DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1PB6B
MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1PB6-A 30.9 0.9 198 198 100 HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC; "
2: 2GEN-A 17.4 2.6 181 188 19 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
3: 2D6Y-A 17.2 2.6 181 186 18 PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN; "
4: 2PZ9-A 17.1 2.2 171 179 24 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN; "
5: 1T33-A 16.0 2.9 186 220 19 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR "
6: 1ZKG-A 14.9 3.0 182 200 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
7: 2FBQ-A 14.5 3.8 183 213 21 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
8: 1VI0-A 14.5 3.1 180 189 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
9: 2IBD-A 14.2 3.7 172 192 16 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
10: 2UXH-A 14.1 3.1 182 206 18 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
11: 2IAI-A 14.1 3.6 173 200 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833; "
12: 2G3B-A 14.1 3.7 179 188 21 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
13: 2NP5-A 13.6 3.3 176 187 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
14: 2DG8-A 13.4 3.7 170 175 18 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY "
15: 1RKT-A 13.4 4.1 178 204 17 PROTEIN YFIR; "
16: 2F07-A 13.2 4.5 173 197 17 YVDT; "
17: 2FX0-A 12.8 3.2 158 179 24 HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN; "
18: 2NX4-A 12.3 4.1 173 194 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN; "
19: 2G7G-A 12.1 3.9 167 197 17 RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
20: 2HYJ-A 12.0 3.4 176 193 16 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
21: 1A6I-A 11.9 3.4 163 193 11 TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D; "
22: 2GUH-A 11.8 3.1 164 179 17 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
23: 1UI5-A 11.8 3.4 168 199 18 A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG; "
24: 2OI8-A 11.3 3.1 165 203 15 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313; "
25: 2OFL-A 11.3 3.7 171 221 19 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
26: 2ID3-A 11.1 4.3 171 191 21 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
27: 2FD5-A 11.1 3.9 161 180 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
28: 2QKO-A 11.0 4.2 163 174 13 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY "
29: 1Z0X-A 11.0 4.4 166 216 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
30: 1V7B-A 10.9 3.9 164 175 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
31: 2Q24-A 10.3 3.8 138 173 20 PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
32: 2GFN-A 10.2 4.3 160 192 19 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED "
33: 2FQ4-A 10.2 5.1 130 184 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
34: 2OF7-A 9.9 4.3 125 191 19 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
35: 2DTZ-A 9.9 4.6 166 186 15 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR; "
36: 1U9N-A 9.7 4.9 108 194 16 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR; "
37: 2O7T-A 9.6 4.0 153 188 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
38: 2HKU-A 9.6 3.7 125 191 19 A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
39: 2G7S-A 8.5 3.7 143 190 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
40: 2IU5-A 8.3 4.0 144 179 12 HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG; "
41: 2HXO-A 8.3 4.2 145 207 11 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
42: 2DG7-A 7.9 4.3 126 187 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
43: 2I10-A 7.6 5.4 135 179 13 PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
44: 2G7L-A 6.4 4.6 134 201 10 TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
45: 2NP3-A 5.6 3.8 118 141 9 PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR; "
46: 1ZK8-A 4.8 4.1 108 177 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
47: 1SGM-A 4.2 5.6 96 184 22 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF; "
48: 1TQI-A 4.1 3.9 83 269 8 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
49: 2HXI-A 3.9 8.6 105 197 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
50: 2AO9-A 3.9 7.2 86 117 7 PHAGE PROTEIN; "
51: 1XJE-A 3.9 4.1 89 627 12 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT; "
52: 2O3F-A 3.7 4.1 59 83 10 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH; "
53: 2OBP-A 3.5 2.7 54 81 11 PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN; "
54: 1L0O-C 3.4 2.5 44 57 11 ANTI-SIGMA F FACTOR; "
55: 2IW5-B 3.3 3.2 48 133 10 LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1; "
56: 2EV0-A 3.3 8.9 71 131 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR; "
57: 1LVA-A 3.3 10.1 81 258 10 SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR; "
58: 2CMP-A 3.2 3.3 48 56 13 TERMINASE SMALL SUBUNIT; "
59: 1SFX-A 3.2 6.6 68 109 15 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008; "
60: 2IA0-A 3.0 4.3 64 156 6 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
61: 2HEO-A 3.0 2.7 43 59 19 Z-DNA BINDING PROTEIN 1; "
62: 2GAU-A 3.0 3.0 51 218 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY; "
63: 2FQ3-A 3.0 2.6 50 85 2 TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3; "
64: 2CUJ-A 3.0 2.8 51 108 18 TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE; "
65: 2CGP-A 3.0 3.3 48 200 17 PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN); "
66: 1T6S-A 3.0 4.7 71 162 6 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
67: 1LDD-A 3.0 2.6 46 74 13 ANAPHASE PROMOTING COMPLEX; "
68: 1I1G-A 3.0 5.1 67 140 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA; "
69: 1CF7-A 3.0 4.3 51 67 8 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
70: 2DBB-A 2.9 8.9 73 146 4 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
71: 2COH-A 2.9 3.0 51 194 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
72: 1R1U-A 2.9 3.5 52 94 8 REPRESSOR PROTEIN; "
73: 1QBJ-A 2.9 2.5 43 65 14 PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE "
74: 2FJI-1 2.8 5.4 91 399 9 EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6; "
75: 2DK5-A 2.8 3.1 52 91 12 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA "
76: 2DIM-A 2.8 4.5 56 70 11 CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN; "
77: 2CFX-A 2.8 5.2 69 140 7 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC; "
78: 1YX3-A 2.8 2.5 53 112 8 HYPOTHETICAL PROTEIN DSRC; "
79: 1YLF-A 2.8 3.5 58 117 9 RRF2 FAMILY PROTEIN; "
80: 1K78-A 2.8 3.0 44 124 5 PAIRED BOX PROTEIN PAX5; "
81: 1AKH-A 2.8 2.7 40 49 10 PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1); "
82: 2NNN-A 2.7 6.4 62 134 10 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
83: 2CG4-A 2.7 6.1 63 150 10 REGULATORY PROTEIN ASNC; "
84: 1WPK-A 2.7 5.3 60 146 15 ADA REGULATORY PROTEIN; "
85: 1UFM-A 2.7 6.6 59 84 8 COP9 COMPLEX SUBUNIT 4; "
86: 1STZ-A 2.7 5.3 84 323 8 HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA "
87: 1JHF-A 2.7 4.0 77 197 18 LEXA REPRESSOR; "
88: 1IRZ-A 2.7 3.4 53 64 9 ARR10-B; "
89: 1ETK-A 2.7 2.0 39 75 10 FACTOR FOR INVERSION STIMULATION; "
90: 2NS0-A 2.6 3.1 48 85 6 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
91: 2NR3-A 2.6 4.9 76 168 8 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
92: 1XMK-A 2.6 3.2 49 79 10 DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE; "
93: 1UMQ-A 2.6 2.6 41 60 10 PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN; "
94: 1FX7-A 2.6 4.5 94 230 11 IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER; "
95: 1EH6-A 2.6 4.5 55 168 18 O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE; "
96: 2ESN-A 2.5 12.0 66 299 8 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
97: 2DT5-A 2.5 8.5 83 210 18 AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN; "
98: 1U78-A 2.5 10.0 63 103 11 TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE; "
99: 1T98-A 2.5 8.9 109 266 6 CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF; "
100: 1D8J-A 2.5 3.4 48 81 4 GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA; "
101: 1YOV-A 2.4 4.6 60 529 12 AMYLOID PROTEIN-BINDING PROTEIN 1; "
102: 1IV6-A 2.4 3.2 51 57 6 TELOMERIC REPEAT BINDING FACTOR 1; "
103: 1B72-B 2.4 4.1 58 73 12 PROTEIN (HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1); "
104: 2V1X-A 2.3 3.1 54 527 6 ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1; "
105: 2P5V-A 2.3 5.7 73 156 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY; "
106: 2P4W-A 2.3 4.7 68 197 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY; "
107: 2OQG-A 2.3 6.1 64 109 13 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY "
108: 2FRH-A 2.3 6.1 60 127 10 STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A; "
109: 1Q1H-A 2.3 3.1 50 85 18 TRANSCRIPTION FACTOR E; "
110: 1MKM-A 2.3 4.1 70 246 14 ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
111: 1K6Y-A 2.3 11.5 55 192 7 POL POLYPROTEIN; "
112: 1HLV-A 2.3 10.6 77 131 9 MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B; "
113: 1GDT-A 2.3 2.8 39 183 3 PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE); "
114: 1FJL-A 2.3 3.5 54 65 11 PROTEIN (SEGMENTATION PROTEIN PAIRED); "
115: 2FUG-2 2.2 5.0 68 178 15 NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1; "
116: 2DA7-A 2.2 3.3 51 71 12 ZINC FINGER HOMEOBOX PROTEIN 1B; "
117: 2BFG-A 2.2 11.6 69 501 9 BETA-XYLOSIDASE; "
118: 1U2W-A 2.2 4.4 54 105 11 CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN; "
119: 1R71-A 2.2 6.2 65 114 9 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB; "
120: 1E2X-A 2.2 4.0 79 222 8 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
121: 1CF7-B 2.2 2.8 47 82 4 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
122: 2PG4-A 2.1 3.7 53 92 13 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
123: 2NTZ-A 2.1 8.6 72 183 14 PARB; "
124: 2H6B-A 2.1 2.5 46 239 13 CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K; "
125: 2CU7-A 2.1 5.8 55 72 11 KIAA1915 PROTEIN; "
126: 2AHQ-A 2.1 3.5 47 67 13 RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR RPON; "
127: 1XN7-A 2.1 11.3 53 78 8 HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG; "
128: 1TWD-A 2.1 3.8 66 234 5 COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC; "
129: 2JGD-A 2.0 9.2 67 811 10 2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE E1 COMPONENT; "
130: 2G7H-A 2.0 4.3 60 167 8 METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE "
131: 1UG2-A 2.0 4.9 54 95 9 2610100B20RIK GENE PRODUCT; "
132: 1S6L-A 2.0 8.4 66 192 8 ALKYLMERCURY LYASE; "
-
No 1: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL 120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL 120
DSSP HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF 180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query NQTVENVQRIIIEGIRPR 198
ident ||||||||||||||||||
Sbjct NQTVENVQRIIIEGIRPR 198
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLLLL
No 2: 2GENA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || ||| || | | | | | | | | ||
Sbjct ....RKDEILQAALACFSEHGVDATTIEXIRDRSGASIGSLYHHFGNKERIHGELYLAGI 56
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhllLLLL....HHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagAPLL....MDE 115
ident | | | | | |
Sbjct GQYAALLEAgFARARSAEETVRLLVTSYIDWVVANPDWARFILHSR...GRVEagelGER 113
DSSP HHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH...HHHHhlllHHH
DSSP HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHhhhlLL
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEavtgAT 173
ident | | | | || | |
Sbjct LRADNQAHFARIHAALAGYRAEGLFREXPDDCFASVVIGPAHDLARQWlaGRTR....VA 169
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLL....LL
DSSP LLlhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query LRdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR 198
ident | | |
Sbjct LA......DCRELLAQVAWDSVRAA 188
DSSP HH......HHHHHHHHHHHHHHLLL
No 3: 2D6YA MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | || | | | | || | | | | | ||
Sbjct ..EATKARIFEAAVAEFARHGIAGARIDRIAAEARANKQLIYAYYGNKGELFASVLEKKX 58
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHHHHh
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGA...PLLMDELt 117
ident | | | | || | |
Sbjct LDLAISVPVD......pDDIEGWIDRLLDYHAAHPELLRLLFWEGXEYGtaeLPHEAER. 111
DSSP HHHHHHLLLL......hHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHLlllLLLHHHH.
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLlllL
Query GDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGAtlrD 176
ident | | | | | |
Sbjct QEHYARKVAAVRDGQERG...VITDaIPAPDLLFLLVAXANWAVVVPQXKRILVGG...G 165
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLL...H
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query EVFFNQTVENVQRIIIEGIRPr 198
ident
Sbjct DAGTDGLRDSIKKAARRIVDR. 186
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
No 4: 2PZ9A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | | | || | || || |||||| |
Sbjct ...STRQRIVAAAKEEFARHGIAGARVDRIAKQARTSKERVYAYFRSKEALYAHVAERET 57
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLlllhhhhhlHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGApllmdeltgDL 120
ident | | | || | | |
Sbjct TALIEATQLD......pADLPGYAGILFDHFAARPDHYRLITWGRLELA.........PL 102
DSSP HHHHHHLLLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHLL.........LH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHHHHHLlllllHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTGatlrdEVF 179
ident | | | | | | || | | | |
Sbjct QATIAGKLDKLRDAQRIGLLDPaWDPVDVLALINQIAXTWA.GQPEIAAAAA.dqavDPS 160
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHLHHH.HLHHHHHHHH.hhllLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query FNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident
Sbjct VTARRAALVTAVEHXFPrp 179
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLll
No 5: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHH
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALY 52
ident | ||| | | || ||| ||| ||| ||
Sbjct mnipttttKGEQAKSQLIAAALAQFGEYGL.HATTRDIAALAGQNIAAITYYFGSKEDLY 59
DSSP lllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLHHHHLL...LLLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHH
Query IAVLRQILDIWLAPLKAF...REDF.........APLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQAS 98
ident | | | | | | |
Sbjct LACAQWIADFLGEKFRPHaekAERLfsqpapdrdAIRELILLACKNMIMLLTQedTVNLS 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLHHHhhhHHHHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHLlLLLL.HHHHHLHHHHHHHhHHHH.HHHHHHLllllllLHHHHHHHHhHHH
Query RLFCMEMLAgAPLL.MDELTGDLKALIDeKSAL.IAGWVKSgklapiDPQHLIFMIwAST 156
ident | | | | |
Sbjct KFISREQLS.PTSAyQLVHEQVIDPLHT.HLTRlVAAYTGCdandtrMILHTHALL.GEV 176
DSSP HHHHHHHHL.LLHHhHHHHHHLHHHHHH.HHHHhHHHHHLLllllhhHHHHHHHHH.HHH
DSSP HHHHHLHHHHHHHH.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..l
Query QHYADFAPQVEAVT.GATLrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..r 198
ident | || | |
Sbjct LAFRLGKETILLRTgWPQF.DEEKAELIYQTVTCHIDLILHGltq 220
DSSP HHHHHLHHHHHHHHlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl
No 6: 1ZKGA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | ||| || | | ||| ||| | || || ||
Sbjct .VLSKRDAILKAAVEVFGKKGYDRATTDEIAEKAGVAKGLIFHYFKNKEELYYQAYXSVT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL.HHHHLLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHH
Query DIWL.APLKAFR..EDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELT 117
ident | ||| | | | |
Sbjct EKLQkEFENFLXknRNRDIFDFXERWIEKKLEYSASHPEEADFLITLVSVDEGLRKRILL 119
DSSP HHHHhHHHHHHHhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......lllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhh
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKSG.......klaPIDP.QHLIFMIWASTQHYADFApqveav 169
ident || |
Sbjct .DLEKSQRVFFDFVREKLKDLdlaedvteeiALKFlXWFFSGFEEVYLRTYQGK...... 172
DSSP .HHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHLLL......
DSSP hlLLLLLhhHHHHHHHHhHHHHHHHHLLL...
Query tgATLRDevFFNQTVENvQRIIIEGIRPR... 198
ident | | ||
Sbjct .pELLKR..DXNTLVEE.VKVXLRILKKGxtk 200
DSSP .hHHHHH..HHHHHHHH.HHHHHHHHHHHhll
No 7: 2FBQA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || || | || | | | ||| | | || || || |
Sbjct AQSETVERILDAAEQLFAEKGFAETSLRLITSKAGVNLAAVNYHFGSKKALIQAVFSRFL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLL........lLLLHH.HHHHHHHHHHHHH....hHHLHHHHHHHHHHHHL
Query DIWLAPLKAFR........eDFAPL.AAIKEYIRLKLEV....sRDYPQASRLFCMEMLA 107
ident | | | | | | ||
Sbjct GPFCASLEKELdrrqakpeaQHATLeDLLHLLVSQAMAVkprsgNDLSIFMRLLGLAFSQ 120
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhhllllLLLLHhHHHHHHHHHHHHLlllllLHHHHHHHHHHHHHHL
DSSP LLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllLLLL...lhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH
Query GAPLLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWvksgkLAPI...dpQHLIFMIWASTQHYADFAP 164
ident | | |
Sbjct SQGHLRKYLEEVYGKVFRRYMLLVNEA.....APKLppielFWRVHFMLGAAAFSMSGIK 175
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....LLLLlhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH
DSSP HHHHHHLlllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....
Query QVEAVTGatlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.... 198
ident | | | |
Sbjct ALRAMAEtdfgvnTSTEQVMHLMVPFFAAGMRAEsgid 213
DSSP HHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllll
No 8: 1VI0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || | | || ||| || || |
Sbjct ...PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKX 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHH.HHHLLLLLLHHHHHl
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCM.EMLAGAPLLMDELTg 118
ident | | |
Sbjct GQFIERXEEdIKEKATAKEKLALVISKHFSLLAGDHNLAIVTQLeLRQSNLELRQKINE. 116
DSSP HHHHHHHHHhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHH.
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhLLLLll
Query DLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtGATLrd 176
ident || || | | |
Sbjct ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEgLDVRLARQXIFGTIDETVTTWvXNDQ...KYDL.. 171
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLLH..
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHhlll
Query evffnQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | |
Sbjct ....vALSNSVLELLVSGihnk 189
DSSP ....hHHHHHHHHHHHHLllll
No 9: 2IBDA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | | || || | | ||| || |
Sbjct GKSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAP..LLMDELT 117
ident | | | | |
Sbjct DDLFGKYREiVASGLDSRATLEALVTTSYEAIDASHSAVAIYQDEVKHLVAneRFTYLSE 120
DSSP HHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHLLHHHLLlhHHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHH.llllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllLLLL
Query gDLKALIDEKSALIAGWVK.sgklapidpqhlIFMIWASTQHYADFApqveavtgaTLRD 176
ident ||
Sbjct .LNTEFRELWXGVLEAGVKdgsfrsdidvelaFRFLRDTAWVAVRWY.........RPGG 170
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllhhhhHHHHHHHLLHHHHLL.........LLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query EVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | | |
Sbjct SVTVDTVAKQYLSIVLDGlasp 192
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHLllll
No 10: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | || | | | | ||||||| | | | | |
Sbjct tkeEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLD 60
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HhHHHHLHHHHLL..LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHLL..l
Query QiLDIWLAPLKAF..REDF.APLAAIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLAG..a 109
ident | | || ||
Sbjct S.LHETHDHLARAseSEDEvDPLGCMRKLLLQVFNELVLdarTRRINEILHHKCEFTddm 119
DSSP H.LLHHHHHHHHHhhLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhHHHHHHHHHHLLLLLhhh
DSSP LLLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH
Query PLLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYaDFAP 164
ident | | | | |
Sbjct CEIRQQRQSAVLDCHKGITLALANAVRRGQLPGeldaerAAVAMFAYVDGLIRRW.LLLP 178
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL
DSSP HHhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query QVeavtgatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident || |
Sbjct DS...........vDLLGDVEKWVDTGLDMLRLSpalrk 206
DSSP LL...........lLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLhhhll
No 11: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;
DSSP ..........lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHH
Query ..........avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA 50
ident || | | | || | || || ||
Sbjct grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERGYDGTSXEHLSKAAGISKSSIYHHVTGKEE 60
DSSP llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLHHHHL..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhLL
Query LYIAVLRQILDIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlAG 108
ident | || | | | || | |
Sbjct LLRRAVSRALDELFGILDEehARVG.TAAERLEYVVRRXVEVLXAELPYVTLLLRV..RG 117
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL..LL
DSSP LLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhh
Query APLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqve 167
ident | || |
Sbjct TGTERWALE.RRREFDHRVAALLKDAAAEGDVRAdVEVRLATRLVFGXINSIVEWYR... 173
DSSP LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLHHHHLL...
DSSP hhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query avtgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | | | |
Sbjct ...pesgvSGAGEREVVDAVARLVFGG.lrk 200
DSSP ...lllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.lll
No 12: 2G3BA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | | || |||| | | | | | | |
Sbjct .XSERRDAILKASATAIAQRGIRGLRVNDVAEVAGVSPGLLYYHFKDRIGLLEAALNYIN 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLH.HHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHhhHHHL..HHHHHHHHHHHHL..LLLLLHHH
Query DIWLA.PLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLevSRDY..PQASRLFCMEMLA..GAPLLMDE 115
ident | | | | |
Sbjct DRARAyRSEGEG.gDSARDRLTRSLLGEI..QDRPevVENSLAWNELRASavYEEALRDP 116
DSSP HHHHHhHLLLLL.lLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHhhHHHHHHHHHHHHHhhHLHHHHHH
DSSP HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHH.HHHLHHHHhhhhlll
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQH.YADFAPQVeavtgat 173
ident | | | | | ||| |
Sbjct LARTTAAWVSEIADAIVQAQATGEISRsLDPQPTAVTXTALVEGlSGRWLCKE....... 169
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHLLL.......
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query lrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident |
Sbjct ....iSTEDARSHLLGAIDVVXS.. 188
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHL..
No 13: 2NP5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | |||| | | ||
Sbjct ...TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLV 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhHHHL.HHHHHHHHHHHHLLLLL..LHHHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEvSRDY.PQASRLFCMEMLAGAPL..LMDELT 117
ident | || | | | | | |
Sbjct DKLLARLSEVERGGDPARALFAAXSQLLP.LDEArSREAHVXAAFAVRAATSpsLAEIRR 116
DSSP HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.LLHHhHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhlllll
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKsgkLAPI..DPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlr 175
ident | | |
Sbjct .KTLFTIRTGLSAVLIGIG...TPEAetRAALLLATVDGLALDA.IGSPAL......... 162
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLHHH.........
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query devfFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | | |
Sbjct ...yPPEYLEHALDIQIGXILQGadvvp 187
DSSP ...lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllll
No 14: 2DG8A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || | || | || ||| | | | |
Sbjct .DPQRRERILAATLDLIAEEGIARVSHRRIAQRAGVPLGSMTYHFTGIEQLLREAFGRFT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHL..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHH
Query DIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAP..LLMDEL 116
ident | | | | | | | | |
Sbjct DHIVAVFDEhlGAAA.DRDEAREAVADLVHELSEDSQRDLVLTQELYTLAARqpAYRELT 118
DSSP HHHHHHHHHhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHlhHHHHHH
DSSP HlHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHhhhhllllll
Query TgDLKALIDEKSALIAGwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVeavtgatlrd 176
ident | | | | | |
Sbjct H.EWMRRSRVHLEKHFD........pGTARQLDALIEGLTLHRA.LAREP.......... 158
DSSP H.HHHHHHHHHHLLLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL..........
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query evffnQTVENVQRIIIEGIRPR 198
ident |
Sbjct .....HGRALTLEAIARITTTD 175
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHLLLL
No 15: 1RKTA MOLECULE: PROTEIN YFIR;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHH
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYI 53
ident || || | || | | | | || | |
Sbjct spkvtkeHKDKRQAEILEAAKTVFKRKGFELTTXKDVVEESGFSRGGVYLYFSSTEEXFR 60
DSSP llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLHHHHLLLLlLLHHHHHHHHHHH.hhhhhhhlhHHHHHHHHHHHLL..ll
Query AVLRQILDIWLAPLKAFREdFAPLAAIKEYIRL.klevsrdypQASRLFCMEMLAG..ap 110
ident || | | | | | |
Sbjct RIIETGLDEGLRKLDKSAEhQSVWASISSYLDElteglrdvadTLAPVQFEYLVTAwrne 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHHHhhhhlllhhhLLHHHHHHHHHHHhhlh
DSSP lLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHhh
Query lLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEav 169
ident | | | | | |
Sbjct eRRQYLEKRYDLFVERFSRLLQKGIDQGEFQPvQPLATIAKFFLNXNDGIIQNALYFD.. 178
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
DSSP HLLLlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query TGATlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident |
Sbjct EEKA.....DVSGLAESAKLYLKTVLQADek 204
DSSP HHHH.....LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLll
No 16: 2F07A MOLECULE: YVDT;
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | | || || | | | || || || || |
Sbjct pftmpkQTSGKYEKILQAAIEVISEKGLDKASISDIVKKAGTAQGTFYLYFSSKNALIPA 60
DSSP llllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHLHHHHLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHHHHhhllLLLL.
Query VLRQILDIWLAPLKAFR.eDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpqaSRLFCMEmlagAPLL. 112
ident | | | | | |
Sbjct IAENLLTHTLDQIKGRLhgDEDFWTVLDILIDETFLITERH...KDIIVLC....YSGLa 113
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHH....HHHHh
DSSP ....HHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH
Query ....MDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFA 163
ident | | |
Sbjct idhsMEKWETIYQPYYSWLEKIINKAIANHEVTEginskwTARTIINLVENTAERFYIGF 173
DSSP hlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP hhhhhhhllllllhhHHHHHhHHHHHHHHHHHLLL....
Query pqveavtgatlrdevFFNQTvENVQRIIIEGIRPR.... 198
ident | |
Sbjct ..............eQDENV.EVYKKEIFTFLKRSlgta 197
DSSP ..............lLLLLH.HHHHHHHHHHHHHHhlll
No 17: 2FX0A MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || || | | ||| || || |
Sbjct SREQTXENILKAAKKKFGERGYEGTSIQEIAKEAKVNVAXASYYFNGKENLYYEVFKKYG 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP hHHLHHhHLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHh
Query dIWLAPlKAFRE..DFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCME.MLAGaPLLMDELt 117
ident | | | | | || | | | |
Sbjct .LANEL.PNFLEknQFNPINALREYLTVFTTHIKENPEIGTLAYEEiIKES.ARLEKIK. 116
DSSP .LHHHL.LLHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHlLLLL.LLHHHHH.
DSSP LHHHhhhhhhhhhhhhhHHLLlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHhhlHHHHHHHHllllll
Query GDLKalideksaliagwVKSGkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYadfAPQVEAVTgatlrd 176
ident | | | | |
Sbjct PYFIgsfeqlkeilqegEKQG.VFHFfSINHTIHWITSIVLFP...KFKKFIDS...... 166
DSSP HHLHhhhhhhhhhhhhhHHLL.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHL......
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHhlll
Query evffnqtveNVQRIIIEGirpr 198
ident ||
Sbjct .........DLVSRIISAltdk 179
DSSP .........LHHHHHHHHhhll
No 18: 2NX4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | || | || || | || |
Sbjct gvpklvDHDERRRSITAAAWRLIAARGIEAANMRDIATEAGYTNGALSHYFAGKDEILRT 60
DSSP lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.HHHHHHHHHHHhLLLL..
Query VLRQILDIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLeVSRDY.PQASRLFCMEMlAGAP.. 110
ident | | | | | | |
Sbjct SYEHISEATDRRIAeALGD.ATGLDALRILCREVM.PINEEqLLEARIAASLW.PRAMyd 117
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHL.LLLHHhHHHHHHHHHHH.HHHLll
DSSP .LLHHHHhLHHHHHHHH.hhhhhHHHHHLLLLLLL...LHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHH
Query .LLMDELtGDLKALIDE.ksaliAGWVKSGKLAPI...DPQHLIFMIWASTQHYADFAPQ 165
ident | | | | |
Sbjct eQMAATN.RRTMDNWREqmaiflEQAREEGSVGDIdvtIVVEQLLNMMMGMQILGVLTPG 176
DSSP lHHHHHH.HHHHHHHHHhhhhhhHHHHHHLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP HhhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHlll
Query VeavtgatlrdevfFNQTVENVQRIIIEGIrpr 198
ident
Sbjct E............tSSERQLEMLEQFVAAL... 194
DSSP L............lLHHHHHHHHHHHHHLL...
No 19: 2G7GA MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | | |
Sbjct ...LDRERIAEAALELVDRDGD..FRXPDLARHLNVQVSSIYHHAKGRAAVVELVRHRVV 55
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHhlHHHHLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhlllllLHHHhhLHH
Query DIwlAPLKAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagaplLMDEltGDL 120
ident || | | | | | || |
Sbjct RE..IDGSAFER.LPWDEAFSEWARSYRAAFSRHPTAIRLLATE.......TVRD..PGS 103
DSSP LL..LLLHHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.......LLLL..HHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHL.........
Query KALIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFApqVEAVTG......... 171
ident | | | | | |
Sbjct LSVYHSAAAGLRGAG....fpddHIXAVITAAENFLLGAALDA.aAPEVXIeadstttdd 158
DSSP HHHHHHHHHHHHHHL....llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hLLLLLLlllllllll
DSSP .......llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query .......atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | |
Sbjct altralaaaprGPERAEQAFELGLAALLAGFHHLlqecg 197
DSSP hhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll
No 20: 2HYJA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | || || | || | | |
Sbjct aEAQATRGRILGRAAEIASEEGLDGITIGRLAEELEMSKSGVHKHFGTKETLQISTLDKA 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLH.HHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hHHHHHHHHHLLLL....LLH
Query LDIWLA.PLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQ.aSRLFCMEMLAGAP....LLM 113
ident | |
Sbjct FVDFWHrVVEPALaePPGLRRLRAVCANSVGYLEEPLLpgGCLLTAALSEYDGrpgrVRD 120
DSSP HHHHHHhHLHHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLLHHHHHHHHHLLlllhHHH
DSSP HHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELtGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg 171
ident | | | | | | | | |
Sbjct AVA.EVWSRWREQLRADLTAAVDKGELPAgFDVEQALFEIVAAGLALNAAMqLQHD.... 175
DSSP HHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL....
DSSP lllllhhhhHHHHhHHHHHHHHHhlll
Query atlrdevffNQTVeNVQRIIIEGirpr 198
ident
Sbjct .....rtaaDRAR.RAIERALAQ...s 193
DSSP .....llhhHHHH.HHHHHHHHH...l
No 21: 1A6IA MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;
DSSP ..lHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ..aVSAKKKAILSAALD.TFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | | | || | | || |
Sbjct srlDKSKVINSALELLNeVGIEG....LTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAV 56
DSSP lllLHHHHHHHHHHHHHhHLLLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHLHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHhhhlllllLHHHhh
Query QILDIWLAPLKaFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMemlagaplLMDElt 117
ident || |
Sbjct EILARHHDYSL.PAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYrDGAKVHLG........TRPD.. 105
DSSP HHHHHHLLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLHHHHHHH........LLLL..
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.........hhhhh
Query GDLKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.........pqvea 168
ident | | |
Sbjct EKQYDTVETQLRFMTENG....fslRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQqehlppllrealqi 161
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhh
DSSP HHLLLlllhhHHHHHHhHHHHHHHHHHLLL........
Query VTGATlrdevFFNQTVeNVQRIIIEGIRPR........ 198
ident | |
Sbjct MDSDD.....GEQAFL.HGLESLIRGFEVQltallqiv 193
DSSP HHLLL.....LHHHHH.HHHHHHHHHHHHHhlllllll
No 22: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqI 59
ident | || | | ||| |||| || ||| | |
Sbjct rTAEQSRSLIVDAAGRAFATRPYREITLKDIAEDAGVSAPLIIKYFGSKEQLFDALVD.F 59
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.L
DSSP HHHHLHHHhLLLLlllhHHHHHHHHHHHHHhhHHLHHHHhHHHHHHHLL......LLLLH
Query LDIWLAPLkAFREdfapLAAIKEYIRLKLEvsRDYPQASrLFCMEMLAG......APLLM 113
ident | | |
Sbjct RAAAEIVF.SGPL....DGLGERXVSXFAR..PLEPYKP.LSLNILFXSgpseesSRKLR 111
DSSP HHHHHHHL.LLLL....LLHHHHHHHHHLL..LLLLLLL.HHHHHHHLLllllhhHHHHH
DSSP HHHHLHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHHhhl
Query DELTGDLKALIDEKSAliagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEAvtg 171
ident | | | |
Sbjct ANYSAQXIDALAERLP............GRDARLRAELVXSXLTGLAVXRrkXXQEH... 156
DSSP HHHHHHLHHHHHHHLL............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLHHH...
DSSP lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query atlrdEVFFNQTVENVQRIIIEgirpr 198
ident | |
Sbjct ....aTGTPEEVVAHYAPLVQElldgg 179
DSSP ....lLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhll
No 23: 1UI5A MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | | | ||| | | | || | | |
Sbjct lRAEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ 60
DSSP lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHhl
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMLAgAPLLMDELtg 118
ident | | | | |
Sbjct SRTSRRLAKDlDGRGYSSLEALXRLTFGXARLCVQG.PVLRAGLRLATA.GVPVRPLP.h 117
DSSP HHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.l
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHhHHHLhhhhhhhhllllllh
Query dLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQhYADFapqveavtgatlrde 177
ident | || |
Sbjct pFTEWREIATSRLLDAVRQSDVHQdIDVDSVAHTLVCSVV.GTRV............... 161
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHH.LLLL...............
DSSP hHHHHHHHHHHHH.................hhhhhlll
Query vFFNQTVENVQRI.................iiegirpr 198
ident |
Sbjct vREPRRLAEXWYIlirgxvpvtrraryvtlaarleqet 199
DSSP lLHHHHHHHHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhl
No 24: 2OI8A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV 55
ident | | | | || | | | || |
Sbjct tprerYRTQVRAEIKDHAWEQIATAGASALSLNAIAKRXGXSGPALYRYFDGRDELITEL 60
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLHHHHL.LLLLLlHHHHHHHHHHHHHHHhhhLHHHHHH.HHHHhhlllLLLH
Query LRQILDIWLAPLKA.FREDFaPLAAIKEYIRLKLEVsrdYPQASRL.FCMEmlagaPLLM 113
ident | | | || | || | |
Sbjct IRDAYRSQADSLRAaAASGA.DLAGLAHALRAWALD...DPQRYFLiFGTP.vpgyRAPD 115
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhHHLLL.LHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHhHLLL.llllLLLH
DSSP HHHhLHHHHHHhHHHHHHHHH..................hhllllllLLHHHHHHHHHHH
Query DELtGDLKALIdEKSALIAGW..................vksgklapIDPQHLIFMIWAS 155
ident |
Sbjct DIT.EIAAETX.AVIVDACAAgtdgafdahldthrqwadrpapssalHRALSFWSRLHGV 173
DSSP HHL.LLLHHHH.HHHHHHHLLllllhhhhhhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHLHhhHHHHHllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query TQHYADFApqVEAVTgatlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPr 198
ident |
Sbjct LSLELAGQ..FTGXG..........fDSALLFEAELKDLLGP. 203
DSSP HHHHHLLL..LLLLL..........lLHHHHHHHHHHHHLLL.
No 25: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident || | | | | || |||| | ||| || | |
Sbjct sKSEQTRALILETAXRLFQERGYDRTTXRAIAQEAGVSVGNAYYYFAGKEHLIQGFYDRI 60
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLL.LLLL...HH
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAG.APLL...MD 114
ident | | | | | ||
Sbjct AAEHRAAVREvLARETDLEARLAGVLKVWLDIATPYHEFAVQFFKNAADPdSPLSpfsPE 120
DSSP HHHHHHHLLLhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLlllHH
DSSP HHhLHHHHHHHhhHHHH..hhHHHLllllllLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhll
Query ELtGDLKALIDekSALI..agWVKSgklapiDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtga 172
ident | | | |
Sbjct SE.HARVEAIGihRAVLagakTKVPeelrdiLPELXWLSQXGLVLYW.IFDRTE...... 172
DSSP HH.HHHHHHHHhhHHHHllllLLLLhhhllhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLL......
DSSP llllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................l
Query tlrdevffNQTVENVQRIIIEGIRP.............................r 198
ident | |
Sbjct ......grERSYRLAERGARLTARGvvlarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv 221
DSSP ......llHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll
No 26: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | || | || | || ||| || | |
Sbjct ggRTARIREAVLLAAGDALAADGFDALDLGEIARRAGVGKTTVYRRWGTPGGLAADLLAD 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLhhhHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlHHHHHHHHHHH.hlLLLL..LHHH
Query ILDIWLaplKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDyPQASRLFCMEM.laGAPL..LMDE 115
ident | | || | | |||
Sbjct XAEQSL...PRAD.TGALEEDLRANARLVVRTLDD.PRQGRLFRALIaasLCNEqaAEAL 115
DSSP HHHHLL...LLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHhhhHHLHhhHHHH
DSSP HhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhlll
Query LtGDLKALIDEKSALIAGWVKSgKLAP..IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtgat 173
ident || | | || |
Sbjct H.RFYAVRVDEWAGCVRDAVAR.GEVPdgTDPHGVVAAVSAPLYYALLNTGRS....... 166
DSSP H.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.......
DSSP lllhhhhhhHHHHHHHHHH...HHHL.....ll
Query lrdevffnqTVENVQRIII...EGIR.....pr 198
ident | | |
Sbjct ........lTEADADRAARaasTAARagvwvtg 191
DSSP ........lLHHHHHHHHHhhhHHHHlllllll
No 27: 2FD5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident || || | || | || ||
Sbjct msdKKTQTRARILGAATQALLERGAVEPSVGEVMGAAGLTVGGFYAHFQSKDALMLEAFE 60
DSSP lllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.hHHHL....hhHHHHHHHHHhLLLL.L
Query QILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLE.vSRDY....pqASRLFCMEMlAGAP.L 111
ident | | | | || | | |
Sbjct QLLGKRRELLGELDPGLSGKERRALAAAFYLSrkHRDAqvdagcPLPATLAEV.ARLPeG 119
DSSP HHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLhhHHLLllllllLHHHHHHHH.HHLLhH
DSSP LHHHHHlHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhl
Query LMDELTgDLKALIdeksaliagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADFApqveavtg 171
ident | |
Sbjct FREVLS.RHVEIM...........vtslaeSPEETDVALADLVLMIGGLALA........ 159
DSSP HHHHHH.HHHHHH...........hhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH........
DSSP lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query aTLRDEVFFNQTVENVQRIIIegirpr 198
ident |
Sbjct rALGPGELSDRVLRAAKQAVN...... 180
DSSP hHHLLLHHHHHHHHHHHHLLL......
No 28: 2QKOA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHH.LLLHhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELA.GVSKtNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | |||| | | |
Sbjct ..PERRAALVNAAIEVLAREGARGLTFRAVDVEAnVPKG.TASNYFPSRDDLFDQVGKRI 57
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlLLLL.LHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHlhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLL......LH
Query LDIWlaplkafredfaPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPL......LM 113
ident | || | |
Sbjct HERL............NLELAIEYXQGLFGRITRDRTGYLALQELRLEAVRRpelrttLT 105
DSSP HHLL............LHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhHH
DSSP HHHhLHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhHHLL
Query DELtGDLKALIDEKSALIAgwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEaVTGA 172
ident |
Sbjct RTI.SENLKRDIGFHLDSG.........lpGDRSTVLXLYLAXNALIVEHlTLPG.VLEG 154
DSSP HHH.HHHHHHHHHHHHHHL.........llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HLLL
DSSP llllhHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLL
Query tlrdeVFFNQTVENVQRIIieGIRPR 198
ident | |
Sbjct .....VDTERLVADLVTRA.vATPDA 174
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHH.lLLLLL
No 29: 1Z0XA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHH.....HHHHhhhlLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTF.....SQFGfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV 55
ident | | || | || || | ||
Sbjct ..KLSKDTIIAAAFSLLeksptLEQL....SXRKVAKQLGVQAPAIYWYFKNKQALLQSX 54
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHhhlllHHHL....LHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLHHhhLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhlllllLHHH
Query LRQILDIWLAPlkAFREdfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagaplLMDE 115
ident | | | | |
Sbjct AEAIEEHFQEP..ALCG..EWYSDLLAFXENYYDLYQQFPCAVAIEIQT.......VPAY 103
DSSP HHHHHHLLLLL..LLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHLL.......LLLL
DSSP HhlHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH.....
Query LtgDLKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVT..... 170
ident |
Sbjct P..QRLRHLNQXXGILREAG....fspEXTHLAVTSLQHLLFGXIXDATEEKQLVsqvln 157
DSSP H..HHHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhl
DSSP ........................llllllHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHLLL......
Query ........................gatlrdEVFFN.QTVENVQRIIIEGIRPR...... 198
ident |
Sbjct gddylkeqvlhxkqyvsdneltyxeesiqfHSIHQkSAFIQAVKTYLDGLQADntsssk 216
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllLHHHLhHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll
No 30: 1V7BA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || | || | | ||| ||
Sbjct MRTSKKEMILRTAIDYIGEYSLETLSYDSLAEATGLSKSGLIYHFPSRHALLLGMHELLA 60
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHLHHHHHHHHHHHhlLLLLLHHHHhLH
Query DIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEvsRDYPQASRLFCMEMlaGAPLLMDELtGD 119
ident | | | | || | | |
Sbjct DDWDKELRdITRDpEDPLERLRAVVVTLAE..NVSRPELLLLIDAP..SHPDFLNAW.RT 115
DSSP HHHHHHHHhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHHHH..HLHHHHHHH.HH
DSSP HHHHHhhHHHHhhhhhhlllllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhllllllhh
Query LKALIdeKSALiagwvksgklaPIDP.QHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlrdev 178
ident | |
Sbjct VNHQW.iPDTD.....dlendaHKRAvYLVQLAADGLFVHD.YIHDDV...........l 157
DSSP HHHHH.lLLLL.....lhhhlhHHHHhHHHHHHHHHHHHHH.HLLLLL...........l
DSSP HHHHHHhHHHHHHHHHHLLl
Query FFNQTVeNVQRIIIEGIRPr 198
ident | | |
Sbjct SKSKRQ.AMLETILELIPS. 175
DSSP LHHHHH.HHHHHHHHLLLL.
No 31: 2Q24A MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || || | || || ||| | || ||| | |
Sbjct ....NRDKILAAAVRVFSEEGLD.AHLERIAREAGVGSGTLYRNFPTREALIEAAYRNEV 55
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHHHhhhhhllLLLL....HHHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSrdYPQASRLFcmemlagAPLL....MDEL 116
ident
Sbjct ARLCDSVPGL...laelPPAEALRAWTRRFIdyATAKLGXA....dalRAVVasggDPYG 108
DSSP HHHHHLHHHH...hhhlLHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHHLH....hhhHHHHhlllLLLL
DSSP hlHHHHH..hhhhhhhhhhhhhlllLLLLLHHHHHHHHhHHHHH.HHHLhHHHHhhhlll
Query tgDLKAL..ideksaliagwvksgkLAPIDPQHLIFMIwASTQH.YADFaPQVEavtgat 173
ident | | | | |
Sbjct ..DSRQLiqsaltalxdaaaaageiRSDIRSTDXFAAL.AGIALtSSRP.DQRA...... 158
DSSP ..LHHHHhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLLHHHHHHHH.HHHHHhHLLH.HHHH......
DSSP lllhhhhhHHHHHHHHhHHHHhlll
Query lrdevffnQTVENVQRiIIEGirpr 198
ident |
Sbjct .....qaeRLLDLVLD.GLRP.... 173
DSSP .....hhhHHHHHHHH.HLLL....
No 32: 2GFNA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED
DSSP ..lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | || | | | || | | | ||
Sbjct ivdHDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRR 60
DSSP lllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLHHHHL.LLLLllhhHHHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHLLllLLHH
Query ILDIWLAPLKA.FREDfaplAAIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLAGapLLMD 114
ident || | | | | |
Sbjct AGDIQGDRYRTiLDEE..gaGPIEKLRNITASILPLderRLAXTRVFLFFYAEG..TARG 116
DSSP HHHHHHHHHHHhHLLL..llLHHHHHHHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLH
DSSP HHHlHHHH....hhhhhhhhhhhhhhllLLLLLLHhHHHHHHhHHHHHHHHLH.HHHHhh
Query ELTgDLKA....lideksaliagwvksgKLAPIDPqHLIFMIwASTQHYADFA.PQVEav 169
ident | | | | | | |
Sbjct EIA.AFLArwrgvvresvvaaqregtvsTDLDADA.VTVALV.ALTDGLALQAiLDPV.. 171
DSSP HHH.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLHHH.HHHHHH.HHHHHHHHHHlLLHH..
DSSP hlLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query tgATLRdevfFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident
Sbjct vxKAIS....AEDAAARCVDAAVRR.... 192
DSSP hhHHHL....LLLHHHHHHHHHHLL....
No 33: 2FQ4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident |||||| || ||| | ||| | | |
Sbjct RNIETQKAILSASYELLLESGFKAVTVDKIAERAKVSKATIYKWWPNKAAVVXDGFLSAA 60
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP hHHLHhhHLLLlLLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhHHHHHHHHHHLL......LLLLHH
Query dIWLAplKAFReDFAPLAaikeyirlklevsrdypqASRLFCMEMLAG......APLLMD 114
ident | | |
Sbjct .AARL..PVPD.TGSALN..dilihatslanflisrEGTIINELVGEGqfdsklAEEYRV 114
DSSP .LLLL..LLLL.LLLHHH..hhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHHHHHHHlllhhhHHHHHH
DSSP .HHHLhHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LLHHHHHhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query .ELTGdLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP.IDPQHLIfmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident | | |
Sbjct rYFQP.RRLQAKQLLEKGIKRG...ELKEnLDIELSI............dliygpifyrl 158
DSSP hLHHH.HHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlLLHHHHH............hhhhhhhhhhh
DSSP llllhhhhhhhhhhhHHHHHHHhlll
Query tlrdevffnqtvenvQRIIIEGirpr 198
ident ||
Sbjct lvtgeklddsyvhdlVINAFEGirlr 184
DSSP hlllllllhhhhhhhHHHHHHLllll
No 34: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAv 55
ident || | | | | ||||| | || | ||| |
Sbjct glrerKKTRTREAIRAATYGLIRQQGYEATTVEQIAERAEVSPSTVLRYFPTREDIVLT. 59
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHLL.
DSSP hhHHHH.HHLHHHHLLlllLLHHhHHHHHHHHH..hhHHHH...LHHHHHHHHHHHHLL.
Query lrQILD.IWLAPLKAFredFAPLaAIKEYIRLK..leVSRD...YPQASRLFCMEMLAG. 108
ident | | | |
Sbjct ..DEYDpVXAAELAAR..pAGEP.WSDSLRHVLrkalGLGAgeeAELIRLRTRLLAEVPa 114
DSSP ..LLLHhHHHHHHHLL..lLLLL.HHHHHHHHHhhhhLLLLllhHHHHHHHHHHHHHLHh
DSSP .LLLLHHHHHLHHH...............hhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhhhhh
Query .APLLMDELTGDLK...............aliDEKSaliagwvksgklapidpqhlifmi 152
ident
Sbjct vRARXLENXSDTGRxlaraiadrtgldpdgleVRIV................sxslvggl 158
DSSP hHHHHHHHLLLLLLhhhhhhhhhhllllllhhHHHH................hhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhlhHHHHhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHhlll
Query wastqhyadfaPQVEavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGirpr 198
ident |
Sbjct xevsrywaehdHEES............laelvdraldALENG.lpa 191
DSSP hhhhhhhhhhlLLLL............hhhhhhhhhhHHHHL.lll
No 35: 2DTZA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;
DSSP lhhHHHHhHHHHHHHHH.hHHHHhHLLHHHHHHhhLLLHHH..HHHHLLLHHHHHHHHHH
Query avsAKKKaILSAALDTF.sQFGFhGTRLEQIAElaGVSKTN..LLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | || | | | | | | | || | |
Sbjct ...NLKDkILGVAKELFikNGYN.ATTTGEIVK..LSESSKgnLYYHFKTKENLFLEILN 54
DSSP ...LHHHhHHHHHHHHHhhHHHH.HLLHHHHHH..HLLLLHhhHHHHHLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHL.HHHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHH.HHHHhHHLLLL...LL
Query QILDIWL.APLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASR.LFCMeMLAGAP...LL 112
ident | | | | | |
Sbjct IEESKWQeQWKKEQIkaKTNREKFYLYNELSLTTEYYY.PLQNaIIEF.YTEYYKtnsIN 112
DSSP HHHHHHHhHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLHHhHHHH.HHHHLLlhhHH
DSSP HHHHhLHHHhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhhhhhhll
Query MDELtGDLKalidekSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqveavtga 172
ident | | |
Sbjct EKMN.KLENkyidayHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIvTFTH........ 163
DSSP HHHH.HHHHhhhhhhHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL........
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query tlRDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident | |
Sbjct .eQNINERIKLMNKFSQIFLNGLS.. 186
DSSP .lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
No 36: 1U9NA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident ||| | | || | ||||||| |
Sbjct .GDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVV 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhh
Query DIWLAplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct NQADX....................................................... 64
DSSP HHHHH.......................................................
DSSP hhhHHHHHHHHHhhhhllLLLLLLHhHHHHHHHH..........................
Query kalIDEKSALIAgwvksgKLAPIDPqHLIFMIWA.......................... 154
ident |
Sbjct ..aLQTLAENPA......DTDRENXwRTGINVFFetfgshkavtragqaaratsvevael 116
DSSP ..hHHHHHHLLL......LLLHHHHhHHHHHHHHhhhhllhhhhhhhhhhllllhhhhhh
DSSP ............................................hHHHHHHLHHHHhhhh
Query ............................................sTQHYADFAPQVeavt 170
ident
Sbjct wstfxqkwiaytaavidaerdrgaaprtlpahelatalnlxnertLFASFAGEQPS.... 172
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLLL....
DSSP llllllhhhhhhHHHHHHHHH....hhhhlll
Query gatlrdevffnqTVENVQRII....iegirpr 198
ident
Sbjct ..........vpEARVLDTLVhiwvtsiygen 194
DSSP ..........llHHHHHHHHHhhhhhhhhlll
No 37: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTF.SQFGfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVL 56
ident | | ||| ||| | || | |
Sbjct xraDALKRREHIITTTCNLYrTHHH.DSLTXENIAEQAGVGVATLYRNFPDRFTLDXACA 59
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLH.HHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHhhhHHHHHHHHHL.HHHHHHHhhHHHLLLLLLHH
Query RQILDIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKeyiRLKLEVSRDY.PQASRLFcmEMLAGAPLLMD 114
ident | |
Sbjct QYLFNVVISLQLqAISTfPTDPEGVW..tSFNQLLFDRGlGSLVPAL..APESLDDLPDE 115
DSSP HHHHHHHHHHHHhHHHHhHHLHHHHH..hHHHHHHHHLLhHHHHHHH..LLLLHHHLLHH
DSSP HHHlHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHlHHHH...hhhhL
Query ELTgDLKALIDEksaliagwvksgklapidpqhLIFMIWASTQHYADfAPQV...eavtG 171
ident |
Sbjct VSA.LRRTTEKN...tttlinlakqhglvhhdiAPGTYIVGLITISR.PPITalatiseN 170
DSSP HHH.HHHHHHHH...hhhhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHLL.LLLHhhlllllH
DSSP LLLllhHHHHHHHHHHHHHhhhhhlll
Query ATLrdeVFFNQTVENVQRIiiegirpr 198
ident
Sbjct SHK...ALLGLYLSGLKHG......xx 188
DSSP HHH...HHHHHHHHHHHHL......ll
No 38: 2HKUA MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | || || || ||| | |
Sbjct ...QTRDALFTAATELFLEHGEG.VPITQICAAAGAHPNQVTYYYGSKERLFVEVACAAV 56
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.LHHHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlHHHHHHHHHHHHL......lllllH
Query DIW.LAPLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVsrdyPQASRLFCMEMLA......gapllM 113
ident | || |
Sbjct LRAgKRAEDDAAtaETVGDYTEKLVGSLLGP...gAPSVELFTSAXLXtgrrselrdliT 113
DSSP HHHhHHHHHHHHllLLHHHHHHHHHHHHHLL...lHHHHHHHHHHHHHllllhhhhhhhH
DSSP HHHhLHHHHHHHHH.HHHHHHHHHllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query DELtGDLKALIDEK.SALIAGWVKsgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident | | |
Sbjct DTL.RTLHSSGEVAlIRTLXRTGW...........qlragidveskafwsaifglviqkt 161
DSSP HHH.HHHHHHHHHLhHHHHHHLLL...........lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLL....
Query tlrdevffnqtvenvqriiieGIRPR.... 198
ident |
Sbjct atgesfgysleeavavifanlQIPETvrnt 191
DSSP hllllllllhhhhhhhhhhhhLLLHHhhhl
No 39: 2G7SA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | | | |||| | |
Sbjct NPQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL.HHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH....HHHHHHHHHHHLL...lLLL
Query DIWL.APLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYP....QASRLFCMEMLAG...aPLL 112
ident | |
Sbjct QEAEaGIAELE....kniSDPLEQLRAYIGYWEGCIadatHPFCVCALLASEIpvlpETV 116
DSSP HHHHhHHHHHH....hhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLLHHHHHHLLHhhllHHH
DSSP HHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhHHHH.......................
Query MDELtgdlkalideksaliagwvksgklapidpQHLI....................... 149
ident |
Sbjct VLEV......................rahfrslSDWLtavlergiaqgrlvltgtarana 154
DSSP HHHH......................hhhhhhhHHHHhhhhhhhhhlllllllllhhhhh
DSSP hHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhlLLLLlhhhhhhHHHHhHHHHHHhhlll
Query fMIWASTQHYADFA.PQVEavtgATLRdevffnqTVENvQRIIIEgirpr 198
ident | | || | |
Sbjct eIFXATVHGAXLSArAHGD...aATFG.....aiTRPX.LERITA..... 190
DSSP hHHHHHHHHHHHHHhLLLL...lLHHH.....hhHHHH.HHHHLL.....
No 40: 2IU5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | | | | || | |
Sbjct meKSIITQKIIAKAFKDLMQSNAYHQISVSDIMQTAKIRRQTFYNYFQNQEELLSWIFEN 60
DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLHhhHLLLllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLllllLHHHHH.
Query ILDIWLAplKAFRedfaplaaikEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAgaplLMDELT. 117
ident | |
Sbjct DFAELIN.dNSDY.........yGWQNELLLLLRYLDENQIFYQKIFVI....DKNFEHf 106
DSSP HHHHHHL.lLLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH....LLLHHHh
DSSP ..lhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...lllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhll
Query ..gdlkalideksaliagwvKSGK...lapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtga 172
ident | | |
Sbjct fliqwenlldkvifdqekksDYHWsdleksFICRYNAAAICAITRESIIRGN........ 158
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLlhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........
DSSP llllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query tlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident |
Sbjct ......sleKLYSQIVNLLLAQIKIFe 179
DSSP ......llhHHHHHHHHHHHHHHHLLl
No 41: 2HXOA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHhhHHHHHLLHHHHHHHHLL.LHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFsqFGFHGTRLEQIAELAGV.SKTNlLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | || | | |
Sbjct ...lSRERIVGAAVELLdtVGERGLTFRALAERLATgPGAI.YWHITGKAELLGAATDAV 56
DSSP ...lLHHHHHHHHHHHHhhLLLLLLLHHHHHHHHLLlHHHH.HHLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHhhhlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHHHHHlLLLLLHhhh
Query LDIWLAplkafredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYP...QASRLFCMEMLaGAPLLMdel 116
ident | |
Sbjct VTAAVT....agptgaadSPQDAVRAVALGLWDATEahpWLATQLATQLS.RTPWGT... 108
DSSP HHHHHL....llllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHhllHHHHHHHHHHH.HLLLLL...
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHH.LHHHhhHHHL...
Query tgdlkalideksaliagwvksgkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYAD.FAPQveAVTG... 171
ident | | |
Sbjct .......vaprifeslgrqvqaxGVPEaHWFTASSALXHYILGAAGqNAAN..DEFLdtv 159
DSSP .......hhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL..LHHHhhh
DSSP ...................lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query ...................atlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident |
Sbjct stawegldpdaypftravadqvrgHDDREQFLAGITLVLTGITALHrp 207
DSSP hhhhllllllllhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLll
No 42: 2DG7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAvlr 57
ident ||| | | ||| || ||| |
Sbjct xarWDPGAEQRLKRAALELYSEHGYDNVTVTDIAERAGLTRRSYFRYFPDKREVLFG... 57
DSSP lllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLLHHHLL...
DSSP HHHH.......................hhLHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHL
Query QILD.......................iwLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsRDY 94
ident
Sbjct GSELlppavaravlaadpgaapltavldaXSQV...................gaqlvAQV 98
DSSP LLLLlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhHHHH...................lllllLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHhLHHHHHHHH...........HHHHhhhhhhlllll
Query PQASRLFCMEMLAG..APLLMDELtGDLKALIDE...........KSALiagwvksgkla 141
ident |
Sbjct EGAAQRRAVIDASPelQERERTKS.AAISRAVQDalvrrqvdadtAELV........... 146
DSSP LLHHHHHHHHHLLHhhHHHHHHHH.HHHHHHHHHhhhhllllhhhHHHH...........
DSSP lllhHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL
Query pidpQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIRPR 198
ident
Sbjct aqlaTVAFGSAFRRWIDAEGH................adfgscldtvtDRLRAVLTG 187
DSSP hhhhHHHHHHHHHHHHHLLLL................llhhhhhhhhhHHHHHHHHL
No 43: 2I10A MOLECULE: PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | || | | | || | |
Sbjct ....DDQVALQTAXELFWRQGYEGTSITDLTKALGINPPSLYAAFGSKRDLFEKTLDRYX 56
DSSP ....LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP hHHLH.HHHLllllllHHHHHHHHHHHhhhhhHHLH......hhhhhhhHHHHllllllh
Query dIWLA.PLKAfredfaPLAAIKEYIRLklevsRDYP......qasrlfcMEMLagapllm 113
ident | |
Sbjct cERTLqLEEA.xvrptAHEAVLDFLTGrvevfTGCXtvqaglasgephhEIVD....... 108
DSSP lLLHHhHHHH.hllllHHHHHHHHHHHhhhhhLLLLllllllllllllhHHHH.......
DSSP hhhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..lLLLH..HHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhhh
Query deltGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKL..aPIDP..QHLIFMIWASTQHYadfapqveav 169
ident | |
Sbjct .lltAAREQXRQTVLDRFEKALADGDLpagTDCTalARYVXAAVYGLSVE.......... 157
DSSP .hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllLLHHhhHHHHHHHHHHHHHH..........
DSSP hllllllhhHHHHHhhhhhhhHHHHHLll
Query tgatlrdevFFNQTvenvqriIIEGIRpr 198
ident
Sbjct ....aasgaPREEL.taaailAAQVVP.. 179
DSSP ....hhlllLHHHH.hhhhhhHHLLLL..
No 44: 2G7LA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...lHHHHHHHHHHH.....hHHHHhhhhhhhllHHHHHHhhLLLHHhhhhhLLLHHHhh
Query ...aVSAKKKAILSA.....aLDTFsqfgfhgtrLEQIAElaGVSKTnllyyFPSKEAly 52
ident | | |
Sbjct kpalSRRWIVDTAVAlxraegLEKV........tXRRLAQ..ELDTG.paslYVYVANta 49
DSSP llllLHHHHHHHHHHhhhhhlLLLL........lHHHHHH..HLLLL.hhhhLLLLLLhh
DSSP HHHHHHHHHHHLHHHHLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhllllll
Query IAVLRQILDIWLAPLKAFredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagapll 112
ident | || |
Sbjct ELHAAVLDALLGEVDLTG..aEDWREQLRAVLTSYTLVLFAHPQLARSALVA........ 99
DSSP HHHHHHHHHHLLLLLLLL..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL........
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhHHHL
Query mdeltgdlkalideksalIAGWVksgklAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveAVTG 171
ident | || | |
Sbjct .rpsgenylrlvervlelLARSG.....APGAqVAWGVDKLLQDATATAAEQA..tSATV 151
DSSP .llllhhhhhhhhhhhhhHHLLL.....LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..lLHHH
DSSP .................lllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......l
Query .................atlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRP......r 198
ident ||
Sbjct ralrdadeathpaiashxpllvaGSAHDRLRWSFDVLVNGITRtpvpgpa 201
DSSP hhhhhllllllhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll
No 45: 2NP3A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;
DSSP lhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllHHHHhHHHHH.HH
Query avsakkkaILSAALDTFsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpsKEALyIAVLR.QI 59
ident || || | |
Sbjct ........ILTAARVCF..............................YGTE.NLFLQaLE 21
DSSP ........LHHHHHHHL..............................LLLL.HHHHHhHL
DSSP HHHHL.HHHHL.LLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhllllllhhhh
Query LDIWL.APLKA.FREDF.APLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagapllmdel 116
ident | | |
Sbjct LPGKIeEAITAaAQGGLdGIGERVVRAHLSVWDDVSSRPALXTXVRSAA.........rl 72
DSSP HHHHHhHHHHHhLLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLH.........hh
DSSP hlhhhHHHHHHHHHHHhhHHLLlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllll
Query tgdlkALIDEKSALIAgwVKSGklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFApqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct retatGILARALGGVI..TGED..axlRTSXVATQLVGLAXXRYVAH............l 116
DSSP hhhhhHHHHHHHLLLL..LLLL..hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL............l
DSSP hhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL...l
Query evffNQTVENVQRIIIEGIRP...r 198
ident | |
Sbjct eplaSADTDTVARHYGRAVQAivtd 141
DSSP llhhHLLHHHHHHHHHHHHHHhhll
No 46: 1ZK8A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAkKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | || |
Sbjct IGLT.LQKIVETAAEIADANGVQEVTLASLAQTLGVRSPSLYNHVKGLQDVRKNLGIYGI 59
DSSP LLLL.HHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLH..HHHLLLllllhhhhhhhhhhhhHHHHhhlhhhHHHHhhhhhllLLLL...HHH
Query DIWLA..PLKAFRedfaplaaikeyirlkLEVSrdypqaSRLFcmemlagAPLL...MDE 115
ident |
Sbjct KKLHNrlEEAAED.....krxdeaihalgEAYV.afvrkHPGL...yeatFLRDeevRKA 110
DSSP HHHHHhhHHHHLL.....llhhhhhhhhhHHHH.hhhhhLHHH...hhhlLLLLhhhHHH
DSSP HhLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllll
Query LtGDLKALIDEKSALIAGwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlr 175
ident |
Sbjct G.DGIVKLCLQVLQQYGL................egenalhatrgfrsichgfasieqqg 153
DSSP H.HHHHHHHHHHHHHHLL................lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP lhhhhhhhhhHHHHHH.hhhhlll
Query devffnqtveNVQRII.iegirpr 198
ident
Sbjct gfglpldldiSLHVLLetfikglr 177
DSSP lllllllhhhHHHHHHhhhhhhhl
No 47: 1SGMA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHhHHHHHL..LLHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKtNLLYYF..PSKEALYIAVLRQ 58
ident || | | | | | || | | || | || | |
Sbjct ..GDSREKILHTASRLSQLQGYHATGLNQIVKESGAPK.GSLYHFfpNGKEELAIEAVTY 57
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLL.LHHHHLllLLHHHHHHHHHHH
DSSP .HHHHHLhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhh
Query .ILDIWLaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdelt 117
ident
Sbjct tGKIVEH..................................................... 64
DSSP hHHHHHH.....................................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.............
Query gdlkalideksaliagwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYaDFAP............. 164
ident |
Sbjct .................liqqsmdesSDPVEAIQLFIKKTAS.QFDNtesikgipvglla 106
DSSP .................hhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHH.LLLLhhhllllllhhhh
DSSP ....................................................hhhhhhLL
Query ....................................................qveavtGA 172
ident
Sbjct setaliseplrtvcmkvfksweavfarklmengfaeeeanqlgtlinsmieggimlslTN 166
DSSP hhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHH
DSSP LLllhhhhhhhhHHHHhHHHHHHLll
Query TLrdevffnqtvENVQrIIIEGIRpr 198
ident | |
Sbjct KD.....ktpllLIAE.QIPVLVR.. 184
DSSP LL.....lhhhhHHHL.LHHHHLL..
No 48: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL...lhH
Query ........aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...skE 49
ident | | | | |
Sbjct mniaelygkMGKHSWRIMDAIFKNLWDYEY..VPLQLISSHARIGEEKARNILKylsdlR 58
DSSP llhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLL..EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhlL
DSSP HHH............hhHHHH.HHHHH...................lhHHHLllllllhh
Query ALY............iaVLRQ.ILDIW...................laPLKAfredfapl 77
ident | |
Sbjct VVQnrqkdyegstftfiGLSLySLHRLvrsgkvdaigklmgegkesavFNCY........ 110
DSSP LEEeellllleeeelhhHHHHhHHHHHhhllllleeeeeeeellleeeEEEE........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaikeyirlklevsrdypqasRLFCMEMlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvks 137
ident
Sbjct ..sekfgecvvkfhkvkvkehFSVLAIR................................ 136
DSSP ..ellleeeeeeeelllllllHHHHHHH................................
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhHHHHhlhhhhhhhhllllllhhhhhhHHHHhHHHH......
Query gklapidpqhlifmiwastQHYAdfapqveavtgatlrdevffnqTVENvQRII...... 191
ident
Sbjct .................saRNEF...................ralQKLQgLAVPkvyawe 160
DSSP .................hhHHHH...................hhhHHLLlLLLLleeeee
DSSP ...............................................hhhHLLL......
Query ...............................................iegIRPR...... 198
ident
Sbjct gnavlmelidakelyrvrvenpdevldmileevakfyhrgivhgdlsqynVLVSeegiwi 220
DSSP lleeeeelllleehhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleellllllllEEELllleee
DSSP .................................................
Query ................................................. 198
ident
Sbjct idfpqsvevgeegwreilerdvrniityfsrtyrtekdinsaidrilqe 269
DSSP lllllleelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl
No 49: 2HXIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqil 60
ident || || | | | | | | ||
Sbjct ..RWSTEQILDAAAELLLAgdaeTFSVRKLAASLGTDSSSLYRHFRNKTELLRAVAD... 55
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHLLllllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH...
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHH..............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMEML.............. 106
ident
Sbjct ......................................rILLSAXDgyrpegdwkqrlta 77
DSSP ......................................hHHHHHHLlllllllhhhhhhh
DSSP ....................llllLLHHHHHlHHHHhHHHHHHHHHhhhhllllllLLHH
Query ....................agapLLMDELTgDLKAlIDEKSALIAgwvksgklapIDPQ 146
ident |
Sbjct valrlresfgqqpqlaavwgrhgsGGTGSRLxXEEV.LQALRASGL........pdDEIP 128
DSSP hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllLLHHHHHhHHHH.HHHHHHLLL........lhHHHH
DSSP HHHHHHH......................hhhhhhhhlhhhhhHHHLLLLLlhhhhhhhh
Query HLIFMIW......................astqhyadfapqveAVTGATLRdevffnqtv 184
ident
Sbjct ARYHRLVilisslitaeggfrvavlgadperfpalshfareirPLGADRGA...afeeil 185
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhllLLLLLHHH...hhhhhh
DSSP hhHHHHHHHHhlll
Query enVQRIIIEGirpr 198
ident
Sbjct aaHLAHLEAA..ap 197
DSSP hhHHHHHHHH..ll
No 50: 2AO9A MOLECULE: PHAGE PROTEIN;
DSSP ..........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhh
Query ..........AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskea 50
ident || | | | |
Sbjct mmakldelkqKLTAKQIQAAYLLVENELM.eeEKRTQDEMANELGINRTTLWEWRTknqd 59
DSSP lhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhlhh
DSSP hhHHHHHHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllll
Query lyIAVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRlfcmemlagap 110
ident
Sbjct fiAFKSEVAD..................................sFLAE........... 74
DSSP hhHHHHHHHH..................................hHHHL...........
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHhhH
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyADFAPQVEavT 170
ident
Sbjct .................................................KREQVYSK.lM 84
DSSP .................................................LHHHHHHH.hH
DSSP LLL...llLHHHHHHHHHHHHHhhhhHHLLL.....
Query GAT...lrDEVFFNQTVENVQRiiieGIRPR..... 198
ident
Sbjct QLIlgpqpSVKAMQLYMQRFGL...lTDKKViegdl 117
DSSP HHHhllllLHHHHHHHHHHLLL...lEEEEEeeell
No 51: 1XJEA MOLECULE: RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;
DSSP .........................................LHHHHHHHHHHHHHhHHHH
Query .........................................AVSAKKKAILSAALdTFSQ 19
ident | | |
Sbjct mklsdlisrwidvepsknaqiilrdryfmkdldgnyletkwEDVARRVARVVATA.ELLN 59
DSSP llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHH.HHHL
DSSP H.hhhhlLHHHHHHHHLL............................lhhHHHHhlLLHHH
Query F.gfhgtRLEQIAELAGV............................sktNLLYyfPSKEA 50
ident | | | |
Sbjct PsykkneKLDRIKEWEDIffrvlkarlfipnsptlfnaglgvkhdllwkPIDQ..MTLED 117
DSSP LlllhhhHHHHHHHHHHHhhhhhhllleeelhhhhhhllllllhhhhllLHHH..LLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHH...lhhhhlllllLLHHHHHHHHHHH.....................
Query LYIAVLRQILDIW...laplkafredFAPLAAIKEYIRL..................... 86
ident | |||
Sbjct YEEIYRSRNHLHMlsacfvvpvgdsiEEIFEAVKEYALItkvgggvgsnfselrpkgsfv 177
DSSP HHHHHHHLLLLLLllleeellllllhHHHHHHHHHHHHHhhllleeeeelllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 86
ident
Sbjct agthgkasgpvsfmhvfnsaisvvkqgsrrrgalmgilninhpdieefidakkvlnffnl 237
DSSP lllleelllhhhhhhhhhhhhllleellleelleeeeeelllllhhhhhlllllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 86
ident
Sbjct svgfpmdkkeilklyeedgelelshprstirkkvkirelfrkiatnawksgdpglaflge 297
DSSP eeellllhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhllleeelhhh
DSSP ........................hhhhHHHL............................
Query ........................klevSRDY............................ 94
ident
Sbjct mnkyyplyphrkinstnpcgeiglsdyeACNLgsidvakfynngfvdlealqelvqiavr 357
DSSP hhhllllllllleeeelllllleeelllEEEEeeeehhhheelleelhhhhhhhhhhhhh
DSSP .....HHHHhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query .....PQASrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli 149
ident
Sbjct fldnvIDVN................................................... 366
DSSP hhhhhHHHL...................................................
DSSP hhhHHHHHHHHHLH..............................................
Query fmiWASTQHYADFA.............................................. 163
ident
Sbjct vfpIDKITKAVKESrrlglgimgfadllykleipynsqeardfaanlmafialhahrtsy 426
DSSP lllLHHHHHHHHHHlleeeeeelhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .......hhhHHHHL.............................................
Query .......pqvEAVTG............................................. 171
ident
Sbjct elgkekgnfpLLEISryrtednfvpfamgmsnyddeirevmkmtkefrrnvalltiaptg 486
DSSP hhhhhhllllLHHHLhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 171
ident
Sbjct sisniadtssglepnfllaytrfvtkedgtkepllyvnqvlreklnpeilkriekeliek 546
DSSP lhhhhllllllllllllleelleeellllleeelleelhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......................................................lllllh
Query ......................................................atlrde 177
ident
Sbjct gslkdipdvpekikkvfvvaldidpmdhllmqdafqryvdnnisktinmpqsatvddvln 606
DSSP llllllllllhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelllllhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct vylealrtnvrgitvyrdgsl 627
DSSP hhhhhhhlllleeleeellll
No 52: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | | || |
Sbjct xatgglaiiqsxxhXLPPSERKLADYILAHPHX..aiESTVNEISALANSSDAAVIRLCX 58
DSSP llllhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHLHHH..hhLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH
DSSP .....LHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHH
Query .....SKEALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLF 101
ident |
Sbjct slglkGFQDLXX............................................rvAG 74
DSSP hllllLHHHHHH............................................hhHH
DSSP HHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query CMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct DLAKPTFQ.................................................... 82
DSSP HHHLHHHL....................................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................g 83
DSSP ....................................l
No 53: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL..............
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQfgFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.............. 46
ident | | || | |
Sbjct gIDPAIVEVLLVLREAGIEngATPWSLPKIAKRAQLPXSVLRRVLTqlqaagladvsvea 60
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHLLLllLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeell
DSSP ....lhhhhhHHHHHHHHHHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query ....skealyIAVLRQILDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfc 102
ident
Sbjct dgrghasltqEGAALAAQLFP....................................... 81
DSSP llleeeeelhHHHHHHHHHLL.......................................
DSSP hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query memlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................... 81
DSSP ....................................
No 54: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLllhhhhhh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFG..fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFpskealyi 53
ident | || | |
Sbjct dgtvkVSRSLKEMGNKIRKAKDELSKtrgRAPTVTEIADHLGISPEDVVLAQ........ 52
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHH........
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllh
Query avlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllm 113
ident
Sbjct ............................................................ 52
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlll
Query deltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgat 173
ident
Sbjct ............................................................ 52
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................eavrl 57
DSSP ....................hhhhl
No 55: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi 60
DSSP llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ...............lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHL.LLHHHHHHH
Query ...............aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYY 44
ident | | | |
Sbjct epyrlpeviqkcnarwTTEEQLLAVQAIRKYG.......RDFQAISDVIGnKSVVQVKNF 113
DSSP hhhlllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHL.......LLHHHHHHHHLlLLHHHHHHH
DSSP LLLhhhhhHHHHhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHhhhh
Query FPSkealyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRLfcme 104
ident |
Sbjct FVNyrrrfNIDE....................................vlqEWEAE.... 133
DSSP HHHlllllLHHH....................................hhhHHHLL....
DSSP hhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query mlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfap 164
ident
Sbjct ............................................................ 133
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................. 133
DSSP ..................................
No 56: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL.........lhhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.........skeal 51
ident | | ||| |
Sbjct .TTPSMEDYIEQIYMLIEEKGY..ARVSDIAEALAVHPSSVTKMVQkldkdeyliyglvl 57
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleelllee
DSSP hhhHHHHhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query yiaVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklEVSRdypqasrlfcmemlagapl 111
ident
Sbjct tskGKKI....................gkrlvyrhelLEQF................... 78
DSSP lhhHHHH....................hhhhhhhhhhHHHH...................
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg 171
ident
Sbjct ..............................lriigvdeekiyndvegiehhlswnsidri 108
DSSP ..............................hhhllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhh
DSSP lLLLLHHH.hHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query aTLRDEVF.fNQTVENVQRIIIEgirpr 198
ident | |
Sbjct gDLVQYFEedDARKKDLKSIQKK..... 131
DSSP hHHHHHHHllHHHHHHHHHHHHL.....
No 57: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhhhhhhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqil 60
ident | | | | | |
Sbjct ..GSPEKILAQIIQE.HREG....LDWQEAATRASLSLEETRKLLQSXAA.......... 43
DSSP ..LLHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH..........
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHHLL............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMEMLAG............ 108
ident
Sbjct .......................agqvtllrvendlyaiSTERYQAWWqavtraleefhs 80
DSSP .......................llleeeeeelleeeeeEHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................lllLHHHHHLHHH.......hhHHHHhhHHHHhhH
Query .........................aplLMDELTGDLK.......alIDEKsaLIAGwvK 136
ident | |
Sbjct ryplrpglareelrsryfsrlparvyqaLLEEWSREGRlqlaantvaLAGF..TPSF..S 136
DSSP hlllllleehhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHLLLeeeelleeeELLL..LLLL..L
DSSP LLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHL
Query SGKlapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIR 196
ident
Sbjct ETQ...............kkllkdledkyrvsrwqppsfkevagsfnldpselEELLHYL 181
DSSP HHH...............hhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhHHHHHHH
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 196
ident
Sbjct vregvlvkindefywhrqalgeareviknlastgpfglaeardalgssrkyvlplleyld 241
DSSP hhllleeellllleeehhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...............ll
Query ...............pr 198
ident
Sbjct qvkftrrvgdkrvvvgn 258
DSSP hllleeeelleeeelll
No 58: 2CMPA MOLECULE: TERMINASE SMALL SUBUNIT;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLHHHHHHHHLL....LHHHHHHHLLLhhHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGV....SKTNLLYYFPSkeALYIAVL 56
ident | | | || |
Sbjct klSPKQERFIEEYFIND.......mNATKAAIAAGYsknsASAIGAENLQK.pAIRARID 52
DSSP llLHHHHHHHHHHHHLL.......lLHHHHHHHLLLllllHHHHHHHHHHL.hHHHHHHH
DSSP HHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct ARLK........................................................ 56
DSSP HHHL........................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................... 56
DSSP ......................
No 59: 1SFXA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;
DSSP ................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | | || |
Sbjct hxsnplgelvkaleklsfKPSDVRIYSLLLERG......gXRVSEIARELDLSARFVRDR 54
DSSP llllhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP LLlhhhhhHHHH...............HHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query FPskealyIAVL...............RQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlkle 89
ident |
Sbjct LK.vllkrGFVRreivekgwvgyiysaEKPEK............................ 85
DSSP HH.hhhhlLLEEeeeeellleeeeeeeLLHHH............................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllHHHHhLHHHHHHHHHHHHHhhHHHLlllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllMDELtGDLKALIDEKSALIagWVKSgklapidpqhli 149
ident | |
Sbjct .....................vlKEFK.SSILGEIERIEKXF..TDGS............ 109
DSSP .....................hhHHHH.HHHHHHHHHHHLLL..LLLL............
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................................................. 109
DSSP .................................................
No 60: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLRqil 60
ident | | |
Sbjct ....hlDDLDRNILRLLKKDA..RLTISELSEQLKKPESTIHFRIKK.lqerGVIER... 50
DSSP ....llLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhlLLEEE...
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct .........................................yTIIL.......geqlkpk 62
DSSP .........................................eEEEE.......lllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhHLLLLLL.................llhhhHHHH............
Query kalideksaliagwvKSGKLAP.................idpqhLIFM............ 151
ident
Sbjct hlalivlevgkpedfLERYISYisstlsalpgvlfvaksgedkiIALVgknnkdelvkfi 122
DSSP eeeeeeeeellllhhHHHHHHHhhhhhhlllleeeeeeellleeEEEEeellllhhhhhh
DSSP ..............hhhhhhHHHHLhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ..............iwastqHYADFapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirp 197
ident
Sbjct eenitsipnlkhiqifpiteIKKGE...........................dltgflae 155
DSSP hhhlllllleeeeeeeelleEEELL...........................lhhhhhll
DSSP l
Query r 198
ident
Sbjct v 156
DSSP l
No 61: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHhhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLrqil 60
ident | | | | | | | |
Sbjct ......DNLEQKILQVLSDDGGP.VAIFQLVKKCQVPKKTLNQVLY.rlkkeDRVS.... 48
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHLLL.EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEE....
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct ............................................................ 48
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevff 180
ident
Sbjct ............................................................ 48
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlll
Query nqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .......spspkywsigg 59
DSSP .......eeelleeeell
No 62: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lghllrdvwsllneeerelldkeiqpfpckkastvfsegdipnnlfylyegkikilrrfh 60
DSSP lhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct isrivkpgqffgmrpyfaeetcsstaiavenskvlaipveaieallkgntsfcryflkal 120
DSSP eeeeelllleelhhhhhhlllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
DSSP ..............lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......HHHLL.hHHHHHHHLLLh
Query ..............aVSAKKKAILSAALDTFSQFG.......FHGTR.lEQIAELAGVSk 38
ident | || | | |
Sbjct akelgyaerrtvtltQKHVRGRLAETLLILKENFGfendgatLSIYLsrEELATLSNMTv 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLLlhHHHHHHLLLLh
DSSP HHHHHHLL.............LHHHhhhhhHHHHhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhh
Query TNLLYYFP.............SKEAlyiavLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyir 85
ident |
Sbjct SNAIRTLStfvsermlaldgkRIKI...idCDRL.......................... 211
DSSP HHHHHHHHhhhhllleeeellEEEE...llHHHH..........................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllh
Query lklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidp 145
ident
Sbjct ............................................................ 211
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..............................................qktarsg 218
DSSP ..............................................hhhhhhl
No 63: 2FQ3A MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;
DSSP ...........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHH
Query ...........................AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAEL 33
ident
Sbjct skwfnlekihsievqslpefftnripsKTPEVYMRYRNFMVNSYRLNPNEYFSVTTARRN 60
DSSP llllllllllhhhhhhlhhhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHH
DSSP HLLLHHHHHHHLLLHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrd 93
ident |
Sbjct VSGDAAALFRLHKFLTK........................................... 77
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHH...........................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw 153
ident
Sbjct ............................................................ 77
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query astqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .....................................wglinyqv 85
DSSP .....................................llllllll
No 64: 2CUJA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE;
DSSP ......................................................LHHHHH
Query ......................................................AVSAKK 6
ident |
Sbjct gssgssgidsglspsvlmasnsgrrsapplnltglpgteklnekekelcqvvrlVPGAYL 60
DSSP llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhlllLHHHHH
DSSP HHhHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhHHHHhhhhhhhlhh
Query KAiLSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyIAVLrqildiwlap 66
ident || | | || | |
Sbjct EY.KSALLNECHKQGG..LRLAQARALIKIDVNKTRKIYDFLIR.eGYIT.......... 106
DSSP HH.HHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHL.lLLLL..........
DSSP hhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhh
Query lkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalide 126
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
Query ksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtven 186
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhlll
Query vqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..........ka 108
DSSP ..........ll
No 65: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dptlewflshchihkypskstlihqgekaetlyyivkgsvavlikdeegkemilsylnqg 60
DSSP lhhhhhhhllleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeeeellllleeeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dfigelglfeegqersawvraktacevaeisykkfrqliqvnpdilmrlsaqmarrlqvt 120
DSSP leelhhhlllllllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......hhHHHLL.HHHHHHHHLLLHHHHHHHL
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQ.......fgFHGTR.LEQIAELAGVSKTNLLYYF 45
ident | | | | | | |
Sbjct sekvgnlAFLDVTGRIAQTLLNLAKQpdamthpdgMQIKItRQEIGQIVGCSRETVGRIL 180
DSSP hhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHLLLllleeelleEEEELlHHHHHHHHLLLHHHHHHHH
DSSP L......LHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query P......SKEAlyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr 99
ident |
Sbjct KmledqnLISA................................................. 191
DSSP HhhhhllLEEE.................................................
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct ............................................................ 191
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..............................hgktivvyg 200
DSSP ..............................elleeeeel
No 66: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLHHHHHHHHllLHHHhhhhlLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAgvSKTNllyyfPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | |
Sbjct .MQEQRQQLLRSLEALIFSS.eEPVNLQTLSQIT..AHKF...tpSELQEAVDELNRDYE 53
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHL..LLLL...lhHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHhhhhhllllllhhhhhlhh
Query DIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFcmemlagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct ATG................................rtFRIH................... 62
DSSP HHL................................llEEEE...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhHHHHhLHHHHHHHHL.........
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastQHYAdFAPQVEAVTG......... 171
ident
Sbjct ..........................aiaggyrfltEPEF.ADLVRQLLAPviqrrlsrs 95
DSSP ..........................eelleeeeeeLHHH.HHHHHHHHLLhhhhhhhhh
DSSP ........................................lllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................atlrdevffnqtvenvqrii 191
ident
Sbjct mlevlavvawhqpvtkgeiqqirgaspdysidrllarglievrgradspgrplqygttev 155
DSSP hhhhhhhhhhhlleehhhhhhhhllllllhhhhhhhllleeeeeellllllleeeeelhh
DSSP hhhhlll
Query iegirpr 198
ident
Sbjct fldlfhl 162
DSSP hhhhlll
No 67: 1LDDA MOLECULE: ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;
DSSP .LHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHL...........lLHHHHHHHLLlh
Query .AVSAKKKAiLSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAG...........vSKTNLLYYFPsk 48
ident | | | | | |
Sbjct kYELTLQRS.LPFIEGMLTNLGA..MKLHKIHSFLKitvpkdwgynriTLQQLEGYLN.t 56
DSSP lLHHHHHHH.HHHHHHHHHHHLL..EEHHHHHHHHHhhllhhhlllllLHHHHHHHHH.h
DSSP hhhhHHHHhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ealyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident
Sbjct ladeGRLK.................................................... 64
DSSP hhhlLLEE....................................................
DSSP llllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ............................................................ 64
DSSP ............................................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................yiangsyeiv 74
DSSP ....................llllleeeel
No 68: 1I1GA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLRqil 60
ident | | || | | |
Sbjct .....iDERDKIILEILEKDA..RTPFTEIAKKLGISETAVRKRVKA.leekGIIEG... 49
DSSP .....lLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhhLLLLL...
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct .........................................yTIKI............np 56
DSSP .........................................lLLLL............ll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhHLLLLLL.llhhhhhhHHHHH........................
Query kalideksaliagwvKSGKLAP.idpqhlifMIWAS........................ 155
ident | ||
Sbjct kklgyslvtitgvdtKPEKLFEvaeklkeydFVKELylssgdhmimaviwakdgedlaei 116
DSSP hhhllleeeeeeeeeLHHHHHHhhhhhhhllLEEEElllllllleeeeeeellhhhhhhh
DSSP ...hhhhhhlhhhhhhHHLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ...tqhyadfapqveaVTGATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct isnkigkiegvtkvcpAIILEKL......................k 140
DSSP hhhllllllleeeeeeEELLLLL......................l
No 69: 1CF7A MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.LHHHHHHHLLLhhhhhHHHHhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFPSkealyIAVLrq 58
ident | | | |
Sbjct sRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVrQKRRIYDITNVlegigLIEK.. 58
DSSP lLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHhhhhlLEEE..
DSSP hhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg 118
ident
Sbjct ............................................................ 58
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident
Sbjct ............................................................ 58
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........ksknsiqwk 67
DSSP ...........eelleeeel
No 70: 2DBBA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHhhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLrqil 60
ident | |
Sbjct ....klDRVDMQLVKILSENS..RLTYRELADILNTTRQRIARRIDK.lkklGIIR.... 49
DSSP ....llLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH.hhhhLLEE....
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct ........................................kfTIIP.........didkl 60
DSSP ........................................eeEEEE.........llhhh
DSSP hhhhhhhhhhHHHHH..............hllllllllhHHHHhhhHHHHhhhhhlhhhh
Query kalideksalIAGWV..............ksgklapidpQHLIfmiWASTqhyadfapqv 166
ident |
Sbjct gymyaivlikSKVPSdadkviseisdieyvksvekgvgrYNII...VRLL.......... 107
DSSP leeeeeeeeeELLHHhhhhhhhhhllllleeeeeeeellLLEE...EEEE..........
DSSP hhhhlllllLHHH..HHHHHHHHH.............hhhhhhhlll
Query eavtgatlrDEVF..FNQTVENVQ.............riiiegirpr 198
ident
Sbjct ........lPKDIkdAENLISEFLqriknaenvevilisevrkfeii 146
DSSP ........eELLHhhHHHHHHHHHhlllleeeeeeeeeeeeeeelll
No 71: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct etvsfkagdvilypgvpgprdrayrvleglvrleavdeegnaltlrlvrpggffgeealf 60
DSSP lleeelllleeellllllllllleeeeelleeeeeellllleeeeeeelllleellhhhh
DSSP .................................................LHHHHHHHHHH
Query .................................................AVSAKKKAILS 11
ident | |
Sbjct gqeriyfaeaatdvrleplpenpdpellkdlaqhlsqglaeayrrierlATQRLKNRXAA 120
DSSP lllllleeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH........hHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL.......lhhhhhhhhH
Query AALDTFSQFGF........hGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.......skealyiavL 56
ident | | | | |
Sbjct ALLELSETPLAheeegkvvlKATHDELAAAVGSVRETVTKVIGelaregyirsgygkiqL 180
DSSP HHHHHLLLLLEeeelleeeeELLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeelleeeE
DSSP HHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct LDLKG....................................................... 185
DSSP LLHHH.......................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 185
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............lkelaesrg 194
DSSP .............hhhhhllll
No 72: 1R1UA MOLECULE: REPRESSOR PROTEIN;
DSSP ..............lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL
Query ..............aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | | | |
Sbjct ntdtlervteifkalGDYNRIRIMELLSVSE.......ASVGHISHQLNLSQSNVSHQLK 53
DSSP lhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHLL.......LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
DSSP ..............lhhhhHHHHHHHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHH
Query ..............skealYIAVLRQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlkleVSR 92
ident
Sbjct llksvhlvkakrqgqsmiySLDDIHVATM.......................lkqaiHHA 90
DSSP hhhhllleeeeeelleeeeEELLHHHHHH.......................hhhhhHHH
DSSP Hlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhh
Query Dypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmi 152
ident
Sbjct N........................................................... 91
DSSP L...........................................................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query wastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........................................hpk 94
DSSP ...........................................lll
No 73: 1QBJA MOLECULE: PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhh
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFG.fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyiavlrqi 59
ident | | | | | |
Sbjct ...SIYQDQEQRILKFLEELGegKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYS............ 45
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH............
DSSP hhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlh
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgd 119
ident
Sbjct ............................................................ 45
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhh
Query lkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevf 179
ident
Sbjct ...........................................................l 46
DSSP ...........................................................h
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct akkgklqkeagtpplwkia 65
DSSP hhllleeeellllleeeel
No 74: 2FJI1 MOLECULE: EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gshmgdkeketlfkdylnlivvkmtewignlekaefdvflerstpphsdsdgllfldgtk 60
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleellllleelhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tcfqmftqqvevaagtnqakilvgvverfsdlltkrqknwiskiseeikkqinynhkydi 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ..............................lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhh
Query ..............................avsakkkailsaaldtfsqfgfhgtrleqi 30
ident
Sbjct dpesitpedecpgglveyliavsndqmkaadyavaisskygklvskvyekqitnhlegtl 180
DSSP hhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllh
DSSP hhhhLLLHHHHHHHLL............................................
Query aelaGVSKTNLLYYFP............................................ 46
ident | |
Sbjct dgfaEVAQCSSLGLITlmfddlrkpyqeifsktwymgsqaqqiadtldeylldikpqmns 240
DSSP hhhhHHHHHHHHHHHHhhhhllhhhhlllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
DSSP .....LHHHHHHHHHH............................................
Query .....SKEALYIAVLR............................................ 57
ident
Sbjct vlfvnFIDNVIGETIIkfltalsfehsfknknnkfleamkrdfeifyqlfvkvldgnesk 300
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllh
DSSP .......hHHHHHLHHHHLLlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhhhhhhhhllll
Query .......qILDIWLAPLKAFredfaplaAIKEYIRLKLEVSRDYPQAsrlfcmemlagap 110
ident | | |
Sbjct dtlitqnfTVMEFFMDLSCE........PIDSILDIWQKYLEVYWDS............. 339
DSSP hhhhhhhhHHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHHHHHLLLLLL.............
DSSP llhhhhhlhhhHHHHHHhHHHHhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHh
Query llmdeltgdlkALIDEKsALIAgwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVt 170
ident | | |
Sbjct .....ridllvGILKCR.KDVS..........SSERKKIVQQATEMLHEYRRNMEANGV. 382
DSSP .....llhhhhHHHLLL.LLLL..........HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........dreptlmrrfvlefekq 399
DSSP ...........lllllhhhhllllllll
No 75: 2DK5A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ................AVSAKKKAILSAALDtFSQFGfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | |
Sbjct gssgssgdsqnagkmkGSDNQEKLVYQIIED.AGNKG...IWSRDVRYKSNLPLTEINKI 56
DSSP llllllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHH.HLLLL...EEHHHHHHHLLLLHHHHHHH
DSSP LL..lhhhHHHHhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHH
Query FP..skeaLYIAvlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFC 102
ident | |
Sbjct LKnleskkLIKA...............................vksvaaskkkvymlyNL 85
DSSP HHhhhhllLEEE...............................ellllllllleeeelLL
DSSP HHHHllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query MEMLagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct SGPS........................................................ 89
DSSP LLLL........................................................
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................................sg 91
DSSP ..................................ll
No 76: 2DIMA MOLECULE: CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN;
DSSP ...........lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHL.LLHHHHHHHLLLh
Query ...........aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPSk 48
ident | || | |
Sbjct gssgssgkggvwRNTEDEILKAAVMKYG......kNQWSRIASLLHrKSAKQCKARWYE. 53
DSSP llllllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHH.
DSSP hHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query eALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident |
Sbjct .WLDP....................................................... 57
DSSP .LLLL.......................................................
DSSP llLLHHhhhLHHHHhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apLLMDeltGDLKAliDEKSaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ..SIKK...TEWSG..PSSG........................................ 70
DSSP ..LLLL...LLLLL..LLLL........................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 70
DSSP ..............................
No 77: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyIAVLRqil 60
ident | | |
Sbjct ...mklDQIDLNIIEELKKDS..RLSMRELGRKIKLSPPSVTERVRQLES.fGIIKQ... 51
DSSP ...lllLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.lLLEEE...
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct .........................................yTLEV............dq 58
DSSP .........................................eEEEE............ll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhHHLLLL....................llLLHHhhHHHH........
Query kalideksaliagwVKSGKL....................apIDPQhlIFMI........ 152
ident ||
Sbjct kklglpvsciveatVKNADYerfksyiqtlpniefcyriagaACYM..LKINaesleave 116
DSSP hhhllleeeeeeeeEHHHLHhhhhhhhhlllleeeeeeeellLLEE..EEEEellhhhhh
DSSP ...............hhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ...............wastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirp 197
ident
Sbjct dfinktspyaqtvthvifseIDTK.................................... 140
DSSP hhhhhhllleeeeeeeeeeeLLLL....................................
DSSP l
Query r 198
ident
Sbjct . 140
DSSP .
No 78: 1YX3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN DSRC;
DSSP ........................................lHHHHHHHHHHHHHHHHH.H
Query ........................................aVSAKKKAILSAALDTFS.Q 19
ident |
Sbjct madtievdgkqfavdeegylsnlndwvpgvadvmakqdnleLTEEHWDIINFLREYYEeY 60
DSSP lleeeeelleeeeeellleelllllllhhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHhH
DSSP HHHhhLLHHHHHHHHL.......LLHHHHHHHL..LLHHHHHHHHHhhhhhhhlhhhhll
Query FGFhgTRLEQIAELAG.......VSKTNLLYYF..PSKEALYIAVLrqildiwlaplkaf 70
ident | | |
Sbjct QIA..PAVRVLTKAVGkklgkekGNSKYLYSLFpyGPAKQACRFAG.............. 104
DSSP LLL..LLHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLllLHHHHHHHHHL..............
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query redfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksal 130
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query iagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqri 190
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhlll
Query iiegirpr 198
ident
Sbjct lpkptgcv 112
DSSP llllllll
No 79: 1YLFA MOLECULE: RRF2 FAMILY PROTEIN;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL............lh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP............sk 48
ident | | ||
Sbjct .kISSRFSIAVHILSILKNNPSSLCTSDYXAESVNTNPVVIRKIXSylkqagfvyvngga 59
DSSP .lLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeellle
DSSP hhhhhhhhHHHH..............................HHHLhhhhlllllllhhh
Query ealyiavlRQIL..............................DIWLaplkafredfapla 78
ident |
Sbjct gllkdlheITLLdvyhavnviganiqavleiiliqaqsaxeeVLRN.............. 105
DSSP eelllhhhLLHHhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL..............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aikeyirlklevsrdYPQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksg 138
ident
Sbjct ............itxGQLFET....................................... 114
DSSP ............llhHHHHHH.......................................
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query klapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .........................................................lqe 117
DSSP .........................................................hll
No 80: 1K78A MOLECULE: PAIRED BOX PROTEIN PAX5;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gvnqlggvfvngrplpdvvrqrivelahqgvrpcdisrqlrvshgcvskilgryyetgsi 60
DSSP llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHL.....llhhHHHHhlll
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAG.....vsktNLLYyfps 47
ident | |
Sbjct kpgviggsKPKVATPKVVEKIAEYKRQNP..TMFAWEIRDRLLaervcdndtVPSV..ss 116
DSSP llllllllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHHhllllllllLLLH..hh
DSSP hHHHHHHHhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query kEALYIAVlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemla 107
ident
Sbjct iNRIIRTK.................................................... 124
DSSP hHHHHHLL....................................................
DSSP lllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query gapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqve 167
ident
Sbjct ............................................................ 124
DSSP ............................................................
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query avtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................... 124
DSSP ...............................
No 81: 1AKHA MOLECULE: PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1);
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHH..lLHHHHHHHHLLLHHHHHhhllLHHHhhhhhhhh
Query avsaKKKAILSAALDTFSQfGFHG..tRLEQIAELAGVSKTNLLyyfpSKEAlyiavlrq 58
ident | | | |
Sbjct ....ISPQARAFLEEVFRR.KQSLnskEKEEVAKKCGITPLQVR...vWFIN........ 44
DSSP ....LLHHHHHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHHHHHLLLHHHHH...hHHHH........
DSSP hhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg 118
ident
Sbjct ............................................................ 44
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident
Sbjct ............................................................ 44
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...............krmrs 49
DSSP ...............hhhhl
No 82: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHH
Query ............................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAE 32
ident | | | |
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangignglTPTQWAALVRLGETG......pCPQNQLGR 54
DSSP llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHH
DSSP HHLLLHHHHHHHLL...................lhhhhHHHHHHHHHHHHlhhhhlllll
Query LAGVSKTNLLYYFP...................skealYIAVLRQILDIWlaplkafred 73
ident | |
Sbjct LTAXDAATIKGVVErldkrgliqrsadpddgrrllvslSPAGRAELEAGL.......... 104
DSSP HLLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeeelleeeeeeeeeLHHHHHHHHHHH..........
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhHHHHlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query faplaaikeyirlkleVSRDypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliag 133
ident
Sbjct .............aaaREIN........................................ 111
DSSP .............hhhHHHH........................................
DSSP hhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllLLLHHhhHHHHhhhhhhhhh
Query wvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatLRDEVffNQTVenvqriiie 193
ident
Sbjct ......................................rqALAPL..SLQE..qetlrgl 129
DSSP ......................................hhHHLLL..LHHH..hhhhhhh
DSSP hhlll
Query girpr 198
ident
Sbjct larli 134
DSSP hhlll
No 83: 2CG4A MOLECULE: REGULATORY PROTEIN ASNC;
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyiavlrqil 60
ident | | | |||
Sbjct ...yliDNLDRGILEALMGNA..RTAYAELAKQFGVSPETIHVRVEK............. 42
DSSP ...lllLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.............
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct ................................mkqagiitgaRIDV.......spkqlgy 63
DSSP ................................hhhhlleeeeEEEE.......lllllll
DSSP hhhhHHHHhhhHHHHhlllLLLL.............lhHHHH..................
Query kaliDEKSaliAGWVksgkLAPI.............dpQHLI.................. 149
ident
Sbjct dvgcFIGI...ILKS....AKDYpsalaklesldevteAYYTtghysifikvmcrsidal 116
DSSP leeeEEEE...EELL....HHHHhhhhhhhhlllleeeEEEEllllleeeeeeellhhhh
DSSP .................hhhhhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .................fmiwastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriii 192
ident
Sbjct qhvlinkiqtideiqstetlivlqnPIMR............................... 145
DSSP hhhhhhllllllleeeeeeeelleeEEEL...............................
DSSP hhhlll
Query egirpr 198
ident
Sbjct .tikpn 150
DSSP .lllll
No 84: 1WPKA MOLECULE: ADA REGULATORY PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mkkatcltddqrwqsvlardpnadgefvfavrttgifxrpscrarhalrenvsfyanase 60
DSSP llllllllhhhhhhhhhhllllllllleeeelllleeellllllllllllleeeellhhh
DSSP ..................lHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHH
Query ..................aVSAKKKAILSAALDtFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLL 42
ident | | | || | | |
Sbjct alaagfrpckrcqpekanaQQHRLDKITHACRL.LEQE..TPVTLEALADQVAMSPFHLH 117
DSSP hhhhhleeellllllllllLLLHHHHHHHHHHH.LLLL..LLLLHHHHHHHHLLLHHHHH
DSSP HHLL.lhhHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query YYFP.skeALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlf 101
ident |
Sbjct RLFKattgMTPK................................................ 129
DSSP HHHHhhllLLHH................................................
DSSP hhhhhlllLLLHHHHHLHhHHHHhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query cmemlagaPLLMDELTGDlKALIdeksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct .....awqQAWRARRLRE.SLAK..................................... 146
DSSP .....hhhHHHHHHHHHL.LLLL.....................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................................... 146
DSSP .....................................
No 85: 1UFMA MOLECULE: COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;
DSSP .........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHh
Query .........AVSAkKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAl 51
ident | | | |
Sbjct gssgssggsSILD.RAVIEHNLLSASKLYN..NITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMIT. 56
DSSP lllllllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHLLL..EEEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH.
DSSP hHHHHhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHlllll
Query yIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapl 111
ident
Sbjct eGRMN.................................gfidqidgivhfeTREA..... 78
DSSP lLLLL.................................eeeelllleeeelLLLL.....
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhHHHHhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiWASTqhyadfapqveavtg 171
ident |
Sbjct .......................................sgPSSG............... 84
DSSP .......................................llLLLL...............
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query atlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................... 84
DSSP ...........................
No 86: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLH.HHHHHHHLL..LHHHHHHHLL...........
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRL.EQIAELAGV..SKTNLLYYFP........... 46
ident | | |
Sbjct kLNDRQRKVLYCIVREYIENK..KPVSsQRVLEVSNIefSSATIRNDMKkleylgyiyqp 58
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLhHHHHHHLLLllLHHHHHHHHHhhhhllleell
DSSP ...lhhhhHHHHHHHHHHHhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHH..........
Query ...skealYIAVLRQILDIwlaplkafredfaplaaikeyirlkleVSRD.......... 93
ident || |
Sbjct htsagripTDKGLRFYYEE........................mlkISKEtseadlavet 94
DSSP lllllleeLHHHHHHHHHH........................hhhHLLLlllllhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 93
ident
Sbjct fksmpladpekvlflagnllarltegyvlierpntrdlkilrvmlipvsedylifsilte 154
DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllhhhlllleeeeeelllleeeeeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 93
ident
Sbjct fgvskvtpiktqerlnweeierqlnfllrgrtvgevlmgkieslkgsgflrliesliget 214
DSSP leeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhlll
DSSP ...lhhhhhhhhhhHHLLllllhhhhhlhhhhhhhhhhHHHHhhhhlllllllLHHHHhH
Query ...ypqasrlfcmeMLAGapllmdeltgdlkalideksALIAgwvksgklapiDPQHLiF 150
ident
Sbjct veryldaglenllkDETL........tledirnlleevKDQK..........fLESLV.G 255
DSSP llleeeelhhhhhhLLLL........lhhhhhhhhhhlLLHH..........hHHHHL.L
DSSP HHHHhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhHHHH..hHHHH.............
Query MIWAstqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenVQRI..iIEGI............. 195
ident |
Sbjct EGIT............vrigreigrkklekfavfsgKYFKgesPIGSvylftskvtkydr 303
DSSP LLLE............eeehhhhllhhhlleeeeeeEEEElleEEEEeeeeeellllhhh
DSSP .................lll
Query .................rpr 198
ident
Sbjct nhrvfeyilnrlseyftsts 323
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 87: 1JHFA MOLECULE: LEXA REPRESSOR;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLL.LHHHHHHHLL..........lh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFP..........sk 48
ident | | || | || | |
Sbjct kaLTARQQEVFDLIRDHISQTGM.pPTRAEIAQRLGFrSPNAAEEHLKalarkgvieivs 59
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lLLHHHHHHHLLLlLHHHHHHHHHhhhhllleeell
DSSP hhhhhhhHHHHhhHHLHhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHH.......lHHHHhhh
Query ealyiavLRQIldIWLAplkafredfaplaaikeyirlkleVSRD.......yPQASrlf 101
ident | |
Sbjct gasrgirLLQE..EEEG.......................lPLVGrvaadeplLAQQ... 91
DSSP llllleeELLL..LLLL.......................eEEELllllllllLLHH...
DSSP hhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHhhHHHH..
Query cmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhLIFMIWasTQHY.. 159
ident |
Sbjct ...................................hieghyqvdpsLFKPNA..DFLLrv 114
DSSP ...................................heeeeelllhhHLLLLL..LEEEel
DSSP .................................hhlhHHHH...................
Query .................................adfaPQVE................... 167
ident |
Sbjct sgmsmkdigimdgdllavhktqdvrngqvvvariddeVTVKrlkkqgnkvellpensefk 174
DSSP lllllhhhlllllleeeeeelllllllleeeeeelleEEEEeeeeelleeeeelllllll
DSSP ....hhhllllllhhhhhhHHHHhhhhhhhhhlll
Query ....avtgatlrdevffnqTVENvqriiiegirpr 198
ident |
Sbjct pivvdlrqqsftieglavgVIRN............ 197
DSSP leeeellllleeeeeeeeeEEEL............
No 88: 1IRZA MOLECULE: ARR10-B;
DSSP ....LHHHHHH.hHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHL...LLHHHHHhhlLLHHHhh
Query ....AVSAKKK.aILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAG...VSKTNLLyyfPSKEAly 52
ident | | | | |
Sbjct taqkKPRVLWTheLHNKFLAAVDHLGVERAVPKKILDLMNvdkLTRENVA...SHLQK.. 55
DSSP llllLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLlllLLHHHHH...HHHHH..
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllLL
Query iavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapLL 112
ident
Sbjct ........................................................frVA 59
DSSP ........................................................hhHH
DSSP HHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query MDELTgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident
Sbjct LKKVS....................................................... 64
DSSP HHLLL.......................................................
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .......................... 64
DSSP ..........................
No 89: 1ETKA MOLECULE: FACTOR FOR INVERSION STIMULATION;
DSSP ...............................LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHH
Query ...............................AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQ 29
ident |
Sbjct dvltvkplrdsvkqalknyfaqlvndlyelvLAEVEQPLLDMVMAYTR.......GNQTR 53
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL.......LLHHH
DSSP HHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query IAELAGVSKTNLLYYFPskealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlkle 89
ident | | |
Sbjct AALMMGINRGTLRKKLK........................................... 70
DSSP HHHHHLLLHHHHHHHHH...........................................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli 149
ident
Sbjct ............................................................ 70
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................................kygmn 75
DSSP ............................................hllll
No 90: 2NS0A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhHHLLHHHHHHHHL.....lLHHHHHHHLL......LH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQF.gfHGTRLEQIAELAG.....vSKTNLLYYFP......SK 48
ident |
Sbjct .xtVSDRELEECIRALLDARadsASICPSDVARAVApddwrpLXEPVREAAGrladagEV 59
DSSP .llLLHHHHHHHHHHHHHHLlllLLLLHHHHHHHHLllllhhHHHHHHHHHHhhhhllLE
DSSP HHhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query EAlyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident |
Sbjct EV........................................tqkgavvdprsargpiri 79
DSSP EE........................................eelleellllllllllee
DSSP llLLHHhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apLLMDeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident |
Sbjct rwTRTD...................................................... 85
DSSP eeLLLL......................................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 85
DSSP ..............................
No 91: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL..HHHHHHHHL.............lLHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTR..LEQIAELAG.............vSKTN 40
ident || |
Sbjct naealQLNSTEVRILGCLIEKQATNP.ETYPltLNALVIACNqktsrdpvxnltqgQVGQ 59
DSSP lllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHLLeeHHHHHHHHLllllllllllllhhHHHH
DSSP HHHHLL............lhhhHHHH....hhHHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhh
Query LLYYFP............skeaLYIA....vlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyi 84
ident |
Sbjct SLRALEgrgltrlvxgsradrwEHKVdkglelVPAQ............viltgllllrgp 107
DSSP HHHHHHhllleeeelllllleeEELHhhhhllLHHH............hhhhhhhhhhll
DSSP hHHHHHHHHLHhhhHHHHhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query rLKLEVSRDYPqasRLFCmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapid 144
ident | |
Sbjct qTVSELLTRSN...RXHD.......................................... 122
DSSP eEHHHHHHHLL...LLLL..........................................
DSSP hhhhhhhhHHHHHHhhhlhhhhhhhhllllllhhhhHHHHhhhhhhhhhhhlll
Query pqhlifmiWASTQHyadfapqveavtgatlrdevffNQTVenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......feDSEQVV..hqlerliarglatlvprqsgQREDryxhligdpedlqd 168
DSSP ......llLHHHHH..hhhhhhhhllleeeelllllLLLLeeeellllhhhhll
No 92: 1XMKA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;
DSSP ...lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLL.LHHHHHHHLLlhhhhhhhhh
Query ...aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFPskealyiavl 56
ident | | | | |
Sbjct gshmASLDMAEIKEKICDYLFNVSD..SSALNLAKNIGLtKARDINAVLI.......... 48
DSSP llllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..EEHHHHHHHHLHhHHHHHHHHHH..........
DSSP hhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHHllllllhhhh
Query rqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMLagapllmdel 116
ident
Sbjct ....................dmerqgdvyrqgttppiwhltdkkRERMQI.......... 78
DSSP ....................hhhhllleeeellllleeeelhhhHLLLLL..........
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 78
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .....................k 79
DSSP .....................l
No 93: 1UMQA MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;
DSSP .............lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLL
Query .............avSAKKKAILSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPS 47
ident || | |
Sbjct lakgeslppppenpmSADRVRWEHIQRIYEMCD....RNVSETARRLNMHRRTLQRILAK 56
DSSP lllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query kealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemla 107
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP lllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query gapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqve 167
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query avtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........................rspr 60
DSSP ...........................llll
No 94: 1FX7A MOLECULE: IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLL...LHHHHHHHLL.........
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV...SKTNLLYYFP......... 46
ident | | |||
Sbjct mnELVDTTEMYLRTIYDLEEEGVT..PLRARIAERLDQsgpTVSQTVSRMErdgllrvag 58
DSSP llLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHLLlhhHHHHHHHHHHhllleeell
DSSP ..lHHHHhHHHHHHHHHHH................................lhHHHLlll
Query ..sKEALyIAVLRQILDIW................................laPLKAfre 72
ident | |
Sbjct drhLELTeKGRALAIAVMRkhrlaerllvdviglpweevhaeacrwehvmsedVERR... 115
DSSP lllEEELhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllhhHHHH...
DSSP lllhhhhHHHHHHhhHHHHHHLHhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
Query dfaplaaIKEYIRlkLEVSRDYPqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksalia 132
ident |
Sbjct .....lvKVLNNP..TTSPFGNP..................................... 131
DSSP .....hhHHLLLL..LLLLLLLL.....................................
DSSP hhhhllllllllhhhHHHHhhhhhhhhhHLHHH........hhhhhLLLL..........
Query gwvksgklapidpqhLIFMiwastqhyaDFAPQ........veavtGATL.......... 174
ident | |
Sbjct ........ipgldelGVGP.....epgaDDANLvrltelpagspvaVVVRqltehvqgdi 178
DSSP ........lllhhhhLLLL.....llllLLLLLeehhhlllllleeEEEEeelhhhhllh
DSSP ............LLHH................hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ............RDEV................ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct dlitrlkdagvvPNARvtvettpgggvtivipghenvtlphemahavkvekv 230
DSSP hhhhhhhhllllLLLEeeeeellllleeeelllllleeelhhhhlleeeeel
No 95: 1EH6A MOLECULE: O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct cemkrttldsplgklelsgceqglheikllgevpapaavlggpeplmqctawlnayfhqp 60
DSSP llleeeeelllllleeeeeelleeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlh
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHLLHHHHHHHHLL..LHHHHH
Query ................AVSAKKKAILSAALDTFSqfgfHGTRLEQIAELAGV..SKTNLL 42
ident | | | | |||
Sbjct eaieefpvpalhhpvfQQESFTRQVLWKLLKVVK..fgEVISYQQLAALAGNpkAARAVG 118
DSSP hhhhhllllllllhhhHLLLHHHHHHHHHHHHLL..llLLEEHHHHHHHLLLllLHHHHH
DSSP HHLL.....lhhHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query YYFP.....skeALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqa 97
ident
Sbjct GAMRgnpvpiliPCHR.....................................vvcssga 141
DSSP HHLLllllllllLHHH.....................................eelllll
DSSP hhhhhhhhhllLLLLH.....hhHHLHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhh
Query srlfcmemlagAPLLM.....deLTGDlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmi 152
ident || |
Sbjct vgnysgglavkEWLLAheghrlgKPGL................................. 168
DSSP lllllllhhhhHHHHHhllllllLLLL.................................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query wastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................................. 168
DSSP ..............................................
No 96: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .....LHHHhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLHHHHHHHHLLLHHHHHHH..lllhhhhHH
Query .....AVSAkKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYY..fpskealYI 53
ident | | |
Sbjct pllrrLDLN.LLLVFDALYRHR........NVGTAASELAISASAFSHAlgrlrqgldDE 51
DSSP lllllLLLL.HHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHLLLHHHHHHHhhhhhhhhlLL
DSSP HH..........hHHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query AV..........lRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcm 103
ident |
Sbjct LFlrqgnrmqptqRAEH................................laaavaaalra 79
DSSP LEeeelleeeelhHHHH................................hhhhhhhhhhh
DSSP hhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query emlagapllmdeltgdlkalideksaliagwVKSGKlapidpqhlifmiwastqhyadfa 163
ident
Sbjct lgegleewrpfvpgqsqrtfvfaatdytafaLLPPL..........mnrlqhsapgvrlr 129
DSSP hhhhlhhhlllllllllleeeeellhhhhhhHHHHH..........hhhhhhhlllleee
DSSP hhhhhhhllllllHHHH...........................................
Query pqveavtgatlrdEVFF........................................... 180
ident
Sbjct lvnaerklsvealASGRidfalgydeeherlpegiqahdwfadryvvvarrdhprlagap 189
DSSP eelllllllhhhhHHLLlleeeellllllllllleeeeeeeeeleeeeeellllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 180
ident
Sbjct tlegylaerhavvtpwnedsgvidrllarsglrrevavqlptvlaalflagstdflltap 249
DSSP lhhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhlllleeeee
DSSP ..............................hhhhHHHHHHHHHHHLLL..
Query ..............................nqtvENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident |
Sbjct rhaaralaeaaglalypapfdippyvlrlyshvqGRDAHAWMIGQLKGld 299
DSSP hhhhhhhhhhhleeeelllllllleeeeeeeellLLHHHHHHHHHLLLll
No 97: 2DT5A MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP .LHHHHHHHhHHHHHHHHHHHH...hHHLLHHHHHHHHLL...LHHHHHHHLLL......
Query .AVSAKKKAiLSAALDTFSQFG...fHGTRLEQIAELAGV...SKTNLLYYFPS...... 47
ident | | | | | || || | | || |
Sbjct kVPEAAISR.LITYLRILEELEaqgvHRTSSEQLGGLAQVtafQVRKDLSYFGSygtrgv 59
DSSP lLLHHHHHH.HHHHHHHHHHHHhlllLEELHHHHHHHHLLlhhHHHHHHHHLLLllllll
DSSP ...hHHHHHHHHH..HHHHhHLHH......................HHLL..........
Query ...kEALYIAVLR..QILDiWLAP......................LKAF.......... 70
ident |
Sbjct gytvPVLKRELRHilGLNR.KWGLcivgmgrlgsaladypgfgesfELRGffdvdpekvg 118
DSSP leehHHHHHHHHHhhLLLL.LEEEeeelllhhhhhhhhllllllleEEEEeeelllllll
DSSP ........llllLHHHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhh
Query ........redfAPLAAIkeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlka 122
ident
Sbjct rpvrggviehvdLLPQRV.......................................... 136
DSSP leelleeeeehhHHHHHL..........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhHHHHH
Query lideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdeVFFNQ 182
ident
Sbjct ............................................pgrieialltvPREAA 152
DSSP ............................................llllleeeellLHHHH
DSSP HHHHHH..........................................hhhhhhhlll
Query TVENVQ..........................................riiiegirpr 198
ident
Sbjct QKAADLlvaagikgilnfapvvlevpkevavenvdflagltrlsfailnpkwreemmg 210
DSSP HHHHHHhhhhllleeeelllllllllllleeeelllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhl
No 98: 1U78A MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;
DSSP .lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhh
Query .avSAKKKAILSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyiavlrqi 59
ident || | | |
Sbjct prgSALSDTERAQLDVMKLLN....VSLHEMSRKISRSRHCIRVYLK.........dpvs 47
DSSP lllLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.........lhhh
DSSP hhhhlhhhHLLLLLL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ldiwlaplKAFREDF.APLAaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg 118
ident
Sbjct ygtskrapRRKALSVrDERN.........................viraasnscktardi 82
DSSP llllllllLLLLLLHhHHHH.........................hhhhhhhllllhhhh
DSSP hhhhhhhhHHHHHHHHHHLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideKSALIAGWVKSGklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident | |
Sbjct rnelqlsaSKRTILNVIKRS........................................ 102
DSSP hhhlllllLHHHHHHHHHHL........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................g 103
DSSP ...................l
No 99: 1T98A MOLECULE: CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;
DSSP ...............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL...HHHHHHHHL.......
Query ...............AVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTR...LEQIAELAG....... 35
ident | | |
Sbjct vpelvawarkndfsiSLPVDRLSFLLAVATLNGERldGEXSegeLVDAFRHVSdafeqts 60
DSSP llhhhhhhhhhllleEELHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLLLhhhHHHHHHHHHhhlllll
DSSP ....lLHHHHHHHLL.........lhhhhhHHHHHHHH.hHHLHhhhlllllllhHHHHh
Query ....vSKTNLLYYFP.........skealyIAVLRQIL.dIWLAplkafredfapLAAIk 81
ident |
Sbjct etigvRANNAINDXVrqrllnrftiyrltpLGIGITDYyiRQRE.........fsTLRL. 110
DSSP llhhhHHHHHHHHHHhhlleeellleeelhHHHHHHHHhhLLLL.........llHHHH.
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHHLL...
Query eyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksalIAGWVKSG... 138
ident
Sbjct ..............................................sxqLSIVAGELkra 124
DSSP ..............................................hhhHHHHHHHHhhh
DSSP ......................llllllhhhHHHHHHHHHHHHhhlhhHHHHHHL.....
Query ......................klapidpqhLIFMIWASTQHYadfapQVEAVTG..... 171
ident |
Sbjct adaaeeggdefhwhrnvyaplkysvaeifdsIDLTQRLXDEQQ.qqvkDDIAQLLnkdwr 183
DSSP hhhhhllllhhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhHHHHHHHHHHHH.hhhhHHHHHHHhhlhh
DSSP llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.................................
Query atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR................................. 198
ident |
Sbjct aaisSCELLLSETSGTLRELQDTLEAAgdklqanllriqdatxthddlhfvdrlvfdlqs 243
DSSP hhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhh
DSSP .......................
Query ....................... 198
ident
Sbjct kldriiswgqqsidlwigydrhv 266
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 100: 1D8JA MOLECULE: GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLH.HHHHHHHLLL.......hhhhhHHL
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRL.EQIAELAGVS.......ktnllYYF 45
ident | |
Sbjct alsgssgYKFGVLAKIVNYMKTRHQRGDT.HPLTlDEILDETQHLdiglkqkqwlmtEAL 59
DSSP lllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLhHHHHHHHLLLlllhhhhhhhhlLHH
DSSP LlhhhhhHHHHhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHH
Query PskealyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEM 105
ident
Sbjct V....nnPKIE.....................................vidgkyafkPKY 78
DSSP H....hlLLEE.....................................elllleeelLLL
DSSP Hllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query Lagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapq 165
ident
Sbjct N........................................................... 79
DSSP L...........................................................
DSSP hhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query veavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...............................vr 81
DSSP ...............................ll
No 101: 1YOVA MOLECULE: AMYLOID PROTEIN-BINDING PROTEIN 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kllkeqkydrqlrlwgdhgqealesahvclinatatgteilknlvlpgigsftiidgnqv 60
DSSP lhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhleeeellllhhhhhhhhhhhllllleeeeelllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sgedagnnfflqrssigknraeaameflqelnsdvsgsfveespenlldndpsffcrftv 120
DSSP lhhhhhhlllllhhhllllhhhhhhhhhhllllllllleelllhhhhhhllhhhhhhlle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vvatqlpestslrladvlwnsqipllicrtyglvgymriiikehpvieshpdnaledlrl 180
DSSP eeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeelleeeeeeellleeellllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dkpfpelrehfqsydldhmekkdhshtpwiviiakylaqwysetngripktykekedfrd 240
DSSP llllhhhhhhhhllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lirqgilknengapedeenfeeaiknvntalnttqipssiedifnddrcinitkqtpsfw 300
DSSP hhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllhhhhlllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ilaralkefvakegqgnlpvrgtipdmiadsgkyiklqnvyrekakkdaaavgnhvakll 360
DSSP hhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......................................................LHHHHH
Query ......................................................AVSAKK 6
ident
Sbjct qsigqapesisekelkllcsnsaflrvvrcrslaeeygldtinkdeiissmdnpDNEIVL 420
DSSP hllllllllllhhhhhhhhhllllleeellllhhhhhllllllhhhhhhhllllLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHH........hhlLHHHHHHHHL...........llHHHHHHHLLL
Query KAILSAALDTFSQFGF........hgtRLEQIAELAG...........vsKTNLLYYFPS 47
ident | | | |
Sbjct YLMLRAVDRFHKQQGRypgvsnyqveeDIGKLKSCLTgflqeyglsvmvkDDYVHEFCRY 480
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLllllllllhhhHHHHHHHHHHhhhhhhlllllllHHHHHHHHHL
DSSP HHHhhhhhhhhhHHHHLHHHHLL...LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query KEAlyiavlrqiLDIWLAPLKAF...REDFaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcme 104
ident | | |
Sbjct GAA..ephtiaaFLGGAAAQEVIkiiTKQF.............................. 508
DSSP LLL..llhhhhhHHHHHHHHHHHhhhHLLL..............................
DSSP hhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query mlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfap 164
ident
Sbjct ............................................................ 508
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............vifnntyiysgmsqtsatfql 529
DSSP .............llllleeeeelllleeeeell
No 102: 1IV6A MOLECULE: TELOMERIC REPEAT BINDING FACTOR 1;
DSSP ..LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LLHHHHHhhhlllhhhHHHHllLHHHHHHHHH
Query ..AVSAkKKAILSAALDTFSQFGFHG..TRLEQIAelagvsktnLLYYfpSKEALYIAVL 56
ident | | |
Sbjct rkRQAW.LWEEDKNLRSGVRKYGEGNwsKILLHYK.........FNNR..TSVMLKDRWR 48
DSSP llLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHLLLLhhHHHHHLL.........LLLL..LHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct TMKKLKL..................................................... 55
DSSP HHHHHHL.....................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 55
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................is 57
DSSP ....................ll
No 103: 1B72B MOLECULE: PROTEIN (HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1);
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL....HHHHHHHHLLLHHHHHHhlllHHHHHHhh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTR....LEQIAELAGVSKTNLLYyfpsKEALYIav 55
ident | | | | | |
Sbjct rkRRNFNKQATEILNEYFYSHLsNPYPseeaKEELAKKCGITVSQVSN...wFGNKRI.. 55
DSSP llLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLlhhhHHHHHHHHLLLHHHHHH...hHHHHHH..
DSSP hhhhHHHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHHHHhhhhhllllllhhh
Query lrqiLDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdyPQASRLFcmemlagapllmde 115
ident |
Sbjct rykkNIGK.............................fqEEANIYA.............. 72
DSSP hhhhLHHH.............................hhHHHHHLL..............
DSSP hhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllll
Query ltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlr 175
ident
Sbjct ............................................................ 72
DSSP ............................................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query devffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................a 73
DSSP ......................l
No 104: 2V1XA MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sspaawnkedfpwsgkvkdilqnvfklekfrplqletinvtmagkevflvmptgggkslc 60
DSSP llhhhhlllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeellllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yqlpalcsdgftlvicplislmedqlmvlkqlgisatmlnassskehvkwvhaemvnkns 120
DSSP hhhhhhlllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhllleeellllllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct elkliyvtpekiakskmfmsrlekayearrftriavdevhccsqwghdfrpdykalgilk 180
DSSP llleeeelhhhhhllhhhhhhhhhhhhllleeeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rqfpnasligltatatnhvltdaqkilciekcftftasfnrpnlyyevrqkpsntedfie 240
DSSP hhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhlllllleeeellllllleeeeeeellllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct divklingrykgqsgiiycfsqkdseqvtvslqnlgihagayhanlepedkttvhrkwsa 300
DSSP hhhhhhllllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct neiqvvvatvafgmgidkpdvrfvihhsmsksmenyyqesgragrddmkadcilyygfgd 360
DSSP lllleeeelllllllllllleeeeeellllllhhhhhhhhllllllllleeeeeeelhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ifrissmvvmenvgqqklyemvsycqniskcrrvlmaqhfdevwacnkmcdncckdsafe 420
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhllllllllllhhhhllllee
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHL....................lLH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAG....................vSK 38
ident
Sbjct rkNITEYCRDLIKILKQAEELNEK..LTPLKLIDSWMgkgaaklrvagvvaptlpredLE 478
DSSP eeELHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHHHHHHLllllhhhlllllllllllhhhHH
DSSP HHHHHHL....LLHH..........hHHHHhhHHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhh
Query TNLLYYF....PSKE..........aLYIAvlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyi 84
ident | | |
Sbjct KIIAHFLiqqyLKEDysftayatisyLKIG.pKANL........................ 513
DSSP HHHHHHHhlllEEEEeeelllleeeeEEEL.hHHHH........................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query rlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapid 144
ident
Sbjct ............................................................ 513
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query pqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................................lnneahaitmqvtk 527
DSSP ........................................hhlllllleeeeel
No 105: 2P5VA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyIAVLRqil 60
ident | | | | | | |
Sbjct ..qltlDKTDIKILQVLQENG..RLTNVELSERVALSPSPCLRRLKQLED.aGIVRQ... 52
DSSP ..llllLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.lLLEEE...
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct .........................................yAALL........spesvn 63
DSSP .........................................eEEEE........llhhhl
DSSP hhhhhhhhhHHHHhhHLLLLLL.llhhhhhhhHHHH........................
Query kalideksaLIAGwvKSGKLAP.idpqhlifmIWAS........................ 155
ident |
Sbjct lglqafirvSIRK..AKDAREDfaasvrkwpeVLSCfaltgetdyllqafftdxnafshf 121
DSSP lleeeeeeeEELL..LLLHHHHhhhhhlllllEEEEeeellllleeeeeeellhhhhhhh
DSSP ....hhhhhhlhhhhhhHHLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ....tqhyadfapqveaVTGATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct vldtllshhgvqdaqssFVLKEIK............httslplnhll 156
DSSP hhhllllllleeeeeeeEEEEEEE............ellllllhhhl
No 106: 2P4WA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;
DSSP .......lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhH
Query .......avsakkKAILSAALDTFSQFGfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyI 53
ident | || |
Sbjct mgeelnrlldvlgNETRRRILFLLTKRP...YFVSELSRELGVGQKAVLEHLRileeagL 57
DSSP llhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHHHLL...EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllL
DSSP HHH.................hhhhHHHLhhhHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query AVL.................rqilDIWLaplKAFRedfaplaaikeyirlklevsrdypq 96
ident |
Sbjct IESrvekiprgrprkyymikkglrLEIL...LTPT......................... 89
DSSP EEEeellllllllleeeeellleeEEEE...EELL.........................
DSSP hhhhhhhhhhllllllhHHHHlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhh
Query asrlfcmemlagapllmDELTgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwast 156
ident |
Sbjct ...........lfgsemYEAK.........................gvrkspeyeqakel 113
DSSP ...........eeeeeeEELL.........................lllllhhhhhhhhh
DSSP hhhhhlhhHHHHHHllllllhhhhhhHHHHHHHHH.........................
Query qhyadfapQVEAVTgatlrdevffnqTVENVQRII......................... 191
ident |
Sbjct iksqepinVKMREL........aeflHELNERIREiieekreleearilietyientmrr 165
DSSP hlllllhhHHHHHH........hhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................hhhhlll
Query .........................iegirpr 198
ident
Sbjct laeenrqiieeifrdiekilppgyarslkekf 197
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlll
No 107: 2OQGA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY
DSSP ................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident || | ||
Sbjct gxtvgtyaelasvfaalSDETRWEILTELGRAD.......QSASSLATRLPVSRQAIAKH 53
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHLL.......LLHHHHHHHLLLLHHHHHHH
DSSP LL............lhhhhhhhHHHHHHHHHLH.HHHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query FP............skealyiaVLRQILDIWLA.PLKAFRedfaplaaikeyirlklevs 91
ident | |
Sbjct LNalqacglvesvkvgreiryrALGAELNKTARtLERIGA.................... 93
DSSP HHhhhhllleeeeeelleeeeeELLHHHHHHHHhHHHHHH....................
DSSP hhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhHHHHHHHLLllllllhhhhhhh
Query rdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaLIAGWVKSGklapidpqhlifm 151
ident |
Sbjct ...................................ewdRRLAAIKQI............. 105
DSSP ...................................hhhHHHHHHHHH.............
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query iwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........................................aesx 109
DSSP ...........................................hlll
No 108: 2FRHA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;
DSSP .................................lHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhHLLH
Query .................................aVSAKKKAILSAALDtFSQFgfhGTRL 27
ident | | | |
Sbjct gshmaitkindcfellsmvtyadklkslikkefsISFEEFAVLTYISE.NKEK...EYYL 56
DSSP lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHH.LLLL...EEEH
DSSP HHHHHHHLLLHHHHHHHLL.......................lhhhhhhhHHHHHHHHHL
Query EQIAELAGVSKTNLLYYFP.......................skealyiaVLRQILDIWL 64
ident |
Sbjct KDIINHLNYKQPQVVKAVKilsqedyfdkkrnehdertvlilvnaqqrkkIESLLSRVNK 116
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHhhhhlllllllllllllllleeelllhhhhhHHHHHHHHHH
DSSP H.HHHL.LLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhh
Query A.PLKA.FREDfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlka 122
ident |
Sbjct RiTEANnEIEL................................................. 127
DSSP HhHHHHhHLLL.................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhh
Query lideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnq 182
ident
Sbjct ............................................................ 127
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhlll
Query tvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................ 127
DSSP ................
No 109: 1Q1HA MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR E;
DSSP ..............lHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL
Query ..............aVSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | || | ||
Sbjct mvnaedlfinlakslLGDDVIDVLRILLD.KGTE....MTDEEIANQLNIKVNDVRKKLN 55
DSSP llllllhhhhhhhllLLLLLHHHHHHHHH.HLLL....LLHHHHHHLLLLLHHHHHHHHH
DSSP lhhhhhHHHH..............hHHHHHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query skealyIAVL..............rQILDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsr 92
ident | | |
Sbjct .lleeqGFVSyrktrsgwfiyywkpNIDQIN............................. 85
DSSP .hhhhhLLLEeeeellllleeeeelLHHHHL.............................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhh
Query dypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmi 152
ident
Sbjct ............................................................ 85
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query wastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................................. 85
DSSP ..............................................
No 110: 1MKMA MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhhhhhhhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqil 60
ident | | ||| | | | |
Sbjct ..MNTLKKAFEILDFIVKNPG..DVSVSEIAEKFNMSVSNAYKYMVVLEE.......... 46
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH..........
DSSP hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllLLLHHHHHLhH
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagaPLLMDELTGdL 120
ident |
Sbjct ..................................kgfvlrkkdkryvpgYKLIEYGSF.V 71
DSSP ..................................llleeellllleeelLHHHHHHHH.H
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhllllllllhHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query KALIdeksaliagwvksgklapidpQHLIFMiwastqhyadfapqveavtgatlrdevff 180
ident
Sbjct LRRF.....................NIRDIA...........................hd 83
DSSP HHHL.....................LHHHHH...........................hh
DSSP hhhhhhhhhhhhHHHL............................................
Query nqtvenvqriiiEGIR............................................ 196
ident
Sbjct hlvdimkrtgetVHLIlkdgfegvyidkvegeqsipmvsrlgmkvdlystasgksilafv 143
DSSP hhhhhhhlllllEEEEeellleeeeeeeelllllllllllllleeellllhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 196
ident
Sbjct pekelkeylkivelkpktpntitnprvlkrelekirkrgyavdneeneigimcvgvpifd 203
DSSP lhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllleeeeeeeeel
DSSP .........................................ll
Query .........................................pr 198
ident
Sbjct hngypvagvsisgvarkfteekieeysdvlkekaeeisrklgy 246
DSSP lllleeeeeeeeeehhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
No 111: 1K6YA MOLECULE: POL POLYPROTEIN;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHhhlllHHHH.........
Query avsaKKKAILSAALDTFSQfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLyyfpsKEAL......... 51
ident | | |
Sbjct ....FLDGIDKAQEEHEKY....hSNWRAMASDFNLPPVVAK...eiVASCdkcqlkcsp 49
DSSP ....LLLHHHHHHHHHHHH....lLLHHHHHHHHLLLHHHHH...hhHHHLlllllllll
DSSP ..........hhhhhhhhhhhhlhhhhllLLLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query ..........yiavlrqildiwlaplkafREDFAPlaaikeyirlklevsrdypqasrlf 101
ident
Sbjct giwqldcthlegkvilvavhvasgyieaeVIPAET......................... 84
DSSP leeeeeeeeelleeeeeeeelllleeeeeEELLLL.........................
DSSP hhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhHHHH...............hhhlLLLL...LL
Query cmemlagapllmdeltgdlkalideksaLIAG...............wvksGKLA...PI 143
ident |
Sbjct ..........................gqETAYfllklagrwpvktvhtdngSNFTsttVK 118
DSSP ..........................hhHHHHhhhhhhhhlllleeellllLLLLlhhHH
DSSP LH...................hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhh
Query DP...................qhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtv 184
ident
Sbjct AAcdwagikqedgviesmnkelkkiigqvrdqaehlktavqmavfihnkkrkggiggysa 178
DSSP HHhhhhlleelllhhhhhhhhhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllllh
DSSP hhhhhhhhhhhlll
Query envqriiiegirpr 198
ident
Sbjct gerivdiiatdiqt 192
DSSP hhhhhhhhhhhhhl
No 112: 1HLVA MOLECULE: MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;
DSSP .......lHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhh
Query .......aVSAKKKAILSAAldtfsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyi 53
ident | | | || |
Sbjct mgpkrrqlTFREKSRIIQEV......eenpDLRKGEIARRFNIPPSTLSTILK...nkra 51
DSSP llllllllLHHHHHHHHHHH......hhllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH...lhhh
DSSP hhHHHHHHH................hlhhhHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query avLRQILDI................wlaplKAFRedfaplaaikeyirlklevsrdypqa 97
ident |
Sbjct ilASERKYGvastcrktnklspydklegllIAWF.......................... 85
DSSP hhHHHHHHHhhhhllllllllllhhhhhhhHHHH..........................
DSSP hhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHhhh
Query srlfcmemlagapllmdeltgdlkalIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWAstq 157
ident
Sbjct ...............qqiraaglpvkGIILKEKALRIAEELGMDDFTASNGWLDRFR... 127
DSSP ...............hhhhhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHH...
DSSP hhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query hyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .....................................rrrs 131
DSSP .....................................hhll
No 113: 1GDTA MOLECULE: PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mrlfgyarvstsqqsldiqvralkdagvkanriftdkasgsssdrkgldllrmkveegdv 60
DSSP lleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeellllllllhhhhhhhhhllllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ilvkkldrlgrdtadmiqlikefdaqgvsirfiddgistdgemgkmvvtilsavaqaerq 120
DSSP eeellhhhllllhhhhhhhhhhhhhllleeeehhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .....................LHHHHhhHHHHHHHHHHHHhhhhhLLHHHHHHHHLLLHH
Query .....................AVSAKkkAILSAALDTFSQfgfhgTRLEQIAELAGVSKT 39
ident |
Sbjct rilertnegrqeamakgvvfgRKRKI..DRDAVLNMWQQG.....LGASHISKTMNIARS 173
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLLL..LHHHHHHHHHLL.....LLHHHHHHHHLLLHH
DSSP HHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query NLLYYFPskealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr 99
ident
Sbjct TVYKVIN..................................................... 180
DSSP HHHHHHH.....................................................
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct ............................................................ 180
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................esn 183
DSSP ....................................lll
No 114: 1FJLA MOLECULE: PROTEIN (SEGMENTATION PROTEIN PAIRED);
DSSP ....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHH..lLHHHHHHHHLLLHHHHHhhlLLHHHhhhh
Query ....aVSAKKKAILSAALDTFSQfGFHG..tRLEQIAELAGVSKTNLLyyfPSKEAlyia 54
ident | | | |
Sbjct kqrrsRTTFSASQLDELERAFER.TQYPdiyTREELAQRTNLTEARIQ...VWFQN.... 52
DSSP lllllLLLLLHHHHHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHHHHHLLLHHHHH...HHHHH....
DSSP hhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllLLHH
Query vlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapLLMD 114
ident |
Sbjct .....................................................rraRLRK 59
DSSP .....................................................hhhHHHH
DSSP HHHLHHhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllll
Query ELTGDLkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatl 174
ident |
Sbjct QHTSVS...................................................... 65
DSSP HHHHHL......................................................
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query rdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................ 65
DSSP ........................
No 115: 2FUG2 MOLECULE: NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;
DSSP .................LHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHH...hlLLHHH
Query .................AVSAKkKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAEL...agVSKTN 40
ident || | | | | | |
Sbjct ffddkqdfleetfakypPEGRR.AAIMPLLRRVQQEEGW..IRPERIEEIarlvgTTPTE 57
DSSP lllllhhhhhhhhhlllLLLHH.HHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHhhhhlLLHHH
DSSP HHHHLLLhhhhhhhhHHHHhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query LLYYFPSkealyiavLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrl 100
ident |
Sbjct VMGVASF......ysYYQF......................................... 70
DSSP HHHHHHH......llLLLL.........................................
DSSP hhhhhHLLL....................................LLLHHhhhLHHHhhH
Query fcmemLAGA....................................PLLMDeltGDLKalI 124
ident |
Sbjct vptgkYHLQvcatlscklagaeelwdyltetlgigpgevtpdglfSVQKV...ECLG..S 125
DSSP lllllEEEEeellhhhhlllhhhhhhhhhhhhlllllllllllleEEEEE...LLLL..L
DSSP HHHH........hhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhHHHHhhhhlhhhhhhhhllllll
Query DEKS........aliagwvksgklapidpqhlifmiwASTQhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct CHTApviqvndepyvecvtrarleallaglragkrleEIEL................... 166
DSSP LLLLlleelllllllllllhhhhhhhhhhhhllllhhHLLL...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..........pgkcghhvheve 178
DSSP ..........llllllllllll
No 116: 2DA7A MOLECULE: ZINC FINGER HOMEOBOX PROTEIN 1B;
DSSP ........lhHHHHHHhHHHHHHHHHHhHHHH..lLHHHHHHHHLLLHHHHHhhlLLHHH
Query ........avSAKKKAiLSAALDTFSQfGFHG..tRLEQIAELAGVSKTNLLyyfPSKEA 50
ident | | | | | |
Sbjct gssgssgspiNPYKDH.MSVLKAYYAM.NMEPnsdELLKISIAVGLPQEFVK...EWFEQ 55
DSSP llllllllllLLLLHH.HHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHHHHHLLLHHHHH...HHHHH
DSSP hhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllll
Query lyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagap 110
ident
Sbjct ........................................................rkvy 59
DSSP ........................................................hhhh
DSSP LLHHHhHLHHhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query LLMDElTGDLkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavt 170
ident
Sbjct QYSNS.RSGP.................................................. 68
DSSP HHLLL.LLLL..................................................
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .........................ssg 71
DSSP .........................lll
No 117: 2BFGA MOLECULE: BETA-XYLOSIDASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gvvnvpsngrekfkknwkfcvgtgrlglalqkeyldhlklvqekigfryirghgllsddv 60
DSSP leeellllllllllhhhhleeeellhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct giyreveidgemkpfynftyidrivdsylalnirpfiefgfmpkalasgdqtvfywkgnv 120
DSSP lleelleelleelleellhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllhhhllllleelllleel
DSSP ..............................................LHHHHHHHHHHHHH
Query ..............................................AVSAKKKAILSAAL 14
ident |
Sbjct tppkdynkwrdlivavvshfierygieevrtwlfevwnapnlvnfwKDANKQEYFKLYEV 180
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhllleeeellllllllllHHHLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH..hHHLLhhHHHH...hhllLHHHHHHHLLLhHHHH.................
Query DTFSQFG..fHGTRleQIAE...lagvSKTNLLYYFPSkEALY................. 52
ident | | |
Sbjct TARAVKSvdpHLQV..GGPAicggsdeWITDFLHFCAE.RRVPvdfvsrhaytskaphkk 237
DSSP HHHHHHHhllLLEE..EEEEelllllhHHHHHHHHHHH.LLLLlleeeeeelllllllee
DSSP ..................................hhhhhhhhhhhlhhhhlLLLL.....
Query ..................................iavlrqildiwlaplkaFRED..... 73
ident
Sbjct tfeyyyqeleppedmleqfktvralirqspfphlplhiteyntsyspinpvHDTAlnaay 297
DSSP lllleelllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeellllllllhhHHLHhhhhh
DSSP ............llhhhhhhHHHHH...................................
Query ............faplaaikEYIRL................................... 86
ident
Sbjct iarilseggdyvdsfsywtfSDVFEemdvpkalfhggfglvalhsipkptfhaftffnal 357
DSSP hhhhhhhhhhllleeeelllLLLLLllllllllllllllleellleelhhhhhhhhhlll
DSSP ....................hhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhh
Query ....................klevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalide 126
ident
Sbjct gdellyrdgemivtrrkdgsiaavlwnlvmekgegltkevqlvipvsesavfikrqivne 417
DSSP lleeeeeelleeeeellllleeeeeeelllllllllleeeeeeeelllleeeeeeeeell
DSSP hhhHHHHHHHLLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
Query ksaLIAGWVKSGKLApidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtven 186
ident |
Sbjct qygNAWRVWKQMGRP............................................. 432
DSSP lllLHHHHHHHLLLL.............................................
DSSP hhhhhhhhHLLL................................................
Query vqriiiegIRPR................................................ 198
ident |
Sbjct ........RFPSrqavetlrqvaqphvmteqrratdgvihlsivlsknevtlieieqvrd 484
DSSP ........LLLLhhhhhhhhhhllleeeeeeeelllleeeeeeeellleeeeeeeeelll
DSSP .................
Query ................. 198
ident
Sbjct etstyvglddgeitsys 501
DSSP lhhhlllllhhhlllll
No 118: 1U2WA MOLECULE: CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;
DSSP ........................lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLL
Query ........................avsakkKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV 36
ident | || ||
Sbjct gydeekvnriqgdlqtvdisgvsqilkaiaDENRAKITYALCQDEE..LCVCDIANILGV 58
DSSP lllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHHHLLL..EEHHHHHHHHLL
DSSP LHHHHHHHLL..lhhHHHH............hhhhHHHHHHLHhHHLLlllllhhhhhhh
Query SKTNLLYYFP..skeALYI............avlrQILDIWLApLKAFredfaplaaike 82
ident |
Sbjct TIANASHHLRtlykqGVVNfrlalyslgdehirqiMMIALAHK.KEVK............ 105
DSSP LHHHHHHHHHhhhhlLLEEellleeeellhhhhhhHHHHHHHH.LLLL............
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query yirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklap 142
ident
Sbjct ............................................................ 105
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query idpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................................................ 105
DSSP ........................................................
No 119: 1R71A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;
DSSP ...........LHHHHHHHhHHHHHHHHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLllhh
Query ...........AVSAKKKAiLSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFpske 49
ident || | |
Sbjct eadqvienlqrNELTPREI.ADFIGRELAKG....KKKGDIAKEIGKSPAFITQHV.... 51
DSSP llhhhhhhhhlLLLLHHHH.HHHHHHHHHLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHH....
DSSP hhhhHHHHhhhHHHLhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query alyiAVLRqilDIWLaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlaga 109
ident
Sbjct ...tLLDLpekIADA.............................fntgrvrdvtvvnelv 79
DSSP ...hHHLLlhhHHHH.............................hhllllllhhhhhhhh
DSSP lllHHHHhLHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query pllMDELtGDLKALIDEKSALiagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav 169
ident | |
Sbjct tafKKRP.EEVEAWLDDDTQE....................................... 99
DSSP hhhHHLH.HHHHHHHHLLLLL.......................................
DSSP hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..............itrgtvkllreflde 114
DSSP ..............llhhhhhhhhhhhhl
No 120: 1E2XA MOLECULE: FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;
DSSP .......lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllhhhhhh
Query .......avsakkkailsaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskealyi 53
ident
Sbjct qspagfaeeyiiesiwnnrfppgtilpaerelseligvtrttlrevlqrlardgwltiqh 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeel
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhllLLLL..........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....hHHHH
Query avlrqildiwlaplkafREDF..........APLAAIKEYIRLKLEVSRDY....pQASR 99
ident | |
Sbjct gkptkvnnfwetsglniLETLarldhesvpqLIDNLLSVRTNISTIFIRTAfrqhpDKAQ 120
DSSP leeeeellhhhhllhhhHHHHhhhllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlhHHHH
DSSP HHHHH...............hhllllllhhhhhlhhhhhhhHHHHHHHHhhhlllllllL
Query LFCME...............mlagapllmdeltgdlkalidEKSALIAGwvksgklapiD 144
ident |
Sbjct EVLATanevadhadafaeldynifrglafasgnpiyglilnGMKGLYTR........igR 172
DSSP HHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHHHHH........hhH
DSSP HHH...hhhhhhHHHHhhhHLHHHHhhhhlLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query PQH...lifmiwASTQhyaDFAPQVeavtgATLRdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident || |
Sbjct HYFanpearslaLGFYhklSALCSE.....GAHD...QVYETVRRYGHESGEIWHRMq 222
DSSP HHLllhhhhhhhHHHHhhhHHHHHH.....LLHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHl
No 121: 1CF7B MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhLLHHHHHHHHL...................lLHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAELAG...................vSKT 39
ident | |
Sbjct gkGLRHFSMKVCEKVQRKGT......TSYNEVADELVseftnsnnhlaadsaydqknIRR 54
DSSP llHHHHHHHHHHHHHHHHLE......ELHHHHHHHHHhhhhllllllhhhlhhhhhhHHH
DSSP HHHHHLLlhhhhhHHHH........HHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query NLLYYFPskealyIAVL........RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevs 91
ident
Sbjct RVYDALN.vlmamNIISkekkeikwIGLP............................... 82
DSSP HHHHHHH.hhhhlLLLLllllleelLLLL...............................
DSSP hhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh
Query rdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifm 151
ident
Sbjct ............................................................ 82
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query iwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................................... 82
DSSP ...............................................
No 122: 2PG4A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP .......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllhhhhhHHHL...........lLHHHHH
Query .......aVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhgtrleqiaELAG...........vSKTNLL 42
ident || | | | |
Sbjct xddetlrlQFGHLIRILPTLLEFEKKGY.....epslaEIVKasgvsektffxgLKDRLI 55
DSSP lllhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....lllhhHHHHhhlllhhhhhllHHHHHH
DSSP .HHLLL.............HHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhlllllllhhhhhhhhhhhhh
Query .YYFPS.............KEALYIAVLRQILDIWLAplkafredfaplaaikeyirlkl 88
ident |
Sbjct rAGLVKeetlsyrvktlklTEKGRRLAECLEKCRDVL....................... 92
DSSP hLLLEEeeeeelleeeeeeLHHHHHHHHHHHHHHHHL.......................
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhh
Query evsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhl 148
ident
Sbjct ............................................................ 92
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................................. 92
DSSP ..................................................
No 123: 2NTZA MOLECULE: PARB;
DSSP ...lHHHHHHHhHHHHHHHHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLllhhhhhhhhhH
Query ...aVSAKKKAiLSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFpskealyiavlR 57
ident || | |
Sbjct qtalQHSIREI.GLRLXRXKNDG....XSQKDIAAKEGLSQAKVTRAL.......qaasA 48
DSSP llllLLLHHHH.HHHHHHHHHLL....LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHH.......hhhlL
DSSP HHHHHHLHHhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllllLHHHhh
Query QILDIWLAPlkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagaplLMDElt 117
ident | |
Sbjct PEELVALFP...........................vqseltfsdyktlcavgdEXGN.. 79
DSSP LHHHHHLLL...........................lhhhllhhhhhhhhhhhhLLLL..
DSSP LHHHHHHHhhhhhhhhhhhllllllllhHHHHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllh
Query GDLKALIDeksaliagwvksgklapidpQHLIFMIwastqhyadfapqveavtgatlrde 177
ident || | |
Sbjct LEFDQLIQ..................niSPEINDI......................... 96
DSSP LHHHHHHH..................hhHHHHHLL.........................
DSSP hhhhhhhhhhHHHH..............................................
Query vffnqtvenvQRII.............................................. 191
ident
Sbjct ........lsIEEXaedevknkilrlitkeaslltdkksvvtelwkfedkdrfarkrvkg 148
DSSP ........llLLLLlllllhhhhhhhhlhhhhhhhllllleeellllllllleeeeelll
DSSP ............................hhhhlll
Query ............................iegirpr 198
ident
Sbjct rafsyefnrlskelqeeldrxighilrksldkkpk 183
DSSP llleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 124: 2H6BA MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct veglgkdfcgaiipdnffpieklrnytqmglirdfakgsavimpgeeitsmiflvegkik 60
DSSP lllleeeelleeeellllllhhhhhlhhhleeeeelllleeelllllllleeeeeellee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ldiifedgsekllyyaggnsligklyptgnniyatameptrtcwfsekslrtvfrtdedm 120
DSSP eeeellllleeeeeeelllleelllllllleeeeeellleeeeeelhhhhhhhhhhllhh
DSSP ......................lhHHHHHHHHHHHHHH.........hhhhHHHHLLHHH
Query ......................avSAKKKAILSAALDT.........fsqfGFHGTRLEQ 29
ident ||
Sbjct ifeifknyltkvayyarqvaemntYNPTIRILRLFYELcssqgkrvgdtyeITMPLSQKS 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleELLLHHHHHHHHHHhhhhleeelleeeEELLLLHHH
DSSP HHHHHLLLHHHHHHHLL.......lhhhhhhhhHHHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhh
Query IAELAGVSKTNLLYYFP.......skealyiavLRQILDiwlaplkafredfaplaaike 82
ident | | ||
Sbjct IGEITGVHHVTVSRVLAclkrenildkkknkiiVYNLGE..................... 219
DSSP HHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeellleeeELLHHH.....................
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query yirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklap 142
ident
Sbjct ............................................................ 219
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query idpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................lkhlseqtsvdklaaaldhh 239
DSSP ....................................hhhhhlllleehhhhhhlll
No 125: 2CU7A MOLECULE: KIAA1915 PROTEIN;
DSSP .......lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLHHHHHHHHL.LLHHHHHhhlLLHHHHh
Query .......avsaKKKAILSAALDTFSQFGfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLyyfPSKEALy 52
ident || | | | |
Sbjct gssgssgysvkWTIEEKELFEQGLAKFG...RRWTKISKLIGsRTVLQVK...SYARQY. 53
DSSP lllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHLlLLHHHHH...HHHHHH.
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllLL
Query iavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapLL 112
ident
Sbjct .......................................................fknKV 58
DSSP .......................................................hhhHL
DSSP HHHhhLHHHHhhhhhHHHHhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query MDEltGDLKAlidekSALIagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident
Sbjct KCG.lDKETP....nQKTG......................................... 72
DSSP LLL.lLLLLL....lLLLL.........................................
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .......................... 72
DSSP ..........................
No 126: 2AHQA MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR RPON;
DSSP .............LHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH.hHHLLHHHHHHHH.....LLLHHHH
Query .............AVSAKKKAILSAALDtFSQFG.fHGTRLEQIAELA.....GVSKTNL 41
ident || |
Sbjct tyslrtffvresaEGLTQGELMKLIKEI.VENEDkrKPYSDQEIANILkekgfKVARRTV 59
DSSP lllllllllllllLLLLHHHHHHHHHHH.HHHLLllLLLLHHHHHHHHlllllLLLHHHH
DSSP HHHLllhHHHHhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query LYYFpskEALYiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlf 101
ident | | |
Sbjct AKYR...EMLG................................................. 67
DSSP HHHH...HHLL.................................................
DSSP hhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query cmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct ............................................................ 67
DSSP ............................................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................................... 67
DSSP .....................................
No 127: 1XN7A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YHGG;
DSSP lhhhHHHHhhHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHhhhh
Query avsaKKKAilSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLrqil 60
ident | | ||
Sbjct ....MASL..IQVRDLLALRGR..MEAAQISQTLNTPQPMINAMLQQ.lesmGKAV.... 47
DSSP ....LLLH..HHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH.hhhhLLEE....
DSSP hhhlhhhHLLLLLLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhh
Query diwlaplKAFREDFAPLaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct riqeepdGCLSGSCKSC........................................... 64
DSSP eelllllLLLLLLLLLL...........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevff 180
ident
Sbjct ............................................................ 64
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlll
Query nqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....pegkaclrewwalr 78
DSSP ....llllllllleeeel
No 128: 1TWDA MOLECULE: COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC;
DSSP ...lhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllhhHHHHhhhH
Query ...avsakkKAILSaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskeALYIavlR 57
ident
Sbjct alleiccysXECAL.................................taqqnGADR...V 24
DSSP leeeeeellHHHHH.................................hhhhlLLLE...E
DSSP HHH..........................hHHLHHhhLLLLlllHHHHHHHHHHHHHHHH
Query QIL..........................dIWLAPlkAFREdfaPLAAIKEYIRLKLEVS 91
ident | |
Sbjct ELCaapkeggltpslgvlksvrqrvtipvhPIIRP..RGGDfcySDGEFAAILEDVRTVR 82
DSSP EELllhhhllllllhhhhhhhhhhlllleeELLLL..LLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHlHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHhlllllllLHHHHHHH
Query RDyPQASrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksalIAGWVksgklapiDPQHLIFM 151
ident
Sbjct EL.GFPG...........................lvtgvLDVDG.......nVDXPRXEK 107
DSSP HL.LLLE...........................eeellLLLLL.......lLLHHHHHH
DSSP HhHHHHHHHH..................................................
Query IwASTQHYAD.................................................. 161
ident |
Sbjct I.XAAAGPLAvtfhrafdxcanplytlnnlaelgiarvltsgqksdalqglskixeliah 166
DSSP H.HHHHLLLEeeelhhhhhlllhhhhhhhhhhhllleeeellllllllllhhhhhhhhll
DSSP ...............................lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ...............................fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqri 190
ident
Sbjct rdapiixagagvraenlhhfldagvlevhssagawqaspxryrnysryivdgaavaexkg 226
DSSP lllleeeeelllllllhhhhhhhllleeeelleeeelllllllllleeeelhhhhhhhhh
DSSP hhhhhlll
Query iiegirpr 198
ident
Sbjct iierhqak 234
DSSP hhhhhhhl
No 129: 2JGDA MOLECULE: 2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE E1 COMPONENT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dtnvkqvkvlqlinayrfrghqhanldplglwqqddldpsfhdltedfqetfnvgsfaet 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhllllllleeelllllle
DSSP ............................................LHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............................................AVSAKKKAILSAALDT 16
ident ||
Sbjct mklgellealkqtycgpigaeymhitsteekrwiqqriesratfNSEEKKRFLSELTAAE 120
DSSP eehhhhhhhhhhhhhlleeeellllllhhhhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHH.....hhhllhhhhhHHHL....................................
Query FSQFG.....fhgtrleqiaELAG.................................... 35
ident |
Sbjct GLERYlgakfpgrfsleggdALIPmlkemirhagnsgtrevvlgmahrgrlnvlvnvlgk 180
DSSP HHHHHhhhhlllllllllllLHHHhhhhhhhhhhllllleeeeelllllhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 35
ident
Sbjct kpqdlfdefagkhhlgtgdvkyhmgfssdfqtdgglvhlalafnpshleivspvvigsvr 240
DSSP lhhhhhhhhhllllllllllhhhlleeeeeeelleeeeeeelllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 35
ident
Sbjct arldrldepssnkvlpitihgdaavtgqgvvqetlnmskargyevggtvrivinnqyctd 300
DSSP hhhlllllllhhheeeeeeeehhhhhhllhhhhhhhhllllllllllleeeeeelllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 35
ident
Sbjct igkmvqapifhvnaddpeavafvtrlaldfrntfkrdvfidlvcyrrhqplmyqkikkhp 360
DSSP hhhllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllllllhhhhhlll
DSSP .llHHHHHHH....lLLHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query .vsKTNLLYY....fPSKEALYIAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklev 90
ident | | |
Sbjct tprKIYADKLeqekvATLEDATEMVNL................................. 387
DSSP lhhHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHHH.................................
DSSP hhhlhhhhhHHHHHHHLlllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhh
Query srdypqasrLFCMEMLAgapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlif 150
ident
Sbjct ........yRDALDAGD........................................... 396
DSSP ........hHHHHHHLL...........................................
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhHHHHHhHHHH....................
Query miwastqhyadfapqveavtgatlrdevffNQTVEnVQRI.................... 190
ident
Sbjct ......................cvvaewrpMNMHS.FTWSpylnhewdeeypnkvemkrl 433
DSSP ......................llllleelLLHHH.LLLHhhllllllllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 190
ident
Sbjct qelakristvpeavemqsrvakiygdrqamaageklfdwggaenlayatlvdegipvrls 493
DSSP hhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeee
DSSP ..........................................................hh
Query ..........................................................ii 192
ident
Sbjct gedsgrgtffhrhavihnqsngstytplqhihngqgafrvwdsvlseeavlafeygyata 553
DSSP elllllllllllllleelllllleelhhhlllllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP HHHLLL......................................................
Query EGIRPR...................................................... 198
ident |
Sbjct EPRTLTiweafgdfangaqvvidqfissgeqkwgrmcglvmllphgyegqgpehssarle 613
DSSP LLLLEEeeellhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllllleeeeellllllllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 198
ident
Sbjct rylqlcaeqnmqvcvpstpaqvyhmlrrqalrgmrrplvvmspksllrhplavssleela 673
DSSP hhhhllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeellhhhhlllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 198
ident
Sbjct ngtflpaigeideldpkgvkrvvmcsgkvyydlleqrrknnqhdvaivrieqlypfphka 733
DSSP hllllleelllllllhhhlleeeeelllhhhhhhhhhhhllllleeeeeeleeelllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 198
ident
Sbjct mqevlqqfahvkdfvwcqeeplnqgawycsqhhfrevipfgaslryagrpasaspavghm 793
DSSP hhhhhhhhlllleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhllllllleeeeeeellllllllllh
DSSP ..................
Query .................. 198
ident
Sbjct svhqkqqqdlvndalnve 811
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlll
No 130: 2G7HA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct miiqieeyfigmifkgnqlvrntiplrreeifnfmdgevvsnpedehlkvaeiilklyfa 60
DSSP leeeelleeeeeeelllleeeeelllllllhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhll
DSSP ..............LHHH.HHHHHHHhHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHL
Query ..............AVSA.KKKAILSaALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYF 45
ident | | || |
Sbjct eiddkkvrelisykLEVPeFTKKVLD.IVKDIEFGKT..LTYGDIAKKLNTSPRAVGMAL 117
DSSP llllllllllllllLLLLlLLHHHHH.HHLLLLLLLL..EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHH
DSSP L.....lhHHHHhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query P.....skEALYiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrl 100
ident
Sbjct KrnplpliIPCH.........................................rvvakns 136
DSSP HlllllllLHHH.........................................heellll
DSSP hhhhhhllLLLLHhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query fcmemlagAPLLMdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhya 160
ident
Sbjct lggysyglDKKKF.......................................ilererln 157
DSSP llllllllHHHHH.......................................hhhhhhll
DSSP HLHHhhHHHHllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query DFAPqvEAVTgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct MVSF..KFNK..........................vy 167
DSSP LLLL..LLLL..........................ll
No 131: 1UG2A MOLECULE: 2610100B20RIK GENE PRODUCT;
DSSP ...............................lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLHHH
Query ...............................aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHgtRLEQ 29
ident | | |
Sbjct gpsgssgagalpkaseatvcannskvsstgekVVLWTREADRVILTMCQEQGAQphTFSV 60
DSSP llllllllllllllllllllllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLllLHHH
DSSP HHHHHLLLHhhhhhhlllhHHHHHHHHHhhhHHHLHHhHLLLllllhhhhhhhhhhhhhh
Query IAELAGVSKtnllyyfpskEALYIAVLRqilDIWLAPlKAFRedfaplaaikeyirlkle 89
ident | |
Sbjct ISQQLGNKT......pvevSHRFRELMQlfhTACESG.PSSG.................. 95
DSSP HHHHHLLLL......hhhhHHHHHHHHHhhhHLLLLL.LLLL..................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli 149
ident
Sbjct ............................................................ 95
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................................................. 95
DSSP .................................................
No 132: 1S6LA MOLECULE: ALKYLMERCURY LYASE;
DSSP lhhhhhhhhhHHHHHHhhHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL..............
Query avsakkkailSAALDTfsQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.............. 46
ident | |
Sbjct ......adllVPLLRElaKGRP..VSRTTLAGILDWPAERVAAVLEqatsteydkdgnii 52
DSSP ......llllLHHHHHhhLLLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLlllllleellleel
DSSP .............lhhhhhhhhhhhhHHHH......lhhhHLLLllllhhhhhhhhhhhh
Query .............skealyiavlrqiLDIW......laplKAFRedfaplaaikeyirlk 87
ident
Sbjct gygltlretsyvfeiddrrlyawcalDTLIfpaligrtarVSSH.....caatgapvslt 107
DSSP lllllllllleeeeelleeeeellllLLLLlhhhhllleeEEEE.....lllllleeeee
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhLHHHhhhhhhhHHHH.HHHHL......lll
Query levsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltGDLKalideksALIA.GWVKS......gkl 140
ident
Sbjct vspseiqavepagmavslvlpqeaadvrqsFCCH....vhfFASVpTAEDWaskhqgleg 163
DSSP elllleeeeelllleeeellllllllllllLLLL....leeELLHhHHHHHhhlllllll
DSSP llLLHHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apIDPQHLIFMIWAStqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident | | |
Sbjct laIVSVHEAFGLGQE.............................fnrhllqtmssrtp 192
DSSP leEEEHHHHHHHHHH.............................hhhhhhllllllll