdhLPSERALSETL 37
DSSP .......................lHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllLLLHHHHHHHH
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEellllllllEEEELLHhhHHHHhHHHHHHHHHHHHhhh
Query KISKGNVSXSLKKLEELGFVRKvwikgerknYYEAVDGfsSIKDiAKRKHDLIAKTYedl 111
ident | | || || | |
Sbjct GVSRSSLREALRVLEALGTIST.atgsgprsGTIITAA..PGQA.LSLSVTLQLVTN... 90
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEL.lllllhhhLLEELLL..LLLH.HHHHHHHHHHLL...
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHH...................................
Query kkleekcneeekefikqkikgIERX................................... 136
ident
Sbjct ..................qvgHHDIyetrqllegwaalhssaergdwdvaeallekmddp 132
DSSP ..................lllHHHHhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhllll
DSSP ..hhhhhhhhhHHHHLL...........................................
Query ..kkisekileALNDLD........................................... 151
ident |
Sbjct slpledflrfdAEFHVViskgaenplistlmealrlsvadhtvararalpdwratsarlq 192
DSSP lllhhhhhhhhHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhh
DSSP .......................................
Query ....................................... 151
ident
Sbjct kehrailaalragestvaatlikehiegyyeetaaaeal 231
DSSP hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 125: 2GWRA MOLECULE: DNA-BINDING RESPONSE REGULATOR MTRA;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dtxrqrilvvdddaslaexltivlrgegfdtavigdgtqaltavrelrpdlvlldlxlpg 60
DSSP llllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xngidvcrvlradsgvpivxltaktdtvdvvlglesgaddyixkpfkpkelvarvrarlr 120
DSSP llhhhhhhhhhlllllleeeeeellllllhhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhhll
DSSP .llhHHHH........hhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHH
Query .xiiXEEA........kkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEE 50
ident | | | |
Sbjct rnddEPAExlsiadveidvpahkvtrngeQISLTPLEFDLLVALARKpRQVFTRDVLLEQ 180
DSSP llllLLLLeeeelleeeelllleeeelleEELLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHH
DSSP HLL...LHHHHHHHHHHHHHH........LLEEEELlllllLLEEEELLHhhhhhhhhhh
Query LKI...SKGNVSXSLKKLEEL........GFVRKVWikgerKNYYEAVDGfssikdiakr 99
ident | | | | | |
Sbjct VWGyraDTRLVNVHVQRLRAKvekdpenpTVVLTVR.....GVGYKAGPP.......... 225
DSSP HLLlllLLHHHHHHHHHHHHHhlllllllLLEEEEL.....LLEEEELLL..........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query khdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................................................... 225
DSSP ....................................................
No 126: 1I7DA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE III;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mrlfiaekpslaraiadvlpkphrkgdgfiecgngqvvtwcighlleqaqpdaydsryar 60
DSSP leeeeellhhhhhhhhllllllleeelleeeellleeeeellllleeellhhhhlhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct wnladlpivpekwqlqprpsvtkqlnvikrflheaseivhagdpdregqllvdevldylq 120
DSSP lllllllllllllleeelhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeellllhhhhhhhhhhhhhll
DSSP .................................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....
Query .................................xiixeeakkliielfselaKIHG.... 23
ident |
Sbjct lapekrqqvqrclindlnpqaveraidrlrsnsefvplcvsalararadwlyGINMtray 180
DSSP llhhhhhlleelllllllhhhhhhhhllleehhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhh
DSSP ..............LLHHHHHHHHHHHHLL..............................
Query ..............LNKSVGAVYAILYLSD.............................. 39
ident | |
Sbjct tilgrnagyqgvlsVGRVQTPVLGLVVRRDeeienfvakdffevkahivtpaderftaiw 240
DSSP hhhhhlllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHhhhhllllleeeeeeeeeellllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct qpseacepyqdeegrllhrplaehvvnrisgqpaivtsyndkresesaplpfslsalqie 300
DSSP lllhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhllleeelleeeeeeeeelllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct aakrfglsaqnvldicqklyethklitfprsdcrylpeehfagrhavmnaisvhapdllp 360
DSSP hhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct qpvvdpdirnrcwddkkvdahhaiiptarssainlteneakvynliarqylmqfcpdavf 420
DSSP llllllllllllllhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 39
ident
Sbjct rkcvieldiakgkfvakarflaeagwrtllgskerdeendgtplpvvakgdellcekgev 480
DSSP eeeeeeelllllleeeleeeeeelhhhhhllllhhhllleelllllllllleeeeeeeee
DSSP ........LLLLHHHHHHHHL.....................lLHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ........KPLTISDIXEELK.....................iSKGNVSXSLKKLEELGF 70
ident | | ||
Sbjct verqtqppRHFTDATLLSAMTgiarfvqdkdlkkilratdglgTEATRAGIIELLFKRGF 540
DSSP eeeellllLLEEHHHHHHHHHlhhhhlllhhhhhhhhhlllllLLLLHHHHHHHHHHLLL
DSSP EEEELllllllLEEEELLH.........................................
Query VRKVWikgerkNYYEAVDG......................................... 89
ident | | |
Sbjct LTKKG......RYIHSTDAgkalfhslpematrpdmtahwesvltqisekqcryqdfmqp 594
DSSP EEELL......LEEEELHHhhhhhhhllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
DSSP ...................hhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query ...................fssIKDIakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqki 130
ident |
Sbjct lvgtlyqlidqakrtpvrqfrgIVAP.................................. 620
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllhhhllLLLL..................................
DSSP hhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................... 620
DSSP .....................
No 127: 1E2XA MOLECULE: FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHH..HHLL...LLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAIL..YLSD...KPLTISDIXEELKISK 55
ident |
Sbjct ....................qspaGFAEEYIIESIwnNRFPpgtILPAERELSELIGVTR 40
DSSP ....................llhhHHHHHHHHHHHhlLLLLlllLLLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELLHHH.HHHH................hhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFS.SIKD................iak 98
ident | | | |
Sbjct TTLREVLQRLARDGWLTIQHG.....KPTKVNNFWEtSGLNiletlarldhesvpqlidn 95
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....EEEEELLHHHhLLHHhhhhhhhhllllhhhhhhh
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL......................................
Query rKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNE...................................... 120
ident
Sbjct lLSVRTNISTIFIRTAFRQHPDkaqevlatanevadhadafaeldynifrglafasgnpi 155
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh
DSSP .....................................llHHHHH.HHHHHHLHHHHhhhh
Query .....................................eeKEFIK.QKIKGIERXKKisek 142
ident |
Sbjct yglilngmkglytrigrhyfanpearslalgfyhklsalCSEGAhDQVYETVRRYG..he 213
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLhHHHHHHHHHHH..hh
DSSP hhhhhhhll
Query ilealndld 151
ident
Sbjct sgeiwhrmq 222
DSSP hhhhhhhhl
No 128: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lghllrdvwsllneeerelldkeiqpfpckkastvfsegdipnnlfylyegkikilrrfh 60
DSSP lhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct isrivkpgqffgmrpyfaeetcsstaiavenskvlaipveaieallkgntsfcryflkal 120
DSSP eeeeelllleelhhhhhhlllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL.............LLLLHH
Query ..XIIXEEAKKLIIELfselakihglnKSVGAVYAILYLSD.............KPLTIS 45
ident | | | |
Sbjct akELGYAERRTVTLTQ..........kHVRGRLAETLLILKenfgfendgatlsIYLSRE 170
DSSP hhHHHHHHHHHHHHHH..........lLHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllllLLLLHH
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFSsikdiakrkhdlia 105
ident | | |
Sbjct ELATLSNMTVSNAIRTLSTFVSERMLALDG......KRIKIIDCDR.............. 210
DSSP HHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELLHHH..............
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ......................................lqktarsg 218
DSSP ......................................hhhhhhhl
No 129: 2FOKA MOLECULE: FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct irtfgwvqnpgkfenlkrvvqvfdrnskvhnevknikiptlvkeskiqkelvaimnqhdl 60
DSSP llllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct iytykelvgtgtapcdaiiqatiadqgkgyidnwssdgflrwahalgfieyinksdsfvi 120
DSSP leehhhhhlllllllllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelllleeee
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLL...
Query .xiixeeakkliielfselakIHGL..NKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKIS... 54
ident | | || | | |
Sbjct tdvglaysksadgsaiekeilIEAIssYPPAIRILTLLEDG.QHLTKFDLGKNLGFSges 179
DSSP lhhhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHhlLHHHHHHHHHHLLL.LLEEHHHHHLLLLLLlll
DSSP .................................hhhhhHHHHHHHHHLLEEEE.LLLL..
Query .................................kgnvsXSLKKLEELGFVRKV.WIKG.. 78
ident | || |
Sbjct gftslpegilldtlanampkdkgeirnnwegssdkyarMIGGWLDKLGLVKQGkKEFIip 239
DSSP llllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhHHHHHHHHLLLEEELlEEEEll
DSSP ...LLLL.EEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhl
Query ...ERKN.YYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgie 134
ident |
Sbjct tnkEFIShAFKITGE............................................. 254
DSSP lleEEELlEEEELHH.............................................
DSSP hhhhhhhhhhhhHHHL............................................
Query rxkkisekileaLNDL............................................ 150
ident
Sbjct .glkvlrrakgsTKFTrvpkrvywemlatnltdkeyvrtrralileilikagslkieqiq 313
DSSP .hhhhhhhhhllLLLLlllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleehhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct dnlkklgfdevietiendikglintgifieikgrfyqlkdhilqfvipnrlvkseleekk 373
DSSP hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeelleeeellllllllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct selrhklkyvpheyielieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyrgkhlggsrkpdgaiy 433
DSSP hhhhlllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct tvgspidygvivdtkaysggynlpigqademqryveenqtrnkhinpnewwkvypssvte 493
DSSP lllllllleeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct fkflfvsghfkgnykaqltrlnhitncngavlsveelliggemikagtltleevrrkfnn 553
DSSP eeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllll
DSSP ....l
Query ....d 151
ident
Sbjct geinf 558
DSSP eelll
No 130: 2CG4A MOLECULE: REGULATORY PROTEIN ASNC;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | |
Sbjct .....................yLIDNLDRGILEALMGN.aRTAYAELAKQFGVSPETIHV 38
DSSP .....................lLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident | | |
Sbjct RVEKMKQAGIITGARI............................................ 54
DSSP HHHHHHHHLLEEEEEE............................................
DSSP llhhhhhhhhhHHLHH....................hhhhHHHHhhhHHLL.........
Query eekefikqkikGIERX....................kkisEKILealNDLD......... 151
ident | |
Sbjct ....dvspkqlGYDVGcfigiilksakdypsalaklesldEVTE...AYYTtghysifik 107
DSSP ....eelllllLLLEEeeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllLEEE...EEEEllllleeee
DSSP ...........................................
Query ........................................... 151
ident
Sbjct vmcrsidalqhvlinkiqtideiqstetlivlqnpimrtikpn 150
DSSP eeellhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelleeeeellllll
No 131: 1WY0A MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlLLHH....
Query xiixeeakkliielfSELAKIHGLnksvgavyailylsdkpltisdixeelkISKG.... 56
ident
Sbjct .ekyeelfarikekaKLIDEKIFE.......................lipekDPRVlyea 36
DSSP .lhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHH.......................hllllLLHHhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 56
ident
Sbjct arhyplaggkrvrpfvvltsteavggdplraiypavaielihnyslvhddimdmdetrrg 96
DSSP hhhlhhhllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
DSSP ................hhhhhhhhhHHHLLeeeelllllllleeeelLHHHHHHHHHHHH
Query ................nvsxslkklEELGFvrkvwikgerknyyeavDGFSSIKDIAKRK 100
ident | |
Sbjct kptvhriwgvnmailagdllfskafEAVAR.............aeipPEKKARVLEVIVK 143
DSSP lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHL.............llllHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLHHH.HHHHHHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHLL.......
Query HDLIAKTYEDLKKLEEKCNeeEKEF.IKQKIKGI.ERXKKISEKILEALNDLD....... 151
ident || |
Sbjct ASNELCEGQARDLEFEKKS..TVTIeEYMEMISGkTGALFEASAKVGGIIGTDneeyika 201
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LLLHhHHHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct lsswgrnvgiafqiwddvldliadekklgkpvgsdirkgkktlivahffenadekdkqrf 261
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhlllllhhhhhllllhhhhhhhhhllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct lkifgkdiksdvmeaidllkkygsidyaaeiakdmikkanealrilpkskarmdlellak 321
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhllllhhhhhhhhhhh
DSSP ......
Query ...... 151
ident
Sbjct fivere 327
DSSP hlllll
No 132: 2FYNA MOLECULE: CYTOCHROME B;
DSSP llhhhhhhhHHHH............hhhhhhhhllLLHHHHHhhHHHHhllllllhhhhh
Query xiixeeakkLIIE............lfselakihgLNKSVGAvyAILYlsdkpltisdix 48
ident |
Sbjct .........GIPHdhyeprtgiekwlhsrlpivalAYDTIMI..PTPR............ 37
DSSP .........LLLLlllllllhhhhhhhllllhhhhHHHHHLL..LLLL............
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllllleeeELLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query eelkiskgnvsxslkkleelgfvrkvwikgerknyyeAVDGFSsIKDIAKRKHDLIAKTY 108
ident |
Sbjct .....................................NLNWMW.IWGVVLAFCLVLQIVT 59
DSSP .....................................LLLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH....lLLLLHHHH......HHHHHHHLHHHHHHHHHHHHH.HHLL......
Query EDLKKLEEK....cNEEEKEFI......KQKIKGIERXKKISEKILEAL.NDLD...... 151
ident | | | |
Sbjct GIVLAMHYTphvdlAFASVEHImrnvngGFMLRYLHANGASLFFIAVYLhIFRGlyygsy 119
DSSP HHHHHLLLLllhhhHHHHHHHHhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct kaprevtwivgmliylammatafmgyvlpwgqmsfwgatvitglfgaipgighsiqtwll 179
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct ggpavdnatlnrffslhyllpfviaalvaihiwafhstgnnnptgvevrrtskaeaqkdt 239
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct vpfwpyfiikdvfalavvllvffaivgfmpnylghpdnyieanplrtpahivpewyflpf 299
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhlllllllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct yailraftadvwvvqianfisfgiidakffgvlamfgailvmalvpwldtspvrsgryrp 359
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllllllhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct mfkiyfwllaadfviltwvgaqqttfpydwisliasaywfayflvilpilgaiekpvapp 419
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll
DSSP .........
Query ......... 151
ident
Sbjct atieedfna 428
DSSP llhhhhhhl
No 133: 1WI9A MOLECULE: PROTEIN C20ORF116 HOMOLOG;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLHhHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLNKsVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | |
Sbjct ..................gSSGSSGF.LTEFINYIKKS.KVVLLEDLAFQMGLRTQDAIN 40
DSSP ..................lLLLLLLH.HHHHHHHHHHL.LEELHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELlllLLLLEEEellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWikgERKNYYEavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident | | | |
Sbjct RIQDLLTEGTLTGVI..dDRGKFIY................................... 63
DSSP HHHHHHHHLLLLEEE..lLLLLEEE...................................
DSSP llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ......................itpsgpssg 72
DSSP ......................lllllllll
No 134: 1WFXA MOLECULE: PROBABLE RNA 2'-PHOSPHOTRANSFERASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHH..........lLLLLLHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYL..........sDKPLTISDIXEE 50
ident || | |
Sbjct ........................VRLSKTLAGILRHhpgrygvrltrEGWARVSEVVEG 36
DSSP ........................LLHHHHHHHHHHLllhhhllllllLLLEEHHHHHHH
DSSP HL......LLHHHHHHHHHHHhHHLLEEEEllllllLLEEEELLH...............
Query LK......ISKGNVSXSLKKLeELGFVRKVwikgerKNYYEAVDG............... 89
ident | | | |
Sbjct LRkagwswVEEWHIVGVALHD.PKGRYELR......NGEIRARYGhsipvnveplpgepp 89
DSSP HHhlllllLLHHHHHHHHHHL.LLLLEEEE......LLEEEELLLlllllllllllllll
DSSP ........................hhhhHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhh
Query ........................fssiKDIAKRKhdliaktyedlkkleekcneeekef 125
ident
Sbjct pilyhgtteealplixergixrgrrlkvHLTSSLE.......................da 126
DSSP leeeelllhhhhhhhhhhllllllllleEEELLHH.......................hh
DSSP hhhhhhhHLHHhhHHHH.................hhhhhHHLL.............
Query ikqkikgIERXkkISEK.................ilealNDLD............. 151
ident |
Sbjct vstgrrhGNLV..AVLLvdveclrrrglkverxsktvytVDWVppeciaevrresl 180
DSSP hhhhlllLLLL..EEEEeehhhhhhllllleelllleeeELLLlhhheeeeeelll
No 135: 1UFMA MOLECULE: COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | |
Sbjct ..........gssgssggssildRAVIEHNLLSASKLY.NNITFEELGALLEIPAAKAEK 49
DSSP ..........lllllllllllllHHHHHHHHHHHHHLL.LEEEHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLE.EEELlllLLLLEEEeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGFV.RKVWikgERKNYYEaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident |
Sbjct IASQMITEGRMnGFID..qIDGIVHF.ETREA............................ 78
DSSP HHHHHHHLLLLlEEEE..lLLLEEEE.LLLLL............................
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLl
Query eeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLd 151
ident
Sbjct .........................sgPSSG. 84
DSSP .........................llLLLL.
No 136: 1R7JA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A;
DSSP llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhhHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnksvgAVYAILYlsdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | |
Sbjct ..........kkSKLE..........iiqAILEACK...SGSPKTRIMYGANLSYALTGR 37
DSSP ..........llLHHH..........hhhHHHHHHL...LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLH..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHl
Query SLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDG..fssikdiakrkhdliaktyeDLKKLEEKc 118
ident | | | | |
Sbjct YIKMLMDLEIIRQEG......KQYMLTKKgeelledirkfnemrknmdqlkEKINSVLS. 90
DSSP HHHHHHHLLLEEEEL......LEEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHL.
DSSP llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................. 90
DSSP .................................
No 137: 2OD5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHhHHHHHHHHHL..LLLLLHHHHHHHHL......
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSvGAVYAILYLS..DKPLTISDIXEELK...... 52
ident | | | | |
Sbjct ....................ETESXKT.VRIREKIKKFlgDRPRNTAEILEHINstxrhg 39
DSSP ....................LLHHHHH.HHHHHHHHHHllLLLEEHHHHHHHHHllllll
DSSP LLHHHHHHHHHHHhhhLLEEEELLLL........llLLEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIKG........erKNYYEAVDgfssikdiakrkhdli 104
ident | | ||
Sbjct TTSQQLGNVLSKD...KDIVKVGYIKrsgilsggydICEWATRN................ 80
DSSP LLHHHHHHHHHHL...LLEEEEEEEEeeellleeeeEEEEEEHH................
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ....................................wvaehcpewte 91
DSSP ....................................hhhhhllllll
No 138: 1WJ5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN (RIKEN CDNA 0610009H20);
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHH..HHLL....
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSDK.PLTISDIXE..ELKI.... 53
ident | |
Sbjct ......gssgssgnkdnldlagltSLLSEKIKEFLQEKKMqSFYQQELETveSLQSlasr 54
DSSP ......lllllllllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHLlhHHHHhhll
DSSP .....................LHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELLHHHH
Query .....................SKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFSS 92
ident | | | | | |
Sbjct pvthstgsdqvelkdsgtsgvAQRVFKNALQLLQEKGLVFQRD..sgsDKLYYVTTKDKD 112
DSSP lllllllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEELLL..lllLLLLEELLLLLL
DSSP hhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikdiakRKHDliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...lqsGPSS................................................g 120
DSSP ...lllLLLL................................................l
No 139: 1D8JA MOLECULE: GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.....LLLLLHHHHHHHHLL..
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLS.....DKPLTISDIXEELKI.. 53
ident ||| | |
Sbjct ...............alsgsSGYKFGVLAKIVNYMKTRhqrgdTHPLTLDEILDETQHld 45
DSSP ...............lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLLLHHHHHHHHLLll
DSSP ....LHHHHH.HHHHHHhhhLLEEEELllllllLEEEELLhHHHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query ....SKGNVS.XSLKKLeelGFVRKVWikgerkNYYEAVDgFSSIKdiakrkhdliakty 108
ident | | |
Sbjct iglkQKQWLMtEALVNN...PKIEVID......GKYAFKP.KYNVR.............. 81
DSSP llhhHHHHHHlLHHHHL...LLEEELL......LLEEELL.LLLLL..............
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query edlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................................... 81
DSSP ...........................................
No 140: 1BBYA MOLECULE: RAP30;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELKISKGN 57
ident | | | |
Sbjct ......................RARADKQHVLDMLFSAfekHQYYNLKDLVDITKQPVVY 38
DSSP ......................LLHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLLLHHHHHHHLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHhhhllEEEELLLLLlLLEEEELLhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLeelgfVRKVWIKGErKNYYEAVDgFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident || || |
Sbjct LKEILKEI.....GVQNVKGIH.KNTWELKP.EYRH........................ 67
DSSP HHHHHHHH.....LLLLLLLLL.LLLLLLLL.LLLL........................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................yq 69
DSSP ................................ll
No 141: 2P5VA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | || | |
Sbjct ....................qlTLDKTDIKILQVLQEN.gRLTNVELSERVALSPSPCLR 39
DSSP ....................llLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELLlllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVWIkgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident || || | ||
Sbjct RLKQLEDAGIVRQYAA..............................llspesvnlglqaf 69
DSSP HHHHHHHLLLEEEEEE..............................eellhhhllleeee
DSSP llhhhhhhhhHHHLHHHHHHHHhhHHHH................................
Query eekefikqkiKGIERXKKISEKilEALN................................ 148
ident
Sbjct irvsirkakdAREDFAASVRKWpeVLSCfaltgetdyllqafftdxnafshfvldtllsh 129
DSSP eeeeelllllHHHHHHHHHLLLllEEEEeeellllleeeeeeellhhhhhhhhhhlllll
DSSP ........................hll
Query ........................dld 151
ident
Sbjct hgvqdaqssfvlkeikhttslplnhll 156
DSSP lleeeeeeeeeeeeeeellllllhhhl
No 142: 2HKXA MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct atqmrltdtnllevlnseeysgvlkefreqryskkailytpnternlvflvksgrvrvyl 60
DSSP llllllllllhhhhllllllllllllleeeeelllleeellllllleeeeeeeleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ayedkeftlaileagdifcthtrafiqamedttilytdirnfqnivvefpafslnmvkvl 120
DSSP eelleeeeeeeeellleeellllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLL..............lllLHH
Query .XIIXEEAKKLIIELfselakihglnKSVGAVYAILYLSD..............kplTIS 45
ident |
Sbjct gDLLKLLLTIINGLV.........fkDARLRLAEFLVQAAmdtglkvpqgiklelglNTE 171
DSSP hHHHHHHHHHHHHHH.........hlLHHHHHHHHHHHHHhhhleeelleeeeelllLHH
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELLHHhHHHHhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDGFsSIKDiakrkhdlia 105
ident | | || | | | | |
Sbjct EIALMLGTTRQTVSVLLNDFKKMGILERVN.....QRTLLLKDLQ.KLKE.......... 215
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELL.....LLEEEELLHH.HHHH..........
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........................................fss 218
DSSP ...........................................hll
No 143: 2A5YB MOLECULE: APOPTOSIS REGULATOR CED-9;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlceiecralstahtrlihdfeprdaltylegkniftedhseliskmstrlerianflri 60
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yrrqaselgplidffnynnqshladfledyidfainepdllrpvviapqfsrqmldrkll 120
DSSP hhhhllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lgnvpkqmtcyireyhvdrvikkldemcdldsfflflhgragsgksviasqalsksdqli 180
DSSP hllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ginydsivwlkdsgtapkstfdlftdillmlkseddllnfpsvehvtsvvlkrmicnali 240
DSSP llllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct drpntlfvfddvvqeetirwaqelrlrclvttrdveisnaasqtcefievtsleidecyd 300
DSSP lllleeeeeeeellhhhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhlllleeeeelllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct fleaygmpmpekeedvlnktielssgnpatlmmffkscepktfekmaqlnnklesrglvg 360
DSSP hhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHLL..lH
Query .xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKI..sK 55
ident | |
Sbjct vecitpysykslamalqrCVEV..LSDEDRSALAFAVVMPpgVDIPVKLWSCVIPVeqlD 418
DSSP lllllllllllhhhhhhhHHHL..LLHHHHHHLLHHHLLLllLLEEHHHHHHHLLLlllL
DSSP HHHHHHHHHHHHH.LLEEEELLlllLLLEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEEL.GFVRKVWIkgeRKNYYEAV..DGFSsikdiakrkhdliaktyedlk 112
ident | || |
Sbjct DEVADRLKRLSKRgALLSGKRM...PVLTFKIDhiIHMF.............lkhvvdaq 462
DSSP HHHHHHHHHLLLLlLLLEEELL...LLLEEELLhhHHHH.............hhlllllh
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct tiangisileqrlleietvirpedfpkfmqlhqkfydsl 501
DSSP hhhhhhllllllllllllllllllllllllllhhhhlll
No 144: 1QZZA MOLECULE: ACLACINOMYCIN-10-HYDROXYLASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHH..HHHHHHhHLLLlLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVG..AVYAILyLSDKpLTISDIXEELKISK 55
ident | | |
Sbjct ....leptdqdldvllknlgNLVTpmaLRVAAtlRLVDHL.LAGA.DTLAGLADRTDTHP 54
DSSP ....llllhhhhhhhhhlllLLHHhhhHHHHHhlLHHHHH.HLLL.LLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllLLEEEELLH..........................
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerKNYYEAVDG.......................... 89
ident | | |
Sbjct QALSRLVRHLTVVGVLEGGE....kGRPLRPTRLgmlladghpaqqrawldlngavshad 110
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEELLL....lLLLLEELLLhhhhlllllllhhhhhllllhhhhhh
DSSP ..........................hhhhhhhhhhhhhhhhHHHH..............
Query ..........................fssikdiakrkhdliaKTYE.............. 109
ident
Sbjct laftglldvvrtgrpayagrygrpfwedlsadvaladsfdalMSCDedlayeapadaydw 170
DSSP hhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhlLHHHlllllhhhhhllll
DSSP ..........hhhHHHHHLL........................................
Query ..........dlkKLEEKCN........................................ 119
ident
Sbjct savrhvldvgggnGGMLAAIalraphlrgtlvelagpaerarrrfadagladrvtvaegd 230
DSSP lllleeeeellllLHHHHHHhhhlllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeell
DSSP .......lllhhHHHH............................HHHHhlhhhhhHHHHH
Query .......eeekeFIKQ............................KIKGierxkkiSEKIL 144
ident
Sbjct ffkplpvtadvvLLSFvllnwsdedaltilrgcvralepggrllVLDR.......ADRFF 283
DSSP lllllllleeeeEEELlhhhllhhhhhhhhhhhhhheeeeeeeeEEEL.......LHHHH
DSSP HH..................................................hhhll
Query EA..................................................lndld 151
ident
Sbjct STlldlrmltfmggrvrtrdevvdlagsaglalasertsgsttlpfdfsileftavs 340
DSSP HHhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhllleeeeeeeeelllllllleeeeeeeell
No 145: 2IP2A MOLECULE: PROBABLE PHENAZINE-SPECIFIC METHYLTRANSFERASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...lHHHHHHhHHHHhLLLL.LLHHHHHHHHLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...nKSVGAVyAILYlSDKP.LTISDIXEELKISKG 56
ident
Sbjct .......nlaaarnliqvvtGEWKsrcvYVATRL.GLADlIESGiDSDETLAAAVGSDAE 52
DSSP .......lhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhHHHHHL.LHHHhHHLLlLLHHHHHHHHLLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEEllllllLLEEEELLH...........................
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVwikgerKNYYEAVDG........................... 89
ident | |
Sbjct RIHRLMRLLVAFEIFQGD.....tRDGYANTPTshllrdvegsfrdmvlfygeefhaawt 107
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEE.....lLLEEEELHHhhlllllllllhhhhhhhllhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 89
ident
Sbjct paceallsgtpgfelafgedfysylkrcpdagrrfllamkasnlafheiprlldfrgrsf 167
DSSP lhhhhhhhlllhhhhhhlllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllee
DSSP .................................................hhhhhhhhhhh
Query .................................................fssikdiakrk 100
ident
Sbjct vdvgggsgeltkailqaepsargvmldregslgvardnlssllagervslvggdmlqevp 227
DSSP eeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhlhhhhhllleeeeellllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhHHHH.lLLLL...........hhhhhhhhhhhlhhHHHHHHH.....
Query hdliaktyedlkkLEEK.cNEEE...........kefikqkikgierxKKISEKI..... 143
ident
Sbjct sngdiyllsriigDLDEaaSLRLlgncreamagdgrvvviertisasePSPMSVLwdvhl 287
DSSP lllleeeeellhhHLLHhhHHHHhhhhhhhllllleeeeeelllllllLLHHHHHhhhhh
DSSP .............................hhHHHH......ll
Query .............................leALND......ld 151
ident
Sbjct fmacagrhrtteevvdllgrggfaverivdlPMETrmivaara 330
DSSP hhhhllllllhhhhhhhhhhlleeeeeeeeeLLLEeeeeeeel
No 146: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHhHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKsVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || || || |
Sbjct .................pllRRLDLN.LLLVFDALYRH...RNVGTAASELAISASAFSH 39
DSSP .................lllLLLLLL.HHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHH...HLLEEEELllllllLEEEEL.LHHHH..........hhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEE...LGFVRKVWikgerkNYYEAV.DGFSS..........ikdiakrkhdliak 106
ident | | |
Sbjct ALGRLRQgldDELFLRQG......NRMQPTqRAEHLaaavaaalralgegleewrpfvpg 93
DSSP HHHHHHHhhlLLLEEEEL......LEEEELhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllll
DSSP hhhhhhHHHH...........................HLLLLlhHHHHHHHH........
Query tyedlkKLEE...........................KCNEEekEFIKQKIK........ 131
ident |
Sbjct qsqrtfVFAAtdytafallpplmnrlqhsapgvrlrlVNAERklSVEALASGridfalgy 153
DSSP lllleeEEELlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeELLLLllLHHHHHHLllleeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 131
ident
Sbjct deeherlpegiqahdwfadryvvvarrdhprlagaptlegylaerhavvtpwnedsgvid 213
DSSP lllllllllleeeeeeeeeleeeeeelllllllllllhhhhhlleeeeellllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 131
ident
Sbjct rllarsglrrevavqlptvlaalflagstdflltaprhaaralaeaaglalypapfdipp 273
DSSP hhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeehhhhhhhhhhhleeeellllllll
DSSP ......hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ......gierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct yvlrlyshvqgrdahawmigqlkgld 299
DSSP eeeeeeeellllhhhhhhhhhlllll
No 147: 2B0LA MOLECULE: GTP-SENSING TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLH.HHHHHHHHHHHLL....LLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNK.SVGAVYAILYLSD....KPLTISDIXEELKISK 55
ident | | | | |
Sbjct ......hhhhhhmskavvqmaiSSLSySELEAIEHIFEELdgneGLLVASKIADRVGITR 54
DSSP ......lllllhhhhhhhhhhhHLLLhHHHHHHHHHLLLLllleEEELHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEeLLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEaVDGFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | ||| | | | |
Sbjct SVIVNALRKLESAGVIESRSL..GMKGTYIkVLNNKFLI..................... 91
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL..LLLLEEEeELLHHHHH.....................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .............................elenlks 98
DSSP .............................hhhhlll
No 148: 1RI7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || |
Sbjct .......................LDEIDKKIIKILQND.gKAPLREISKITGLAESTIHE 36
DSSP .......................LLHHHHHHHHHHLLL.lLLLHHHHHHHLLLLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEElllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGFVRKVwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident || | | |
Sbjct RIRKLRESGVIKKF.............................taiidpealgysmlafi 67
DSSP HHHHHHHLLLLLLL.............................lllllhhhlllleeeee
DSSP llhhhhhhhhhHHLHHHHHHHHH.............HHHH....................
Query eekefikqkikGIERXKKISEKI.............LEAL.................... 147
ident | |
Sbjct lvkvkagkyseVASNLAKYPEIVevyettgdydmvvKIRTknseelnnfldligsipgve 127
DSSP eeeellllhhhHHHHHHLLLLEEeeeelllllleeeEEEEllhhhhhhhhhhhhllllee
DSSP ...............hhll
Query ...............ndld 151
ident
Sbjct gthtmivlkthkettelpi 146
DSSP eeeeeelllllllllllll
No 149: 2QC0A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP .............................................LLHHhHHHH......
Query .............................................XIIXeEAKK...... 9
ident
Sbjct ewqaeqaynhlpplpldsklaelaetlpilkaciparaalaelkqAGEL.LPNQgllinl 59
DSSP llllllllllllllllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.LLLHhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 9
ident
Sbjct lplleaqgsseienivtttdklfqyaqedsqadpxtkealryrtalyqcftqlsnrplcv 119
DSSP hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 9
ident
Sbjct ttaleicstiksvqxdvrkvpgtsltnqatgeviytppagesvirdllsnweaflhnqdd 179
DSSP hhhhhhhhhhhllllllllllllleelllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 9
ident
Sbjct vdplikxaxahyqfeaihpfidgngrtgrvlnilylidqqllsapilylsryivahkqdy 239
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhlhhhh
DSSP .......................................hhhhhHHHHHHHL.LLLHHhh
Query .......................................liielFSELAKIH.GLNKSvg 29
ident | |
Sbjct yrlllnvttqqewqpwiifilnaveqtakwtthkiaaareliahTTEYVRQQlPKIYS.h 298
DSSP hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHlLLLLL.h
DSSP HHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEllllLLLLEEEELLH
Query AVYAILYLSdKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVwikgERKNYYEAVDG 89
ident | | | || | | |
Sbjct ELVQVIFEQ.PYCRIQNLVESGLAKRQTASVYLKQLCDIGVLEEV....GKEKLFVHPKF 353
DSSP HHHHHHHHL.LEEEHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEL....LLLLEEELHHH
DSSP .......hhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query .......fssIKDIakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek 142
ident
Sbjct vtlxtkdsnqFSRY.............................................. 367
DSSP hhhhhlllllLLLL..............................................
DSSP hhhhhhhll
Query ilealndld 151
ident
Sbjct ......... 367
DSSP .........
No 150: 2H6BA MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct veglgkdfcgaiipdnffpieklrnytqmglirdfakgsavimpgeeitsmiflvegkik 60
DSSP lllleeeelleeeellllllhhhhhlhhhleeeeelllleeelllllllleeeeeellee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ldiifedgsekllyyaggnsligklyptgnniyatameptrtcwfsekslrtvfrtdedm 120
DSSP eeeellllleeeeeeelllleelllllllleeeeeellleeeeeelhhhhhhhhhhllhh
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHhHHHHHHHHHLL..............LLLLHH
Query .xiixeeakkliielfselakihGLNKSvGAVYAILYLSD..............KPLTIS 45
ident | | ||
Sbjct ifeifknyltkvayyarqvaemnTYNPT.IRILRLFYELCssqgkrvgdtyeitMPLSQK 179
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllEELLL.HHHHHHHHHHHhhhleeelleeeeeLLLLHH
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllleEEELLHHHhhhhhhhhhhhhhh
Query DIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknyYEAVDGFSsikdiakrkhdlia 105
ident | | || | | |
Sbjct SIGEITGVHHVTVSRVLACLKRENILDKKKN......kIIVYNLGE.............. 219
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......eEEELLHHH..............
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..........................lkhlseqtsvdklaaaldhh 239
DSSP ..........................hhhhhlllleehhhhhhlll
No 151: 2DU9A MOLECULE: PREDICTED TRANSCRIPTIONAL REGULATORS;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHH.....hhhhhhlLLLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAV.....yailylsDKPLTISDIXEELKISK 55
ident |
Sbjct ....................vplyKQIASLIedsivdgtlsidQRVPSTNELAAFHRINP 40
DSSP ....................llhhHHHHHHHhhhhhlllllllLEELLHHHHHHHLLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLlllllLEEEELL..HHHHHHhhHHHHHH.HHHHHHHHHH
Query GNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerkNYYEAVD..GFSSIKdiAKRKHD.LIAKTYEDLK 112
ident | | | | | |
Sbjct ATARNGLTLLVEAGILYKKRG.....IGXFVSAqaPALIRErrDAAFAAtYVAPLIDESI 95
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEELL.....LEEEELLlhHHHHHHhhHHHHHHhHLHHHHHHHH
DSSP HHHhhlllllhhhHHHHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query KLEekcneeekefIKQKIKGierxkkisekilealndld 151
ident | |
Sbjct HLG.........fTRARIHA.........lldqvaesrg 116
DSSP HLL.........lLHHHHHH.........hhhhhhhhll
No 152: 1RP3A MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA);
DSSP ......................LLHH..................................
Query ......................XIIX.................................. 4
ident
Sbjct hmknpysnqiereelilkylplVKAIatnikkhlpedvdirdlisygviglikavdnlst 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 4
ident
Sbjct enpkraeayiklrikgaiydylrsldfgsrqvrekerrikevveklkeklgreptdeeva 120
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh
DSSP ..............................................hhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................................eeakkliielfsel 18
ident
Sbjct kelgisteelfktldkinfsyilsleevfrdfardyselipsstnveeevikreltekvk 180
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLleeeellll
Query akiHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikg 78
ident | | | | | || | |
Sbjct eavSKLPEREKLVIQLIFYE..ELPAKEVAKILETSVSRVSQLKAKALERL......... 229
DSSP hhhLLLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.........
DSSP lllleeeellhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhh
Query erknyyeavdgfsSIKDiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkk 138
ident
Sbjct ...........reMLSN........................................... 235
DSSP ...........hhHHHL...........................................
DSSP hhhhhhhhhhhll
Query isekilealndld 151
ident
Sbjct ............. 235
DSSP .............
No 153: 1AOYA MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHllLLLL.HHHHHHHHL......L
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLsdKPLT.ISDIXEELK......I 53
ident | | | | | | |
Sbjct .................mrssaKQEELVKAFKALLKE..EKFSsQGEIVAALQeqgfdnI 41
DSSP .................lllllLLLLHHHHHHHHHHL..LLLLlHHHHHHHHHhhllllL
DSSP LHHHHHHHHHHHHhhllEEEELLLLLllLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIKGErkNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkk 113
ident || | | |
Sbjct NQSKVSRMLTKFG....AVRTRNAKM.eMVYCLPAE........................ 72
DSSP LHHHHHHHHHHHL....LEEEELLLL.lEEEELLLL........................
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................lgvptt 78
DSSP ................................llllll
No 154: 1A04A MOLECULE: NITRATE/NITRITE RESPONSE REGULATOR PROTEIN NARL;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct epatilliddhpmlrtgvkqlismapditvvgeasngeqgielaesldpdlilldlnmpg 60
DSSP lleeeeeelllhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mngletldklrekslsgrivvfsvsnheedvvtalkrgadgyllkdmepedllkalhqaa 120
DSSP llhhhhhhhhhhllllleeeeeellllhhhhhhhhhlllleeeellllhhhhhhhhhhhh
DSSP .llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHH
Query .xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVS 59
ident | | | | | |
Sbjct agemvlsealtpvlaaslerdvNQLTPRERDILKLIAQG...LPNKMIARRLDITESTVK 177
DSSP hlllllllllhhhhhhhllllhHHLLHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLleeeelllllllleEEEL...LHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query XSLKKLEELGfvrkvwikgerknyYEAV...DGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkklee 116
ident |
Sbjct VHVKHMLKKM...........klkSRVEaavWVHQER....................... 203
DSSP HHHHHHHHHH...........lllLHHHhhhHHHHHL.......................
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................................if 205
DSSP .................................ll
No 155: 2V1XA MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sspaawnkedfpwsgkvkdilqnvfklekfrplqletinvtmagkevflvmptgggkslc 60
DSSP llhhhhlllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeellllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yqlpalcsdgftlvicplislmedqlmvlkqlgisatmlnassskehvkwvhaemvnkns 120
DSSP hhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeellllllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct elkliyvtpekiakskmfmsrlekayearrftriavdevhccsqwghdfrpdykalgilk 180
DSSP llleeeelhhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rqfpnasligltatatnhvltdaqkilciekcftftasfnrpnlyyevrqkpsntedfie 240
DSSP hhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhlllllleeeellllllleeeeeeellllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct divklingrykgqsgiiycfsqkdseqvtvslqnlgihagayhanlepedkttvhrkwsa 300
DSSP hhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct neiqvvvatvafgmgidkpdvrfvihhsmsksmenyyqesgragrddmkadcilyygfgd 360
DSSP lllleeeelllllllllllleeeeeellllllhhhhhhhhllllllllleeeeeeelhhh
DSSP ........................................llhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................xiixeeakkliielfselak 20
ident
Sbjct ifrissmvvmenvgqqklyemvsycqniskcrrvlmaqhfdevwacnkmcdncckdsafe 420
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhllllllllllhhhhllllee
DSSP HLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHL....................lLHHH
Query IHGLNKSVGAVYAILYLSD...KPLTISDIXEELK....................iSKGN 57
ident || ||
Sbjct RKNITEYCRDLIKILKQAEelnEKLTPLKLIDSWMgkgaaklrvagvvaptlpredLEKI 480
DSSP EEELHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLllllhhhlllllllllllhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHhhllEEEELLLL..lLLLEEEE.llhHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEelgfVRKVWIKG..eRKNYYEA.vdgFSSIKDIakrkhdliaktyedlkkl 114
ident | |
Sbjct IAHFLIQQY....LKEDYSFTayaTISYLKIgpkaNLLNNEA.................. 518
DSSP HHHHHHLLL....EEEEEEELlllEEEEEEElhhhHHHHLLL..................
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................haitmqvtk 527
DSSP ............................llleeeeel
No 156: 1U5TC MOLECULE: APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;
DSSP llhhhhHHHH......hhhhhhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHH.HLLLLLLHHH.hhHH
Query xiixeeAKKL......iielfselakIHGL..NKSVGAVYAILY.LSDKPLTISD.ixEE 50
ident
Sbjct ......SALPpvysfpplytrqpnslTRRQqiSTWIDIISQYCKtKKIWYMSVDGtskNL 54
DSSP ......LLLLhhhhlhhhhlllllhhHHHHhhHHHHHHHHHHHLlLLLLEELLLLlllLL
DSSP HL.......LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL....llLLLL.EEEELLHhhHHHHHHH
Query LK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI....kgERKN.YYEAVDGfsSIKDIAK 98
ident | | | | |
Sbjct FNnediqrsVSQVFIDEIWSQMTKEGKCLPIDQsgrrssNTTTtRYFILWK..SLDSWAS 112
DSSP LLlllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLllllllLLLLlLEEELLL..LHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhHLHH......................
Query RKHDLIAKTYedlkkleekcneeekefikqkikgIERX...................... 136
ident
Sbjct LILQWFEDSG........................KLNQvitlyelsegdetvnwefhrmp 148
DSSP HHHHHHHHHL........................LLLLeelhhhhlllllllllllllll
DSSP ...hhhhhhHHHH............hhhll
Query ...kkisekILEA............lndld 151
ident |
Sbjct esllyyclkPLCDrnratmlkdendkviai 178
DSSP hhhhhhhhlLLLLlllleelllllllleel
No 157: 2HGCA MOLECULE: YJCQ PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLLLlllhhHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSDKpltisDIXEELKISKGNVSX 60
ident | |
Sbjct .........................KLRYAILKEIFEGNT....pLSENDIGVTEDQFDD 31
DSSP .........................LLHHHHHHHHHHHLL....lLLHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEELlllLLLL......eEEELL..HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEELGFVRKVWikgERKN......yYEAVD..GFSSikdiakrkhdliaktyedlk 112
ident | | | |
Sbjct AVNFLKREGYIIGVH..ySDDRphlyklgPELTEkgENYL.................... 69
DSSP HHHHHHHHLLEELLE..eLLLLeelllllLEELHhhHHHH....................
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..............................kengtwska 78
DSSP ..............................hhhllllll
No 158: 1ZYBA MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sdkihhhhhhxetxfdtllqlplfqglchedftsildkvklhfikhkagetiiksgnpct 60
DSSP llllllhhhhhhhhhllhhhlhhhllllhhhhhhhhhlllleeeeelllleeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qlcfllkgeisivtnakeniytvieqieapyliepqslfgxntnyassyvahtevhtvci 120
DSSP eeeeeeeleeeeeeelhhhlleeeeeeelleeelhhhhllllllllleeeellleeeeee
DSSP .............................LLHHHHHhhHHHHhhhhhhhhllllHHHHHH
Query .............................XIIXEEAkkLIIElfselakihglnKSVGAV 31
ident
Sbjct skafvlsdlfrydifrlnyxnivsnraqnLYSRLWD..EPTL............DLKSKI 166
DSSP ehhhhhhlhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLL..LLLL............LHHHHH
DSSP HHHHHHLL.......LLLL.HHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLE
Query YAILYLSD.......KPLT.ISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNY 83
ident | | | | | | |
Sbjct IRFFLSHCekpqgekTFKVkXDDLARCLDDTRLNISKTLNELQDNGLIELHR......KE 220
DSSP HHHHHLLLlllllleEEELlHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEL......LE
DSSP EEELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query YEAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiseki 143
ident |
Sbjct ILIPDAQK.................................................... 228
DSSP EEELLHHH....................................................
DSSP hhhhhhll
Query lealndld 151
ident
Sbjct ......ll 230
DSSP ......hl
No 159: 1YIOA MOLECULE: RESPONSE REGULATORY PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct akptvfvvdddmsvreglrnllrsagfevetfdcastflehrrpeqhgclvldmrmpgms 60
DSSP llleeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeellhhhhhhhlllllleeeeeelllllll
DSSP .........................................................llh
Query .........................................................xii 3
ident
Sbjct gielqeqltaisdgipivfitahgdipmtvramkagaieflpkpfeeqalldaieqglql 120
DSSP hhhhhhhhhhlllllleeeeellllllllhhhhhlleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query xeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSXSLK 63
ident | | | | || | |
Sbjct naerrqaretqdqleqlfSSLTGREQQVLQLTIRG...LMNKQIAGELGIAEVTVKVHRH 177
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLleeeelllllllleeEELL.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query KLEELGfvrkvwikgerknyyEAVD.GFSSikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneee 122
ident |
Sbjct NIMQKL.........nvrslaNLVHlVEKY.............................. 198
DSSP HHHHHL.........llllhhHHHHhHHHL..............................
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................. 198
DSSP .............................
No 160: 1FSEA MOLECULE: GERE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | | || || |
Sbjct ...................skpLLTKREREVFELLVQD...KTTKEIASELFISEKTVRN 38
DSSP ...................lllLLLHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLleeeelllllllleeeELLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query SLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeAVDGFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcne 120
ident |
Sbjct HISNAMQKL........gvkgrsqaVVELLRMG........................... 63
DSSP HHHHHHHHH........llllhhhhHHHHHHLL...........................
DSSP llhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........................elel 67
DSSP ...........................llll
No 161: 2NOVA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE 4 SUBUNIT A;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....LLHHHHHHHHHHHHLL.....LLLLHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG....LNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEEL 51
ident |
Sbjct ...................ALPDirdgLKPVQRRILYSMNKDSntfdkSYRKSAKSVGNI 41
DSSP ...................LLLLllllLLHHHHHHHHHHHHLLlllllLLEEHHHHHHHH
DSSP L.....lLHHHHHHHHHHHHH.....hLLEEEEL.........lllllLLEEEEL.LHHH
Query K.....iSKGNVSXSLKKLEE.....lGFVRKVW.........ikgerKNYYEAV.DGFS 91
ident |
Sbjct MgnfhphGDSSIYDAMVRMSQnwknreILVEMHGnngsmdgdppaamrYTEARLSeIAGY 101
DSSP HhhllllLLLLLHHHHHHLLLllllllLLEEEELllllllllllllllLLEEEELhHHHL
DSSP ..............................................hhhhhHHHHHHHHH
Query ..............................................sikdiAKRKHDLIA 105
ident |
Sbjct llqdiekktvpfawnfddtekeptvlpaafpnllvngstgisgyatdipphNLAEVIDAA 161
DSSP llllhhhhhlleeelllllleeellllllllhhhhhleellllllleelllLHHHHHHHH
DSSP HHhhHHHHhhhhlllllhhhhhhhHHHHLH.HHHH.........................
Query KTyeDLKKleekcneeekefikqkIKGIER.XKKI......................... 139
ident |
Sbjct VYmiDHPT...............aKIDKLMeFLPGpdfptgaiiqgrdeikkayetgkgr 206
DSSP HHhhHLLL...............lLHHHHLlLLLLllllllleellhhhhhhhhhhleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct vvvrskteieklkggkeqiviteipyeinkanlvkkiddvrvnnkvaevrdelriaidan 266
DSSP lleeleeeeeellllleeeeeeellllllhhhhhhhllhhhhllllllleellleellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct telvlnylfkytdlqinynfnmvaidnftprqvgivpilssyiahrrevilarsrfdkek 326
DSSP lllhhhhhhhlllleelleeeleeeelleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct aekrlhiveglirvisildevialirasenkadakenlkvydfteeqaeaivtlqlyrlt 386
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllllhhhhhlllllllllhhhhhhhhlllhhhhl
DSSP ......................................hhhhHHHH....hhll
Query ......................................sekiLEAL....ndld 151
ident
Sbjct ntdvvvlqeeeaelrekiamlaaiigdertmynlmkkelrevKKKFatprlssl 440
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhHHHHllllllll
No 162: 2IJLA MOLECULE: MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.....LLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG.....LNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISK 55
ident | | || |
Sbjct ..........krlplkpvlRIDFppgerLGHGKVELXQLIAET...GSISAAGRAXDXSY 47
DSSP ..........llllleeeeEEEEllleeELHHHHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHLLLLH
DSSP HHHHHHHHHHHHH...LLEEEELlllllllEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEEL...GFVRKVWikgerknYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlk 112
ident |
Sbjct RRAWLLVDALNHXfrqPVICSQR.......GAALTVF................gaeller 84
DSSP HHHHHHHHHHHHHlllLLEEELL.......LEEELHH................hhhhhhh
DSSP hhhhhlllllhhhhhhHHHHHLHhhhhhhhhhhhhhhll
Query kleekcneeekefikqKIKGIERxkkisekilealndld 151
ident |
Sbjct yrgxeerxnealrediDWLEANR.............npq 110
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHL.............lll
No 163: 1T98A MOLECULE: CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLL......LLLL..HHHHHHHHL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSD......KPLT..ISDIXEELK 52
ident | |
Sbjct .......vpelvawarkndfsISLPVDRLSFLLAVATLNgerldgEXSEgeLVDAFRHVS 53
DSSP .......llhhhhhhhhhlllEEELHHHHHHHHHHHHHHhlllllLLLHhhHHHHHHHHH
DSSP ........lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELlllllllEEEELLH..............h
Query ........iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknYYEAVDG..............f 90
ident |
Sbjct dafeqtsetIGVRANNAINDXVRQRLLNRFT.......IYRLTPLgigitdyyirqrefs 106
DSSP hhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHLLEEELL.......LEEELHHhhhhhhhhhllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhhlllllhhhHHHHHHHH.LHHHHHHHHHHHHHHH
Query ssikdiakrkhdliaktyedLKKLEekcneeekefIKQKIKGI.ERXKKISEKILEALND 149
ident | | |
Sbjct tlrlsxqlsivagelkraadAAEEG.........gDEFHWHRNvYAPLKYSVAEIFDSID 157
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL.........lLHHHHHHHlHHHHHHLHHHHHHHHH
DSSP LL..........................................................
Query LD.......................................................... 151
ident |
Sbjct LTqrlxdeqqqqvkddiaqllnkdwraaisscelllsetsgtlrelqdtleaagdklqan 217
DSSP HHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .................................................
Query ................................................. 151
ident
Sbjct llriqdatxthddlhfvdrlvfdlqskldriiswgqqsidlwigydrhv 266
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 164: 2HYDA MOLECULE: ABC TRANSPORTER HOMOLOG;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeellhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC.. 118
ident
Sbjct .............................MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIpm 31
DSSP .............................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhh
DSSP ......................................lLLLHHHHHHHHHHHLHHHHHH
Query ......................................nEEEKEFIKQKIKGIERXKKIS 140
ident |
Sbjct lipllikyaidgvinnhalttdekvhhltiaigialfifVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNK 91
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLL.................................................
Query EKILEALNDLD................................................. 151
ident
Sbjct ILYDIRKKLYNhlqalsarfyannqvgqvisrvindveqtkdfiltglmniwldcitiii 151
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct alsimffldvkltlaalfifpfyiltvyvffgrlrkltrersqalaevqgflhervqgis 211
DSSP hhhhhhhhllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct vvksfaiedneaknfdkkntnfltralkhtrwnaysfaaintvtdigpiivigvgaylai 271
DSSP hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct sgsitvgtlaafvgylellfgplrrlvasfttltqsfasmdrvfqlidedydikngvgaq 331
DSSP hllllhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct pieikqgrididhvsfqyndneapilkdinlsiekgetvafvgmsgggkstlinliprfy 391
DSSP lllllllleeeeeeeellllllllleeeeeeeelllleeeeellllllhhhhhlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct dvtsgqilidghnikdfltgslrnqiglvqqdnilfsdtvkenillgrptatdeevveaa 451
DSSP llleeeeeelleehhhllhhhhhhleeeellllllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct kmanahdfimnlpqgydtevgergvklsggqkqrlsiariflnnppilildeatsaldle 511
DSSP hhlllhhhhhllllhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct sesiiqealdvlskdrttlivahrlstithadkivvienghivetgthreliakqgayeh 571
DSSP hhhhhhhhhhhhlllleeeeelllhhhllllleeeeeelleeeeeelhhhhhhlllhhhh
DSSP .......
Query ....... 151
ident
Sbjct lysiqnl 578
DSSP hhlllll
No 165: 2FEZA MOLECULE: PROBABLE REGULATORY PROTEIN EMBR;
DSSP llhhhhHHHHhhhhhhhhhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL......
Query xiixeeAKKLiielfselakIHGL.NKSVGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK...... 52
ident || | | | |
Sbjct ..rldfGLLG.plqmtidgtPVPSgTPKQRAVLAMLVINrNRPVGVDALITALWeewpps 57
DSSP ..leeeELLL.lleeeelleELLLlLHHHHHHHHHHHHLlLLEELHHHHHHHHHllllll
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHL.........lEEEELllllllLEEEELL...............
Query iSKGNVSXSLKKLEELG.........fVRKVWikgerkNYYEAVD............... 88
ident | | |
Sbjct gARASIHSYVSNLRKLLggagidprvvLAAAP......PGYRLSIpdntcdlgrfvaekt 111
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhEEEEL......LEEEELLlhhhlhhhhhhhhhh
DSSP ....................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH
Query ....................................gfssikdiakrkhdliaktyEDLK 112
ident
Sbjct agvhaaaagrfeqasrhlsaalrewrgpvlddlrdfqfvepfatalvedkvlahtaKAEA 171
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH
DSSP HHHHH.......................................................
Query KLEEK....................................................... 117
ident
Sbjct EIACGrasaviaelealtfehpyreplwtqlitayylsdrqsdalgayrrvkttladdlg 231
DSSP HHHLLlhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ................lllLLHHHH.HHHHHhhlhhhhhhhhhhhhhHHLL.........
Query ................cneEEKEFI.KQKIKgierxkkisekilealNDLD......... 151
ident |
Sbjct idpgptlralnerilrqqpLDAKKSaKTTAA.....gtvtvldqrtmASGQqavaylhdi 286
DSSP llllhhhhhhhhhhhllllLLHHHHhHHHHH.....hhhhhhhhhllLLLLlllleeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct asgrgyplqaaatrigrlhdndivldsanvsrhhavivdtgtnyvindlrssngvhvqhe 346
DSSP lllleeelllleeeeelllllleelllllllllleeeeelllleeeeellllllleelle
DSSP ...........................
Query ........................... 151
ident
Sbjct rirsavtlndgdhiricdheftfqisa 373
DSSP ellleeellllleeeelleeeeeelll
No 166: 1W36D MOLECULE: DNA HAIRPIN;
DSSP .........lLHHHhhHHHH.HHHHhHHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHL....LLLLLHHH
Query .........xIIXEeaKKLI.IELFsELAKihGLNKSVGAVYAILYLS....DKPLTISD 46
ident | | | | | |
Sbjct klqkqlleavEHKQ..LRPLdVQFAlTVAG..DEHPAVTLAAALLSHDagegHVCLPLSR 56
DSSP llhhhhhhhhHLLL..LLHHhHHHHhHHLL..LLLHHHHHHHHHHHHHhhllLLEEELLL
DSSP HHH.............hhlLLHHhHHHHHH..HHHH....hLLEEEELllllllLEEEEL
Query IXE.............elkISKGnVSXSLK..KLEE....lGFVRKVWikgerkNYYEAV 87
ident |
Sbjct LENneashpllatcvseigELQN.WEECLLasQAVSrgdepTPMILCG......DRLYLN 109
DSSP LLLhhhhllllllllllllLLLL.HHHHHHhlLLEElllllLLEEELL......LEEEEH
DSSP L....................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHH..........
Query D....................gfssikdiakrkhdliaktyedlKKLEEK.......... 117
ident |
Sbjct RmwcnertvarffnevnhaievdeallaqtldklfpvsdeinwqKVAAAValtrrisvis 169
DSSP HhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhllllllllllhhHHHHHHhhllleeeee
DSSP .....lllLLHHHHHH............................................
Query .....cneEEKEFIKQ............................................ 128
ident
Sbjct ggpgtgktTTVAKLLAaliqmadgercrirlaaptgkaaarlteslgkalrqlpltdeqk 229
DSSP llllllhhHHHHHHHHhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhhhhlhhhhhllllllll
DSSP .....................hhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL................
Query .....................kikgierxkkisekileaLNDLD................ 151
ident
Sbjct kripedastlhrllhagnplhldvlvvdeasmidlpmmsRLIDAlpdharviflgdrdql 289
DSSP llllllllllllllllllllllleeeellhhhllhhhhhHHHHLllllleeeeeellllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct asveagavlgdicayanagftaerarqlsrltgthvpagtgteaaslrdslcllqksyrf 349
DSSP hhllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhlleeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct gsdsgigqlaaainrgdktavktvfqqdftdiekrllqsgedyiamleealagygryldl 409
DSSP lllllhhhhhhhhlllhhhhhllllhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct lqaraepdliiqafneyqllcalregpfgvaglnerieqfmqqkrqpsrlpehettwamt 469
DSSP hhllllllllhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct vhksqgsefdhaalilpsqrtpvvtrelvytavtrarrrlslyaderilsaaiatrterr 529
DSSP lllllllllleeeeellllllllllhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhhhhllllll
DSSP .........
Query ......... 151
ident
Sbjct sglaalfss 538
DSSP llhhhhlll
No 167: 1S6LA MOLECULE: ALKYLMERCURY LYASE;
DSSP llhhhhhhHHHHhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHHlLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakKLIIelfselakihglnksvgAVYAILYLsDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | |
Sbjct .......aDLLV.................PLLRELAK.GRPVSRTTLAGILDWPAERVAA 35
DSSP .......lLLLL.................HHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHhHHHLleEEELLlllllLEEEELLhHHHH...........................
Query SLKKlEELGfvRKVWIkgerkNYYEAVDgFSSI........................... 93
ident |
Sbjct VLEQ.ATST..EYDKD.....GNIIGYG.LTLRetsyvfeiddrrlyawcaldtlifpal 86
DSSP HHLL.LLLL..LEELL.....LEELLLL.LLLLllleeeeelleeeeelllllllllhhh
DSSP ...............................hhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhlllll
Query ...............................kdiakrkhdliAKTYedlkkleekcneee 122
ident
Sbjct igrtarvsshcaatgapvsltvspseiqavepagmavslvlpQEAA.............. 132
DSSP hllleeeeeelllllleeeeeelllleeeeelllleeeelllLLLL..............
DSSP hhhhhhhhhhhlhhHHHHhhHHHH....................................
Query kefikqkikgierxKKISekILEA.................................... 146
ident
Sbjct ...........dvrQSFC..CHVHffasvptaedwaskhqgleglaivsvheafglgqef 179
DSSP ...........lllLLLL..LLLEeellhhhhhhhhhlllllllleeeehhhhhhhhhhh
DSSP ........hhhll
Query ........lndld 151
ident
Sbjct nrhllqtmssrtp 192
DSSP hhhhhllllllll
No 168: 1OR7A MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA-E FACTOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct shmseqltdqvlvervqkgdqkafnllvvryqhkvaslvsryvpsgdvpdvvqeafikay 60
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ................................................llhhhhhhhhhh
Query ................................................xiixeeakklii 12
ident
Sbjct raldsfrgdsafytwlyriavntaknylvaqgrrppssdvdaieaenfesgganlmlsee 120
DSSP hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllleeehhh
DSSP hhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLlee
Query elfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGfvr 72
ident | | | | | | |
Sbjct lrqivfrtiESLPEDLRMAITLRELD..GLSYEEIAAIMDCPVGTVRSRIFRAREAI... 175
DSSP hhhhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHH...
DSSP eelllllllleeeellhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
Query kvwikgerknyyeavdgfsSIKDiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikg 132
ident
Sbjct .................dnKVQP..................................... 181
DSSP .................hhHHLL.....................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................... 181
DSSP ...................
No 169: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...LHHHHHHHHHHHHL....LLLLLHHHHHHHHLL
Query xiixeeakkliielfselakIHGL...NKSVGAVYAILYLS....DKPLTISDIXEELKI 53
ident | | | |
Sbjct .................dgtVKVSrslKEMGNKIRKAKDELsktrGRAPTVTEIADHLGI 43
DSSP .................lllLLLHhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLLLLHHHHHHHHLL
DSSP LHHHHHHHHHHHHHhlleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEElgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkk 113
ident | |
Sbjct SPEDVVLAQEAVRL.............................................. 57
DSSP LHHHHHHHHHHHHL..............................................
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query leekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...................................... 57
DSSP ......................................
No 170: 2O8XA MOLECULE: PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHH.HHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAI.LYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVS 59
ident | | | | |
Sbjct ........mgfedlvevttmiADLTTDQREALLLtQLLG...LSYADAAAVCGCPVGTIR 49
DSSP ........llhhhhhhhhlllLLLLHHHHHHHHHhHLLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query XSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident
Sbjct SRVARARDAL.................................................. 59
DSSP HHHHHHHHHH..................................................
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..............................la 61
DSSP ..............................hl
No 171: 2G7HA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE
DSSP ....................................................llhhhhhh
Query ....................................................xiixeeak 8
ident
Sbjct miiqieeyfigmifkgnqlvrntiplrreeifnfmdgevvsnpedehlkvaeiilklyfa 60
DSSP leeeelleeeeeeelllleeeeelllllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhll
DSSP hhhhhhhhhhhhHLLLL.hHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query kliielfselakIHGLN.kSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKL 65
ident | | | || || | | | ||
Sbjct eiddkkvrelisYKLEVpeFTKKVLDIVKDIEfgKTLTYGDIAKKLNTSPRAVGMALKRN 120
DSSP llllllllllllLLLLLllLLHHHHHHHLLLLllLLEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHLL
DSSP hHHLL.EEEEllllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query eELGF.VRKVwikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeeke 124
ident
Sbjct pLPLIiPCHRvvakNSLG........................................gy 140
DSSP lLLLLlHHHHeellLLLL........................................ll
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query fikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct sygldkkkfilererlnmvsfkfnkvy 167
DSSP llllhhhhhhhhhhhllllllllllll
No 172: 2GMGA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PF0610;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHH....llLHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEEL....kiSKG 56
ident | | | | ||
Sbjct ...............ahhhhhhGSATRREKIIELLLEG..DYSPSELARILdmrgkgSKK 43
DSSP ...............lllllllLHHHHHHHHHHHLLLL..LLLLLHHHHLLllllllLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHL....leEEELLLL.........................llLLEEEEL
Query NVSXSLKKLEELG....fvRKVWIKG.........................erKNYYEAV 87
ident ||
Sbjct VILEDLKVISKIAkregmvLLIKPAQcrkcgfvfkaeinipsrcpkcksewieEPRFKLE 103
DSSP HHHHHHHHHHHHHlllleeEEELLLLlllllllllllllllllllllllllllLLLEEEE
DSSP Lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhh
Query Dgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileal 147
ident
Sbjct R........................................................... 104
DSSP E...........................................................
DSSP hhll
Query ndld 151
ident
Sbjct ...k 105
DSSP ...l
No 173: 2BS2C MOLECULE: QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhHHHHHHHHhHLLLLLLhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksVGAVYAILyLSDKPLTisdixeelkiskgnvsx 60
ident |
Sbjct ...........................MTNESILEsYSGVTPE................. 16
DSSP ...........................LLHHHHHHhHHLLLLL.................
DSSP hhhhhhhhlleeeellllllllEEEELL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query slkkleelgfvrkvwikgerknYYEAVD.GFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCN 119
ident |
Sbjct ......................RKKSRMpAKLDWWQSATGLFLGLFMIGHMFFVSTILLG 54
DSSP ......................LLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
DSSP LLLHHH.HHHH.............hhhhLHHHHHHHHHHHHHHHLL..............
Query EEEKEF.IKQK.............ikgiERXKKISEKILEALNDLD.............. 151
ident | |
Sbjct DNVMLWvTKKFeldfifeggkpivvsflAAFVFAVFIAHAFLAMRKfpinyrqyltfkth 114
DSSP HHHHHHhHHHLlllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct kdlmrhgdttlwwiqamtgfamfflgsvhlyimmtqpqtigpvsssfrmvsewmwplylv 174
DSSP hhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct llfavelhgsvglyrlavkwgwfdgetpdktranlkklktlmsaflivlglltfgayvkk 234
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ....................
Query .................... 151
ident
Sbjct gleqtdpnidykyfdykrth 254
DSSP hlllllllllllllllllll
No 174: 1ZELA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RV2827C;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHhHHHHHHHH.HLLLLLLHHHHHHHHL...LLHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSvGAVYAILY.LSDKPLTISDIXEELK...ISKG 56
ident | | | | |
Sbjct ..........amvvspagadrriPTWA.SRVVSGLArDRPVVVTKEDLTQRLTeagCGRD 49
DSSP ..........leeelllllllllLHHH.HHHHHHHHhHLLLLEEHHHHHHHHHhllLLLL
DSSP HHHHhHHHHHHHLLEEEELLllllLLEEEELLHHHH........................
Query NVSXsLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAVDGFSS........................ 92
ident | | | |
Sbjct PDSA.IRELRRIGWLVQLPV....KGTWAFIPPGEAaisdpylplrswlardqnagfmla 104
DSSP HHHH.HHHHHHHLLEEELLL....LLEEEELLLLLLeeelllhhhhhhhhhlllllleel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 92
ident
Sbjct gasaawhlgyldrqpdgripiwlppakrlpdglasyvsvvripwnaadtallaprpallv 164
DSSP hhhhhhhhlllllllllleeeellllllllhhhllleeeellllllllhhhhlllhhhhh
DSSP ................hhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHL..................
Query ................ikdiakrkhdliaktYEDLKKLEEKC.................. 118
ident |
Sbjct rrrldlvawatglpalgpeallvqiatrpasFGPWADLVPHLddlvadcsderlerllsg 224
DSSP hllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhLLLHHHHHHHHhhhhhlllhhhhhhhhll
DSSP ...........LLLL.........................................hhHH
Query ...........NEEE.........................................keFI 126
ident
Sbjct rptsawqrasyLLDSggepargqallakrhtevmpvtrfttahsgesvwapeyqlvdeLV 284
DSSP llhhhhhhhhhHHHHlllhhhhhhhhlllllllllleeelllllllleeehhhleeelLH
DSSP HHhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query KQkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct VP................llrvigk 293
DSSP HH................hhhhhhl
No 175: 1S29A MOLECULE: LA PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHH................hllLLLL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILY................lsdKPLT 43
ident | |
Sbjct ..............gshxplsSENKqKLQKQVEFYFSdvnvqrdiflkgkxaenaeGFVS 46
DSSP ..............lllllllHHHHhHHHHHHHHHLLhhhhlllhhhhhhhlllllLLEE
DSSP HHHHHHH.....hlLLHHHHHHHHHHHhhhLLEEEELLlllllLEEEELLHHHhhhhhhh
Query ISDIXEE.....lkISKGNVSXSLKKLeelGFVRKVWIkgerkNYYEAVDGFSsikdiak 98
ident | |
Sbjct LETLLTFkrvnsvtTDVKEVVEAIRPS...EKLVLSED....gLXVRRRDPLP....... 92
DSSP HHHHLLLhhhhlllLLHHHHHHHHLLL...LLEEELLL....lLEEEELLLLL.......
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query rkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................................... 92
DSSP .....................................................
No 176: 1DVEA MOLECULE: HEME OXYGENASE-1;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselaKIHGLnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ...sqdlsealkeatkevhIRAEN...................................s 22
DSSP ...lllhhhhhhhhhhhhhHHHHL...................................l
DSSP hhhHHHHhlleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query slkKLEElgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCNe 120
ident | |
Sbjct efmRNFQ.................kgqvSREGFKLVMASLYHIYTALEEEIERNKQNPV. 64
DSSP hhhHHHH.................llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.
DSSP llHHHHHhHHHHHLhHHHHHHHHHHHHHH...............................
Query eeKEFIKqKIKGIErXKKISEKILEALND............................... 149
ident |
Sbjct ..YAPLY.FPEELH.RRAALEQDMAFWYGphwqeaipytpatqhyvkrlhevggthpell 120
DSSP ..LHHHL.LLLLLL.LHHHHHHHHHHHHLllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 149
ident
Sbjct vahaytrylgdlsggqvlkkiaqkamalpssgeglafftfpsidnptkfkqlyrarmntl 180
DSSP hhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ................................ll
Query ................................ld 151
ident
Sbjct emtpevkhrvteeaktafllnielfeelqallte 214
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 177: 2P8TA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH0730;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYlsdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || | || | | | | |
Sbjct .....................eyTVEDVLAVIFLLK...EPLGRKQISERLELGEGSVRT 36
DSSP .....................llLHHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEEEEllllllllEEEELLH...............................
Query SLKKLEELGFVRKVwikgerknYYEAVDG............................... 89
ident | || | |
Sbjct LLRKLSHLDIIRSK........GHFLTLKgkeirdkllsmfsepigvsvdgypgiaivvk 88
DSSP HHHHHHHLLLEEEL........LEEELHHhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeeeel
DSSP .........hhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhlllllhhhhHHHHH.........
Query .........fssikdiakrkhdliaktYEDLkkleekcneeekefiKQKIK......... 131
ident
Sbjct nppefksielrdeaikfdakgamiltvKDNE............ivfPEDFRplkemypev 136
DSSP llllllhhhhhhhhhhlllleeeeeeeELLE............eelLLLLLlhhhllhhh
DSSP ............................hhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ............................gierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct akkivdyedgdaviitwaetpakalksaihvayilkkeeitpeilevv 184
DSSP hhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhlll
No 178: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi 60
DSSP llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ..LLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLHHH
Query ..XIIXeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGN 57
ident | |
Sbjct epYRLP.........eviqkcnarwtTEEQLLAVQAIRKY..GRDFQAISDVIGnKSVVQ 109
DSSP hhHLLL.........lllllllllllHHHHHHHHHHHHHH..LLLHHHHHHHHLlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEeelllllllleeeELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEELGFVRkvwikgerknyyeAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident |
Sbjct VKNFFVNYRRRFNID............eVLQE............................ 129
DSSP HHHHHHHLLLLLLHH............hHHHH............................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..............................weae 133
DSSP ..............................hhll
No 179: 2HQRA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mrvllieknsvlggeiekglnvkgfmadvtesledgeylmdirnydlvmvsdknalsfvs 60
DSSP lleeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhlllllleeeellllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rikekhssivvlvssdnptseeevhafeqgaddyiakpyrsikalvariearlrfwgsnv 120
DSSP hhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeellllllhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ..llhhhhHHHHHhhhhhhhhhhllLLHHhHHHHHHHHHL.LLLLLHHHHHHHHL.....
Query ..xiixeeAKKLIielfselakihgLNKSvGAVYAILYLS.DKPLTISDIXEELK..... 52
ident | | | |
Sbjct ieigdltiSPDEE.kiiykgrevevKGKP.FEVLTHLARHrDQIVSKEQLLDAIWeepem 178
DSSP eeelleeeELLLL.eeeelleeellLLLL.LHHHHHHHHLlLEEEEHHHHHHHHLlllll
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHH...hLLEEEELLlllllLEEEELLhhhHHHHHHHhhhhhhh
Query ....iSKGNVSXSLKKLEE...lGFVRKVWIkgerkNYYEAVDgfsSIKDIAKrkhdlia 105
ident | | | |
Sbjct vtpnvIEVAINQIRQKMDKplgiSTVETVRR.....RGYRFCY...PKPACEE....... 223
DSSP lhhhlHHHHHHHHHHHHHLllllLLEEELLL.....LEEEELL...LHHHLLL.......
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .............................................. 223
DSSP ..............................................
No 180: 2DOAA MOLECULE: RNA POLYMERASE II ELONGATION FACTOR ELL;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhHHHHhhllllHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL...LLHHH
Query xiixeeakkliielfSELAkihglnKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK...ISKGN 57
ident | | | | |
Sbjct ........gssgssgVSQR......PFRDRVLHLLALR..PYRKAELLLRLQkdgLTQAD 44
DSSP ........lllllllLLLL......LHHHHHHHHHHHL..LEEHHHHHHHHHhhlLLHHH
DSSP HHHHHHHHHhhLLEEEELLllllLLEEEELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEelGFVRKVWIkgerKNYYEAVDGfssikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident | |
Sbjct KDALDGLLQ..QVANMSAK....DGTCTLQDC............................ 70
DSSP HHHHHHHHH..HLLEELLL....LLEEELLLL............................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL
Query cneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD 151
ident
Sbjct mykdvqkdwpgysegdqqllkrvlvrklsGPSSG 104
DSSP hhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhllLLLLL
No 181: 2AXLA MOLECULE: WERNER SYNDROME;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHL........
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELK........ 52
ident | |
Sbjct .............mddsedtSWDFGPQAFKLLSAVDILGEKFGIGLPILFLRgsnsqrla 47
DSSP .............lllllllEEELHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlllllhhh
DSSP ..............lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEEL..LHHH.....
Query ..............iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgERKNYYEAV..DGFS..... 91
ident | || |
Sbjct dqyrrhslfgtgkdqTESWWKAFSRQLITEGFLVEVSRynKFMKICALTkkGRNWlhkan 107
DSSP hhllllllllhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllLLLLEEEELhhHHHHhhhll
DSSP ..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLlhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..sikdiakrkhdliaktyedlkkleEKCNEEekefikqkikgierxkkisekilealnd 149
ident
Sbjct tesqslilqaneelcpkklllpssktVSSGTK.........................ehc 142
DSSP lllllleeelllllllllllllllllLLLLLL.........................lll
DSSP ll
Query ld 151
ident
Sbjct yn 144
DSSP ll
No 182: 1O7DC MOLECULE: LYSOSOMAL ALPHA-MANNOSIDASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeellhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHH..HHHHHhhl
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiAKRKHDLIAKTYED..LKKLEekc 118
ident
Sbjct ...................................gDSAPLNEAMAVLQHhdAVSGT... 22
DSSP ...................................lLLHHHHHHHHHLLLllLLLLL...
DSSP llllhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL...........................
Query neeekefIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD........................... 151
ident | | |
Sbjct ......sRQHVANDYARQLSEGWRPCEVLMSNAlahlsglkedfafcrklnisicpltqt 76
DSSP ......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllleellllhhhlllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct aerfqvivynplgrkvdwmvrlpvskhvylvkdpggkivpsdvvtipssdsqellfsalv 136
DSSP lleeeeeeeellllleeeeeeeeelllleeeellllleelleeeeelllleeeeeeeeee
DSSP ..............
Query .............. 151
ident
Sbjct pavgfsiysvsqmp 150
DSSP llleeeeeeeeell
No 183: 1X3UA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN FIXJ;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | || |
Sbjct .....gshmddandiraRLQT..LSERERQVLSAVVAG...LPNKSIAYDLDISPRTVEV 50
DSSP .....lllllllhhhhhHHHH..HLHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHH...HLLEEeelllllllleeeELLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SLKKLEE...LGFVRkvwikgerknyyeAVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleek 117
ident
Sbjct HRANVMAkmkAKSLP...........hlVRMALA.......................... 73
DSSP HHHHHHHhllLLLHH...........hhHHHHHH..........................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query cneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ............................ggfgps 79
DSSP ............................hlllll
No 184: 2H7OA MOLECULE: PROTEIN KINASE YPKA;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeellhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfssIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEekcne 120
ident | | |
Sbjct ...............................rITPKKLRELSDLLRTHLSSAATK..... 24
DSSP ...............................lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
DSSP llhhhhhhHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHL..............................
Query eekefikqKIKGIERXKKISEKILEALNDL.............................. 150
ident | |
Sbjct ......qlDMGGVLSDLDTMLVALDKAEREvdkdqlksfnslilktyrviedyvkgnfml 78
DSSP ......llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct sivepslqriqkhldqthsfsdigslvrahkhletllevlvtlsqpvssetygflnrlae 138
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct akitlsqqlntlqqqqesakaqlsilinrsgswadvarqslqrfdstrpvvkfgteqyta 198
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct ihrqmmaahaaitlqevseftddmrnftvdsiplliqlgrsslmdehlveqreklreltt 258
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........l
Query ...........d 151
ident
Sbjct iaerlnrlerew 270
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 185: 2EWFA MOLECULE: NICKING ENDONUCLEASE N.BSPD6I;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHhHHHHHHHHHHLLL........llLHHHHHHHHL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKsVGAVYAILYLSDK........plTISDIXEELK 52
ident | | ||
Sbjct ........makkvnwyvscspRSPEK.IQPELKVLANFEGsywkgvkgykAQEAFAKELA 51
DSSP ........lllllllllllllLLHHH.HHHHHHHHHHHLLllllllllhhHHHHHHHHHH
DSSP .....llhHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllllEEEELLH...........hhhHHHH
Query .....iskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDG...........fssIKDI 96
ident ||| | |
Sbjct alpqflgaFSTRDRVAPMKTYGFVFVDEE.....gYLRITEAgkmlannrrpkdvfLKQL 106
DSSP llhhhlllLLHHHHHHHHHHLLLEEELLL.....lLEEELHHhhhhhllllhhhhhHHHH
DSSP HH....................hhhHHHHHHHHHH.......................hH
Query AK....................rkhDLIAKTYEDL.......................kK 113
ident |
Sbjct VKwqypsfqhkgkeypeeewsinplVFVLSLLKKVgglskldiamfcltatnnnqvdeiA 166
DSSP HHlllllllllllllllllllllhhHHHHHHHHHHllllhhhhhhhllllllhhhhhhhH
DSSP HHHHL..LLLL.................................................
Query LEEKC..NEEE................................................. 122
ident | || |
Sbjct EEIMQfrNEREkikgqnkkleftenyffkrfekiygnvshkskietkmrnardvadattr 226
DSSP HHHHHhhHHHHhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........hhhhhhhhhhhLHHHHHHH.......................hHHHH...
Query ..........kefikqkikgiERXKKISE.......................kILEA... 146
ident
Sbjct yfrytglfvargnqlvlnpekSDLIDEIIssskvvknytrveefheyygnpslPQFSfet 286
DSSP hhhhllleeeelleeeelhhhHHHHHHHHhhlllllllllhhhhhhhhlllllLLLLlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 146
ident
Sbjct keqlldlahrirdentrlaeqlvehfpnvkveiqvlediynslnkkvdvetlkdviyhak 346
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 146
ident
Sbjct elqlelkkkklqadfndprqleevidllevyhekknvieekikarfiankntvfewltwn 406
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 146
ident
Sbjct gfiilgnaleyknnfvideelqpvthaagnqpdmeiiyedfivlgevttskgatqfkmes 466
DSSP hhhhhlllleeeelleellllleeelllllllleeeellleeeeeeellllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 146
ident
Sbjct epvtrhylnkkkelekqgvekelyclfiapeinkntfeefmkynivqntriiplslkqfn 526
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeehhhhh
DSSP ........................................................hhhl
Query ........................................................lndl 150
ident
Sbjct mllmvqkkliekgrrlssydiknlmvslyrttiecerkytqikagleetlnnwvvdkevr 586
DSSP hhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP l
Query d 151
ident
Sbjct f 587
DSSP l
No 186: 1U78A MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | |
Sbjct .................prgsalSDTERAQLDVMKLLN...VSLHEMSRKISRSRHCIRV 40
DSSP .................llllllLHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHlleeeelllllllleeeellhhhhhhhHHHHhhhHHHHhhHHHHHHHHHL.L
Query SLKKLEELgfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdIAKRkhdLIAKtyEDLKKLEEKC.N 119
ident || | |
Sbjct YLKDPVSY.........................gtSKRA...PRRK..ALSVRDERNViR 70
DSSP HHHLHHHL.........................llLLLL...LLLL..LLLHHHHHHHhH
DSSP LLL.....................hhhHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query EEE.....................kefIKQKikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct AASnscktardirnelqlsaskrtilnVIKR....................sg 103
DSSP HHHhllllhhhhhhhllllllhhhhhhHHHH....................ll
No 187: 1RZ4A MOLECULE: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 3
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct amfeqxranvgkllkgidrynpenlatleryvetqakenaydleanlavlklyqfnpaff 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlhhhl
DSSP ...........................................lLHHHHHHHHH......
Query ...........................................xIIXEEAKKLI...... 11
ident |
Sbjct qttvtaqillkaltnlphtdftlckcxidqahqeerpirqilylGDLLETCHFQafwqal 120
DSSP lhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllhhhhllllhhhhhhhHHHHHLLLHHhhhhhl
DSSP .......hhhhhHHHHhllllhhhHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHH.LLLHHHHHHHHH
Query .......ielfsELAKihglnksvGAVYAILYLSDKPLTISDIXEEL.KISKGNVSXSLK 63
ident | | |
Sbjct denxdllegitgFEDS......vrKFICHVVGITYQHIDRWLLAEXLgDLSDSQLKVWXS 174
DSSP llllhhhhllllHHHH......hhHHHHHHHHHHLLEELHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHH
DSSP HHHhhllEEEELlllllllEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllh
Query KLEelgfVRKVWikgerknYYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeek 123
ident |
Sbjct KYG....WSADE.......QIFICS..........................qeesikpkn 197
DSSP HHL....LEELL.......LEELLL..........................hhhhlllll
DSSP hhhhhhhhHHLHHHHHhhhhhhhhhhll
Query efikqkikGIERXKKIsekilealndld 151
ident
Sbjct ivekidfdSVSSIXAS............ 213
DSSP llllllhhHHHHHHLL............
No 188: 1R71A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;
DSSP llhhhhHHHHhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeAKKLiielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || | |
Sbjct ......EADQ..vienlqrneltPREIADFIGRELAKG...KKKGDIAKEIGKSPAFITQ 49
DSSP ......LLHH..hhhhhhlllllHHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHH.hlleeeelllllllleeeellhhhhhHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhhhhll
Query SLKKLEE.lgfvrkvwikgerknyyeavdgfssiKDIAKRKHDLIaKTYEdlkkleekcn 119
ident | | |
Sbjct HVTLLDLpekiadafntgrvrdvtvvnelvtafkKRPEEVEAWLD.DDTQ.......... 98
DSSP HHHHHLLlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhHLHHHHHHHHH.LLLL..........
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhHHHHHhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkiseKILEAlndld 151
ident |
Sbjct ...........eitrgtvkllrEFLDE..... 114
DSSP ...........lllhhhhhhhhHHHHL.....
No 189: 1P4WA MOLECULE: RCSB;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | | | | | |
Sbjct .ytpesvakllekisaggygDKRLSPKESEVLRLFAEG...FLVTEIAKKLNRSIKTISS 56
DSSP .llllhhhhhhhhhhlllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL...LLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLleeeelllllllleeEELL.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query SLKKLEELGfvrkvwikgerknyyEAVD.GFSSikdiakrkhdliaktyedlkkleekcn 119
ident | |
Sbjct QKKSAMMKL........gvdndiaLLNYlSSVS........................... 81
DSSP HHHHHHHHH........llllhhhHHHHhHHHL...........................
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..........................mtpvdk 87
DSSP ..........................llllll
No 190: 1ZH5A MOLECULE: LUPUS LA PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHH...............hlLLLLLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILY...............lsDKPLTIS 45
ident |
Sbjct ..............gdnekxaaleAKICHQIEYYFGdfnlprdkflkeqikldEGWVPLE 46
DSSP ..............lhhhhhhhhhHHHHHHHHHHLLlllhhhlhhhhhhhlllLLLEEHH
DSSP HHHHH.....hLLLHHHHHHHHHHHhHHLLEEEELLlllllLEEEEL.LHHHhhhhhhhh
Query DIXEE.....lKISKGNVSXSLKKLeELGFVRKVWIkgerkNYYEAV.DGFSsikdiakr 99
ident | |
Sbjct IXIKFnrlnrlTTDFNVIVEALSKS.KAELXEISED....kTKIRRSpSKPL........ 93
DSSP HHLLLhhhhhhLLLHHHHHHHHHLL.LLLLEEELLL....lLEEEELlLLLL........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHHHHHLL........
Query khdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiSEKILEALNDLD........ 151
ident
Sbjct .....................................pevTDEYKNDVKNRSvyikgfpt 116
DSSP .....................................lllLHHHHHHHHLLEeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct datlddikewledkgqvlniqxrrtlhkafkgsifvvfdsiesakkfvetpgqkyketdl 176
DSSP lllhhhhhhhhllllleeeeeeeellllleeeeeeeeellhhhhhhhhllllleelleel
DSSP .........
Query ......... 151
ident
Sbjct lilfkddyf 185
DSSP eeeehhhll
No 191: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLL.HHHHHHHHHHHHLLL.....lLLHHHHHHHHLLL
Query xiixeeakkliielfselakIHGLN.KSVGAVYAILYLSDK.....pLTISDIXEELKIS 54
ident | || | |
Sbjct ....................XRADAlKRREHIITTTCNLYRthhhdsLTXENIAEQAGVG 40
DSSP ....................LLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhllhhhLLHHHHHHHHLLL
DSSP HHHHHHHHHhhhhhLLEEeelllllllleeeELLH.HHHHH...hhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeAVDG.FSSIK...diakrkhdliaktyed 110
ident |
Sbjct VATLYRNFP..drfTLDX............aCAQYlFNVVIslqlqaistfptdpegvwt 86
DSSP HHHHHHHLL..lhhHHHH............hHHHHhHHHHHhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
DSSP hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL...................
Query lkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD................... 151
ident
Sbjct sfnqllfdrglgslvpalapeslddlpdevsalrrtTEKNTttlinlakqhglvhhdiap 146
DSSP hhhhhhhhllhhhhhhhhllllhhhllhhhhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhlllllllllh
DSSP ..........................................
Query .......................................... 151
ident
Sbjct gtyivglitisrppitalatisenshkallglylsglkhgxx 188
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 192: 2BKNA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEekcne 120
ident | | |
Sbjct ..........................pKSVKEIFIEMKDTVELMVDLAYASLLFG..... 29
DSSP ..........................lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....
DSSP llhhhhhHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefikQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD............................. 151
ident | |
Sbjct ......dKEIAEEVLELEERIDLLNYQLMMHsvlaarnvkeaeqvitilqianaiedisn 83
DSSP ......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct aagdlakmvlegvelhpviketilegeeiigkiqvypesvivgktlgeldlatntgvwii 143
DSSP hhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhlllleeeeeelllllllllllhhhhlhhhhhlleee
DSSP ...............................................
Query ............................................... 151
ident
Sbjct avrrgkrwifgpnenfkiragdvligrgtrtsidhlkeiargairvi 190
DSSP eeeelleeeelllllllllllleeeeeelhhhhhhhhhhhhllllll
No 193: 1J1JA MOLECULE: TRANSLIN;
DSSP .....................llhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLllhhhhhhhhhhhhll
Query .....................xiixeeakkliielfSELAKIHGlnksvgavyailylsd 39
ident | |
Sbjct msvseifvelqgflaaeqdireeirkvvqsleqtarEILTLLQG................ 44
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHH................
DSSP llllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhHHLLEE...........................
Query kpltisdixeelkiskgnvsxslkkleELGFVR........................... 72
ident ||
Sbjct ........................vhqGAGFQDipkrclkarehfgtvkthltslktkfp 80
DSSP ........................hhlLLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 72
ident
Sbjct aeqyyrfhehwrfvlqrlvflaafvvyletetlvtreavteilgiepdrekgfhldvedy 140
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlllllllllllllhhhh
DSSP ...eelllllllleeeellHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLlllHHHHHHH
Query ...kvwikgerknyyeavdGFSSiKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKleEKCNeeeKEFIKQK 129
ident |
Sbjct lsgvlilaselsrlsvnsvTAGD.YSRPLHISTFINELDSGFRL..LNLK...NDSLRKR 194
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL...LHHHHHH
DSSP HHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query IKGIERXKKISEKILEALNDLD. 151
ident | | | |
Sbjct YDGLKYDVKKVEEVVYDLSIRGf 217
DSSP HLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLl
No 194: 1IXCA MOLECULE: LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHllllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLsdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | |
Sbjct .......................XEFRQLKYFIAVAE...aGNXAAAAKRLHVSQPPITR 34
DSSP .......................LLHHHHHHHHHHHH...hLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHH...HLLEEeelllllllleEEELL.HHHH.....................hhh
Query SLKKLEE...LGFVRkvwikgerknyYEAVD.GFSS.....................ikd 95
ident || | |
Sbjct QXQALEAdlgVVLLE...........IELTAaGHAFledarrilelagrsgdrsraaarg 83
DSSP HHHHHHHhhlLLLLL...........LLLLHhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP hhhhhhhhhHHHHH.HHHHHHHHL.LLLLhhhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHHH.....
Query iakrkhdliAKTYE.DLKKLEEKC.NEEEkefikqkikgierXKKISEKILEALN..... 148
ident | | | |
Sbjct dvgelsvayFGTPIyRSLPLLLRAfLTST....ptatvslthXTKDEQVEGLLAGtihvg 139
DSSP lleeeeeeeLLHHHhLHHHHHHHHhHHHL....lleeeeeeeLLHHHHHHHHHHLlllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct fsrffprhpgieivniaqedlylavhrsqsgkfgktckladlraveltlfprggrpsfad 199
DSSP eelllllllleeeeeeeeeeeeeeeehhhhhhllleelhhhhllleeeellllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct eviglfkhagiepriarvvedataalaltxagaassivpasvaairwpdiafarivgtrv 259
DSSP hhhhhhhhllllleeeeelllhhhhhhhhhllllleeeehhhhlllllleeeeeelllll
DSSP ...........................hll
Query ...........................dld 151
ident
Sbjct kvpiscifrkekqppilarfvehvrrsakd 289
DSSP eeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhll
No 195: 1HBXG MOLECULE: SERUM RESPONSE FACTOR;
DSSP llhhhhhhHHHHhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHH................llLLLL.
Query xiixeeakKLIIelfselakihglnksvgAVYAILYL................sdKPLT. 43
ident | |
Sbjct ........DSAI.................TLWQFLLQllqkpqnkhmicwtsndgQFKLl 35
DSSP ........LLLL.................LHHHHLLLllllhhhllleeelllllLEEEl
DSSP .hhhHHHHHL.......LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllLLEEEELLHHHHhhh
Query .isdIXEELK.......ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAVDGFSSikd 95
ident | | || | | |
Sbjct qaeeVARLWGirknkpnMNYDKLSRALRYYYVKNIIKKVNG...qKFVYKFVSYPEI... 89
DSSP lhhhHHHHHHhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLL...lLLEEEELLLLHH...
DSSP hhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHH..LLLLlhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query iakrkhdliaktyEDLKkLEEK..CNEEekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..........lnmSRND.YIHSglYSSF........................tlnsln 112
DSSP ..........hllLHHH.HHHLllEEEE........................elhhhl
No 196: 1B9MA MOLECULE: PROTEIN (MODE);
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL......LLHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLL
Query xiixeeakkliielfselaKIHG......LNKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKIS 54
ident || || ||
Sbjct ............hxqaeilLTLKlqqklfADPRRISLLKHIALS...GSISQGAKDAGIS 45
DSSP ............lllleeeEEEEelleeeELHHHHHHHHHHHHH...LLHHHHHHHHLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHH...HLLEEEELllllllLEEEELLH..................hhhh
Query KGNVSXSLKKLEE...LGFVRKVWikgerkNYYEAVDG..................fssi 93
ident |
Sbjct YKSAWDAINEXNQlseHILVERAT......GGAVLTRYgqrliqlydllaqiqqkafdvl 99
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhlLLLEEELL......LLEEELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHH..................................hhhhhhHLL
Query kdiakrkhdLIAKTYED..................................lkkleeKCN 119
ident
Sbjct sdddalplnSLLAAISRfslqtsarnqwfgtitardhddvqqhvdvlladgktrlkvAIT 159
DSSP hhlllllllLHHHHHHHhleeellleeeeeeelllllllllleeeeeellllleeeeELL
DSSP LLLHHHHH....................................................
Query EEEKEFIK.................................................... 127
ident
Sbjct AQSGARLGldegkevlillkapwvgitqdeavaqnadnqlpgiishiergaeqcevlxal 219
DSSP HHHHHHLLllllleeeeeelhhhleeellhhhhhllleeeeeeeeeeeellleeeeeeel
DSSP ..................................hHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ..................................qKIKGierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct pdgqtlcatvpvneatslqqgqnvtayfnadsviiATLC................... 258
DSSP lllleeeeeeehhhhllllllleeeeeelhhhleeEEEL...................
No 197: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHH.LLLL....LLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKISK 55
ident | | | |
Sbjct .....................skSEQTRALILETAXRlFQERgydrTTXRAIAQEAGVSV 39
DSSP .....................lhHHHHHHHHHHHHHHhHHHLlhhhLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHhhhhhLLEEeelllllllleeeeLLHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeaVDGFSSIKdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident || |
Sbjct GNAYYYFA..gkeHLIQ............gfYDRIAAEH..................... 64
DSSP HHHHHHLL..lllHHHH............hhHHHHHHHH.....................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH.............hHHLL...........
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekILEA.............lNDLD........... 151
ident
Sbjct .........................raAVREvlaretdlearlagVLKVwldiatpyhef 99
DSSP .........................hhHLLLhhhllllhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct avqffknaadpdsplspfspeseharveaigihravlagaktkvpeelrdilpelxwlsq 159
DSSP hhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct xglvlywifdrtegrersyrlaergarltargvvlarfrvlrplvrevhelftdflpgxt 219
DSSP hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ..
Query .. 151
ident
Sbjct kv 221
DSSP ll
No 198: 1OTVA MOLECULE: COENZYME PQQ SYNTHESIS PROTEIN C;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct .......................................litdtlspqafeealrakgdf 21
DSSP .......................................lllllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhHHHHHLLeeeelllllllleeeELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.l
Query slkKLEELGFvrkvwikgerknyyeAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC.n 119
ident | |
Sbjct yhiHHPYHIA............mhnGDATRKQIQGWVANRFYYQTTIPLKDAAIMANCpd 69
DSSP lhhHLHHHHH............hhhLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLll
DSSP LLLHHHHHHHHHHHL......HHHHHHHHHHHHHH.........................
Query EEEKEFIKQKIKGIE......RXKKISEKILEALN......................... 148
ident | | ||
Sbjct AQTRRKWVQRILDHDgshgedGGIEAWLRLGEAVGlsrddllserhvlpgvrfavdayln 129
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHllllllLHHHHHHHHHHHLLllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct farracwqeaacssltelfapqihqsrldswpqhypwikeegyfyfrsrlsqanrdvehg 189
DSSP hhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct lalakaycdsaekqnrmleilqfkldilwsmldamtmayalqrppyhtvtdkaawhttrl 249
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll
DSSP ..hll
Query ..dld 151
ident
Sbjct vlehh 254
DSSP lllll
No 199: 1SFEA MOLECULE: ADA O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE;
DSSP ..........................................................ll
Query ..........................................................xi 2
ident
Sbjct lavryaladcelgrclvaesergicaillgdddatliselqqmfpaadnapadlmfqqhv 60
DSSP llleeeeeeelleeeeeeelllleeeeeeellhhhhhhhhhhhlllleellllhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHLL..LHHHH
Query ixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKI..SKGNV 58
ident | | |
Sbjct reviaslnqrdtpltlplDIRGTAFQQQVWQALRTIPcgETVSYQQLANAIGKpkAVRAV 120
DSSP hhhhhhhhllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHLLLLllLLEEHHHHHHHLLLllLHHHH
DSSP HHHHHHhHHHL..LEEE.ellllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SXSLKKlEELG..FVRK.vwikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident |
Sbjct ASACAA.NKLAivIPCHrvvrgdGSLS................................. 146
DSSP HHHHHL.LLLLllLLHHheelllLLLL.................................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .................gyrwgvsrkaqllrreaen 165
DSSP .................lllllhhhhhhhhhhhlll
No 200: 1Q16C MOLECULE: RESPIRATORY NITRATE REDUCTASE 1 ALPHA CHAIN;
DSSP ............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhHHHHhhhhhhllllllhhhhh
Query ............xiixeeakkliielfselakihglnksVGAVyailylsdkpltisdix 48
ident
Sbjct xqflnmfffdiypyiagavfligswlrydygqytwraasSQML................. 43
DSSP lhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllllLLLL.................
DSSP hhhlllhhhHHHH...............................................
Query eelkiskgnVSXS............................................... 61
ident
Sbjct ........dRKGMnlasnlfhigilgifvghffgmltphwmeawlpievkqkmamfagga 95
DSSP ........lLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........hhhhhHHLLEEEelllllllleeEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........lkkleELGFVRKvwikgerknyyEAVDGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKK 113
ident |
Sbjct sgvlcliggvlllKRRLFSP........rvrATTTGADILILSLLVIQCALGLLTIPFSA 147
DSSP hhhhhhhhhhhhhHHHHHLH........hhhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLL................lllhhhhHHHHhHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL......
Query LEEKCN................eeekefiKQKIkGIERXKKISEKILEALNDLD...... 151
ident | | | |
Sbjct QHMDGSemmklvgwaqsvvtfhggasqhlDGVA.FIFRLHLVLGMTLFLLFPFSrlihiw 206
DSSP HHLLLHhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhh
DSSP ..................
Query .................. 151
ident
Sbjct svpveyltrkyqlvrarh 224
DSSP hllhhhhhllleeeelll
No 201: 2IPQX MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN STY4665;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHH....................llL
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYL....................sdK 40
ident |
Sbjct .....................lsSTELGDLFWSWLRDglregdipvntadacvhltcgfV 39
DSSP .....................llHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllleeeelleE
DSSP LLLHHHHHHHHL...lLHHHHHHHHHHHhhhLLEE......EELLLL..........LLL
Query PLTISDIXEELK...iSKGNVSXSLKKLeelGFVR......KVWIKG..........ERK 81
ident | | | |
Sbjct FISVPGVFFLFLkshgRKEQVQAAFEKX...RKHRvsdsrrFWQCCLyeepggrgryKKL 96
DSSP EEELLHHHHHHHhhllHHHHHHHHHHLL...LLLLllllllLEEEEEeeellleeeeEEE
DSSP LEEEEL..LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query NYYEAV..DGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkki 139
ident |
Sbjct TGYLIKxsEIYN...............................................g 109
DSSP EEEEEEhhHHLL...............................................l
DSSP hhhhhhhhhhll
Query sekilealndld 151
ident
Sbjct nfpddslflkvi 121
DSSP lllllllleeel
No 202: 2GA1A MOLECULE: PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION DUF433;
DSSP ...................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLH......HHHHHHHHH
Query ...................xiixeeakkliielfselakIHGLNK......SVGAVYAIL 35
ident | | |
Sbjct xnkktqlleviaalpeelvdqalnyvqxlqnpiqitpgvCGGQARirntriPVWTLVAYR 60
DSSP llhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllHHHLLEelllllLHHHHHHHH
DSSP HHLlllLLHHHHHHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHHLleeeelllllllleeeellhhhhhh
Query YLSdkpLTISDIXEELK.ISKGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssik 94
ident | |
Sbjct QQG...APDKELLANYPgLTAEDLSAAWHYYEQNP......................... 92
DSSP HLL...LLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHHHHHLH.........................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query diakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................eqidreiaq 101
DSSP ................................................hhhhhhhll
No 203: 2BYVE MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct wiacldkrplerssedvdiiftrlkgvkafekfhpnllrqiclcgyyenlekgitlfrqg 60
DSSP lhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct digtnwyavlagsldvkvsetsshqdavtictlgigtafgesildntprhativtresse 120
DSSP lllleeeeeeelleeeeelllllhhhleeeeeelllleelhhhhhlllllleeeelllee
DSSP ...............................................llhhhhhHHHHhh
Query ...............................................xiixeeaKKLIie 13
ident
Sbjct llrieqedfkalwekyrqymagllappygvmetgsnnvpsekilragkilriaiLSRA.. 178
DSSP eeeeehhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHL..
DSSP hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhHLLL...........LLLHHHHHHHHL......lLHH
Query lfselakihglnksvgavyailyLSDK...........PLTISDIXEELK......iSKG 56
ident |
Sbjct ......................pHMIRdrkyhlktyrqCCVGTELVDWMIqqtscvhSRT 216
DSSP ......................hHHLEeeeelleeeeeEEEHHHHHHHHHhllllllLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEEL...lllllLLEEEELLHHH......................
Query NVSXSLKKLEELGFVRKVW...ikgerKNYYEAVDGFS...................... 91
ident | | | | | |
Sbjct QAVGMWQVLLEDGVLNHVDqerhfqdkYLFYRFLDDERedaplpteeekkecdeelqdtm 276
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEELLllllllllLLEEEEHHHLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..................................................hhhhhhhhhH
Query ..................................................sikdiakrkH 101
ident
Sbjct lllsqmgpdahmrmilrkppgqrtvddleiiydellhikalshlsttvkrelagvlifeS 336
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhlllhhhllllhhhhhhhlllleeeE
DSSP HHHhhHHHHhhHHHHH...............lLLLLhhHHHHH.................
Query DLIakTYEDlkKLEEK...............cNEEEkeFIKQK................. 129
ident
Sbjct HAK.gGTVL..FNQGEegtswyiilkgsvnvvIYGK..GVVCTlhegddfgklalvndap 391
DSSP ELL.lLLEE..ELLLLllleeeeeeelleeeeELLL..EEEEEelllleelhhhhlllll
DSSP ...hhhHLHH..................................................
Query ...ikgIERX.................................................. 136
ident
Sbjct raasivLREDnchflrvdkedfnrilrdveantvrlkehdqdvlvlekvpaqqkytvmsg 451
DSSP llleeeELLLleeeeeeehhhhhhhhhhhhlleeeeelllleeeeeeelllllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct tpekilehfletirlepslneatdsvlndfvmmhcvfmpntqlcpalvahyhaqpsqgte 511
DSSP lhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhllllllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct qermdyalnnkrrvirlvlqwaamygdllqeddvamafleefyvsvsddarmmaafkeql 571
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct pelekivkkrqpirgsdevlfkvycidhtyttirvpvaasvkevisavadklgsgeglii 631
DSSP lhhhhlllllllllllleeeeellllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhlllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct vkmnsggekvvlksndvsvfttltingrlfasltplpeqegpttgtvgtfelmsskdlay 691
DSSP eeellllleeelllllllllllllllleeellllllhhhhllllllllhhhhllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct qmttydwelfncvheleliyhtfgrhnfkkttanldlflrrfneiqfwvvtevclcsqls 751
DSSP hhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct krvqllkkfikiaahckeyknlnsffaivmglsnvavsrlaltweklpskfkkfyaefes 811
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 136
ident
Sbjct lmdpsrnhrayrltaaklepplipfmpllikdmtfthegnktfidnlvnfekmrmianta 871
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhhh
DSSP ....................................hhhhhhhhhhhhhll
Query ....................................kkisekilealndld 151
ident
Sbjct rtvryyrsqpfnpdaaqanknhqdvrsyvrqlnvidnqrtlsqmshrlepr 922
DSSP hhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlll
No 204: 2BDPA MOLECULE: PROTEIN (DNA POLYMERASE I);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aamaftladrvteemladkaalvvevveenyhdapivgiavvnehgrfflrpetaladpq 60
DSSP llllleelllllhhhhlleeeeeeelllllllllllleeeeeelleeeeelhhhhlllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct fvawlgdetkkksmfdskraavalkwkgielcgvsfdlllaaylldpaqgvddvraaakm 120
DSSP hhhhhhlllleeeellhhhhhhhhhlllllllleeeehhhhhhhhlhhhllllhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kqyeavrpdeavygkgakravpdepvlaehlvrkaaaiwelerpfldelrrneqdrllve 180
DSSP llllllllhhhhhllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct leqplssilaemefagvkvdtkrleqmgkelaeqlgtveqriyelagqefninspkqlgv 240
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhleeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ilfeklqlpvlkktktgystsadvleklapyheivenilhyrqlgklqstyiegllkvvr 300
DSSP hhhllllllllleelleelllhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhll
DSSP ..............................LLHH..........................
Query ..............................XIIX.......................... 4
ident |
Sbjct pdtkkvhtifnqaltqtgrlsstepnlqniPIRLeegrkirqafvpsesdwlifaadysq 360
DSSP lllleelleeellllllllleeelllllllLLLLhhhhhhhhheellllleeeeeeeell
DSSP ..............hhhhhhhhhHHHHHHHHL..........llLHHHHHHHHHHHHLll
Query ..............eeakkliieLFSELAKIH..........glNKSVGAVYAILYLSdk 40
ident
Sbjct ielrvlahiaeddnlmeafrrdlDIHTKTAMDifqvsedevtpnMRRQAKAVNFGIVY.. 418
DSSP hhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllLHHHHHHHHhllllhhhllhhHHHHHHHHHHHHHH..
DSSP LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHL.leEEEL........................
Query PLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELG.fvRKVW........................ 75
ident | || |
Sbjct GISDYGLAQNLNISRKEAAEFIERYFESFpgvKRYMenivqeakqkgyvttllhrrrylp 478
DSSP LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHhhhhhhhhhhleeellllleeelh
DSSP ...lLLLL....lleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhh
Query ...iKGER....knyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikq 128
ident
Sbjct ditsRNFNvrsfaermamntpiqgsaadiikkamidlnarlkeerlqahlllqvhdelil 538
DSSP hhhlLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeellleeee
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhHHHHHHLL...................
Query kikgierxkkisekiLEALNDLD................... 151
ident
Sbjct eapkeemerlcrlvpEVMEQAVTlrvplkvdyhygstwydak 580
DSSP eeehhhhhhhhhhhhHHHHHLLLlllllleeeeeelllllll
No 205: 1V3FA MOLECULE: PLECKSTRIN 2;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHhHHHHHHHHH....HLLL............LLLH
Query xiixeeakkliielfselakIHGLNKsVGAVYAILY....LSDK............PLTI 44
ident |
Sbjct ...................gSSGSSG.LHRIVDKMHdtstGIRPspnmeqgstykkTFLG 40
DSSP ...................lLLLLLH.HHHHHHHHLllllLLLLllllllllllllLEEH
DSSP HHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL...............llllLLEE
Query SDIXEELK.....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI...............kgerKNYY 84
ident | | | | | | | | |
Sbjct SSLVDWLIssnfaASRLEAVTLASMLMEENFLRPVGVrsmgairsgdlaeqflddsTALY 100
DSSP HHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEELLLlllllllllllllllllllLLEE
DSSP EEL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query EAV.DGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiseki 143
ident
Sbjct TFAeSYKK.................................................... 108
DSSP EELlLLLL....................................................
DSSP hhhHHHLL......
Query leaLNDLD...... 151
ident
Sbjct ..kVSSKEsgpssg 120
DSSP ..lLLLLLllllll
No 206: 1L8QA MOLECULE: CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dflnpkytlenfivgegnrlayevvkealenlgslynpifiygsvgtgkthllqaagnea 60
DSSP llllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kkrgyrviyssaddfaqaxvehlkkgtinefrnxyksvdllllddvqflsgkertqieff 120
DSSP hhlllleeeeehhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllleeeeelhhhhlllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hifntlyllekqiilasdrhpqkldgvsdrlvsrfeggilveieldnktrfkiikeklke 180
DSSP hhhhhhhhllleeeeeelllhhhlllllhhhhhhhhlleeeellllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................llhhhhHHHHHHHH..
Query ............................................xiixeeAKKLIIEL.. 14
ident
Sbjct fnlelrkevidyllentknvreiegkikliklkgfeglerkerkerdklxQIVEFVANyy 240
DSSP llllllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHhh
DSSP ......hhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLL.LHHHHHHHHHHHH
Query ......fselaKIHG.LNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELKI.SKGNVSXSLKKLE 66
ident | | | | | |
Sbjct avkvedilsdkRNKRtSEARKIAXYLCRKVC..SASLIEIARAFKRkDHTTVIHAIRSVE 298
DSSP lllhhhhllllLLLLlHHHHHHHHHHHHHHH..LLLHHHHHHHLLLlLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHLleeeelllllllleeeellhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh
Query ELGfvrkvwikgerknyyeavdgFSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefi 126
ident |
Sbjct EEK..................krKFKH................................. 307
DSSP HLL..................llLHHH.................................
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........lvgflekqafdkic 321
DSSP ...........hhhhhhhhhhhhhl
No 207: 2FQ3A MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhHHHH..LLLL.............hhhHHHHHHHHHL.....lL
Query xiixeeakkliielfseLAKI..HGLN.............ksvGAVYAILYLS.....dK 40
ident |
Sbjct ..........skwfnleKIHSieVQSLpefftnripsktpevyMRYRNFMVNSyrlnpnE 50
DSSP ..........lllllllLLLHhhHHHLhhhlllllllllhhhhHHHHHHHHHHhhhlllL
DSSP LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllleeeellhhhhhhhhhhhh
Query PLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerknyyeavdgfssikdiakrk 100
ident | | |
Sbjct YFSVTTARRNVSGDAAALFRLHKFLTKWGLINYQV......................... 85
DSSP LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL.........................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query hdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................... 85
DSSP ...................................................
No 208: 1W9CA MOLECULE: CRM1 PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeellHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdGFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEkcne 120
ident |
Sbjct ..........................viQLGRIYLDMLNVYKCLSENISAAIQANG.... 30
DSSP ..........................llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....
DSSP llhhhhhhHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefikqKIKGIERXKKISEKILEALNDLD............................. 151
ident | | |
Sbjct ....emvtKQPLIRSMRTVKRETLKLISGWVsrsndpqmvaenfvpplldavlidyqrnv 86
DSSP ....lhhhHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct paarepevlstmaiivnklgghitaeipqifdavfectlnminkdfeeypehrtnfflll 146
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct qavnshcfpaflaipptqfklvldsiiwafkhtmrnvadtglqilftllqnvaqeeaaaq 206
DSSP hhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct sfyqtyfcdilqhifsvvtdtshtagltmhasilaymfnlveegkistslnpgnpvnnqi 266
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhh
DSSP .......................................................
Query ....................................................... 151
ident
Sbjct flqeyvanllksafphlqdaqvklfvtglfslnqdipafkehlrdflvqikefag 321
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 209: 1V4RA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLL.....lLLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLSD.....kPLTISDIXEELKISK 55
ident ||
Sbjct .............mpykapegkgyADVATHFRTLIKSGElapgdtLPSVADIRAQFGVAA 47
DSSP .............llllllllllhHHHHHHHHHHLLLLLllllllLLLHHHHHHHLLLLL
DSSP HHHHHHHHHHHhHLLEEEELLLllllleeeeLLHHHhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
Query GNVSXSLKKLEeLGFVRKVWIKgerknyyeaVDGFSsikdiAKRKhdliaktyedlkkle 115
ident || | |
Sbjct KTVSRALAVLK.SEGLVSSRGA..lgtvvekNPIVI.....TGAD............... 84
DSSP LHHHHHLLLLL.LLLLLEEELL..leeelllLLLLL.....LLHH...............
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ....................rlkrmekngmryapge 100
DSSP ....................hhhlllllllllllll
No 210: 1REPC MOLECULE: DNA (5'-
DSSP llhhhHHHHHH.................................................
Query xiixeEAKKLI................................................. 11
ident |
Sbjct sprivQSNDLTeaayslsrdqkrmlylfvdqirkshdgiceihvakyaeifgltsaeask 60
DSSP lleeeELHHHHhllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeehhhhhhhllllhhhhhh
DSSP .....................................................hhhhhhh
Query .....................................................ielfsel 18
ident
Sbjct dirqalksfagkevvfyesfpwfikpahspsrglysvhinpylipffiglqnrftqfrls 120
DSSP hhhhhhhllllleeellleeelllllleeeelleeeeellhhhhhhhllllllleeeehh
DSSP hhHLLLLHHHHHHHHHHHHL.......lLLLLHHHHHHHHLLLHHH......hhHHHHHH
Query akIHGLNKSVGAVYAILYLS.......dKPLTISDIXEELKISKGN......vsXSLKKL 65
ident | | | | | | | |
Sbjct etKEITNPYAMRLYESLCQYrkpdgsgiVSLKIDWIIERYQLPQSYqrmpdfrrRFLQVC 180
DSSP hhLLLLLHHHHHHHHHHHLLllllleeeEEEEHHHHHHHLLLLHHHhlhhhhhhHLHHHH
DSSP HHH.......lLEEEELLLLLLLLEEEELLhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query EEL.......gFVRKVWIKGERKNYYEAVDgfsSIKDiakrkhdliaktyedlkkleekc 118
ident ||
Sbjct VNEinsrtpmrLSYIEKKKGRQTTHIVFSF...RDIT....................... 214
DSSP HHHhhhhlleeEEEEEEELLLLEEEEEEEE...EELL.......................
DSSP llllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query neeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................. 214
DSSP .................................
No 211: 1MJGA MOLECULE: CARBON MONOXIDE DEHYDROGENASE BETA SUBUNIT;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhHLLLHHHhhH
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeeLKISKGNvsX 60
ident
Sbjct ..................................................RFRDLSH..N 8
DSSP ..................................................LLLLLLL..L
DSSP HHHhhhhhlleeeELLLLL.................................llleeeEL
Query SLKkleelgfvrkVWIKGE.................................rknyyeAV 87
ident
Sbjct CRP......seapRVMEPKnrdrtvdpavlemlvkskddkvitafdrfvaqqpqckigYE 62
DSSP LLL......llllLLLLLLlllllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhHL
DSSP LH.............................HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query DG.............................FSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKC 118
ident | |
Sbjct GIccrfcmagpcrikatdgpgsrgicgasawTIVARNVGLMILTGAAAHCEHGNHIAHAL 122
DSSP LLeellllllleellllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP L...................................lLLHHHHHHHHHHHL.........
Query N...................................eEEKEFIKQKIKGIE......... 134
ident |
Sbjct VemaegkapdysvkdeaklkevcrrvgievegksvleLAQEVGEKALEDFRrlkgegeat 182
DSSP HhhhlllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHllllllllh
DSSP ......................HHHHHHHHHHHHHHHLL.....................
Query ......................RXKKISEKILEALNDLD..................... 151
ident
Sbjct wlmttinegrkekfrthnvvpfGIHASISELVNQAHMGMdndpvnlvfsairvaladytg 242
DSSP hhhllllhhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct ehiatdfsdilfgtpqpvvseanmgvldpdqvnfvlhghnpllseiivqaaremegeaka 302
DSSP hhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhllllleeeeeelllhhhhhhhhhhhhllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct agakginlvgicctgnevlmrqgiplvtsfasqelaictgaidamcvdvqcimpsisava 362
DSSP llllleeeeeehhhhhhhhhhhllleeelhhhhhhhhlllllleeeellllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct ecyhtriittadnakipgayhidyqtataiesaktairmaieafkerkesnrpvyipqik 422
DSSP llllleeeelllllllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct nrvvagwslealtkllatqnaqnpirvlnqaildgelagvalicgcnnlkgfqdnshltv 482
DSSP eeeeelllhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct mkellknnvfvvatgcsaqaagklglldpanvetycgdglkgflkrlgeganieiglppv 542
DSSP hhhhhhlleeeeeehhhhhhhhhlllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct fhmgscvdnsravdllmamandlgvdtpkvpfvasapeamsgkaaaigtwwvslgvpthv 602
DSSP eeeellllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct gtmppvegsdliysiltqiasdvyggyfifemdpqvaarkildaleyrtwklgvhkevae 662
DSSP lllllllllhhhhhhhhlhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........
Query .......... 151
ident
Sbjct ryetklcqgy 672
DSSP hlllllllll
No 212: 1MGTA MOLECULE: PROTEIN (O6-METHYLGUANINE-DNA METHYLTRANSFERASE);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlsvekfrvgervvwigvifsgrvqgiafafdrgtlmkrihdlaehlgkrgvsisldvqp 60
DSSP leeeeeeeelleeeeeeeeellleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
DSSP .....llhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHH.HHLL..LLLLHHHHHHHHL
Query .....xiixeeakkliielfselakIHGLNKSVGAVYAIL.YLSD..KPLTISDIXEELK 52
ident | || | | | |
Sbjct sdypekvfkvligeldnasflrelsFEGVTPFEKKVYEWLtKNVKrgSVITYGDLAKALN 120
DSSP llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllLLLLLHHHHHHHHHHhHHLLllLLEEHHHHHHHLL
DSSP LLHHHHHHHHHHHhHHLL..EEEEllllLLLLeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ISKGNVSXSLKKLeELGF..VRKVwikgERKNyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyed 110
ident | | |
Sbjct TSPRAVGGAMKRN.PYPIvvPCHRvvahDGIG............................ 151
DSSP LLHHHHHHHHHLL.LLLLllLHHHeellLLLL............................
DSSP hhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query lkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .......................yyssgieekkflleiegv 169
DSSP .......................lllllhhhhhhhhhhlll
No 213: 1KA8A MOLECULE: PUTATIVE P4-SPECIFIC DNA PRIMASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHhHHHL..lLLLLHH...........HH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKSVGAVYAiLYLS..dKPLTIS...........DI 47
ident |
Sbjct ......................DADPTFDFIGY.LETLpqtSGMYMGnasiiprnyrkYL 37
DSSP ......................LLLHHHHHHHH.EEELlllLLLLLLlllllllllllLH
DSSP HHHHL...........LLHHHHHHHHHHHHHH..LLEEEELLllLLLLEEEellhhhhhh
Query XEELK...........ISKGNVSXSLKKLEEL..GFVRKVWIkgERKNYYEavdgfssik 94
ident | | |
Sbjct YHAYLaymeangyrnvLSLKMFGLGLPVMLKEygLNYEKRHT..KQGIQTN......... 86
DSSP HHHHHhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHllLLLLEEEE..LLEEEEL.........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query diakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...........................................ltlkeesygdwlpk 100
DSSP ...........................................eeellhhhhhllll
No 214: 1K78A MOLECULE: PAIRED BOX PROTEIN PAX5;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhhHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihGLNKsvGAVYAILYlsdKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || | | | ||
Sbjct ..........gvnqlggvfvngRPLP.dVVRQRIVElahQGVRPCDISRQLRVSHGCVSK 49
DSSP ..........llllllllllllLLLL.hHHHHHHHHhhhLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLEeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHHHHL..
Query SLKKLEELGFVrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhDLIAkTYEDLKKLEEKC.. 118
ident | | |
Sbjct ILGRYYETGSI.......................kpgviggSKPKvATPKVVEKIAEYkr 86
DSSP HHHHHHHHLLL.......................lllllllLLLLlLLHHHHHHHHHHhh
DSSP .....lLLLH.HHHH........HHHHhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query .....nEEEK.EFIK........QKIKgierxkkisekilealndld 151
ident |
Sbjct qnptmfAWEIrDRLLaervcdndTVPS.........vssinriirtk 124
DSSP hlllllHHHHhHHHHhlllllllLLLL.........hhhhhhhhhll
No 215: 1HKQA MOLECULE: REPLICATION PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLL...........LLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSD...........KPLTISDIXE 49
ident | |
Sbjct ..........qsnklieSSHT..LTLNEKRLVLCAASLIdsrkplpkdgyLTIRADTFAE 48
DSSP ..........llhhhhhHHHL..LLHHHHHHHHHHHHLLlllllllhhheEEEEHHHHHH
DSSP HHLLLHHHH.HHHHHHHHHHL...................leEEELllllLLLEEEELlH
Query ELKISKGNV.SXSLKKLEELG...................fvRKVWikgeRKNYYEAVdG 89
ident | | | |
Sbjct VFGIDVKHAyAALDDAATKLFnrdirryvkgkvvermrwvfhVKYR...eGQGCVELG.F 104
DSSP HLLLLHHHHhHHHHHHHHHHHllleeeeelleeeeeelleeeEEEE...lLLLEEEEE.E
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query FSSIkdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealnd 149
ident |
Sbjct SPTI.........................................iphltmlhkeftsyq 123
DSSP LLLL.........................................lllhhhhhhhhhhll
DSSP ll
Query ld 151
ident
Sbjct lk 125
DSSP ll
No 216: 1D8YA MOLECULE: DNA POLYMERASE I;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct misydnyvtildeetlkawiaklekapvfafatatdsldnisanlvglsfaiepgvaayi 60
DSSP llllllleelllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllllleeeeeeeeelleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pvahdyldapdqisreralellkplledekalkvgqnlkydrgilanygielrgiafdtm 120
DSSP elllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeellhhhhhhhhhlllllllleeeehh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lesyilnsvagrhdmdslaerwlkhktitfeeiagkgknqltfnqialeeagryaaedad 180
DSSP hhhhhhllllllllhhhhhhhhhllllllhhhhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vtlqlhlkmwpdlqkhkgplnvfeniemplvpvlsrierngvkidpkvlhnhseeltlrl 240
DSSP hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aelekkaheiageefnlsstkqlqtilfekqgikplkktpstseevleelaldyplpkvi 300
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhllllhhhhhh
DSSP ....................................................LLHH....
Query ....................................................XIIX.... 4
ident
Sbjct leyrglaklkstytdklplminpktgrvhtsyhqavtatgrlsstdpnlqniPVRNeegr 360
DSSP hhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllllleeellllllllleeelllhhhlLLLLhhhh
DSSP ....................................hhhhhhhhHHHHHHHH......hl
Query ....................................eeakkliiELFSELAK......ih 22
ident |
Sbjct rirqafiapedyvivsadysqielrimahlsrdkglltafaegkDIHRATAAevfglple 420
DSSP hhhlllllllleeeeeeeellhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllLHHHHHHHhhllllhh
DSSP lllhhhHHHHHHHHH.lLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH.LLEE........
Query glnksvGAVYAILYL.sDKPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEEL.GFVR........ 72
ident | | | |
Sbjct tvtseqRRSAKAINFglIYGMSAFGLARQLNIPRKEAQKYMDLYFERyPGVLeymertra 480
DSSP hllhhhHHHHHHHHHhhHLLLLHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHlHHHHhhhhhhhh
DSSP .......................eelLLLLLlleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .......................kvwIKGERknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktye 109
ident
Sbjct qakeqgyvetldgrrlylpdikssngARRAA...aeraainapmqgtaadiikramiavd 537
DSSP hhhhhleeellllleeelhhhhllllHHHHH...hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhHHLL...........lllHHHHHHHhhhhlhhhhhhhhhHHHH...........
Query dlkkleEKCN...........eeeKEFIKQKikgierxkkisekiLEAL........... 147
ident
Sbjct awlqaeQPRVrmimqvhdelvfevHKDDVDA.vakqihqlmenctRLDVpllvevgsgen 596
DSSP hhhhhhLLLEeeeeeelleeeeeeELLLHHH.hhhhhhhhhhhllLLLLllleeeeeell
DSSP .hhll
Query .ndld 151
ident
Sbjct wdqah 601
DSSP hhhhl
No 217: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhHHHHhllLLHHHHHHHHHHHH.LLLL....LLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfsELAKihgLNKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKISK 55
ident | | | | | | | |
Sbjct ..............glRERK...KTRTREAIRAATYGlIRQQgyeaTTVEQIAERAEVSP 43
DSSP ..............llLHHH...HHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHH...HHHHHLleeeelllllllleeeellhhhHHHHHHHH.............
Query GNVSXSLK...KLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfsSIKDIAKR............. 99
ident |
Sbjct STVLRYFPtreDIVLTD......................EYDPVXAAelaarpagepwsd 81
DSSP HHHHHHLLlhhHHHLLL......................LLHHHHHHhhhlllllllhhh
DSSP ...............................................hHHHHHHHHHHhh
Query ...............................................kHDLIAKTYEDlk 112
ident
Sbjct slrhvlrkalglgageeaelirlrtrllaevpavrarxlenxsdtgrxLARAIADRTG.. 139
DSSP hhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhllllllhHHHHHHHHHL..
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhHHHHHHHHHHHHHLL.....................
Query kleekcneeekefikqkikgierxKKISEKILEALNDLD..................... 151
ident | |
Sbjct ................ldpdglevRIVSXSLVGGLXEVSrywaehdheeslaelvdrald 183
DSSP ................lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
DSSP ........
Query ........ 151
ident
Sbjct alenglpa 191
DSSP hhhhllll
No 218: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;
DSSP llhhhhhhhhhhhHHHHHHhhlllLHHHHHHHHHHHHLLLL...LLHHHHHHHHLLLHHH
Query xiixeeakkliieLFSELAkihglNKSVGAVYAILYLSDKP...LTISDIXEELKISKGN 57
ident | | | |
Sbjct ...xatgglaiiqSXXHXL.....PPSERKLADYILAHPHXaieSTVNEISALANSSDAA 52
DSSP ...llllhhhhhhHHHHHL.....LHHHHHHHHHHHHLHHHhhlLLHHHHHHHLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHH..hllEEEElllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VSXSLKKLEE..lgfVRKVwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkle 115
ident | |
Sbjct VIRLCXSLGLkgfqdLXXR......................................... 71
DSSP HHHHHHHLLLllhhhHHHH.........................................
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ........................vagdlakptfqg 83
DSSP ........................hhhhhhlhhhll
No 219: 1WRJA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE
DSSP ...............................................llhhhhhhhhhhh
Query ...............................................xiixeeakkliie 13
ident
Sbjct mivyglykspfgpitvaknekgfvmldfcdcaerssldndyftdffykldlyfegkkvdl 60
DSSP lleeeeeeelleeeeeeelllleeeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP hhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHhHHLL.
Query lfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLSD..KPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLeELGF. 70
ident | | | | | | | | |
Sbjct tepvDFKP..FNEFRIRVFKEVMRIKwgEVRTYKQVADAVKTSPRAVGTALSKN.NVLLi 117
DSSP llllLLLL..LLHHHHHHHHHHLLLLllLLEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHLL.LLLLl
DSSP .EEEElllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query .VRKVwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqk 129
ident
Sbjct iPCHR.................................................vigeks 128
DSSP lLHHH.................................................eellll
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct lggysrgvelkrkllelegidv 150
DSSP lllllllhhhhhhhhhhlllll
No 220: 1TROA MOLECULE: PROTEIN (TRP REPRESSOR);
DSSP ......................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHhhl
Query ......................xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILyls 38
ident |
Sbjct spysaamaeerhqewlrfvdllknayqndlhlpllnlmltpderealGTRVRIVEEL..l 58
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllhhhhhhhHHHHHHHHHH..h
DSSP llLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHlleeeelllllllleeeelLHHHhhhhhhh
Query dkPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEELgfvrkvwikgerknyyeavDGFSsikdiak 98
ident || |
Sbjct rgEMSQRELKNELGAGIATITRGSNSLKAA............pvelrqwLEEV....... 99
DSSP hlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHLL............lhhhhhhHHHH.......
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query rkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................................llksd 104
DSSP ................................................lllll
No 221: 1PP8F MOLECULE: 39 KDA INITIATOR BINDING PROTEIN;
DSSP .........llhHHHHHHHHHHHhhHHHHHllllhhhhhHHHHHHHLL............
Query .........xiiXEEAKKLIIELfsELAKIhglnksvgaVYAILYLSD............ 39
ident |
Sbjct dsndleasftsrLPPEIVAALKR..KSSRD.....pnsrFPRKLHMLLtylasnpqleee 53
DSSP lllhhhhhhhhlLLHHHHHHHHL..LLLLL.....llllHHHHHHHHHhhhlllhhhhhh
DSSP ..........lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHhhllEEEELLllLLLLEE.eeLL
Query ..........kPLTISDIXEELKISKGNVSXSLKKLEelgfVRKVWIkgERKNYY.eaVD 88
ident | | |
Sbjct iglswisdtefKMKKKNVALVMGIKLNTLNVNLRDLA....FEQLQHdkGGWTQWkrsGF 109
DSSP hleeellllleEELHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLL....LEELLLllLLLEEEellLL
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query GFSSikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealn 148
ident |
Sbjct TRNS........................................................ 113
DSSP LLLL........................................................
DSSP hll
Query dld 151
ident
Sbjct ... 113
DSSP ...
No 222: 1O4XA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR OCT-1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct eepsdleeleqfaktfkqrriklgftqgdvglamgklygndfsqttisrfealnlsfknm 60
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllhhhh
DSSP ....llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhHHHHHHHHHL..llllLHHHHHHHHLLL
Query ....xiixeeakkliiELFSelakihglnksvGAVYAILYLS..dkplTISDIXEELKIS 54
ident | | | | |
Sbjct aklkpllekwlndasiETNI...........rVALEKSFLENqkptseEITMIADQLNME 109
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllLHHH...........hHHHHHHHHHLllllhhHHHHHHHHHLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KGNVSXSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkl 114
ident |
Sbjct KEVIRVWFCNRRQKE............................................. 124
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH.............................................
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................kri 127
DSSP ..................................lll
No 223: 1JKUA MOLECULE: PSEUDOCATALASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeelLHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhh
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavDGFSSIKD...IAKRKHDLIAKTYEDLKkleek 117
ident
Sbjct .....mfkhtrklqynakpdrsdpimaRRLQESLGgqwGETTGMMSYLSQGWAST..... 50
DSSP .....leeellllllllllllllhhhhHHHHHHHHlllLHHHHHHHHHHHHHHLL.....
DSSP lllllhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL..........................
Query cneeekefIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD.......................... 151
ident |
Sbjct .......gAEKYKDLLLDTGTEEMAHVEMISTMIgylledapfgpedlkrdpslattmag 103
DSSP .......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhlllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct mdpehslvhglnaslnnpngaawnagyvtssgnlvadmrfnvvresearlqvsrlysmte 163
DSSP llhhhhhlllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct degvrdmlkfllaretqhqlqfmkaqeeleekygiivpgdmkeiehsefshvlmnfsdgd 223
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhlleeellllll
DSSP ...........................................
Query ........................................... 151
ident
Sbjct gskafegqvakdgekftyqenpeamggiphikpgdprlhnhqg 266
DSSP hhhhhllllllllllleeellllllllllllllllhhhlllll
No 224: 1BGWA MOLECULE: TOPOISOMERASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rksritnypkledankagtkegykctlvltegdsalslavaglavvgrdyygcyplrgkm 60
DSSP lllllllllllllllllllllhhhleeeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lnvreasadqilknaeiqaikkimglqhrkkyedtkslryghlmimtdqdhdgshikgli 120
DSSP llllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllleeeeellllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct inflessflglldiqgfllefitpiikvsitkptkntiafynmpdyekwreeeshkftwk 180
DSSP hhhhhhhlhhhhllllleeellllleeeeeellleeeeeellhhhhhhhhhhlhhhllee
DSSP ..........................llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL..LLHHHHHHH
Query ..........................xiixeeakkliielfselaKIHG..LNKSVGAVY 32
ident |
Sbjct qkyykglgtslaqevreyfsnldrhlkifhslqglfsladnirsiPNVLdgFKPGQRKVL 240
DSSP eeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlLLLLllLLHHHHHHH
DSSP HHHH..HLLLLLLHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHH.......HLLEEEEL..
Query AILY..LSDKPLTISDIXEELK......ISKGNVSXSLKKLEE.......LGFVRKVW.. 75
ident | |
Sbjct YGCFkkNLKSELKVAQLAPYVSectayhHGEQSLAQTIIGLAQnfvgsnnIYLLLPNGaf 300
DSSP HHHHhlLLLLLEEHHHHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLLLLLll
DSSP .........lllllLLEEEEL.LHHHHH................................
Query .........ikgerKNYYEAV.DGFSSI................................ 93
ident | |
Sbjct gtratggkdaaaarYIYTELNkLTRKIFhpaddplykyiqedektvepewylpilpmilv 360
DSSP llhhhlllllllllLLEELLLlLHHHHLlhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhh
DSSP .............hhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhHH
Query .............kdiaKRKHdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkIS 140
ident
Sbjct ngaegigtgwstyippfNPLE...................................iiKN 385
DSSP hleeeelllleeeelllLHHH...................................hhHH
DSSP HH..........................................................
Query EK.......................................................... 142
ident
Sbjct IRhlmndeeleqmhpwfrgwtgtieeieplryrmygrieqigdnvleitelpartwtsti 445
DSSP HHhhhhlllllllllllllllleeeelllleeeeeleeeeeelleeeeeellllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 142
ident
Sbjct keylllglsgndkikpwikdmeeqhddnikfiitlspeemaktrkigfyerfklispisl 505
DSSP hhhhhhhhllllllllllleeeellllllleeeellhhhhhhhhhhlhhhhllleeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 142
ident
Sbjct mnmvafdphgkikkynsvneilsefyyvrleyyqkrkdhmserlqwevekysfqvkfikm 565
DSSP lleeeellllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 142
ident
Sbjct iiekeltvtnkprnaiiqelenlgfprfnkegkpyygspndeieelygtyeyllgmriws 625
DSSP hhllllllllllhhhhhhhhhhlllleellllleelllllllllllllllhhhhlllhhh
DSSP ...........................hhhhHHHLL..................
Query ...........................ileaLNDLD.................. 151
ident |
Sbjct ltkeryqkllkqkqeketelenllklsakdiWNTDLkafevgyqeflqrdaear 679
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 225: 2DT5A MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHHHHHHHHHHLLL.......llLHHHHHHHHLL
Query xiixeeakkliielfselakiHGLNKSVGAVYAILYLSDK.......plTISDIXEELKI 53
ident |
Sbjct .....................KVPEAAISRLITYLRILEEleaqgvhrtSSEQLGGLAQV 39
DSSP .....................LLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllleeLHHHHHHHHLL
DSSP LHHHHHHHHHHHHhhlleeeelllllLLLE....EEEL.....LHHHhhhhhhhhhhhhh
Query SKGNVSXSLKKLEelgfvrkvwikgeRKNY....YEAV.....DGFSsikdiakrkhdli 104
ident | | |
Sbjct TAFQVRKDLSYFG........sygtrGVGYtvpvLKRElrhilGLNR..........kwg 81
DSSP LHHHHHHHHHHLL........lllllLLLEehhhHHHHhhhhhLLLL..........lee
DSSP hhHHHH.....................hhHHHHHL.......................ll
Query akTYED.....................lkKLEEKC.......................ne 120
ident
Sbjct lcIVGMgrlgsaladypgfgesfelrgffDVDPEKvgrpvrggviehvdllpqrvpgrie 141
DSSP eeEELLlhhhhhhhhllllllleeeeeeeELLLLLllleelleeeeehhhhhhhllllll
DSSP llhhhhHHHHHHHLH................hhhhHHHHH....................
Query eekefiKQKIKGIER................xkkiSEKIL.................... 144
ident |
Sbjct ialltvPREAAQKAAdllvaagikgilnfapvvleVPKEVavenvdflagltrlsfailn 201
DSSP eeeellLHHHHHHHHhhhhhhllleeeelllllllLLLLLeeeelllhhhhhhhhhhhhl
DSSP ..hhhhhll
Query ..ealndld 151
ident
Sbjct pkwreemmg 210
DSSP llllhhhhl
No 226: 2CW7A MOLECULE: ENDONUCLEASE PI-PKOII;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct silpeewlpvleegevhfvrigelidrmmeenagkvkregetevlevsglevpsfnrrtn 60
DSSP lllllleeeeeelleeeeeehhhhhhhhhhllhhhleellleeeeellleeeeeelllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kaelkrvkalirhdysgkvytirlksgrrikitsghslfsvrngelvevtgdelkpgdlv 120
DSSP leeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellleeeeelllleeeeellllllllee
DSSP ...................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHHlll
Query ...................xiixeeakkliielfselakiHGLN.KSVGAVYAILYLsdk 40
ident |
Sbjct avprrlelpernhvlnlvelllgtpeeetldivmtipvkgKKNFfKGMLRTLRWIFG... 177
DSSP eeelllllllllleeehhhhhhlllhhhhlleeeeeelllLLLHhHHHHHHHHHHLL...
DSSP lllhhhhhhHHLLlhhHHHHHHHHHHHHLLEEEELllllllLEEEELLHHH.........
Query pltisdixeELKIskgNVSXSLKKLEELGFVRKVWikgerkNYYEAVDGFS......... 91
ident | || || || || | |
Sbjct .......eeKRPR...TARRYLRHLEDLGYVRLKK......IGYEVLDWDSlknyrrlye 221
DSSP .......llLLLL...LHHHHHHHHHHLLLEEELL......LLEEELLHHHhhhhhhhhh
DSSP .........................hhHHHH............hhhhHHHHH........
Query .........................siKDIA............krkhDLIAK........ 106
ident
Sbjct alvenvryngnkreylvefnsirdavgIMPLkelkewkigtlngfrmRKLIEvdeslakl 281
DSSP hhhhhleeelllleeeeehhhhlllhhHLLHhhhllleeeelllleeELEEEllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 106
ident
Sbjct lgyyvsegyarkqrnpkngwsysvklynedpevlddmerlasrffgkvrrgrnyveipkk 341
DSSP hhhhhhheeeeeellllllleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhllleelllleeellh
DSSP ...................hhhhhhHHHHHLLllLHHH......................
Query ...................tyedlkKLEEKCNeeEKEF...................... 125
ident |
Sbjct igyllfenmcgvlaenkripefvftSPKGVRL.aFLEGyfigdgdvhpnkrlrlstksel 400
DSSP hhhhhhhhhhlllhhhllllhhhhhLLHHHHH.hHHHHhhhhllllllllleeeeellhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 125
ident
Sbjct lanqlvlllnsvgvsavklghdsgvyrvyineelpfvkldkkknayyshvipkevlsevf 460
DSSP hhhhhhhhhhhllllleeeellllleeeeellllllllllllllllhhhlllhhhhhhhh
DSSP ...................................................hhhhhhhhl
Query ...................................................ikqkikgie 134
ident
Sbjct gkvfqknvspqtfrkmvedgrldpekaqrlswliegdvvldrvesvdvedydgyvydlsv 520
DSSP lllllllllhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlleeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhll
Query rxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ednenflvgfglvyahn 537
DSSP lllleeeelllleeeel
No 227: 2CU7A MOLECULE: KIAA1915 PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK.ISKGNVS 59
ident | | |
Sbjct ...........gssgssgysvkwTIEEKELFEQGLAKF..GRRWTKISKLIGsRTVLQVK 47
DSSP ...........llllllllllllLHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHLlLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLleeeelllllllleeeellhhhhhhHHHHhhHHHHhhhHHHHhhhhhhll
Query XSLKKLEELGfvrkvwikgerknyyeavdgfssikDIAKrkHDLIaktYEDLkkleekcn 119
ident |
Sbjct SYARQYFKNK......................vkcGLDK..ETPN...QKTG........ 72
DSSP HHHHHHHHHH......................lllLLLL..LLLL...LLLL........
DSSP lllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ................................ 72
DSSP ................................
No 228: 1K6YA MOLECULE: POL POLYPROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnKSVGAVYAILYLSdkpLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident
Sbjct .......................flDGIDKAQEEHEKY..hSNWRAMASDFNLPPVVAKE 35
DSSP .......................llLHHHHHHHHHHHH..lLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
DSSP hhhhhhhhllEEEEllllllLLEEeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLL
Query slkkleelgfVRKVwikgerKNYYeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekCNE 120
ident |
Sbjct .....ivascDKCQ.....lKCSP...giwqldcthlegkvilvavhvasgyieaevIPA 82
DSSP .....hhhhlLLLL.....lLLLL...leeeeeeeeelleeeeeeeelllleeeeeeELL
DSSP LLhHHHH...........................HHHHHHL...................
Query EEkEFIK...........................QKIKGIE................... 134
ident | |
Sbjct ETgQETAyfllklagrwpvktvhtdngsnftsttVKAACDWagikqedgviesmnkelkk 142
DSSP LLhHHHHhhhhhhhhhlllleeelllllllllhhHHHHHHHhlleelllhhhhhhhhhhh
DSSP .................................hhhhhhhhhhhhhhhll
Query .................................rxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct iigqvrdqaehlktavqmavfihnkkrkggiggysagerivdiiatdiqt 192
DSSP hhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhl
No 229: 2PFTA MOLECULE: EXOCYTOSIS PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeelllllllleeeellhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlll
Query slkkleelgfvrkvwikgerknyyeavdgfSSIKdIAKRKHDLIAKTYEDLkkleekcne 120
ident |
Sbjct ..............................DHVI.SYYHVASDTEKIIREG......... 20
DSSP ..............................LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHL.........
DSSP llhhhhhHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................
Query eekefikQKIKGIERXKKISEKILEALNDLD............................. 151
ident
Sbjct ......pTGRLEEYLGSMAKIQKAVEYFQDNspdspelnkvkllfergkeslesefrslm 74
DSSP ......lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct trhskvvspvllldlisaddelehlpesvlrdvvrisrwlveygrnqdfmnvyyqirssq 134
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct ldrsikglkehfrksldvetdayihcvsafvklaqseyrllmeiipehhqkktfdsliqd 194
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct aldglmlegenivsaarkaiirhdfstvltvfpilrhlkqtkpefdqvlqgtaastknkl 254
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhlhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct pglitsmetigakaledfadnikndpdkeynmpkdgtvheltsnailflqqlldfqetag 314
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct amlasqessefskrllstyickvlgnlqlnllskskvyedpalsaiflhnnynyilksle 374
DSSP hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct kseliqlvavtqktaersyrehieqqiqtyqrswlkvtdyiaeknlpvfqpgvklrdker 434
DSSP lllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlllllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct qmikerfkgfndgleelckiqkvwaipdteqrdkirqaqkdivketygaflhrygsvpft 494
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP .........................
Query ......................... 151
ident
Sbjct knpekyikyrveqvgdmidrlfdts 519
DSSP llhhhhllllhhhhhhhhhllllll
No 230: 2NTZA MOLECULE: PARB;
DSSP llhhhhhhhhhhHHHHhhhhhllllHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query xiixeeakkliiELFSelakihglnKSVGAVYAILYLSDKPLTISDIXEELKISKGNVSX 60
ident | || | |
Sbjct ..........qtALQH.........SIREIGLRLXRXKNDGXSQKDIAAKEGLSQAKVTR 41
DSSP ..........llLLLL.........LHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHL...leeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhh
Query SLKKLEELG...fvrkvwikgerknyyeavdgfssikdiakrkhDLIAKTYEDlkkleek 117
ident |
Sbjct ALQAASAPEelvalfpvqseltfsdyktlcavgdexgnlefdqlIQNISPEIN......d 95
DSSP HHHHHLLLHhhhhllllhhhllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHHHH......l
DSSP lllllhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHhHHHHH.............................
Query cneeekefikqkikgierxkkISEKiLEALN............................. 148
ident |
Sbjct ilsieexaedevknkilrlitKEAS.LLTDKksvvtelwkfedkdrfarkrvkgrafsye 154
DSSP llllllllllllhhhhhhhhlHHHH.HHHLLllleeellllllllleeeeelllllleee
DSSP ..........................hll
Query ..........................dld 151
ident
Sbjct fnrlskelqeeldrxighilrksldkkpk 183
DSSP eelllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 231: 2CWLA MOLECULE: MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhh
Query xiixeeakkliielfselakihglnksvgavyailylsdkpltisdixeelkiskgnvsx 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeeellllllllEEEEL..LHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
Query slkkleelgfvrkvwikgerknYYEAV..DGFSSIKD...IAKRKHDLIAKTYEDLKkle 115
ident
Sbjct ......mflridrlqielpmpkEQDPNaaAAVQALLGgrfGEMSTLMNYMYQSFNFR... 51
DSSP ......leeellllllllllllLLLHHhhHHHHHHLLlllLHHHHHHHHHHHHHHLL...
DSSP hhlllllhHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHL.........................
Query ekcneeekEFIKQKIKGIERXKKISEKILEALNDL......................... 150
ident | | |
Sbjct ......gkKALKPYYDLIANIATEELGHIELVAATinsllaknpgkdleegvdpesaplg 105
DSSP ......llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllllllllllllhhhlllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct fakdvrnaahfiagganslvmgamgehwngeyvftsgnlildllhnfflevaarthklrv 165
DSSP hhhlllllhhhhlllllllllllllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct yemtdnpvaremigyllvrggvhaaaygkalesltgvemtkmlpipkidnskipeakkym 225
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllllhhhlhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct dlgfhrnlyrfspedyrdlgliwkgaspedgtevvvvdgpptggpvfdaghdaaefapef 285
DSSP hllllleeeellllllllhhhllllllllllllleeeellllllllllllllhhhlllll
DSSP .............l
Query .............d 151
ident
Sbjct hpgelyeiakklye 299
DSSP llhhhhhhhhhhll
No 232: 2CSOA MOLECULE: PLECKSTRIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLH...hhhhhHHHHH....HLLL............L
Query xiixeeakkliielfselakihGLNK...svgavYAILY....LSDK............P 41
ident |
Sbjct .............gssgssgrsIRLPetidlgalYLSMKdtekGIKElnlekdkkifnhC 47
DSSP .............lllllllllLLLLllllhhhhHHHHHllllLLLLeeeeelleeeeeE
DSSP LLHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL..............llllLL
Query LTISDIXEELK.....ISKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWI..............kgerKN 82
ident | | | |
Sbjct FTGNCVIDWLVsnqsvRNRQEGLMIASSLLNEGYLQPAGDmsksavdgtaenpfldnpDA 107
DSSP EEHHHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEELHhhhhhhhlllllllllllLL
DSSP EEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query YYEAVDgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisek 142
ident | |
Sbjct FYYFPD.................................................sgffc 118
DSSP EEELLL.................................................lllle
DSSP hhhhhhhll
Query ilealndld 151
ident
Sbjct eensgpssg 127
DSSP eelllllll
No 233: 1D3UB MOLECULE: TATA-BINDING PROTEIN;
DSSP ......................llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL....hHHHHHHHH
Query ......................xiixEEAKKLIIELFSELAKIHGLN....kSVGAVYAI 34
ident | ||
Sbjct mvsdaaernlafalseldritaqlklPRHVEEEAARLYREAVRKGLIrgrsiESVMAACV 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllllhHHHHHHHH
DSSP HHHL...LLLLLHHHHHHhhLLLHhHHHHHHHHHHH........................
Query LYLS...DKPLTISDIXEelKISKgNVSXSLKKLEE........................ 67
ident | | |
Sbjct YAACrllKVPRTLDEIAD..IARV.DKKEIGRSYRFiarnlnltpkklfvkptdyvnkfa 117
DSSP HHHHhhhLLLLLHHHHHH..HLLL.LHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhh
DSSP ........................hlleeeELLL....................LLLLLe
Query ........................lgfvrkVWIK....................GERKNy 83
ident
Sbjct delglsekvrrraieildeaykrgltsgksPAGLvaaalyiasllegekrtqreVAEVA. 176
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllHHHHhhhhhhhhhhhllllllhhhHHHHH.
DSSP eeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query yeavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkiseki 143
ident
Sbjct ...........................................rvtevtvrnrykelvek 193
DSSP ...........................................lllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhll
Query lealndld 151
ident
Sbjct lkikvpia 201
DSSP llllllll
No 234: 1AB4A MOLECULE: GYRASE A;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL....LLHHHHHHHHHHHHLL.....LLLLHHHHHHHH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG....LNKSVGAVYAILYLSD.....KPLTISDIXEEL 51
ident | |
Sbjct ................vgrALPDvrdgLKPVHRRVLYAMNVLGndwnkAYKKSARVVGDV 44
DSSP ................lllLLLLllllLLHHHHHHHHHHHHLLlllllLLEEHHHHHHHH
DSSP L.....LLHHHHHHHHHHHHH.....hLLEEEEL.........lllllLLEEEEL.LHHH
Query K.....ISKGNVSXSLKKLEE.....lGFVRKVW.........ikgerKNYYEAV.DGFS 91
ident | |
Sbjct IgkyhpHGDSAVYDTIVRMAQpfslryMLVDGQGnfgsidgdsaaamrYTEIRLAkIAHE 104
DSSP HhhlllLLHHHHHHHHHHLLLllllllLLEEEELllllllllllllllLLEEEELlLHHH
DSSP ..........................hHHHH....................hHHHHHHHh
Query ..........................sIKDI....................aKRKHDLIa 105
ident |
Sbjct lmadleketvdfvdnydgtekipdvmpTKIPnllvngssgiavgmatnipphNLTEVIN. 163
DSSP hlllllllllleeelllllleeellllLLLLhhhhhleeelllllleeelllLHHHHHH.
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHLHHHHH..........................
Query ktyedlkkleekcneeekefikQKIKGIERXKKI.......................... 139
ident
Sbjct .............gclayiddeDISIEGLMEHIPgpdfptaaiingrrgieeayrtgrgk 210
DSSP .............hhhhhhhllLLLHHHHLLLLLlllllllleelllhhhhhhhhhleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct vyiraraevevetiivheipyqvnkarliekiaelvkekrvegisalrdesdkdgmrivi 270
DSSP eeeeleeeeelleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelllllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct egevvlnnlysqtqlqvsfginmvalhhgqpkimnlkdiiaafvrhrrevvtrrtifelr 330
DSSP llhhhhhhhhhhllleeeeeeeleeeelleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct kardrahilealavalanidpiielirhaptpaeaktalvanpwqlgnvaamledaarpe 390
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlleellhhhllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 139
ident
Sbjct wlepefgvrdglyylteqqaqaildlrlqkltgleheklldeykelldqiaellrilgsa 450
DSSP lllllleellleeellhhhhhhhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
DSSP ..hhhhhHHHHHL.............l
Query ..sekilEALNDL.............d 151
ident |
Sbjct drlmeviREELELvreqfgdkrrteit 477
DSSP hhhhhhhHHHHHHhhhhhlllllleel
No 235: 2V1DA MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC DEMETHYLASE 1;
DSSP llhhhhhhhHHHH......hhhHHHHHLLL..............lhhHHHHHHHHHH..L
Query xiixeeakkLIIE......lfsELAKIHGL..............nksVGAVYAILYL..S 38
ident |
Sbjct ........pSGVEgaafqsrlpHDRMTSQEaacfpdiisgpqqtqkvFLFIRNRTLQlwL 52
DSSP ........lLLHHhhhhhllllLLLLLHHHhhhlhhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHhhH
DSSP LLL...LLHHHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEE..eELLL............
Query DKP...LTISDIXEEL....KISKGNVSXSLKKLEELGFVR..kVWIK............ 77
ident | | || | | || |
Sbjct DNPkiqLTFEATLQQLeapyNSDTVLVHRVHSYLERHGLINfgiYKRIkplptkktgkvi 112
DSSP HLLlllLLHHHHHHHLlllhHHLHHHHHHHHHHHHHLLLLLlllLLLLllllllllleee
DSSP ............................................llllleeeellhHHHH
Query ............................................gerknyyeavdgFSSI 93
ident
Sbjct iigsgvsglaaarqlqsfgmdvtlleardrvggrvatfrkgnyvadlgamvvtglgGNPM 172
DSSP eelllhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllllllleeeelleeeelllleellllLLHH
DSSP .......................................................hhhhh
Query .......................................................kdiak 98
ident
Sbjct avvskqvnmelakikqkcplyeangqavpkekdemveqefnrlleatsylshqldfnvln 232
DSSP hhhhhhlllleeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleel
DSSP hhhhhhHHHHHHHHHHHHHLL.......................................
Query rkhdliAKTYEDLKKLEEKCN....................................... 119
ident | | ||
Sbjct nkpvslGQALEVVIQLQEKHVkdeqiehwkkivktqeelkellnkmvnlkekikelhqqy 292
DSSP leellhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......................................................LLLHHH
Query ......................................................EEEKEF 125
ident
Sbjct keasevkpprditaeflvkskhrdltalckeydelaetqgkleeklqeleanppSDVYLS 352
DSSP hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLLLL
DSSP ..hHHHHHHHLH............hhhhhHHHHHHHH.......................
Query ..iKQKIKGIER............xkkisEKILEALN....................... 148
ident |
Sbjct srdRQILDWHFAnlefanatplstlslkhWDQDDDFEftgshltvrngyscvpvalaegl 412
DSSP hhhHHHHHHHHHhhhhhllllllllllllLLLLHHHLllllleeelllllhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct diklntavrqvrytasgceviavntrstsqtfiykcdavlctlplgvlkqqppavqfvpp 472
DSSP leelleeeeeeeeelleeeeeeeelllllleeeeeeleeeelllhhhhhlllllleeell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct lpewktsavqrmgfgnlnkvvlcfdrvfwdpsvnlfghvgsttasrgelflfwnlykapi 532
DSSP llhhhhhhhhhleellleeeeeellllllllllleeellllllllllllleeeellllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct llalvageaagimenisddvivgrclailkgifgssavpqpketvvsrwradpwargsys 592
DSSP eeeeelhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeellllllllllllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 148
ident
Sbjct yvaagssgndydlmaqpitpgpsipgapqpiprlffagehtirnypatvhgallsglrea 652
DSSP ellllllhhhhhhhhlllllllllllllllllleeellhhhlllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........hll
Query ...........dld 151
ident
Sbjct griadqflgamytl 666
DSSP hhhhhhhlllhhhl
No 236: 2NRAC MOLECULE: PI PROTEIN;
DSSP llhHHHHHHHhhhhhhhHHHHllLLHHHHHHHHHHHHL...........lLLLLHHHHHH
Query xiiXEEAKKLiielfseLAKIhgLNKSVGAVYAILYLS...........dKPLTISDIXE 49
ident | | | |
Sbjct ..vNKKTKIRhrnelnhTLAQ..LPLPAKRVMYMALALidskeplergrvFKIRAEDLAA 56
DSSP ..lLLLLEEEeehhhhhHHHH..LLHHHHHHHHHHHHLllllllllllllEEEEHHHHHH
DSSP HHLLLHHHHHHHH.HHHHHHL.............................leEEELllll
Query ELKISKGNVSXSL.KKLEELG.............................fvRKVWikge 79
ident || | ||
Sbjct LAKITPSLAYRQLkEGGKLLGaskislrgddiialakelnseeldlniiewiAYSP.... 112
DSSP HHLLLHHHHHHHHhHHHHHHHhllllllllhhhhhhhhlllllllllleeeeEEEL....
DSSP LLLEEEElLHHH...............................hhhhhhhhhhhhhhhhh
Query RKNYYEAvDGFS...............................sikdiakrkhdliakty 108
ident |
Sbjct DEGYLSL.KFTRtiepyissligkknkfttqlltaslrlssqyssslyqlirkhysnfkk 171
DSSP LLLEEEE.EELLllhhhlllllllhhheeeeehhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlllllll
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhHHHHlhhhHHHHH..........................
Query edlkkleekcneeekefikqkIKGIerxkKISEK.......................... 142
ident |
Sbjct knyfiisvdelkeeliaytfdKDGN...iEYKYPdfpifkrdvlnkaiaeikkkteisfv 228
DSSP leeeeeehhhhhhhhlleellLLLL...lEELLLlhhhhhhhlhhhhhhhhhhhlleeee
DSSP ...............hhhhhhhll
Query ...............ilealndld 151
ident
Sbjct gftvhekegrkisklkfefvvded 252
DSSP eeeeeellllllleeeeeeeelll
No 237: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLL.....LLLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDK.....PLTISDIXEELKISK 55
ident || | | |
Sbjct ....................ggrTARIREAVLLAAGDALAadgfdALDLGEIARRAGVGK 40
DSSP ....................lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhHLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHH.hhhhHLLEeeelllllllleeeeLLHH........................
Query GNVSXSLK.kleeLGFVrkvwikgerknyyeaVDGF........................ 90
ident | |
Sbjct TTVYRRWGtpgglAADL..............lADXAeqslpradtgaleedlranarlvv 86
DSSP HHHHHHHLlhhhhHHHH..............hHHHHhhlllllllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................HHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhh
Query ..........................SSIKDIAKrkhdliaktyedlkkleekcneeeke 124
ident
Sbjct rtlddprqgrlfraliaaslcneqaaEALHRFYA.......................... 120
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHH..........................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH......................................
Query fikqkikgierxkkisekILEA...................................... 146
ident |
Sbjct ................vrVDEWagcvrdavargevpdgtdphgvvaavsaplyyallntg 164
DSSP ................hhHHHHhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ......................hhhll
Query ......................lndld 151
ident
Sbjct rslteadadraaraastaaragvwvtg 191
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 238: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHHLLLHHHH.
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS.dKPLTISDIXEELKISKGNV. 58
ident |||
Sbjct ........grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERgyDGTSXEHLSKAAGISKSSIy 52
DSSP ........llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHl
DSSP ..hhhHHHHHHHLLeeeelllllllleeeellhhhHHHHHHHHhHHHHHhhhhhhhhhhh
Query ..sxsLKKLEELGFvrkvwikgerknyyeavdgfsSIKDIAKRkHDLIAktyedlkklee 116
ident | |
Sbjct hhvtgKEELLRRAV....................sRALDELFG.ILDEE........... 80
DSSP lllllHHHHHHHHH....................hHHHHHHHH.HLLLH...........
DSSP hlllllhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHH................................
Query kcneeekefikqkikgierxkKISEKIL................................ 144
ident
Sbjct ..........harvgtaaerlEYVVRRXvevlxaelpyvtlllrvrgtgterwalerrre 130
DSSP ..........hhhlllhhhhhHHHHHHHhhhhhhlhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...............................hhhHHLL......................
Query ...............................ealNDLD...................... 151
ident
Sbjct fdhrvaallkdaaaegdvradvevrlatrlvfgxINSIvewyrpesgvsgagerevvdav 190
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhHHLHhhhlllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ..........
Query .......... 151
ident
Sbjct arlvfgglrk 200
DSSP hhhhhhllll
No 239: 2DAOA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR ETV6;
DSSP lLHHHHhhHHHHhhhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHHL.................lLLLL
Query xIIXEEakKLIIelfselakihglnksvgAVYAILYLS.................dKPLT 43
ident |
Sbjct .GSSGS..SGCR.................LLWDYVYQLlsdsryenfirwedkeskIFRI 40
DSSP .LLLLL..LLLL.................LHHHHHHHHhhlhhhllleeeeehhhlEEEE
DSSP ..hhhhHHHHL.......lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllLLEEEEL.LHHHHH
Query ..isdiXEELK.......iSKGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerKNYYEAV.DGFSSI 93
ident | | | ||
Sbjct vdpnglARLWGnhknrtnmTYEKMSRALRHYYKLNIIRKEPG...qRLLFRFMkTPDEIM 97
DSSP llhhhhHHHHHhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHLLEELLLL...lLLEEEELlLLHHHL
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct .....................................sgrtdrlehlesqelsgpssg 118
DSSP .....................................llllllhhhhhllllllllll
No 240: 2B9RA MOLECULE: HUMAN CYCLIN B1;
DSSP ..............................llhhhhHHHH..............hhhhhH
Query ..............................xiixeeAKKL..............iielfS 16
ident
Sbjct vkdiyaylrqleaaqavrpkyllgrevtgnmrailiDWLVqvqmkfrllqetmymtvsiI 60
DSSP lllllllhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhHHHHhhhhhllllhhhhhhhhhhH
DSSP HHHHHLL.....lLHHHHHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHH..LLLHHHHHHHHHHHH
Query ELAKIHG.....lNKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEEL..KISKGNVSXSLKKLE 66
ident || | | | | |
Sbjct DRFMQNNsvpkkmLQLVGVTAMFIASKyeeMYPPEIGDFAFVTdnTYTKHQIRQMEMKIL 120
DSSP HHHHLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLleeeelllllllleeeeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh
Query ELGfvrkvwikgerknyyeaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefi 126
ident
Sbjct RAL..............nfgLGRPL.............plhflrraskigevdveqhtla 153
DSSP HHL..............lllLLLLL.............hhhhhhhhhhlllllhhhhhhh
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhHHHHHHHLL...................................
Query kqkikgierxkkisekILEALNDLD................................... 151
ident
Sbjct kylmeltmldydmvhfPPSQIAAGAfslalkildngewtptlqhylsyteesllpvmqhl 213
DSSP hhhhhhhhhlhhhlllLLLHHHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhllllllllllhhhhh
DSSP .........................................
Query ......................................... 151
ident
Sbjct aknvvmvnqgltkhmtvknkyatskhakistlpqlnsalvq 254
DSSP hhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhllhhhlllllhhhll
No 241: 1VINA MOLECULE: CYCLIN A;
DSSP ................................llhhhhHHHH..............hhhh
Query ................................xiixeeAKKL..............iiel 14
ident
Sbjct dihtylremevkckpkvgymkkqpditnsmrailvdwlVEVGeeyklqnetlhlavnyid 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhlllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhHHHHhhllllhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhHLLL..LHHHHHHHHHHHHL...LLLLLHHHHHHHHL..LLHHHHHHHHHHHHH
Query fselakIHGL..NKSVGAVYAILYLS...DKPLTISDIXEELK..ISKGNVSXSLKKLEE 67
ident || | | | |
Sbjct rflssmSVLRgkLQLVGTAAMLLASKfeeIYPPEVAEFVYITDdtYTKKQVLRMEHLVLK 120
DSSP hhhlllLLLHhhHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLleeeelllllllleeeeLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh
Query LGfvrkvwikgerknyyeaVDGFSsikdiakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefik 127
ident
Sbjct VL..............afdLAAPT...............inqfltqyflhqqpanckves 151
DSSP HL..............lllLLLLL...............hhhhhhhhhhhlllllhhhhh
DSSP hhhhhhlhhhhhHHHHHHHH.HHLL...................................
Query qkikgierxkkiSEKILEAL.NDLD................................... 151
ident | |
Sbjct lamflgelslidADPYLKYLpSVIAaaafhlalytvtgqswpeslvqktgytletlkpcl 211
DSSP hhhhhhhhhhhlHHHHLLLLhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllhhhh
DSSP .........................................
Query ......................................... 151
ident
Sbjct ldlhqtylrapqhaqqsirekyknskyhgvsllnppetlnl 252
DSSP hhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhllhhhlllllllll
No 242: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLHHHHHHHHHHHH.LLLL...LLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselaKIHG.LNKSVGAVYAILYL.SDKP...LTISDIXEELKISK 55
ident | | ||
Sbjct ...............mnipTTTTkGEQAKSQLIAAALAqFGEYglhATTRDIAALAGQNI 45
DSSP ...............llllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhLLHHHHHHHHLLLH
DSSP HHHHHHHHhhhhhLLEEeelllllllleeeELLH.HHHH.................hhhh
Query GNVSXSLKkleelGFVRkvwikgerknyyeAVDG.FSSI.................kdia 97
ident
Sbjct AAITYYFG..skeDLYL............aCAQWiADFLgekfrphaekaerlfsqpapd 91
DSSP HHHHHHHL..lhhHHHH............hHHHHhHHHHhhhlhhhhhhhhhhhllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHLL......
Query krkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekileaLNDLD...... 151
ident |
Sbjct rdairelillacknmimlltqedtvnlskfisreqlsptsayqlvheqvIDPLHthltrl 151
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlHHHHHhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct vaaytgcdandtrmilhthallgevlafrlgketillrtgwpqfdeekaeliyqtvtchi 211
DSSP hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........
Query ......... 151
ident
Sbjct dlilhgltq 220
DSSP hhhhhhhhl
No 243: 1OMIA MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
DSSP lhhhhhhhhlllllleellllleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
DSSP ..........................................................LL
Query ..........................................................XI 2
ident
Sbjct gafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqtlqkQV 120
DSSP lleeeellllllllllllleeeellllleeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllhHHHHHHHHHHHLLL................llLHHH
Query IXEEAKKLIIELFSelakihglnkSVGAVYAILYLSDK................plTISD 46
ident || | |
Sbjct SYSLAKFNDFSING..........KLGSICGQLLILTYvygketpdgikitldnltMQEL 170
DSSP HHHHHHHHHHHHHH..........HHHHHHHHHHHHHHhheeeelleeeellllllHHHL
DSSP hhhhhlllhHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLllllllEEEELLHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ixeelkiskGNVSXSLKKLEELGFVRKVWIkgerknYYEAVDGFssikdiakrkhdliak 106
ident || ||
Sbjct .........SAVSRIISKLKQEKVIVYKNS......CFYVQNLD................ 199
DSSP .........LHHHHHHHHHHHLLLEEELLL......LEEELLHH................
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query tyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ....................ylkryapkldewfylacpatwgkln 224
DSSP ....................hhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
No 244: 1N52A MOLECULE: 80 KDA NUCLEAR CAP BINDING PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct etedhleslickvgeksacslesnleglagvleadlpnykskilrllctvarllpeklti 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yttlvgllnarnynfggefveamirqlkeslkannyneavylvrflsdlvnchviaapsm 120
DSSP hhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vamfenfvsvtqeedvpqvrrdwyvyaflsslpwvgkelyekkdaemdrifantesylkr 180
DSSP hhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rqkthvpmlqvwtadkphpqeeyldclwaqiqklkkdrwqerhilrpylafdsilcealq 240
DSSP lllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhllhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hnlppftppphtedsvypmprvifrmfdytddpegpvmpgshsverfvieenlhciiksh 300
DSSP llllllllllllllllllllllllllllhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct wkerktcaaqlvsypgknkiplnyhivevifaelfqlpapphidvmyttllielcklqpg 360
DSSP lllhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct slpqvlaqatemlymrldtmnttcvdrfinwfshhlsnfqfrwswedwsdclsqdpespk 420
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhlllllhh
DSSP ........................................................LLHH
Query ........................................................XIIX 4
ident
Sbjct pkfvrevlekcmrlsyhqrildivpptfsalcpanptciykygdessnslpghsvaLCLA 480
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhhHHHH
DSSP ........................hhhHHHH...................hhhhhhhhhh
Query ........................eeaKKLI...................ielfselaki 21
ident
Sbjct vafkskatndeifsilkdvpnfnplkiEVFVqtllhlaaksfshsfsalakfhevfktla 540
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhllllllhhhhHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
DSSP lllLHHHHHHHHHHHH.LLLL.lLHHHHhHHHL....LLHHHHHHhHHHHhhhLLEE..E
Query hglNKSVGAVYAILYL.SDKP.lTISDIxEELK....ISKGNVSXsLKKLeelGFVR..K 73
ident | |
Sbjct esdEGKLHVLRVMFEVwRNHPqmIAVLV.DKMIrtqiVDCAAVAN.WIFS...SELSrdF 595
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHhLLLHhhHHHHH.HHHHhlllLLHHHHHH.HHLL...HHHLllL
DSSP ELL..............................................lllllleeeel
Query VWI..............................................kgerknyyeav 87
ident
Sbjct TRLfvweilhstirkmnkhvlkiqkeleeakekvleeqierlqekvesaqseqknlflvi 655
DSSP LLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP lhhhhhhhHHHHHHHHHHHH.............hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhl
Query dgfssikdIAKRKHDLIAKT.............yedlkkleekcneeekefikqkikgie 134
ident |
Sbjct fqrfimilTEHLVRCETDGTsvltpwykncierlqqiflqhhqiiqqymvtlenllftae 715
DSSP hhhhhhhhHHHHHHHHHHLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhll
Query rxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ldphilavfqqfcalqa 732
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhl
No 245: 1MSZA MOLECULE: DNA-BINDING PROTEIN SMUBP-2;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHL....LLLLLHHhhhhhhlllHH
Query xiixeeakkliielfselakihglnkSVGAVYAILYLS....DKPLTISdixeelkisKG 56
ident | | |
Sbjct ..........................GVDHFRAMIVEFmaskKMQLEFP......pslNS 28
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHhhhlLLEEEEL......lllLL
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEE..lllllLLLEEEellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NVSXSLKKLEELGFVRKV..wikgeRKNYYEavdgfssikdiakrkhdliaktyedlkkl 114
ident | | |
Sbjct HDRLRVHQIAEEHGLRHDssgegkrRFITVS............................. 59
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEEEeelllllLEEEEE.............................
DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhll
Query eekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ..................................kra 62
DSSP ..................................ell
No 246: 1EYSM MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;
DSSP ..........LLHHhhhhHHHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHhllllllhhhhhhh
Query ..........XIIXeeakKLIIelfselakihglnksvgavyAILYlsdkpltisdixee 50
ident
Sbjct peyqniftavQVRA....PAYP....................GVPL.............. 22
DSSP llllllllllLEEL....LLLL....................LLLL..............
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllllleEEEL......................l
Query lkiskgnvsxslkkleelgfvrkvwikgerknyYEAV......................d 88
ident
Sbjct ................................pKGNLprigrpifsywlgkigdaqigpi 50
DSSP ................................lLLLLlllllllllllhhhhllllllll
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.................lllhhhhHHHH.
Query GFSSIKDIAKRKHDLIAKTYEDLKKLEEKCN.................eeekefiKQKI. 130
ident
Sbjct YLGLTGTLSIFFGLVAISIIGFNMLASVHWDvfqflkhffwlgleppppqyglriPPLSe 110
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLhhhhhhhhhhlllllllhhhllllLLHHh
DSSP HHHLHHHHHHHHHHHHHHHL........................................
Query KGIERXKKISEKILEALNDL........................................ 150
ident | |
Sbjct GGWWLIAGLFLTLSILLWWVrtykraealgmsqhlswafaaaiffylvlgfirpvmmgsw 170
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct akavpfgifphldwtaafsirygnlyynpfhmlsiaflygsallfamhgatilsvsrfgg 230
DSSP hhlllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct dreidqithrgtaaegaalfwrwtmgfnatmesihrwawwcavltvitagigillsgtvv 290
DSSP llhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP ...........................l
Query ...........................d 151
ident
Sbjct dnwylwavkhgmapaypevvtavnpyet 318
DSSP llhhhhhhhlllllllllllllllllll
No 247: 1DE4C MOLECULE: HEMOCHROMATOSIS PROTEIN;
DSSP llhhhhhhhhhhHHHHH...........................................
Query xiixeeakkliiELFSE........................................... 17
ident
Sbjct ............LYWDDlkrklsekldstdftstikllnensyvpreagsqkdenlalyv 48
DSSP ............LLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 17
ident
Sbjct enqfrefklskvwrdqhfvkiqvkdsaqnsviivdkngrlvylvenpggyvayskaatvt 108
DSSP hhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllleeeeeelllleellllllllleelllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 17
ident
Sbjct gklvhanfgtkkdfedlytpvngsivivragkitfaekvanaeslnaigvliymdqtkfp 168
DSSP eleeelllllhhhhhllllllllleeeeelllllhhhhhhhhhhllllleeeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 17
ident
Sbjct ivnaelsffghahlgtgdpytpgfpsfnhtqfppsrssglpnipvqtisraaaeklfgnm 228
DSSP llllllllleellllllllllllllllhhhlllllllllllllleeellhhhhhhhhlll
DSSP ............................hhhhllllhhhhhhhhhhhHLLLlllhhhhhh
Query ............................lakihglnksvgavyailyLSDKpltisdixe 49
ident
Sbjct egdcpsdwktdstcrmvtsesknvkltvsnvlkeikilnifgvikgfVEPD......... 279
DSSP lllllhhhllllllllllllleeeeeeelleeeeeeeeeeeeeelllLEEE.........
DSSP hhlllhhhhhhhhhhhhhhllEEEELL............llLLLL...............
Query elkiskgnvsxslkkleelgfVRKVWI............kgERKN............... 82
ident |
Sbjct ...................hyVVVGAQrdawgpgaaksgvgTALLlklaqmfsdmvlkdg 320
DSSP ...................eeEEEEEElllllllllllhhhHHHHhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct fqpsrsiifaswsagdfgsvgatewlegylsslhlkaftyinldkavlgtsnfkvsaspl 380
DSSP lllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhhlhhhhllleeeeeellllllllleeeeeelhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct lytliektmqnvkhpvtgqflyqdsnwaskvekltldnaafpflaysgipavsfcfcedt 440
DSSP hhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhlllllllllhhhhhhllllleeeeeeelll
DSSP ......................................eeeellHHHHhhHHHHhHHHHH
Query ......................................yyeavdGFSSikDIAKrKHDLI 104
ident |
Sbjct dypylgttmdtykelieripelnkvaraaaevagqfviklthdvELNL..DYER.YNSQL 497
DSSP lllllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL..LHHH.HHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLlllHHHHHhhHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL.............
Query AKTYEDLKKLEEKCNeeeKEFIKqkIKGIERXKKISEKILEALNDLD............. 151
ident || |
Sbjct LSFVRDLNQYRADIK...EMGLS..LQWLYSARGDFFRATSRLTTDFgnaektdrfvmkk 552
DSSP HHHHHHHHLLHHHHH...HLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 151
ident
Sbjct lndrvmrveyhflspyvspkespfrhvfwgsgshtlpallenlklrkqnngafnetlfrn 612
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhh
DSSP .......................
Query ....................... 151
ident
Sbjct qlalatwtiqgaanalsgdvwdi 635
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhl
No 248: 1CF7B MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHLLLL...LLHHHHHHHHL.....
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYLSDKP...LTISDIXEELK..... 52
ident | | |
Sbjct ....................gkgLRHFSMKVCEKVQRKGTTsynEVADELVSEFTnsnnh 40
DSSP ....................llhHHHHHHHHHHHHHHHLEElhhHHHHHHHHHHHlllll
DSSP ......lLHHHHHHHHHHHHHHL....leEEELLlllllleeeeLLHHhhhhhhhhhhhh
Query ......iSKGNVSXSLKKLEELG....fvRKVWIkgerknyyeaVDGFssikdiakrkhd 102
ident | |
Sbjct laadsayDQKNIRRRVYDALNVLmamniiSKEKK......eikwIGLP............ 82
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Query liaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
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Sbjct ................................................. 82
DSSP .................................................
No 249: 2H9UA MOLECULE: DNA/RNA-BINDING PROTEIN ALBA 2;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHL....LLLLLHHhhhhhhllLHH
Query xiixeeakkliielfselakihglNKSVGAVYAILYLS....DKPLTISdixeelkiSKG 56
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Sbjct ............acegapevrigrKPVMNYVLAILTTLmeqgTNQVVVK....argrNIN 44
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Query NVSXSLKKLEELG..fVRKVW....................ikgerkNYYEavdgfssik 94
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Sbjct RAVDAVEIVRKRFaknIEIKDikidsqeievqtpegqtrtrrvssieICLE......... 95
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Query diakrkhdliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxkkisekilealndld 151
ident
Sbjct ...................................................kagesa 101
DSSP ...................................................elllll
No 250: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHH.LLLL....LLHHHHHHHHLLLH
Query xiixeeakkliielfselakihgLNKSVGAVYAILYL.SDKP....LTISDIXEELKISK 55
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Sbjct .....................rtAEQSRSLIVDAAGRaFATRpyreITLKDIAEDAGVSA 39
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Query GNVSXSLKkleelgfvrkvwikgerknyyeAVDGfSSIKDIAKrKHDLiaktyedlkkle 115
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Sbjct PLIIKYFG...............skeqlfdALVD.FRAAAEIV.FSGP............ 70
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Query ekcneeekefikqkikgiERXKKISE.................................k 142
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Sbjct .................lDGLGERXVsxfarplepykplslnilfxsgpseessrklran 113
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Query ileaLNDL.................................................... 150
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Sbjct ysaqXIDAlaerlpgrdarlraelvxsxltglavxrrkxxqehatgtpeevvahyaplvq 173
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DSSP .....l
Query .....d 151
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Sbjct elldgg 179
DSSP hhhhll
No 251: 2FUG2 MOLECULE: NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;
DSSP llhHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL...LLHHH
Query xiiXEEAKKLIielfselakihglNKSVGAVYAILYLSdkPLTISDIXEELK...ISKGN 57
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Sbjct ffdDKQDFLEE..tfakyppegrrAAIMPLLRRVQQEE.gWIRPERIEEIARlvgTTPTE 57
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DSSP HHHHHHHHhhhLLEEEELllllllleeeelLHHH..........................
Query VSXSLKKLeelGFVRKVWikgerknyyeavDGFS.......................... 91
ident | |
Sbjct VMGVASFY...SYYQFVP.........tgkYHLQvcatlscklagaeelwdyltetlgig 105
DSSP HHHHHHHL...LLLLLLL.........lllEEEEeellhhhhlllhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ...........hhHHHHhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlhhHHHH
Query ...........siKDIAkRKHDliaktyedlkkleekcneeekefikqkikgierxKKIS 140
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Sbjct pgevtpdglfsvqKVEC.LGSC.................................hTAPV 131
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DSSP ....................................hhhhhhhhhll
Query ....................................ekilealndld 151
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Sbjct iqvndepyvecvtrarleallaglragkrleeielpgkcghhvheve 178
DSSP eelllllllllllhhhhhhhhhhhhllllhhhlllllllllllllll
No 252: 1MNMC MOLECULE: PROTEIN (MCM1 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR);