DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1PB6C
MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1PB6-A 32.1 0.4 198 198 100 HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC; "
2: 2D6Y-A 17.1 2.6 181 186 18 PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN; "
3: 2GEN-A 17.0 2.8 181 188 19 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
4: 2PZ9-A 16.7 2.3 171 179 24 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN; "
5: 2IBD-A 15.7 3.6 184 192 17 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
6: 1T33-A 15.6 2.8 186 220 20 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR "
7: 2IAI-A 14.4 3.4 173 200 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833; "
8: 1ZKG-A 14.3 3.2 182 200 21 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
9: 2FBQ-A 14.0 3.7 179 213 20 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
10: 1U9N-A 14.0 3.4 178 194 14 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR; "
11: 1VI0-A 13.9 3.2 177 189 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
12: 2UXH-A 13.1 3.1 176 206 18 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
13: 2DG8-A 13.1 3.9 170 175 19 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY "
14: 2FX0-A 12.9 3.3 167 179 23 HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN; "
15: 2NP5-A 12.8 3.5 176 187 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
16: 1UI5-A 12.6 3.2 169 199 20 A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG; "
17: 2NX4-A 12.3 4.1 176 194 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN; "
18: 1RKT-A 12.1 4.4 177 204 18 PROTEIN YFIR; "
19: 2ID3-A 11.9 4.5 175 191 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
20: 1A6I-A 11.6 3.6 164 193 11 TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D; "
21: 2HYJ-A 11.4 3.6 176 193 16 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
22: 2GUH-A 11.3 3.1 161 179 18 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
23: 2G3B-A 11.3 3.8 157 188 20 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
24: 2G7G-A 11.2 3.9 161 197 17 RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
25: 2OI8-A 11.1 3.4 168 203 13 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313; "
26: 2OFL-A 11.1 3.8 172 221 19 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
27: 2F07-A 11.0 4.2 151 197 18 YVDT; "
28: 2O7T-A 10.9 4.3 170 188 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
29: 2HYT-A 10.9 4.1 170 193 16 TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
30: 2QKO-A 10.8 3.8 161 174 13 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY "
31: 2FD5-A 10.6 4.0 161 180 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
32: 2Q24-A 10.5 5.1 150 173 19 PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
33: 2GFN-A 10.4 4.6 162 192 19 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED "
34: 1ZK8-A 10.2 3.7 164 177 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
35: 2OF7-A 10.1 3.5 109 191 21 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
36: 1V7B-A 10.0 3.9 161 175 19 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
37: 2HKU-A 9.8 4.5 153 191 18 A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
38: 1Z0X-A 9.7 4.6 161 216 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
39: 2OER-A 9.1 4.1 146 179 16 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
40: 1SGM-A 9.1 4.0 150 184 17 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF; "
41: 2G7S-A 8.5 3.7 143 190 17 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
42: 2DTZ-A 8.3 4.5 163 186 12 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR; "
43: 2DG7-A 8.2 4.2 154 187 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
44: 2IU5-A 7.8 4.0 132 179 10 HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG; "
45: 2FQ4-A 7.4 4.0 140 184 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
46: 2HXO-A 7.2 4.1 142 207 8 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
47: 2G7L-A 6.7 4.4 136 201 10 TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
48: 1L0O-C 4.8 2.1 45 57 16 ANTI-SIGMA F FACTOR; "
49: 1TQI-A 4.4 5.3 84 269 10 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
50: 1XJE-A 4.1 4.9 86 627 9 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT; "
51: 2O3F-A 4.0 4.1 60 83 12 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH; "
52: 1LVA-A 3.8 9.9 82 258 16 SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR; "
53: 2OBP-A 3.7 2.8 53 81 11 PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN; "
54: 2AO9-A 3.7 6.4 84 117 7 PHAGE PROTEIN; "
55: 1BBY-A 3.7 2.5 52 69 12 RAP30; "
56: 1GPJ-A 3.6 4.4 92 400 9 GLUTAMYL-TRNA REDUCTASE; "
57: 2CJJ-A 3.5 3.9 49 63 12 RADIALIS; "
58: 2CFX-A 3.5 4.4 64 140 3 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC; "
59: 2NR3-A 3.4 9.0 72 168 6 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
60: 2HXI-A 3.4 6.7 101 197 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
61: 2DOB-A 3.3 2.8 53 82 13 PROACTIVATOR POLYPEPTIDE; "
62: 2CMP-A 3.3 3.1 47 56 13 TERMINASE SMALL SUBUNIT; "
63: 1T6S-A 3.3 12.9 86 162 7 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
64: 1B9M-A 3.3 7.7 69 258 13 PROTEIN (MODE); "
65: 2NNN-A 3.2 6.3 53 134 11 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
66: 2HEO-A 3.2 2.5 43 59 16 Z-DNA BINDING PROTEIN 1; "
67: 1FX7-A 3.2 4.9 78 230 9 IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER; "
68: 2IA0-A 3.1 3.8 67 156 7 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
69: 1STZ-A 3.1 4.0 82 323 6 HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA "
70: 1SFU-A 3.1 3.0 50 70 8 34L PROTEIN; "
71: 1J5Y-A 3.1 6.4 82 172 7 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR "
72: 2IW5-B 3.0 3.7 50 133 8 LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1; "
73: 2FXA-A 3.0 6.6 62 156 8 PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR; "
74: 2FQ3-A 3.0 2.6 50 85 4 TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3; "
75: 2EV0-A 3.0 10.2 78 131 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR; "
76: 2DT5-A 3.0 8.6 87 210 13 AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN; "
77: 2DBB-A 3.0 3.6 63 146 3 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
78: 2P5V-A 2.9 3.7 61 156 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY; "
79: 2ESN-A 2.9 7.8 55 299 9 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
80: 1HLV-A 2.9 12.1 63 131 10 MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B; "
81: 1CF7-A 2.9 4.1 50 67 8 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
82: 1B4A-A 2.9 7.8 79 146 4 ARGININE REPRESSOR; "
83: 2COH-A 2.8 2.4 49 194 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
84: 1UFM-A 2.8 6.5 58 84 7 COP9 COMPLEX SUBUNIT 4; "
85: 1SFX-A 2.8 6.5 64 109 14 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008; "
86: 1S7Z-A 2.8 2.8 54 106 7 GENE 0.3 PROTEIN; "
87: 1QBJ-A 2.8 3.1 47 65 13 PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE "
88: 1FSE-A 2.8 2.1 49 67 10 GERE; "
89: 1EH6-A 2.8 4.6 56 168 20 O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE; "
90: 2DK5-A 2.7 3.2 51 91 10 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA "
91: 1Z1D-A 2.7 2.3 46 69 4 REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT; "
92: 1NKL-A 2.7 3.0 51 78 8 NK-LYSIN; "
93: 1HST-A 2.7 2.9 49 74 8 HISTONE H5; "
94: 2P4W-A 2.6 4.7 77 197 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY; "
95: 2NYX-A 2.6 7.3 66 146 12 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN, "
96: 2CQR-A 2.6 3.5 46 73 13 DNAJ HOMOLOG SUBFAMILY C MEMBER 1; "
97: 1R1U-A 2.6 3.2 49 94 10 REPRESSOR PROTEIN; "
98: 1AOY-A 2.6 3.1 49 78 6 ARGININE REPRESSOR; "
99: 2PG4-A 2.5 2.8 51 92 20 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
100: 2DIM-A 2.5 4.7 55 70 11 CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN; "
101: 2CU7-A 2.5 6.6 51 72 14 KIAA1915 PROTEIN; "
102: 2AVU-E 2.5 3.8 55 156 5 TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR FLHD; "
103: 1YLF-A 2.5 3.3 57 117 7 RRF2 FAMILY PROTEIN; "
104: 1Y0U-A 2.5 2.6 44 89 20 ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE; "
105: 1UST-A 2.5 4.4 58 92 3 HISTONE H1; "
106: 2AJA-A 2.4 5.0 97 343 9 ANKYRIN REPEAT FAMILY PROTEIN; "
107: 1U78-A 2.4 9.8 64 103 11 TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE; "
108: 1RI7-A 2.4 3.4 59 146 10 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
109: 1R7J-A 2.4 8.7 61 90 15 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A; "
110: 1FT9-A 2.4 2.8 50 210 18 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
111: 2G9W-A 2.3 4.2 76 119 9 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
112: 2FRH-A 2.3 5.8 56 127 11 STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A; "
113: 1XMK-A 2.3 3.3 50 79 10 DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE; "
114: 1WHU-A 2.3 3.1 63 104 10 POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE; 3'-5' RNA "
115: 1UMQ-A 2.3 2.5 40 60 10 PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN; "
116: 1SD4-A 2.3 8.2 75 122 5 PENICILLINASE REPRESSOR; "
117: 1N81-A 2.3 3.8 71 186 3 PLASMODIUM FALCIPARUM GAMETE ANTIGEN 27/25; "
118: 1LNW-A 2.3 7.3 58 141 10 MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR; "
119: 1E2X-A 2.3 4.3 84 222 8 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
120: 2IJL-A 2.2 7.3 61 110 7 MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR; "
121: 1YO3-A 2.2 3.1 46 85 4 DYNEIN LIGHT CHAIN 1; "
122: 1T98-A 2.2 7.4 112 266 4 CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF; "
123: 1IRZ-A 2.2 3.6 46 64 13 ARR10-B; "
124: 2HZD-A 2.1 4.2 49 82 12 TRANSCRIPTIONAL ENHANCER FACTOR TEF-1; "
125: 1ZQ3-P 2.1 3.7 51 68 10 HOMEOTIC BICOID PROTEIN; "
126: 1WRJ-A 2.1 3.7 53 150 9 METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE "
127: 1TWD-A 2.1 4.1 64 234 5 COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC; "
128: 1OF9-A 2.1 2.9 52 77 6 PORE-FORMING PEPTIDE AMEOBAPORE A; "
129: 1H88-C 2.1 11.0 81 152 11 CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA; "
130: 1EZF-A 2.1 7.8 85 323 6 FARNESYL-DIPHOSPHATE FARNESYLTRANSFERASE; "
131: 1D8J-A 2.1 3.7 47 81 6 GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA; "
132: 1CF7-B 2.1 3.6 55 82 4 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
133: 1U2W-A 2.0 4.5 56 105 13 CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN; "
134: 1K78-A 2.0 9.0 64 124 11 PAIRED BOX PROTEIN PAX5; "
135: 1JGS-A 2.0 6.6 58 138 10 MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR; "
-
No 1: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
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Sbjct DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL 120
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No 2: 2D6YA MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;
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Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGA...PLLMDELT 117
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Sbjct .EHYARKVAAVRDGQERG...VITDaIPAPDLLFLLVAXANWAVVVPQXKRILVGG...G 165
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Query EVFFNQTVENVQRIIIEGIRPr 198
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Sbjct DAGTDGLRDSIKKAARRIVDR. 186
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No 3: 2GENA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
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Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
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Sbjct ....RKDEILQAALACFSEHGVDATTIEXIRDRSGASIGSLYHHFGNKERIHGELYLAGI 56
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Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagAPLL....MDE 115
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Sbjct GQYAALLEAgFARARSAEETVRLLVTSYIDWVVANPDWARFILHSR...GRVEagelGER 113
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Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEavtgAT 173
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Query LRdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR 198
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Sbjct LA......DCRELLAQVAWDSVRAA 188
DSSP HH......HHHHHHHHHHHHHHLLL
No 4: 2PZ9A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;
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Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
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Sbjct ...STRQRIVAAAKEEFARHGIAGARVDRIAKQARTSKERVYAYFRSKEALYAHVAERET 57
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Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGApllmdeltgDL 120
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Sbjct TALIEATQLD......pADLPGYAGILFDHFAARPDHYRLITWGRLELA.........PL 102
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Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTGatlrdEVF 179
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No 5: 2IBDA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
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Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
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Sbjct GKSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL 60
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ident | | | | |
Sbjct DDLFGKYREiVASGLDSRATLEALVTTSYEAIDASHSAVAIYQdEVKHLVANeRFTYLS. 119
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Query GDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFApqveavtgaTLRD 176
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Sbjct ELNTEFRELWXGVLEAGVKDGSFRSdIDVELAFRFLRDTAWVAVRWY.........RPGG 170
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DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query EVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
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Sbjct SVTVDTVAKQYLSIVLDGlasp 192
DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHLllll
No 6: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHH
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALY 52
ident | ||| | | || ||| ||| ||| ||
Sbjct mnipttttKGEQAKSQLIAAALAQFGEYGL.HATTRDIAALAGQNIAAITYYFGSKEDLY 59
DSSP lllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHH.HHHHLL..LLLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHH
Query IAVLRQILDIWL.APLKAF..REDF.........APLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQAS 98
ident | | | | | | |
Sbjct LACAQWIADFLGeKFRPHAekAERLfsqpapdrdAIRELILLACKNMIMLLTQedTVNLS 119
DSSP HHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhHHHHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHLlLLLL.HHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLHHHHHHHHhHHHH
Query RLFCMEMLAgAPLL.MDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSgklapiDPQHLIFMIwASTQ 157
ident | | | | | |
Sbjct KFISREQLS.PTSAyQLVHEQVIDPLHTHLTRLVAAYTGCdandtrMILHTHALL.GEVL 177
DSSP HHHHHHHHL.LLHHhHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllhhHHHHHHHHH.HHHH
DSSP HHHHLHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..l
Query HYADFAPQVEAVTGAtlRDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..r 198
ident || || | |
Sbjct AFRLGKETILLRTGWpqFDEEKAELIYQTVTCHIDLILHGltq 220
DSSP HHHHLHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl
No 7: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;
DSSP ..........lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHH
Query ..........avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA 50
ident || | | | || | || || ||
Sbjct grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERGYDGTSXEHLSKAAGISKSSIYHHVTGKEE 60
DSSP llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhLL
Query LYIAVLRQILDIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlAG 108
ident | || | | | || | |
Sbjct LLRRAVSRALDELFGILDEehARVG.TAAERLEYVVRRXVEVLXAELPYVTLLLRV..RG 117
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL..LL
DSSP LLLLHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhh
Query APLLMDELtGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqve 167
ident | || |
Sbjct TGTERWAL.ERRREFDHRVAALLKDAAAEGDVRAdVEVRLATRLVFGXINSIVEWYR... 173
DSSP LHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLHHHHLL...
DSSP hhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query avtgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | | | |
Sbjct ...pesgvSGAGEREVVDAVARLVFGG.lrk 200
DSSP ...lllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.lll
No 8: 1ZKGA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | ||| || | | ||| ||| | || || ||
Sbjct .VLSKRDAILKAAVEVFGKKGYDRATTDEIAEKAGVAKGLIFHYFKNKEELYYQAYXSVT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLL...LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHh
Query DIWLAPLKAFR...EDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELt 117
ident | | ||| | | | |
Sbjct EKLQKEFENFLxknRNRDIFDFXERWIEKKLEYSASHPEEADFLITLVSVDEGLRKRIL. 118
DSSP HHHHHHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHH.
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......lllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhh
Query GDLKALIDEKSALIAGWVKSG.......klaPIDP.QHLIFMIWASTQHYADFApqveav 169
ident || |
Sbjct LDLEKSQRVFFDFVREKLKDLdlaedvteeiALKFlXWFFSGFEEVYLRTYQGK...... 172
DSSP HHHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHLLL......
DSSP hlLLLLLhhHHHHHHHHHHHHhHHHHLLL...
Query tgATLRDevFFNQTVENVQRIiIEGIRPR... 198
ident | | || |
Sbjct .pELLKR..DXNTLVEEVKVX.LRILKKGxtk 200
DSSP .hHHHHH..HHHHHHHHHHHH.HHHHHHHhll
No 9: 2FBQA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || || | || | | | ||| | | || || || |
Sbjct AQSETVERILDAAEQLFAEKGFAETSLRLITSKAGVNLAAVNYHFGSKKALIQAVFSRFL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHH.LLLL........llLHHHHHHHHHHHHHHH...hHHLH.HHHHHHHHHHHL
Query DIWLAPLK.AFRE........dfAPLAAIKEYIRLKLEV...sRDYP.QASRLFCMEMLA 107
ident | | | ||
Sbjct GPFCASLEkELDRrqakpeaqhaTLEDLLHLLVSQAMAVkprsGNDLsIFMRLLGLAFSQ 120
DSSP HHHHHHHHhHHHHhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHLllllLLHHhHHHHHHHHHHHL
DSSP LLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllLLLL...lhhhhHHHHHHHHHHHHHLHH
Query GAPLLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWvksgkLAPI...dpqhlIFMIWASTQHYADFAP 164
ident | | |
Sbjct SQGHLRKYLEEVYGKVFRRYMLLVNEA.....APKLppielfwrVHFMLGAAAFSMSGIK 175
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....LLLLlhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLHH
DSSP HHHHHHLlllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....
Query QVEAVTGatlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.... 198
ident | | | |
Sbjct ALRAMAEtdfgvnTSTEQVMHLMVPFFAAGMRAEsgid 213
DSSP HHHHHHHhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllll
No 10: 1U9NA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident ||| | | || | ||||||| |
Sbjct .GDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVV 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLL...lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhlLLLL.LHHHH
Query DIWLAPLKAFR...edfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlaGAPL.LMDEL 116
ident | | | |
Sbjct NQADXALQTLAenpadtDRENXWRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAAR..ATSVeVAELW 117
DSSP HHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHL..LLLHhHHHHH
DSSP HlHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhh
Query TgDLKALIDEKSALIAG.WVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavt 170
ident | | |
Sbjct S.TFXQKWIAYTAAVIDaERDRGAAPRtlpaheLATALNLXNERTLFASFAGEQPS.... 172
DSSP H.HHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL....
DSSP llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query gatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident | |
Sbjct .......vPEARVLDTLVHIWVTSIYGEn 194
DSSP .......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
No 11: 1VI0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || | | || ||| || || |
Sbjct ...PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKX 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHH.HHHLLlLLLHHHHHl
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCM.EMLAGaPLLMDELTg 118
ident | | |
Sbjct GQFIERXEEdIKEKATAKEKLALVISKHFSLLAGDHNLAIVTQLeLRQSNlELRQKINE. 116
DSSP HHHHHHHHHhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLlLLLLLhHHHHHHHH.
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHH.LHHHhhhhhLLLLll
Query DLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAD.FAPQveavtGATLrd 176
ident || || | | |
Sbjct ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEgLDVRLARQXIFGTIDETVTtWVXN...dqKYDL.. 171
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL...llLLLH..
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHhlll
Query evffnQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | |
Sbjct ....vALSNSVLELLVSGihnk 189
DSSP ....hHHHHHHHHHHHHLllll
No 12: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | || | | | | ||||||| | | | | |
Sbjct tkeEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLD 60
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHhHHHHH.HHHLL.LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHL....
Query QIlDIWLA.PLKAF.REDF.APLAAIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLA.... 107
ident | || ||
Sbjct SL.HETHDhLARASeSEDEvDPLGCMRKLLLQVFNELVLdarTRRINEILHHKCEFtddm 119
DSSP HL.LHHHHhHHHHHhLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhHHHHHHHHHHLLLLlhhh
DSSP ..lLLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL....lLHHH.HHHHHHHHHHHHh
Query ..gAPLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP....iDPQH.LIFMIWASTQHYa 160
ident | | | |
Sbjct ceiRQQRQSAVL.DCHKGITLALANAVRRG...QLPGeldaeRAAVaMFAYVDGLIRRW. 174
DSSP hhhHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlllhhHHHHhHHHHHHHHHHHH.
DSSP HLHHHHhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....ll
Query DFAPQVeavtgatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIR.....pr 198
ident | || |
Sbjct LLLPDS...........vDLLGDVEKWVDTGLDMLRlspalrk 206
DSSP HHLLLL...........lLLLLLHHHHHHHHHHHHHhlhhhll
No 13: 2DG8A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || | || | || ||| | | | |
Sbjct .DPQRRERILAATLDLIAEEGIARVSHRRIAQRAGVPLGSMTYHFTGIEQLLREAFGRFT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHL..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHH
Query DIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGA..PLLMDEL 116
ident | | | | | | | | | |
Sbjct DHIVAVFDEhlGAAA.DRDEAREAVADLVHELSEDSQRDLVLTQELYTLAArqPAYRELT 118
DSSP HHHHHHHHHhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHhlHHHHHHH
DSSP HlHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHhhhhllllll
Query TgDLKALIDEKSALIAGwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVeavtgatlrd 176
ident | | | | | |
Sbjct H.EWMRRSRVHLEKHFD........pGTARQLDALIEGLTLHRA.LAREP.......... 158
DSSP H.HHHHHHHHHHLLLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL..........
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query evffnQTVENVQRIIIEGIRPR 198
ident |
Sbjct .....HGRALTLEAIARITTTD 175
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHLLLL
No 14: 2FX0A MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || || | | ||| || || |
Sbjct SREQTXENILKAAKKKFGERGYEGTSIQEIAKEAKVNVAXASYYFNGKENLYYEVFKKYG 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP hHHHHHhHLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHh
Query dIWLAPlKAFRE..DFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCME.MLAGaPLLMDELt 117
ident | | | | | || | | | |
Sbjct .LANEL.PNFLEknQFNPINALREYLTVFTTHIKENPEIGTLAYEEiIKES.ARLEKIK. 116
DSSP .LHHHL.LLHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHlLLLL.LLHHHHH.
DSSP LHHHhhhhhHHHH.HHHHHHLLlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHhhlHHHHHHHHlllll
Query GDLKalideKSAL.IAGWVKSGkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYadfAPQVEAVTgatlr 175
ident | | | | |
Sbjct PYFI.gsfeQLKEiLQEGEKQG.VFHFfSINHTIHWITSIVLFP...KFKKFIDS..... 166
DSSP HHLH.hhhhHHHHhHHHHHHLL.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHL.....
DSSP lhhhhhhhhhHHHHHHHHHHlll
Query devffnqtveNVQRIIIEGIrpr 198
ident ||
Sbjct ..........DLVSRIISALtdk 179
DSSP ..........LHHHHHHHHHhll
No 15: 2NP5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | |||| | | ||
Sbjct ...TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLV 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHLH.HHHHHHHHHHHLLLLL..LHHHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLeVSRDYP.QASRLFCMEMLAGAPL..LMDELT 117
ident | || | | | | | |
Sbjct DKLLARLSEVERGGDPARALFAAXSQLL.PLDEARsREAHVXAAFAVRAATSpsLAEIRR 116
DSSP HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHhHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhlllll
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKsgkLAPI..DPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlr 175
ident | | |
Sbjct .KTLFTIRTGLSAVLIGIG...TPEAetRAALLLATVDGLALDA.IGSPAL......... 162
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLHHH.........
DSSP lhhHHHHHHHhHHHHHHHHHLLL.....
Query devFFNQTVEnVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | |
Sbjct ..yPPEYLEH.ALDIQIGXILQGadvvp 187
DSSP ..lLHHHHHH.HHHHHHHHHLLLlllll
No 16: 1UI5A MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | | | ||| | | | || | | |
Sbjct lRAEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ 60
DSSP lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHhl
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMLAgAPLLMDELtg 118
ident | | | | |
Sbjct SRTSRRLAKDlDGRGYSSLEALXRLTFGXARLCVQG.PVLRAGLRLATA.GVPVRPLP.h 117
DSSP HHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.l
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllh
Query dlkalidekSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrde 177
ident | || |
Sbjct pftewreiaTSRLLDAVRQSDVHQdIDVDSVAHTLVCSVVGTRVV............... 162
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLLLLL...............
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.................
Query vFFNQTVENVQRIIIEGIRPR................. 198
ident | | | |
Sbjct .REPRRLAEXWYILIRGXVPVtrraryvtlaarleqet 199
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhhl
No 17: 2NX4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;
DSSP ......lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHH
Query ......avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | || | || || | || |
Sbjct gvpklvdhderrRSITAAAWRLIAARGIEAANMRDIATEAGYTNGALSHYFAGKDEILRT 60
DSSP lllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH.HHHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHH.LHHHHHHHHHHHhLLLL..
Query VLRQILDIWLA.PLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLeVSRD.YPQASRLFCMEMlAGAP.. 110
ident | | | | | | | |
Sbjct SYEHISEATDRrIAEALG.DATGLDALRILCREVM.PINEeQLLEARIAASLW.PRAMyd 117
DSSP HHHHHHHHHHHhHHHHHL.LLLHHHHHHHHHHHHL.LLLHhHHHHHHHHHHHH.HHHLll
DSSP .LLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHhh
Query .LLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADF.APQVea 168
ident | ||
Sbjct eQMAATNRRTMDNWREQMAIFLEQAREEGSVGDIDVTIVVEQLLNMMMGMQILgVLTP.. 175
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL..
DSSP hhlLLLLlhhhHHHHHHHHhHHHHHHHlll
Query vtgATLRdevfFNQTVENVqRIIIEGIrpr 198
ident |
Sbjct ...GETS....SERQLEML.EQFVAAL... 194
DSSP ...LLLL....HHHHHHHH.HHHHHLL...
No 18: 1RKTA MOLECULE: PROTEIN YFIR;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHH
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYI 53
ident || || | || | | | | || | |
Sbjct spkvtkeHKDKRQAEILEAAKTVFKRKGFELTTXKDVVEESGFSRGGVYLYFSSTEEXFR 60
DSSP llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHHHHLL..ll
Query AVLRQILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYP.QASRLFCMEMLAG..ap 110
ident || | | | | | | | ||
Sbjct RIIETGLDEGLRKLDKSAEHQSVWASISSYLDELTEGLRDVAdTLAPVQFEYLVTAwrne 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhLLHHHHHHHHHHHhhlh
DSSP lLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHH.hHLLLlLLLL...HHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhh
Query lLMDELTGDLKALIDEKSALIAGW.vKSGKlAPID...PQHLIFMIWASTQHYADFApqv 166
ident | | | |
Sbjct eRRQYLEKRYDLFVERFSRLLQKGidQGEFqPVQPlatIAKFFLNXNDGIIQNALYF... 177
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLlLLLLhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...
DSSP hhhhllLLLLhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLL......l
Query eavtgaTLRDevffnqTVENVQRIIIEGIRP......r 198
ident |
Sbjct ......DEEK.....aDVSGLAESAKLYLKTvlqadek 204
DSSP ......LHHH.....hLHHHHHHHHHHHHHHhhlllll
No 19: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | || | || | || ||| || | |
Sbjct ggRTARIREAVLLAAGDALAADGFDALDLGEIARRAGVGKTTVYRRWGTPGGLAADLLAD 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHHHHhlLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHHHHHHHHHHLlLLLL.HHH
Query ILDIwLAPLkaFREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQASRLFCMEMLAgAPLL.MDE 115
ident | | || | | |
Sbjct XAEQ.SLPR..ADTG.ALEEDLRANARLVVRTLDDprQGRLFRALIAASLC.NEQAaEAL 115
DSSP HHHH.LLLL..LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhHHHHHHHHHHHHHH.LHHHhHHH
DSSP HHlhhHHHHhHHHHHHHHHHHLLLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhllll
Query LTgdlKALIdEKSALIAGWVKSGKLA.PIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtgatl 174
ident | | | || |
Sbjct HRfyaVRVD.EWAGCVRDAVARGEVPdGTDPHGVVAAVSAPLYYALLNTGRS........ 166
DSSP HHhhhHHHH.HHHHHHHHHHHLLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL........
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....l
Query rdevfFNQTVENVQRIIIEGIRP.....r 198
ident | |
Sbjct ....lTEADADRAARAASTAARAgvwvtg 191
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHLllllll
No 20: 1A6IA MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;
DSSP ..lHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query ..aVSAKKKAILSAALD.TFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | | | || | | || |
Sbjct srlDKSKVINSALELLNeVGIEG....LTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAV 56
DSSP lllLHHHHHHHHHHHHHhHLLLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHhhhlllllLHHHhh
Query QILDIWLAPLKaFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMemlagaplLMDElt 117
ident || |
Sbjct EILARHHDYSL.PAAGESWQSFLRNNAMSFRRALLRYrDGAKVHLG........TRPD.. 105
DSSP HHHHHHLLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLHHHHHHH........LLLL..
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.........hhhhH
Query GDLKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.........pqveA 168
ident | | |
Sbjct EKQYDTVETQLRFMTENG....fslRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQqehlppllrealqI 161
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhH
DSSP HHLLLlllhhHHHHHHHHHhHHHHHHHLLL........
Query VTGATlrdevFFNQTVENVqRIIIEGIRPR........ 198
ident | |
Sbjct MDSDD.....GEQAFLHGL.ESLIRGFEVQltallqiv 193
DSSP HHLLL.....LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHhlllllll
No 21: 2HYJA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | || || | || | | |
Sbjct aEAQATRGRILGRAAEIASEEGLDGITIGRLAEELEMSKSGVHKHFGTKETLQISTLDKA 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH.HHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hHHHHHHHHHLLL....LLLH
Query LDIWLA.PLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQ.aSRLFCMEMLAGA....PLLM 113
ident | |
Sbjct FVDFWHrVVEPALaePPGLRRLRAVCANSVGYLEEPLLpgGCLLTAALSEYDgrpgRVRD 120
DSSP HHHHHHhHLHHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLLHHHHHHHHHLllllHHHH
DSSP HHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELtGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg 171
ident | | | | | | | | |
Sbjct AVA.EVWSRWREQLRADLTAAVDKGELPAgFDVEQALFEIVAAGLALNAAMqLQHD.... 175
DSSP HHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL....
DSSP lllllhhhhHHHHhHHHHHHHHHhlll
Query atlrdevffNQTVeNVQRIIIEGirpr 198
ident
Sbjct .....rtaaDRAR.RAIERALAQ...s 193
DSSP .....llhhHHHH.HHHHHHHHH...l
No 22: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqi 59
ident | || | | ||| |||| || ||| | |
Sbjct rTAEQSRSLIVDAAGRAFATRPYREITLKDIAEDAGVSAPLIIKYFGSKEQLFDALVD.. 58
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL..
DSSP HHHHH.HHHHLlllllLHHHhHHHHHHHHHHHhHHLHHHHhHHHHHHHL...LLLLLHHH
Query LDIWL.APLKAfredfAPLAaIKEYIRLKLEVsRDYPQASrLFCMEMLA...GAPLLMDE 115
ident | | |
Sbjct FRAAAeIVFSG.....PLDG.LGERXVSXFAR.PLEPYKP.LSLNILFXsgpSEESSRKL 110
DSSP LHHHHhHHLLL.....LLLL.HHHHHHHHHLL.LLLLLLL.HHHHHHHLlllLLHHHHHH
DSSP HHLhhhhhhHHHHHHHHhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..HHHHhhhHLLL
Query LTGdlkaliDEKSALIAgwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADF..APQVeavTGAT 173
ident | | | ||
Sbjct RANysaqxiDALAERLP.........GRDARLRAELVXSXLTGLAVXrrKXXQ...EHAT 158
DSSP HHHhhhhlhHHHHHHLL.........LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLH...HHLL
DSSP lllhHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query lrdeVFFNQTVENVQRIIIEgirpr 198
ident | |
Sbjct ....GTPEEVVAHYAPLVQElldgg 179
DSSP ....LLHHHHHHHHHHHHHHhhhll
No 23: 2G3BA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | | || |||| | | | | | | |
Sbjct .XSERRDAILKASATAIAQRGIRGLRVNDVAEVAGVSPGLLYYHFKDRIGLLEAALNYIN 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHH.HHHHlllllLLHHHHHHHHHHHHH...hhhhhLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHH
Query DIWL.APLKafredFAPLAAIKEYIRLKL...evsrdYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDEL 116
ident | | |
Sbjct DRARaYRSE.geggDSARDRLTRSLLGEIqdrpevveNSLAWNELRASAVYEEALRDPLA 118
DSSP HHHHhHHLL.llllLLHHHHHHHHHHHLLlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHH
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHhhhlLLLL
Query tgdlkalideksaliagwVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEavtgATLR 175
ident | ||| | |
Sbjct .rttaawvseiadaivqaQATGEISRsLDPQPTAVTXTALVEGLSGRWLCKE....ISTE 173
DSSP .hhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLHH
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query devFFNQTVENVQRIIIEgirpr 198
ident
Sbjct ...DARSHLLGAIDVVXS..... 188
DSSP ...HHHHHHHHHHHHHHL.....
No 24: 2G7GA MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | |
Sbjct ...LDRERIAEAALELVDR..dgdFRXPDLARHLNVQVSSIYHHAKGRAAVVELVRHRVV 55
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHH..hllLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHhhHHHHLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhlllllLHHHhhLHH
Query DIwlAPLKAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagaplLMDEltGDL 120
ident || | | | | | || |
Sbjct RE..IDGSAFER.LPWDEAFSEWARSYRAAFSRHPTAIRLLATE.......TVRD..PGS 103
DSSP LL..LLLHHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.......LLLL..HHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhhHHHHHL.........
Query KALIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADfapqVEAVTG......... 171
ident | | | | |
Sbjct LSVYHSAAAGLRGAG....fpddHIXAVITAAENFLLGAAL.daaAPEVXIeadstttdd 158
DSSP HHHHHHHHHHHHHHL....llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhLLLLLLlllllllll
DSSP .......lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query .......atlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | |
Sbjct altralaaaprgPERAEQAFELGLAALLAGFHHLlqecg 197
DSSP hhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll
No 25: 2OI8A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV 55
ident | | | | || | | | || |
Sbjct tprerYRTQVRAEIKDHAWEQIATAGASALSLNAIAKRXGXSGPALYRYFDGRDELITEL 60
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHL.LLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHhHHLL.lLLLH
Query LRQILDIWLAPLKA.FREDFaplaAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMeMLAG.aPLLM 113
ident | | | | || |
Sbjct IRDAYRSQADSLRAaAASGA....DLAGLAHALRAWALDDPQRYFLIFG.TPVPgyRAPD 115
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhHHLLL....LHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHL.LLLLllLLLH
DSSP HHHhLHHHHHHhHHHHHHHHH..................hhllllllLLHHHHHHHHHHH
Query DELtGDLKALIdEKSALIAGW..................vksgklapIDPQHLIFMIWAS 155
ident |
Sbjct DIT.EIAAETX.AVIVDACAAgtdgafdahldthrqwadrpapssalHRALSFWSRLHGV 173
DSSP HHL.LLLHHHH.HHHHHHHLLllllhhhhhhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHLHHhHHHHHllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query TQHYaDFAPqVEAVTgatlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPr 198
ident |
Sbjct LSLE.LAGQ.FTGXG..........fDSALLFEAELKDLLGP. 203
DSSP HHHH.HLLL.LLLLL..........lLHHHHHHHHHHHHLLL.
No 26: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident || | | | | || |||| | ||| || | |
Sbjct sKSEQTRALILETAXRLFQERGYDRTTXRAIAQEAGVSVGNAYYYFAGKEHLIQGFYDRI 60
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLL.LLLL...HH
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAG.APLL...MD 114
ident | | | | | ||
Sbjct AAEHRAAVREvLARETDLEARLAGVLKVWLDIATPYHEFAVQFFKNAADPdSPLSpfsPE 120
DSSP HHHHHHHLLLhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLlllHH
DSSP HHhLHHHHhHHHHHHHH..hhHHHLlllllllhHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhhhhhhLL
Query ELtGDLKAlIDEKSALI..agWVKSgklapidpQHLIFMIWASTQHYaDFAPqveavtGA 172
ident | | |
Sbjct SE.HARVEaIGIHRAVLagakTKVPeelrdilpELXWLSQXGLVLYW.IFDR......TE 172
DSSP HH.HHHHHhHHHHHHHHllllLLLLhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHH.HHLL......LL
DSSP LLllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................l
Query TLrdevffNQTVENVQRIIIEGIRP.............................r 198
ident | |
Sbjct GR......ERSYRLAERGARLTARGvvlarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv 221
DSSP LL......HHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll
No 27: 2F07A MOLECULE: YVDT;
DSSP ......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHH
Query ......aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | | || || | | | || || || || |
Sbjct pftmpkqTSGKYEKILQAAIEVISEKGLDKASISDIVKKAGTAQGTFYLYFSSKNALIPA 60
DSSP lllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH.HHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHHHHHHLLLLL.L
Query VLRQILDIWLA.PLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpqaSRLFCMEMLAGAPL.L 112
ident | | | | |
Sbjct IAENLLTHTLDqIKGRLHGDEDFWTVLDILIDETFLITERH...KDIIVLCYSGLAIDhS 117
DSSP HHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHLlL
DSSP HHHHHLHHHhhHHHH.....hhhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLHhhhh
Query MDELTGDLKalIDEK.....saliagwvksgklapidpqhLIFMIWASTQHYADFApqve 167
ident | |
Sbjct MEKWETIYQpyYSWLekiinkaianhevteginskwtartIINLVENTAERFYIGF.... 173
DSSP HHHHHHHHHhhHHHHhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL....
DSSP hhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLLL....
Query avtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRPR.... 198
ident | |
Sbjct ...........eqdenvEVYKKEIFTFLKRSlgta 197
DSSP ...........lllllhHHHHHHHHHHHHHHhlll
No 28: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | | ||| ||| | || | |
Sbjct xraDALKRREHIITTTCNLYrthhhDSLTXENIAEQAGVGVATLYRNFPDRFTLDXACAQ 60
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLL..LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHHHhhHHHL.LLLL..L
Query QILDIWLAPLKAF..REDFAPLAAIKEYIRLKLEVSrdYPQASRLFcmEMLA.GAPL..L 112
ident | |
Sbjct YLFNVVISLQLQAisTFPTDPEGVWTSFNQLLFDRG..LGSLVPAL..APESlDDLPdeV 116
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhHHHHLHHHHHHHHHHHHHHLL..HHHHHHHH..LLLLhHHLLhhH
DSSP HHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllLLLLhhhHHHHHHHHHHHHHhLHHHhhHHHLL
Query MDELtGDLKALIDEKSALIAGWVksgklAPIDpqhLIFMIWASTQHYAdFAPQveAVTGA 172
ident | |
Sbjct SALR.RTTEKNTTTLINLAKQHG...lvHHDI...APGTYIVGLITIS.RPPI..TALAT 166
DSSP HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLL...llLLLL...LHHHHHHHHHHHL.LLLL..HHHLL
DSSP lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query tlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | |
Sbjct ..iSENSHKALLGLYLSGLKHG..xx 188
DSSP ..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHL..ll
No 29: 2HYTA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ........lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHH
Query ........avsAKKKAILSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALY 52
ident | | | | | |
Sbjct rtraexeetraTLLATARKVFSERGYAD....TSXDDLTAQASLTRGALYHHFGDKKGLL 56
DSSP llhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLL....LLHHHHHHHHLLLLLHHHHHHLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHH.HHHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHH.HHHHHHHHHll
Query IAVLRQILDIWL.APLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQA.SRLFCMEMLag 108
ident || || | || |
Sbjct AAVVEQIDAEXDeRLQAISDtaEDDWEGFRCRCRAYLEXALEpeIQRIvLRDARAVLG.. 114
DSSP HHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhHHHHlLLHHHHHHL..
DSSP llllhhHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhh
Query apllmdELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFApqvea 168
ident || | | ||| | | | |
Sbjct .....gASPDSQRHCVESXQRLIDNLIRQGVVAEADPQALASLIYGSLAEAAFWI..... 164
DSSP .....lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....
DSSP hhlLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHhHHHLLL..
Query vtgATLRDevFFNQTVENVQRIIiEGIRPR.. 198
ident | | |
Sbjct aegEDGNA..RLAQGVAALELLL.RGLLVKpr 193
DSSP hhlLLHHH..HHHHHHHHHHHHH.HLLLLLll
No 30: 2QKOA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHL.LLLHhHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELA.GVSKtNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | |||| | | |
Sbjct ..PERRAALVNAAIEVLAREGARGLTFRAVDVEAnVPKG.TASNYFPSRDDLFDQVGKRI 57
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlLLLL.LHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLL......LH
Query LDIWlaplkafredfaPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPL......LM 113
ident | || | |
Sbjct HERL............NLELAIEYXQGLFGRITRDRTGYLALQELRLEAVRRpelrttLT 105
DSSP HHLL............LHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhHH
DSSP HHHhlHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHLl
Query DELtgDLKALIDEKSALIAgwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEAVTGa 172
ident |
Sbjct RTI.sENLKRDIGFHLDSG.........lPGDRSTVLXLYLAXNALIVEHlTLPGVLEG. 154
DSSP HHH.hHHHHHHHHHHHHHL.........lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHLLL.
DSSP llllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query tlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident | |
Sbjct ........vDTERLVADLVTRAVATPda 174
DSSP ........lLHHHHHHHHHHHHLLLLll
No 31: 2FD5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident || || | || | || ||
Sbjct msdKKTQTRARILGAATQALLERGAVEPSVGEVMGAAGLTVGGFYAHFQSKDALMLEAFE 60
DSSP lllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.hHHHL....hhHHHHHHHHHhLLLL.L
Query QILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLE.vSRDY....pqASRLFCMEMlAGAP.L 111
ident | | | | || | | |
Sbjct QLLGKRRELLGELDPGLSGKERRALAAAFYLSrkHRDAqvdagcPLPATLAEV.ARLPeG 119
DSSP HHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLhhHHLLllllllLHHHHHHHH.HHLLhH
DSSP LHHHHHlHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHhhH
Query LMDELTgDLKALIdeksaliagwvksgkLAPIDPqHLIFMIWASTQHYADF.APQVEavT 170
ident | |
Sbjct FREVLS.RHVEIM..........vtslaESPEET.DVALADLVLMIGGLALaRALGP..G 165
DSSP HHHHHH.HHHHHH..........hhhhlLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLL..L
DSSP LLLLllhhHHHHHHhHHHHhhhhhhlll
Query GATLrdevFFNQTVeNVQRiiiegirpr 198
ident
Sbjct ELSD...rVLRAAK.QAVN......... 180
DSSP HHHH...hHHHHHH.HLLL.........
No 32: 2Q24A MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || || | || || ||| | || ||| | |
Sbjct ....NRDKILAAAVRVFSEEGLD.AHLERIAREAGVGSGTLYRNFPTREALIEAAYRNEV 55
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHhhhHHHHhhhhhLHHHHHHHhhhhhllLLLL....HHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKeyiRLKLevsrdYPQASRLFcmemlagAPLL....MDEL 116
ident | | |
Sbjct ARLCDSVPGLLAELPPAEALRawtRRFI...dyATAKLGXA....dalRAVVasggDPYG 108
DSSP HHHHHLHHHHHHHLLHHHHHHhhhHHHH...hhHHHHHHLH....hhhHHHHhlllLLLL
DSSP hLHHHhhhhhhhhhHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.HHHLHhhhhhhhllLLL
Query tGDLKalideksalIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQH.YADFApqveavtgaTLR 175
ident | | |
Sbjct .DSRQliqsaltalXDAAAAAGEIRSDIRSTDXFAALAGIALtSSRPD.........QRA 158
DSSP .LHHHhhhhhhhhhHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHhHLLHH.........HHH
DSSP LhhhhHHHHHHHHHhhhHHHLll
Query DevffNQTVENVQRiiiEGIRpr 198
ident |
Sbjct Q...aERLLDLVLD...GLRP.. 173
DSSP H...hHHHHHHHHH...HLLL..
No 33: 2GFNA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED
DSSP ..lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query ..avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | || | | | || | | | ||
Sbjct ivdhDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRR 60
DSSP llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH.HHHHLL.LLLLLHHHHHHHHHHHHHhhHHHL..HHHHHHHHHHHHLLllLLHH
Query ILDIWL.APLKAF.REDFAPLAAIKEYIRLKLevSRDY..PQASRLFCMEMLAGapLLMD 114
ident || | | | | | | |
Sbjct AGDIQGdRYRTILdEEGAGPIEKLRNITASIL..PLDErrLAXTRVFLFFYAEG..TARG 116
DSSP HHHHHHhHHHHHHlLLLLLHHHHHHHHHHLLL..LLLHhhHHHHHHHHHHHHHL..LLLH
DSSP HHHLhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query ELTGdlkalideksaliagwvkSGKLAP..IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg 171
ident | | | | | |
Sbjct EIAA.flarwrgvvresvvaaqREGTVStdLDADAVTVALVALTDGLALQAiLDPV..vx 173
DSSP HHHH.hhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLHH..hh
DSSP LLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query ATLRdevfFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident
Sbjct KAIS....AEDAAARCVDAAVRR.... 192
DSSP HHHL....LLLHHHHHHHHHHLL....
No 34: 1ZK8A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHhHHHHHHHHHHHH....HHHLllllLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHH
Query AVSAkKKAILSAALDTF....SQFGfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVL 56
ident | | | | | || |
Sbjct IGLT.LQKIVETAAEIAdangVQEV....TLASLAQTLGVRSPSLYNHVKGLQDVRKNLG 55
DSSP LLLL.HHHHHHHHHHHHhhhlHHHL....LHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH.HHHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHhhhhllllLLHHH
Query RQILDIWLA.PLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCmemlagapLLMDE 115
ident | | || | |
Sbjct IYGIKKLHNrLEEAAE.DKRXDEAIHALGEAYVAFVRKHPGLYEATF.......lRDEEV 107
DSSP HHHHHHHHHhHHHHHL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHLL.......lLLHHH
DSSP HhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHhhhHLLLl
Query LtGDLKALIDEKSALIAGWVKsgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADF.APQVeavTGATl 174
ident | | |
Sbjct R.KAGDGIVKLCLQVLQQYGL....egeNALHATRGFRSICHGFASIeQQGG...FGLP. 158
DSSP H.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL...LLLL.
DSSP llhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLL.l
Query rdevffnQTVENVQRIIIEGIRP.r 198
ident |
Sbjct ......lDLDISLHVLLETFIKGlr 177
DSSP ......lLHHHHHHHHHHHHHHHhl
No 35: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAv 55
ident || | | | | ||||| | || | ||| |
Sbjct glrerKKTRTREAIRAATYGLIRQQGYEATTVEQIAERAEVSPSTVLRYFPTREDIVLT. 59
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHLL.
DSSP hHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLH..hhhhhhhhhhhHHHHhHLHHHHHHHHHHHHLL..LL
Query lRQILDIWLAPLKAF.REDFAP..laaikeyirlkLEVSrDYPQASRLFCMEMLAG..AP 110
ident | | |
Sbjct .DEYDPVXAAELAARpAGEPWSdslrhvlrkalglGAGE.EAELIRLRTRLLAEVPavRA 117
DSSP .LLLHHHHHHHHHLLlLLLLHHhhhhhhhhhhhllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHLHhhHH
DSSP LLHHH........................hhlhHHHH..hhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LLMDE........................ltgdLKAL..ideksaliagwvksgklapid 144
ident |
Sbjct RXLENxsdtgrxlaraiadrtgldpdglevrivSXSLvgglxevsrywaehdheeslael 177
DSSP HHHHHllllllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh
DSSP hHHHHhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query pQHLIfmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct vDRAL........................................dalenglpa 191
DSSP hHHHH........................................hhhhhllll
No 36: 1V7BA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || | || | | ||| ||
Sbjct MRTSKKEMILRTAIDYIGEYSLETLSYDSLAEATGLSKSGLIYHFPSRHALLLGMHELLA 60
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHH.HHHHLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhhhhlHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHHhLH
Query DIWL.APLKAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEvsrdyPQASRLFCMEMlAGAPLLMDELtGD 119
ident | | | || | | |
Sbjct DDWDkELRDITRDpEDPLERLRAVVVTLAE...nvSRPELLLLIDA.PSHPDFLNAW.RT 115
DSSP HHHHhHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL...llLHHHHHHHHHH.HHLHHHHHHH.HH
DSSP HHHHhhhHHHHhhhhhhlllllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhllllllhh
Query LKALideKSALiagwvksgklaPIDP.QHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlrdev 178
ident | |
Sbjct VNHQ.wiPDTD.....dlendaHKRAvYLVQLAADGLFVHD.YIHDDV...........l 157
DSSP HHHH.hlLLLL.....lhhhlhHHHHhHHHHHHHHHHHHHH.HLLLLL...........l
DSSP HHHHHHhHHHHHHHHHHLLl
Query FFNQTVeNVQRIIIEGIRPr 198
ident | | |
Sbjct SKSKRQ.AMLETILELIPS. 175
DSSP LHHHHH.HHHHHHHHLLLL.
No 37: 2HKUA MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | || || || ||| | |
Sbjct ...QTRDALFTAATELFLEHGEG.VPITQICAAAGAHPNQVTYYYGSKERLFVEVACAAV 56
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHH.HHHLLllllLHHHHHHHHHHHH.HHHHhhlhhHHHHHHHHHhlLLLL....LHH
Query DIWLA.PLKAFredfAPLAAIKEYIRLK.LEVSrdypqASRLFCMEMlaGAPL....LMD 114
ident || | |
Sbjct LRAGKrAEDDAataeTVGDYTEKLVGSLlGPGA....pSVELFTSAX..LXTGrrseLRD 110
DSSP HHHHHhHHHHHhlllLHHHHHHHHHHHHhLLLH....hHHHHHHHHH..HHLLllhhHHH
DSSP HHHLHHHHHHHHHHHH.HHHHHHLLlLLLL.....LHHHHHHHHHhhhhhhhhlhhhhhh
Query ELTGDLKALIDEKSAL.IAGWVKSGkLAPI.....DPQHLIFMIWastqhyadfapqvea 168
ident | | | | | |
Sbjct LITDTLRTLHSSGEVAlIRTLXRTG.WQLRagidvESKAFWSAIF..............g 155
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHLL.LLLLllhhhHHHHHHHHHH..............h
DSSP hhllllllhhhhhHHHHHHHH...HHHHhHLLL....
Query vtgatlrdevffnQTVENVQR...IIIEgIRPR.... 198
ident | |
Sbjct lviqktatgesfgYSLEEAVAvifANLQ.IPETvrnt 191
DSSP hhhhhhhllllllLLHHHHHHhhhHHHL.LLHHhhhl
No 38: 1Z0XA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQF.GFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | | || | || || | || |
Sbjct ..KLSKDTIIAAAFSLLEKSpTLEQLSXRKVAKQLGVQAPAIYWYFKNKQALLQSXAEAI 58
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHHHLlLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhllllLLLHhhhhHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHhhhhhllllLLHHHHhLH
Query LDIWLAPlkafreDFAPlaaiKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFcmemlagapLLMDELtGD 119
ident |
Sbjct EEHFQEP....alCGEWysdlLAFXENYYDLYQQF.PCAVAI.......eiQTVPAY.PQ 105
DSSP HHLLLLL....llLLLHhhhhHHHHHHHHHHHHHL.LLHHHH.......hhLLLLLL.HH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHH.LHHH.............
Query LKALIDEKSALIAGWVksgkLAPIDpQHLIFMIWASTQHYAD.FAPQ............. 165
ident |
Sbjct RLRHLNQXXGILREAG....FSPEXtHLAVTSLQHLLFGXIXdATEEkqlvsqvlngddy 161
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLL....LLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhhhhlllhh
DSSP ......................hhhHHLLLlllhhHHHHHHhHHHHHHHHHHLLL.....
Query ......................veaVTGATlrdevFFNQTVeNVQRIIIEGIRPR..... 198
ident |
Sbjct lkeqvlhxkqyvsdneltyxeesiqFHSIH.....QKSAFI.QAVKTYLDGLQADntsss 215
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlLLHHH.....LHHHHH.HHHHHHHHHHLLLlllll
DSSP .
Query . 198
ident
Sbjct k 216
DSSP l
No 39: 2OERA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTfsqfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || || || |||| | ||| | |
Sbjct ..SELVASILEAAVQV......QRFTTARVAERAGVSIGSLYQYFPNKAAILFRLQSDEW 52
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHL......LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLL..lllLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlhhHHHHHHHHhhllLLLLhhhhhl
Query DIWLAPLKAF..redFAPLAAIKEYIRLKLEVsrdypqASRLFCMEmlagAPLLmdeltg 118
ident | ||
Sbjct RRTTRLLGEIledttRPPLERLRRLVLAFVRS....ecEEAAIRVA...lSDAA...ply 102
DSSP HHHHHHHHHHhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHH....hhHHHHHHHH...hHHHL...lll
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......llllLLLHhHHHHHH...HHHHhhhhHLHHhhhh
Query DLKALIDEKSALIAGWVKS.......gklaPIDPqHLIFMI...WASTqhyaDFAPqvea 168
ident | |
Sbjct EAREVKAEGARVFQAFLREalpevaeaersLAGD.LLTTTLgavGKQF..seQPRS.... 155
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhHHHH.HHHHHHhhhHHHH..llLLLL....
DSSP hhllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query vtgatlrdevffNQTVENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident |
Sbjct ........eaeiERYAEALADXLCAYLAALge 179
DSSP ........hhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhl
No 40: 1SGMA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLhHHHLLLLL..LHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSkTNLLYYFP..SKEALYIAVLRQ 58
ident || | | | | | || | || | || | |
Sbjct ..GDSREKILHTASRLSQLQGYHATGLNQIVKESGAP.KGSLYHFFpnGKEELAIEAVTY 57
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLL.LLHHHHLLllLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH.HHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHH....lhhhhHHHHHHHHLLL....
Query ILDIWLA.PLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRD....ypqasRLFCMEMLAGA.... 109
ident | |
Sbjct TGKIVEHlIQQSM...dessDPVEAIQLFIKKTASQfdntesikgIPVGLLASETAlise 114
DSSP HHHHHHHhHHHHH...hlllLHHHHHHHHHHHHHHLlllhhhlllLLLHHHHHHHLlllh
DSSP LLLHHHHHlhhhhhhhhhhhhHHHHHhlllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhh
Query PLLMDELTgdlkalideksalIAGWVksgkLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeav 169
ident || | | |
Sbjct PLRTVCMK.vfksweavfarkLMENG....FAEEEANQLGTLINSMIEGGIMLSLTN... 166
DSSP HHHHHHHH.hhhhhhhhhhhhHHHLL....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
DSSP hlLLLLlhhhhHHHHHHhHHHHHHhhlll
Query tgATLRdevffNQTVENvQRIIIEgirpr 198
ident |
Sbjct ..KDKT...plLLIAEQ.IPVLVR..... 184
DSSP ..LLLH...hhHHHHLL.HHHHLL.....
No 41: 2G7SA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | | | |||| | |
Sbjct NPQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHH.HHHLLLllLLHHhhhhhhhhhhHHHHHHL....hHHHHHHHHHHHLL...lLLL
Query DIWLA.PLKAFRedFAPLaaikeyirlkLEVSRDY....pQASRLFCMEMLAG...aPLL 112
ident | ||
Sbjct QEAEAgIAELEKniSDPL....eqlrayIGYWEGCiadatHPFCVCALLASEIpvlpETV 116
DSSP HHHHHhHHHHHHhlLLHH....hhhhhhHHHHHHHhhhllLLLLHHHHHHLLHhhllHHH
DSSP HHHHhlhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLL.llllhhhhHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhh
Query MDELtgdlkalideksalIAGWVKSGKL.apidpqhlIFMIWASTQHYADFA.PQVEavt 170
ident | | | | |
Sbjct VLEVrahfrslsdwltavLERGIAQGRLvltgtaranAEIFXATVHGAXLSArAHGD... 173
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLLlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL...
DSSP LLLLllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLl
Query GATLrdevffnqtvenvqrIIIEGIRPr 198
ident || | |
Sbjct AATF..........gaitrPXLERITA. 190
DSSP LLHH..........hhhhhHHHHHHLL.
No 42: 2DTZA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLHHHHHHhlLLLHH..hhllLLLLHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFgfhGTRLEQIAElaGVSKT..nllyYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | || | |
Sbjct NLKDKILGVAKELFIKNGYN...ATTTGEIVK..LSESSkgnlyyHFKTKENLFLEILNI 55
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HLLHHHHHH..HLLLLhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH.HHHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHhhhhHHLLL...LLLHH
Query ILDIWL.APLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLfcmeMLAGA...PLLMD 114
ident | | | | | |
Sbjct EESKWQeQWKKEQIkaKTNREKFYLYNELSLTTEYYY.PLQNAiiefYTEYYktnSINEK 114
DSSP HHHHHHhHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLHHHhhhhHHHHLllhHHHHH
DSSP HHhLHHHhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhllll
Query ELtGDLKalidekSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtgatl 174
ident | | |
Sbjct MN.KLENkyidayHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIVTFTH.........e 164
DSSP HH.HHHHhhhhhhHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.........l
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query RDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident | |
Sbjct QNINERIKLMNKFSQIFLNGLS.. 186
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
No 43: 2DG7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHhhhHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKealYIAVLR 57
ident ||| | | ||| || ||| |
Sbjct xarWDPGAEQRLKRAALELYSEHGYDNVTVTDIAERAGLTRRSYFRYFPDK...REVLFG 57
DSSP lllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLL...LHHHLL
DSSP HHHHhhhHHHHLLL...lLLLHHHHHHHHHHH.hhhHHHH...LHHHHHHHHHHhhllLL
Query QILDiwlAPLKAFR...eDFAPLAAIKEYIRL.kleVSRD...YPQASRLFCMEmlagAP 110
ident | | ||| | |
Sbjct GSELlppAVARAVLaadpGAAPLTAVLDAXSQvgaqLVAQvegAAQRRAVIDAS....PE 113
DSSP LLLLlhhHHHHHHHllllLLLHHHHHHHHHHHhlllLLLLlllHHHHHHHHHLL....HH
DSSP LLHHhhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHH...HHHHHHHHHHHHhhlhhhhh
Query LLMDeltGDLKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQH...LIFMIWASTQHYadfapqve 167
ident | | | |
Sbjct LQER.erTKSAAISRAVQDALVRRQ....vdaDTAELvaqLATVAFGSAFRR........ 160
DSSP HHHH.hhHHHHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHhhhHHHHHHHHHHHH........
DSSP hhhlLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query avtgATLRDevFFNQTVENVQRIIIegirpr 198
ident | | |
Sbjct .widAEGHA..DFGSCLDTVTDRLR.avltg 187
DSSP .hhhLLLLL..LHHHHHHHHHHHHH.hhhhl
No 44: 2IU5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | | | | || | |
Sbjct meKSIITQKIIAKAFKDLMQSNAYHQISVSDIMQTAKIRRQTFYNYFQNQEELLSWIFEN 60
DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhhlllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHlhhHHHHHHHHHHLLLLlLHHHHHL
Query ILDIWLAplkafredfaplaAIKEYIRLKLEVSRDypqASRLFCMEMLAGAPlLMDELTG 118
ident | |
Sbjct DFAELIN.......dnsdyyGWQNELLLLLRYLDE...NQIFYQKIFVIDKN.FEHFFLI 109
DSSP HHHHHHL.......llllllLHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHLLL.HHHHHHH
DSSP .........hhhhhhhhhhhhhHHHHHllllllllhhhHHHHhhhhhhhHHHLHHhhhhh
Query .........dlkalideksaliAGWVKsgklapidpqhLIFMiwastqhYADFAPqveav 169
ident
Sbjct qwenlldkvifdqekksdyhwsDLEKS......ficryNAAAicaitreSIIRGN..... 158
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllHHHHH......hhhhhHHHHhhhhhhhHHHHLL.....
DSSP hllllllhhhhhHHHHHHHHHhHHHHLLL..
Query tgatlrdevffnQTVENVQRIiIEGIRPR.. 198
ident
Sbjct .........sleKLYSQIVNL.LLAQIKIfe 179
DSSP .........llhHHHHHHHHH.HHHHHHLll
No 45: 2FQ4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllhhhhhhhllllhHHHLLL........l
Query .......AVSAKKKAILSAALDTfsqfgfhgtrleqiaelagvskTNLLYY........f 45
ident | |
Sbjct rnietqkAILSASYELLLESGFK..................avtvDKIAERakvskatiy 42
DSSP llhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL..................lllhHHHHHHhlllhhhhh
DSSP llhHHHHHHHHH..hhhhHHHHhhHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHhHHH
Query pskEALYIAVLR..qildIWLAplKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQAsRLF 101
ident | | |
Sbjct kwwPNKAAVVXDgflsaaAARL..PVPD.TGSALNDILIHATSLANFLISreGTII.NEL 98
DSSP hhlLLHHHHHHHhhhhhlLLLL..LLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLHH.HHH
DSSP HHHHHLlLLLL.HHHHHLhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHH
Query CMEMLAgAPLL.MDELTGdlkaliDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHY 159
ident | | | | | | | | |
Sbjct VGEGQF.DSKLaEEYRVRyfqprrLQAKQLLEKGIKRGELKEnLDIELSIDLIYGPIFYR 157
DSSP HHHHLL.LHHHhHHHHHHlhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLhHHHHhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query ADFaPQVEavtgatlrdevfFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | ||
Sbjct LLV.TGEK...........lDDSYVHDLVINAFEGirlr 184
DSSP HHL.LLLL...........lLHHHHHHHHHHHHHLllll
No 46: 2HXOA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHH.hHHHHlllllLHHHHHHHLlLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALD.tFSQFgfhgtRLEQIAELAgVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident || || | | |
Sbjct lSRERIVGAAVELLDtvGERG....lTFRALAERLaTGPGAIYWHITGKAELLGAATDAV 56
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHhlLLLL....lLHHHHHHHHlLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHhhhlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHHHHHLlLLLLHhhh
Query LDIWLAplkafredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYP...QASRLFCMEMLAgAPLLMdel 116
ident | |
Sbjct VTAAVT....agptgaadSPQDAVRAVALGLWDATEahpWLATQLATQLSR.TPWGT... 108
DSSP HHHHHL....llllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHhllHHHHHHHHHHHH.LLLLL...
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhHHHH.....
Query tgdlkalideksaliagwvksgkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYADFApqvEAVT..... 170
ident | |
Sbjct .......vaprifeslgrqvqaxGVPEaHWFTASSALXHYILGAAGQN.aaNDEFldtvs 160
DSSP .......hhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhLLHHhhhhh
DSSP .................llllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query .................gatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.. 198
ident |
Sbjct tawegldpdaypftravadqvrgHDDREQFLAGITLVLTGITALHrp 207
DSSP hhhllllllllhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLll
No 47: 2G7LA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...lhhhhhhHHHH.....hhHHHHhhhllllllHHHHHhhlLLLHHhhllllLLHHHH.
Query ...avsakkkAILS.....aaLDTFsqfgfhgtrLEQIAelaGVSKTnllyyfPSKEAL. 51
ident | |
Sbjct kpalsrrwivDTAValxraegLEKV........tXRRLA..qELDTG....paSLYVYVa 46
DSSP lllllhhhhhHHHHhhhhhhlLLLL........lHHHHH..hHLLLL....hhHHLLLLl
DSSP ..hHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhlll
Query ..yIAVLRQILDIWLAPLKAFredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlaga 109
ident | || |
Sbjct ntaELHAAVLDALLGEVDLTG..aEDWREQLRAVLTSYTLVLFAHPQLARSALVA..... 99
DSSP lhhHHHHHHHHHHLLLLLLLL..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL.....
DSSP lllhhhHHLHHHhhhhhhHHHHHHHHhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhH
Query pllmdeLTGDLKalidekSALIAGWVksgklAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveA 168
ident | | || |
Sbjct ....rpSGENYLrlvervLELLARSG.....APGAqVAWGVDKLLQDATATAAEQA..tS 148
DSSP ....llLLHHHHhhhhhhHHHHHLLL.....LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..lL
DSSP HHL.................lllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL......
Query VTG.................atlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR...... 198
ident | ||
Sbjct ATVralrdadeathpaiashxpllvaGSAHDRLRWSFDVLVNGITRTpvpgpa 201
DSSP HHHhhhhhllllllhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllll
No 48: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhh
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealy 52
ident | | | || | |
Sbjct dgtvkvsrSLKEMGNKIRKAKDELSKTRGR.APTVTEIADHLGISPEDVVLAQE...... 53
DSSP llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH......
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllll
Query iavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapll 112
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query mdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................avrl 57
DSSP ......................hhhl
No 49: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL......
Query ........aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...... 46
ident | | | | |
Sbjct mniaelygkMGKHSWRIMDAIFKNLWDYEY..VPLQLISSHARIGEEKARNILKylsdlr 58
DSSP llhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLL..EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhll
DSSP .......lhhhHHHH..HHHH.....................hhhhHHHHhhLLLLLLlh
Query .......skeaLYIA..VLRQ.....................ildiWLAPlkAFREDFap 76
ident | | |
Sbjct vvqnrqkdyegSTFTfiGLSLyslhrlvrsgkvdaigklmgegkesAVFN..CYSEKF.. 114
DSSP leeeellllleEEELhhHHHHhhhhhhhhllllleeeeeeeellleEEEE..EEELLL..
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query laaikeyirlklevsrdypqasRLFCMEMlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvk 136
ident
Sbjct .......gecvvkfhkvkvkehFSVLAIR............................... 136
DSSP .......eeeeeeeelllllllHHHHHHH...............................
DSSP llllllllhhhhhhhhHHHHhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhHHHHhhHHHH....
Query sgklapidpqhlifmiWASTqhyadfapqveavtgatlrdevffnqTVENvqRIII.... 192
ident
Sbjct .............sarNEFR.......................alqKLQG.lAVPKvyaw 159
DSSP .............hhhHHHH.......................hhhHLLL.lLLLLeeee
DSSP .................................................hhHLLL.....
Query .................................................egIRPR..... 198
ident
Sbjct egnavlmelidakelyrvrvenpdevldmileevakfyhrgivhgdlsqynVLVSeegiw 219
DSSP elleeeeelllleehhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleellllllllEEELlllee
DSSP ..................................................
Query .................................................. 198
ident
Sbjct iidfpqsvevgeegwreilerdvrniityfsrtyrtekdinsaidrilqe 269
DSSP elllllleelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl
No 50: 1XJEA MOLECULE: RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;
DSSP .........................................LHHHHHHHHHHHHHhHHHH
Query .........................................AVSAKKKAILSAALdTFSQ 19
ident | | |
Sbjct mklsdlisrwidvepsknaqiilrdryfmkdldgnyletkwEDVARRVARVVATA.ELLN 59
DSSP llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHH.HHHL
DSSP H.llLLLLHHHHHHHLLL............................lhhHHLLllLLHHH
Query F.gfHGTRLEQIAELAGV............................sktNLLYyfPSKEA 50
ident | | | |
Sbjct PsykKNEKLDRIKEWEDIffrvlkarlfipnsptlfnaglgvkhdllwkPIDQ..MTLED 117
DSSP LlllHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllleeelhhhhhhllllllhhhhllLHHH..LLHHH
DSSP HHHHHHHHhhHHHH......hhhhllLLLL.LHHHHHHHHH...................
Query LYIAVLRQilDIWL......aplkafREDF.APLAAIKEYI................... 84
ident |
Sbjct YEEIYRSR..NHLHmlsacfvvpvgdSIEEiFEAVKEYALItkvgggvgsnfselrpkgs 175
DSSP HHHHHHHL..LLLLlllleeelllllLHHHhHHHHHHHHHHhhllleeeeelllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 84
ident
Sbjct fvagthgkasgpvsfmhvfnsaisvvkqgsrrrgalmgilninhpdieefidakkvlnff 235
DSSP eelllleelllhhhhhhhhhhhhllleellleelleeeeeelllllhhhhhlllllllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 84
ident
Sbjct nlsvgfpmdkkeilklyeedgelelshprstirkkvkirelfrkiatnawksgdpglafl 295
DSSP eeeeellllhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhllleeelh
DSSP ......hhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ......rlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksg 138
ident
Sbjct gemnkyyplyphrkinstnpcgeiglsdyeacnlgsidvakfynngfvdlealqelvqia 355
DSSP hhhhhllllllllleeeelllllleeellleeeeeeeehhhheelleelhhhhhhhhhhh
DSSP llllllhhhhhhhhHHHHHHHHHLH...................................
Query klapidpqhlifmiWASTQHYADFA................................... 163
ident
Sbjct vrfldnvidvnvfpIDKITKAVKESrrlglgimgfadllykleipynsqeardfaanlma 415
DSSP hhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHlleeeeeelhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................HHHHHHH..................................
Query ...................PQVEAVT.................................. 170
ident
Sbjct fialhahrtsyelgkekgnFPLLEISryrtednfvpfamgmsnyddeirevmkmtkefrr 475
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHLhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 170
ident
Sbjct nvalltiaptgsisniadtssglepnfllaytrfvtkedgtkepllyvnqvlreklnpei 535
DSSP llllllllllllhhhhllllllllllllleelleeellllleeelleelhhhhhhllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 170
ident
Sbjct lkriekeliekgslkdipdvpekikkvfvvaldidpmdhllmqdafqryvdnnisktinm 595
DSSP hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllllleee
DSSP ....llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ....gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct pqsatvddvlnvylealrtnvrgitvyrdgsl 627
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhlllleeleeellll
No 51: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | | || |
Sbjct xatgglaiiqsxxhXLPPSERKLADYILAHPHX..aiESTVNEISALANSSDAAVIRLCX 58
DSSP llllhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHLHHH..hhLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH
DSSP .....LHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhH
Query .....SKEALYIAVlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlF 101
ident | |
Sbjct slglkGFQDLXXRV............................................aG 74
DSSP hllllLHHHHHHHH............................................hH
DSSP HHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query CMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct DLAKPTFQ.................................................... 82
DSSP HHHLHHHL....................................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................g 83
DSSP ....................................l
No 52: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHhhHHHHhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyIAVLrqil 60
ident | | | | | | |
Sbjct ..GSPEKILAQIIQE.HREG....LDWQEAATRASLSLEETRKLLQSXAA.aGQVT.... 48
DSSP ..LLHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.lLLEE....
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHHLL............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMEMLAG............ 108
ident
Sbjct ............................llrvendlyaiSTERYQAWWqavtraleefhs 80
DSSP ............................eeeelleeeeeEHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................lllLHHHHHLHHH........hHHHH.........
Query .........................aplLMDELTGDLK........aLIDE......... 126
ident | | |
Sbjct ryplrpglareelrsryfsrlparvyqaLLEEWSREGRlqlaantvaLAGFtpsfsetqk 140
DSSP hlllllleehhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHLLLeeeelleeeELLLlllllhhhh
DSSP .................................hhhhHHHHHHLLLLLL...........
Query .................................ksalIAGWVKSGKLAP........... 142
ident | | |
Sbjct kllkdledkyrvsrwqppsfkevagsfnldpseleelLHYLVREGVLVKindefywhrqa 200
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHHHLLLEEEllllleeehhh
DSSP ..llhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ..idpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct lgeareviknlastgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn 258
DSSP hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 53: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL..............
Query aVSAKKKAILSAALDTFSqfgFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.............. 46
ident | | || | |
Sbjct gIDPAIVEVLLVLREAGIengATPWSLPKIAKRAQLPXSVLRRVLTqlqaagladvsvea 60
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHLLlllLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeell
DSSP ....lhhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query ....skealyIAVLRQILDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfc 102
ident
Sbjct dgrghasltqEGAALAAQLFP....................................... 81
DSSP llleeeeelhHHHHHHHHHLL.......................................
DSSP hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query memlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................... 81
DSSP ....................................
No 54: 2AO9A MOLECULE: PHAGE PROTEIN;
DSSP ..........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhh
Query ..........aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskea 50
ident || | | | |
Sbjct mmakldelkqkLTAKQIQAAYLLVENELM.eeEKRTQDEMANELGINRTTLWEWRTknqd 59
DSSP lhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhlhh
DSSP hhHHHHHHHHhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllll
Query lyIAVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRlfcmemlagap 110
ident
Sbjct fiAFKSEVAD...................................SFLA........... 73
DSSP hhHHHHHHHH...................................HHHH...........
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHLHHHHHHHH
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyaDFAPQVEAVT 170
ident
Sbjct .................................................eKREQVYSKLM 84
DSSP .................................................lLHHHHHHHHH
DSSP LL...llllhHHHHHHHHHHHHHhhhHHLLL.....
Query GA...tlrdeVFFNQTVENVQRIiieGIRPR..... 198
ident
Sbjct QLilgpqpsvKAMQLYMQRFGLL...TDKKViegdl 117
DSSP HHhhlllllhHHHHHHHHHLLLL...EEEEEeeell
No 55: 1BBYA MOLECULE: RAP30;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.LHHH.........
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.SKEA......... 50
ident | | | | | |
Sbjct RARADKQHVLDMLFSAFEKHQ..YYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKeIGVQnvkgihknt 58
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhHLLLlllllllll
DSSP ..hhhhhHHHHhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ..lyiavLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident
Sbjct welkpeyRHYQ................................................. 69
DSSP lllllllLLLL.................................................
DSSP llllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ............................................................ 69
DSSP ............................................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 69
DSSP ..............................
No 56: 1GPJA MOLECULE: GLUTAMYL-TRNA REDUCTASE;
DSSP .........lhhhhHHHHHhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhllllllhhhh
Query .........avsakKKAILsaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskeal 51
ident |
Sbjct medlvsvgithkeaEVEEL..................ekarfesdeavrdivesfglsgs 42
DSSP llleeeeeeellllLHHHH..................hhhllllllhhhhhhhhhlllee
DSSP hhhhHHHHHHhhhHHHHLLLLLL..........lhhhHHHHHHHHHHHHHHH........
Query yiavLRQILDiwlAPLKAFREDF..........aplaAIKEYIRLKLEVSRD........ 93
ident | | | |
Sbjct vllqTSNRVE...VYASGARDRAeelgdlihddawvkRGSEAVRHLFRVASGlesmmvge 99
DSSP eeeeELLEEE...EEEELLLLLHhhhhhlllllleeeEHHHHHHHHHHHHLLllllllll
DSSP ..LHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhlhHHHHHhhhhhhhhhhhhllllllllhHHHHHH
Query ..YPQASrlfcmemlagapllmdeltgdLKALIdeksaliagwvksgklapidpQHLIFM 151
ident
Sbjct qeILRQV.............kkaydraaRLGTL.....................DEALKI 125
DSSP hhHHHHH.............hhhhhhhhHHLLL.....................LHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLHHHhhhhHLLL......................................
Query IWASTQHYADFAPQveavTGAT...................................... 173
ident |
Sbjct VFRRAINLGKRARE....ETRIsegavsigsaavelaerelgslhdktvlvvgagemgkt 181
DSSP HHHHHHHHHHHHHH....HLLLllllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 173
ident
Sbjct vakslvdrgvravlvanrtyeravelardlggeavrfdelvdhlarsdvvvsataaphpv 241
DSSP hhhhhhhhllleeeeelllhhhhhhhhhhhlleellhhhhhhhhhllleeeellllllll
DSSP ...........................................................l
Query ...........................................................l 174
ident
Sbjct ihvddvrealrkrdrrspiliidianprdveegveniedvevrtiddlrviarenlerrr 301
DSSP llhhhhhhhhhhlllllleeeeellllllllllhhhllleeeeehhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....................................
Query rDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..................................... 197
ident | |
Sbjct kEIPKVEKLIEEELSTVEEELEKlkerrlvadvakslheikdreleralrrlktvlqdfa 361
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh
DSSP ......................................l
Query ......................................r 198
ident
Sbjct eaytkrlinvltsaimelpdeyrraasralrraselnge 400
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhlll
No 57: 2CJJA MOLECULE: RADIALIS;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLllLHHHHHHHLL.LLHHHHLLLLLlhhhhhhhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFsqFGFHgtRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPskealyiavl 56
ident || | | |
Sbjct grpWSAKENKAFERALAVYD..KDTP.dRWANVARAVEgRTPEEVKKHYE.......... 47
DSSP lllLLHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL.lHHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHH..........
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllHHHH
Query rqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllMDEL 116
ident
Sbjct ..................................................ilvediKYIE 57
DSSP ..................................................hhhhhhHHHH
DSSP HLHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query TGDlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident |
Sbjct SGK......................................................... 60
DSSP HLL.........................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................vpf 63
DSSP ...................lll
No 58: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHHhh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqi 59
ident | |
Sbjct mkLDQIDLNIIEELKKDS......rLSMRELGRKIKLSPPSVTERVR.qlesfGIIKQ.. 51
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEE..
DSSP hhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHhhhllllllhhhhhlh
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMemlagapllmdeltgd 119
ident
Sbjct .......................................yTLEV...dqkklglpvsciv 69
DSSP .......................................eEEEE...llhhhllleeeee
DSSP hhhhhhhhHHHHHHH....hhllllllllhhhHHHHH.........hhhhhhhhhlhhhh
Query lkalidekSALIAGW....vksgklapidpqhLIFMI.........wastqhyadfapqv 166
ident
Sbjct eatvknadYERFKSYiqtlpniefcyriagaaCYMLKinaesleavedfinktspyaqtv 129
DSSP eeeehhhlHHHHHHHhhlllleeeeeeeelllLEEEEeeellhhhhhhhhhhhllleeee
DSSP hhhhLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query eavtGATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct thviFSEID.....................tk 140
DSSP eeeeEEELL.....................ll
No 59: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP .....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLL..LHHHHHHHLL..........LLHHHHLL
Query .....aVSAKKKAILSAALDTFSQFgFHGT..RLEQIAELAG..........VSKTNLLY 43
ident || |
Sbjct naealqLNSTEVRILGCLIEKQATN.PETYplTLNALVIACNqktsrdpvxnLTQGQVGQ 59
DSSP llllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHLleEHHHHHHHHLllllllllllLLHHHHHH
DSSP LLL............lhhhhhHHHHhHHHHHhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query YFP............skealyIAVLrQILDIwlaplkafredfaplaaikeyirlklevs 91
ident
Sbjct SLRalegrgltrlvxgsradrWEHK.VDKGL............................e 90
DSSP HHHhhhhllleeeelllllleEEEL.HHHHH............................l
DSSP hHLHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh
Query rDYPQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifm 151
ident |
Sbjct lVPAQVIL.......................................tgllllrgpqtvs 111
DSSP lLHHHHHH.......................................hhhhhhhlleehh
DSSP hhhhhhhhhHLHHhhhhhhlLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhHHHH...............l
Query iwastqhyaDFAPqveavtgATLRdevffnqtvenvqriiIEGI...............r 196
ident
Sbjct elltrsnrxHDFE.....dsEQVVhqlerliarglatlvpRQSGqredryxhligdpedl 166
DSSP hhhhhllllLLLL.....lhHHHHhhhhhhhhllleeeelLLLLlllleeeellllhhhh
DSSP ll
Query pr 198
ident
Sbjct qd 168
DSSP ll
No 60: 2HXIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHH...HHLLlllLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL...LHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFS...QFGFhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...SKEALYIA 54
ident || || | | | | |
Sbjct ..RWSTEQILDAAAELLLagdAETF...SVRKLAASLGTDSSSLYRHFRnktELLRAVAD 55
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHLlllLLLL...LHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhHHHHhhLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHhllLLLLHH
Query VLRQILDiWLAPlkAFREdfaplaaikeyirlklevsrdypqasRLFCMEMlagAPLLMD 114
ident | |
Sbjct RILLSAX.DGYR..PEGD.............wkqrltavalrlrESFGQQP.qlAAVWGR 98
DSSP HHHHHHH.LLLL..LLLL.............hhhhhhhhhhhhhHHLLLLH.hhHHHHHH
DSSP ......hhhlHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllLLHHHH....................
Query ......eltgDLKALIDEKSALIAgwvksgklapIDPQHL.................... 148
ident |
Sbjct hgsggtgsrlXXEEVLQALRASGL........pdDEIPARyhrlvilisslitaeggfrv 150
DSSP hllllhhhhhHHHHHHHHHHHLLL........lhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP .............hhhhhhhhhhhhhLHHHhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .............ifmiwastqhyadFAPQveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegi 195
ident
Sbjct avlgadperfpalshfareirplgadRGAA................feeilaahlahlea 194
DSSP llllllllllhhhhhhhhhlllllllHHHH................hhhhhhhhhhhhhh
DSSP lll
Query rpr 198
ident
Sbjct aap 197
DSSP hll
No 61: 2DOBA MOLECULE: PROACTIVATOR POLYPEPTIDE;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHH.........lllLHHHHLLLLllhH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAEL.........agvSKTNLLYYFpskE 49
ident | || | | | |
Sbjct gsLPCDICKDVVTAAGDXLKDNATeeEILVYLEKTcdwlpkpnxsasCKEIVDSYL...P 57
DSSP llHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLhhHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhHHHHHHHHH...H
DSSP HHHHHHHHhhHHHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query ALYIAVLRqiLDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlaga 109
ident
Sbjct VILDIIKG..EXSR.............................................. 69
DSSP HHHHHLLL..LLLL..............................................
DSSP lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query pllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav 169
ident
Sbjct ............................................................ 69
DSSP ............................................................
DSSP hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................pgevcsalnlces 82
DSSP ................hhhhhhhllllll
No 62: 2CMPA MOLECULE: TERMINASE SMALL SUBUNIT;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLL....LHHHHLLLLLlhhHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGV....SKTNLLYYFPskeALYIAVL 56
ident | | | || |
Sbjct klSPKQERFIEEYFIND.......mNATKAAIAAGYsknsASAIGAENLQ.kpAIRARID 52
DSSP llLHHHHHHHHHHHHLL.......lLHHHHHHHLLLllllHHHHHHHHHH.lhHHHHHHH
DSSP HHHHhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct ARLK........................................................ 56
DSSP HHHL........................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................... 56
DSSP ......................
No 63: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLHHHHHHHLLLLHHhhllllLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfhGTRLEQIAELAGVSKTnllyyfPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | |
Sbjct .MQEQRQQLLRSLEALIFSS.eePVNLQTLSQITAHKFT.....pSELQEAVDELNRDYE 53
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLHHHHHHHLLLLLL.....hHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHH..........HHLLll
Query DIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCME..........MLAGap 110
ident
Sbjct ATG.....................................RTFRihaiaggyrfLTEP.. 74
DSSP HHL.....................................LLEEeeeelleeeeEELH..
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHhhh
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadFAPQVEavt 170
ident |
Sbjct ...............................................efadLVRQLL... 84
DSSP ...............................................hhhhHHHHHH...
DSSP llllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL................................
Query gatlrdevfFNQTVENVQRIIIEGIRPR................................ 198
ident |
Sbjct .......apVIQRRLSRSMLEVLAVVAWhqpvtkgeiqqirgaspdysidrllargliev 137
DSSP .......llHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlleehhhhhhhhllllllhhhhhhhllleee
DSSP .........................
Query ......................... 198
ident
Sbjct rgradspgrplqygttevfldlfhl 162
DSSP eeellllllleeeeelhhhhhhlll
No 64: 1B9MA MOLECULE: PROTEIN (MODE);
DSSP ................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllHHHHHHHLLLLHHHHLLL
Query ................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtrLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | || |
Sbjct hxqaeilltlklqqklfADPRRISLLKHIALSG........sISQGAKDAGISYKSAWDA 52
DSSP lllleeeeeeeelleeeELHHHHHHHHHHHHHL........lHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP LL......lhHHHH.....hhHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query FP......skEALY.....iaVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrd 93
ident |
Sbjct INexnqlsehILVEratggavLTRY................................... 77
DSSP HHhhhhhhllLLEEelllleeELHH...................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw 153
ident
Sbjct ....................................................gqrliqly 85
DSSP ....................................................hhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhlhhHHHHHHlllllLHHHHHHHHHHHHHHhhHHHL.................
Query astqhyadfapQVEAVTgatlrDEVFFNQTVENVQRIiiEGIR................. 196
ident | |
Sbjct dllaqiqqkafDVLSDD..dalPLNSLLAAISRFSLQ..TSARnqwfgtitardhddvqq 141
DSSP hhhhhhhhhhhHHHHHL..lllLLLLHHHHHHHHLEE..ELLLeeeeeeellllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 196
ident
Sbjct hvdvlladgktrlkvaitaqsgarlgldegkevlillkapwvgitqdeavaqnadnqlpg 201
DSSP eeeeeellllleeeeellhhhhhhllllllleeeeeelhhhleeellhhhhhllleeeee
DSSP .......................................................ll
Query .......................................................pr 198
ident
Sbjct iishiergaeqcevlxalpdgqtlcatvpvneatslqqgqnvtayfnadsviiatlc 258
DSSP eeeeeeellleeeeeeellllleeeeeeehhhhllllllleeeeeelhhhleeeeel
No 65: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHH
Query ............................aVSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAE 32
ident | | | |
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangigngLTPTQWAALVRLGETGP......CPQNQLGR 54
DSSP llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHLL......LLHHHHHH
DSSP HLLLLHHHHLLLLL..lhhhHHHH.............HHHHhhhhhhhhhhlllllllhh
Query LAGVSKTNLLYYFP..skeaLYIA.............VLRQildiwlaplkafredfapl 77
ident | |
Sbjct LTAXDAATIKGVVErldkrgLIQRsadpddgrrllvsLSPA................... 95
DSSP HLLLLHHHHHHHHHhhhhllLEEEeeelleeeeeeeeELHH...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvks 137
ident
Sbjct ............................................................ 95
DSSP ............................................................
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlRDEVFFnqtvenvqriiiegirp 197
ident
Sbjct ...............graeleaglaaareinrqalapLSLQEQ.......etlrgllarl 133
DSSP ...............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHH.......hhhhhhhhll
DSSP l
Query r 198
ident
Sbjct i 134
DSSP l
No 66: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.........lhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.........skeal 51
ident || | | | | |
Sbjct ..DNLEQKILQVLSD.DGGP....VAIFQLVKKCQVPKKTLNQVLYrlkkedrvsspspk 53
DSSP ..LHHHHHHHHHHHH.HLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeell
DSSP hhHHHHhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query yiAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapl 111
ident
Sbjct ywSIGG...................................................... 59
DSSP eeEELL......................................................
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg 171
ident
Sbjct ............................................................ 59
DSSP ............................................................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query atlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................... 59
DSSP ...........................
No 67: 1FX7A MOLECULE: IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL...........l
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...........s 47
ident | | ||| |
Sbjct mnELVDTTEMYLRTIYDLEEEGVT..PLRARIAERLDQSGPTVSQTVSrmerdgllrvag 58
DSSP llLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeell
DSSP hhhHHHH..HHHH.........................hhhhhhhhhhlllllllhhhhH
Query keaLYIA..VLRQ.........................ildiwlaplkafredfaplaaI 80
ident |
Sbjct drhLELTekGRALaiavmrkhrlaerllvdviglpweevhaeacrwehvmsedverrlvK 118
DSSP lllEEELhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhH
DSSP HHHHhhHHHH...HHHLhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query KEYIrlKLEV...SRDYpqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvks 137
ident
Sbjct VLNN..PTTSpfgNPIP........................................... 133
DSSP HLLL..LLLLlllLLLL...........................................
DSSP lllllllhhhHHHHhhhhhhhhhhLHHHH...............................
Query gklapidpqhLIFMiwastqhyadFAPQV............................... 166
ident
Sbjct .....gldelGVGP......epgaDDANLvrltelpagspvavvvrqltehvqgdidlit 182
DSSP .....lhhhhLLLL......llllLLLLLeehhhlllllleeeeeeeelhhhhllhhhhh
DSSP hhhhllllLLHH................hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query eavtgatlRDEV................ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct rlkdagvvPNARvtvettpgggvtivipghenvtlphemahavkvekv 230
DSSP hhhhllllLLLEeeeeellllleeeelllllleeelhhhhlleeeeel
No 68: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHHhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqil 60
ident || | |
Sbjct hLDDLDRNILRLLKKDA......RLTISELSEQLKKPESTIHFRIK.klqerGVIER... 50
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHLL......LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEE...
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct .........................................yTIIL.......geqlkpk 62
DSSP .........................................eEEEE.......lllllll
DSSP hhhhhhhhhhhhHHHHllllllLLHHH...hhhhHHHH......................
Query kalideksaliaGWVKsgklapIDPQH...lifmIWAS...................... 155
ident
Sbjct hlalivlevgkpEDFL..eryiSYISStlsalpgVLFVaksgedkiialvgknnkdelvk 120
DSSP eeeeeeeeelllLHHH..hhhhHHHHHhhhllllEEEEeeellleeeeeeeellllhhhh
DSSP .....hhhhhhlhhhhhhhHLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .....tqhyadfapqveavTGATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct fieenitsipnlkhiqifpITEIKK............gedltgflaev 156
DSSP hhhhhlllllleeeeeeeeLLEEEE............lllhhhhhlll
No 69: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllLHHHHHHHLLL..LHHHHLLLLL............
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgtRLEQIAELAGV..SKTNLLYYFP............ 46
ident | | |
Sbjct kLNDRQRKVLYCIVREYIENKK.pvSSQRVLEVSNIefSSATIRNDMKkleylgyiyqph 59
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.llLHHHHHHHLLLllLHHHHHHHHHhhhhllleelll
DSSP lhHHHHhhHHHH................................................
Query skEALYiaVLRQ................................................ 58
ident
Sbjct tsAGRI..PTDKglrfyyeemlkisketseadlavetfksmpladpekvlflagnllarl 117
DSSP llLLLE..ELHHhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 58
ident
Sbjct tegyvlierpntrdlkilrvmlipvsedylifsiltefgvskvtpiktqerlnweeierq 177
DSSP hlleeeeelllhhhlllleeeeeelllleeeeeeeelleeeeeeeeellllllhhhhhhh
DSSP .....hhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHLLllllh
Query .....ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmeMLAGapllm 113
ident
Sbjct lnfllrgrtvgevlmgkieslkgsgflrliesligetveryldaglenllkDETL..... 232
DSSP hhhhhllllhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeelhhhhhhLLLL.....
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllLLHHHHHHH......................
Query deltgdlkalideksaliagwvksgklapIDPQHLIFM...................... 151
ident
Sbjct ................tledirnlleevkDQKFLESLVgegitvrigreigrkklekfav 276
DSSP ................lhhhhhhhhhhllLHHHHHHHLlllleeeehhhhllhhhlleee
DSSP ...........hhhHHHH.......hHHLHhhhhhhhllLLLLhhHHHHHHHhhhhhhhh
Query ...........iwaSTQH.......yADFApqveavtgaTLRDevFFNQTVEnvqriiie 193
ident | |
Sbjct fsgkyfkgespigsVYLFtskvtkydRNHR.........VFEY..ILNRLSE.......y 318
DSSP eeeeeeelleeeeeEEEEeellllhhHHHH.........HHHH..HHHHHHH.......h
DSSP hhlll
Query girpr 198
ident
Sbjct ftsts 323
DSSP hhhll
No 70: 1SFUA MOLECULE: 34L PROTEIN;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTfsQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLr 57
ident | | | |
Sbjct ctvNDAEIFSLVKKEVLSL.nTNDY..TTAISLSNRLKINKKKINQQLY.klqkeDTVK. 55
DSSP lllLLHHHHHHHHHHHHLL.lLLLE..ELHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEE.
DSSP hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHhhhllllllhhhhh
Query qildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMemlagapllmdelt 117
ident
Sbjct ...............................mvpsnppkwfkNYNC.............. 70
DSSP ...............................eellllleeeeLLLL..............
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllh
Query gdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrde 177
ident
Sbjct ............................................................ 70
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................... 70
DSSP .....................
No 71: 1J5YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR
DSSP LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHhhhh
Query AVSAkKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLrqil 60
ident | | || ||
Sbjct XKTV.RQERLKSIVRILERS.kEPVSGAQLAEELSVSRQVIVQDIA..ylrsLGYN.... 52
DSSP LHHH.HHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH..hhhhHLLL....
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHhhllllllhhHHHLhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMEmlagapllmdELTGdl 120
ident
Sbjct ............................ivatprgyvlaGGKSG.........vSRLV.. 73
DSSP ............................leeelleeellLLLLL.........eEEEE..
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHH..lhhhhhhhhllllllhh
Query kalideksaliagwvksgklapidpqHLIFMIWASTQHYAD..fapqveavtgatlrdev 178
ident
Sbjct .....................avkhaPEEIKEELLCVVRNGgrivdvivehpvygeirgi 112
DSSP .....................eeellHHHHHHHHHHHHHLLleeeeeeeeellleeeeee
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHLLL........................................
Query ffnqtvenvQRIIIEGIRPR........................................ 198
ident
Sbjct idvsseeevLKFVNLXEXAKteplltlsggvhlhtieapdeetxerixrelkkkgfliee 172
DSSP eeellhhhhHHHHHHHHHLLllllllhhhheeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllll
No 72: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi 60
DSSP llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ...............lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.LLHHHHLLL
Query ...............aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYY 44
ident | | | |
Sbjct epyrlpeviqkcnarwTTEEQLLAVQAIRKYG.......RDFQAISDVIGnKSVVQVKNF 113
DSSP hhhlllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHL.......LLHHHHHHHHLlLLHHHHHHH
DSSP llLHHHhhHHHHHhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHhhhh
Query fpSKEAlyIAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRLfcme 104
ident
Sbjct .fVNYRrrFNIDE...................................vlqEWEAE.... 133
DSSP .hHHLLllLLHHH...................................hhhHHHLL....
DSSP hhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query mlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfap 164
ident
Sbjct ............................................................ 133
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................. 133
DSSP ..................................
No 73: 2FXAA MOLECULE: PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;
DSSP .....................................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query .....................................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfh 23
ident || |
Sbjct ppydvkealvftqkxaqlskalwksiekdwqqwlkpydLNINEHHILWIAYQLN...... 54
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlLLHHHHHHHHHHHHHL......
DSSP llLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL...........lhhhHHHH..HHHHHHHHhhhhhhll
Query gtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...........skeaLYIA..VLRQILDIwlaplkaf 70
ident ||
Sbjct gaSISEIAKFGVXHVSTAFNFSKkleergylrfskrtyVQLTeeGTEVFWSL........ 106
DSSP leEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhhhhlleeeellleEEELhhHHHHHHHH........
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhh
Query redfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksal 130
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllLLHHhHHHHHHHHH..
Query iagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlRDEVfFNQTVENVQ.. 188
ident
Sbjct ..................................leefdptrnaVFKG.SQPLYHLFGkf 131
DSSP ..................................hhhllhhhlhHHHH.LHHHHHHHLll
DSSP ...............hhhhhhhlll
Query ...............riiiegirpr 198
ident
Sbjct pevaexxcxirhiygddfxeifets 156
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 74: 2FQ3A MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;
DSSP ...........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHH
Query ...........................AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTRLEQIAEL 33
ident
Sbjct skwfnlekihsievqslpefftnripsKTPEVYMRYRNFMVNSYRLNPnEYFSVTTARRN 60
DSSP llllllllllhhhhhhlhhhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLHHHHHHH
DSSP LLLLHHHHLLLLLlhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AGVSKTNLLYYFPskeALYIAvlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrd 93
ident | |
Sbjct VSGDAAALFRLHK...FLTKW....................................... 78
DSSP LLLLHHHHHHHHH...HHHHL.......................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw 153
ident
Sbjct ............................................................ 78
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query astqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................................glinyqv 85
DSSP ......................................lllllll
No 75: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.........lhhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.........skeal 51
ident | | ||| |
Sbjct .tTPSMEDYIEQIYMLIEEKGY..ARVSDIAEALAVHPSSVTKMVQkldkdeyliyglvl 57
DSSP .lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleelllee
DSSP hHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHHlhhhhhhhhhhhhlllll
Query yIAVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlkleVSRDypqasrlfcmemlagapl 111
ident
Sbjct tSKGKKI.......................gkrlvyrhELLE.................. 76
DSSP lHHHHHH.......................hhhhhhhhHHHH..................
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhHHHH........hhhhhlh
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiWAST........qhyadfa 163
ident
Sbjct .......................................qfLRIIgvdeekiyndvegie 97
DSSP .......................................hhHHHLlllhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhlLLLLLhhHHHHHH...hHHHHHHHHHHLll
Query pqveavtgATLRDevFFNQTV...eNVQRIIIEGIRpr 198
ident |
Sbjct hhlswnsiDRIGD..LVQYFEeddaRKKDLKSIQKK.. 131
DSSP hhllhhhhHHHHH..HHHHHHllhhHHHHHHHHHHL..
No 76: 2DT5A MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..lLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL...........
Query .aVSAKKKAILSAALDTFSQFG..fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP........... 46
ident | | | || || |
Sbjct kvPEAAISRLITYLRILEELEAqgvHRTSSEQLGGLAQVTAFQVRKDLSyfgsygtrgvg 60
DSSP llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLEELHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhllllllllll
DSSP .lhhhHHHHHHH.HHHHHhHHHHhllllllLHHH.hhhhhhhhhHHHHhhlhhhhhhhhh
Query .skeaLYIAVLR.QILDIwLAPLkafredfAPLA.aikeyirlkLEVSrdypqasrlfcm 103
ident | | |
Sbjct ytvpvLKRELRHiLGLNR.KWGL......cIVGMgrlgsaladyPGFG............ 101
DSSP eehhhHHHHHHHhHLLLL.LEEE......eEELLlhhhhhhhhlLLLL............
DSSP hhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHHHhlllLLLL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhl
Query emlagapllmdeltgdlkalideksaliAGWVksgkLAPI.DPQHlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct .....esfelrgffdvdpekvgrpvrggVIEH....VDLLpQRVP............... 137
DSSP .....lleeeeeeeelllllllleelleEEEE....HHHHhHHLL...............
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhHHHHHHH...........................
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqRIIIEGI........................... 195
ident
Sbjct ...........grieialltvpreaaQKAADLLvaagikgilnfapvvlevpkevavenv 186
DSSP ...........lllleeeelllhhhhHHHHHHHhhhllleeeelllllllllllleeeel
DSSP .....................lll
Query .....................rpr 198
ident
Sbjct dflagltrlsfailnpkwreemmg 210
DSSP llhhhhhhhhhhhhlllllhhhhl
No 77: 2DBBA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHHhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqil 60
ident |
Sbjct kLDRVDMQLVKILSENS......rLTYRELADILNTTRQRIARRID.klkklGIIRK... 50
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH.hhhhhLLEEE...
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHH.................
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCM................. 103
ident
Sbjct ......................................fTIIPdidklgymyaivliksk 72
DSSP ......................................eEEEEllhhhleeeeeeeeeel
DSSP ...hhhllllllhhhhhlhHHHH........................hhhhhhhhHHHHh
Query ...emlagapllmdeltgdLKAL........................ideksaliAGWVk 136
ident
Sbjct vpsdadkviseisdieyvkSVEKgvgryniivrlllpkdikdaenliseflqrikNAEN. 131
DSSP lhhhhhhhhhhhllllleeEEEEeelllleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllLEEE.
DSSP llllllllhhhHHHHhhhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query sgklapidpqhLIFMiwastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegir 196
ident |
Sbjct .........veVILI....seVRKF..................................e 144
DSSP .........eeEEEE....eeEEEE..................................l
DSSP ll
Query pr 198
ident
Sbjct ii 146
DSSP ll
No 78: 2P5VA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhHHHHHh
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRq 58
ident || | | | |
Sbjct qlTLDKTDIKILQVLQENG......rLTNVELSERVALSPSPCLRRLK.qledaGIVRQ. 52
DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEE.
DSSP hhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH.llllllhhhhh
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEML.agapllmdelt 117
ident
Sbjct ..........................................yaALLSpesvnlglqafi 70
DSSP ..........................................eeEEELlhhhllleeeee
DSSP lhhhhhhhhhhHHHH.....hhhhllllllllhhhHHHHH....................
Query gdlkalideksALIA.....gwvksgklapidpqhLIFMI.................... 152
ident |
Sbjct rvsirkakdarEDFAasvrkwpevlscfaltgetdYLLQAfftdxnafshfvldtllshh 130
DSSP eeeelllllhhHHHHhhhllllleeeeeeelllllEEEEEeellhhhhhhhhhhllllll
DSSP .......hhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .......wastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct gvqdaqssfvlkEIKH...........................ttslplnhll 156
DSSP leeeeeeeeeeeEEEE...........................llllllhhhl
No 79: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .....LHHHhHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.....lhhH
Query .....AVSAkKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.....skeA 50
ident | | |
Sbjct pllrrLDLN.LLLVFDALYRHR........NVGTAASELAISASAFSHALGrlrqglddE 51
DSSP lllllLLLL.HHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhhhllL
DSSP HHH.......hhhHHHHhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query LYI.......avlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcm 103
ident | |
Sbjct LFLrqgnrmqptqRAEH........................................... 68
DSSP LEEeelleeeelhHHHH...........................................
DSSP hhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query emlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfa 163
ident
Sbjct ............laaavaaalralgegleewrpfvpgqsqrtfvfaatdytafallpplm 116
DSSP ............hhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllllllllleeeeellhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhHHHLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL.........................
Query pqveAVTGATlrdevffnqtvenvqriiiegIRPR......................... 198
ident
Sbjct nrlqHSAPGV.................rlrlVNAErklsvealasgridfalgydeeher 159
DSSP hhhhHHLLLL.................eeeeELLLllllhhhhhhlllleeeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 198
ident
Sbjct lpegiqahdwfadryvvvarrdhprlagaptlegylaerhavvtpwnedsgvidrllars 219
DSSP lllleeeeeeeeeleeeeeelllllllllllhhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 198
ident
Sbjct glrrevavqlptvlaalflagstdflltaprhaaralaeaaglalypapfdippyvlrly 279
DSSP lllleeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeehhhhhhhhhhhleeeelllllllleeeeee
DSSP ....................
Query .................... 198
ident
Sbjct shvqgrdahawmigqlkgld 299
DSSP eellllhhhhhhhhhlllll
No 80: 1HLVA MOLECULE: MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.......
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP....... 46
ident | | | || |
Sbjct mgpkrrqLTFREKSRIIQEVEENP......DLRKGEIARRFNIPPSTLSTILKnkraila 54
DSSP lllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL......LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHlhhhhhh
DSSP .........lhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL..LLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query .........skealyiavlrqildiwlaPLKAF..REDFaplaaikeyirlklevsrdyp 95
ident
Sbjct serkygvastcrktnklspydkleglliAWFQQirAAGL..................... 93
DSSP hhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhHHHHHhhHHLL.....................
DSSP hhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLHHHHHhhhhhh
Query qasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapiDPQHLIfmiwas 155
ident
Sbjct ............................................pvkgIILKEK...... 103
DSSP ............................................lllhHHHHHH......
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhHHHHhhHHHL............ll
Query tqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenVQRIiiEGIR............pr 198
ident
Sbjct .........................alriaeELGM..DDFTasngwldrfrrrrs 131
DSSP .........................hhhhhhHHLL..LLLLllhhhhhhhhhhll
No 81: 1CF7A MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLL.LHHHHLLLLLlhhhhhHHHHhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFPskealyIAVLrq 58
ident | | | |
Sbjct sRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVrQKRRIYDITNvlegigLIEK.. 58
DSSP lLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHhhhhhlLEEE..
DSSP hhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg 118
ident
Sbjct ............................................................ 58
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident
Sbjct ............................................................ 58
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........ksknsiqwk 67
DSSP ...........eelleeeel
No 82: 1B4AA MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.....LLHHHHLLLLLlhhHHHH..
Query avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.....VSKTNLLYYFPskeALYI.. 53
ident | | |
Sbjct ..GQRHIKIREIIMSND......iETQDELVDRLReagfnVTQATVSRDIK.emQLVKvp 51
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHHHhllllLLHHHHHHHHH.hlLLEEee
DSSP ........HHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
Query ........AVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmem 105
ident
Sbjct mangrykySLPSD............................................... 64
DSSP llllleeeELLLL...............................................
DSSP hllLLLLHHHHHLHHHHHHHH............HHHH...........hhhhhhllllll
Query lagAPLLMDELTGDLKALIDE............KSAL...........iagwvksgklap 142
ident
Sbjct ...QRFNPLQKLKRALVDVFIkldgtgnllvlrTLPGnahaigvlldnldwdeivgticg 121
DSSP ...LLLLHHHHHHHHHHHHEEeeeeelleeeeeELLLlhhhhhhhhhhhlllleeeeeel
DSSP llHHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhHHHHHHH....hhhlll
Query idPQHLifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtveNVQRIII....egirpr 198
ident
Sbjct ddTCLI...................................icRTPKDAKkvsnqllsml 146
DSSP llEEEE...................................eeLLHHHHHhhhhhhhlll
No 83: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct etvsfkagdvilypgvpgprdrayrvleglvrleavdeegnaltlrlvrpggffgeealf 60
DSSP lleeelllleeellllllllllleeeeelleeeeeellllleeeeeeelllleellhhhh
DSSP .................................................lhHHHHHHHHH
Query .................................................avSAKKKAILS 11
ident |
Sbjct gqeriyfaeaatdvrleplpenpdpellkdlaqhlsqglaeayrrierlatQRLKNRXAA 120
DSSP lllllleeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLL........lLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL.......lhhhhhhhhH
Query AALDTFSQFGF........hGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.......skealyiavL 56
ident | | | | |
Sbjct ALLELSETPLAheeegkvvlKATHDELAAAVGSVRETVTKVIGelaregyirsgygkiqL 180
DSSP HHHHHLLLLLEeeelleeeeELLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeelleeeE
DSSP HHHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct LDLKG....................................................... 185
DSSP LLHHH.......................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 185
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............lkelaesrg 194
DSSP .............hhhhhllll
No 84: 1UFMA MOLECULE: COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;
DSSP .........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHLlllLLHH.HHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHH
Query .........AVSAkKKAILSAALDTFSQFGfhgTRLE.QIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA 50
ident | | |
Sbjct gssgssggsSILD.RAVIEHNLLSASKLYN...NITFeELGALLEIPAAKAEKIASQMIT 56
DSSP lllllllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHLLL...EEEHhHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP hhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllll
Query lyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagap 110
ident
Sbjct .eGRMN.................................gfidqidgivhfeTREA.... 78
DSSP .lLLLL.................................eeeelllleeeelLLLL....
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhHHHHhhhhhlhhhhhhhh
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiWASTqhyadfapqveavt 170
ident |
Sbjct ........................................sgPSSG.............. 84
DSSP ........................................llLLLL..............
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................ 84
DSSP ............................
No 85: 1SFXA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;
DSSP ................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLL
Query ................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | | || |
Sbjct hxsnplgelvkaleklsfKPSDVRIYSLLLERG......gXRVSEIARELDLSARFVRDR 54
DSSP llllhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP LL...............lhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query FP...............skealyiaVLRQILDIWlaplkafredfaplaaikeyirlkle 89
ident
Sbjct LKvllkrgfvrreivekgwvgyiysAEKPEKVLK.......................... 88
DSSP HHhhhhllleeeeeeellleeeeeeELLHHHHHH..........................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhLHHHHHHHHHHHHHhhHHHLlllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltGDLKALIDEKSALIagWVKSgklapidpqhli 149
ident | |
Sbjct .........................efkSSILGEIERIEKXF..TDGS............ 109
DSSP .........................hhhHHHHHHHHHHHLLL..LLLL............
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................................................. 109
DSSP .................................................
No 86: 1S7ZA MOLECULE: GENE 0.3 PROTEIN;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....lllLHHHHHHHLL...................
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGF.....hgtRLEQIAELAG................... 35
ident | |
Sbjct xTYNNVFDHAYEXLKENIRYDDIrdtddlhdAIHXAADNAVphyyadifsvxasegidle 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhlhhHHHHHHHHHLlllhhhhhhhhllllllll
DSSP ...................lLHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllllh
Query ...................vSKTNLLYYFPskeALYIAVLRqildiwlaplkafredfap 76
ident | |
Sbjct fedsglxpdtkdvirilqarIYEQLTIDLW...EDAEDLLN................... 98
DSSP lllhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHH...HLHHHHHH...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query laaikeyirlklevsrdypqasrLFCMemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvk 136
ident
Sbjct ......................eYLEE................................. 103
DSSP ......................hHHLL.................................
DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query sgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegir 196
ident
Sbjct ...........................................................v 104
DSSP ...........................................................l
DSSP ll
Query pr 198
ident
Sbjct ee 106
DSSP ll
No 87: 1QBJA MOLECULE: PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLhhhhhHHHHhhh
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFG.fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLrqi 59
ident | | | | | |
Sbjct ...SIYQDQEQRILKFLEELGegKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYS.lakkGKLQ... 53
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhlLLEE...
DSSP hhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlh
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgd 119
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhh
Query lkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevf 179
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .......keagtpplwkia 65
DSSP .......eellllleeeel
No 88: 1FSEA MOLECULE: GERE;
DSSP ...lhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL......lhhHH
Query ...avSAKKKAILSAALDTfsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP......skeAL 51
ident || |
Sbjct skpllTKREREVFELLVQD........KTTKEIASELFISEKTVRNHISnamqklgvkGR 52
DSSP lllllLHHHHHHHHHHLLL........LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhhhlllLH
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query YIAVLRQILDIwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapl 111
ident ||
Sbjct SQAVVELLRMG................................................. 63
DSSP HHHHHHHHHLL.................................................
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg 171
ident
Sbjct ............................................................ 63
DSSP ............................................................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query atlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .......................elel 67
DSSP .......................llll
No 89: 1EH6A MOLECULE: O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct cemkrttldsplgklelsgceqglheikllgevpapaavlggpeplmqctawlnayfhqp 60
DSSP llleeeeelllllleeeeeelleeeeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlh
DSSP ................lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLLHHHHHHHLLL..LHHHHL
Query ................aVSAKKKAILSAALDTFSqfgfHGTRLEQIAELAGV..SKTNLL 42
ident | | | | |||
Sbjct eaieefpvpalhhpvfqQESFTRQVLWKLLKVVK..fgEVISYQQLAALAGNpkAARAVG 118
DSSP hhhhhllllllllhhhhLLLHHHHHHHHHHHHLL..llLLEEHHHHHHHLLLllLHHHHH
DSSP LLLLlhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query YYFPskealYIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfc 102
ident |
Sbjct GAMR.gnpvPILIP...............................chrvvcssgavgnys 146
DSSP HHLL.llllLLLLL...............................hhheellllllllll
DSSP hhhhllLLLLHH....hhHLHHhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query memlagAPLLMD....elTGDLkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqh 158
ident || |
Sbjct gglavkEWLLAHeghrlgKPGL...................................... 168
DSSP llhhhhHHHHHHllllllLLLL......................................
DSSP hhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query yadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................................ 168
DSSP ........................................
No 90: 2DK5A MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLL
Query ................AVSAKKKAILSAALDTfsQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | |
Sbjct gssgssgdsqnagkmkGSDNQEKLVYQIIEDA..GNKG..IWSRDVRYKSNLPLTEINKI 56
DSSP llllllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHH..LLLL..EEHHHHHHHLLLLHHHHHHH
DSSP LL..lhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHH
Query FP..skeaLYIAvlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFC 102
ident | |
Sbjct LKnleskkLIKA..............................vksvaaskkkvymlynLS 86
DSSP HHhhhhllLEEE..............................ellllllllleeeellLL
DSSP HHHhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query MEMlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct GPS......................................................... 89
DSSP LLL.........................................................
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................................sg 91
DSSP ..................................ll
No 91: 1Z1DA MOLECULE: REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT;
DSSP ..lHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllLLHHHHHHHLL.LLHHHHLLLLL..........l
Query ..aVSAKKKAILSAALDTfsQFGFhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFP..........s 47
ident | |
Sbjct angLTVAQNQVLNLIKAC..PRPE.gLNFQDLKNQLKhMSVSSIKQAVDflsneghiyst 57
DSSP lllLLHHHHHHHHHHHLL..LLLL.lEEHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHhhhhllleeel
DSSP hhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query kealyiaVLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemla 107
ident
Sbjct vdddhfkSTDAE................................................ 69
DSSP lllleeeELLLL................................................
DSSP lllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query gapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqve 167
ident
Sbjct ............................................................ 69
DSSP ............................................................
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query avtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................... 69
DSSP ...............................
No 92: 1NKLA MOLECULE: NK-LYSIN;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL.lLLHHHHHHHLL.......lLHHHHLL.llLLHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSqFGFH.gTRLEQIAELAG.......vSKTNLLY.yfPSKEA 50
ident | | | |
Sbjct gYFCESCRKIIQKLEDMVG.PQPNedTVTQAASQVCDklkilrglCKKIMRSflrRISWD 59
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLhhHHHHHHHHHHHhllllhhhHHHHHHHhhhHHHHH
DSSP HHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllll
Query LYIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagap 110
ident
Sbjct ILTGKK...................................................... 65
DSSP HHLLLL......................................................
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavt 170
ident
Sbjct ............................................................ 65
DSSP ............................................................
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...............pqaicvdikicke 78
DSSP ...............hhhhhhhllllll
No 93: 1HSTA MOLECULE: HISTONE H5;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllLLHHHHHHHLL.......lLHHHHLLLLL..lhhHH
Query AVSAKKKAILSAALDTfsQFGFhgTRLEQIAELAG.......vSKTNLLYYFP..skeAL 51
ident | | |
Sbjct SHPTYSEMIAAAIRAE..KSRG.gSSRQSIQKYIKshykvghnADLQIKLSIRrllaaGV 57
DSSP LLLLHHHHHHHHHHLL..LLLL.lEEHHHHHHHHHhhllllllHHHHHHHHHHhhhhlLL
DSSP HH..........hHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query YI..........aVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlf 101
ident |
Sbjct LKqtkgvgasgsfRLAK........................................... 74
DSSP EEeellllllleeEELL...........................................
DSSP hhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query cmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct ............................................................ 74
DSSP ............................................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..................................... 74
DSSP .....................................
No 94: 2P4WA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;
DSSP ...........lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhh
Query ...........aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPske 49
ident || || |
Sbjct mgeelnrlldvlGNETRRRILFLLTKRP.......YFVSELSRELGVGQKAVLEHLR.il 52
DSSP llhhhhhhhhhhHLHHHHHHHHHHHHLL.......EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hh
DSSP hhhHHHH..................hhHHHHhhhhhHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query alyIAVL..................rqILDIwlaplKAFRedfaplaaikeyirlklevs 91
ident
Sbjct eeaGLIEsrvekiprgrprkyymikkgLRLE...ilLTPT.................... 89
DSSP hhlLLEEeeellllllllleeeeelllEEEE...eeEELL....................
DSSP hhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh
Query rdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifm 151
ident
Sbjct .................................................lfgsemyeakg 100
DSSP .................................................eeeeeeeelll
DSSP HHHHhhhhhhLHHHHHHH.......hlLLLLLHHHHHHHHHH..................
Query IWAStqhyadFAPQVEAV.......tgATLRDEVFFNQTVEN.................. 186
ident | | |
Sbjct VRKS..peyeQAKELIKSqepinvkmrELAEFLHELNERIREiieekreleeariliety 158
DSSP LLLL..hhhhHHHHHHLLlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........................hhhhhhhhhlll
Query ...........................vqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ientmrrlaeenrqiieeifrdiekilppgyarslkekf 197
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlll
No 95: 2NYXA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,
DSSP ...................................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllL
Query ...................................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgT 25
ident |
Sbjct pataeesvdvitdalltasrllvaisahsiaqvdeniTIPQFRTLVILSNHG......pI 54
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHL......lE
DSSP LHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL....................lhhhhhHHHHHHHHHHHHH
Query RLEQIAELAGVSKTNLLYYFP....................skealyIAVLRQILDIWLA 65
ident | | | ||
Sbjct NLATLATLLGVQPSATGRXVDrlvgaelidrlphptsrrellaaltkRGRDVVRQVTEHR 114
DSSP EHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeellllllleeeeelhHHHHHHHHHHHHH
DSSP .HHHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhh
Query .PLKAFRedfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkali 124
ident |
Sbjct rTEIARI..................................................... 121
DSSP hHHHHHH.....................................................
DSSP hhhhhHHHHHHhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllLLLLhhhhhhhh
Query deksaLIAGWVksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgaTLRDevffnqtv 184
ident |
Sbjct ...veQXAPAE...........................rhglvraltaFTEA........ 143
DSSP ...hhLLLHHH...........................hhhhhhhhhhHHHH........
DSSP hhhhhhhhhhhlll
Query envqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........gge 146
DSSP ...........lll
No 96: 2CQRA MOLECULE: DNAJ HOMOLOG SUBFAMILY C MEMBER 1;
DSSP ....................LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLLLLHHHHHHHL.LLLHH
Query ....................AVSAKKKAILSAALDTFsqfgFHGTRLEQIAELA.GVSKT 39
ident | | || ||
Sbjct gssgssgslrkerarsaeepWTQNQQKLLELALQQYP...rGSSDCWDKIARCVpSKSKE 57
DSSP llllllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL...lLLHHHHHHHHHHLlLLLHH
DSSP HHLLLLLlhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query NLLYYFPskealyiavlrqilDIWLaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr 99
ident
Sbjct DCIARYK.........llvsgPSSG................................... 73
DSSP HHHHHHH.........hhhllLLLL...................................
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct ............................................................ 73
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................... 73
DSSP .......................................
No 97: 1R1UA MOLECULE: REPRESSOR PROTEIN;
DSSP ..............lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL
Query ..............avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | | | |
Sbjct ntdtlervteifkalgDYNRIRIMELLSVSE.......ASVGHISHQLNLSQSNVSHQLK 53
DSSP lhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHLL.......LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
DSSP ..lhhHHHH.............hhhHHHHhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHH
Query ..skeALYI.............avlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlkleVS 91
ident |
Sbjct llksvHLVKakrqgqsmiyslddihVATM........................lkqaiHH 89
DSSP hhhhlLLEEeeeelleeeeeellhhHHHH........................hhhhhHH
DSSP HHlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhh
Query RDypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifm 151
ident
Sbjct AN.......................................................... 91
DSSP HL..........................................................
DSSP hhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query iwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................................hpk 94
DSSP ............................................lll
No 98: 1AOYA MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL......LLHHHHLLLLLlhh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG......VSKTNLLYYFPske 49
ident || |
Sbjct mrssaKQEELVKAFKALLKEEK......fSSQGEIVAALQeqgfdnINQSKVSRMLT.kf 53
DSSP lllllLLLLHHHHHHHHHHLLL......lLLHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHHHHH.hh
DSSP HHHH..........hHHHHHHhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query ALYI..........aVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr 99
ident
Sbjct GAVRtrnakmemvycLPAELG....................................... 74
DSSP LLEEeellllleeeeLLLLLL.......................................
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct ............................................................ 74
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................................vptt 78
DSSP ...................................llll
No 99: 2PG4A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLL.LHHH...hLLLLL...
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV.SKTN...lLYYFP... 46
ident || | | | || ||
Sbjct xddetlrLQFGHLIRILPTLLEFEKKGYE..PSLAEIVKASGVsEKTFfxglKDRLIrag 58
DSSP lllhhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHHHHHHLLlHHHHhllhHHHHHhll
DSSP ..........lhhHHHH.hHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query ..........skeALYI.aVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdyp 95
ident |
Sbjct lvkeetlsyrvktLKLTekGRRL..................................... 81
DSSP leeeeeeelleeeEEELhhHHHH.....................................
DSSP hhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhh
Query qasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwas 155
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................................aeclekcrdvl 92
DSSP ................................hhhhhhhhhhl
No 100: 2DIMA MOLECULE: CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN;
DSSP ...........lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHH.lLLLHHHHLLLLLLh
Query ...........aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAEL.aGVSKTNLLYYFPSk 48
ident | || | |
Sbjct gssgssgkggvwRNTEDEILKAAVMKYG......kNQWSRIASLlhRKSAKQCKARWYE. 53
DSSP llllllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHllLLLHHHHHHHHHH.
DSSP hHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query eALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident |
Sbjct .WLDP....................................................... 57
DSSP .LLLL.......................................................
DSSP llLLHHHhhLHHHhhHHHHhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apLLMDEltGDLKalIDEKsaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ..SIKKT..EWSG..PSSG......................................... 70
DSSP ..LLLLL..LLLL..LLLL.........................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 70
DSSP ..............................
No 101: 2CU7A MOLECULE: KIAA1915 PROTEIN;
DSSP ...........lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLL.LLHHHHLLLLLLH
Query ...........aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPSK 48
ident | | | | | |
Sbjct gssgssgysvkwTIEEKELFEQGLAKFG.......rRWTKISKLIGsRTVLQVKSYARQY 53
DSSP llllllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL.......lLHHHHHHHHLlLLHHHHHHHHHHH
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident
Sbjct ..........................................................fk 55
DSSP ..........................................................hh
DSSP llLLHHhhHLHHhhhhhHHHHhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apLLMDelTGDLkalidEKSAliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident |
Sbjct nkVKCGldKETP....nQKTG....................................... 72
DSSP hhLLLLllLLLL....lLLLL.......................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 72
DSSP ..............................
No 102: 2AVUE MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR FLHD;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sivqeardiqlamelitlgarlqmlesetqlsrgrliklykelrgspppkgmlpfstdwf 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhh
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL..HHHHHHHLL........llhhHHLLLLLl
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTR..LEQIAELAG........vsktNLLYYFPs 47
ident | | |
Sbjct mtwEQNVHASMFCNAWQFLLKT.glCNGVdaVIKAYRLYLeqcpqaeegpllALTRAWT. 118
DSSP hllHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLHhhHHHHHHHHHhhllllllllllLHHHHHH.
DSSP hhHHHHHHHH..............hhHHHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhHHHHhhh
Query keALYIAVLR..............qiLDIWlaplkafredfaplaaikeyirlKLEVsrd 93
ident
Sbjct ..LVRFVESGllqlsscnccggnfitHAHQ......................pVGSF... 151
DSSP ..HHHHHHLLleeeeelllllleeeeELLL......................lLLLL...
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw 153
ident
Sbjct ............................................................ 151
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query astqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................................acslc 156
DSSP ........................................lllll
No 103: 1YLFA MOLECULE: RRF2 FAMILY PROTEIN;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLL........lhhhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP........skealy 52
ident | | ||
Sbjct .kISSRFSIAVHILSILKNNPSSLCTSDYXAESVNTNPVVIRKIXSylkqagfvyvngga 59
DSSP .lLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeellle
DSSP hhhHHHHHHH........hhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHhhhhh
Query iavLRQILDI........wlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdYPQASRlfcme 104
ident
Sbjct gllKDLHEITlldvyhavnviganiqavleiiliqaqsaxeevlrnitxGQLFET..... 114
DSSP eelLLHHHLLhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhHHHHHH.....
DSSP hhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query mlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfap 164
ident
Sbjct ............................................................ 114
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...............................lqe 117
DSSP ...............................hll
No 104: 1Y0UA MOLECULE: ARSENICAL RESISTANCE OPERON REPRESSOR, PUTATIVE;
DSSP ...........................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHH
Query ...........................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAEL 33
ident || | |
Sbjct ghxsleewikadslekadeyhkrynyavTNPVRRKILRXLDKGR........SEEEIXQT 52
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHHHHLLL........LHHHHHHH
DSSP LLLLHHHHLLLLL........lhhhhHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhh
Query AGVSKTNLLYYFP........skealYIAVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyir 85
ident || | | |
Sbjct LSLSKKQLDYHLKvleagfciervgeRWVVTDA........................... 85
DSSP HLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeellEEEELLL...........................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllh
Query lklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidp 145
ident
Sbjct ............................................................ 85
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................................gkiv 89
DSSP .................................................llll
No 105: 1USTA MOLECULE: HISTONE H1;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLllLLHHHHHHHLL..........lLHHHHLLLLL
Query ....AVSAKKKAILSAALDTFsQFGFhgTRLEQIAELAG..........vSKTNLLYYFP 46
ident |
Sbjct keeaSSKSYRELIIEGLTALK.ERKG..SSRPALKKFIKenypivgsasnFDLYFNNAIK 57
DSSP llllLLLLHHHHHHHHHLLLL.LLLL..EEHHHHHHHHHhhlhhhhllllHHHHHHHHHH
DSSP ..lhhHHHH.........hHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query ..skeALYI.........aVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdyp 95
ident
Sbjct kgveaGDFEqpkgpagavkLAKK..................................... 80
DSSP hhhhlLLEEllllllleeeELLL.....................................
DSSP hhhhhhhhhhhLLLLllHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhh
Query qasrlfcmemlAGAPllMDELtgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwas 155
ident |
Sbjct ..........kSPEV..KKEK....................................... 89
DSSP ..........lLLLL..LLLL.......................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................................evs 92
DSSP ........................................lll
No 106: 2AJAA MOLECULE: ANKYRIN REPEAT FAMILY PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nltihnienyendpqlrlipwilwenlfqhfisanelslxtlsykeaihiflpgtknxeq 60
DSSP leelllhhhllllllhhhllhhhhhhlllleelhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vrqllclyyahynrnakqlwsdahkkgiksevicfvaaitgcssaldtlcllsdeivkqa 120
DSSP hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllllllh
DSSP ..............................................LHHH..........
Query ..............................................AVSA.......... 4
ident
Sbjct enyqafrlaaenghlhvlnrlcelapteixaxiqaenyhafrlaaeNGHLhvlnrlcela 180
DSSP hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLHhhhhhhhhll
DSSP ........................HHHHHHHHHHH..HHHHHLLLlllhhhhhhhllllh
Query ........................KKKAILSAALD..TFSQFGFHgtrleqiaelagvsk 38
ident | |
Sbjct pteataxiqaenyyafrwaavgrgHHNVINFLLDCpvXLAYAEIH............... 225
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHLLLhhHHHHHHHL...............
DSSP hhhlllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllhhHHHHHhhhHHHHhhHHLHHH
Query tnllyyfpSKEA.LYIAVLRQILDIWLAPLKAFredfaplAAIKEyirLKLEvsRDYPQA 97
ident || |
Sbjct ......efEYGEkYVNPFIARHVNRLKEXHDAF....klsNPDGV...FDLV.tKSECLQ 271
DSSP ......llLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....lllLLLLL...LLLL.lHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLlllHHHHHLhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhHHHHH
Query SRLFCMEMLAGApllMDELTGdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiWASTQ 157
ident |
Sbjct GFYXLRNLIRRN...DEVLLD............................dirfllSIPGI 300
DSSP HHHHHHHHHHHL...LHHHHH............................hhhhhhLLLLL
DSSP HHhHLHH..............................HHHHHHllllllhhhhhhhhhhh
Query HYaDFAP..............................QVEAVTgatlrdevffnqtvenv 187
ident | | |
Sbjct KA.LAPTatipgdanellrlalrlgnqgacalllsipSVLALT................. 342
DSSP HH.HLLLllllllllhhhhhhhhhllllhhhhhlllhHHHHLL.................
DSSP hhhhhhhhlll
Query qriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..........k 343
DSSP ..........l
No 107: 1U78A MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLhhhhhhhhhhhh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyiavlrqi 59
ident || | | |
Sbjct prGSALSDTERAQLDVMKLLN....VSLHEMSRKISRSRHCIRVYLKD.........pvs 47
DSSP llLLLLLHHHHHHHHHHHHLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL.........hhh
DSSP hhhhhhhhHLLLLLL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ldiwlaplKAFREDF.APLAaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg 118
ident
Sbjct ygtskrapRRKALSVrDERN.........................viraasnscktardi 82
DSSP llllllllLLLLLLHhHHHH.........................hhhhhhhllllhhhh
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalidekSALIAGWVKSGklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident | |
Sbjct rnelqlsasKRTILNVIKRS........................................ 102
DSSP hhhllllllHHHHHHHHHHL........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................g 103
DSSP ...................l
No 108: 1RI7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhhHHHHhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyiAVLRqil 60
ident | | | | |
Sbjct .LDEIDKKIIKILQNDG......kAPLREISKITGLAESTIHERIR.klresgVIKK... 49
DSSP .LLHHHHHHHHHHLLLL......lLLHHHHHHHLLLLLLLHHHHHH.hhhhllLLLL...
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident
Sbjct ........................................ftAIID.............. 55
DSSP ........................................llLLLL..............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL..LHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query kalideksaliagwvksgkLAPI..DPQHlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev 178
ident |
Sbjct ...pealgysmlafilvkvKAGKysEVAS..........................nlaky 86
DSSP ...hhhlllleeeeeeeeeLLLLhhHHHH..........................hhhll
DSSP hhhhhhhhhHHHHH........................................hhhlll
Query ffnqtvenvQRIII........................................egirpr 198
ident
Sbjct peivevyetTGDYDmvvkirtknseelnnfldligsipgvegthtmivlkthkettelpi 146
DSSP lleeeeeelLLLLLeeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelllllllllllll
No 109: 1R7JA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN SSO10A;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHhhhhhhhhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqil 60
ident | | | | | | | |
Sbjct ..KKSKLEIIQAILEACKSG....SPKTRIMYGANLSYALTGRYIKMLMD.......... 44
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHLLL....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH..........
DSSP hhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHHhhhhhhllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdYPQASRLfcmemlagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct ...................leiirqegkqymltKKGEELL.........edirkfnemrk 76
DSSP ...................llleeeelleeeelHHHHHHH.........hhhhhhhhhhh
DSSP hhhhHHHHHHHHHHhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query kaliDEKSALIAGWvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevff 180
ident
Sbjct nmdqLKEKINSVLS.............................................. 90
DSSP hhhhHHHHHHHHHL..............................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlll
Query nqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................. 90
DSSP ..................
No 110: 1FT9A MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pprfnianvllspdgetffrgfrskihakgslvctgegdengvfvvvdgrlrvylvgeer 60
DSSP llllllhhhhlllllllllllleeeeelllleeelllllllleeeeeeleeeeeeeelle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct eislfyltsgdmfcmhsgclveatertevrfadirtfeqklqtcpsmawgliailgralt 120
DSSP eeeeeeeellleeellllleeeellleeeeeelhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........LHHHHHHHHHHHHHHHHH.......hhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLL
Query .........AVSAKKKAILSAALDTFS.......qfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | | || | | |
Sbjct scmrtiedlMFHDIKQRIAGFFIDHANttgrqtgvivsvDFTVEEIANLIGSSRQTTSTA 180
DSSP hhhhhhhhhHLHHHHHHHHHHHHHLLLlllllllllleeLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP LLlhhhhhHHHH.........HHHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query FPskealyIAVL.........RQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdyp 95
ident
Sbjct LN.slikeGYISrqgrghytiPNLVR.................................. 205
DSSP HH.hhhhlLLLEellllleelLLHHH..................................
DSSP hhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhh
Query qasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwas 155
ident
Sbjct ............................................................ 205
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................................lkaaa 210
DSSP ......................................hhhll
No 111: 2G9WA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ...lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHLL....lLHHHHLLLLL.......
Query ...avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAG....vSKTNLLYYFP....... 46
ident | | | |
Sbjct kltrlGDLERAVXDHLWS.RTEP....QTVRQVHEALSarrdlAYTTVXAVLQrlakknl 55
DSSP lhhhlLHHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLlllllLHHHHHHHHHhhhhlll
DSSP .....lhhhhHHHHhhHHHHHHHH.HHHLLLLLLLHHHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query .....skealYIAVlrQILDIWLA.PLKAFREDFAPLAAIKEYirlklevsrdypqasrl 100
ident | ||
Sbjct vlqirahryaPVHGrdELVAGLXVdALAQAEDSGSRQAALVHF................. 98
DSSP eeeellleeeELLLhhHHHHHHHHhHHLLLLLHHHHHHHHHHH.................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query fcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhya 160
ident
Sbjct ............................................................ 98
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhhllllllhhhHHHHHHHHhhhhhhhhlll
Query dfapqveavtgatlrdevfFNQTVENVqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...............vervGADEADAL..rralaelea 119
DSSP ...............hhhlLHHHHHHH..hhhhhhhhl
No 112: 2FRHA MOLECULE: STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;
DSSP .................................lHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllLLH
Query .................................aVSAKKKAILSAALDTfsQFGFhgTRL 27
ident | | | |
Sbjct gshmaitkindcfellsmvtyadklkslikkefsISFEEFAVLTYISEN..KEKE..YYL 56
DSSP lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHL..LLLE..EEH
DSSP HHHHHHLLLLHHHHLLLLL.......................lhhhhhhhHHHHHHhhhh
Query EQIAELAGVSKTNLLYYFP.......................skealyiaVLRQILdiwl 64
ident |
Sbjct KDIINHLNYKQPQVVKAVKilsqedyfdkkrnehdertvlilvnaqqrkkIESLLS.... 112
DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHHHHhhhhlllllllllllllllleeelllhhhhhHHHHHH....
DSSP hhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHHlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhh
Query aplkafredfaplaaikeyirlkleVSRDypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkali 124
ident
Sbjct ......................rvnKRIT............................... 119
DSSP ......................hhhHHHH...............................
DSSP hhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllLLLHHhhhhhh
Query deksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatLRDEVffnqtv 184
ident |
Sbjct ..............................................eanNEIEL...... 127
DSSP ..............................................hhhHHLLL......
DSSP hhhhhhhhhhhlll
Query envqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............. 127
DSSP ..............
No 113: 1XMKA MOLECULE: DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;
DSSP ...lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLL.LHHHHLLLLLL.........
Query ...aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFPS......... 47
ident | | | | |
Sbjct gshmASLDMAEIKEKICDYLFNVSD..SSALNLAKNIGLtKARDINAVLIDmerqgdvyr 58
DSSP llllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..EEHHHHHHHHLHhHHHHHHHHHHHhhhllleee
DSSP ...hhhhhhhhHHHHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query ...kealyiavLRQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcme 104
ident
Sbjct qgttppiwhltDKKRER........................................... 75
DSSP ellllleeeelHHHHLL...........................................
DSSP hhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhh
Query mlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfap 164
ident
Sbjct ............................................................ 75
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query qveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ..............................mqik 79
DSSP ..............................llll
No 114: 1WHUA MOLECULE: POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE; 3'-5' RNA
DSSP .............lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..........lLLLL..HHHHHHHLL
Query .............aVSAKKKAILSAALDTFSQFG..........fHGTR..LEQIAELAG 35
ident | | |
Sbjct gssgssgpqkiftpSAEIVKYTKIIAMEKLYAVFtdyehdkvsrdEAVNkiRLDTEEHLK 60
DSSP llllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllhhhhHHHHhhHHHHHHHHL
DSSP .....llhHHHLLLLllhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query .....vskTNLLYYFpskeALYIAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklev 90
ident | | |
Sbjct ekfpevdqFEIIESF...nIVAKEVFR................................. 84
DSSP lllllllhHHHHHHH...hHHHHHHHH.................................
DSSP hhhlhhhhhhhhHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHH
Query srdypqasrlfcMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlIF 150
ident
Sbjct ...........sIILNEYK...................................rcdgRD 98
DSSP ...........hHHLLLLL...................................llllLL
DSSP HHhhhHHHHhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query MIwasTQHYadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct SG...PSSG....................................... 104
DSSP LL...LLLL.......................................
No 115: 1UMQA MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;
DSSP .............lhHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLL
Query .............avSAKKKAILSAALDTFSqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPS 47
ident || | |
Sbjct lakgeslppppenpmSADRVRWEHIQRIYEM....cDRNVSETARRLNMHRRTLQRILAK 56
DSSP lllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHH....lLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhl
Query kealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemla 107
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP lllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query gapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqve 167
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query avtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...........................rspr 60
DSSP ...........................llll
No 116: 1SD4A MOLECULE: PENICILLINASE REPRESSOR;
DSSP ..lhHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllLLHHHHHHHLL....LLHHHHLLLLL..lhhHHH
Query ..avSAKKKAILSAALdTFSQfgfhgTRLEQIAELAG....VSKTNLLYYFP..skeALY 52
ident | | ||
Sbjct qveiSXAEWDVXNIIW.DKKS.....VSANEIVVEIQkykeVSDKTIRTLITrlykkEII 54
DSSP llllLHHHHHHHHHHH.HLLL.....EEHHHHHHHHHllllLLHHHHHHHHHhhhhlLLE
DSSP H...........hhHHHHHHHHHhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query I...........avLRQILDIWLaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlf 101
ident
Sbjct KrykseniyfyssnIKEDDIKXK..................................... 77
DSSP EeeeelleeeeeelLLHHHHHHH.....................................
DSSP hhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query cmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct ............................................taktflnklyggdxks 93
DSSP ............................................hhhhhhhhhhlllhhh
DSSP lhhHHHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlll
Query fapQVEAVTGAtlRDEVFFNQTVENVQRIiiegirpr 198
ident
Sbjct lvlNFAKNEELnnKEIEELRDILNDISKK........ 122
DSSP hhhHHHHLLLLlhHHHHHHHHHHHHHLLL........
No 117: 1N81A MOLECULE: PLASMODIUM FALCIPARUM GAMETE ANTIGEN 27/25;
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhllllllhhhhhhhhhhhhh
Query avsakkkailsaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskealyiavlrqil 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLH...........hHHHHhhhhhhlll
Query diwlaplkafredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYP...........qASRLfcmemlaga 109
ident |
Sbjct ..yhyehethaplSPRIRKVGDIEFHACSDYIYLLmtlskdpekfnyALKD......... 49
DSSP ..lllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllhhhhHHLL.........
DSSP lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHHHH
Query pllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidPQHLIFMIWASTQHYADFApqVEAV 169
ident |
Sbjct ...............rvsirryvrknqnrynyfliEERVQDNIVNRISDRLISY.cTDKE 93
DSSP ...............hhhhhhhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hLLLL
DSSP hllllLLHHHHHHHHHHH..........................................
Query tgatlRDEVFFNQTVENV.......................................... 187
ident
Sbjct .vtedYIKKIDDYLWVEQrvieevsinvdharevkekkrimndkklirmlfdtyeyvkdv 152
DSSP .llhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP .............hhHHHHHHLLL..........
Query .............qrIIIEGIRPR.......... 198
ident
Sbjct kftddqykdaaarisQFLIDVVDSyiikpipalp 186
DSSP lllhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLllllllllll
No 118: 1LNWA MOLECULE: MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR;
DSSP ................................lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHH
Query ................................aVSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLE 28
ident | |
Sbjct nypvnpdlxpalxavfqhvrtriqseldcqrldLTPPDVHVLKLIDEQRG......LNLQ 54
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHLLLL......LLHH
DSSP HHHHHLLLLHHHHLLLLL..lhhHHHH.............hHHHHhhhhhhhhhhlllll
Query QIAELAGVSKTNLLYYFP..skeALYI.............aVLRQildiwlaplkafred 73
ident | |
Sbjct DLGRQXCRDKALITRKIRelegrNLVRrernpsdqrsfqlfLTDE............... 99
DSSP HHHHHLLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeellllllleeeeELHH...............
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query faplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliag 133
ident
Sbjct ............................................................ 99
DSSP ............................................................
DSSP hhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllLLLLHHHhhHHHH..hhhhhh
Query wvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgaTLRDEVFfnQTVE..nvqrii 191
ident ||
Sbjct .......................glaihqhaeaixsrvhDELFAPL..TPVEqatlvhll 134
DSSP .......................hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLL..LHHHhhhhhhhh
DSSP hhhhlll
Query iegirpr 198
ident
Sbjct dqclaaq 141
DSSP hhhhhll
No 119: 1E2XA MOLECULE: FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;
DSSP .......lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhllllllhhhhhh
Query .......avsakkkailsaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskealyi 53
ident
Sbjct qspagfaeeyiiesiwnnrfppgtilpaerelseligvtrttlrevlqrlardgwltiqh 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeel
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhllLLLL..........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....HHHHH
Query avlrqildiwlaplkafREDF..........APLAAIKEYIRLKLEVSRDY....PQASR 99
ident | | |
Sbjct gkptkvnnfwetsglniLETLarldhesvpqLIDNLLSVRTNISTIFIRTAfrqhPDKAQ 120
DSSP leeeeellhhhhllhhhHHHHhhhllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlHHHHH
DSSP HHHHHHHLL...............llllhhhhhlhhhhhhhhHHHHHHHhhhlllllllL
Query LFCMEMLAG...............apllmdeltgdlkalideKSALIAGwvksgklapiD 144
ident |
Sbjct EVLATANEVadhadafaeldynifrglafasgnpiyglilngMKGLYTR........igR 172
DSSP HHHHHHHLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhHHHHHHH........hhH
DSSP HHH....hhhHHHHHhhhhhHLHHHHhhhhlLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query PQH....lifMIWAStqhyaDFAPQVeavtgATLRdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident || |
Sbjct HYFanpearsLALGF.yhklSALCSE.....GAHD...QVYETVRRYGHESGEIWHRMq 222
DSSP HHLllhhhhhHHHHH.hhhhHHHHHH.....LLHH...HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHl
No 120: 2IJLA MOLECULE: MOLYBDENUM-BINDING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR;
DSSP .................LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllHHHHHHHLLLLHHHHLL
Query .................AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtrLEQIAELAGVSKTNLLY 43
ident | | |
Sbjct krlplkpvlridfppgeRLGHGKVELXQLIAETG........sISAAGRAXDXSYRRAWL 52
DSSP llllleeeeeeeellleEELHHHHHHHHHHHHHL........lHHHHHHHLLLLHHHHHH
DSSP LLL......lhHHHH....hHHHH.HHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query YFP......skEALY....iAVLR.QILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsr 92
ident |
Sbjct LVDalnhxfrqPVICsqrgaALTVfGAEL............................... 81
DSSP HHHhhhhhlllLLEEellleEELHhHHHH...............................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhh
Query dypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmi 152
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlll
Query wastqhyadfapqveavtgaTLRDEVFFNQTVenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .........leryrgxeerxNEALREDIDWLE........anrnpq 110
DSSP .........hhhhhhhhhhhHHHLHHHHHHHH........hhllll
No 121: 1YO3A MOLECULE: DYNEIN LIGHT CHAIN 1;
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLLL.HHHHHHHLL......LLHH......
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFgFHGTR.LEQIAELAG......VSKT...... 39
ident | |
Sbjct gsvvknvdMTEEMQIDAIDCANQALQKY.NVEKDiAAHIKKEFDrkydptWHCVvgrnfg 59
DSSP llleeellLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHHhHHHHHHHHHhhhlllEEEEelllll
DSSP ......hhlLLLLlhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ......nllYYFPskealyiAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrd 93
ident
Sbjct syvthetknFIYF.......YIGQ.................................... 76
DSSP leeelllleEEEE.......EELL....................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw 153
ident
Sbjct ............................................................ 76
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query astqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................vaillfksg 85
DSSP ....................................eeeeeeell
No 122: 1T98A MOLECULE: CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;
DSSP ...............lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLL...HHHHHHHLL.......
Query ...............avSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTR...LEQIAELAG....... 35
ident | | |
Sbjct vpelvawarkndfsislPVDRLSFLLAVATLNGERldGEXSegeLVDAFRHVSdafeqts 60
DSSP llhhhhhhhhhllleeeLHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLLLhhhHHHHHHHHHhhlllll
DSSP .lLHHHHLLLLL..lhhHHHH.........hHHHHhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhh
Query .vSKTNLLYYFP..skeALYI.........aVLRQildiwlaplkafredfaplaaikey 83
ident |
Sbjct etIGVRANNAINdxvrqRLLNrftiyrltplGIGI......................... 95
DSSP llHHHHHHHHHHhhhhhLLEEellleeelhhHHHH.........................
DSSP hhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhHHHHHHHLL.....
Query irlklevsrdypQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaLIAGWVKSG..... 138
ident
Sbjct .........tdyYIRQ.............refstlrlsxqlsivagELKRAADAAeeggd 133
DSSP .........hhhHHLL.............llllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhllll
DSSP .....llllLLHH.HHHHHHHHHHHHHHhLHHHHHHHHL....................l
Query .....klapIDPQ.HLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTG....................a 172
ident
Sbjct efhwhrnvyAPLKySVAEIFDSIDLTQR.LXDEQQQQVKddiaqllnkdwraaisscell 192
DSSP hhhhhhhlhHHHHhLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLL...................................
Query tlRDEVFFNQTVENVQRIiIEGIRP................................... 197
ident
Sbjct lsETSGTLRELQDTLEAA.GDKLQAnllriqdatxthddlhfvdrlvfdlqskldriisw 251
DSSP hhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..............l
Query ..............r 198
ident
Sbjct gqqsidlwigydrhv 266
DSSP hhhhhhhhhhhhhll
No 123: 1IRZA MOLECULE: ARR10-B;
DSSP .........LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLLHHHHHHHLL...LLHHHHLLLLLlh
Query .........AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfHGTRLEQIAELAG...VSKTNLLYYFPsk 48
ident | | | | |
Sbjct taqkkprvlWTHELHNKFLAAVDHLG....vERAVPKKILDLMNvdkLTRENVASHLQ.. 54
DSSP lllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL....lLLLLHHHHHHHHLlllLLHHHHHHHHH..
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ealyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident
Sbjct ..........................................................kf 56
DSSP ..........................................................hh
DSSP lllLHHHHhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query aplLMDELtgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident |
Sbjct rvaLKKVS.................................................... 64
DSSP hhhHHLLL....................................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 64
DSSP ..............................
No 124: 2HZDA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ENHANCER FACTOR TEF-1;
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLLL............lLHHHHHHHLL.....
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFsqfGFHG............tRLEQIAELAG..... 35
ident | | | ||
Sbjct mdndaegvWSPDIEQSFQEALSIYP...PCGRrkiilsdegkmygRNELIARYIKlrtgk 57
DSSP llhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLllllhhhhlllllLHHHHHHHHHhhhll
DSSP .LLHHhhllllllhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query .VSKTnllyyfpskeALYIAVlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdy 94
ident
Sbjct tRTRK.......qvsSHIQVL....................................... 71
DSSP lLLLH.......hhhHHHHHH.......................................
DSSP hhhhhhhhhhhhllllLLHHhhhlhHHHHhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhh
Query pqasrlfcmemlagapLLMDeltgdLKALideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwa 154
ident |
Sbjct ..............arRKSR....dLVPR............................... 82
DSSP ..............hhHHLL....lLLLL...............................
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query stqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................................ 82
DSSP ............................................
No 125: 1ZQ3P MOLECULE: HOMEOTIC BICOID PROTEIN;
DSSP ....lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.llLHHHHHHHLLLLHHhhllllLLHHHhhhhh
Query ....avsAKKKAILSAALDTFSQFGFH.gtRLEQIAELAGVSKTnllyyfPSKEAlyiav 55
ident | | ||
Sbjct gprrtrtTFTSSQIAELEQHFLQGRYLtapRLADLSAKLALGTA...qvkIWFKN..... 52
DSSP lllllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhHHHHHHHHHLLLHH...hhhHHHHH.....
DSSP hhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllLLHHH
Query lrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapLLMDE 115
ident
Sbjct ....................................................rrrRHKIQ 60
DSSP ....................................................hhhHHHHH
DSSP HHLhHHHHhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlllll
Query LTGdLKALideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlr 175
ident |
Sbjct SDQ.HKDQ.................................................... 67
DSSP HHL.LLLL....................................................
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query devffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................s 68
DSSP ......................l
No 126: 1WRJA MOLECULE: METHYLATED-DNA--PROTEIN-CYSTEINE
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mivyglykspfgpitvaknekgfvmldfcdcaerssldndyftdffykldlyfegkkvdl 60
DSSP lleeeeeeelleeeeeeelllleeeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP .......lHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlhhhhhH
Query .......aVSAKKKAILSAALDtFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyI 53
ident | | |
Sbjct tepvdfkpFNEFRIRVFKEVMR.IKWGEV..RTYKQVADAVKTSPRAVGTALS.knnvlL 116
DSSP llllllllLLHHHHHHHHHHLL.LLLLLL..EEHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH.lllllL
DSSP HHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhHHHLLLLllh
Query AVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmEMLAGAPllm 113
ident | |
Sbjct IIP........................chrvigekslggysrgvelkrklLELEGID... 149
DSSP LLL........................hhheelllllllllllhhhhhhhHHHLLLL...
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlll
Query deltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgat 173
ident
Sbjct ............................................................ 149
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................v 150
DSSP ........................l
No 127: 1TWDA MOLECULE: COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC;
DSSP ...lhhhhhHHHHHhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhllllllhhhhhHHHH.
Query ...avsakkKAILSaaldtfsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskealyIAVL. 56
ident |
Sbjct alleiccysXECAL..................................taqqngaDRVEl 26
DSSP leeeeeellHHHHH..................................hhhhlllLEEEe
DSSP .........................HHHHhhhHHHHhLLLLlllHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .........................RQILdiwLAPLkAFREdfaPLAAIKEYIRLKLEVS 91
ident |
Sbjct caapkeggltpslgvlksvrqrvtiPVHP...IIRP.RGGDfcySDGEFAAILEDVRTVR 82
DSSP lllhhhllllllhhhhhhhhhhlllLEEE...LLLL.LLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHlHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHHHHhlllllllLHHHHHHH
Query RDyPQASrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksalIAGWVksgklapiDPQHLIFM 151
ident
Sbjct EL.GFPG...........................lvtgvLDVDG.......nVDXPRXEK 107
DSSP HL.LLLE...........................eeellLLLLL.......lLLHHHHHH
DSSP HhHHHHHHH...................................................
Query IwASTQHYA................................................... 160
ident |
Sbjct I.XAAAGPLavtfhrafdxcanplytlnnlaelgiarvltsgqksdalqglskixeliah 166
DSSP H.HHHHLLLeeeelhhhhhlllhhhhhhhhhhhllleeeellllllllllhhhhhhhhll
DSSP ..............................hlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ..............................dfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqri 190
ident
Sbjct rdapiixagagvraenlhhfldagvlevhssagawqaspxryrnysryivdgaavaexkg 226
DSSP lllleeeeelllllllhhhhhhhllleeeelleeeelllllllllleeeelhhhhhhhhh
DSSP hhhhhlll
Query iiegirpr 198
ident
Sbjct iierhqak 234
DSSP hhhhhhhl
No 128: 1OF9A MOLECULE: PORE-FORMING PEPTIDE AMEOBAPORE A;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHhhllLLHH.......hhLLLL..LLHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAelagVSKT.......nlLYYF..PSKE 49
ident | |
Sbjct geILCNLCTGLINTLENLLTTKGAD.KVKDYIS....SLCNkasgfiatlCTKVldFGID 55
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLH.HHHHHHH....HHHLllllllhhhHHHHhhHLHH
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query ALYIAVLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlaga 109
ident |
Sbjct KLIQLIEDKV.................................................. 65
DSSP HHHHHHHHLL..................................................
DSSP lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query pllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav 169
ident
Sbjct ............................................................ 65
DSSP ............................................................
DSSP hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................danaicakihac 77
DSSP .................lhhhhhhhhlll
No 129: 1H88C MOLECULE: CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA;
DSSP ....lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHhlLLLHHhhllllllHHHHHHHHH
Query ....aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAElaGVSKTnllyyfpsKEALYIAVL 56
ident ||
Sbjct gktrwTREEDEKLKKLVEQNG......tDDWKVIAN..YLPNR...tdvqcQHRWQKVLN 49
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHH..HLLLL...lhhhhHHHHHLLLL
DSSP hHHHHhhHHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhH
Query rQILDiwLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeL 116
ident | |
Sbjct .PELI..KGPW............................tkeedqrviklvqkygpkrwS 78
DSSP .LLLL..LLLL............................lhhhhhhhhhhhhhhllllhH
DSSP HLH.......HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query TGD.......LKALIDEKSALIAGWVKSgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav 169
ident | ||
Sbjct VIAkhlkgriGKQCRERWHNHLNPEVKK..............................ts 108
DSSP HHHlllllllHHHHHHHHHHLLLLLLLL..............................ll
DSSP hllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLL...............l
Query tgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRP...............r 198
ident | |
Sbjct wteeedriiyqahkrLGNRWAEIAKLLPgrtdnaiknhwnstmr 152
DSSP llhhhhhhhhhhhhhHLLLHHHHHHHLLlllhhhhhhhhhhlll
No 130: 1EZFA MOLECULE: FARNESYL-DIPHOSPHATE FARNESYLTRANSFERASE;
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhHHHHhllllllhhhhhhhllllhhhhllLLLLhHHHHHHHHHHHH
Query avsakkkailsaaldTFSQfgfhgtrleqiaelagvsktnllyYFPSkEALYIAVLRQIL 60
ident |
Sbjct ...............NSLK......tcykylnqtsrsfaaviqALDG.EMRNAVCIFYLV 38
DSSP ...............LHHH......hhhhhhhhhlllhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHL...lLLLL.............lhhhhhhHHHHHHHHHHhhlhhhHHHHHHH
Query DIWLAPLKA...fREDF.............aplaaikEYIRLKLEVSrdypqaSRLFCME 104
ident | | | |
Sbjct LRALDTLEDdmtiSVEKkvpllhnfhsflyqpdwrfmESKEKDRQVL...edfPTISLEF 95
DSSP HHHHHHHHHllllLHHHhhhhhhhhhhhlllllllllLLLLLLHHHH...hlhHHHHHHH
DSSP HHllLLLLHHHHhLHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.....lllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query MLagAPLLMDELtGDLKALIDEKSALIaGWVKS.....gklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct RNlaEKYQTVIA.DICRRMGIGMAEFL.DKHVTseqewdkychyvaglvgiglsrlfsas 153
DSSP HLllHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHH.LLLLLlhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHH........................
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGI........................ 195
ident
Sbjct efedplvgedteransmglflqktniirdyLEDQQGgrefwpqevwsryvkklgdfakpe 213
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Query ............................................................ 195
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Sbjct nidlavqclnelitnalhhipdvitylsrlrnqsvfnfcaipqvmaiatlaacynnqqvf 273
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DSSP ...............................................lll
Query ...............................................rpr 198
ident
Sbjct kgavkidatnmpavkaiiyqymeeiyhripdsdpsssktrqiistirtqn 323
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No 131: 1D8JA MOLECULE: GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHH..hhhHHLLllLLHHHHHHHLLLL..hhhhLLLLL.lh
Query .......AVSAKKKAILSAALD..tfsQFGFhgTRLEQIAELAGVS..ktnlLYYFP.sk 48
ident | | |
Sbjct alsgssgYKFGVLAKIVNYMKTrhqrgDTHP..LTLDEILDETQHLdiglkqKQWLMtea 58
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Query ealyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMLag 108
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Sbjct lvnnPKIE...................................vidgkyafkPKYNVR.. 81
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Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
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Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 81
DSSP ..............................
No 132: 1CF7B MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..llLHHHHHHH...........lllLHHHHLLLLll
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFH..gtRLEQIAEL...........agvSKTNLLYYFps 47
ident | |
Sbjct ..GKGLRHFSMKVCEKVQRKGTTsyneVADELVSEftnsnnhlaadsayDQKNIRRRV.. 56
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLEElhhhHHHHHHHHhhllllllhhhlhhHHHHHHHHH..
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Query keALYIAVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFcmemla 107
ident
Sbjct .yDALNVLMAM.......................................NIIS...... 70
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Query gAPLLmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqve 167
ident
Sbjct kEKKE....................................................... 75
DSSP lLLLL.......................................................
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Query avtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................ikwiglp 82
DSSP ........................eelllll
No 133: 1U2WA MOLECULE: CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;
DSSP ............................lhHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHH
Query ............................avSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAE 32
ident | | ||
Sbjct gydeekvnriqgdlqtvdisgvsqilkaiaDENRAKITYALCQDEE......LCVCDIAN 54
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Query LAGVSKTNLLYYFP..skeALYI......aVLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyi 84
ident || |
Sbjct ILGVTIANASHHLRtlykqGVVNfrlalysLGDEH........................i 90
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Query rlkleVSRDypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapid 144
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Sbjct rqimmIALA................................................... 99
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Query pqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatLRDEVffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ............................hKKEVK.................... 105
DSSP ............................hHLLLL....................
No 134: 1K78A MOLECULE: PAIRED BOX PROTEIN PAX5;
DSSP ............LHHHhHHHHHHHHHHHHHHhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLlh
Query ............AVSAkKKAILSAALDTFSQfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPsk 48
ident | | ||
Sbjct gvnqlggvfvngRPLP.DVVRQRIVELAHQG.....VRPCDISRQLRVSHGCVSKILG.. 52
DSSP llllllllllllLLLL.HHHHHHHHHHHHLL.....LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH..
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Query eALYIavlrqildiwlaplKAFREdfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident |
Sbjct .RYYE....tgsikpgvigGSKPK.................................... 71
DSSP .HHHH....hlllllllllLLLLL....................................
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Query apllmdeltgdlkalideksalIAGWVKSGKlapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident |
Sbjct ....................vaTPKVVEKIA.....................eykrqnpt 90
DSSP ....................llLHHHHHHHH.....................hhhhhlll
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Query vtgatlrdevffnqtvenvqriIIEGIR....pr 198
ident |
Sbjct mfaweirdrllaervcdndtvpSVSSINriirtk 124
DSSP llhhhhhhhhhhllllllllllLHHHHHhhhhll
No 135: 1JGSA MOLECULE: MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR;
DSSP ..............................lhHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHH
Query ..............................avSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQI 30
ident | |
Sbjct lfneiiplgrlihmvnqkkdrllneylspldiTAAQFKVLCSIRCAAC......ITPVEL 54
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHLL......LLHHHH
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Query AELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVL.................RQILdiwlaplkafred 73
ident | | |
Sbjct KKVLSVDLGALTRMLD.rlvckGWVErlpnpndkrgvlvklttGGAA............. 100
DSSP HHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEeeellllllleeeeelhHHHH.............
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Query faplaaikeyirlkleVSRDypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliag 133
ident
Sbjct ..........iceqchQLVG........................................ 110
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Query wvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfaPQVEAVTGatlrdevffnqtvenvqriiie 193
ident |
Sbjct ..............qdlhqeltknltadevATLEYLLK...................... 134
DSSP ..............hhhhhhhhlllllllhHHHHHHHH......................
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Query girpr 198
ident
Sbjct .kvlp 138
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